PřF:C7235 Pokr. biofyzikální metody -cv. - Informace o předmětu

C7235 Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii - cvičení

Rozsah

0/2/0. 2 kr. (plus ukončení). Doporučované ukončení: k. Jiná možná ukončení: z.

Vyučující

doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D. (cvičící)
Patrycja Anna Kłos, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Vratislav Peška, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Petra Bencúrová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Martina Dvořáčková, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Milan Hluchý, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Eliška Janoušková, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Ivona Nečasová, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

NOW( C7230 Pokročilé biofyzikální metody )

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30

Mateřské obory/plány

• Genomika a proteomika (program PřF, N-BCH)
• Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Ekotoxikologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Experimentální biologie rostlin)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Experimentální biologie živočichů a imunologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Předmět je zaměřen na získání praktických zkušeností s moderními spektroskopickými metodami analýzy struktury a vzájemné interakce nukleových kyselin a proteinů. Z metodických přístupů je zvláštní důraz kladen na vysoce citlivé fluorimetrické metody a jejich použití v laboratorní praxi. Naplní přednášek jsou principy detekce, způsoby fluorescenčního značení biomakromolekul a jeho použití při analýze funkce a vzájemných interakcí molekul v rámci genomu a proteomu. Součástí výuky je volitelný blok navazujících praktických cvičení, což umožňuje experimentální ověření získaných teoretických poznatků za použití moderního instrumentálního vybavení výzkumných laboratoří. Vyúka je zaměřena na účinné předávání teoretických základů a praktických dovedností při používání specializovaných technik, jejichž využití pro řešení projektů základního i aplikovaného výzkumu se v biologických oborech stává nezbytností v současném interdisciplinárním pojetí biologie.

Osnova

• Měření spektrálních charakteristik proteinů a nukleových kyselin
• Přesné stanovení koncentrace nukleových kyselin a proteinů za použití fluorescence a absorpční spektroskopie (kolorimetrie)
• Vliv pH a teploty na spektrální vlastnosti fluorescenčních sond
• Měření vlastní fluorescence BSA, tryptofanu a tyroxinu
• Příprava fluorescenčně značeného fragmentu DNA
• Spektroskopická charakteristika fluorescenčně značené DNA
• Vizualizace makromolekul při elektroforetické separaci
• Využití fluorescenčního rezonančního přenosu energie (FRET) při sledování hybridizace komplementárních řetězců nukleových kyselin
• Sledování zhášení fluorescence po relaxaci vlásenkové struktury fluorescenčně značené DNA
• Real-time PCR - detekce amplifikace DNA. Fluorescenční mikroskopie (fluorescenční in situ hybridizace)
• Studium vazby molekul za pomocí anizotropie fluorescence –vazba proteinu a fluorescenčně značené DNA

Literatura

• Lakowicz J.R.: Principles of Fluorescence Spectroscopy. Third Edition, Springer + Business Media, New York, 2006

Metody hodnocení

kolokvium

Informace učitele

http://is.muni.cz/el/1431/podzim2011/Bi7230/um/6053971/PBMEBuvod.html

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

• Statistika zápisu (podzim 2013, nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2013/C7235