Informace o předmětu

C8857c Protein Preparation and Characterization III - practice

Rozsah

0/2/0. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.

Vyučující

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

It is highly recommended to participate in other courses that are part of Protein Preparation and Characterization.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10

Mateřské obory/plány

předmět má 11 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The practical course will focus on simple and basic methodology allowing students to monitor or characterize protein-mediated interactions. The spectrum of methods will include study of protein-protein interaction by in vitro pull-down assay using purified proteins or in vivo using yeast 2-hybrid method. Example of complex protein interactions will be presented on posttranslational modification by SUMO protein. Protein-DNA interactions will be monitored by electrophoretic mobility shift assay. To study mobile enzymes on a DNA, the ability of helicases to translocate on separate DNA strands will be monitored.

Osnova

• 1. Protein-protein interactions and post-translational modification a) pull-down b) sumoylation c) two-hybrid 2. Protein-DNA interaction and 2-hybrid a) EMSA b) 2-hybrid c) data evaluation 3. Protein-DNA interaction a) helicase assay b) data evluation

Literatura

• MEYERS., Robert A. Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine, 2nd Edition. 2004. ISBN 3-527-30545-9. info

Výukové metody

Each day will start with theoretical section describing the background and use of the individual methods. The students will be then divided in group of two and they will perform all tasks practically based on available protocol.

Metody hodnocení

Each practical course will be evaluated based on the written protocols including control question. To pass the practical course each students has to successfully complete 3/4 of all experiments.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• Bi8858 Příprava a charakterizace proteinů II - Biokatalýza a enzymové technologie
• Bi8858c Příprava a charakterizace proteinů II, cvičení
• Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace
• Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Informace učitele

Maximum 10 students can enroll the course.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C8857c Protein Preparation and Characterization III - practice

Rozsah

0/2/0. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.

Vyučující

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

It is highly recommended to participate in other courses that are part of Protein Preparation and Characterization.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10

Mateřské obory/plány

předmět má 11 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The practical course will focus on simple and basic methodology allowing students to monitor or characterize protein-mediated interactions. The spectrum of methods will include study of protein-protein interaction by in vitro pull-down assay using purified proteins or in vivo using yeast 2-hybrid method. Example of complex protein interactions will be presented on posttranslational modification by SUMO protein. Protein-DNA interactions will be monitored by electrophoretic mobility shift assay. To study mobile enzymes on a DNA, the ability of helicases to translocate on separate DNA strands will be monitored.

Osnova

• 1. Protein-protein interactions and post-translational modification a) pull-down b) sumoylation c) two-hybrid 2. Protein-DNA interaction and 2-hybrid a) EMSA b) 2-hybrid c) data evaluation 3. Protein-DNA interaction a) helicase assay b) data evluation

Literatura

• MEYERS., Robert A. Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine, 2nd Edition. 2004. ISBN 3-527-30545-9. info

Výukové metody

Each day will start with theoretical section describing the background and use of the individual methods. The students will be then divided in group of two and they will perform all tasks practically based on available protocol.

Metody hodnocení

Each practical course will be evaluated based on the written protocols including control question. To pass the practical course each students has to successfully complete 3/4 of all experiments.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• Bi8858 Příprava a charakterizace proteinů II - Biokatalýza a enzymové technologie
• Bi8858c Příprava a charakterizace proteinů II, cvičení
• Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace
• Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Informace učitele

Maximum 10 students can enroll the course.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C8857c Protein Preparation and Characterization III - practice

Rozsah

0/2/0. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.

Vyučující

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

It is highly recommended to participate in other courses that are part of Protein Preparation and Characterization.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10

Mateřské obory/plány

předmět má 11 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The practical course will focus on simple and basic methodology allowing students to monitor or characterize protein-mediated interactions. The spectrum of methods will include study of protein-protein interaction by in vitro pull-down assay using purified proteins or in vivo using yeast 2-hybrid method. Example of complex protein interactions will be presented on posttranslational modification by SUMO protein. Protein-DNA interactions will be monitored by electrophoretic mobility shift assay. To study mobile enzymes on a DNA, the ability of helicases to translocate on separate DNA strands will be monitored.

