Výpis publikací

HRADISKÁ, Helena, Martin KUREČKA, Jan BERÁNEK, Guglielmo TEDESCHI, Vladimír VIŠŇOVSKÝ, Aleš KŘENEK a Vojtěch SPIWOK. Acceleration of Molecular Simulations by Parametric Time-Lagged tSNE Metadynamics. The Journal of Physical Chemistry B. 2024. ISSN 1520-6106. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.3c05669.

NOVOTNÁ, Lucie, Terézia SLANINÁKOVÁ, David PROCHÁZKA, Lukáš HEJTMÁNEK, Katarína GREŠOVÁ, Jaroslav OĽHA, Vlastislav DOHNAL, Adrián ROŠINEC a Matej ANTOL. AlphaFind: Discover structure similarity across the entire known proteome – data and model. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48700/datst.d35zf-1ja47.

BERANEK, Jan, Aleš KŘENEK a Vojtěch SPIWOK. Analysis of metadynamics simulations by metadynminer.py. Bioinformatics. OXFORD: Oxford University Press, 2024, roč. 40, č. 10, 4 s. ISSN 1367-4803. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btae614.

SLANINÁKOVÁ, Terézia, Katarína GREŠOVÁ, David PROCHÁZKA, Viktória SPIŠAKOVÁ, Adrián ROŠINEC, Jakub ČILLÍK, Pavlína ŠPRINGEROVÁ, Aleš KŘENEK, Vlastislav DOHNAL, Radka SVOBODOVÁ a Matej ANTOL. Fast, structure-based searching in a large-scale protein data repository. In ELIXIR CZ Annual Conference. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.13140/RG.2.2.31355.53281.

JEANSON, Francis, Spencer J GIBSON, Pinar ALPER, Alexander BERNIER, J Patrick WOOLLEY, Daniel MIETCHEN, Andrzej STRUG, Regina BECKER, Pim KAMERLING, Maria del Carmen Sanchez GONZALEZ, Nancy MAH, Ann NOVAKOWSKI, Mark D WILKINSON, Oussama Mohammed BENHAMED, Annalisa LANDI, Georg Philip KROG, Heimo MÜLLER, Umar RIAZ, Colin VEAL, Petr HOLUB, Esther VAN ENCKEVORT a Anthony J BROOKES. Getting your DUCs in a row - standardising the representation of Digital Use Conditions. SCIENTIFIC DATA. London: NATURE PORTFOLIO, 2024, roč. 11, č. 1, s. 1-10. ISSN 2052-4463. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41597-024-03280-6.

NOVOTNÁ, Lucie, Terézia SLANINÁKOVÁ, David PROCHÁZKA, Lukáš HEJTMÁNEK, Adrián ROŠINEC, Jaroslav OĽHA, Katarína GREŠOVÁ, Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. GraSR: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48700/datst.br8aq-db495.

KÉPEŠ, Erik, Jakub VRÁBEL, Tomáš BRÁZDIL, Petr HOLUB, Pavel POŘÍZKA a Jozef KAISER. Interpreting convolutional neural network classifiers applied to laser-induced breakdown optical emission spectra. Talanta. AMSTERDAM: Elsevier, 2024, roč. 266, č. 124946, s. 1-11. ISSN 0039-9140. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.talanta.2023.124946.

HOLUB, Petr. Leveraging BBMRI-ERIC for XAI Research in Digital Pathology. In 20th European Congress on Digital Pathology 2024 (ECDP2024). 2024.

NOVOTNÁ, Lucie, Terézia SLANINÁKOVÁ, David PROCHÁZKA, Lukáš HEJTMÁNEK, Adrián ROŠINEC, Jaroslav OĽHA, Katarína GREŠOVÁ, Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. LMI-10: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48700/datst.t45hr-bcw17.

NOVOTNÁ, Lucie, Terézia SLANINÁKOVÁ, David PROCHÁZKA, Lukáš HEJTMÁNEK, Adrián ROŠINEC, Jaroslav OĽHA, Katarína GREŠOVÁ, Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. LMI-30: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48700/datst.kgb8j-r5f84.

OHMANN, Christian, Maria PANAGIOTOPOULOU, Steve CANHAM, Petr HOLUB, Kurt MAJCEN, Gary SAUNDERS, Maddalena FRATELLI, Jing TANG, Philip GRIBBON, Reagon KARKI, Mari KLEEMOLA, Katja MOILANEN, Daan BROEDER, Walter DAELEMANS a Pieter FIVEZ. Proposal for a framework of contextual metadata in selected research infrastructures of the life sciences and the social sciences & humanities. International Journal of Metadata, Semantics and Ontologies. Inderscience Publishers, 2024, roč. 16, č. 4, s. 261-277. ISSN 1744-2621.

HECHT, Helge, Wudmir Yudy ROJAS VERASTEGUI, Zargham AHMAD, Aleš KŘENEK, Jana KLÁNOVÁ a Elliott James PRICE. Quantum Chemistry-Based Prediction of Electron Ionization Mass Spectra for Environmental Chemicals. Analytical chemistry. WASHINGTON: American Chemical Society, 2024, roč. 96, č. 33, s. 13652-13662. ISSN 0003-2700. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.analchem.4c02589.

SVOBODA, Tomáš, Adrián ROŠINEC, Tomáš RAČEK, Josef HANDL, Aleš KŘENEK a Radka SVOBODOVÁ. Scientific Dataset Management System for the Research Institute Based on Onedata. In EGI Conference 2024. 2024.

WITTNER, Rudolf, Petr HOLUB, Cecilia MASCIA, Francesca FREXIA, Heimo MÜLLER, Markus PLASS, Clare ALLOCCA, Fay BETSOU, Tony BURDETT, Ibon CANCIO, Adriane CHAPMAN, Martin CHAPMAN, Mélanie COURTOT, Vasa CURCIN, Johann EDER, Mark ELLIOT, Katrina EXTER, Carole GOBLE, Martin GOLEBIEWSKI, Bron KISLER, Andreas KREMER, Simone LEO, Sheng LIN-GIBSON, Anna MARSANO, Marco MATTAVELLI, Josh MOORE, Hiroki NAKAE, Isabelle PERSEIL, Ayat SALMAN, James SLUKA, Stian SOILAND-REYES, Caterina STRAMBIO-DE-CASTILLIA, Michael SUSSMAN, Jason R SWEDLOW, Kurt ZATLOUKAL a Jörg GEIGER. Toward a common standard for data and specimen provenance in life sciences. LEARNING HEALTH SYSTEMS. UNITED STATES: WILEY, 2024, roč. 8, č. 1, s. 1-9. ISSN 2379-6146. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/lrh2.10365.

NOVOTNÁ, Lucie, Terézia SLANINÁKOVÁ, David PROCHÁZKA, Lukáš HEJTMÁNEK, Adrián ROŠINEC, Jaroslav OĽHA, Katarína GREŠOVÁ, Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. 3D-af-Surfer: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48700/datst.tbws0-hj147.

NOVOTNÁ, Lucie, Terézia SLANINÁKOVÁ, David PROCHÁZKA, Lukáš HEJTMÁNEK, Adrián ROŠINEC, Jaroslav OĽHA, Katarína GREŠOVÁ, Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. 3DZD: Protein structural embeddings of AlphaFold DB v4. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48700/datst.t45hr-bcw17.

