PřF BIOMB Biomedicínská bioinformatika
Název anglicky: Biomedical bioinformatics
navazující prezenční se specializací, vyučovací jazyk: čeština![čeština čeština](/pics/flags_svg/cz.svg)
Zahrnut v programu: PřF N-MBB Matematická biologie a biomedicína
navazující prezenční se specializací, vyučovací jazyk: čeština
Zahrnut v programu: PřF N-MBB Matematická biologie a biomedicína
Informace o studiu
- Součásti SZZ a jejich obsahMagisterská státní závěrečná zkouška se skládá ze tří částí, v případě prvních dvou se jedná o ústní zkoušku, v případě třetí pak o ústní obhajobu závěrečné práce:
1. Biologie a bioinformatika - specializační část SZZ je zaměřena na ověření znalostí z oblasti molekulární biologie, genetiky, bioinformatiky a pokročilých analytických metod pro hodnocení a interpretaci dat z vysoce výkonných technologií biomedicínských experimentů.
2. Matematika a statistika - tématické okruhy matematické části SZZ jsou zaměřeny na ověření základních i pokročilých znalostí z oblasti matematické statistiky, vícerozměrných metod a matematického modelování.
3. Obhajoba diplomové práce. - Návrh témat kvalifikačních prací a témata obhájených prací1. Andrea Janotová (2012): Genové interakční sítě a jejich využití v odkrývání heterogenity nádoru kolorekta (https://is.muni.cz/auth/th/269452/prif_m/),
2. Barbora Zwinsová (2014): Heterogenita KRAS mutantních nádorů kolorekta z pohledu genové exprese (https://is.muni.cz/auth/th/356955/prif_m/),
3. Lucie Brožová (2015): Analýza genových interakcí na základě mikročipů a CGH čipů a jejich využití jako prediktorů u pacientů s mnohočetným myelomem (https://is.muni.cz/auth/th/357561/prif_m/),
4. Kamil Jaroň (2015): Simulace smíšené genetické informace pomocí Fisherova spojovacího modelu (https://is.muni.cz/auth/th/376090/prif_m/),
5. Anna Bílková (2016): Podíl falešné pozitivity ve studiích alternativního sestřihu v závislosti na volbě mapovacího algoritmu pro RNAseq dat (https://is.muni.cz/auth/th/394358/prif_m/).
Doporučený průchod studijním plánem
Společná část (60-80 kr.)
Diplomová práce (min 20kr.)
Kód | Název | Ukončení | Kreditů | Semestr | Profilace |
PřF:E0060 | Seminář (podle zaměření DP) IV | z | 2 | 4 | Z |
PřF:E0061 | Diplomová práce IV | z | 10 | 4 | Z |
PřF:E7013 | Diplomová práce I | z | 5 | 1 | Z |
PřF:E7014 | Seminář (podle zaměření DP) I | z | 1 | 1 | Z |
PřF:E8014 | Seminář (podle zaměření DP) II | z | 1 | 2 | Z |
PřF:E8017 | Diplomová práce II | z | 5 | 2 | Z |
PřF:E9013 | Diplomová práce III | z | 5 | 3 | Z |
PřF:E9014 | Seminář (podle zaměření DP) III | z | 1 | 3 | Z |
30 kreditů |
Povinné předměty
Kód | Název | Ukončení | Kreditů | Semestr | Profilace |
PřF:E0034 | Analýza a klasifikace dat | zk | 3+2 | 1 | Z |
PřF:E0180 | Magisterská státní závěrečná zkouška z Matematické biologie a biomedicíny | - | - | 4 | Z |
PřF:E8678 | Aplikovaná analýza přežití | zk | 2+2 | 1 | P |
PřF:M5120 | Lineární statistické modely I | zk | 4+2 | 1 | Z |
PřF:M6120 | Lineární statistické modely II | zk | 4+2 | 2 | Z |
PřF:M7222 | Zobecněné lineární modely | zk | 4+2 | 3 | Z |
PřF:M7986 | Statistická inference I | zk | 4+2 | 3 | P |
PřF:M9211 | Bayesovské metody | zk | 4+2 | 4 | - |
39 kreditů |
Povinně-volitelné předměty
Pokročilý cizí jazyk
Student si vybírá z nabídky Centra jazykového vzdělávání MU jeden z předmětů v hodnotě 2 kreditů. Je doporučeno absolvovat předmět JA002, pokud již nebyl absolvován v rámci bakalářského studia. V tomto případě se volí jiný cizí jazyk.
Kód | Název | Ukončení | Kreditů | Semestr | Profilace |
PřF:JA002 | Pokročilá odborná angličtina - zkouška | zk | 2 | - | - |
PřF:JF002 | Pokročilá odborná francouzština - zkouška | zk | 2 | - | - |
PřF:JN002 | Pokročilá odborná němčina - zkouška | zk | 2 | - | - |
PřF:JR002 | Pokročilá odborná ruština - zkouška | zk | 2 | - | - |
PřF:JS002 | Pokročilá odborná španělština - zkouška | zk | 2 | - | - |
10 kreditů |
Volitelné předměty
Studenti si vybírají z 18 doporučených předmětů tak, aby dosáhli v celkovém součtu 120 kreditů. Dále uvedené předměty slouží jako příklad.
Specializační část (40-60 kr.)
Povinné předměty
Kód | Název | Ukončení | Kreditů | Semestr | Profilace |
PřF:C2138 | Pokročilá bioinformatika | zk | 2+2 | 2 | P |
PřF:C2139 | Pokročilá bioinformatika - seminář | z | 1 | 2 | - |
PřF:C7188 | Úvod do molekulární medicíny | zk | 2+2 | 1 | P |
PřF:E4014 | Projekt z Matematické biologie a biomedicíny - biomedicínská bioinformatika | z | 3 | 1 | - |
PřF:E5020 | Analýza necílených dat z MS | zk | 2+2 | 4 | P |
PřF:E5444 | Analysis of sequencing data | zk | 2+2 | 3 | P |
PřF:E5510 | Detekce biomarkerů z omics experimentů | zk | 2+2 | 3 | - |
PřF:E7441 | Vědecké výpočty v biologii a biomedicíně | zk | 2+2 | 2 | - |
PřF:E7528 | Analýza genomických a proteomických dat | zk | 3+2 | 2 | P |
33 kreditů |
Povinně-volitelné předměty
Blok 1
Student absolvuje minimálně 1 předmět z této skupiny:
Kód | Název | Ukončení | Kreditů | Semestr | Profilace |
PřF:Bi0036 | Metagenomika | zk | 2+2 | 2 | - |
PřF:Bi7250 | Lékařská genetika a genetické poradenství | zk | 2+2 | 2 | - |
PřF:Bi9910 | Molekulární a buněčná biologie nádorů | zk | 2+2 | 2 | - |
PřF:E0220 | Hmotnostní spektrometrie | zk | 2+2 | 2 | - |
FI:PB162 | Programování v jazyce Java | zk | 3+2 | 2 | - |
21 kreditů |
Blok 2
Student absolvuje minimálně 1 předmět z této skupiny:
Kód | Název | Ukončení | Kreditů | Semestr | Profilace |
PřF:Bi5220 | Imunologie | zk | 2+2 | 3 | - |
PřF:Bi9325 | Molekulární genetika člověka | zk | 2+2 | 3 | - |
PřF:C7187 | Experimentální onkologie | zk | 2+2 | 3 | - |
12 kreditů |