PřF:C9035 Evol. cytogenetika rostlin-cv. - Informace o předmětu
C9035 Evoluční a srovnávací cytogenetika rostlin - cvičení
Přírodovědecká fakultapodzim 2018
- Rozsah
- 0/2. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: k. Jiná možná ukončení: z.
- Vyučující
- prof. Mgr. Martin Lysák, Ph.D., DSc. (cvičící)
RNDr. Terezie Malík Mandáková, Ph.D. (cvičící) - Garance
- prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Martin Lysák, Ph.D., DSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta - Předpoklady
- Ideálním předpokladem jsou základní dovednosti a znalosti z oblasti cytogenetiky a cytologie (např. pipetování, příprava roztoků, mikroskopování).
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20 - Mateřské obory/plány
- Botanika (program PřF, N-EB)
- Ekologická a evoluční biologie (program PřF, B-EB)
- Ekologická a evoluční biologie (program PřF, B-EB, směr Botanika)
- Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-EXB)
- Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
- Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Experimentální biologie rostlin)
- Cíle předmětu
- Absolvent si osvojí pokročilé techniky moderní rostlinné cytogenetiky (příprava mikroskopických preparátů, pokročilá fluorescenční mikroskopie, malování chromosomů, genomická in situ hybridizace, úprava obrazu).
- Výstupy z učení
- Student bude po absolvování předmětu schopen:
- připravit mikroskopické preparáty;
- naznačit DNA hapteny či fluorochromy;
- připravit DNA sondu;
- provést fluorescenční in situ hybridizaci (FISH) značených sond na chromosomy a buněčná jádra;
- analyzovat preparáty pomocí fluorescenční mikroskopie;
- fotografovat chromosomy a buněčná jádra;
- analyzovat a upravovat získané fotografie. - Osnova
- Úvod do evoluční a srovnávací cytogenetiky rostlin. Principy světelné a fluorescenční mikroskopie. Příprava mitotických a meiotických chromozomů z kořenových špiček a prašníků, mikroskopická analýza chromozomových preparátů. Přímé a nepřímé značení DNA sond metodou nick translace. Fluorescence in situ hybridization (FISH), genomic in situ hybridization (GISH), comparative chromosome painting (CCP). Immunodetekce nepřímo značených hybridizačních sond. Fluorescenční mikroskopie chromozomových preparátů po FISH, GISH a CCP. Zpracování a úprava mikroskopických fotografií (Adobe Photoshop), interpretace výsledků.
- Literatura
- doporučená literatura
- MANDÁKOVÁ, Terezie a Martin LYSÁK. Chromosome Preparation for Cytogenetic Analyses in Arabidopsis. Current protocols in plant biology. John Wiley & Sons, 2016, roč. 1, č. 1, s. 43-51. ISSN 2379-8068. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cppb.20009. URL info
- MANDÁKOVÁ, Terezie a Martin LYSÁK. Painting of Arabidopsis Chromosomes with Chromosome-Specific BAC Clones. Current protocols in plant biology. John Wiley & Sons, 2016, roč. 4, č. 2, s. 359-371. ISSN 2379-8068. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cppb.20022. URL info
- SCHWARZACHER, T. a HESLOP-HARRISON. Practical in situ hybridization. Bios, 2000. info
- Výukové metody
- Praktické cvičení v cytogenetické laboratoři.
- Metody hodnocení
- Ukončení kurzu formou kolokvia. Úspěšné zakončení je podmíněno včasným dodáním všech požadovaných protokolů a absolvováním závěrečného pohovoru.
- Další komentáře
- Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Poznámka k četnosti výuky: blok 5 dni.
Výuka proběhne ve dnech 4.-8.11.2013.
- Statistika zápisu (podzim 2018, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2018/C9035