C6270 Metody separace proteinů - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2005
Rozsah
0/0/3. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Oldřich Janiczek, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Oldřich Janiczek, CSc.
Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
C6270/01: Út 13:00–15:50 Kontaktujte učitele, O. Janiczek
C6270/02: Po 7:00–9:50 Kontaktujte učitele, O. Janiczek
C6270/03: Út 10:00–12:50 Kontaktujte učitele, O. Janiczek
C6270/04: Čt 11:00–13:50 Kontaktujte učitele, O. Janiczek
Předpoklady
( C3580 Biochemie && ( C3600 Biochemie-lab.cvič. || C3620 Biochemie-lab.cvič. ))
Základní znalosti z obecné biochemie získané absolvováním přednášek Biochemie I (C3181) nebo Biochemie (3580) a přednášky Metody separace proteinů (C6260).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem toho cvičení je, aby studenti získali základní znalosti o separačních metodách využívaných v biochemii a molekulární biologii pro purifikaci bílkovin. První část je věnována úvodním metodám práce se vzorky biologického materiálu jako jsou extrakce, cemtrifugace, srážení, ultrafiltrace a lyofilizace. Další část je věnována chromatografickým metodám. V poslední části jsou podány infromace o elektromigračních metodách.
Osnova
  • 1.Úvod. Zásady práce s biologickým materiálem. Strategie a plánování . 2.Desintegrace tkání a buněk.Centrifugace a sedimentační analýza. 3.Fázové separace. Srážení a extrakce. Membránové separace. 4.Zahušťování a sušení. Úprava vody. 5.Chromatografické metody. Obecné principy a charakteristiky. 6.Chromatografie adsorpční a rozdělovací. 7.Iontoměničová chromatografie, chromatofokusace. 8.Chromatografie reverzně fázová a spojení s ESI-MS. Analýza tryptického digestu proteinu. 9.Chromatografie gelová. 10.Chromatografie afinitní. 11.Elektromigrační metody. Obecné charakteristiky a vlivy. 12.Elektroforesa volná a zónová 13.Izoelektrická fokusace. 14.Isotachoforesa.
Literatura
  • ANZENBACHER, Pavel a Jan KOVÁŘ. Metody chemického výzkumu pro biochemiky. 1. vyd. Praha: Ministerstvo školství ČSR, 1986, 199 s. info
  • Guide to protein purification. Edited by Murray P. Deutscher. San Diego: Academic Press, 1990, xiii, 894. ISBN 0-12-213585-7. info
  • Protein purification methods : a practical approach. Edited by E. L. V. Harris - S. Angal. Oxford: Oxford University Press, 1989, xvi, 317. ISBN 0199630038. info
  • A practical guide to membrane protein purification. Edited by Gebhard von Jagow - Hermann Schägger. San Diego: Academic Press, 1994, 166 s. ISBN 0127255508. info
Metody hodnocení
Zápočet je udělován na základě absolvování předepsaného počtu cvičení.
Navazující předměty
Informace učitele
http://orion.chemi.muni.cz/biochem/student.htm
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2011 - akreditace, jaro 2001, jaro 2002, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022.