Bi7921 Vybrané metody analýzy biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2011 - akreditace
Rozsah
0/2. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (cvičící)
Mgr. David Zelený, Ph.D. (cvičící)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz && Bi8190 Vizualizace biologických dat && Bi7920 Analýza dat && Bi7540 Zprac. dat ekol. společenstev
Základní biostatistické metody, obecný lineární model, zobecněný lineární model.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem přednášky je představit vybrané metody pokročilé analýzy dat, zaměřené na analýzu korelovaných dat.
Osnova
  • 1) Korelované data. 2) Experimentální design: Nested, Split-plot, Pseudoreplikace. 3) Analýza časových řad. 4) Prostorová analýza. 5) Smíšené modely: GLS, LME a GEE. 6) Fylogenetické korekce.
Metody hodnocení
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů. Zkoušení je průběžné - v podobě řešení domácích úkolů. Návštěva přednášek je doporučená.
Informace učitele
Literatura: Crawley M. J. 2002. Statistical Computing. An Introduction to Data Analysis using S-Plus. Chichester:John Wiley & Sons. Pinheiro J.C. & Bates D.M. 2000. Mixed-Effects Models in S and S-PLUS. New York: Springer Verlag. Venables W.N. & Ripley B.D. 2002. Modern Applied Statistics with S, New York: Springer-Verlag.
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2017, jaro 2019, jaro 2021, jaro 2023, jaro 2025.