NOVOTNÁ, Lucie, Terézia SLANINÁKOVÁ, David PROCHÁZKA, Lukáš HEJTMÁNEK, Adrián ROŠINEC, Jaroslav OĽHA, Katarína GREŠOVÁ, Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. 3DZD: Protein structural embeddings of ESM Atlas. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48700/datst.cd6zk-k0v44.

DAUBNER, Lukáš, Raimundas MATULEVICIUS, Barbora BÜHNOVÁ, Matej ANTOL, Michal RŮŽIČKA a Tomáš PITNER. A Case Study on the Impact of Forensic-Ready Information Systems on the Security Posture. Online. In Advanced Information Systems Engineering. Cham: Springer Nature Switzerland, 2023, s. 522-538. ISBN 978-3-031-34559-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-34560-9_31.

CALATRAVA, Amanda, Hernán ASOREY, Jan ASTALOS, Alberto AZEVEDO, Francesco BENINCASA, Ignacio BLANQUER, Martin BOBAK, Francisco BRASILEIRO, Laia CODÓ, Laura del CANO, Borja ESTEBAN, Meritxell FERRET, Josef HANDL, Tobias KERZENMACHER, Valentin KOZLOV, Aleš KŘENEK, Ricardo MARTINS, Manuel PAVESIO, Antonio Juan RUBIO-MONTERO a Juan SÁNCHEZ-FERRERO. A survey of the European Open Science Cloud services for expanding the capacity and capabilities of multidisciplinary scientific applications. COMPUTER SCIENCE REVIEW. NETHERLANDS: ELSEVIER, 2023, roč. 49. ISSN 1574-0137. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.cosrev.2023.100571.

HOLZINGER, Andreas, Katharina KEIBLINGER, Petr HOLUB, Kurt ZATLOUKAL a Heimo MÜLLER. AI for Life: Trends in Artificial Intelligence for Biotechnology. NEW BIOTECHNOLOGY. NETHERLANDS: ELSEVIER, 2023, roč. 74, č. 1, s. 16-24. ISSN 1871-6784. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.nbt.2023.02.001.

LAMOTHE, Lucie, Jennifer R B JENSEN, Hans IENASESCU, Ove J R GUSTAFSSON, Alban GAIGNARD, Dmitry REPCHEVSKY, Radka SVOBODOVÁ, Tomáš RAČEK, Adrián ROŠINEC, Matej ANTOL a Hervé MÉNAGER. An Evaluation of EDAM Coverage in the Tools Ecosystem and Prototype Integration of Galaxy and Workflowhub Systems. BioHackrXiv. 2023, s. 1-10. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.37044/osf.io/79kje.

DAVID, Romain, Arina RYBINA, Jean-Marie BUREL, Jean-Karim HERICHE, Pauline AUDERGON, Jan-Willem BOITEN, Frederik COPPENS, Sara CROCKETT, Exter KATRINA, Sven FAHRENER, Maddalena FRATELLI, Carole GOBLE, Philipp GORMANNS, Tobias GRANTNER, Bjorn GRUNING, Kim Tamara GURWITZ, John HANCOCK, Henriette HARMSE, Petr HOLUB, Nick JUTY, Geoffrey KARNBACH, Emma KAROUNE, Antje KEPPLER, Jessica KLEMEIER, Carla LANCELOTTI, Jean-Luc LEGRAS, L Allyson LISTER, Livio Longo DARIO, Rebecca LUDWIG, Benedicte MADON, Marzia MASSIMI, Vera MATSER, Rafaele MATTEONI, Michaela Th MAYRHOFER, Ohmann CHRISTIAN, Maria PANAGIOTOPOULOU, Helen PARKINSON, Isabelle PERSEIL, Claudia PFANDER, Roland PIERUSCHKA, Michael RAESS, Andreas RAUBER, Audrey S RICHARD, Paolo ROMANO, Antonio ROSATO, Alex SANCHEZ-PLA, Susanna-Assunta SANSONE, Ugis SARKANS, Beatriz SERRANO-SOLANO, Jing TANG, Ziaurrehman TANOLI, Jonathan TEDDS, Harald WAGENER, Martin WEISE, Hans V WESTERHOFF, Rudolf WITTNER, Jonathan EWBANK, Niklas BLOMBERG a Philip GRIBBON. "Be Sustainable Recommendations" for FAIR Resources in Life Sciences research: EOSC-Life's Lessons. EMBO Journal. 2023. ISSN 1460-2075.

ROŠINEC, Adrián a Klára MORAVCOVÁ. Beskar Cloud: OpenStack Deployment on Top of Kubernetes. In 12th Iberian Grid Conference. 2023.

MÜLLER, Heimo, Catarina LOPES-DIAS, Petr HOLUB, Markus PLASS, Emilian JUNGWIRTH, Robert REIHS, Paul R TORKE, Apostolos MALATRAS, Anouk BERGER, Heather COOMBS, Joakim DILLNER a Roxana MERINO-MARTINEZ. BIBBOX, a FAIR toolbox and App Store for Life Science Research. NEW BIOTECHNOLOGY. NETHERLANDS: ELSEVIER, 2023, roč. 77, s. 12-19. ISSN 1871-6784. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.nbt.2023.06.001.

ROŠINEC, Adrián a Klára MORAVCOVÁ. Building OpenStack Cloud with Kubernetes as Undercloud. In EGI Conference 2023. 2023.

CAPANDOVÁ, Michaela, Veronika SEDLÁKOVÁ, Dáša BOHAČIAKOVÁ, Hana KOTASOVÁ, Vendula PELKOVÁ, Zbyněk VORÁČ, Matej ANTOL a Aleš HAMPL. By leaps and bounds: From in vitro lung tissue models to fostering collaboration in science. In The Annual PhD Conference in Biomedical Sciences. 2023.

BEURAN, Razvan, Jan VYKOPAL, Daniela BELAJOVÁ, Pavel ČELEDA, Yasuo TAN a Yoichi SHINODA. Capability Assessment Methodology and Comparative Analysis of Cybersecurity Training Platforms. Computers & Security. Elsevier, 2023, roč. 128, č. 103120, s. 1-14. ISSN 0167-4048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.cose.2023.103120.

SVOBODA, Tomáš, Aleš KŘENEK, Łukasz OPIOŁA, Andrea MANZI a Josef HANDL. Cloudification of scientific experimental data using Onedata. In EGI Conference 2023. 2023.

HEJTMÁNEK, Lukáš, Adrián ROŠINEC a Sebastian LUNA-VALERO. Easy Deployment of Dask and Jupyter Notebooks on Managed Kubernetes. In EGI Conference 2023. 2023.

BRIONES DELGADO, Alan, Sara RICCI, Argyro CHATZOPOULOU, Jakub ČEGAN, Petr DZURENDA a Ioannis KOUTOUDIS. Enhancing Cybersecurity Education in Europe: The REWIRE's Course Selection Methodology. Online. In 979-8-4007-0772-8. 18TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON AVAILABILITY, RELIABILITY & SECURITY, ARES 2023. Benevento, Italy: ACM, 2023, s. 1-15. ISBN 979-8-4007-0772-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3600160.3605091.

