Výpis publikací

SCHWARZEROVÁ, Jana, Aleš KOSTOVAL, Adam BAJGER, Lucia JAKUBÍKOVÁ, Iro PIERDOU, Lubomír POPELÍNSKÝ, K. SEDLÁŘ a Wolfram WECKWERTH. A Revealed Imperfection in Concept Drift Correction in Metabolomics Modeling. In Ewa Pietka, Pawel Badura, Jacek Kawa, Wojciech Wieclawek. Information Technology in Biomedicine: 9th International Conference, ITIB 2022. Kamien Slaski: Springer, 2022, s. 498-509. ISBN 978-3-031-09134-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-09135-3_42.

JAVORNÍK, Michal, Jana KOMÁRKOVÁ a Martin HUSÁK. Decision Support for Mission-Centric Cyber Defence. Online. In Proceedings of the 14th International Conference on Availability, Reliability and Security (ARES 2019). New York: ACM, 2019, s. "34:1"-"34:8", 8 s. ISBN 978-1-4503-7164-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3339252.3340522.

SAUNDERS, Gary, Michael BAUDIS, Regina BECKER, Sergi BELTRAN, Christophe BÉROUD, Ewan BIRNEY, Cath BROOKSBANK, Søren BRUNAK, Marc Van den BULCKE, Rachel DRYSDALE, Salvador CAPELLA-GUTIERREZ, Paul FLICEK, Francesco FLORINDI, Peter GOODHAND, Ivo GUT, Jaap HERINGA, Petr HOLUB, Jef HOOYBERGHS, Nick JUTY, Thomas M KEANE, Jan O KORBEL, Ilkka LAPPALAINEN, Brane LESKOSEK, Gert MATTHIJS, Michaela Th MAYRHOFER, Andres METSPALU, Arcadi NAVARRO, Steven NEWHOUSE, Tommi NYRÖNEN, Angela PAGE, Bengt PERSSON, Aarno PALOTIE, Helen PARKINSON, Jordi RAMBLA, David SALGADO, Erik STEINFELDER, Morris A SWERTZ, Alfonso VALENCIA, Susheel VARMA, Niklas BLOMBERG a Serena SCOLLEN. Leveraging European infrastructures to access 1 million human genomes by 2022. Nature Reviews Genetics. 2019, roč. 20, č. 11, s. 692-701, 9 s. ISSN 1471-0056. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41576-019-0156-9.

RŮŽIČKA, Michal, Andrea MIRANDA, Lukáš HEJTMÁNEK, Zdeněk VAŠEK, Vlastimil KREJČÍŘ a Miroslav BARTOŠEK. Metodika bitové ochrany digitálních dat. 2019.

MATE, Sebastian, Marvin KAMPF, Wolfgang RÖDLE, Stefan KRAUS, Rumyana PROYNOVA, Kaisa SILANDER, Lars EBERT, Martin LABLANS, Christina SCHÜTTLER, Christian KNELL, Niina EKLUND, Michael HUMMEL, Petr HOLUB a Hans-Ulrich PROKOSCH. Pan-European Data Harmonization for Biobanks in ADOPT BBMRI-ERIC. Appl Clin Inform. 2019, roč. 10, č. 04, s. 679-692. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1055/s-0039-1695793.

PETERS, K, J BRADBURY, S BERGMANN, M CAPUCCINI, M CASCANTE, Atauri P DE, TMD EBBELS, C FOGUET, R GLEN, A GONZALEZ-BELTRAN, UL GUNTHER, E HANDAKAS, T HANKEMEIER, K HAUG, S HERMAN, Petr HOLUB, M IZZO, D JACOB, D JOHNSON, F JOURDAN, N KALE, I KARAMAN, B KHALILI, PE KHONSARI, K KULTIMA, S LAMPA, A LARSSON, C LUDWIG, P MORENO, S NEUMANN, JA NOVELLA, O Donovan C, JTM PEARCE, A PELUSO, ME PIRAS, L PIREDDU, MAC REED, P ROCCA-SERRA, P ROGER, A ROSATO, R RUEEDI, C RUTTKIES, N SADAWI, RM SALEK, SA SANSONE, V SELIVANOV, O SPJUTH, D SCHOBER, EA THEVENOT, M TOMASONI, M VAN RIJSWIJK, M VAN VLIET, MR VIANT, RJM WEBER, G ZANETTI a C STEINBECK. PhenoMeNal: processing and analysis of metabolomics data in the cloud. GIGASCIENCE. OXFORD: OXFORD UNIV PRESS, 2019, roč. 8, č. 2, 12 s. ISSN 2047-217X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/gigascience/giy149.

