Výpis publikací

2024

1. Detekce klinicky významné varianty genu MYD88 ve volné DNA získané z tekutých biopsií pacientů s lymfomy postihujícími centrální nervovou soustavu: likvor nebo plazma?

   NAVRKALOVÁ, Veronika, Andrea MAREČKOVÁ, Samuel HRICKO, Viera HRABČÁKOVÁ, Jakub Paweł PORC, Klára ČINÁTLOVÁ, Natálie KAZDOVÁ, Hana HALÁMOVÁ, Martina FILIPOVÁ, Andrea JANÍKOVÁ a Jana KOTAŠKOVÁ. Detekce klinicky významné varianty genu MYD88 ve volné DNA získané z tekutých biopsií pacientů s lymfomy postihujícími centrální nervovou soustavu: likvor nebo plazma? In 26. celostátní konference DNA diagnostiky. 2024.

   Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2455731/cs
2. FoxO1/Rictor axis induces a non-genetic adaptation to Ibrutinib via Akt activation in chronic lymphocytic leukemia

   ONDRIŠOVÁ, Laura, Václav ŠEDA, Kryštof HLAVÁČ, Petra PAVELKOVÁ, Eva HOFERKOVÁ, Giorgia CHIODIN, Lenka KOŠŤÁLOVÁ, Gabriela MLADONICKÁ PAVLASOVÁ, Daniel FILIP, Josef VEČEŘA, Pedro FARIA ZENI, Jan OPPELT, Zuzana KAHOUNOVÁ, Rachel VICHOVA, Karel SOUČEK, Anna PANOVSKÁ, Karla PLEVOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Martin ŠIMKOVIČ, Filip VRBACKÝ, Daniel LYSÁK, Stacey M. FERNANDES, M.S. DAVIDS, Alba MAIQUES-DIAZ, Stella CHARALAMPOPOULOU, Jose I. MARTIN-SUBERO, Jenifer R. BROWN, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. FoxO1/Rictor axis induces a non-genetic adaptation to Ibrutinib via Akt activation in chronic lymphocytic leukemia. The Journal of Clinical Investigation. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1172/JCI173770.

   Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2446258/cs
3. Chromatin complexity in cancer: Unraveling the impact of complex structural variations in chronic lymphocytic leukemia

   ČERNOVSKÁ, Karolína, Jakub Paweł PORC, Katarína ZÁVACKÁ, Kamila STRÁNSKÁ, Sabina ADAMOVÁ, Eva ONDROUŠKOVÁ, Marie JAROŠOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Chromatin complexity in cancer: Unraveling the impact of complex structural variations in chronic lymphocytic leukemia. In EMBO Workshop - Chromatin Biology in Cancer 2024. 2024.

   Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2455748/cs
4. Integrative NGS testing reveals clonal dynamics of adverse genomic defects contributing to a natural progression in treatment-naïve CLL patients

   NAVRKALOVÁ, Veronika, Karla PLEVOVÁ, Lenka RADOVÁ, Jakub Paweł PORC, Karol PÁL, Jitka MALČÍKOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Michael DOUBEK, Anna PANOVSKÁ, Jana KOTAŠKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Integrative NGS testing reveals clonal dynamics of adverse genomic defects contributing to a natural progression in treatment-naïve CLL patients. British journal of haematology. Hoboken: Wiley-Blackwell, 2024, roč. 204, č. 1, s. 240-249. ISSN 0007-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/bjh.19191.

   Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2372237/cs
5. Klonální kompetice a alterace molekulárních drah u chronické lymfocytární leukémie

   TAUŠOVÁ, Kristýna, Jakub Paweł PORC, Petr TAUŠ, Karol PÁL, Šárka PAVLOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Kamila STRÁNSKÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Boris TICHÝ, Hana SKUHROVÁ FRANCOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Michael DOUBEK, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Klonální kompetice a alterace molekulárních drah u chronické lymfocytární leukémie. In 26. celostátní konference DNA diagnostiky. 2024.

   Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2455725/cs
6. Potenciál pokročilých genomických metod pro analýzu komplexního karyotypu: příklad využití u chronické lymfocytární leukémie

   ČERNOVSKÁ, Karolína, S. ADAMOVÁ, Jan SVATOŇ, Jakub Paweł PORC, Natálie KAZDOVÁ, Eva ONDROUŠKOVÁ, Kristýna TAUŠOVÁ, M. BOHÚNOVÁ, T. RAUSCH, Karol PÁL, Jakub HYNŠT, Vladimír BENEŠ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Marie JAROŠOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Potenciál pokročilých genomických metod pro analýzu komplexního karyotypu: příklad využití u chronické lymfocytární leukémie. In 26. celostátní konference DNA diagnostiky. 2024.

   Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2455743/cs
7. The Genomic Landscape of Lymphomas Invading the Central Nervous System Inferred from Cell-Free DNA by Integrative NGS Analysis and the Diagnostic Benefit Compared to Flow Cytometry

   NAVRKALOVÁ, Veronika, Andrea MARECKOVA, Viera HRABCAKOVA, Samuel HRICKO, Jakub Paweł PORC, Martina FILIPOVÁ, Andrea JANÍKOVÁ a Jana KOTAŠKOVÁ. The Genomic Landscape of Lymphomas Invading the Central Nervous System Inferred from Cell-Free DNA by Integrative NGS Analysis and the Diagnostic Benefit Compared to Flow Cytometry. In Annual Meeting of the Association-for-Molecular-Pathology (AMP). 2024. ISSN 1525-1578.

   Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2431608/cs
8. The non-canonical BAF chromatin remodeling complex is a novel target of spliceosome dysregulation in SF3B1-mutated chronic lymphocytic leukemia

   HAGERSTRAND, Daniel, Blaz ODER, Diego CORTESE, Ying QU, Amrei BINZER-PANCHAL, Cecilia OSTERHOLM, Teresa Del Peso SANTOS, Leily RABBANI, Hassan Foroughi ASL, Aron SKAFTASON, Viktor LJUNGSTROM, August LUNDHOLM, Maria KOUTROUMANI, Zahra HAIDER, Cecilia JYLHA, John MOLLSTEDT, Larry MANSOURI, Karla PLEVOVÁ, Andreas AGATHANGELIDIS, Lydia SCARFO, Marine ARMAND, Alice F MUGGEN, Neil E KAY, Tait SHANAFELT, Davide ROSSI, Lukas M ORRE, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Konstantin BARYLYUK, Frederic DAVI, Mattias VESTERLUND, Anton W LANGERAK, Janne LEHTIO, Paolo GHIA, Kostas STAMATOPOULOS, Lesley-Ann SUTTON a Richard ROSENQUIST. The non-canonical BAF chromatin remodeling complex is a novel target of spliceosome dysregulation in SF3B1-mutated chronic lymphocytic leukemia. Leukemia. LONDON: SPRINGERNATUR, 2024, roč. 38, č. 11, s. 2429-2442. ISSN 0887-6924. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41375-024-02379-4.

   Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2447550/cs
9. The 1+Million Genomes Minimal Dataset for Cancer

   RIBA, Michela, Cinzia SALA, Aedin C CULHANE, Asmund FLOBAK, Attila PATOCS, Kjetil BOYE, Karla PLEVOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Giorgia GANDOLFI, Marco J MORELLI, Gabriele BUCCI, Anders EDSJO, Ulrik LASSEN, Fatima AL-SHAHROUR, Nuria LOPEZ-BIGAS, Randi HOVLAND, Edwin CUPPEN, Alfonso VALENCIA, Helene A POIREL, Richard ROSENQUIST, Serena SCOLLEN, Juan Arenas MARQUEZ, Jeroen BELIEN, De Nicolo ARCANGELA, De Maria RUGGERO, David TORRENTS a Giovanni TONON. The 1+Million Genomes Minimal Dataset for Cancer. Nature genetics. Berlin: Nature Publishing Group, 2024, roč. 56, č. 5, s. 733-736. ISSN 1061-4036. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41588-024-01721-x.

   Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2407780/cs
10. Unveiling the dynamics and molecular landscape of a rare chronic lymphocytic leukemia subpopulation driving refractoriness: insights from single-cell RNA sequencing

    KURUCOVÁ, Terézia, Kamila RÉBLOVÁ, Pavlína JANOVSKÁ, Jakub Paweł PORC, Veronika NAVRKALOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Boris TICHÝ, Michael DOUBEK, Vítězslav BRYJA, Jana KOTAŠKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Unveiling the dynamics and molecular landscape of a rare chronic lymphocytic leukemia subpopulation driving refractoriness: insights from single-cell RNA sequencing. Molecular oncology. Hoboken: Wiley, 2024, roč. 18, č. 10, s. 2541-2553. ISSN 1574-7891. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/1878-0261.13663.

    Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2407762/cs