ROŠINEC, Adrián, Tomáš SVOBODA, Tomáš RAČEK, Aleš KŘENEK a Radka SVOBODOVÁ. Enhancing Data Accessibility: Strategies and Tools for Effective Metadata Management. In IBERGRID 2023. 2023.

ŠPAČEK, Stanislav, Petr VELAN, Martin HOLKOVIČ a Tomáš PLESNÍK. Event-Flow Correlation for Anomaly Detection in HTTP/3 Web Traffic. Online. In 2023 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium (NOMS 2023). Miami, Florida, USA: IEEE Xplore Digital Library, 2023, s. 1-6. ISBN 978-1-6654-7716-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS56928.2023.10154211.

ČERMÁK, Milan a Petr VELAN. How can network traffic lie? DFRWS EU 2023, 2023.

SCHINDLER, Ondřej, Karel BERKA, Alessio CANTARA, Aleš KŘENEK, Dominik TICHÝ, Tomáš RAČEK a Radka SVOBODOVÁ. αCharges: partial atomic charges for AlphaFold structures in high quality. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2023, roč. 51, W1, s. "W11"-"W16", 6 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkad349.

DOSEDLA, Martin, Zdeněk HODIS, Martina JANČOVÁ, Jiří LEDVINKA, Leni LVOVSKÁ, Kamil MALINKA, Darina MÍSAŘOVÁ, Pavla PITNEROVÁ, Vladimír SCHINDLER, Vojtěch STANĚK, Libuše VODOVÁ a Tomáš STAUDEK. Integration of 3D printing technology into teaching in primary and secondary schools. Certified Methodology. Online. 1. vyd. Brno: Masaryk University Press, 2023. odborné a technické vzdělávání. ISBN 978-80-280-0350-0.

DOSEDLA, Martin, Zdeněk HODIS, Martina JANČOVÁ, Jiří LEDVINKA, Leni LVOVSKÁ, Kamil MALINKA, Darina MÍSAŘOVÁ, Pavla PITNEROVÁ, Vladimír SCHINDLER, Vojtěch STANĚK, Libuše VODOVÁ a Tomáš STAUDEK. Integration of 3D printing technology into teaching in primary and secondary schools. Certified Methodology. 2023.

SVOBODA, Tomáš, Radka SVOBODOVÁ, David ANTOŠ, Adrián ROŠINEC a Aleš KŘENEK. Introduction to Onedata at CEITEC MU and in Czech National Repository Platform. In MATECHat meeting. 2023.

GRENAR, David, Jakub FROLKA, Karel SLAVÍČEK, Otto DOSTÁL a Martin KYSELAK. NETWORK PHYSICAL LAYER ATTACK IN THE VERY HIGH CAPACITY NETWORKS. Advances in electrical and electronic engineering. OSTRAVA: VSB-TECHNICAL UNIV OSTRAVA, 2023, roč. 21, č. 1, s. 37-47. ISSN 1336-1376. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.15598/aeee.v21i1.4973.

SPIŠAKOVÁ, Viktória, Lukáš HEJTMÁNEK a Jakub HYNŠT. Nextflow in Bioinformatics: Executors Performance Comparison Using Genomics Data. FUTURE GENERATION COMPUTER SYSTEMS-THE INTERNATIONAL JOURNAL OF ESCIENCE. NETHERLANDS: ELSEVIER, 2023, roč. 142, May 2023, s. 328-339. ISSN 0167-739X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.future.2023.01.009.

ROŠINEC, Adrián, Tomáš SVOBODA, Tomáš RAČEK, Josef HANDL, Jozef SABO, Aleš KŘENEK a Radka SVOBODOVÁ. Onedata4Sci: Life-science experimental datasets management system. In 3D-BioInfo | ISCB 3D-SIG | ELIXIR Czech Republic Structural Bioinformatics. 2023.

LAŠTOVIČKA, Martin, Martin HUSÁK, Petr VELAN, Tomáš JIRSÍK a Pavel ČELEDA. Passive Operating System Fingerprinting Revisited: Evaluation and Current Challenges. Computer Networks. Netherlands: Elsevier, 2023, roč. 229, č. 109782, s. 1-12. ISSN 1389-1286. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.comnet.2023.109782.

HOLUB, Petr, Heimo MÜLLER, Tomáš BÍL, Luca PIREDDU, Markus PLASS, Fabian PRASSER, Irene SCHLÜNDER, Kurt ZATLOUKAL, Rudolf NENUTIL a Tomáš BRÁZDIL. Privacy risks of whole-slide image sharing in digital pathology. Nature Communications. 2023, roč. 14, č. 2577, s. 1-15. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-37991-y.

PLASS, Markus, Rudolf WITTNER, Petr HOLUB, Francesca FREXIA, Cecilia MASCIA, Matej GALLO, Heimo MÜLLER a Jörg GEIGER. Provenance of specimen and data – A prerequisite for AI development in computational pathology. NEW BIOTECHNOLOGY. NETHERLANDS: ELSEVIER, 2023, roč. 78, DEC, s. 22-28. ISSN 1871-6784. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.nbt.2023.09.006.

ANTOL, Matej, Michal RŮŽIČKA, Luděk MATYSKA a Jiří MAREK. Public (Health) Sector and Academia. In Martin Komenda. Data-Driven Decision-Making in Medical Education and Healthcare. First edition. Brno: Masaryk University, 2023, s. 51-66. Data Rulezzzz! ISBN 978-80-280-0392-0.

SLANINÁKOVÁ, Terézia, Matej ANTOL, Jaroslav OĽHA, Vlastislav DOHNAL, Susana LADRA a Miguel A. MARTÍNEZ-PRIETO. Reproducible experiments with Learned Metric Index Framework. Information systems. Elsevier, 2023, roč. 118, č. 1, s. 102255-102270. ISSN 0306-4379. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.is.2023.102255.

GALLO, Matej, Vojtěch KRAJŇANSKÝ, Rudolf NENUTIL, Petr HOLUB a Tomáš BRÁZDIL. Shedding light on the black box of a neural network used to detect prostate cancer in whole slide images by occlusion-based explainability. NEW BIOTECHNOLOGY. NETHERLANDS: ELSEVIER, 2023, roč. 78, December, s. 52-67. ISSN 1871-6784. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.nbt.2023.09.008.

SLANINÁKOVÁ, Terézia, David PROCHÁZKA, Matej ANTOL, Jaroslav OĽHA a Vlastislav DOHNAL. SISAP 2023 Indexing Challenge – Learned Metric Index. In Pedreira, O., Estivill-Castro, V. Similarity Search and Applications. SISAP 2023. Lecture Notes in Computer Science, vol 14289. Cham: Springer, 2023, s. 282-290. ISBN 978-3-031-46993-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-46994-7_24.