LHOTÁK, Martin, Zdeněk VAŠEK a Michal RŮŽIČKA. Projekt ARCLib – vývoj open-source řešení pro dlouhodobou archivaci digitálních dokumentů pro knihovny a další paměťové instituce – aktuální stav. In LTP 2019: Nové trendy a východiská pri budovaní LTP archívov: zborník príspevkov zo 4. medzinárodnej konferencie o dlhodobej archivácii. Bratislava: Univerzitná knižnica v Bratislave, 2019, s. 53-63. ISBN 978-80-89303-77-9.

TROUBIL, Pavel, Hana RUDOVÁ a Petr HOLUB. Dynamic Reconfiguration in Multigroup Multicast Routing under Uncertainty. Journal of Heuristics. Springer, 2018, roč. 24, č. 3, s. 395-423. ISSN 1381-1231. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10732-017-9339-8.

HOLUB, Petr, Florian KOHLMAYER, Fabian PRASSER, Michaela Theresia MAYRHOFER, Irene SCHLUNDER, Gillian M. MARTIN, Sara CASATI, Lefteris KOUMAKIS, Andrea WUTTE, Lukas KOZERA, Dominik STRAPAGIEL, Gabriele ANTON, Gianluigi ZANETTI, Osman Ugur SEZERMAN, Maimuna MENDY, Dalibor VALÍK, Marialuisa LAVITRANO, Georges DAGHER, Kurt ZATLOUKAL, GertJan B. VAN OMMEN a Jan-Eric LITTON. Enhancing Reuse of Data and Biological Material in Medical Research: From FAIR to FAIR-Health. Biopreservation and Biobanking. NEW ROCHELLE: MARY ANN LIEBERT, INC, 2018, roč. 16, č. 2, s. 97-105. ISSN 1947-5535. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1089/bio.2017.0110.

NOVOTNÝ, Vít. Implementation Notes for the Soft Cosine Measure. Online. In Proceedings of the 27th ACM International Conference on Information and Knowledge Management (CIKM '18). Torino, Italy: Association for Computing Machinery, 2018, s. 1639-1642. ISBN 978-1-4503-6014-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3269206.3269317.

POLČÁK, Radim, Leoš ŠEVČÍK, Michal KOŠČÍK, Jakub KLODWIG a Petr HOLUB. Metodika aplikace GDPR na výzkumná data v prostředí vysokých škol v ČR. 1. vydání. Brno: Neuveden, 2018, 156 s. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5281/zenodo.2532860.

SOJKA, Petr, Michal RŮŽIČKA a Vít NOVOTNÝ. MIaS: Math-Aware Retrieval in Digital Mathematical Libraries. Online. In Proceedings of the 27th ACM International Conference on Information and Knowledge Management (CIKM '18). Torino, Italy: Association for Computing Machinery, 2018, s. 1923-1926. ISBN 978-1-4503-6014-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3269206.3269233.

NOVOTNÝ, Vít. Příprava Zpravodaje CSTUG. Zpravodaj CSTUG. Brno: CSTUG, 2018, roč. 28, 1-4, s. 1-10. ISSN 1211-6661. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5300/2018-1-4/1.

NOVOTNÝ, Vít a Petr SOJKA. Weighting of Passages in Question Answering. In Aleš Horák, Pavel Rychlý, Adam Rambousek. Proceedings of the Twelfth Workshop on Recent Advances in Slavonic Natural Language Processing, RASLAN 2018. Brno: Tribun EU, 2018, s. 31-40. ISBN 978-80-263-1517-9.

PROYNOVA, Rumyana, Diogo ALEXANDRE, Martin LABLANS, David VAN ENCKEVORT, Sebastian MATE, Niina EKLUND, Kaisa SILANDER, Michael HUMMEL, Petr HOLUB a Frank ÜCKERT. A Decentralized IT Architecture for Locating and Negotiating Access to Biobank Samples. Stud Health Technol Inform. Netherlands: IOS Press, 2017, roč. 243, s. 75-79, 6 s. ISSN 0926-9630. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3233/978-1-61499-808-2-75.

PANG, Chao, Fleur KELPIN, David VAN ENCKEVORT, Niina EKLUND, Kaisa SILANDER, Dennis HENDRIKSEN, Mark DE HAAN, Jonathan JETTEN, Tommy DE BOER, Bart CHARBON, Petr HOLUB, Hans HILLEGE a Morris A. SWERTZ. BiobankUniverse: automatic matchmaking between datasets for biobank data discovery and integration. Bioinformatics. Oxford: Oxford University Press, 2017, roč. 33, č. 22, s. 3627-3634. ISSN 1367-4803. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btx478.

