Experimentální biologie rostlin

Cílem programu Experimentální biologie rostlin je vyškolit špičkové samostatné vědecké pracovníky v oblasti rostlinné biologie. Absolventi získají komplexní znalosti v tématech zaměřených na rostlinnou genetiku, molekulární či buněčnou biologii a fyziologii rostlin. Program pokrývá výzkum základních biologických procesů v rostlinných organismech, jako jsou fotosyntéza, metabolismus, hormonální regulace, růst a vývoj rostlin, a to na úrovni genů, genomů, buněk, pletiv, celých organismů i v kontextu jejich interakcí s prostředím.

Hlavní důraz je kladen na vědecké formování doktorandů, kteří budou systematicky školeni ve výzkumných a také přenositelných dovednostech. Cílem je rozvíjet teoretické znalosti i praktické zkušenosti s moderními metodami, zaměřenými na výzkum rostlin. Samotné těžiště činnosti studentů spočívá v jejich vlastní vědecké práci. Program navíc klade důraz na interdisciplinaritu a reaguje na současné výzvy a požadavky rychle se rozvíjejících oblastí výzkumu rostlinné biologie.

Program Experimentální biologie rostlin bude sdružovat výzkumná témata řešená na několika ústavech a pracovištích. To zahrnuje zejména Přírodovědeckou fakultu Masarykovy univerzity –Národní centrum pro výzkum biomolekul (NCBR) a Ústav experimentální biologie (ÚEB) a Středoevropský technologický institut MU (CEITEC MU). Zapojeny budou také další akademické instituce, jako je Biofyzikální ústav AV ČR (BFÚ), Ústav experimentální botaniky AV ČR v Olomouci (zejm. Centrum strukturní a funkční genomiky rostlin) nebo CzechGlobe – Ústav výzkumu globální změny AV ČR. Program nabídne výzkumná témata týkající se širokého spektra oblastí jako jsou studium genetické výbavy a genomu rostlin, udržování a evoluce rostlinných chromozomů, analýza proteinů zapojených do růstu, vývoje a hormonální regulace rostlin, fyziologické adaptace rostlin, genetické inženýrství a biotechnologie s cílem porozumět procesům důležitým pro udržitelné zemědělství a biotechnologické aplikace.

Absolventi programu budou připraveni primárně na kariéru v základním i aplikovaném výzkumu v akademickém prostředí a v soukromém sektoru (včetně biotechnologických a zemědělských společností), ale díky své interdisciplinární odbornosti, zkušenostem z výzkumu a získaným přenositelným znalostem (soft skills) budou nacházet uplatnění i v dalších karierních cestách ve společnosti. Program nabídne mezinárodní spolupráci, účast na prestižních fórech a vědeckých konferencích, přičemž zvláštní důraz bude kladen na využívání angličtiny jako hlavního komunikačního jazyka ve vědecké komunitě.

Absolvent je po úspěšném ukončení studia schopen:

• Samostatně a kreativně plánovat a realizovat vědecké a výzkumné aktivity v oblasti experimentální biologie rostlin, s důrazem na pokročilé metody molekulární biologie, fyziologie rostlin a genetické manipulace.
• Sepsat a připravit k publikaci připravit kritický vědecký text v podobě odborných článků zaměřených na experimentální biologii rostlin.
• Prezentovat a obhájit výsledky vlastního výzkumu na mezinárodních vědeckých konferencích a fórech.
• Rozumět a aplikovat široké odborné a teoretické znalosti v oblastech experimentální biologie rostlin tedy oblastech molekulární biologie, genetiky, biochemie, fyziologie, anatomie, ekologie či biotechnologie.
• Kriticky hodnotit nejnovější vědecké poznatky a trendy v experimentální biologii rostlin, a přispívat k jejich dalšímu rozvoji prostřednictvím inovativního výzkumu.
• Efektivně komunikovat odborné poznatky v angličtině a zapojit se do mezinárodních vědeckých diskusí a spolupráce.
• Využívat zkušenosti z mezinárodních výzkumných projektů a spoluprací, a integrovat poznatky z různých výzkumných prostředí.
• Předávat získané znalosti a zkušenosti prostřednictvím vlastní pedagogické činnosti nebo vedení studentů, a tím přispívat k rozvoji mladé vědecké komunity.
• Využívat přenositelné dovednosti v oblasti projektového řízení, týmové spolupráce a efektivní vědecké komunikace, které mohou být aplikovány i mimo akademické prostředí.

Absolventi doktorského studijního programu Experimentální biologie rostlin mohou získanou kvalifikaci uplatnit zejména na pracovištích zabývajících se výzkumem ať už z akademických nebo z neakademických pracovišť, stejně jako ve vysokoškolském vzdělávání. Jsou připraveni realizovat samostatnou vědeckou a výzkumnou činnost v oblasti základního i aplikovaného výzkumu, se zaměřením na vývoj nových biotechnologií, genetického inženýrství rostlin, či analýzu molekulárních, buněčných a fyziologických procesů rostlin.

Absolventi jsou kvalifikováni pro vykonávání všech činností spojených s vědeckou prací, včetně řešení koncepčních otázek, organizace vědeckých projektů a výuky. Jejich odborné znalosti a výzkumné dovednosti je činí vhodnými nejen pro akademickou sféru, ale i pro aplikované výzkumné projekty v oblasti udržitelného zemědělství a biotechnologií.

Studenti provádějí výzkum v laboratořích svých školitelů, kde si osvojují praktické dovednosti ve své specializaci. Své praktické i teoretické znalosti dále rozvíjejí prostřednictvím spolupráce s dalšími laboratořemi, a to jak v České republice, tak v zahraničí.

Podmínkou pro obhajobu disertační práce je, aby alespoň část výsledků byla publikována nebo přijata k publikaci v časopise, který je zařazen v databázi Web of Science (WoS) a má impaktní faktor (IF) vyšší než medián daného oboru, přičemž student je prvním autorem publikace. V případě, že časopis má IF pod mediánem, očekává se, že student prezentuje alespoň dvě publikace. U spoluautorských publikací musí student jasně definovat svůj podíl na výsledcích. Preferuje se, aby disertační práce byla sestavena jako soubor již zveřejněných nebo k tisku přijatých prací, doplněný o ucelený úvod, komplexní syntézu a komentář k vlastním výsledkům v kontextu stavu poznání. Při menším počtu publikací má disertační práce podobu monografie popisující a detailně diskutující originálními výsledky doktoranda. Ve výjimečných případech, a to na základě doporučení oborové rady, lze přistoupit z obhajobě disertační práce také v případě absence publikované práce z časopise. Jde především o případy komplexních výzkumů směřujících do nejlepších mezioborových časopisů, nebo v případě metodicky směřovaných prací, kdy doktorand vyvíjí metody a postupy ve spolupráci a bylo by samoúčelné publikovat prvoautorský článek. Požadavkem pro splnění je kompletní text formou monografické dizertace, který popisuje všechny experimentální detaily a dosažené výsledky, které by v ideálním případě měly mít formu vědeckých rukopisů. Uchazeč musí být prvním autorem těchto rukopisů. Nejvhodnější formou je předložení celé práce v jazyce anglickém.