DAVID, Romain, Audrey RICHARD, Claire CONNELLAN, Katharina LAUER, Maria Luisa CHIUSANO, Carole GOBLE, Martin HOUDE, Isabel KEMMER, Antje KEPPLER, Philippe LIEUTAUD, Christian OHMANN, Maria PANAGIOTOPOULOU, Sara Raza KHAN, Arina RYBINA, Stian SOILAND-REYES, Charlotte WIT, Rudolf WITTNER, Rafael Andrade BUONO, Sarah Arnaud MARSH, Pauline AUDERGON, Dylan BONFILS, Carazo JOSE-MARIA, Remi CHARREL, Frederik COPPENS, Wolfgang FECKE, Claudia FILIPPONE, Eva Garcia ALVAREZ, Sheraz GUL, Henning HERMJAKOB, Katja HERZOG, Petr HOLUB, Lukasz KOZERA, Allyson LISTER, José LÓPEZ-CORONADO, Bénédicte MADON, Kurt MAJCEN, William MARTIN, Wolfgang MÜLLER, Elli PAPADOPOULOU, Christine M.A. PRAT, Paolo ROMANO, Sansone SUSANNA-ASSUNTA, Gary SAUNDERS, Niklas BLOMBERG a Jonathan EWBANK. Umbrella Data Management Plans to Integrate FAIR Data: Lessons From the ISIDORe and BY-COVID Consortia for Pandemic Preparedness. Data Science Journal. Ubiquity Press, 2023. ISSN 1683-1470. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5334/dsj-2023-035.

SPIŠAKOVÁ, Viktória, Dalibor KLUSÁČEK a Lukáš HEJTMÁNEK. Using Kubernetes in Academic Environment : Problems and Approaches. In Dalibor Klusáček, Julita Corbalán, Gonzalo P. Rodrigo. Job Scheduling Strategies for Parallel Processing. 1. vyd. Cham (Switzerland): Springer, 2023, s. 235-253. ISBN 978-3-031-22697-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-22698-4_12.

DOSEDLA, Martin, Zdeněk HODIS, Martina JANČOVÁ, Jiří LEDVINKA, Leni LVOVSKÁ, Kamil MALINKA, Darina MÍSAŘOVÁ, Pavla PITNEROVÁ, Vladimír SCHINDLER, Vojtěch STANĚK, Libuše VODOVÁ a Petr VYBÍRAL. Výuková pomůcka - soubor výukových pomůcek pro integraci technologie 3D tisku do výuky na základních a středních školách. Online. Brno: Masarykova univerzita, 2023.

KRAUS, Lydia, Valdemar ŠVÁBENSKÝ, Martin HORÁK, Václav MATYÁŠ, Jan VYKOPAL a Pavel ČELEDA. Want to Raise Cybersecurity Awareness? Start with Future IT Professionals. Online. In Proceedings of the 28th Annual ACM Conference on Innovation and Technology in Computer Science Education (ITiCSE'23). New York, NY, USA: ACM, 2023, s. 236-242. ISBN 979-8-4007-0138-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3587102.3588862.

HORÁK, Jiří, Katarína FURMANOVÁ, Barbora KOZLÍKOVÁ, Tomáš BRÁZDIL, Petr HOLUB, Martin KAČENGA, Matej GALLO, Rudolf NENUTIL, Jan BYŠKA a Vít RUSŇÁK. xOpat: eXplainable Open Pathology Analysis Tool. COMPUTER GRAPHICS FORUM. England: Wiley, 2023, roč. 42, č. 3, s. 63-73. ISSN 0167-7055. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/cgf.14812.

RAČEK, Tomáš. Zpracování dat na CEITECu. In SitSem - Seminář laboratoře Sitola. 2023.

DOSEDLA, Martin, Zdeněk HODIS, Martina JANČOVÁ, Jiří LEDVINKA, Leni LVOVSKÁ, Kamil MALINKA, Darina MÍSAŘOVÁ, Pavla PITNEROVÁ, Vladimír SCHINDLER, Vojtěch STANĚK a Libuše VODOVÁ. 3D tisk a jeho uplatnění na základních a středních školách. 2023.

SCHINDLER, Ondřej, Tomáš RAČEK a Radka SVOBODOVÁ. Alphacharges - a web service for calculating QM-like partial atomic charges for AlphaFold proteins. In XXI. setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2022.

ČEGAN, Jakub, Tomáš PLESNÍK, Daniel TOVARŇÁK, Zdeněk FORMAN a Roman VESELÝ. Analytická studie rozvoje a nasazení SOC. 2022.

PITNER, Tomáš, Otto DOSTÁL, Michal JAVORNÍK, Pavel ANDRES, Aleš ROČEK, Karel SLAVÍČEK, Tomáš KUBALA a Otto DOSTÁL. Analýza systému pro podporu efektivní spolupráce distribuovaných zdravotnických týmů. Brno: MU, 2022, 76 s.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar, Jan VYKOPAL, Pavel ČELEDA a Lydia KRAUS. Applications of Educational Data Mining and Learning Analytics on Data From Cybersecurity Training. Education and Information Technologies. Springer, 2022, roč. 27, č. 9, s. 12179 - 12212. ISSN 1360-2357. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10639-022-11093-6.

BRÁZDIL, Tomáš, Matej GALLO, Rudolf NENUTIL, Andrej KUBANDA, Martin TOUFAR a Petr HOLUB. Automated annotations of epithelial cells and stroma in hematoxylin–eosin-stained whole-slide images using cytokeratin re-staining. The Journal of Pathology: Clinical Research. 2022, roč. 8, č. 2, s. 129-142. ISSN 2056-4538. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cjp2.249.

SVOBODA, Tomáš, Aleš KŘENEK a Josef HANDL. Automatic storing, sharing and archiving datasets with Onedata. In EGI Conference 2022. 2022.

SVOBODA, Tomáš, Aleš KŘENEK a Josef HANDL. Automating scientific dataset management and processing using Onedata. In IBERGRID 2022. 2022.

MIHÁLIKOVÁ, Ivana, Martin FRIÁK, Matej PIVOLUSKA, Martin PLESCH, Martin SAIP a Mojmír ŠOB. Best-Practice Aspects of Quantum-Computer Calculations: A Case Study of the Hydrogen Molecule. MOLECULES. SWITZERLAND: MDPI, 2022, roč. 27, č. 3, s. 1-15. ISSN 1420-3049. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/molecules27030597.

SPIWOK, Vojtěch, Martin KUREČKA a Aleš KŘENEK. Collective Variable for Metadynamics Derived From AlphaFold Output. FRONTIERS IN MOLECULAR BIOSCIENCES. SWITZERLAND: FRONTIERS MEDIA SA, 2022, roč. 2022, č. 9, s. 1-10. ISSN 2296-889X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3389/fmolb.2022.878133.

FIRC, Anton, Kamil MALINKA a Petr HANÁČEK. Creation and detection of malicious synthetic media - a preliminary survey on deepfakes. In Sborník příspevků z 54. konference EurOpen.CZ, 28.5.-1.6.2022. 2022, s. 125-145. ISBN 978-80-86583-34-1.

HUSÁK, Martin, Lukáš SADLEK, Stanislav ŠPAČEK, Martin LAŠTOVIČKA, Michal JAVORNÍK a Jana KOMÁRKOVÁ. CRUSOE: A Toolset for Cyber Situational Awareness and Decision Support in Incident Handling. Computers & Security. Elsevier, 2022, roč. 115, April, s. 1-19. ISSN 0167-4048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.cose.2022.102609.

