PřF:C7790 Počítač.chemie a MM I - Informace o předmětu
C7790 Počítačová chemie a molekulové modelování I
Přírodovědecká fakultapodzim 2007 - akreditace
- Rozsah
- 1/0/0. 1 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
- Vyučující
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc. (přednášející)
Mgr. Zdeněk Kříž, Ph.D. (přednášející) - Garance
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta - Předpoklady
- Předpokládají se základní znalosti obecné a fyzikální chemie. Znalost základů kvantové chemie je výhodou.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/10 - Mateřské obory/plány
- Analytická chemie (program PřF, D-CH) (2)
- Analytická chemie (program PřF, M-CH)
- Anorganická chemie (program PřF, D-CH) (2)
- Anorganická chemie (program PřF, M-CH)
- Biochemie (program PřF, D-CH) (2)
- Biochemie (program PřF, M-CH)
- Fyzikální chemie (program PřF, D-CH) (2)
- Fyzikální chemie (program PřF, M-CH)
- Chemie makromolekulárních látek (program PřF, D-CH) (2)
- Chemie odborná (program PřF, M-CH)
- Chemie životního prostředí (program PřF, D-CH) (2)
- Chemie životního prostředí (program PřF, M-CH)
- Makromolekulární chemie (program PřF, M-CH)
- Organická chemie (program PřF, D-CH) (2)
- Organická chemie (program PřF, M-CH)
- Organická chemie (program PřF, N-CH)
- Cíle předmětu
- Kurs je zaměřen na získání základních znalostí v oblasti výpočetní chemie. Jeho orientace je výrazně aplikační. Student získá přehled o reprezentaci molekul v počítači a o tom, jaké údaje zadat počítačovým programům, aby výsledky modelování byly realistické. V závěru se studenti seznámí s některým uživatelsky příjemným programovým balíkem pro počítačové modelování molekul a molekulárních systémů.
- Osnova
- 1. Popis geometrie pomocí kartézských a interních souřadnic. 2. Molekulová mechanika, základní typy interakcí a jejich funkční vyjádření. 3. Přehled metod kvantové chemie. 4. Molekulová dynamika, základní vztahy. 5. Pojem hyperplocha potenciální energie (PES). Stacionární body na PES. 6. Minimimalizace energie, relaxace, fixace, driving. 7. Programy SPARTAN, HYPERCHEM. Základní funkce. Metodika studia konformačního chování. Výpočty struktury a energie.
- Literatura
- REMKO, M. Molekulové modelovanie. Princípy a aplikácie. Bratislava: Slovak Academic Press, 2000. info
- JENSEN, Frank. Introduction to Computational Chemistry. New York: J. Wiley & Sons Ltd., 1999. info
- LIPKOWITZ, K B a D B BOYD. Reviews in Computational Chemistry 1-9. New York: VCH Publishers, 1998. info
- HEHRE, Warren J., Alan J. SHUSTERMAN a W. Wayne HUANG. A laboratory book of computational organic chemistry. Irvine, Calif.: Wavefunction, 1996, xiv, 291 s. ISBN 0-9643495-5-8. info
- FORESMAN, J B a A FRISCH. Exploring Chemistry with Electronic Structure Methods. Pittsburgh: Gaussian, Inc., 1996. info
- Metody hodnocení
- Kurs sestává ze sedmi dvouhodinových přednášek. Pro ty studenty, kteří si zapsali cvičení, pak následuje samostatný projekt.
- Informace učitele
- http://www.chemi.muni.cz/~jkoca/#TEACHING MATERIAL
Kurs sestává ze sedmi dvouhodinových přednášek. Pro ty studenty, kteří si zapsali cvičení, pak následuje samostatný projekt. - Další komentáře
- Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden. - Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
- Statistika zápisu (podzim 2007 - akreditace, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2007-akreditace/C7790