Výpis publikací

SVOBODA, Tomáš, Jakub ČILLÍK, Michal MIKL, Tomáš SLAVÍČEK a Radka SVOBODOVÁ. Data Management and FAIRification in MAFIL. In Czech‐BioImaging Annual Scientific Conference 2024: Imaging Principles of Life. 2024.

SVOBODA, Tomáš, Adrián ROŠINEC, Tomáš RAČEK a Radka SVOBODOVÁ. Data Management of Biological Imaging Data. In ELIXIR CZ Annual Conference 2024: Data management. 2024.

SVOBODA, Tomáš a Adrián ROŠINEC. Data workflows at CEITEC MU. In Setkání OS metodiků MU. 2024.

SVOBODA, Tomáš, Adrián ROŠINEC a Ondřej FILIP. Hands-on experience with big data transfer via iRODS and Onedata. In e-INFRA CZ CONFERENCE 2024. 2024.

SVOBODA, Tomáš. MAFILDB - technická realizace. In FAIR data pro uživatele CF MAFIL. 2024.

BUČEKOVÁ, Gabriela, Viktoriia DOSHCHENKO, Aliaksei CHARESHNEU, Jana PORUBSKÁ, Michal PAJTINKA, Michal OLEKSIK, Tomáš SVOBODA, Vladimír HORSKÝ a Radka SVOBODOVÁ. Rare ring conformations in PDB: Facts or wishful thinking? bioRxiv. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1101/2024.06.20.598822.

ROŠINEC, Adrián a Tomáš SVOBODA. Research Data Management at CEITEC MU. In Open Science Workshop 2024. 2024.

SVOBODA, Tomáš, Adrián ROŠINEC, Tomáš RAČEK, Josef HANDL, Aleš KŘENEK a Radka SVOBODOVÁ. Scientific Dataset Management System for the Research Institute Based on Onedata. In EGI Conference 2024. 2024.

DAUBNER, Lukáš, Raimundas MATULEVICIUS, Barbora BÜHNOVÁ, Matej ANTOL, Michal RŮŽIČKA a Tomáš PITNER. A Case Study on the Impact of Forensic-Ready Information Systems on the Security Posture. Online. In Advanced Information Systems Engineering. Cham: Springer Nature Switzerland, 2023, s. 522-538. ISBN 978-3-031-34559-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-34560-9_31.

SVOBODA, Tomáš, Aleš KŘENEK, Łukasz OPIOŁA, Andrea MANZI a Josef HANDL. Cloudification of scientific experimental data using Onedata. In EGI Conference 2023. 2023.

ROŠINEC, Adrián, Tomáš SVOBODA, Tomáš RAČEK, Aleš KŘENEK a Radka SVOBODOVÁ. Enhancing Data Accessibility: Strategies and Tools for Effective Metadata Management. In IBERGRID 2023. 2023.

SVOBODA, Tomáš, Radka SVOBODOVÁ, David ANTOŠ, Adrián ROŠINEC a Aleš KŘENEK. Introduction to Onedata at CEITEC MU and in Czech National Repository Platform. In MATECHat meeting. 2023.

RAČEK, Tomáš, Tomáš SVOBODA a Radka SVOBODOVÁ. Management of life-science data and their metadata. In XXII. setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2023.

ROŠINEC, Adrián, Tomáš SVOBODA, Tomáš RAČEK, Josef HANDL, Jozef SABO, Aleš KŘENEK a Radka SVOBODOVÁ. Onedata4Sci: Life-science experimental datasets management system. In 3D-BioInfo | ISCB 3D-SIG | ELIXIR Czech Republic Structural Bioinformatics. 2023.

ANTOL, Matej, Michal RŮŽIČKA, Luděk MATYSKA a Jiří MAREK. Public (Health) Sector and Academia. In Martin Komenda. Data-Driven Decision-Making in Medical Education and Healthcare. First edition. Brno: Masaryk University, 2023, s. 51-66. Data Rulezzzz! ISBN 978-80-280-0392-0.

SVOBODA, Tomáš, Aleš KŘENEK a Josef HANDL. Automatic storing, sharing and archiving datasets with Onedata. In EGI Conference 2022. 2022.

SVOBODA, Tomáš, Aleš KŘENEK a Josef HANDL. Automating scientific dataset management and processing using Onedata. In IBERGRID 2022. 2022.

