PřF:C7195 Pokročilé prakt. z biochemie - Informace o předmětu

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Rozsah

0/0/5. 5 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.
Vyučováno kontaktně

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Petr Lapčík, Ph.D. (pomocník)
Mgr. David Novák (pomocník)

Garance

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 15:00–19:50 C15/211

Předpoklady

C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 18/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24

Mateřské obory/plány

• Analytická biochemie (program PřF, N-BCH)
• Analytická biochemie (program PřF, N-BIC)
• Bioanalytik - odborný pracovník v laboratorních metodách (program PřF, N-BCH)
• Biochemie (program PřF, N-BCH)
• Biochemie (program PřF, N-BIC)
• Biotechnologie (program PřF, N-BTC)
• Genomika a proteomika (program PřF, N-BCH)
• Genomika a Proteomika (program PřF, N-BIC)

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet pokročilé biochemické metodiky. V rámci kurzu se studenti naučí samostatně provádět izolaci a separaci biomolekul (nukleové kyseliny, proteiny, nízkomolekulární látky), aplikovat metody pro stanovení aktivit enzymů, metody pro stanovení hladin mRNA a proteinů (qPCR, proteomika na bázi kvantitativní hmotnostní spektrometrie), práci s tkáňovými kulturami a moderními diagnostickými metodami, zpracovávat proteomická data data v prostředí vituálních počítačů, statisticky vyhodnocovat a interpretovat získaná data.

Výstupy z učení

Student bude po absolvování předmětu schopen: - Provést nativní elektroforézu a stanovit enzymovou aktivitu - Izolovat proteiny z nádorových buněčných linií a stanovit celkovou koncentraci proteinu - Provést štěpení proteinů trypsinem a purifikovat získané peptidy v rámci proteomického experimentu - Provést databázové prohledávání proteomických LC-MS/MS dat s využitím virtuálních počítačů, statisticky zanalyzovat, vyhodnotit a interpretovat výsledky - Provést molekulární klonování - Izolovat RNA z biologického materiálu - Provést reverzní transkripci - Provést qPCR a vyhodnotit data - Provést PCR-RFLP analýzu - Provádět kritické hodnocení získaných dat

Osnova

• Úloha A: Analýza izoenzymů askorbát peroxidasy pomocí nativní PAGE a aktivity phenylalanin-amoniak lyasy Úloha B: Porovnání proteotypů nádorových buněčných linií pomocí kvantitativní hmotnostní spektrometrie Úloha C: Klonování PCR produktu do plasmidu Úloha D: Identifikace neznámého elicitinu na základě jeho aktivity Úloha E: Identifikace jednotlivých druhů václavek ze vzorku půdy

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Student musí absolvovat všechny úlohy a odevzdat z nich požadované protokoly.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

• Statistika zápisu (nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2024/C7195