Vámi zvolený výběr obsahuje 114 výsledků. Upravit výběr.
Filtrování publikací
-
PAJTINKA, Peter a Robert VÁCHA. Amphipathic Helices Can Sense Both Positive and Negative Curvatures of Lipid Membranes. Journal of physical chemistry letters. Washington DC: AMER CHEMICAL SOC1155 16TH ST, NW, WASHINGTON, DC 20036, 2024, roč. 15, č. 1, s. 175-179. ISSN 1948-7185. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jpclett.3c02785.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Pajtinka, Peter (703 Slovensko, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: lipid bilayers; amphiphilic helices; positive-negative membrane curvature
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 8. 8. 2024 13:20.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2361861/cs -
DEB, Rahul, Marcelo D T TORRES, Miroslav BOUDNÝ, Marketa KOBERSKA, Floriana CAPPIELLO, Miroslav POPPER, Katerina DVORAKOVA BENDOVA, Martina DRABINOVÁ, Adelheid HANACKOVA, Katy JEANNOT, Milos PETRIK, Maria Luisa MANGONI, Gabriela BALIKOVA NOVOTNA, Marek MRÁZ, Cesar DE LA FUENTE-NUNEZ a Robert VÁCHA. Computational Design of Pore-Forming Peptides with Potent Antimicrobial and Anticancer Activities. Journal of Medicinal Chemistry. Washington: American Chemical Society, 2024, roč. 67, č. 16, s. 14040-14061. ISSN 0022-2623. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jmedchem.4c00912.URL
angličtina. Spojené státy.
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 19. 9. 2024 08:44.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2430458/cs -
BARTOŠ, Ladislav, Anant K. MENON a Robert VÁCHA. Insertases scramble lipids: Molecular simulations of MTCH2. Structure. 2024, roč. 2024, č. 32, s. 505-510. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.str.2024.01.012.URL
Klíčová slova anglicky: flip-flop rate; free energy barrier; hydrophilic groove; insertase; membrane defect; molecular dynamics; scramblase
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 7. 8. 2024 21:11.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2392637/cs -
KHODAM HAZRATI, Mehrnoosh a Robert VÁCHA. Membrane Adsorption Enhances Translocation of Antimicrobial Peptide Buforin 2. Journal of Physical Chemistry B. WASHINGTON: American Chemical Society, 2024, roč. 128, č. 35, s. 8469-8476. ISSN 1520-6106. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.4c04338.URL
angličtina. Spojené státy.
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 11. 9. 2024 21:47.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2431699/cs -
BLASCO, Sofia, Lukáš SUKENÍK a Robert VÁCHA. Nanoparticle induced fusion of lipid membranes. Nanoscale. CAMBRIDGE: Royal Society of Chemistry, 2024, roč. 16, č. 21, s. 10221-10229. ISSN 2040-3364. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/d4nr00591k.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Blasco, Sofia (724 Španělsko, domácí) -- Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: GOLD NANOPARTICLES; VESICLE FUSION; SIMULATIONS; MOLECULES; MECHANISM; STALK
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 7. 8. 2024 21:11.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2407878/cs -
BARTOŠ, Ladislav, Martina DRABINOVÁ a Robert VÁCHA. Optimizing properties of translocation-enhancing transmembrane proteins. Biophysical Journal. 2024, roč. 123, č. 10, s. 1240-1252. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2024.04.009.URL
angličtina. Spojené státy.
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 7. 8. 2024 21:10.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2403318/cs -
BIRIUKOV, Denys a Robert VÁCHA. Pathways to a Shiny Future: Building the Foundation for Computational Physical Chemistry and Biophysics in 2050. Online. ACS PHYSICAL CHEMISTRY AU. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2024, roč. 4, č. 4, s. 302-313. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acsphyschemau.4c00003.URL
angličtina. Spojené státy.
Klíčová slova anglicky: molecular dynamics; multiscale modeling; artificialintelligence; simulation databases; computationalphysical chemistry; computational biophysics
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 7. 8. 2024 21:09.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2421704/cs -
BARTOŠ, Ladislav a Robert VÁCHA. Peptide translocation across asymmetric phospholipid membranes. Biophysical Journal. 2024, roč. 123, č. 6, s. 693-702. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2024.02.006.URL
angličtina. Spojené státy.
Recenzováno: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 7. 8. 2024 21:09.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2403339/cs -
DEB, Rahul, Ivo KABELKA, Jan PŘIBYL a Robert VÁCHA. De novo design of peptides that form transmembrane barrel pores killing antibiotic resistant bacteria. In BPS Annual Meeting 2023. 2023.URL
Název česky: De novo design peptidů, které tvoří transmembránové válcovité póry zabíjející bakterie odolné vůči antibiotikům
RIV/00216224:14740/23:00132296 Konferenční abstrakt. angličtina. Spojené státy.
Deb, Rahul (356 Indie, domácí) -- Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Přibyl, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: antimicrobial peptide design; transmembrane nanopores; atomic force microscopy; CryoEM
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 6. 4. 2024 19:48.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2340060/cs -
BLASCO, Sofia, Lukáš SUKENÍK a Robert VÁCHA. Designing spheroidal nanoparticles to induce membrane fusion of liposomes. In EMBO Workshop Mechanisms of membrane fusion 2023. 2023.
Název česky: Návrh sférických nanočástic k indukci membránové fúze liposomů
RIV/00216224:14740/23:00132214 Konferenční abstrakt. angličtina. Německo.
Blasco, Sofia (724 Španělsko, domácí) -- Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: design of nanoparticles; liposomes; membrane fusion; molecular dynamics simulations
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 14. 11. 2023 11:54.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2337579/cs -
BIRIUKOV, Denys a Matti JAVANAINEN. Efficient Simulations of Solvent Asymmetry Across Lipid Membranes Using Flat-Bottom Restraints. Journal of Chemical Theory and Computation. Washington DC: American Chemical Society, 2023, roč. 19, č. 18, s. 6332-6341. ISSN 1549-9618. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jctc.3c00614.URL
RIV/00216224:14740/23:00131808 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Biriukov, Denys (804 Ukrajina, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: LINEAR CONSTRAINT SOLVER; PARTICLE MESH EWALD; MOLECULAR-DYNAMICS; COMPUTATIONAL LIPIDOMICS; FORCE-FIELD; BILAYERS; ALGORITHM; BUILDER; UPDATE; LINCS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 5. 4. 2024 09:14.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2319240/cs -
SUKENÍK, Lukáš, Liya MUKHAMEDOVA, Michaela PROCHÁZKOVÁ, Karel ŠKUBNÍK, Pavel PLEVKA a Robert VÁCHA. Elucidating the Mechanisms of Genome Release in Picornaviruses using Cryo-EM and Coarse-Grained Simulations. In EBSA Congress 2023. 2023.URL
Název česky: Objasnění mechanismů uvolnění genomu u pikonavirů pomocí Kryo-EM a "Coarse-Grained" simulací
RIV/00216224:14740/23:00132208 Konferenční abstrakt. angličtina. Švédsko.
Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Mukhamedova, Liya (643 Rusko, domácí) -- Procházková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Škubník, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: piconaviruses; genome release; cryoEM; coarse grained simulation; virus like particles
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 6. 3. 2024 09:10.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2337319/cs -
KHODAM HAZRATI, Mehrnoosh a Robert VÁCHA. Membrane adsorption enhances translocation of antimicrobial peptide buforin 2. In EBSA Congress 2023. 2023.URL
Název česky: Membranová adsorpce zvyšuje translokaci antimikrobiálního peptidu buforin 2
RIV/00216224:14740/23:00132213 Konferenční abstrakt. angličtina. Švédsko.
Khodam Hazrati, Mehrnoosh (364 Írán, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: antimicrobial peptides; buforin 2; intracelular interactions; buforin 2 membrane translocation
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 14. 11. 2023 12:18.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2337517/cs -
BIRIUKOV, Denys, Riopedre Fernández MIGUEL a Martinez-Seara HECTOR. Model Sugars Right: Improved Interactions of Glycans in All-Atom Molecular Dynamics Simulations. In GGMM 2023 – Young Modellers Conference. 2023.URL
Název česky: Správný model: Vylepšení interakcí glykanů v simulacích molekulové dynamiky
RIV/00216224:14740/23:00132294 Konferenční abstrakt. angličtina. Francie.
