PřF:C2115 Superpočítání - Informace o předmětu
C2115 Praktický úvod do superpočítání
Přírodovědecká fakultapodzim 2012
- Rozsah
- 0/2. 2 kr. Ukončení: k.
- Vyučující
- RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Jakub Štěpán, Ph.D. (cvičící) - Garance
- RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta - Předpoklady
- C2110 UNIX a programování
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 42 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/42, pouze zareg.: 0/42, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/42 - Mateřské obory/plány
- Analytická biochemie (program PřF, N-BCH)
- Analytická chemie (program PřF, D-CH4)
- Analytická chemie (program PřF, N-CH)
- Anorganická chemie (program PřF, D-CH4)
- Anorganická chemie (program PřF, N-CH)
- Aplikovaná biochemie (program PřF, B-AB)
- Biofyzikální chemie (program PřF, B-CH)
- Biofyzika (program PřF, B-FY)
- Biofyzika (program PřF, D-FY4)
- Biofyzika (program PřF, N-FY)
- Biochemie (program PřF, B-BCH)
- Biochemie (program PřF, D-BCH4)
- Biochemie (program PřF, N-BCH)
- Biomolekulární chemie (program PřF, D-BCH4)
- Biomolekulární chemie (program PřF, N-BCH)
- Fyzikální chemie (program PřF, D-CH4)
- Fyzikální chemie (program PřF, N-CH)
- Chemie (program PřF, B-CH)
- Chemie životního prostředí (program PřF, D-CH4)
- Chemie životního prostředí (program PřF, N-CH)
- Chemoinformatika a bioinformatika (program PřF, B-BCH)
- Materiálová chemie (program PřF, D-CH4)
- Materiálová chemie (program PřF, N-CH)
- Modelování a výpočty (program PřF, B-MA)
- Organická chemie (program PřF, D-CH4)
- Organická chemie (program PřF, N-CH)
- Strukturní chemie (program PřF, N-CH)
- Cíle předmětu
- Předmět je primárně určen pro studenty věnující se výpočtům v oblasti biochemie, chemie i biofyziky (mateřský obor Chemoinformatika a bioinformatika). Cílem předmětu je zvýšení schopnosti studentů efektivně využívat dostupných výpočetních zdrojů a má za úkol rozvíjet základní znalosti ze skriptování ve smyslu analýzy získaných dat. Zároveň je ve výuce kladen důraz na praktickou aplikaci dostupného software, ať již komerčního, nebo vyvíjeného na Národním centru pro výzkum biomolekul.
- Osnova
- Stručný úvod do UNIXu. Seznámení se s prostředím výpočetního clusteru (struktura, stavba, software) – cluster WOLF, registrace uživatelů do MetaCentra
- Seznámení s prostředím MetaCentra, systém modulů, úvod do rozhraní na správu výpočetních úloh (torque, Pbspro) – Infinity.
- Metodika testování použitelnosti software pro paralelní spouštění, efektivní správa výpočetních úloh; procvičování praktických úkolů v rozhraní Infinity na specifických výpočtech studentů
- Analýza získaných dat, využití znalostí ze skriptování pro zjednodušení správy výpočetních úloh a násobné spouštění výpočtů
- Diskuse praktických problémů
- Literatura
- Dokumentace MetaCentra, software Infinity
- Výukové metody
- výuka v počítačové učebně
- Metody hodnocení
- závěrečný test
- Navazující předměty
- Informace učitele
- Předmět bude vyučován blokově.
- Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
- Statistika zápisu (podzim 2012, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2012/C2115