PORTEŠOVÁ, Šárka, Eva NOVÁKOVÁ, Růžena BLAŽKOVÁ, Michal JABŮREK, Ondřej STRAKA, Michal RŮŽIČKA, Matěj SMETANA, Jaroslav TOČÍK, Jana UNČOVSKÁ, Kateřina KREPSOVÁ, Ondřej DVOŘÁK, Ondřej VORÁČ, Jan KOTTMAN, Zdeněk NOVÁK, Petra BUŠKOVÁ, Jindřiška SVOBODOVÁ, Eva MALACHOVÁ a Tereza HRSTKOVÁ. Podporujeme nadané prvňáčky. 2022.

LÍŠKA, Martin, Dávid LUPTÁK, Vít STARÝ NOVOTNÝ, Michal RŮŽIČKA, Boris SHMINKE, Petr SOJKA, Michal ŠTEFÁNIK a Makarius WENZEL. CICM'21 Systems Entries. Online. In 978-3-030-81097-9. INTELLIGENT COMPUTER MATHEMATICS (CICM 2021). CHAM: SPRINGER INTERNATIONAL PUBLISHING AG, 2021, s. 245-248. ISBN 978-3-030-81096-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-81097-9_20.

LHOTÁK, Marin, Martin DUDA, Andrea FOJTŮ, Jan HEJZL, Jan HUTAŘ, Filip KERSCH, Jana KŘÍŽOVÁ, Marek MELICHAR, Martina NEZBEDOVÁ, Miroslav PAVELKA, Eliška PAVLÁSKOVÁ, Jan POKORSKÝ, Michal PŠENIČKA, Ivana ŠLAPÁKOVÁ, Zdeněk TICHÝ, Miroslav BARTOŠEK, Jan BILWACHS, Lukáš HEJTMÁNEK, Zdeněk HRUŠKA, Václav JIROUŠEK, Pavlína KOČIŠOVÁ, Vlastimil KREJČÍŘ, Iveta LODROVÁ, Natalie OSTRÁKOVÁ, Michal RŮŽIČKA, Zdeněk VAŠEK a Petr ŽABIČKA. ARCLib. 2020.

RŮŽIČKA, Michal, Andrea MIRANDA, Lukáš HEJTMÁNEK, Zdeněk VAŠEK, Vlastimil KREJČÍŘ a Miroslav BARTOŠEK. Metodika bitové ochrany digitálních dat. 2019.

LHOTÁK, Martin, Zdeněk VAŠEK a Michal RŮŽIČKA. Projekt ARCLib – vývoj open-source řešení pro dlouhodobou archivaci digitálních dokumentů pro knihovny a další paměťové instituce – aktuální stav. In LTP 2019: Nové trendy a východiská pri budovaní LTP archívov: zborník príspevkov zo 4. medzinárodnej konferencie o dlhodobej archivácii. Bratislava: Univerzitná knižnica v Bratislave, 2019, s. 53-63. ISBN 978-80-89303-77-9.

SOJKA, Petr, Michal RŮŽIČKA a Vít NOVOTNÝ. MIaS: Math-Aware Retrieval in Digital Mathematical Libraries. Online. In Proceedings of the 27th ACM International Conference on Information and Knowledge Management (CIKM '18). Torino, Italy: Association for Computing Machinery, 2018, s. 1923-1926. ISBN 978-1-4503-6014-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3269206.3269233.

RŮŽIČKA, Michal, Vít NOVOTNÝ, Petr SOJKA, Jan POMIKÁLEK a Radim ŘEHŮŘEK. Flexible Similarity Search of Semantic Vectors Using Fulltext Search Engines. Online. In CEUR Workshop Proceedings, Vol. 1923. Vienna, Austria: Neuveden, 2017, s. 1-12. ISSN 1613-0073.

RŮŽIČKA, Michal. Math Information Retrieval for Digital Libraries. Brno: Masaryk University, Faculty of Informatics, 2017, 144 s. Doctoral Thesis.

BARTOŠEK, Miroslav, Michal RŮŽIČKA a Václav STUPKA. Nařízení GDPR a jeho implementace na vysokých školách v ČR – jak na to. In EUNIS-CZ. Dopad zavedení novely VŠ zákona do IS vysokých škol. 1. vyd. Plzeň: Západočeská univerzita v Plzni, 2017, s. 5-14. ISBN 978-80-261-0713-2.

RYGL, Jan, Jan POMIKÁLEK, Radim ŘEHŮŘEK, Michal RŮŽIČKA, Vít NOVOTNÝ a Petr SOJKA. Semantic Vector Encoding and Similarity Search Using Fulltext Search Engines. Online. In Proceedings of the 2nd Workshop on Representation Learning for NLP, RepL4NLP 2017 c/o ACL 2017. Vancouver, Canada: Association for Computational Linguistics, ACL, 2017, s. 81-90. ISBN 978-1-945626-62-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.18653/v1/W17-2611.