Biriukov, Denys (804 Ukrajina, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: glycosaminglycans; drug design; molecular dynamics simulations
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 6. 3. 2024 09:08.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2339986/cs -
BIRIUKOV, Denys, Timothée Emmanuel J. RIVEL a Robert VÁCHA. Multiple factors modulating the formation of toroidal membrane pores. In NIVB MEETING 2023. 2023. ISSN 2336-7202.URL
Název česky: Faktory modulující tvorbu toroidních membránových pórů
RIV/00216224:14740/23:00132221 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Biriukov, Denys (804 Ukrajina, domácí) -- Rivel, Timothée Emmanuel J. (250 Francie, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: membrane pore formation; cell membrane; drug delivery; molecular dynamics
Druh účasti: aktivní účast
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 14. 11. 2023 10:07.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2338722/cs -
JAHN, Helene, Ladislav BARTOŠ, Grace I. DEARDEN, Jeremy S. DITTMAN, Joost C. M HOLTHUIS, Robert VÁCHA a Anant K. MENON. Phospholipids are imported into mitochondria by VDAC, a dimeric beta barrel scramblase. Nature Communications. Heidelberger: Nature Research, 2023, roč. 14, č. 1, s. 1-16. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-43570-y.URL
RIV/00216224:14740/23:00133057 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Jahn, Helene (840 Spojené státy) -- Bartoš, Ladislav (203 Česká republika, domácí) -- Dearden, Grace I. (840 Spojené státy) -- Dittman, Jeremy S. (840 Spojené státy) -- Holthuis, Joost C. M (276 Německo) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Menon, Anant K. (276 Německo, garant)
Klíčová slova anglicky: Mitochondria; Phospholipids; Saccharomyces cerevisiae; Voltage-Dependent Anion Channels
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 11. 4. 2024 11:07.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2361877/cs -
LIRUSSI, Frederic, Kyrylo PYRSHEV, Semen YESYLEVSKYY, Timothée Emmanuel Jonathan RIVEL, Tatiana LOPEZ, Eleonore COPPENS, Simona MURA, Patrick COUVREUR a Christophe RAMSEYER. Plasma membrane lipid bilayer is druggable: Selective delivery of gemcitabine-squalene nano-medicine to cancer cells. Biochimica et Biophysica Acta - Molecular Basis of Disease. Amsterdam: ELSEVIER SCIENCE BV, 2023, roč. 1869, č. 2, s. 1-12. ISSN 0925-4439. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bbadis.2022.166614.URL
RIV/00216224:14740/23:00133950 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Lirussi, Frederic (garant) -- Rivel, Timothée Emmanuel Jonathan (250 Francie, domácí)
Klíčová slova anglicky: Gemcitabine-squalene; Nanomedicine; Lipid composition; Selective delivery; Plasma membrane; Cancer targeting
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 10. 4. 2024 12:07.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2392899/cs -
VAZDAR, K., C. TEMPRA, A. OLŻYŃSKA, Denys BIRIUKOV, L. CWIKLIK a M. VAZDAR. Stealthy Player in Lipid Experiments? EDTA Binding to Phosphatidylcholine Membranes Probed by Simulations and Monolayer Experiments. Journal of Physical Chemistry B. WASHINGTON: American Chemical Society, 2023, roč. 127, č. 24, s. 5462-5469. ISSN 1520-6106. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.3c03207.URL
RIV/00216224:14740/23:00131072 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Biriukov, Denys (804 Ukrajina, domácí) -- Cwiklik, L. (garant)
Klíčová slova anglicky: phosphatidylcholine monolayers; EDTA; molecular simulation dynamics; Langmuir monolayer experiments
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 4. 4. 2024 21:57.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2293419/cs -
FALGINELLA, Francesco Luca, Marek KRAVEC, Martina DRABINOVÁ, Petra PACLÍKOVÁ, Vítězslav BRYJA a Robert VÁCHA. Binding of DEP domain to phospholipid membranes: More than just electrostatics. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes. Amsterdam: Elsevier, 2022, roč. 1864, č. 10, s. 1-12. ISSN 0005-2736. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bbamem.2022.183983.URL
RIV/00216224:14740/22:00127606 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Falginella, Francesco Luca (380 Itálie, domácí) -- Kravec, Marek (703 Slovensko, domácí) -- Drabinová, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Paclíková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: DVL protein; DEP domain; Lipid membrane; Molecular dynamics; Flow cytometry; QCM-D; Lipid preference; Phosphatidylserine; Phosphatidic acid; Phosphatidylinositol
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 31. 1. 2023 14:31.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2242919/cs -
DEB, Rahul, Ivo KABELKA, Jan PŘIBYL a Robert VÁCHA. De novo design of peptides that form transmembrane barrel pores killing antibiotic resistant bacteria. 2022.Link to bioRxiv Link to Single-Molecule Protein Sequencing 3 (SMPS3) conference
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: Rahul Deb, M.Sc., učo 241774. Změněno: 9. 11. 2022 11:36.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2230237/cs -
SUKENÍK, Lukáš, Rahul DEB a Robert VÁCHA. HOW LARGE MOLECULES CAN ENTER CELL. In Czech Chemical Society Symposium Series - Annual meeting of the National Institute of Virology and Bacteriology (NIVB). 2022. ISSN 2336-7202.URL
RIV/00216224:14740/22:00128568 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Deb, Rahul (356 Indie, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: LARGE MOLECULES; CELL
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 6. 2. 2023 16:57.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2253242/cs -
KABELKA, Ivo, Vasil GEORGIEV, Lisa MARX, Peter PAJTINKA, Karl LOHNER, Georg PABST, Rumiana DIMOVA a Robert VÁCHA. Magainin 2 and PGLa in Bacterial Membrane Mimics III: Membrane Fusion and Disruption. Biophysical Journal. New York, USA: Cell Press, 2022, roč. 121, č. 5, s. 852-861. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2021.12.035.URL
RIV/00216224:14740/22:00125525 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Pajtinka, Peter (703 Slovensko, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Cell Membrane; Cryoelectron Microscopy; Lipid Bilayers; Magainins; Membrane Fusion
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 1. 2023 15:57.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1841097/cs -
SEMERARO, E.F., Peter PAJTINKA, L. MARX, Ivo KABELKA, R. LEBER, K. LOHNER, Robert VÁCHA a G. PABST. Magainin 2 and PGLa in bacterial membrane mimics IV: Membrane curvature and partitioning. BIOPHYSICAL JOURNAL. UNITED STATES: CELL PRESS, 2022, roč. 121, č. 23, s. 4689-4701. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2022.10.018.URL
RIV/00216224:14740/22:00127107 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Pajtinka, Peter (703 Slovensko, domácí) -- Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: LIPID-BILAYERSANTIBIOTIC PEPTIDEFORCE-FIELDFLUORESCENCEDYNAMICSSIMULATIONSMECHANISMSYNERGISMFUSIONMODEL
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 2. 2023 21:20.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2230384/cs -
PETERKOVÁ, Kateřina, Ivo DURNÍK, Radek MAREK, Janez PLAVEC a Peter PODBEVŠEK. Pyrene-Lablled G-Quadruplexes Derived from the KIT Proto-Oncogene. In 35th Central European NMR Meeting, VALTICE, 2022. 2022.
angličtina. Česká republika.
Klíčová slova anglicky: NMR, G-Quadruplexes, KIT proto-oncogene, decoy strategy
Druh účasti: aktivní účast
Změnila: Mgr. Kateřina Peterková, Ph.D., učo 423977. Změněno: 11. 4. 2022 12:10.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1846457/cs -
PETERKOVÁ, Kateřina, Ivo DURNÍK, Radek MAREK, Janez PLAVEC a Peter PODBEVŠEK. Structural analysis of pyrene-labelled G-quadruplexes derived from the KIT proto-oncogene. In XIIth International conference, NMR: a tool for biology, Institut Pasteur. 2022.
Klíčová slova anglicky: NMR, G-Quadruplexes, KIT proto-oncogene, decoy strategy
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: Mgr. Ivo Durník, Ph.D., učo 424066. Změněno: 30. 5. 2023 16:25.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1851397/cs -
KHIRSARIYA, PrashantKumar, Patrik POSPÍŠIL, Lukáš MAIER, Miroslav BOUDNÝ, Martin BABÁŠ, Ondřej KROUTIL, Marek MRÁZ, Robert VÁCHA a Kamil PARUCH. Synthesis and Profiling of Highly Selective Inhibitors of Methyltransferase DOT1L Based on Carbocyclic C-Nucleosides. Journal of Medicinal Chemistry. Washington: American Chemical Society, 2022, roč. 65, č. 7, s. 5701-5723. ISSN 0022-2623. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jmedchem.1c02228.URL
RIV/00216224:14310/22:00125850 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Khirsariya, PrashantKumar (356 Indie, domácí) -- Pospíšil, Patrik (203 Česká republika, domácí) -- Maier, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Boudný, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Babáš, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Kroutil, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Mráz, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Paruch, Kamil (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Molecular structure; Genetics; Ethanol; Inhibitors; Assays; leukemia; DOT1L
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 27. 5. 2022 16:00.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1854512/cs -
DRABINOVÁ, Martina, Martina ČARNECKÁ, Otakar HUMPA, Iva SLANINOVÁ a Jiří SLANINA. Acetylace 7-hydroxy skupiny dibenzocyklooktadienových lignanů zvyšuje inhibici P-glykoproteinu. In 65. Studentská vědecká konference - program a sborník abstraktů. 2021. ISBN 978-80-210-6313-6.URL
Název česky: Acetylace 7-hydroxy skupiny dibenzocyklooktadienových lignanů zvyšuje inhibici P-glykoproteinu
Název anglicky: Acetylation of 7-hydroxygroup of dibenzocyclooktadiene lignans increases inhibition of P-glycoprotein
RIV/00216224:14110/21:00123775 Konferenční abstrakt. čeština. Česká republika.