SADLEK, Lukáš, Pavel ČELEDA a Daniel TOVARŇÁK. Current Challenges of Cyber Threat and Vulnerability Identification Using Public Enumerations. Online. In The 17th International Conference on Availability, Reliability and Security (ARES 2022). Vienna, Austria: ACM, 2022, s. 1-8. ISBN 978-1-4503-9670-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3538969.3544458.

MALINKA, Kamil. Deepfakes - zábava, nebo hrozba? In Aimtechackathon. 2022.

ŠEDA, Pavel, Jan VYKOPAL, Pavel ČELEDA a Igor IGNÁC. Designing Adaptive Cybersecurity Hands-on Training. Online. In 2022 IEEE Frontiers in Education Conference (FIE). Uppsala, Sweden: IEEE, 2022, s. 1-8. ISBN 978-1-6654-6244-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/FIE56618.2022.9962663.

RUMAN, Ádám a Daniel KOUŘIL. Detection of Malicious Code in SSH programs. In Sborník příspěvků z 54. konference EurOpen.CZ. 2022, s. 115-124.

ČELEDA, Pavel, Attila FARKAS, Pavel ŠEDA, Andrej TOMČI, Daniel IĽKOVIČ, Martin ŠVÉDA a Tomáš HRADSKÝ. Dohledové centrum pro monitorování výrobních informačních systémů. 2022.

HUJŇÁK, Ondřej, Kamil MALINKA a Petr HANÁČEK. E-Banking Authentication - Dynamic Password Generators and Hardware Tokens. In Sborník příspěvků z 54. konference EurOpen.CZ, 28.5.-1.6.2022. 2022, s. 211-221.

MALINKA, Kamil, Ondřej HUJŇÁK, Petr HANÁČEK a Lukáš HELLEBRANDT. E-Banking Security Study — 10 Years Later. IEEE Access. IEEE Xplore Digital Library, 2022, roč. 10, s. 16681-16699. ISSN 2169-3536. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ACCESS.2022.3149475.

MALINKA, Kamil, Libuše VODOVÁ, Martina JANČOVÁ, Lenka SOBKOVÁ a Vladimír SCHINDLER. Effective Teaching through Multidisciplinary Lessons Adopting 3D Print – Preliminary Study. Online. In Theo Bastiaens. Proceedings of EdMedia + Innovate Learning. United States: Association for the Advancement of Computing in Education (AACE), 2022, s. 286-291. ISBN 978-1-939797-62-9.

ŠPAČEK, Stanislav, Petr VELAN, Pavel ČELEDA a Daniel TOVARŇÁK. Encrypted Web Traffic Dataset: Event Logs and Packet Traces. Data in Brief. 2022, roč. 42, June, s. 1-10. ISSN 2352-3409. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2022.108188.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar, Richard WEISS, Jack COOK, Jan VYKOPAL, Pavel ČELEDA, Jens MACHE, Radoslav CHUDOVSKÝ a Ankur CHATTOPADHYAY. Evaluating Two Approaches to Assessing Student Progress in Cybersecurity Exercises. Online. In Proceedings of the 53rd ACM Technical Symposium on Computer Science Education (SIGCSE '22). New York, NY, USA: ACM, 2022, s. 787-793. ISBN 978-1-4503-9070-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3478431.3499414.

MATYÁŠ, Václav, Kamil MALINKA, Lydia KRAUS, Lenka KNAPOVÁ a Agáta KRUŽÍKOVÁ. Even if users do not read security directives, their behavior is not so catastrophic. Communications of the ACM. New York, NY, USA: ACM, 2022, roč. 65, č. 1, s. 37-40. ISSN 0001-0782. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3471928.

KYSELAK, Martin, Karel SLAVÍČEK, David GRENAR, Marek BOHRN a Jiri VAVRA. Fiber optic polarization temperature sensor for biomedical and military security systems. In SMART BIOMEDICAL AND PHYSIOLOGICAL SENSOR TECHNOLOGY XIX. 2022. ISSN 0277-786X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1117/12.2618911.

APPEL, Paul, Alexander J. HEILMAN, Ezekiel W. WERTZ, David W. LYONS, Marcus HUBER, Matej PIVOLUSKA a Giuseppe VITAGLIANO. Finite-Function-Encoding Quantum States. QUANTUM. WIEN: VEREIN FORDERUNG OPEN ACCESS PUBLIZIERENS QUANTENWISSENSCHAF, 2022, roč. 6, č. 708, s. 1-34. ISSN 2521-327X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.22331/q-2022-05-09-708.

HUSÁK, Martin, Martin LAŠTOVIČKA a Tomáš PLESNÍK. Handling Internet Activism during the Russian Invasion of Ukraine: A Campus Network Perspective. Digital Threats: Research and Practice. New York, NY, USA: ACM, 2022, roč. 3, č. 3, s. "17:1-17:5", 5 s. ISSN 2692-1626. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3534566.

ŠPAČEK, Stanislav, Petr VELAN, Pavel ČELEDA a Daniel TOVARŇÁK. HTTPS Event-Flow Correlation: Improving Situational Awareness in Encrypted Web Traffic. Online. In 2022 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium (NOMS 2022). Budapešť, Maďarsko: IEEE Xplore Digital Library, 2022, s. 1-6. ISBN 978-1-6654-0601-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS54207.2022.9789877.

SADLEK, Lukáš, Pavel ČELEDA a Daniel TOVARŇÁK. Identification of Attack Paths Using Kill Chain and Attack Graphs. Online. In NOMS 2022 - 2022 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium. Budapest, Hungary: IEEE Xplore Digital Library, 2022, s. 1-6. ISBN 978-1-6654-0601-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS54207.2022.9789803.

PIVOLUSKA, Matej a Martin PLESCH. Implementation of quantum compression on IBM quantum computers. Nature Scientific Reports. USA: NATURE PUBLISHING GROUP, 2022, roč. 12, č. 1, s. 5841-5849. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-022-09881-8.

NĚMCOVÁ, Petra, Jana HOZZOVÁ a Jiří FILIPOVIČ. Improving ligand transport trajectory within flexible receptor in CaverDock. Online. In SAC '22: Proceedings of the 37th ACM/SIGAPP Symposium on Applied Computing. USA: Association for Computing Machinery, 2022, s. 619-626. ISBN 978-1-4503-8713-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3477314.3506988.

DOSEDLA, Martin, Zdeněk HODIS, Martina JANČOVÁ, Jiří LEDVINKA, Leni LVOVSKÁ, Kamil MALINKA, Darina MÍSAŘOVÁ, Pavla PITNEROVÁ, Vladimír SCHINDLER, Vojtěch STANĚK a Libuše VODOVÁ. Integrace technologie 3D tisku do výuky na základních a středních školách. Ověřená metodika. Brno: Masarykova univerzita, 2022. ISBN 978-80-280-0279-4.

DOSEDLA, Martin, Zdeněk HODIS, Martina JANČOVÁ, Jiří LEDVINKA, Leni LVOVSKÁ, Kamil MALINKA, Darina MÍSAŘOVÁ, Pavla PITNEROVÁ, Vladimír SCHINDLER, Vojtěch STANĚK, Libuše VODOVÁ a Tomáš STAUDEK. Integrace technologie 3D tisku do výuky na základních a středních školách. Ověřená metodika. 2022.