RŮŽIČKA, Michal, Petr SOJKA a Martin LÍŠKA. Math Indexer and Searcher under the Hood: Fine-Tuning Query Expansion and Unification Strategies. Online. In Noriko Kando and Kazuaki Kishida and Makoto P. Kato and Shuhei Yamamoto. Proceedings of the 12th NTCIR Conference on Evaluation of Information Access Technologies. Tokyo: National Institute of Informatics, 2-1-2 Hitotsubashi, Chiyoda-ku, Tokyo 101-8430 Japan, 2016, s. 331-337. ISBN 978-4-86049-071-3.

SOJKA, Petr a Michal RŮŽIČKA. Math-Aware Search Interfaces for Digital Mathematical Libraries (DML). 2016.

MELICHAR, Marek, Jan HUTAŘ, Michal RŮŽIČKA, Zdeněk HRUŠKA, Zdeněk VAŠEK, Miroslav BARTOŠEK a Martin LHOTÁK. Projekt ArcLib – budování systému pro dlouhodobou archivaci digitálních dat v českých knihovnách. IT lib. Bratislava: Centrum vedecko-technických informácií SR, 2016, roč. 20, č. 2, s. 13-17. ISSN 1335-793X.

RYGL, Jan, Petr SOJKA, Michal RŮŽIČKA a Radim ŘEHŮŘEK. ScaleText: The Design of a Scalable, Adaptable and User-Friendly Document System for Similarity Searches : Digging for Nuggets of Wisdom in Text. In Aleš Horák, Pavel Rychlý, Adam Rambousek. Proceedings of the Tenth Workshop on Recent Advances in Slavonic Natural Language Processing, RASLAN 2016. Brno: Tribun EU, 2016, s. 79-87. ISBN 978-80-263-1095-2.

LÍŠKA, Martin, Petr SOJKA a Michal RŮŽIČKA. Combining Text and Formula Queries in Math Information Retrieval: Evaluation of Query Results Merging Strategies. In Davood Rafiei, Katsumi Tanaka. NWSearch '15: Proceedings of the First International Workshop on Novel Web Search Interfaces and Systems. New York, NY, USA: ACM, 2015, s. 7-9. ISBN 978-1-4503-3789-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/2810355.2810359.

RŮŽIČKA, Michal, Petr SOJKA a Martin LÍŠKA. Math Indexer and Searcher under the Hood: History and Development of a Winning Strategy. In Noriko Kando, Hideo Joho, Kazuaki Kishida. Proceedings of the 11th NTCIR Conference on Evaluation of Information Access Technologies. Tokyo: National Institute of Informatics, 2-1-2 Hitotsubashi, Chiyoda-ku, Tokyo 101-8430 Japan, 2014, s. 127-134. ISBN 978-4-86049-065-2.

LÍŠKA, Martin, Petr SOJKA a Michal RŮŽIČKA. Math Indexer and Searcher Web Interface: Towards Fulfillment of Mathematicians' Information Needs. In Stephen M. Watt, James H. Davenport, Alan P. Sexton, Petr Sojka, Josef Urban. Intelligent Computer Mathematics CICM 2014. Proceedings of Calculemus, DML, MKM, and Systems and Projects. LNAI 8543. Zurich: Springer International Publishing Switzerland, 2014, s. 444-448. ISBN 978-3-319-08433-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-08434-3_36.

SZALAI, Dominik, Robert ŠIŠKA, David FORMÁNEK, Jakub ADLER a Michal RŮŽIČKA. MathCanEval 1.0. 2014.

FORMÁNEK, David, Robert ŠIŠKA, Dominik SZALAI, Jakub ADLER, Michal RŮŽIČKA, Martin LÍŠKA a Petr SOJKA. MathML Canonicalizer 1.0.0. 2014.

RŮŽIČKA, Michal. Maths Information Retrieval for Digital Libraries. 2014. ISBN 978-3-319-08434-3.

LÍŠKA, Martin, Petr SOJKA a Michal RŮŽIČKA. WebMIaS 1.5. 2014.

SOJKA, Petr, Michal RŮŽIČKA, Maroš KUCBEL a Martin JARMAR. Accessibility Issues in Digital Mathematical Libraries. In Proceedings of the Conference Universal Learning Design 2013. Brno: Masaryk University, 2013, s. 89-97. ISBN 978-80-210-6270-2.

KREJČÍŘ, Vlastimil, Tomáš HOFMAN, Michal RŮŽIČKA a Miroslav BARTOŠEK. DML-CZ DSpace. 2013.