Drabinová, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Čarnecká, Martina (703 Slovensko, domácí) -- Humpa, Otakar (203 Česká republika, domácí) -- Slaninová, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Slanina, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Acetylation; dibenzocyclooctadiene lignans; doxorubicin; multidrug resistance; Pglycoprotein; Schisandra
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: Mgr. Jiří Slanina, Ph.D., učo 689. Změněno: 7. 2. 2022 13:53.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1822763/cs -
KABELKA, Ivo a Robert VÁCHA. Advances in Molecular Understanding of α-helical Membrane-Active Peptides. Accounts of chemical research. American Chemical Society, 2021, roč. 54, č. 9, s. 2196-2204. ISSN 0001-4842. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.accounts.1c00047.URL
RIV/00216224:14740/21:00118992 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: ANTIMICROBIAL PEPTIDESPORE FORMATIONMAGAININ 2LIPID-BILAYERSBUFORIN IISIMULATIONSMECHANISMTRANSLOCATIONSPECTROSCOPYALAMETHICIN
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 2. 2022 15:16.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1773100/cs -
ŠKUBNÍK, Karel, Lukáš SUKENÍK, David BUCHTA, Tibor FÜZIK, Michaela PROCHÁZKOVÁ, Jana MORAVCOVÁ, Lenka ŠMERDOVÁ, Antonín PŘIDAL, Robert VÁCHA a Pavel PLEVKA. Capsid opening enables genome release of iflaviruses. Science advances. New York: American Association for the Advancement of Science, 2021, roč. 7, č. 1, s. 1-9. ISSN 2375-2548. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1126/sciadv.abd7130.URL
RIV/00216224:14740/21:00118990 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Škubník, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Buchta, David (203 Česká republika, domácí) -- Füzik, Tibor (703 Slovensko, domácí) -- Procházková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Moravcová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Šmerdová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Přidal, Antonín (203 Česká republika) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: DEFORMED WING VIRUSBEE PARALYSIS VIRUSCRYO-EMMOLECULAR-DYNAMICSFORCE-FIELDX-RAYPOLIOVIRUSRNAMODELTRANSITIONS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 5. 2022 15:18.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1773097/cs -
PROCHÁZKOVÁ, Michaela, Tibor FÜZIK, Danyil GRYBCHUK, Francesco Luca FALGINELLA, Lucie PODEŠVOVÁ, Vyacheslav YURCHENKO, Robert VÁCHA a Pavel PLEVKA. Capsid Structure of Leishmania RNA Virus 1. Journal of Virology. American Society for Microbiology, 2021, roč. 95, č. 3, s. "e01957", 12 s. ISSN 0022-538X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1128/JVI.01957-20.URL
RIV/00216224:14740/21:00121505 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Procházková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Füzik, Tibor (703 Slovensko, domácí) -- Grybchuk, Danyil (804 Ukrajina, domácí) -- Falginella, Francesco Luca (380 Itálie, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: virus; Leishmania; Viannia; leishmaniasis; parasite; RNA; LRV1; Totiviridae; virion; structure; cryo-electron microscopy; capsid; genome; uncoating; mRNA; CAP-4; decapping
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 23. 5. 2022 13:22.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1764656/cs -
LABAJOVA, N., N. BARANOVA, Miroslav JURÁSEK, Robert VÁCHA, M. LOOSE a I. BARAK. Cardiolipin-Containing Lipid Membranes Attract the Bacterial Cell Division Protein DivIVA. International Journal of Molecular Sciences. Basel: Multidisciplinary Digital Publishing Institute, 2021, roč. 22, č. 15, s. 8350-8370. ISSN 1422-0067. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/ijms22158350.URL
RIV/00216224:14740/21:00119690 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Jurásek, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Clostridioides difficile; DivIVA; lipid membrane; cardiolipin; phosphatidylglycerol
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 5. 2022 16:23.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1838601/cs -
SUKENÍK, Lukáš, Liya MUKHAMEDOVA, Michaela PROCHÁZKOVÁ, Karel ŠKUBNÍK, Pavel PLEVKA a Robert VÁCHA. Cargo Release from Nonenveloped Viruses and Virus-like Nanoparticles: Capsid Rupture or Pore Formation. ACS Nano. Washington, D.C.: American Chemical Society, 2021, roč. 15, č. 12, s. 19233-19243. ISSN 1936-0851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acsnano.1c04814.URL
RIV/00216224:14740/21:00119475 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Mukhamedova, Liya (643 Rusko, domácí) -- Procházková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Škubník, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: virus-like nanoparticlesRNA virusgenome releasecapsidcomputer simulationscoarse-grained modelcryo-EM
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 29. 4. 2022 08:16.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1815461/cs -
BARTOŠ, Ladislav, Ivo KABELKA a Robert VÁCHA. Enhanced translocation of amphiphilic peptides across membranes by transmembrane proteins. Biophysical Journal. New York, USA: Cell Press, 2021, roč. 120, č. 11, s. 2296-2305. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2021.04.005.URL
RIV/00216224:14740/21:00118993 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Bartoš, Ladislav (203 Česká republika, domácí) -- Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: CELL-PENETRATING PEPTIDESMOLECULAR-DYNAMICSFORCE-FIELDEXTENSION
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 29. 4. 2022 08:15.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1773101/cs -
PEŠKA, Vratislav, Petr FAJKUS, Michal BUBENÍK, Václav BRÁZDA, Natália BOHÁLOVÁ, Vojtěch DVOŘÁČEK, Jiří FAJKUS a Sonia GARCIA. Extraordinary diversity of telomeres, telomerase RNAs and their template regions in Saccharomycetaceae. Scientific Reports. Nature Research, 2021, roč. 11, č. 1, s. "12784", 11 s. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-021-92126-x.URL
RIV/00216224:14740/21:00119109 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Peška, Vratislav (203 Česká republika, garant) -- Fajkus, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Bubeník, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Brázda, Václav (203 Česká republika) -- Bohálová, Natália (703 Slovensko, domácí) -- Dvořáček, Vojtěch (203 Česká republika) -- Fajkus, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Garcia, Sonia (724 Španělsko)
Klíčová slova anglicky: DNA END-REPLICATION; SECONDARY STRUCTURE; G-QUADRUPLEXES SEQUENCES; REPEATS IDENTIFICATION; EVOLUTION; GENOME
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 9. 6. 2022 11:22.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1784130/cs -
SAVENKO, M., Timothée Emmanuel J. RIVEL, S. YESYLEVSKYY a C. RAMSEYER. Influence of Substrate Hydrophilicity on Structural Properties of Supported Lipid Systems on Graphene, Graphene Oxides, and Silica. Journal of Physical Chemistry B. Washington, D.C.: American Chemical Society, 2021, roč. 125, č. 29, s. 8060-8074. ISSN 1520-6106. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.1c04615.URL
RIV/00216224:14740/21:00124353 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Rivel, Timothée Emmanuel J. (250 Francie, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: PHOSPHOLIPID-BILAYER FORMATIONMOLECULAR-DYNAMICSNEUTRON REFLECTIVITYMEMBRANE ORGANIZATIONVESICLE ADSORPTIONFORCE-FIELDSURFACEWATERSINGLEMODEL
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 4. 3. 2022 13:10.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1838621/cs -
JURÁSEK, Miroslav, Jitender KUMAR, Petra PACLÍKOVÁ, Alka Kumari JADAUN, Konstantinos TRIPSIANES, Vítězslav BRYJA a Robert VÁCHA. Phosphorylation-induced changes in the PDZ domain of Dishevelled 3. Scientific Reports. NATURE PUBLISHING GROUP, 2021, roč. 11, č. 1, s. "1484", 14 s. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-020-79398-5.URL
RIV/00216224:14740/21:00118888 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Jurásek, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Kumar, Jitender (356 Indie, domácí) -- Paclíková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Jadaun, Alka Kumari (356 Indie, domácí) -- Tripsianes, Konstantinos (300 Řecko, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: HUMAN PHOSPHATASE HPTP1E; PARTICLE MESH EWALD; PROTEIN INTERACTIONS; LIGAND RECOGNITION; PAR-6 PDZ; BINDING; DYNAMICS; REVEALS; COMPLEX; MODES
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 20. 2. 2023 08:18.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1752563/cs -
KABELKA, Ivo, Radim BROŽEK a Robert VÁCHA. Selecting Collective Variables and Free Energy Methods for Peptide Translocation Across Membranes. Journal of Chemical Information and Modeling. USA, 2021, roč. 61, č. 2, s. 819-830. ISSN 1549-9596. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jcim.0c01312.URL
RIV/00216224:14740/21:00118991 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Brožek, Radim (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Cell Membrane; Entropy; Molecular Dynamics Simulation; Peptides
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 29. 4. 2022 08:15.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1773098/cs -
SARMENTO, M.J., Michael Christopher OWEN, J.C. RICARDO, B. CHMELOVÁ, D. DAVIDOVIĆ, I. MIKHALYOV, N. GRETSKAYA, M. HOF, M. AMARO, Robert VÁCHA a R. ŠACHL. The impact of the glycan headgroup on the nanoscopic segregation of gangliosides. Biophysical Journal. New York, USA: Cell Press, 2021, roč. 120, č. 24, s. 5530-5543. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2021.11.017.URL
RIV/00216224:14740/21:00123439 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Owen, Michael Christopher (124 Kanada, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: GM1 GANGLIOSIDE; ALPHA-SYNUCLEIN; ENERGY-TRANSFER; CHOLERA-TOXIN; CELL-SURFACE; FORCE-FIELD; RECEPTOR; CHOLESTEROL; LIGANDS; DOMAINS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 23. 5. 2022 13:22.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1815460/cs -
TÜRKOVÁ, Alžběta, Ivo KABELKA, Tereza KRÁLOVÁ, Lukáš SUKENÍK, Šárka POKORNÁ, Martin HOF a Robert VÁCHA. Effect of helical kink in antimicrobial peptides on membrane pore formation. eLife. Cambridge: eLife Sciences Publications Ltd, 2020, roč. 9, March 2020, s. 1-38. ISSN 2050-084X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.7554/eLife.47946.URL
RIV/00216224:14740/20:00114711 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Türková, Alžběta (203 Česká republika, domácí) -- Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Králová, Tereza (203 Česká republika, domácí) -- Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Melitten; Magainins; Polypeptide Antibiotic Agent
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 19. 2. 2023 22:05.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1731416/cs -
BROŽEK, Radim, Ivo KABELKA a Robert VÁCHA. Effect of Helical Kink on Peptide Translocation across Phospholipid Membranes. The Journal of Physical Chemistry B. Washington, D.C.: American Chemical Society, 2020, roč. 124, č. 28, s. 5940-5947. ISSN 1520-6106. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.0c03291.URL