Osnova

• 1. Protein-protein interactions and post-translational modification a) pull-down b) sumoylation c) two-hybrid 2. Protein-DNA interaction and 2-hybrid a) EMSA b) 2-hybrid c) data evaluation 3. Protein-DNA interaction a) helicase assay b) data evluation

Literatura

• MEYERS., Robert A. Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine, 2nd Edition. 2004. ISBN 3-527-30545-9. info

Výukové metody

Each day will start with theoretical section describing the background and use of the individual methods. The students will be then divided in group of two and they will perform all tasks practically based on available protocol.

Metody hodnocení

Each practical course will be evaluated based on the written protocols including control question. To pass the practical course each students has to successfully complete 3/4 of all experiments.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• Bi8858 Příprava a charakterizace proteinů II - Biokatalýza a enzymové technologie
• Bi8858c Příprava a charakterizace proteinů II, cvičení
• Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace
• Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Informace učitele

Maximum 10 students can enroll the course.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C8857c Protein Preparation and Characterization III - practice

Rozsah

0/2/0. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.

Vyučující

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

It is highly recommended to participate in other courses that are part of Protein Preparation and Characterization.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10

Mateřské obory/plány

předmět má 11 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The practical course will focus on simple and basic methodology allowing students to monitor or characterize protein-mediated interactions. The spectrum of methods will include study of protein-protein interaction by in vitro pull-down assay using purified proteins or in vivo using yeast 2-hybrid method. Example of complex protein interactions will be presented on posttranslational modification by SUMO protein. Protein-DNA interactions will be monitored by electrophoretic mobility shift assay. To study mobile enzymes on a DNA, the ability of helicases to translocate on separate DNA strands will be monitored.

Osnova

• 1. Protein-protein interactions and post-translational modification a) pull-down b) sumoylation c) two-hybrid 2. Protein-DNA interaction and 2-hybrid a) EMSA b) 2-hybrid c) data evaluation 3. Protein-DNA interaction a) helicase assay b) data evluation

Literatura

• MEYERS., Robert A. Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine, 2nd Edition. 2004. ISBN 3-527-30545-9. info

Výukové metody

Each day will start with theoretical section describing the background and use of the individual methods. The students will be then divided in group of two and they will perform all tasks practically based on available protocol.

Metody hodnocení

Each practical course will be evaluated based on the written protocols including control question. To pass the practical course each students has to successfully complete 3/4 of all experiments.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• Bi8858 Příprava a charakterizace proteinů II - Biokatalýza a enzymové technologie
• Bi8858c Příprava a charakterizace proteinů II, cvičení
• Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace
• Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Informace učitele

Maximum 10 students can enroll the course.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C8857c Protein Preparation and Characterization III - practice

Rozsah

0/2/0. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.

Vyučující

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

It is highly recommended to participate in other courses that are part of Protein Preparation and Characterization.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10

Mateřské obory/plány

předmět má 11 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The practical course will focus on simple and basic methodology allowing students to monitor or characterize protein-mediated interactions. The spectrum of methods will include study of protein-protein interaction by in vitro pull-down assay using purified proteins or in vivo using yeast 2-hybrid method. Example of complex protein interactions will be presented on posttranslational modification by SUMO protein. Protein-DNA interactions will be monitored by electrophoretic mobility shift assay. To study mobile enzymes on a DNA, the ability of helicases to translocate on separate DNA strands will be monitored.

Osnova

• 1. Protein-protein interactions and post-translational modification a) pull-down b) sumoylation c) two-hybrid 2. Protein-DNA interaction and 2-hybrid a) EMSA b) 2-hybrid c) data evaluation 3. Protein-DNA interaction a) helicase assay b) data evluation

Literatura

• MEYERS., Robert A. Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine, 2nd Edition. 2004. ISBN 3-527-30545-9. info

Výukové metody

Each day will start with theoretical section describing the background and use of the individual methods. The students will be then divided in group of two and they will perform all tasks practically based on available protocol.

Metody hodnocení

Each practical course will be evaluated based on the written protocols including control question. To pass the practical course each students has to successfully complete 3/4 of all experiments.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• Bi8858 Příprava a charakterizace proteinů II - Biokatalýza a enzymové technologie
• Bi8858c Příprava a charakterizace proteinů II, cvičení
• Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace
• Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Informace učitele

Maximum 10 students can enroll the course.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C8857c Protein Preparation and Characterization III - practice

Rozsah

0/2/0. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

It is highly recommended to participate in other courses that are part of Protein Preparation and Characterization.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10

Mateřské obory/plány

předmět má 11 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The practical course will focus on simple and basic methodology allowing students to monitor or characterize protein-mediated interactions. The spectrum of methods will include study of protein-protein interaction by in vitro pull-down assay using purified proteins or in vivo using yeast 2-hybrid method. Example of complex protein interactions will be presented on posttranslational modification by SUMO protein. Protein-DNA interactions will be monitored by electrophoretic mobility shift assay. To study mobile enzymes on a DNA, the ability of helicases to translocate on separate DNA strands will be monitored.