RŮŽIČKA, Michal. Masaryk University DOI Tools. 2013.

RŮŽIČKA, Michal, Petr KOVÁŘ a Vlastimil KREJČÍŘ. Metadata Editor FFdigi. 2013.

LÍŠKA, Martin, Petr SOJKA a Michal RŮŽIČKA. Similarity Search for Mathematics: Masaryk University team at the NTCIR-10 Math Task. In Noriko Kando, Kazuaki Kishida. Proceedings of the 10th NTCIR Conference on Evaluation of Information Access Technologies. Tokyo: National Institute of Informatics, 2-1-2 Hitotsubashi, Chiyoda-ku, Tokyo 101-8430 Japan, 2013, s. 686-691. ISBN 978-4-86049-062-1.

WOJCIECHOWSKI, Krzys, Petr SOJKA, Nicolas HOUILLON, Michal RŮŽIČKA, Radim HATLAPATKA, Vlastimil KREJČÍŘ, Miroslav HRDINA, Jiří SOCHOR, Pavel RYCHLÝ, Aleš HORÁK, Alan SEXTON, Gilberto PEDROSA, Franck LONTIN, Thierry BOUCHE a Maciej KOŁUDA. Toolset for Image and Text Processing and Metadata Enhancements — Final Release: Deliverable 7.4 of project EuDML. 1 as of 9th February 2013. EU CIP-ICT-PSP project 250503 EuDML: The European Digital Mathematics Library, 2013, 24 s. Deliverable D7.4.

RŮŽIČKA, Michal, Petr SOJKA a Vlastimil KREJČÍŘ. Towards Machine-Actionable Modules of a Digital Mathematics Library: The Example of DML-CZ. In J. Carette et al. CICM 2013, LNAI 7961. Berlin / Heidelberg: Springer, 2013, s. 263-277. ISBN 978-3-642-39319-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-39320-4_17.

LÍŠKA, Martin, David FORMÁNEK, Michal RŮŽIČKA a Petr SOJKA. MathML Canonicalizer. 2012.

FORMÁNEK, David, Martin LÍŠKA, Michal RŮŽIČKA a Petr SOJKA. Normalization of Digital Mathematics Library Content. In Petr Sojka, Michael Kohlhase. DML 2012: Towards a Digital Mathematics Library. Brno: Masaryk University, 2012, s. 91-103. ISSN 1613-0073.

FORMÁNEK, David, Martin LÍŠKA, Michal RŮŽIČKA a Petr SOJKA. Normalization of Digital Mathematics Library Content. In CEUR Workshop Proceedings, Volume 921. Aachen: Neuveden, 2012, s. 91-103, 12 s. ISSN 1613-0073.

SOJKA, Petr, Krzysztof WOJCIECHOWSKI, Nicolas HOUILLON, Michal RŮŽIČKA a Radim HATLAPATKA. Toolset for Image and Text Processing and Metadata Enhancements — Value release: Deliverable 7.3 of project EuDML. 1.01 as of 8th March 2012. EU CIP-ICT-PSP project 250503 EuDML: The European Digital Mathematics Library, 2012, 32 s. Deliverable D7.3.

SOJKA, Petr, Martin LÍŠKA a Michal RŮŽIČKA. Building Corpora of Technical Texts : Approaches and Tools. In Aleš Horák, Pavel Rychlý. Fifth Workshop on Recent Advances in Slavonic Natural Languages Processing, RASLAN 2011. první. Brno: Tribun EU, 2011, s. 71--82, 11 s. ISBN 978-80-263-0077-9.

RŮŽIČKA, Michal. Použití Subversion pro verzování TeXových dokumentů. Zpravodaj CSTUG. Brno: CSTUG, 2011, roč. 2011, č. 1, s. 21–64. ISSN 1211-6661. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5300/2011-1/21.

RŮŽIČKA, Michal a Petr SOJKA. Redakční systém odborného časopisu s podporou exportu do digitální knihovny. Zpravodaj CSTUG. Brno: CSTUG, 2011, roč. 2011, č. 1, s. 4–20. ISSN 1211-6661. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5300/2011-1/4.

RŮŽIČKA, Michal a Petr SOJKA. Scientific Journal Processing System with the Capability of Exporting to a Digital Library using MathML. 2011.

LÍŠKA, Martin, Petr SOJKA, Michal RŮŽIČKA a Peter MRAVEC. Web Interface and Collection for Mathematical Retrieval : WebMIaS and MREC. In Petr Sojka, Thierry Bouche. DML 2011: Towards a Digital Mathematics Library. Brno: Masaryk University, 2011, s. 77-84. ISBN 978-80-210-5542-1.