RIV/00216224:14740/20:00114328 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Brožek, Radim (203 Česká republika, domácí) -- Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Free energy; Lipids; Peptides and proteins; Membranes; Conformation
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 12. 11. 2020 14:07.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1680660/cs -
JURÁSEK, Miroslav, Klas FLÄRDH a Robert VÁCHA. Effect of membrane composition on DivIVA-membrane interaction. BBA Biomembranes. Amsterdam: Elsevier, 2020, roč. 1862, č. 8, s. 1-9. ISSN 0005-2736. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bbamem.2019.183144.URL
RIV/00216224:14740/20:00114560 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Jurásek, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Flärdh, Klas (752 Švédsko) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: DivIVA protein; Lipid membrane; Molecular dynamics; Negative curvature; Lipid preference; N-terminal domain
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 15. 3. 2021 18:51.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1707177/cs -
ZAPLETAL, Vojtěch, Arnošt MLÁDEK, Kateřina BENDOVÁ, Petr LOUŠA, Erik NOMILNER, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Vojtěch KUBÁŇ, Markéta MAKOVICKÁ, Alice LANÍKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Jozef HRITZ. Choice of Force Field for Proteins Containing Structured and Intrinsically Disordered Regions. Biophysical Journal. Bethesda, USA: Biophysical Society, 2020, roč. 118, č. 7, s. 1621-1633. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2020.02.019.URL
RIV/00216224:14740/20:00115635 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Mládek, Arnošt (203 Česká republika, domácí) -- Bendová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Louša, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Nomilner, Erik (703 Slovensko, domácí) -- Jaseňáková, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Kubáň, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Makovická, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Laníková, Alice (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: MOLECULAR-DYNAMICS; TYROSINE-HYDROXYLASE; NMR RELAXATION; RNA-POLYMERASE; DELTA-SUBUNIT; PREDICTION; PHOSPHORYLATION; RECOGNITION; ALIGNMENT; BIOLOGY
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 30. 4. 2021 18:28.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1655320/cs -
KABELKA, Ivo, Michael PACHLER, Sylvain PRÉVOST, Ilse LETOFSKY-PAPST, Karl LOHNER, Georg PABST a Robert VÁCHA. Magainin 2 and PGLa in Bacterial Membrane Mimics II: Membrane Fusion and Sponge Phase Formation. Biophysical Journal. Cambridge, USA: Cell Press, 2020, roč. 118, č. 3, s. 612-623. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2019.12.019.URL
RIV/00216224:14740/20:00114044 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: X-RAY-SCATTERING; FORCE-FIELD; PEPTIDES; DYNAMICS; CURVATURE; MECHANISM; TRANSITIONS; VALIDATION; POTENTIALS; EXTENSION
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 19. 2. 2023 22:08.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1617676/cs -
FATAFTA, H., C. POOJARI, A. SAYYED-AHMAD, B. STRODEL a Michael Christopher OWEN. Role of Oxidized Gly25, Gly29, and Gly33 Residues on the Interactions of A beta(1-42) with Lipid Membranes. ACS CHEMICAL NEUROSCIENCE. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2020, roč. 11, č. 4, s. 535-548, 27 s. ISSN 1948-7193. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acschemneuro.9b00558.URL
RIV/00216224:14740/20:00118347 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Owen, Michael Christopher (124 Kanada, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Amyloid-beta peptide; molecular dynamics; membrane simulations; oxidative stress; GM1; peptide membrane interactions
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 8. 3. 2021 20:36.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1750456/cs -
TÜRKOVÁ, Alžběta, Ivo KABELKA, Lukáš SUKENÍK, Šárka POKORNÁ, Martin Peter HOF a Robert VÁCHA. ROLE OF PROLINE/GLYCINE KINK IN PORE FORMATION BY ANTIMICROBIAL PEPTIDES. In XXth INTERDISCIPLINARY MEETING OF YOUNG RESEARCHERS AND STUDENTS IN THE FIELD OF CHEMISTRY, BIOCHEMISTRY, MOLECULAR BIOLOGY, AND BIOMATERIALS. 2020. ISSN 2336-7202.URL
RIV/00216224:14740/20:00118418 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Türková, Alžběta (203 Česká republika, domácí) -- Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Hof, Martin Peter (276 Německo, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: PROLINE/GLYCINE KINK
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 19. 2. 2023 22:07.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1753497/cs -
BRÁZDA, Pavel, Magdaléna KREJČÍKOVÁ, Aiste KASILIAUSKAITE, Eliška ŠMIŘÁKOVÁ, Tomáš KLUMPLER, Robert VÁCHA, Karel KUBÍČEK a Richard ŠTEFL. Yeast Spt6 Reads Multiple Phosphorylation Patterns of RNA Polymerase II C-Terminal Domain In Vitro. Journal of Molecular Biology. Academic Press, 2020, roč. 432, č. 14, s. 4092-4107. ISSN 0022-2836. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jmb.2020.05.007.URL
RIV/00216224:14740/20:00114180 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Brázda, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Krejčíková, Magdaléna (203 Česká republika, domácí) -- Kasiliauskaite, Aiste (440 Litva, domácí) -- Šmiřáková, Eliška (203 Česká republika, domácí) -- Klumpler, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: CTD; RNA polymerase II; Spt6; NMR structure; phosphorylation
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 3. 2021 19:00.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1662603/cs -
HARNOŠ, Jakub, M.C.A. CANIZAL, Miroslav JURÁSEK, Jitender KUMAR, Cornelia HOLLER, Alexandra SCHAMBONY, Kateřina HANÁKOVÁ, Ondřej BERNATÍK, Zbyněk ZDRÁHAL, Kristína GÖMÖRYOVÁ, Tomáš GYBEĽ, Tomasz Witold RADASZKIEWICZ, Marek KRAVEC, Lukáš TRANTÍREK, Jan RYNEŠ, Zankruti DAVE, Ana Iris FERNANDEZ-LLAMAZARES, Robert VÁCHA, Konstantinos TRIPSIANES, Carsten HOFFMANN a Vítězslav BRYJA. Dishevelled-3 conformation dynamics analyzed by FRET-based biosensors reveals a key role of casein kinase 1. Nature Communications. London: Nature Publishing Group, 2019, roč. 10, APR 18 2019, s. 1-18. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-019-09651-7.Full Text
RIV/00216224:14310/19:00107391 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Harnoš, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Canizal, M.C.A. (276 Německo) -- Jurásek, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Kumar, Jitender (356 Indie, domácí) -- Holler, Cornelia (276 Německo) -- Schambony, Alexandra (276 Německo) -- Hanáková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Bernatík, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Gömöryová, Kristína (703 Slovensko, domácí) -- Gybeľ, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Radaszkiewicz, Tomasz Witold (616 Polsko, domácí) -- Kravec, Marek (703 Slovensko, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Ryneš, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Dave, Zankruti (356 Indie, domácí) -- Fernandez-Llamazares, Ana Iris (528 Nizozemské království) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Tripsianes, Konstantinos (300 Řecko, domácí) -- Hoffmann, Carsten (276 Německo) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: PARTICLE MESH EWALD; BETA-CATENIN; WNT/BETA-CATENIN; DIX DOMAIN; MOLECULAR-DYNAMICS; STRUCTURAL BASIS; PDZ DOMAIN; DEP DOMAIN; G-PROTEIN; WNT
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 18. 3. 2020 09:38.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1529116/cs -
OWEN, Michael Christopher, D. GNUTT, M.M. GAO, S.K.T.S. WARMLANDER, J. JARVET, A. GRASLUND, R. WINTER, S. EBBINGHAUS a B. STRODEL. Effects of in vivo conditions on amyloid aggregation. Chemical Society Reviews. Cambridge: RSC Publishing, 2019, roč. 48, č. 14, s. 3946-3996. ISSN 0306-0012. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c8cs00034d.URL
RIV/00216224:14740/19:00113279 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Owen, Michael Christopher (124 Kanada, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: SINGLE-MOLECULE SPECTROSCOPY; A-BETA PEPTIDE; RECEPTOR-RELATED PROTEIN-1; ALZHEIMERS-DISEASE BRAIN
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 31. 3. 2020 21:33.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1636680/cs -
BUCHTA, David, Tibor FÜZIK, Dominik HREBÍK, Yevgen LEVDANSKY, Lukáš SUKENÍK, Liya MUKHAMEDOVA, Jana MORAVCOVÁ, Robert VÁCHA a Pavel PLEVKA. Enterovirus particles expel capsid pentamers to enable genome release. Nature Communications. London: Nature Publishing Group, 2019, roč. 10, MAR, s. 1-9. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-019-09132-x.URL
RIV/00216224:14740/19:00107387 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Buchta, David (203 Česká republika, domácí) -- Füzik, Tibor (703 Slovensko, domácí) -- Hrebík, Dominik (703 Slovensko, domácí) -- Levdansky, Yevgen (804 Ukrajina, domácí) -- Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Mukhamedova, Liya (643 Rusko, domácí) -- Moravcová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: MOLECULAR-DYNAMICS; CONFORMATIONAL-CHANGES; FORCE-FIELD; CELL ENTRY; POLIOVIRUS; VIRUS; RNA; MODEL; TRANSITIONS; RECOGNITION
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 19. 3. 2020 11:36.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1528796/cs -
OWEN, Michael Christopher, Andreas KARNER, Radek ŠACHL, Johannes PREINER, Mariana AMARO a Robert VÁCHA. Force Field Comparison of GM1 in a DOPC Bilayer Validated with AFM and FRET Experiments. JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B. Washington, D.C.: American Chemical Society, 2019, roč. 123, č. 35, s. 7504-7517. ISSN 1520-6106. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.9b05095.Full Text
RIV/00216224:14740/19:00107895 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Owen, Michael Christopher (124 Kanada, domácí) -- Karner, Andreas (40 Rakousko) -- Šachl, Radek (203 Česká republika) -- Preiner, Johannes (40 Rakousko) -- Amaro, Mariana (203 Česká republika) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: MOLECULAR-DYNAMICS; BRAIN GANGLIOSIDES; MEMBRANE-LIPIDS; CHOLERA-TOXIN; SIMULATIONS; GLYCOSPHINGOLIPIDS; CONFORMATIONS; GLYCOLIPIDS; EXTENSION; GLYCAM06
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 3. 3. 2020 15:46.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1597056/cs -
TÜRKOVÁ, Alžběta, Ivo KABELKA, Tereza KRÁLOVÁ, Lukáš SUKENÍK, S. POKORNÁ, M. HOF a Robert VÁCHA. Kink in Helical Peptides Affects Membrane Pore Formation. 2019. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2018.11.2760.Kink in Helical Peptides Affects Membrane Pore Formation
Název anglicky: Kink in Helical Peptides Affects Membrane Pore Formation
RIV/00216224:14310/19:00112870 Konferenční abstrakt. angličtina. Spojené státy.
