PřF:C7175 Diagnostika DNA - Informace o předmětu
C7175 DNA diagnostika
Přírodovědecká fakultajaro 2019
- Rozsah
- 2/0/0. 4 kr. Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Omar Šerý, Ph.D. (přednášející) - Garance
- prof. RNDr. Omar Šerý, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta - Rozvrh
- Po 18. 2. až Pá 17. 5. St 17:00–18:50 B11/205
- Předpoklady
- Bez předpokladů.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- Aplikovaná biochemie (program PřF, B-AB)
- Aplikovaná biochemie (program PřF, B-CH)
- Biochemie (program PřF, M-CH)
- Biochemie (program PřF, N-BCH)
- Biochemie (program PřF, N-BCH3)
- Biochemie (program PřF, N-CH)
- Biologie (program PřF, N-BI)
- Cíle předmětu
- Cílem cyklu přednášek je seznámení se současnými trendy a využitím DNA diagnostiky v praxi
- Výstupy z učení
- Studenti budou na konci kurzu rozumět principům metody PCR, RealTime PCR, sekvenování, sekvenování nové generace, restrkičním analýzám, práci s DNA databázemi, legislativě Evropské unie týkající se zdravotnických prostředků in vitro, využití DNA diagnostiky v medicínské praxi. Studenti budou mít teoretické znalosti o metodách používaných v klinických laboratořích za účelem DNA diagnostiky bakteriálních a virových patogenů.
- Osnova
- 1. Obecný úvod, historie DNA diagnostiky (objevení struktury DNA, objevení principu PCR), struktura a funkce DNA, replikace, transkripce, translace 2. Klonování DNA, DNA knihovny, sekvenování DNA, blotování, databáze DNA, vyhledávání v databázích DNA 3. Princip řetězové polymerázové reakce tzv. master mixy, templátová DNA, primery, pufr, dNTP, DNA polymeráza, kroky PCR, termocyklér, metody množení DNA in vitro bez použití DNA polymerázy 4. Detekce amplifikované DNA, agarózové gely, polyakrylamidové gely, elektroforéza, blotování, imunochromatografie, PCR in situ, ELISA metody, restrikční analýza 5. Real Time PCR, princip, sybrgreen, TaqMan, molecular bacons, detekce bodových polymorfizmů, kvantifikace 6. DNA diagnostika v lékařství: legislativní požadavky na in vitro diagnostické zdravotnické prostředky, mikrobiologie, virologie, parazitologie: praktické využití DNA diagnostiky v přímé detekci mikroorganizmů. Detekce MTB, borélií, chlamydií, HIV, virových hepatitid, herpetických virů atd. 7. DNA diagnostika v zemědělství a lesnictví, detekce václavky v půdě, využití PCR v kvantifikaci mRNA při výzkumu tabáku 8. DNA diagnostika v potravinářství: diagnostika geneticky modifikovaných organizmů v potravinách, druhová specifikace masných výrobků, sýrů, evropská legislativa týkající se GMO
- Literatura
- doporučená literatura
- Manual of commercial methods in clinical microbiology. Edited by Allan L. Truant. Washington: ASM Press, 2002, xix, 481 s. ISBN 1-55581-189-2. info
- RAPLEY, Ralph. The nucleic acid protocols : handbook. Totowa, New Jersey: Humana Press, 1999, xxii, 1050. ISBN 0-89603-459-3. info
- Výukové metody
- Výukové metody zahrnují jednak přednášky s PowerPointovou prezentací, jednak samostudium doporučené literatury.
- Metody hodnocení
- Ústní zkouška
- Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně. - Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
- Statistika zápisu (jaro 2019, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2019/C7175