C7920 Proteinové inženýrství

Faculty of Science
Autumn 2000
Extent and Intensity
2/0/0. 3 credit(s). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
prof. RNDr. Břetislav Brzobohatý, CSc. (lecturer)
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr. (lecturer)
RNDr. Alena Kuderová, CSc. (lecturer)
doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D. (lecturer)
Guaranteed by
prof. RNDr. Břetislav Brzobohatý, CSc.
Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Předpokladem pro porozumění předmětu je absolvování základů biochemie nebo molekulární biologie.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
Course objectives (in Czech)
Přednáška je uvedena shrnutím strukturních motivů polypeptidových řetězců a principů vytváření strukturních domén. Následně se zaměřuje se na roli jednotlivých motivů v biologické funkci proteinů. Budou diskutovány strukturní prvky podmiňující specificitu interakcí transkripčních faktorů a polymeráz s DNA.Bude probrána molekulární podmíněnost plasticity odpovědi imunitního systému na expozici novým antigenum. V oblasti membránových proteinů bude položen důraz na charakteristiky transmembranových domén, využití jejich strukturních specifik k předpovedi jejich výskytu na základě primárni sekvence aminokyselin u nově objevených proteinů, detailněji budou osvětleny strukturně-funkční vztahy u bakteriorhodopsinu,fotosyntetického reakčního centra, membranových receptorů, jejich interakce s G proteiny a strukturní poruchy jejichž manifestací jsou některá nadorová onemocnění. Bude diskutována enzymová katalýza a možnosti modifikace substrátové specificity a reakční rychlosti. Součástí přednášky budou také metody předpovídání sekundární a terciární struktury proteinů na základě jejich aminokyselinové sekvence, počítačové modelování struktur proteinů, jejich interakce s ligandy a modelování enzymatických reakcí a rovněž metody stanovení trojrozměrné struktury proteinů. Na závěr bude shrnuto využití technik genového inženýrství pro studium vztahu struktury a funkce proteinů. Na zajištění přednášky participují RNDr. Jiři Damborský,CSc. (Počítačové modelování v proteinovém inženýrství) a RNDr. Alena Kuderová, CSc. (Rozpoznávání cizorodých molekul imunitním systémem).
Syllabus (in Czech)
  • 1.Základní strukturní principy architektury proteinů. 2.Role jednotlivých strukturních motivů v biologické funkci proteinů. -Proteiny interagující s DNA -Rozpoznávání cizorodých molekul imunitním systémem -Membránové proteiny (membránové receptory) -Enzymová katalýza -Předpovídání, modelování a navrhování cíleného obměňování struktury proteinů -Metody stanovení trojrozměrné struktury proteinů 3.Použití technik genového inženýrství pro studium vztahu struktury a funkce proteinů -Metody přípravy rekombinantních molekul DNA, izolace klonovaných genů, genetické elementy řídící expresi genů -Mutageneze in vitro -Produkce rekombinantních proteinů v heterologních expresních systémech
Literature
  • BRANDEN, Carl and John TOOZE. Introduction to protein structure. 2nd ed. New York: Garland Publishing, 1998, xiv, 410 s. ISBN 0-8153-2304-2. info
Language of instruction
Czech
Follow-Up Courses
Further Comments
The course can also be completed outside the examination period.
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
Listed among pre-requisites of other courses
The course is also listed under the following terms Autumn 2007 - for the purpose of the accreditation, Autumn 1999, Autumn 2010 - only for the accreditation, Autumn 2001, Autumn 2002, Autumn 2003, Autumn 2004, Autumn 2005, Autumn 2006, Autumn 2007, Autumn 2008, Autumn 2009, Autumn 2010, Autumn 2011, Autumn 2011 - acreditation, Autumn 2012, Autumn 2013, Autumn 2014, Autumn 2015, Autumn 2016, autumn 2017, Autumn 2018, Autumn 2019, Autumn 2020, autumn 2021, Autumn 2022, Autumn 2023, Autumn 2024.
  • Enrolment Statistics (Autumn 2000, recent)
  • Permalink: https://is.muni.cz/course/sci/autumn2000/C7920