Türková, Alžběta (203 Česká republika, domácí) -- Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Králová, Tereza (203 Česká republika, domácí) -- Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Pokorná, S. (203 Česká republika) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Kink; Helical Peptides
Mezinárodní význam: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 1. 4. 2020 15:51.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1616699/cs -
PACHLER, Michael, Ivo KABELKA, Marie-Sousai APPAVOU, Karl LOHNER, Robert VÁCHA a Georg PABST. Magainin 2 and PGLa in Bacterial Membrane Mimics I: Peptide-Peptide and Lipid-Peptide Interactions. Biophysical Journal. New York: Cell Press, 2019, roč. 117, č. 10, s. 1858-1869. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2019.10.022.Full Text
RIV/00216224:14740/19:00107896 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: X-RAY-SCATTERING; ANTIMICROBIAL PEPTIDES; FORCE-FIELD; DYNAMICS; BILAYERS; MODEL; SIMULATIONS; VALIDATION; POTENTIALS; DERIVATION
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 21. 2. 2020 10:51.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1597058/cs -
HAMID, A.K.M., J.C. SALVATORE, K. WANG, P. MURAHARI, A. GULJAS, A. RAGYANSZKI, Michael Christopher OWEN, B. JOJART, M. SZORI, I.G. CSIZMADIA, B. VISKOLCZ a B. FISER. Oxidatively-mediated in silico epimerization of a highly amyloidogenic segment in the human calcitonin hormone (hCT(15-19)). COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY. OXFORD: ELSEVIER SCI LTD, 2019, roč. 80, JUN, s. 259-269. ISSN 1476-9271. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.compbiolchem.2019.04.005.URL
RIV/00216224:14740/19:00113246 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Owen, Michael Christopher (124 Kanada, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: DFNKF; Amyloidosis; Aggregation; Oxidative-stress; Molecular ageing; Peptide
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 31. 3. 2020 21:47.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1635285/cs -
PAVLÍKOVÁ PŘECECHTĚLOVÁ, Jana, Arnošt MLÁDEK, Vojtěch ZAPLETAL a Jozef HRITZ. Quantum Chemical Calculations of NMR Chemical Shifts in Phosphorylated Intrinsically Disordered Proteins. Journal of Chemical Theory and Computation. Washington DC: American Chemical Society, 2019, roč. 15, č. 10, s. 5642-5658. ISSN 1549-9618. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jctc.8b00257.URL
RIV/00216224:14740/19:00107747 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Pavlíková Přecechtělová, Jana (203 Česká republika, garant, domácí) -- Mládek, Arnošt (203 Česká republika, domácí) -- Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí)
Klíčová slova anglicky: DENSITY-FUNCTIONAL CALCULATIONS; MOLECULAR-ORBITAL METHODS; CORRELATION-ENERGY; BASIS-SET; MECHANICAL CALCULATION; PERTURBATION-THEORY; SHIELDING SCALE; AB-INITIO; P-31; N-15
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 31. 3. 2020 21:50.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1574798/cs -
PACHLER, M., Ivo KABELKA, R. LEBER, I. LETOFSKY-PAPST, K. LOHNER, Robert VÁCHA a G. PABST. Synergism of Magainins is Not Coupled to the Formation of a Well-Defined Peptide Pore. In 63rd Annual Meeting of the Biophysical-Society. 2019. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2018.11.280.
RIV/00216224:14740/19:00113469 Konferenční abstrakt. angličtina. Spojené státy.
Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Magainin
Mezinárodní význam: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 1. 4. 2020 15:57.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1641750/cs -
VÁCHA, Robert. Toxicita a aktivita antimikrobiálních peptidů. Masarykova univerzita, 2019.
Název anglicky: Toxicity and activity of antimicrobial peptides
RIV/00216224:14740/19:00108436 Projekty výzkumu a vývoje. čeština. Česká republika.
Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Toxicity; activity; antimicrobial peptides
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 15. 4. 2020 13:14.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1645706/cs -
LIAO, Q.H., Michael Christopher OWEN, S. BALI, B. BARZ a B. STRODEL. A beta under stress: the effects of acidosis, Cu2+-binding, and oxidation on amyloid beta-peptide dimers. Chemical communications. Cambridge: Royal Society of Chemistry, 2018, roč. 54, č. 56, s. 7766-7769. ISSN 1359-7345. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c8cc02263a.URL
RIV/00216224:14740/18:00106574 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Liao, Q.H. (276 Německo) -- Owen, Michael Christopher (124 Kanada, garant, domácí) -- Bali, S. (276 Německo) -- Barz, B. (276 Německo) -- Strodel, B. (276 Německo)
Klíčová slova anglicky: ALZHEIMERS-DISEASE; PROTEIN OLIGOMERS; FIBRIL FORMATION; AGGREGATION; TOXICITY; PATHWAYS; ASSEMBLIES; DYNAMICS; MONOMER; BINDING
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 3. 2019 15:09.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1505077/cs -
TESEI, Giulio, Erik HELLSTRAND, Kalyani SANAGAVARAPU, Sara LINSE, Emma SPARR, Robert VÁCHA a Mikael LUND. Aggregate Size Dependence of Amyloid Adsorption onto Charged Interfaces. Langmuir. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 1155 16TH ST, NW, WASHINGTON, DC 20036 USA, 2018, roč. 34, č. 4, s. 1266-1273. ISSN 0743-7463. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.langmuir.7b03155.URL
RIV/00216224:14740/18:00100839 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Tesei, Giulio (752 Švédsko) -- Hellstrand, Erik (752 Švédsko) -- Sanagavarapu, Kalyani (752 Švédsko) -- Linse, Sara (752 Švédsko) -- Sparr, Emma (752 Švédsko) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Lund, Mikael (752 Švédsko)
Klíčová slova anglicky: QUARTZ-CRYSTAL MICROBALANCE; ATOMIC-RESOLUTION STRUCTURE; POISSON-BOLTZMANN THEORY; AIR-WATER-INTERFACE; ALPHA-SYNUCLEIN; MONTE-CARLO; STRUCTURAL BASIS; LIPID-MEMBRANES; BETA-PEPTIDE; FIBRILS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 21. 3. 2019 09:47.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1409325/cs -
ŠTĚPÁN, Jakub, Ivo KABELKA, Jaroslav KOČA a Petr KULHÁNEK. Behavior of BsoBI endonuclease in the presence and absence of DNA. Journal of Molecular Modeling. New York: Springer, 2018, roč. 24, č. 1, s. 22-31. ISSN 1610-2940. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00894-017-3557-8.URL
RIV/00216224:14310/18:00102342 Článek v odborném periodiku. angličtina. Česká republika.
Štěpán, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Conformational change; Enzyme opening; Molecular dynamics; Metadynamics
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 23. 4. 2024 11:02.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1409455/cs -
HRITZ, Jozef a Arnošt MLÁDEK. Computational Molecular Modeling Techniques of Biomacromolecular Systems. Online. In Jan Hejátko, Toshio Hakoshima. Plant Structural Biology: Hormonal Regulations. 1. vyd. CHAM: SPRINGER INT PUBLISHING AG, 2018, s. 295-322. n/a. ISBN 978-3-319-91352-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-91352-0_15.URL
RIV/00216224:14740/18:00103861 Kapitola resp. kapitoly v odborné knize. angličtina. Švýcarsko.
Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí) -- Mládek, Arnošt (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Molecular biology Plant development Signal transduction Arabidopsis X-ray crystallography NMR SAXS Molecular dynamics simulations
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 3. 2019 10:38.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1443152/cs -
OWEN, Michael Christopher, W. KULIG, T. ROG, I. VATTULAINEN a B. STRODEL. Cholesterol Protects the Oxidized Lipid Bilayer from Water Injury: An All-Atom Molecular Dynamics Study. JOURNAL OF MEMBRANE BIOLOGY. NEW YORK: SPRINGER, 2018, roč. 251, č. 3, s. 521-534. ISSN 0022-2631. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00232-018-0028-9.
RIV/00216224:14740/18:00106584 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Owen, Michael Christopher (124 Kanada, garant, domácí) -- Kulig, W. (246 Finsko) -- Rog, T. (246 Finsko) -- Vattulainen, I. (246 Finsko) -- Strodel, B. (276 Německo)
Klíčová slova anglicky: Lipid oxidation; Cholesterol protection; Oxidative stress; Oxidized membranes; Pore formation
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 11:20.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1505247/cs -
TUBIANA, L., Miroslav JURÁSEK a I. COLUZZA. Implementing efficient concerted rotations using Mathematica and C code. EUROPEAN PHYSICAL JOURNAL E. NEW YORK: SPRINGER, 2018, roč. 41, č. 7, s. 87-95. ISSN 1292-8941. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1140/epje/i2018-11694-7.
