PřF:C9903 Databáze molekulových struktur - Informace o předmětu

C9903 Databáze molekulových struktůr jako nástroj chemie a biologie

Rozsah

8/8. 2 kr. Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

prof. Ing. Bohdan Schneider, CSc., DSc. (přednášející), Mgr. Eva Fadrná, Ph.D. (zástupce)

Garance

Mgr. Eva Fadrná, Ph.D.
Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Mgr. Eva Fadrná, Ph.D.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24

Mateřské obory/plány

• Analytická chemie (program PřF, D-CH)
• Analytická chemie (program PřF, M-CH)
• Anorganická chemie (program PřF, D-CH)
• Anorganická chemie (program PřF, M-CH)
• Biofyzika (program PřF, D-FY)
• Biochemie (program PřF, D-BCH)
• Biochemie (program PřF, M-CH)
• Biomolekulární chemie (program PřF, D-BCH)
• Fyzikální chemie (program PřF, D-CH)
• Fyzikální chemie (program PřF, M-CH)
• Chemie makromolekulárních látek (program PřF, D-CH)
• Chemie odborná (program PřF, M-CH)
• Chemie (program PřF, M-CH)
• Chemie životního prostředí (program PřF, D-CH)
• Chemie životního prostředí (program PřF, M-CH)
• Makromolekulární chemie (program PřF, M-CH)
• Organická chemie (program PřF, D-CH)
• Organická chemie (program PřF, M-CH)

Cíle předmětu

Velké množství experimentálně stanovených struktur organických a biologických molekul je možné efektivně využívat, studujeme-li je vhodnými nástroji. Mezi ty základní patří databáze molekulárních struktur a práci s databázemi od získávání strukturních dat k jejich zpracování je kurs věnován. Studenti se naučí používat tři databáze nejdůležitější pro biologii a chemii: CAMBRIDGE STRUCTURAL DATABASE (CSD), PROTEIN DATA BANK (PDB), NUCLEIC STRUCTURE DATABASE (NDB). Na databasové dotazy navazuje zpracování nalezené informace. V kurzu se zmíníme o základních metodách statistického zpracovaní dat se zvláštním zřetelem na (periodicky se opakující) torsní úhly. Studenti se naučí používat i originální metodu průměrování 3D distribicí bodů technikou Fourierových transformací.

Osnova

• 1. CSD, 2. PDB, 3. NDB, 4. Další významné zdroje informací na webu a jejich použití, 5. Formáty souřadnicových soubor, příprava dat k dalšímu zpracování, 6. Základní statistické zpracování dat, 7. Metoda Fourierovského průměrování, 8. Příklady zpracování distribucí torsních úhlů

Metody hodnocení

Test + diskuse nad výsledky

Informace učitele

http://www.ncbr.chemi.muni.cz/~evaf/databaze.html
Upřesňující informace o místě konání kurzu budou uvedeny na jeho WWW stránce. Dotazy směřujte na e-mail evaf@chemi.muni.cz (Dr. Eva Fadrná).

Další komentáře

Předmět je vyučován jednorázově.
Výuka probíhá blokově.
Poznámka k četnosti výuky: 2.-4.11.

• Statistika zápisu (nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2004/C9903