Osnova

• 1. Protein-protein interactions and post-translational modification a) pull-down b) sumoylation c) two-hybrid 2. Protein-DNA interaction and 2-hybrid a) EMSA b) 2-hybrid c) data evaluation 3. Protein-DNA interaction a) helicase assay b) data evluation

Literatura

• MEYERS., Robert A. Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine, 2nd Edition. 2004. ISBN 3-527-30545-9. info

Výukové metody

Each day will start with theoretical section describing the background and use of the individual methods. The students will be then divided in group of two and they will perform all tasks practically based on available protocol.

Metody hodnocení

Each practical course will be evaluated based on the written protocols including control question. To pass the practical course each students has to successfully complete 3/4 of all experiments.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• Bi8858 Příprava a charakterizace proteinů II - Biokatalýza a enzymové technologie
• Bi8858c Příprava a charakterizace proteinů II, cvičení
• Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace
• Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Informace učitele

Maximum 10 students can enroll the course.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C8857c Protein Preparation and Characterization III - practice

Rozsah

0/2/0. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

It is highly recommended to participate in other courses that are part of Protein Preparation and Characterization.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10

Mateřské obory/plány

předmět má 11 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The practical course will focus on simple and basic methodology allowing students to monitor or characterize protein-mediated interactions. The spectrum of methods will include study of protein-protein interaction by in vitro pull-down assay using purified proteins or in vivo using yeast 2-hybrid method. Example of complex protein interactions will be presented on posttranslational modification by SUMO protein. Protein-DNA interactions will be monitored by electrophoretic mobility shift assay. To study mobile enzymes on a DNA, the ability of helicases to translocate on separate DNA strands will be monitored.

Osnova

• 1. Protein-protein interactions and post-translational modification a) pull-down b) sumoylation c) two-hybrid 2. Protein-DNA interaction and 2-hybrid a) EMSA b) 2-hybrid c) data evaluation 3. Protein-DNA interaction a) helicase assay b) data evluation

Literatura

• MEYERS., Robert A. Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine, 2nd Edition. 2004. ISBN 3-527-30545-9. info

Výukové metody

Each day will start with theoretical section describing the background and use of the individual methods. The students will be then divided in group of two and they will perform all tasks practically based on available protocol.

Metody hodnocení

Each practical course will be evaluated based on the written protocols including control question. To pass the practical course each students has to successfully complete 3/4 of all experiments.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• Bi8858 Příprava a charakterizace proteinů II - Biokatalýza a enzymové technologie
• Bi8858c Příprava a charakterizace proteinů II, cvičení
• Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace
• Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Informace učitele

Maximum 10 students can enroll the course.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C8857c Protein Preparation and Characterization III - practice

Rozsah

0/2/0. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

It is highly recommended to participate in other courses that are part of Protein Preparation and Characterization.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10

Mateřské obory/plány

předmět má 11 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The practical course will focus on simple and basic methodology allowing students to monitor or characterize protein-mediated interactions. The spectrum of methods will include study of protein-protein interaction by in vitro pull-down assay using purified proteins or in vivo using yeast 2-hybrid method. Example of complex protein interactions will be presented on posttranslational modification by SUMO protein. Protein-DNA interactions will be monitored by electrophoretic mobility shift assay. To study mobile enzymes on a DNA, the ability of helicases to translocate on separate DNA strands will be monitored.

Osnova

• 1. Protein-protein interactions and post-translational modification a) pull-down b) sumoylation c) two-hybrid 2. Protein-DNA interaction and 2-hybrid a) EMSA b) 2-hybrid c) data evaluation 3. Protein-DNA interaction a) helicase assay b) data evluation

Literatura

• MEYERS., Robert A. Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine, 2nd Edition. 2004. ISBN 3-527-30545-9. info

Výukové metody

Each day will start with theoretical section describing the background and use of the individual methods. The students will be then divided in group of two and they will perform all tasks practically based on available protocol.

