PřF:Bi5130c Základy práce s aDNA cvičení - Informace o předmětu

Bi5130c Základy práce s lidskou aDNA cvičení

Rozsah

0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.

Vyučující

Mgr. Dana Buriánková Fialová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Eva Chocholová (cvičící)

Garance

Mgr. Dana Buriánková Fialová, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Mgr. Eva Chocholová
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 16 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/16, pouze zareg.: 0/16

Mateřské obory/plány

• Bioanalytická laboratorní diagnostika ve zdravotnictví - Lékařská genetika a molekulární diagnostika (program PřF, N-LGM)
• Lékařská genetika a molekulární diagnostika pro odborné pracovníky v laboratorních metodách (program PřF, N-BI)
• Lékařská genetika a molekulární diagnostika (program PřF, B-BI)
• Lékařská genetika a molekulární diagnostika (program PřF, B-LGM)
• Molekulární biologie a genetika (program PřF, B-EMB)
• Molekulární biologie a genetika (program PřF, B-EXB)
• Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-EXB)
• Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-MBG)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Antropobiologie a antropogenetika)

Cíle předmětu

Cílem předmětu je získání praktických dovedností analýzy lidské starobylé DNA - výběr vhodného vzorku, ošetření a očištění zvolené tkáně, izolace DNA, amplifikace aDNA, sekvenace aDNA a hodnocení výsledků. Studenti se také naučí pracovat za protikontaminačních opatření.

Výstupy z učení

Student bude po absolvování přemetu schopen: - vybrat vhodnou část lidského skeletu pro analýzu aDNA a příslušnými metodami ji separovat - očistit a ošetřit vybranou tkáň tak, aby minimalizoval nebezpečí kontaminace recentní DNA - historickou kost lyzovat a purifikovat z ní aDNA - zvolit protokol amplifikace pro danou cílovou sekvenci (design primerů, modifikace PCR...) - vizualizovat produkty PCR a enzymaticky je přečistit pro sekvenování - zhodnotit získanou sekvenci a interpretovat ji i v historických souvislostech

Osnova

• Odběr tkáně, očištění vzorku, lyzace kostní tkáně Izolace aDNA Amplifikace HVR I mtDNA ELFO, příprava vzorku na sekvenaci Hodnocení výsledků

Literatura

• HUMMEL, Susanne. Ancient DNA typing : methods, strategies and applications. Berlin: Springer, 2010, xii, 298. ISBN 9783642077050. info

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Odevzdaný protokol, v němž bude uvedeno: - použitý materiál a metody - fotografie analyzovaných vzorků, určení jejich zachovalosti - snímek ELFO produktů PCR, zhodnocení úspěšnosti reakce - elektroforetofram získaných sekvencí - shrnutí získané sekvence - zasazení do historického kontextu (např. mtDNA)

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Poznámka k četnosti výuky: jednou za 14 dní 4 hodiny pro skupinu studentů.

• Statistika zápisu (podzim 2021, nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2021/Bi5130c