DOSEDLA, Martin, Zdeněk HODIS, Martina JANČOVÁ, Jiří LEDVINKA, Leni LVOVSKÁ, Kamil MALINKA, Darina MÍSAŘOVÁ, Pavla PITNEROVÁ, Vladimír SCHINDLER, Vojtěch STANĚK, Libuše VODOVÁ a Tomáš STAUDEK. Integrace technologie 3D tisku do výuky na základních a středních školách. Ověřená metodika. 2022.

DOSTÁL, Otto, Karel SLAVÍČEK, Vladimír SCHINDLER, Miloslav FILKA, David GRENAR, Martin KYSELÁK a Jiří VÁVRA. Kaskádní zapojení sady PM vláknových senzorů v DWDM rastru 50GHz. 2022.

TOVARŇÁK, Daniel, Martin HAMERNÍK a Vít RUSŇÁK. Kolaborativní prostředí pro členy bezpečnostních týmů. 2022.

DOSTÁL, Otto, Karel SLAVÍČEK, Aleš ROČEK, Martin KYSELÁK, Jiří VÁVRA, Jan MASCHKE, David GRENAR a Milan ČUCKA. Kombinovaná jednotka postavená na PM vláknovém senzoru a FGB. 2022.

OĽHA, Jaroslav, Terézia SLANINÁKOVÁ, Martin GENDIAR, Matej ANTOL a Vlastislav DOHNAL. Learned Indexing in Proteins: Extended Work on Substituting Complex Distance Calculations with Embedding and Clustering Techniques. arXiv, 2022. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48550/ARXIV.2208.08910.

OĽHA, Jaroslav, Terézia SLANINÁKOVÁ, Martin GENDIAR, Matej ANTOL a Vlastislav DOHNAL. Learned Indexing in Proteins: Substituting Complex Distance Calculations with Embedding and Clustering Techniques. In Tomáš Skopal, Fabrizio Falchi, Jakub Lokoč, Maria Luisa Sapino, Ilaria Bartolini, Marco Patella. Similarity Search and Applications, 15th International Conference, SISAP 2022, Bologna, Italy, October 5–7, 2022, Proceedings. 1. vyd. Cham: Springer Cham, 2022, s. 274-282. ISBN 978-3-031-17848-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-17849-8_22.

SPIŠAKOVÁ, Viktória, Adrián ROŠINEC, Lukáš HEJTMÁNEK a Matej ANTOL. Managed Kubernetes — Next Gen Academic Infrastructure? In EGI Conference 2022. 2022.

VOSTOUPAL, Jakub, Pavel LOUTOCKÝ, Kamil MALINKA, František KASL, Anna BLECHOVÁ, Andrej KRIŠTOFÍK, Jan KLEINER, Lukáš POHANKA, Juraj SZABÓ, Václav STUPKA, Alena SAYDUEVA KNAPOVÁ, Vladimír ROHEL, Pavel HRABĚ, Petr MIENCIL, Radan BŘEZA a Petr DUŠEK. Metodika programu odpovědného hlášení kyberbezpečnostních zranitelností. 2022, 80 s.

JAVORNÍK, Michal a Martin HUSÁK. Mission-centric Decision Support in Cybersecurity via Bayesian Privilege Attack Graph. Engineering Reports. John Wiley & Sons, Inc, 2022, roč. 4, č. 12, s. "e12538", 25 s. ISSN 2577-8196. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/eng2.12538.

TOVARŇÁK, Daniel, Michal ČECH, Dušan TICHÝ a Vojtěch DOHNAL. ObservableDB: An Inverted Index for Graph-Based Traversal of Cyber Threat Intelligence. Online. In Varga, Pal, et al. Proceedings of the IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium 2022. USA: IEEE, 2022, s. 1-4. ISBN 978-1-6654-0601-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS54207.2022.9789882.

ČEGAN, Jakub, Daniel TOVARŇÁK, Tomáš PLESNÍK, Martin KEPRT a Milan PERNICA. Organizační, technický a právní model sdíleného SOC. 2022.

ČEGAN, Jakub, Martin LEBEDA, Vojtěch HAMERSKÝ, Zdeněk FORMAN, Roman VESELÝ, Robert SCHINDLER, Jaromír EMMER a Kristýna STYBLÍKOVÁ. Platforma pro realizaci kyberbezpečnostních kurzů. 2022.

PORTEŠOVÁ, Šárka, Eva NOVÁKOVÁ, Růžena BLAŽKOVÁ, Michal JABŮREK, Ondřej STRAKA, Michal RŮŽIČKA, Matěj SMETANA, Jaroslav TOČÍK, Jana UNČOVSKÁ, Kateřina KREPSOVÁ, Ondřej DVOŘÁK, Ondřej VORÁČ, Jan KOTTMAN, Zdeněk NOVÁK, Petra BUŠKOVÁ, Jindřiška SVOBODOVÁ, Eva MALACHOVÁ a Tereza HRSTKOVÁ. Podporujeme nadané prvňáčky. 2022.

FIRC, Anton a Kamil MALINKA. Practical lessons of (deep)faking human speech. In Sborník příspěvků z 54. konference EurOpen.CZ, 28.5.-1.6.2022. 2022, s. 161-172. ISBN 978-80-86583-34-1.

SCHINDLER, Ondřej, Tomáš RAČEK a Radka SVOBODOVÁ. Prediction of QM-like partial atomic charges for alphafold. In XXII. Workshop of biophysical chemists and electrochemists. 2022. ISBN 978-80-280-0087-5.

VYKOPAL, Jan, Valdemar ŠVÁBENSKÝ, Pavel ŠEDA a Pavel ČELEDA. Preventing Cheating in Hands-on Lab Assignments. Online. In Proceedings of the 53rd ACM Technical Symposium on Computer Science Education (SIGCSE '22). New York, NY, USA: ACM, 2022, s. 78-84. ISBN 978-1-4503-9070-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3478431.3499420.

TRAPL, Dalibor, MArtin KRUPIČKA, Vladimír VIŠŇOVSKÝ, Jana HOZZOVÁ, Jaroslav OĽHA, Aleš KŘENEK a Vojtěch SPIWOK. Property Map Collective Variable as a Useful Tool for a Force Field Correction. Journal of Chemical Information and Modeling. American Chemical Society, 2022, roč. 62, č. 3, s. 567-576. ISSN 1549-9596. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jcim.1c00651.

PARDY, Filip, Jakub HYNŠT, Dana FIALOVÁ, Kristýna BRZOBOHATÁ, Lukáš HEJTMÁNEK a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Reconstructing of the genome of Gregor Johann Mendel using state-of-the-art molecular and bioinformatics tools. In Mendel Genetics Conference 2022. 2022.