Metody hodnocení

Each practical course will be evaluated based on the written protocols including control question. To pass the practical course each students has to successfully complete 3/4 of all experiments.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• Bi8858 Příprava a charakterizace proteinů II - Biokatalýza a enzymové technologie
• Bi8858c Příprava a charakterizace proteinů II, cvičení
• Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace
• Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Informace učitele

Maximum 10 students can enroll the course.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C8857c Protein Preparation and Characterization III - practice

Rozsah

0/2/0. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

It is highly recommended to participate in other courses that are part of Protein Preparation and Characterization.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10

Mateřské obory/plány

předmět má 11 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The practical course will focus on simple and basic methodology allowing students to monitor or characterize protein-mediated interactions. The spectrum of methods will include study of protein-protein interaction by in vitro pull-down assay using purified proteins or in vivo using yeast 2-hybrid method. Example of complex protein interactions will be presented on posttranslational modification by SUMO protein. Protein-DNA interactions will be monitored by electrophoretic mobility shift assay. To study mobile enzymes on a DNA, the ability of helicases to translocate on separate DNA strands will be monitored.

Osnova

• 1. Protein-protein interactions and post-translational modification a) pull-down b) sumoylation c) two-hybrid 2. Protein-DNA interaction and 2-hybrid a) EMSA b) 2-hybrid c) data evaluation 3. Protein-DNA interaction a) helicase assay b) data evluation

Literatura

• MEYERS., Robert A. Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine, 2nd Edition. 2004. ISBN 3-527-30545-9. info

Výukové metody

Each day will start with theoretical section describing the background and use of the individual methods. The students will be then divided in group of two and they will perform all tasks practically based on available protocol.

Metody hodnocení

Each practical course will be evaluated based on the written protocols including control question. To pass the practical course each students has to successfully complete 3/4 of all experiments.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• Bi8858 Příprava a charakterizace proteinů II - Biokatalýza a enzymové technologie
• Bi8858c Příprava a charakterizace proteinů II, cvičení
• Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace
• Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Informace učitele

Maximum 10 students can enroll the course.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C8857c Protein Preparation and Characterization III - practice

Rozsah

0/2/0. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

It is highly recommended to participate in other courses that are part of Protein Preparation and Characterization.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10

Mateřské obory/plány

předmět má 11 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The practical course will focus on simple and basic methodology allowing students to monitor or characterize protein-mediated interactions. The spectrum of methods will include study of protein-protein interaction by in vitro pull-down assay using purified proteins or in vivo using yeast 2-hybrid method. Example of complex protein interactions will be presented on posttranslational modification by SUMO protein. Protein-DNA interactions will be monitored by electrophoretic mobility shift assay. To study mobile enzymes on a DNA, the ability of helicases to translocate on separate DNA strands will be monitored.

Osnova

• 1. Protein-protein interactions and post-translational modification a) pull-down b) sumoylation c) two-hybrid 2. Protein-DNA interaction and 2-hybrid a) EMSA b) 2-hybrid c) data evaluation 3. Protein-DNA interaction a) helicase assay b) data evluation

Literatura

• MEYERS., Robert A. Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine, 2nd Edition. 2004. ISBN 3-527-30545-9. info

Výukové metody

Each day will start with theoretical section describing the background and use of the individual methods. The students will be then divided in group of two and they will perform all tasks practically based on available protocol.

Metody hodnocení

Each practical course will be evaluated based on the written protocols including control question. To pass the practical course each students has to successfully complete 3/4 of all experiments.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• Bi8858 Příprava a charakterizace proteinů II - Biokatalýza a enzymové technologie
• Bi8858c Příprava a charakterizace proteinů II, cvičení
• Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace
• Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Informace učitele

Maximum 10 students can enroll the course.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C8857c Protein Preparation and Characterization III - practice

Rozsah

0/2/0. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

It is highly recommended to participate in other courses that are part of Protein Preparation and Characterization.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10

Mateřské obory/plány

předmět má 10 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The practical course will focus on simple and basic methodology allowing students to monitor or characterize protein-mediated interactions. The spectrum of methods will include study of protein-protein interaction by in vitro pull-down assay using purified proteins or in vivo using yeast 2-hybrid method. Example of complex protein interactions will be presented on posttranslational modification by SUMO protein. Protein-DNA interactions will be monitored by electrophoretic mobility shift assay. To study mobile enzymes on a DNA, the ability of helicases to translocate on separate DNA strands will be monitored.

