Bi7941 Molekulární biologie - laboratorní cvičení (pro obor biochemie)

Přírodovědecká fakulta
podzim 2010
Rozsah
0/3/0. 3 kr. Ukončení: z.
Vyučující
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Jiří Doškař, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
Bi7941/01_1: St 8:00–13:50 BprR, R. Pantůček
Bi7941/01_2: St 8:00–13:50 BprR, R. Pantůček
Bi7941/02_1: St 14:00–19:50 BprR, R. Pantůček
Bi7941/02_2: St 14:00–19:50 BprR, R. Pantůček
Předpoklady
( Ex_3148 Obecná a anorganická chemie || Ex_3155 Obecná chemie || Ex_2145 Anorganická chemie - cvičení || Ex_3148 Obecná a anorganická chemie || C1080 Obecná chemie-lab.cvič. || C1620 Obecná a anorg.chemie-cvič. || C1650 Základy chemie-lab.cvič. || C2100 Anorganická chemie-lab.cvičení || C2500 Obecná chemie-lab.cvič. || C2740 Základy chemie-lab.cvič. || C2480 Základy org. chemie a biochem. || SOUHLAS) && ( Bi4020 Molekulární biologie || NOW( Bi4020 Molekulární biologie ))
Znalost molekulární struktury a nukleových kyselin a genomu. Znalost základních mikrobiologických technik jako kultivace bakterií, stanovení titru bakteriální suspenze. Znalost výpočtů složení chemických roztoků.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět patří k základnímu praktickému kurzu Molekulární biologie pro studenty bakalářského programu Biochemie. Obsahuje praktické úlohy, sloužící k osvojení si základních metodických postupů v molekulární biologii, především izolace a manipulace s nukleovými kyselinami.
Osnova
  • 1. Příprava roztoků používaných v molekulární biologii.
  • 2. Izolace plazmidového vektoru (pUC18, pBR322). Stanovení čistoty a koncentrace DNA.
  • 3. Štěpení DNA restrikčními endonukleázami a agarózová gelová elektroforéza DNA.
  • 4. Konstrukce restrikční mapy, izolace DNA z gelů.
  • 5. Klonování ve vektorech řady pUC, trasformace, selekce klonů.
  • 6. Ultracentrifugace v hustotním gradientu.
  • 7. Izolace bakteriální (genomové) DNA pro DNA fingerprinting.
  • 8. PCR (polymerázová řetězová reakce) a její modifikace PCR-RFLP, AP-PCR.
Literatura
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. ISBN 0-87969-309-6. info
Výukové metody
Praktická výuka probíha v laboratoři molekulární biologie jedenkrát za 14 dnů v šestihodinových blocích. Studenti pracují podle předem prostudovaných protokolů.
Metody hodnocení
Pro získání zápočtu je požadováno vypracování protokolů a složení písemného testu obsahujícího 20 otázek.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007 - akreditace, podzim 2010 - akreditace, podzim 2002, podzim 2003, podzim 2004, podzim 2005, podzim 2006, podzim 2007, podzim 2008, podzim 2009, podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012, podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018.