C8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2020
Rozsah
0/2. blok 5 dnů. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: z.
Vyučující
RNDr. Lubomír Janda, Ph.D. (přednášející)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
C8980 Exprese a purifikace proteinů || NOW( C8980 Exprese a purifikace proteinů )
Předpokladem pro porozumění předmětu je znalost základů biochemie nebo molekulární biologie.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
předmět má 19 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Student po absolvování praktického cvičení je schopen samostatně použít expresní systém pro produkci proteinu, vybrat vhodnou purifikační metodu a analyzovat získané výsledky.
Výstupy z učení
Po absolvování laboratorního cvičení jsou studenti schopni: - navrhnout klonovací strategii - exprimovat protein v heterologním prokaryotickém systému - purifikovat protein (srážení proteinů, afinitní, iontově výměnná a gelová permeační chromatografie) - analýza funkce a čistoty proteinů.
Osnova
  • 1. Bioinformatika a teoretická lekce klonování DNA. 2. Exprese proteinů v bakteriích. 3. Dezintegrace buněk. 4. Purifikace. 5. SDS-PAGE. 6. Měření aktivity proteinů.
Literatura
    doporučená literatura
  • HARDIN, Charles. Cloning, gene expression and protein purification : experimental procedures and process rationale. New York: Oxford University Press, 2001, viii, 435. ISBN 0195132947. info
  • Guide to protein purification. Edited by Richard R. Burgess - Murray P. Deutscher. 2nd ed. Boston: Elsevier/Academic Press, 2009, liii, 851. ISBN 9780123749789. info
Výukové metody
Laboratorní cvičení
Metody hodnocení
Vypracovaný protokol, prezentace získaných výsledků
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2012, podzim 2013, podzim 2014, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.