VOSTOUPAL, Jakub, Pavel LOUTOCKÝ, Kamil MALINKA, František KASL, Anna BLECHOVÁ, Andrej KRIŠTOFÍK, Jan KLEINER, Lukáš POHANKA, Juraj SZABÓ, Václav STUPKA, Alena SAYDUEVA KNAPOVÁ, Vladimír ROHEL, Pavel HRABĚ, Petr MIENCIL, Radan BŘEZA a Petr DUŠEK. Sada metodických, organizačních a právních nástrojů pro realizaci procedur odpovědného hlášení kyberbezpečnostních zranitelností a poskytnutí relevantních vzorových dokumentů (pravidla a podmínky RVDP, poskytnutí detailních vzorových podkladů, dokumentů atp. se zaměřením na soukromou i veřejnou správu vč. popisu relevantních parametrů). 2022, 58 s.

KOLOUCH, Jan, Tomáš PLESNÍK a Radovan IGLIAR. Security Operations Center (SOC) aneb nepřeceňujte jeden článek systému (část I.). Data Security Management. Praha: TATE International s.r.o., 2022, XXVI, č. 2, s. 32-37. ISSN 1211-8737.

KOLOUCH, Jan, Tomáš PLESNÍK, Radovan IGLIAR a Andrea KROPÁČOVÁ. Security Operations Center (SOC) aneb nepřeceňujte jeden článek systému (část II.). Data Security Management. Praha: TATE International s.r.o., 2022, XXVI, č. 3, s. 14-20. ISSN 1211-8737.

PLESNÍK, Tomáš, Jan KOLOUCH, Radovan IGLIAR a Andrea KROPÁČOVÁ. Security Operations Center (SOC) aneb nepřeceňujte jeden článek systému (část III.). Data Security Management. Praha: TATE International s.r.o., 2022, XXVI, č. 4, s. 24-30. ISSN 1211-8737.

RAI, Ashutosh, Matej PIVOLUSKA, Souradeep SASMAL, Manik BANIK, Sibasish GHOSH a Martin PLESCH. Self-testing quantum states via nonmaximal violation in Hardy's test of nonlocality. PHYSICAL REVIEW A. UNITED STATES: AMER PHYSICAL SOC, 2022, roč. 105, č. 5, s. 1-8. ISSN 2469-9926. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevA.105.052227.

PEREŠÍNI, Martin, Ivan HOMOLIAK, Kamil MALINKA, Federico Matteo BENČIĆ a Tomáš HLADKÝ. Simulations of DAG-based Blockchain Protocols and Attacks on the PHANTOM Protocol via Transaction Selection Strategies. In Sborník příspěvků z 54. konference EurOpen.CZ, 28.5.-1.6.2022. 2022, s. 173-184. ISBN 978-80-86583-34-1.

ČELEDA, Pavel, Igor IGNÁC, Boris JADUŠ, Erik KOČAMBA, Lukáš MAJDAN, Dominik PILÁR, Pavel ŠEDA a Jan VYKOPAL. Software inteligentního asistenta pro hraní bezpečnostních her. 2022.

TOVARŇÁK, Daniel a Matúš RAČEK. Software pro integrovaný datový pohled na chráněnou infrastrukturu. 2022.

TOVARŇÁK, Daniel, Vojtěch DOHNAL, Dušan TICHÝ, Benjamin KRÁL a Martin MACHÁČ. Software pro podporu orchestrace bezpečnosti a řízení životního cyklu hrozeb. 2022.

ANDONIADIS, Kamil, Pavel ČELEDA, Karolína DOČKALOVÁ BURSKÁ, Igor IGNÁC, Martin JUHÁS, Erik KOČAMBA, Radek OŠLEJŠEK, Juraj PALUBA, Dominik PILÁR, Pavel ŠEDA, Michal URBAN a Jan VYKOPAL. Software pro přípravu a realizaci bezpečnostních her. 2022.

ČELEDA, Pavel, Karolína DOČKALOVÁ BURSKÁ, Igor IGNÁC, Martin JUHÁS, Erik KOČAMBA, Radek OŠLEJŠEK, Dominik PILÁR, Pavel ŠEDA a Jan VYKOPAL. Software pro sběr a vyhodnocení dat z bezpečnostních her. 2022.

HUSÁK, Martin a Milan ČERMÁK. SoK: Applications and Challenges of using Recommender Systems in Cybersecurity Incident Handling and Response. Online. In The 17th International Conference on Availability, Reliability and Security (ARES 2022). Vienna: ACM, 2022, s. "25:1"-"25:10", 10 s. ISBN 978-1-4503-9670-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3538969.3538981.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar, Jan VYKOPAL, Pavel ČELEDA, Kristián TKÁČIK a Daniel POPOVIČ. Student Assessment in Cybersecurity Training Automated by Pattern Mining and Clustering. Education and Information Technologies. Springer, 2022, roč. 27, č. 7, s. 9231-9262. ISSN 1360-2357. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10639-022-10954-4.

FREXIA, Francesca, Cecilia MASCIA, Rudolf WITTNER, Markus PLASS, Heimo MÜLLER, Jörg GEIGER a Petr HOLUB. The Common Provenance Model: Capturing Distributed Provenance in Life Sciences Processes. In Challenges of Trustable AI and Added-Value on Health. 2022. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3233/SHTI220489.

MIHÁLIKOVÁ, Ivana, Matej PIVOLUSKA, Martin PLESCH, Martin FRIÁK, Daniel NAGAJ a Mojmír ŠOB. The Cost of Improving the Precision of the Variational Quantum Eigensolver for Quantum Chemistry. Nanomaterials. London: MDPI, 2022, roč. 12, č. 2, s. 1-22. ISSN 2079-4991. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/nano12020243.

FIRC, Anton a Kamil MALINKA. The dawn of a text-dependent society: deepfakes as a threat to speech verification systems. Online. In SAC '22: Proceedings of the 37th ACM/SIGAPP Symposium on Applied Computing. Association for Computing Machinery, 2022, s. 1646--1655. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3477314.3507013.

DUDOVÁ, Zdenka, Nathalie CONTE, Jeremy MASON, Dalibor STUCHLÍK, Radim PEŠA, Csaba HALMAGYI, Zinaida PEROVA, Abayomi MOSAKU, Ross THORNE, Alex FOLLETTE, Ľuboslav PIVARČ, Radim ŠAŠINKA, Muhammad USMAN, Steven NEUHAUSER, Dale A BEGLEY, Debra M KRUPKE, Massimiliano FRASSÀ, Alessandro FIORI, Riccardo CORSI, Luca VEZZADINI, Claudio ISELLA, Andrea BERTOTTI, Carol BULT, Helen PARKINSON, Enzo MEDICO, Terrence MEEHAN a Aleš KŘENEK. The EurOPDX Data Portal: an open platform for patient-derived cancer xenograft data sharing and visualization. BMC Genomics. BioMed Central, 2022, roč. 23, č. 1, s. 1-11. ISSN 1471-2164. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12864-022-08367-1.

FILIPOVIČ, Jiří, Jana HOZZOVÁ, Amin NEZARAT, Jaroslav OĽHA a Filip PETROVIČ. Using hardware performance counters to speed up autotuning convergence on GPUs. Journal of Parallel and Distributed Computing. Elsevier, 2022, roč. 160, February, s. 16-35. ISSN 0743-7315. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jpdc.2021.10.003.

DOSTÁL, Otto, Jiří VÁVRA, Martin KYSELÁK, Karel SLAVÍČEK, Vladimír SCHINDLER a David GRENAR. Vyhodnocovací elektronika včetně řídícího SW. 2022.