Osnova

• 1. Protein-protein interactions and post-translational modification a) pull-down b) sumoylation c) two-hybrid 2. Protein-DNA interaction and 2-hybrid a) EMSA b) 2-hybrid c) data evaluation 3. Protein-DNA interaction a) helicase assay b) data evluation

Literatura

• MEYERS., Robert A. Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine, 2nd Edition. 2004. ISBN 3-527-30545-9. info

Výukové metody

Each day will start with theoretical section describing the background and use of the individual methods. The students will be then divided in group of two and they will perform all tasks practically based on available protocol.

Metody hodnocení

Each practical course will be evaluated based on the written protocols including control question. To pass the practical course each students has to successfully complete 3/4 of all experiments.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• Bi8858 Příprava a charakterizace proteinů II - Biokatalýza a enzymové technologie
• Bi8858c Příprava a charakterizace proteinů II, cvičení
• Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace
• Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Informace učitele

Maximum 10 students can enroll the course.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C8857c Protein Preparation and Characterization III - practice

Rozsah

0/2/0. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

It is highly recommended to participate in other courses that are part of Protein Preparation and Characterization.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10

Mateřské obory/plány

předmět má 10 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The practical course will focus on simple and basic methodology allowing students to monitor or characterize protein-mediated interactions. The spectrum of methods will include study of protein-protein interaction by in vitro pull-down assay using purified proteins or in vivo using yeast 2-hybrid method. Example of complex protein interactions will be presented on posttranslational modification by SUMO protein. Protein-DNA interactions will be monitored by electrophoretic mobility shift assay. To study mobile enzymes on a DNA, the ability of helicases to translocate on separate DNA strands will be monitored.

Osnova

• 1. Protein-protein interactions and post-translational modification a) pull-down b) sumoylation c) two-hybrid 2. Protein-DNA interaction and 2-hybrid a) EMSA b) 2-hybrid c) data evaluation 3. Protein-DNA interaction a) helicase assay b) data evluation

Literatura

• MEYERS., Robert A. Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine, 2nd Edition. 2004. ISBN 3-527-30545-9. info

Výukové metody

Each day will start with theoretical section describing the background and use of the individual methods. The students will be then divided in group of two and they will perform all tasks practically based on available protocol.

Metody hodnocení

Each practical course will be evaluated based on the written protocols including control question. To pass the practical course each students has to successfully complete 3/4 of all experiments.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• Bi8858 Příprava a charakterizace proteinů II - Biokatalýza a enzymové technologie
• Bi8858c Příprava a charakterizace proteinů II, cvičení
• Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace
• Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Informace učitele

Maximum 10 students can enroll the course.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C8857c Protein Preparation and Characterization III - practice

Předmět se v období jaro 2025 nevypisuje.

Rozsah

0/2/0. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.

Vyučující

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

It is highly recommended to participate in other courses that are part of Protein Preparation and Characterization.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10

Mateřské obory/plány

předmět má 11 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The practical course will focus on simple and basic methodology allowing students to monitor or characterize protein-mediated interactions. The spectrum of methods will include study of protein-protein interaction by in vitro pull-down assay using purified proteins or in vivo using yeast 2-hybrid method. Example of complex protein interactions will be presented on posttranslational modification by SUMO protein. Protein-DNA interactions will be monitored by electrophoretic mobility shift assay. To study mobile enzymes on a DNA, the ability of helicases to translocate on separate DNA strands will be monitored.

Osnova

• 1. Protein-protein interactions and post-translational modification a) pull-down b) sumoylation c) two-hybrid 2. Protein-DNA interaction and 2-hybrid a) EMSA b) 2-hybrid c) data evaluation 3. Protein-DNA interaction a) helicase assay b) data evluation

Literatura

• MEYERS., Robert A. Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine, 2nd Edition. 2004. ISBN 3-527-30545-9. info

Výukové metody

Each day will start with theoretical section describing the background and use of the individual methods. The students will be then divided in group of two and they will perform all tasks practically based on available protocol.

Metody hodnocení

Each practical course will be evaluated based on the written protocols including control question. To pass the practical course each students has to successfully complete 3/4 of all experiments.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• Bi8858 Příprava a charakterizace proteinů II - Biokatalýza a enzymové technologie
• Bi8858c Příprava a charakterizace proteinů II, cvičení
• Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace
• Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Informace učitele

Maximum 10 students can enroll the course.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C8857c Protein Preparation and Characterization III - practice

Předmět se v období jaro 2019 nevypisuje.