HOFER-PICOUT, Philipp, Horst PICHLER, Johann EDER, Sabrina B. NEURURER, Heimo MÜLLER, Robert REIHS, Petr HOLUB, Thomas INSAM a Georg GOEBEL. Conception and Implementation of an Austrian Biobank Directory Integration Framework. Biopreservation and Biobanking. NEW ROCHELLE: MARY ANN LIEBERT, INC, 2017, roč. 15, č. 4, s. 332-340. ISSN 1947-5535. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1089/bio.2016.0113.

RŮŽIČKA, Michal, Vít NOVOTNÝ, Petr SOJKA, Jan POMIKÁLEK a Radim ŘEHŮŘEK. Flexible Similarity Search of Semantic Vectors Using Fulltext Search Engines. Online. In CEUR Workshop Proceedings, Vol. 1923. Vienna, Austria: Neuveden, 2017, s. 1-12. ISSN 1613-0073.

JIMÉNEZ, Rafael C, Mateusz KUZAK, Monther ALHAMDOOSH, Michelle BARKER, Bérénice BATUT, Mikael BORG, Salvador CAPELLA-GUTIERREZ, Neil Chue HONG, Martin COOK, Manuel CORPAS, Madison FLANNERY, Leyla GARCIA, Josep Ll GELPÍ, Simon GLADMAN, Carole GOBLE, Montserrat González FERREIRO, Alejandra GONZALEZ-BELTRAN, Philippa C GRIFFIN, Björn GRÜNING, Jonas HAGBERG, Petr HOLUB, Rob HOOFT, Jon ISON, Daniel S KATZ, Brane LESKOŠEK, Federico López GÓMEZ, Luis J OLIVEIRA, David MELLOR, Rowland MOSBERGEN, Nicola MULDER, Yasset PEREZ-RIVEROL, Robert PERGL, Horst PICHLER, Bernard POPE, Ferran SANZ, Maria V SCHNEIDER, Victoria STODDEN, Radosław SUCHECKI, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Harry-Anton TALVIK, Ilian TODOROV, Andrew TRELOAR, Sonika TYAGI, Maarten van GOMPEL, Daniel VAUGHAN, Allegra VIA, Xiaochuan WANG, Nathan S WATSON-HAIGH a Crouch STEVE. Four simple recommendations to encourage best practices in research software. F1000Research. 2017, roč. 6, JUN, s. 876-888. ISSN 2046-1402. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.12688/f1000research.11407.1.

RŮŽIČKA, Michal. Math Information Retrieval for Digital Libraries. Brno: Masaryk University, Faculty of Informatics, 2017, 144 s. Doctoral Thesis.

BARTOŠEK, Miroslav, Michal RŮŽIČKA a Václav STUPKA. Nařízení GDPR a jeho implementace na vysokých školách v ČR – jak na to. In EUNIS-CZ. Dopad zavedení novely VŠ zákona do IS vysokých škol. 1. vyd. Plzeň: Západočeská univerzita v Plzni, 2017, s. 5-14. ISBN 978-80-261-0713-2.

DOSTÁL, Otto, Otto DOSTÁL a Michal JAVORNÍK. Právní limity nakládání s údaji o zdravotním stavu. In XIII. mezinárodní kongres informačních technologií ve zdravotnictví. 2017.

ROČEK, Aleš, Michal JAVORNÍK, Karel SLAVÍČEK a Otto DOSTÁL. Reversible Watermarking in Medical Imaging with Zero Distortion in ROI. Online. In Proceedings of 24th IEEE International Conference on Electronics, Circuits and Systems (ICECS 2017). New York: IEEE, 2017, s. 356-359. ISBN 978-1-5386-1911-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ICECS.2017.8292071.

RYGL, Jan, Jan POMIKÁLEK, Radim ŘEHŮŘEK, Michal RŮŽIČKA, Vít NOVOTNÝ a Petr SOJKA. Semantic Vector Encoding and Similarity Search Using Fulltext Search Engines. Online. In Proceedings of the 2nd Workshop on Representation Learning for NLP, RepL4NLP 2017 c/o ACL 2017. Vancouver, Canada: Association for Computational Linguistics, ACL, 2017, s. 81-90. ISBN 978-1-945626-62-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.18653/v1/W17-2611.

SOJKA, Petr a Vít NOVOTNÝ. TeX na školách? Samozřejmě ano! Příklad užití TeXu na Fakultě informatiky Masarykovy univerzity. Zpravodaj CSTUG. Brno: CSTUG, 2017, roč. 27, 3-4, s. 118-137. ISSN 1211-6661. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5300/2017-3-4/118.

NOVOTNÝ, Vít. Using Markdown Inside TeX Documents. TUGboat. Portland, OR 97208-2311, U.S.A: TUG, 2017, roč. 38, č. 2, s. 214-217. ISSN 0896-3207.

NOVOTNÝ, Vít. Vector Space Representations in Information Retrieval. Brno: Fakulta Informatiky Masarykovy Univerzity, 2017, 56 s.