C9085 Protein-RNA interactions

Přírodovědecká fakulta
jaro 2024
Rozsah
1/0/0. 1 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 19. 2. až Ne 26. 5. Pá 9:00–9:50 C04/211
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
The course will provide an overview on how proteins interact with RNAs. Different modes of interactions as well as their importance for biological functions will be discussed. In addition, the course will highlight advantages and disadvantages of various techniques when applied to protein-RNA complexes.
Výstupy z učení
At the end of the course students should be able to understand and explain how proteins interact with RNAs. Different modes of interactions as well as their importance for biological functions will be discussed. In addition, the course will highlight advantages and disadvantages of various techniques when applied to protein-RNA complexes.
Osnova
  • 1. A Brief introduction to chemical structure of RNAs and proteins 2. A Brief introduction to basic structural motifs of RNAs and proteins 3. Introduction to protein-RNA interactions 4. RNA sequence-dependent recognition by proteins 5. RNA structure-dependent recognition by proteins 6. Experimental methods for structural determination of protein-RNA complexes 7. Biochemical methods for characterization of protein-RNA complexes 8. Known mechanistic pictures on how the interactions between Proteins and RNAs mediate gene expression and its regulation.
Literatura
  • VOET, Donald a Judith G. VOET. Biochemistry. 3rd ed. Hoboken: John Wiley & Sons, 2004, xv, 1591. ISBN 0471392235. info
Výukové metody
lectures & class discussions
Metody hodnocení
přednášky, diskuse v hodině, ústní zkouška
Vyučovací jazyk
Angličtina
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každý semestr.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2025.