Rozsah

0/2/0. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.

Vyučující

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

It is highly recommended to participate in other courses that are part of Protein Preparation and Characterization.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10

Mateřské obory/plány

předmět má 11 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The practical course will focus on simple and basic methodology allowing students to monitor or characterize protein-mediated interactions. The spectrum of methods will include study of protein-protein interaction by in vitro pull-down assay using purified proteins or in vivo using yeast 2-hybrid method. Example of complex protein interactions will be presented on posttranslational modification by SUMO protein. Protein-DNA interactions will be monitored by electrophoretic mobility shift assay. To study mobile enzymes on a DNA, the ability of helicases to translocate on separate DNA strands will be monitored.

Osnova

• 1. Protein-protein interactions and post-translational modification a) pull-down b) sumoylation c) two-hybrid 2. Protein-DNA interaction and 2-hybrid a) EMSA b) 2-hybrid c) data evaluation 3. Protein-DNA interaction a) helicase assay b) data evluation

Literatura

• MEYERS., Robert A. Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine, 2nd Edition. 2004. ISBN 3-527-30545-9. info

Výukové metody

Each day will start with theoretical section describing the background and use of the individual methods. The students will be then divided in group of two and they will perform all tasks practically based on available protocol.

Metody hodnocení

Each practical course will be evaluated based on the written protocols including control question. To pass the practical course each students has to successfully complete 3/4 of all experiments.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• Bi8858 Příprava a charakterizace proteinů II - Biokatalýza a enzymové technologie
• Bi8858c Příprava a charakterizace proteinů II, cvičení
• Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace
• Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Informace učitele

Maximum 10 students can enroll the course.

Další komentáře

Předmět již není vypisován.
Výuka probíhá blokově.

C8857c Protein Preparation and Characterization III - practice

Předmět se v období jaro 2018 nevypisuje.

Rozsah

0/2/0. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.

Vyučující

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

It is highly recommended to participate in other courses that are part of Protein Preparation and Characterization.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10

Mateřské obory/plány

předmět má 11 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The practical course will focus on simple and basic methodology allowing students to monitor or characterize protein-mediated interactions. The spectrum of methods will include study of protein-protein interaction by in vitro pull-down assay using purified proteins or in vivo using yeast 2-hybrid method. Example of complex protein interactions will be presented on posttranslational modification by SUMO protein. Protein-DNA interactions will be monitored by electrophoretic mobility shift assay. To study mobile enzymes on a DNA, the ability of helicases to translocate on separate DNA strands will be monitored.

Osnova

• 1. Protein-protein interactions and post-translational modification a) pull-down b) sumoylation c) two-hybrid 2. Protein-DNA interaction and 2-hybrid a) EMSA b) 2-hybrid c) data evaluation 3. Protein-DNA interaction a) helicase assay b) data evluation

Literatura

• MEYERS., Robert A. Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine, 2nd Edition. 2004. ISBN 3-527-30545-9. info

Výukové metody

Each day will start with theoretical section describing the background and use of the individual methods. The students will be then divided in group of two and they will perform all tasks practically based on available protocol.

Metody hodnocení

Each practical course will be evaluated based on the written protocols including control question. To pass the practical course each students has to successfully complete 3/4 of all experiments.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• Bi8858 Příprava a charakterizace proteinů II - Biokatalýza a enzymové technologie
• Bi8858c Příprava a charakterizace proteinů II, cvičení
• Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace
• Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Informace učitele

Maximum 10 students can enroll the course.

Další komentáře

Předmět již není vypisován.
Výuka probíhá blokově.

C8857c Protein Preparation and Characterization III - practice

Předmět se v období jaro 2017 nevypisuje.

Rozsah

0/2/0. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

It is highly recommended to participate in other courses that are part of Protein Preparation and Characterization.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10

Mateřské obory/plány

předmět má 11 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The practical course will focus on simple and basic methodology allowing students to monitor or characterize protein-mediated interactions. The spectrum of methods will include study of protein-protein interaction by in vitro pull-down assay using purified proteins or in vivo using yeast 2-hybrid method. Example of complex protein interactions will be presented on posttranslational modification by SUMO protein. Protein-DNA interactions will be monitored by electrophoretic mobility shift assay. To study mobile enzymes on a DNA, the ability of helicases to translocate on separate DNA strands will be monitored.