RIV/00216224:14740/18:00101714 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Tubiana, L. (40 Rakousko) -- Jurásek, Miroslav (203 Česká republika, garant, domácí) -- Coluzza, I. (724 Španělsko)
Klíčová slova anglicky: INTRINSICALLY UNSTRUCTURED PROTEINS; MONTE-CARLO SIMULATIONS; COARSE-GRAINED MODELS; MOLECULAR-DYNAMICS; SYSTEMS; ALGORITHM
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 13:30.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1500778/cs -
KABELKA, Ivo a Robert VÁCHA. Optimal Hydrophobicity and Reorientation of Amphiphilic Peptides Translocating through Membrane. Biophysical Journal. New York, USA: Cell Press, 2018, roč. 115, č. 6, s. 1045-1054. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2018.08.012.
RIV/00216224:14740/18:00101183 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: CELL-PENETRATING PEPTIDES; SOLID-STATE NMR; TRANSMEMBRANE HELIX INSERTION; ORIENTED CIRCULAR-DICHROISM; MOLECULAR-DYNAMICS METHOD; ANTIMICROBIAL PEPTIDE; LIPID-BILAYERS; FORCE-FIELD; AMPHIPATHIC PEPTIDES; BUFORIN II
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 16:31.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1438436/cs -
BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ, Petra, Ladislava BARTOŠOVÁ, Adam KŘENEK, Ladislav BARTOŠ, Jiří DOLINA, Filip MAREK, Zdeněk KALA a Lydie IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ. Personalizovaná terapie pacientů s gastroezofageální refluxní chorobou - metodika stanovení genového profilu CYP2C19. Gastroenterologie a Hepatologie. Praha: Ambit Media, 2018, roč. 72, č. 4, s. 320-328. ISSN 1804-7874. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.14735/amgh2018320.
Název anglicky: Personalized therapy in patients with gastroesophageal reflux disease - methodology of CYP2C19 gene profile´s determination
RIV/00216224:14110/18:00101416 Článek v odborném periodiku. čeština. Česká republika.
Bořilová Linhartová, Petra (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bartošová, Ladislava (203 Česká republika, domácí) -- Křenek, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Bartoš, Ladislav (203 Česká republika, domácí) -- Dolina, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Filip (203 Česká republika, domácí) -- Kala, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Izakovičová Hollá, Lydie (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: CYP2C19*17; CYP2C19*2; Gastroesophageal reflux; Gene polymorphism; Pharmacogenetics; Poor metabolizer; Proton pump inhibitors; Ultra rapid metabolizer
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Soňa Böhmová, učo 232884. Změněno: 14. 2. 2019 18:13.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1476897/cs -
OWEN, Michael Christopher, W. KULIG, C. POOJARI, T. ROG a B. STRODEL. Physiologically-relevant levels of sphingomyelin, but not GM1, induces a beta-sheet-rich structure in the amyloid-beta(1-42) monomer. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOMEMBRANES. AMSTERDAM: ELSEVIER SCIENCE BV, 2018, roč. 1860, č. 9, s. 1709-1720. ISSN 0005-2736. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bbamem.2018.03.026.
RIV/00216224:14740/18:00106641 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Owen, Michael Christopher (124 Kanada, garant, domácí) -- Kulig, W. (246 Finsko) -- Poojari, C. (246 Finsko) -- Rog, T. (246 Finsko) -- Strodel, B. (276 Německo)
Klíčová slova anglicky: Peptide-membrane interactions; Sphingomyelin; Lipid rafts; Amyloid-beta peptide; Molecular dynamics; Membrane simulations; GM1; Gangliosides; Peptide-ganglioside interactions
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 18. 3. 2019 14:36.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1506977/cs -
LEBER, R., M. PACHLER, Ivo KABELKA, I. SVOBODA, D. KOLLER, Robert VÁCHA, K. LOHNER a G. PABST. Synergism of Antimicrobial Frog Peptides Couples to Membrane Intrinsic Curvature Strain. Biophysical Journal. New York, USA: Cell Press, 2018, roč. 114, č. 8, s. 1945-1954. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2018.03.006.
RIV/00216224:14740/18:00101149 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Leber, R. (40 Rakousko) -- Pachler, M. (40 Rakousko) -- Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Svoboda, I. (203 Česká republika) -- Koller, D. (276 Německo) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Lohner, K. (276 Německo) -- Pabst, G. (276 Německo)
Klíčová slova anglicky: MONOLAYER SPONTANEOUS CURVATURE; RAPID SOLVENT EXCHANGE; HOST-DEFENSE PEPTIDES; MAGAININ 2; ANTIBIOTIC PEPTIDE; ESCHERICHIA-COLI; ACTIVE PEPTIDES; PGLA; MECHANISM; BILAYERS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 21. 3. 2019 09:48.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1433963/cs -
ZAPLETAL, Vojtěch, Arnošt MLÁDEK, Jozef HRITZ a Lukáš ŽÍDEK. Computational characterization of hybrid proteins containing ordered and intrinsically disordered regions. In 42nd Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies (FEBS) on From Molecules to Cells and Back. 2017. ISSN 1742-464X.URL
Název anglicky: Computational characterization of hybrid proteins containing ordered and intrinsically disordered regions
RIV/00216224:14740/17:00095560 Konferenční abstrakt. angličtina. Spojené státy.
Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Mládek, Arnošt (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: NMR; hybrid proteins
Druh účasti: aktivní účast
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 9. 3. 2018 15:10.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1410473/cs -
SCHUBERTOVÁ, Veronika, F.J. MARTINEZ-VERACOECHEA a Robert VÁCHA. Design of Multivalent Inhibitors for Preventing Cellular Uptake. Scientific Reports. London: Nature Publishing Group, 2017, roč. 7, SEP, s. 11689-11695. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-017-11735-7.URL
RIV/00216224:14740/17:00095111 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Schubertová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Martinez-Veracoechea, F.J. (233 Estonsko) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: RECEPTOR-MEDIATED ENDOCYTOSIS; SHAPE ANISOTROPY; NANOPARTICLES; NEUTRALIZATION; MATTER; VIRUS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 15. 3. 2018 09:37.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1393665/cs -
MANZANO, Susana, Zoraida MEGÍAS, Cecilia MARTÍNEZ, Alicia GARCÍA, Encarnación AGUADO, Tarik CHILEH, Diego LÓPEZ-ALONSO, Federico GARCÍA-MAROTO, Eduard KEJNOVSKÝ, Jiří ŠIROKÝ, Zdeněk KUBÁT a Tereza KRÁLOVÁ. Overexpression of a flower-specific aerolysin-like protein from the dioecious plant Rumex acetosa alters flower development and induces male sterility in transgenic tobacco. The Plant Journal. 2017, roč. 89, s. 58-72. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/tpj.13322.URL
Klíčová slova anglicky: sex determination, Rumex acetosa, aerolysin-like protein, reproductive development, male sterility, FEM32 gene
Změnila: Mgr. Tereza Králová, Ph.D., učo 150676. Změněno: 17. 10. 2017 14:36.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1392877/cs -
JURÁSEK, Miroslav a Robert VÁCHA. Self-assembled clusters of patchy rod-like molecules. SOFT MATTER. CAMBRIDGE: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2017, roč. 13, č. 41, s. 7492-7497. ISSN 1744-683X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c7sm01384a.URL
RIV/00216224:14740/17:00095110 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Jurásek, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: COILED-COIL; HARD SPHEROCYLINDERS; DESIGN
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 23. 3. 2018 13:37.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1393664/cs -
VÁCHA, Robert. Anomalous Fibril Interaction with Surfaces. In CECAM workshop "Multiscale modeling of biomolecular aggregation and protein-membrane interactions in amyloid diseases". 2016.URL
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 25. 2. 2017 14:43.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1373451/cs -
VÁCHA, Robert. Anomalous Fibril Interaction with Surfaces. 2016.
Druh účasti: vyžádaná přednáška
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 24. 2. 2017 10:19.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1373450/cs -
VÁCHA, Robert. Efficiency of Nanoparticle Uptake Influenced by Multivalent Inhibitors or Ligand Distribution. In Biomembrane days 2016. 2016.
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 25. 2. 2017 14:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1373453/cs -
AMARO, Mariana, Radek ŠACHL, Gokcan AYDOGAN, Ilya I. MIKHALYOV, Robert VÁCHA a Martin HOF. (GM1) Ganglioside Inhibits beta-Amyloid Oligomerization Induced bySphingomyelin. Angewandte Chemie International Edition. WEINHEIM: Wiley-V C H VERLAG GMBH, 2016, roč. 55, č. 32, s. 9411-9415. ISSN 1433-7851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/anie.201603178.URL
RIV/00216224:14740/16:00088531 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Německo.
Amaro, Mariana (203 Česká republika) -- Šachl, Radek (203 Česká republika) -- Aydogan, Gokcan (203 Česká republika) -- Mikhalyov, Ilya I. (643 Rusko) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Hof, Martin (276 Německo)
Klíčová slova anglicky: Alzheimer's disease; amyloid beta-peptides; diffusion coefficients; fluorescence spectroscopy; neuroprotectives
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 1. 3. 2017 13:59.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1367185/cs -
VÁCHA, Robert. Influence of ligand distribution on the efficiency of nanoparticle uptake. In 10th European Biophysics Congress. 2016.
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 16. 2. 2016 17:00.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1335969/cs -
VÁCHA, Robert. Peptide Features Determining its Ability of Translocation and Membrane Pore Formation. In 6th International Meeting on Antimicrobial Peptides (IMAP2016). 2016.
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 25. 2. 2017 14:44.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1373452/cs -
VÁCHA, Robert. Peptide Features Determining its Translocation and Pore Formation. In Liposomes, Exosomes, and Virosomes: From Modeling Complex Membrane Processes to Medical Diagnostics and Drug Delivery. 2016.
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 25. 2. 2017 14:43.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1373456/cs -
AMARO, M., R. SACHL, G. AYDOGAN, I. MIKHALYOV, Robert VÁCHA a Martin Peter HOF. The role of ganglioside GM1 and sphingomyelin in the oligomerisation of beta-amyloid at physiological conditions: a single molecule study. 2016. ISSN 1742-464X.
angličtina. Spojené státy.
Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 15. 4. 2020 11:41.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1645598/cs -
VÁCHA, Robert. Influence of ligand distribution on nanoparticle uptake effciency. In 3rd European Joint Theory/Experiment Meeting on Membranes – EJTEMM15. 2015.
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 16. 2. 2016 17:00.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1335971/cs -
SCHUBERTOVÁ, Veronika, Francisco J. MARTINEZ-VERACOECHEA a Robert VÁCHA. Influence of ligand distribution on uptake efficiency. SOFT MATTER. CAMBRIDGE: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2015, roč. 11, č. 14, s. 2726-2730. ISSN 1744-683X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c4sm02815e.URL
RIV/00216224:14740/15:00081252 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Schubertová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Martinez-Veracoechea, Francisco J. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: RECEPTOR-MEDIATED ENDOCYTOSIS; SHAPE ANISOTROPY; LIPID-BILAYER; NANOPARTICLES; MEMBRANE; TRANSLOCATION; ROTATION
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 4. 4. 2016 13:37.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1319430/cs -
KABELKA, Ivo a Robert VÁCHA. Optimal conditions for opening of membrane pore by amphiphilic peptides. JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS. Melville (USA): AMER INST PHYSICS, 2015, roč. 143, č. 24, s. nestránkováno, 6 s. ISSN 0021-9606. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1063/1.4933229.URL
RIV/00216224:14740/15:00081581 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
Kabelka, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: PORE FORMATION; ANTIMICROBIAL PEPTIDES; PHOSPHOLIPID MEMBRANE; COMPUTER SIMULATION; COARSE GRAINED; MONTE CARLO
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 5. 4. 2016 16:08.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1335966/cs -
KRUSE, Holger, Arnošt MLÁDEK, Konstantinos GKIONIS, Andreas HANSEN, Sstefan GRIMME a Jiří ŠPONER. Quantum Chemical Benchmark Study on 46 RNA Backbone Families Using a Dinucleotide Unit. Journal of Chemical Theory and Computation. Washington DC: American Chemical Society, 2015, roč. 11, č. 10, s. 4972-4991. ISSN 1549-9618. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jctc.5b00515.URL
RIV/00216224:14740/15:00081386 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
Kruse, Holger (276 Německo, domácí) -- Mládek, Arnošt (203 Česká republika) -- Gkionis, Konstantinos (300 Řecko, domácí) -- Hansen, Andreas (276 Německo) -- Grimme, Sstefan (276 Německo) -- Šponer, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS; DENSITY-FUNCTIONAL THEORY; SUGAR-PHOSPHATE BACKBONE; ELECTRONIC-STRUCTURE CALCULATIONS; MAIN-GROUP THERMOCHEMISTRY; BASIS-SET CALCULATIONS; LONG NONCODING RNAS; NUCLEIC-ACID BASES; AMBER FORCE-FIELD; B-DNA STRUCTURE
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 5. 4. 2016 12:38.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1322783/cs -
VÁCHA, Robert. Self-assembly of prolate patchy particles. In CECAM workshop on The Physics of Protein Self-Assembly. 2015.
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 16. 2. 2016 17:00.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1335968/cs -
VÁCHA, Robert. Self-assembly of prolate patchy particles. In Gordon Research Conference on „Self-Assembly & Supramolecular Chemistry. 2015.
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 16. 2. 2016 16:52.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1335967/cs -
VÁCHA, Robert. Double-belt a Novel Structure of Membrane Pore. In 2nd European Joint Theoretical/Experimental Meeting on Membranes. 2014.
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 3. 10. 2014 13:53.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1200186/cs -
VÁCHA, Robert a D FRENKEL. Double-belt a Novel Structure of Membrane Pore. In 4th International Meeting on Antimicrobial Peptides (IMAP). 2014.
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 3. 10. 2014 13:51.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1200185/cs -
VÁCHA, Robert a D FRENKEL. Double-belt a Novel Structure of Membrane Pore. In The Physics of Soft and Biological Matter. 2014.
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 20. 9. 2014 16:23.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1198343/cs -
VÁCHA, Robert a D FRENKEL. Double-belt a Novel Structure of Membrane Pore. In CECAM workshop - How proteins can shape and sense membranes--a closer look at hybrid models. 2014.
Název anglicky: Double-belt a Novel Structure of Membrane Pore
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 20. 9. 2014 16:24.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1197994/cs -
VÁCHA, Robert a D FRENKEL. Double-belt a Novel Structure of Membrane Pore. In 58th Annual Meeting of the Biophysical Society. 2014.
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 27. 2. 2014 12:54.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1167248/cs -
VÁCHA, Robert, Frank UHLIG a Pavel JUNGWIRTH. Charges at Aqueous Interfaces: Development of Computational Approaches in Direct Contact with Experiment. In S. A. Rice and A. R. Dinner. Advances in Chemical Physics. Hoboken: John Wiley & Sons, Inc., 2014, s. 69-95. Volume 155. ISBN 978-1-118-75577-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/9781118755815.ch02.URL
RIV/00216224:14740/14:00079245 Kapitola resp. kapitoly v odborné knize. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Uhlig, Frank (840 Spojené státy) -- Jungwirth, Pavel (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: aqueous interfaces; computational approaches; electronic structure approach; ionic charges; polarization
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 24. 6. 2020 08:42.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1228051/cs -
VÁCHA, Robert, S LINSE a M LUND. Physics of colloidal particles with heterogeneously patterned surfaces. In CECAM workshop - Physics of colloidal particles with heterogeneously patterned surfaces. 2014.
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 3. 10. 2014 13:49.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1200184/cs -
VÁCHA, Robert a D. FRENKEL. Simulations Suggest Possible Novel Membrane Pore Structure. Langmuir. Washington D.C.: Amer Chemical Soc, 2014, roč. 30, č. 5, s. 1304-1310. ISSN 0743-7463. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/la402727a.URL
RIV/00216224:14740/14:00075124 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Frenkel, D. (826 Velká Británie a Severní Irsko)
Klíčová slova anglicky: MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS; ANTIMICROBIAL PEPTIDES; STATE NMR; BILAYER-MEMBRANES; LIPID-BILAYERS; AMYLOID PORES; ION CHANNELS; FORCE-FIELD; MODEL; DISEASE
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 24. 10. 2014 11:07.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1168435/cs -
VÁCHA, Robert a D. FRENKEL. Stability of Bicelles: A Simulation Study. Langmuir. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 1155 16TH ST, NW, WASHINGTON, DC 20036 USA, 2014, roč. 30, č. 15, s. 4229-4235. ISSN 0743-7463. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/la4048159.URL
RIV/00216224:14740/14:00077734 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Frenkel, D. (826 Velká Británie a Severní Irsko)
Klíčová slova anglicky: SOLID-STATE NMR; MODEL MEMBRANE SYSTEM; CAPILLARY-ELECTROPHORESIS; ATOMISTIC SIMULATIONS; PHOSPHOLIPID-BILAYERS; UNILAMELLAR VESICLES; PHOSPHORUS NMR; LIPID MIXTURES; TEMPERATURE; PROTEIN
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 11. 3. 2015 09:24.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1212657/cs -
VÁCHA, Robert, S. LINSE a M. LUND. Surface Effects on Aggregation Kinetics of Amyloidogenic Peptides. Journal of the American Chemical Society. Washington, D.C.: American Chemical Society, 2014, roč. 136, č. 33, s. 11776-11782. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ja505502e.URL
RIV/00216224:14740/14:00073857 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Linse, S. (752 Švédsko) -- Lund, M. (752 Švédsko)
Klíčová slova anglicky: BETA PROTEIN FIBRILLATION; ALPHA-SYNUCLEIN; POLYMERIC NANOPARTICLES; MEMBRANE INTERACTIONS; LIPID-BILAYERS; DRUG-DELIVERY; PHASE; NUCLEATION; INHIBITION; INTERFACES
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 24. 10. 2014 10:46.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1197997/cs -
VÁCHA, Robert, S LINSE a M LUND. Surface Effects on Aggregation Kinetics of Amyloidogenic Peptides. In CECAM workshop - Molecular and coarse-grained modelling of interactions at bio-nano interface. 2014.
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 3. 10. 2014 13:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1200182/cs -
VÁCHA, Robert, S LINSE a M LUND. Surface Effects on Aggregation Kinetics of Amyloidogenic Peptides. In CECAM workshop - Protein assemblies at the interface of functionalised materials. 2014.
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 20. 9. 2014 16:27.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1198344/cs -
SHI, Q., K.-E. BERGQUIST, R. HUO, J. LI, M. LUND, Robert VÁCHA, A. SUNDIN, E. BUTKUS, E. ORENTAS a K. WÄRNMARK. Composition- and Size-Controlled Cyclic Self-Assembly by Solvent- and C60-Responsive Self-Sorting. J AM CHEM SOC. Washington: American Chemical Society, 2013, roč. 135, č. 40, s. 15263-15268. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ja408582w.URL
RIV/00216224:14740/13:00069887 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Shi, Q. (752 Švédsko) -- Bergquist, K.-E. (752 Švédsko) -- Huo, R. (156 Čína) -- Li, J. (156 Čína) -- Lund, M. (752 Švédsko) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Sundin, A. (752 Švédsko) -- Butkus, E. (440 Litva) -- Orentas, E. (440 Litva) -- Wärnmark, K. (752 Švédsko)
Klíčová slova anglicky: SUPRAMOLECULAR CHEMISTRY; NONCOVALENT SYNTHESIS; FULLERENES; ACID; CUCURBITURIL; RECOGNITION; SYSTEMS; HOSTS; CYCLODEXTRIN; COMPLEXATION
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 25. 4. 2014 16:55.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1127135/cs -
STENQVIST, Bjoern, Axel THURESSON, Anil KURUT, Robert VÁCHA a Mikael LUND. Faunus - a flexible framework for Monte Carlo simulation. Molecular Simulation. Oxon: Taylor & Francis, 2013, roč. 39, 14-15, s. 1205-1211. ISSN 0892-7022. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/08927022.2013.828207.URL
RIV/00216224:14740/13:00070869 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Stenqvist, Bjoern (752 Švédsko) -- Thuresson, Axel (752 Švédsko) -- Kurut, Anil (752 Švédsko) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Lund, Mikael (752 Švédsko)
Klíčová slova anglicky: Metropolis Monte Carlo; coarse graining; C plus plus scientific programming
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 25. 4. 2014 17:11.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1139133/cs -
VÁCHA, Robert, F. J. MARTINEZ-VERACOECHEA a D. FRENKEL. Challenges in Nanoparticle Delivery: Cellular Uptake and Intracellular Escape. In Biophysical Society 57th Annual Meeting. 2013.
