C8950 NMR - Strukturní analýza

Přírodovědecká fakulta
jaro 2024
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
Vyučující
prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 19. 2. až Ne 26. 5. Po 15:00–16:50 B11/335
Předpoklady
absolvování předmětů fyzikální a organická chemie, fyzika
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
NMR spektroskopie jako jedna z nejdůležitějších strukturně-analytických metod zaujímá významné místo ve výzbroji každého chemika. Předmět NMR strukturní analýza by měl absolventovi umožnit základní orientaci v problematice řešení struktury přírodních produktů a organických sloučenin pomocí vysokorozlišovací NMR spektroskopie. Hlavní důraz je kladen na interpretaci a extrakci informací ze základních typů 2D spekter (COSY, NOESY, HSQC, HMBC).
Výstupy z učení
Po absolvování předmětu bude student schopen:
- navrhnout 1D a 2D NMR experimenty vhodné pro řešení daného strukturního problému;
- popsat princip jednotlivých NMR technik;
- porovnat a vyzdvihnout rozdíly v jednotlivých NMR korelačních experimentech;
- vysvětlit význam základních NMR parametrů;
- interpretovat vícedimenzionální NMR spektra středně komplikovaných organických molekul, přírodních látek a jednoduchých biomakromolekul.
Osnova
  • 1. Některé aspekty NMR - úvod, metody magnetické rezonance, vznik NMR signálu, typy jaderných interakcí, chemický posun, interakční konstanta, příklady, Fourierova transformace - relaxace jader (inversion recovery), selektivní excitace, potlačení signálu rozpouštědla, NOE; 2. Konstrukce spektrometrů - magnety, sondy, kyvety a propojení s HPLC, MS; 3. Editační techniky - spinové echo, APT - přenos polarizace, INEPT, DEPT; 4. NMR spektroskopie ve více dimenzích - homonukleární korelace - korelační spektroskopie (COSY) - interakce dalekého dosahu (LR-COSY, Relayed COSY) - TOCSY; 5. Heteronukleární korelace - jednovazebné (HETCOR) - dalekého dosahu (LR-HETCOR, COLOC); 6. Měření J konstant - J spektroskopie - jiné techniky-korelace chemických posunů, časová doména; 7. Interakce dipól-dipól - selektivní NOE - 2D NOESY; 8. Vícekvantová spektroskopie - MQF-COSY - INADEQUATE; 9. NMR spektroskopie jiných jader než 1H a 13C - 15N, 31P, 77Se (19F, 29Si, , 111Cd a 113Cd, 117Sn a 119Sn, 125Te, 195Pt a 207Pb); 10. Inverzní experimenty - jednovazebné (HMQC, HSQC) - dalekého dosahu (HMBC, HSQC) - kombinované techniky (HMQC-TOCSY, HSQC-TOCSY, HSQC-NOESY; 11. Gradientní NMR spektroskopie - homokorelační spektroskopie - NOESY - heterokorelační inverzní metodiky; 12. Nepřímá spin-spinová interakce a přímá interakce dipól-dipól - informace pro řešení prostorové struktury molekul - J konstanty a informace o dihedrálních úhlech - NOE a meziatomové vzdálenosti - vstupní data pro molekulovou mechaniku; 13. Praktické aspekty - typy sond, logická struktura analýzy, citlivost experimentů; 14. Praktické příklady a interpretace spekter
Literatura
    povinná literatura
  • CLARIDGE, Timothy D. W. High-resolution NMR techniques in organic chemistry. 1st ed. Amsterdam: Elsevier, 1999, xiv, 382. ISBN 0080427995. info
  • KEELER, James. Understanding NMR spectroscopy. 2nd ed. Chichester: John Wiley and Sons, 2010, xiii, 511. ISBN 9780470746080. info
    doporučená literatura
  • RAHMAN, Atta-ur-. Solving problems with NMR spectroscopy. Edited by Muhammad Iqbal Choudhary. San Diego: Academic Press, 1995, xvi, 430. ISBN 0120663201. info
  • RAHMAN, Atta-ur-. One and Two Dimensional NMR Spectroscopy. 1. vyd. Amsterdam: Elsevier Science Publishers B.V., 1989, 578 s. ISBN 0444873163. info
  • BREITMAIER, Eberhard. Structure elucidation by NMR in organic chemistry : a practical guide. Translated by Julia Wade. Chichester: John Wiley & Sons, 1993, 265 s. ISBN 0471933813. info
Výukové metody
Přednášky
Metody hodnocení
výuka probíhá každý týden, zakončení zkouškou s písemnou event. ústní částí.
Navazující předměty
Informace učitele
Doporučený zápis souběžného semináře C8953.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2000, jaro 2001, jaro 2002, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2025.