Osnova

• 1. Protein-protein interactions and post-translational modification a) pull-down b) sumoylation c) two-hybrid 2. Protein-DNA interaction and 2-hybrid a) EMSA b) 2-hybrid c) data evaluation 3. Protein-DNA interaction a) helicase assay b) data evluation

Literatura

• MEYERS., Robert A. Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine, 2nd Edition. 2004. ISBN 3-527-30545-9. info

Výukové metody

Each day will start with theoretical section describing the background and use of the individual methods. The students will be then divided in group of two and they will perform all tasks practically based on available protocol.

Metody hodnocení

Each practical course will be evaluated based on the written protocols including control question. To pass the practical course each students has to successfully complete 3/4 of all experiments.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• Bi8858 Příprava a charakterizace proteinů II - Biokatalýza a enzymové technologie
• Bi8858c Příprava a charakterizace proteinů II, cvičení
• Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace
• Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Informace učitele

Maximum 10 students can enroll the course.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C8857c Protein Preparation and Characterization III - practice

Údaje z období jaro 2012 - akreditace se nezveřejňují

Rozsah

0/2/0. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

It is highly recommended to participate in other courses that are part of Protein Preparation and Characterization.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10

Mateřské obory/plány

předmět má 10 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The practical course will focus on simple and basic methodology allowing students to monitor or characterize protein-mediated interactions. The spectrum of methods will include study of protein-protein interaction by in vitro pull-down assay using purified proteins or in vivo using yeast 2-hybrid method. Example of complex protein interactions will be presented on posttranslational modification by SUMO protein. Protein-DNA interactions will be monitored by electrophoretic mobility shift assay. To study mobile enzymes on a DNA, the ability of helicases to translocate on separate DNA strands will be monitored.

Osnova

• 1. Protein-protein interactions and post-translational modification a) pull-down b) sumoylation c) two-hybrid 2. Protein-DNA interaction and 2-hybrid a) EMSA b) 2-hybrid c) data evaluation 3. Protein-DNA interaction a) helicase assay b) data evluation

Literatura

• MEYERS., Robert A. Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine, 2nd Edition. 2004. ISBN 3-527-30545-9. info

Výukové metody

Each day will start with theoretical section describing the background and use of the individual methods. The students will be then divided in group of two and they will perform all tasks practically based on available protocol.

Metody hodnocení

Each practical course will be evaluated based on the written protocols including control question. To pass the practical course each students has to successfully complete 3/4 of all experiments.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• Bi8858 Příprava a charakterizace proteinů II - Biokatalýza a enzymové technologie
• Bi8858c Příprava a charakterizace proteinů II, cvičení
• Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace
• Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Informace učitele

Maximum 10 students can enroll the course.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C8857c Protein Preparation and Characterization III - practice

Rozsah

0/2/0. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

It is highly recommended to participate in other courses that are part of Protein Preparation and Characterization.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10

Mateřské obory/plány

předmět má 10 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The practical course will focus on simple and basic methodology allowing students to monitor or characterize protein-mediated interactions. The spectrum of methods will include study of protein-protein interaction by in vitro pull-down assay using purified proteins or in vivo using yeast 2-hybrid method. Example of complex protein interactions will be presented on posttranslational modification by SUMO protein. Protein-DNA interactions will be monitored by electrophoretic mobility shift assay. To study mobile enzymes on a DNA, the ability of helicases to translocate on separate DNA strands will be monitored.

Osnova

• 1. Protein-protein interactions and post-translational modification a) pull-down b) sumoylation c) two-hybrid 2. Protein-DNA interaction and 2-hybrid a) EMSA b) 2-hybrid c) data evaluation 3. Protein-DNA interaction a) helicase assay b) data evluation

Literatura

• MEYERS., Robert A. Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine, 2nd Edition. 2004. ISBN 3-527-30545-9. info

Výukové metody

Each day will start with theoretical section describing the background and use of the individual methods. The students will be then divided in group of two and they will perform all tasks practically based on available protocol.

Metody hodnocení

Each practical course will be evaluated based on the written protocols including control question. To pass the practical course each students has to successfully complete 3/4 of all experiments.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• Bi8858 Příprava a charakterizace proteinů II - Biokatalýza a enzymové technologie
• Bi8858c Příprava a charakterizace proteinů II, cvičení
• Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace
• Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Informace učitele

Maximum 10 students can enroll the course.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

• Statistika zápisu (nejnovější)