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 15. 3. 2013 10:22.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1091379/cs -
VÁCHA, Robert. Self-assembly of amphiphilic peptides and their interaction with membranes. In TAPPO workshop. 2013.
Druh účasti: vyžádaná přednáška
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 6. 12. 2013 09:47.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1132171/cs -
VÁCHA, Robert, F. J. MARTINEZ-VERACOECHEA a D. FRENKEL. Simulations of cellular uptake of nanoparticles with various shapes. In International Soft Matter Conference. 2013.
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 25. 10. 2013 11:32.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1127154/cs -
BERKOWITZ, M. L. a Robert VÁCHA. Aqueous Solutions at the Interface with Phospholipid Bilayers. Accounts of chemical research. Washington: American Chemical Society, 2012, roč. 45, č. 1, s. 74-82. ISSN 0001-4842. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ar200079x.URL
Neurologie, neurochirurgie, neurovědy. angličtina. Spojené státy.
Klíčová slova anglicky: MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATION; LIPID-BILAYERS; PHOSPHATIDYLCHOLINE BILAYERS; MEMBRANE INTERACTIONS; COMPUTER-SIMULATION; HOFMEISTER SERIES; MONOVALENT ANIONS; WATER-INTERFACE; HYDRATION FORCE; IONS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 4. 4. 2013 11:12.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/966936/cs -
BIELER, Noah S., Tuomas P.J. KNOWLES, Daan FRENKEL a Robert VÁCHA. Connecting Macroscopic Observables and Microscopic Assembly Events in Amyloid Formation Using Coarse Grained Simulations. PLOS Computational Biology. San Francisco: PLOS, 2012, roč. 8, č. 10, s. "nestránkováno", 10 s. ISSN 1553-7358. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002692.URL
RIV/00216224:14740/12:00061327 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
Bieler, Noah S. (756 Švýcarsko) -- Knowles, Tuomas P.J. (246 Finsko) -- Frenkel, Daan (554 Nový Zéland) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: BETA-PEPTIDE; AGGREGATION KINETICS; MOLECULAR-DYNAMICS; PROTEIN; MECHANISM; OLIGOMERS; THERMODYNAMICS; PROPAGATION; IMPACT; OCCURS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 5. 4. 2013 11:58.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1069047/cs -
VÁCHA, Robert, Ondrej MARSALEK, A.P. WILLARD, D.J. BONTHUIS, R.R. NETZ a Pavel JUNGWIRTH. Charge Transfer between Water Molecules As the Possible Origin of the Observed Charging at the Surface of Pure Water. Journal of Physical Chemistry Letters. Washington: American Chemical Society, 2012, roč. 3, č. 1, s. 107–111. ISSN 1948-7185. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jz20148521.URL
RIV/00216224:14740/12:00059172 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Marsalek, Ondrej (203 Česká republika) -- Willard, A.P. (840 Spojené státy) -- Bonthuis, D.J. (276 Německo) -- Netz, R.R. (276 Německo) -- Jungwirth, Pavel (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: simple continuum model; shear surface; Gibbs dividing surface; water/vapor interface; hydrogen bonding asymmetry
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 11. 3. 2013 04:32.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/963560/cs -
VÁCHA, Robert, Francisco J. MARTINEZ-VERACOECHEA a Daan FRENKEL. Intracellular Release of Endocytosed Nanoparticles Upon a Change of Ligand-Receptor Interaction. ACS Nano. WASHINGTON: American Chemical Society, 2012, roč. 6, č. 12, s. 10598-10605. ISSN 1936-0851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/nn303508c.URL
RIV/00216224:14740/12:00064625 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Martinez-Veracoechea, Francisco J. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Frenkel, Daan (826 Velká Británie a Severní Irsko)
Klíčová slova anglicky: cytosol release; late endosome; ligand-receptor interaction; phospholipid membrane; nanoparticle shape; molecular dynamics
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 3. 4. 2013 07:49.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1094399/cs -
VAZDAR, Mario, Eva PLUHAŘOVÁ, Phil E MASON, Robert VÁCHA a Pavel JUNGWIRTH. Ions at Hydrophobic Aqueous Interfaces: Molecular Dynamics with Effective Polarization. Journal of Physical Chemistry Letters. WASHINGTON: American Chemical Society, 2012, roč. 3, č. 15, s. 2087–2091. ISSN 1948-7185. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jz300805b.URL
RIV/00216224:14740/12:00060530 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
Vazdar, Mario (191 Chorvatsko) -- Pluhařová, Eva (203 Česká republika) -- Mason, Phil E (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Jungwirth, Pavel (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: ions; aqueous interface; charge scaling; molecular dynamics; polarizability
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 15. 4. 2013 10:51.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/988350/cs -
VÁCHA, Robert, Noah S BIELER, Tuomas P J KNOWLES a Daan FRENKEL. Morphology and Kinetics of Self-assembled Peptide Aggregates Using Coarse Grained Simulations. In Gordon Research Coneference - Peptides, Chemistry and Biology of. 2012.
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 27. 9. 2012 15:48.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/988351/cs -
VÁCHA, Robert, F.J. MARTINEZ-VERACOECHEA a D. FRENKEL. Receptor-mediated endocytosis of nanoparticles of various shapes. In Biomembrane days. 2012.
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 27. 9. 2012 15:53.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1066956/cs -
VÁCHA, Robert, N.S. BIELER, T.P.J. KNOWLES a D FRENKEL. Self-Assembly of Patchy Spherocylinders. In CECAM workshop - Design of self-assembling materials. 2012.
Druh účasti: vyžádaná přednáška
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 27. 9. 2012 15:51.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1066953/cs -
VÁCHA, Robert. Self-assembly of Proteins and Peptides in Cellular Environment. In Telluride Science Research Center workshop Protein and Peptide Interactions in Cellular Environments. 2012.
Změnil: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD., učo 115936. Změněno: 7. 8. 2012 16:07.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/988352/cs -
VÁCHA, Robert a Sylvie ROKE. Sodium Dodecyl Sulfate at Water-Hydrophobic Interfaces: A Simulation Study. Journal of Physical Chemistry B. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2012, roč. 116, č. 39, s. 11936-11942. ISSN 1520-6106. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jp304900z.URL
RIV/00216224:14740/12:00061199 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí) -- Roke, Sylvie (528 Nizozemské království)
Klíčová slova anglicky: FREQUENCY VIBRATIONAL SPECTROSCOPY; NEWTON BLACK FILMS; MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS; AIR/WATER INTERFACE; GENERATION SPECTROSCOPY; SURFACTANT MONOLAYERS; COMPUTER-SIMULATIONS; AQUEOUS INTERFACE; LIQUID INTERFACES; IONIC SURFACTANTS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 6. 4. 2013 20:57.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1067803/cs -
VÁCHA, Robert, F.J. MARTINEZ-VERACOECHEA a D. FRENKEL. Receptor-Mediated Endocytosis of Nanoparticles of Various Shapes. Nano Lett. American Chemical Society, 2011, roč. 11, č. 12, s. 5391–5395. ISSN 1530-6984. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/nl2030213.
Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
Klíčová slova anglicky: Effective uptake; passive endocytosis; phospholipid membrane; nanoparticle shape; molecular dynamics
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 8. 10. 2012 01:47.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/963555/cs -
VÁCHA, Robert a D FRENKEL. Relation between Molecular Shape and the Morphology of Self-Assembling Aggregates: A Simulation Study. Biophysical Journal. Bethesda, USA: Biophysical Society, 2011, roč. 101, č. 6, s. 1432-1439. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2011.07.046.URL
Biofyzika. angličtina. Spojené státy.
Klíčová slova anglicky: HARD SPHEROCYLINDERS; PROTEIN STRUCTURES; PEPTIDES; SYSTEMS; FLUID
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 12. 10. 2012 10:52.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957098/cs -
VÁCHA, Robert, S W RICK, P JUNGWIRTH, A G F DE BEER, H B DE AGUIAR, J S SAMSON a S ROKE. The Orientation and Charge of Water at the Hydrophobic Oil Droplet-Water Interface. Journal of the American Chemical Society. Washington, DC., USA: American Chemical Society, 2011, roč. 133, č. 26, s. 10204-10210. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ja202081x.URL
Biofyzika. angličtina. Spojené státy.
Klíčová slova anglicky: SUM-FREQUENCY GENERATION; 2ND-HARMONIC GENERATION; AQUEOUS-SOLUTIONS; LIQUID WATER; VIBRATIONAL SPECTROSCOPY; MOLECULAR-DYNAMICS; HYDRATED PROTON; HYDROXIDE IONS; NEAT WATER; IN-WATER
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 12. 10. 2012 10:50.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/957097/cs
2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
2016
2015
2014
2013
2012
2011
Zobrazeno: 28. 9. 2024 03:18