PřF:Bi8980c Příprava proteinů - cvičení - Informace o předmětu
Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení
Přírodovědecká fakultapodzim 2011
- Rozsah
- 0/2. blok 5 dnů. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: kz. Jiná možná ukončení: z.
- Vyučující
- RNDr. Lubomír Janda, Ph.D. (cvičící)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (cvičící) - Garance
- prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D. - Předpoklady
- NOW( Bi8980 Exprese a purifikace proteinů )
Předpokladem pro porozumění předmětu je znalost základů biochemie nebo molekulární biologie - Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
- Mateřské obory/plány
- Aplikovaná biochemie (program PřF, B-AB)
- Aplikovaná biochemie (program PřF, B-AB, směr Bioanalytická chemie)
- Aplikovaná biochemie (program PřF, B-AB, směr Biotechnologie)
- Aplikovaná biochemie (program PřF, B-AB, směr Klinická biochemie)
- Biofyzika (program PřF, N-FY)
- Biofyzika (program PřF, N-FY, směr Aplikovaná biofyzika)
- Biofyzika (program PřF, N-FY, směr Molekulární biofyzika)
- Biochemie (program PřF, B-BCH)
- Biochemie (program PřF, D-BCH4)
- Biochemie (program PřF, N-BCH)
- Genomika a proteomika (program PřF, D-BI4)
- Molekulární a buněčná biologie (program PřF, D-BI4)
- Molekulární biologie a genetika (program PřF, B-BI)
- Molekulární biologie a genetika (program PřF, B-EXB)
- Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-BI)
- Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-EXB)
- Obecná a molekulární genetika (program PřF, D-BI4)
- Obecná biologie (program PřF, N-BI)
- Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Ekotoxikologie)
- Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Fyziologie rostlin)
- Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Fyziologie živočichů)
- Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)
- Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
- Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Ekotoxikologie)
- Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Experimentální biologie rostlin)
- Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Experimentální biologie živočichů a imunologie)
- Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)
- Cíle předmětu
- Toto praktické cvičení je určeno pro studenty v počáteční fázi jejich vědecké kariéry a bude se zabývat nadexpresí proteinů v prokaryotních systémech pomocí různých vektorů, strategií purifikace proteinů a jejich charakterizací. Na konci tohoto praktického kurzu studenti budou schopni používat bionformatickou analýzu k plánování správného postupu pro expresi proteinů, navrhovat primery k optimálnímu složení genu na expresi; porovnat různé vektory s odlišnými kotvičkami spolu s různými hostitelskými kmeny; sledování funkční aktivity proteinů během různých purifikačních strategií.
- Osnova
- 1. Startegie klonování do expresních plasmidů. 2. Exprese a purifikace scFv produkovaných do cytoplasmy nebo do periplasmatického prostoru. 3. Exprese a purifikace rotliných proteinů (A. pET32 – thioredoxin - chaperon/B. pRSET – His.tag/ C. pET161DEST – Gate way technologie – Lumio.tag/D. pET28 – bez kotvičky.)
- Literatura
- doporučená literatura
- PRICE, Nicholas C. a Jacqueline NAIRN. Exploring proteins : a student's guide to experimental skills and methods. Oxford: Oxford University Press, 2009, xv, 512. ISBN 9780199205707. info
- Výukové metody
- Laboratorní cvičení
- Metody hodnocení
- vypracování protokolu, test
- Navazující předměty
- Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
- Statistika zápisu (nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2011/Bi8980c