VODOVÁ, Libuše, Kamil MALINKA a Martina JANČOVÁ. Vytváření výukových modelů pomocí technologie 3D tisku. In Mezinárodní konference EDUCO 2022, XVII.ročník. 2022.

VODOVÁ, Libuše, Kamil MALINKA a Martina JANČOVÁ. Výtvaření výukových modelů pomocí technologie 3D tisku. In Mezinárodní konference EDUCO. 2022.

VODOVÁ, Libuše, Martina JANČOVÁ, Kamil MALINKA, Lenka SOBKOVÁ a Ivo BEDNÁŘ. 3D tisk jako příležitost pro vytváření výukových modelů pro výuku přírodopisu a biologie. In Trendy v didaktice biologie. 2022.

VODOVÁ, Libuše, Martina JANČOVÁ, Kamil MALINKA, Lenka SOBKOVÁ a Ivo BEDNÁŘ. 3D tisk jako příležitost pro vytváření výukových modelů pro výuku přírodopisu a biologie. 2022.

REIHS, Robert, Rumyana PROYNOVA, Saher MAQSOOD, Maxmilian ATAIAN, Martin LABLANS, Philip R. QUINLAN, Emma LAWRENCE, Erinna BOWMAN, Esther VAN ENCKEVORT, Dominik František BUČÍK, Heimo MÜLLER a Petr HOLUB. BBMRI-ERIC Negotiator: Implementing Efficient Access to Biobanks. Biopreservation and Biobanking. NEW ROCHELLE: MARY ANN LIEBERT, INC, 2021, 8 s. ISSN 1947-5535. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1089/bio.2020.0144.

LÍŠKA, Martin, Dávid LUPTÁK, Vít STARÝ NOVOTNÝ, Michal RŮŽIČKA, Boris SHMINKE, Petr SOJKA, Michal ŠTEFÁNIK a Makarius WENZEL. CICM'21 Systems Entries. Online. In 978-3-030-81097-9. INTELLIGENT COMPUTER MATHEMATICS (CICM 2021). CHAM: SPRINGER INTERNATIONAL PUBLISHING AG, 2021, s. 245-248. ISBN 978-3-030-81096-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-81097-9_20.

TOVARŇÁK, Daniel, Matúš RAČEK a Petr VELAN. Cloud Native Data Platform for Network Telemetry and Analytics. Online. In Müge Sayıt, Stuart Clayman. 17th International Conference on Network and Service Management. Izmir, Turkey (Virtual): IFIP Open Digital Library, IEEE Xplore, 2021, s. 394-396. ISBN 978-3-903176-36-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.23919/CNSM52442.2021.9615568.

VIŠŇOVSKÝ, Vladimír, Viktória SPIŠAKOVÁ, Jana HOZZOVÁ, Jaroslav OĽHA, Dalibor TRAPL, Vojtěch SPIWOK, Lukáš HEJTMÁNEK a Aleš KŘENEK. Complex simulation workflows in containerized high-performance environment. In Armenia S., Geril P. Proc. ESM 2021. Brusel: EUROSIS, 2021, s. 42-45. ISBN 978-94-92859-18-1.

OŠLEJŠEK, Radek, Vít RUSŇÁK, Karolína DOČKALOVÁ BURSKÁ, Valdemar ŠVÁBENSKÝ, Jan VYKOPAL a Jakub ČEGAN. Conceptual Model of Visual Analytics for Hands-on Cybersecurity Training. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics. 2021, roč. 27, č. 8, s. 3425-3437. ISSN 1077-2626. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/TVCG.2020.2977336.

MALINKA, Kamil a Vladimír SCHINDLER. Current Challenges in the Educational Usage of 3D Printing in Primary and Secondary Schools. Online. In Theo Bastiaens. Proceedings of EdMedia + Innovate Learning. United States: Association for the Advancement of Computing in Education (AACE), 2021, s. 88-96. ISBN 978-1-939797-56-8.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar, Pavel ČELEDA, Jan VYKOPAL a Silvia BRIŠÁKOVÁ. Cybersecurity Knowledge and Skills Taught in Capture the Flag Challenges. Computers & Security. Elsevier, 2021, roč. 102, č. 102154, s. 1-14. ISSN 0167-4048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.cose.2020.102154.

SLANINÁKOVÁ, Terézia, Matej ANTOL, Jaroslav OĽHA a Vlastislav DOHNAL. Data-driven Learned Metric Index: an Unsupervised Approach. In 14th International Conference on Similarity Search and Applications (SISAP 2021). Cham: Springer, 2021, s. 81-94. ISBN 978-3-030-89656-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-89657-7_7.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar, Jan VYKOPAL, Pavel ŠEDA a Pavel ČELEDA. Dataset of Shell Commands Used by Participants of Hands-on Cybersecurity Training. Data in Brief. Elsevier, 2021, roč. 38, September, s. 1-9. ISSN 2352-3409. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2021.107398.

JIMÉNEZ-MORENO, Amaya, David STŘELÁK, Jiří FILIPOVIČ, José María CARAZO a Carlos Óscar S. SORZANO. DeepAlign, a 3D Alignment Method based on Regionalized Deep Learning for Cryo-EM. Journal of Structural Biology. San Diego,USA: Academic Press, 2021, roč. 213, č. 2, s. "107712", 14 s. ISSN 1047-8477. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jsb.2021.107712.

RAI, A., Matej PIVOLUSKA, Martin PLESCH, S. SASMAL, M. BANIK a S. GHOSH. Device-independent bounds from Cabello's nonlocality argument. Physical review A. New York: The American Physical Society, 2021, roč. 103, č. 6, s. 1-7. ISSN 2469-9926. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevA.103.062219.

PITNER, Tomáš, Otto DOSTÁL, Otto DOSTÁL, Pavel LOUTOCKÝ, František KASL a Pavel ANDRES. Dílčí projekt „CovidCareShare – Bezpečné sdílení medicínských dat v období pandemie Covid19“ Výsledek V1 – Architektura systému pro bezpečné sdílení medicínských dat. Brno: Neuveden, 2021, 20 s. Dílčí projekt CovidCareShare.

PITNER, Tomáš, Otto DOSTÁL, Otto DOSTÁL, Pavel LOUTOCKÝ, František KASL a Pavel ANDRES. Dílčí projekt „CovidCareShare – Bezpečné sdílení medicínských dat v období pandemie Covid19“ Výsledek V2 – Studie proveditelnosti. Brno: Neuveden, 2021, 8 s. Dílčí projekt CovidCareShare.

WITTNER, Rudolf, Jörg GEIGER, Cecilia MASCIA, Francesca FREXIA, Heimo MULLER a Petr HOLUB. Enabling Trustworthy and Traceable Research by Non-Repudiable Opaque Provenance in a Distributed Environment. In Provenance Week 2021; Workshop on Provenance for Transparent Research. 2021.

ŠPAČEK, Stanislav, Daniel TOVARŇÁK a Pavel ČELEDA. Enriching DNS Flows with Host-Based Events to Bypass Future Protocol Encryption. In Audun Jøsang, Lynn Futcher, Janne Hagen. ICT Systems Security and Privacy Protection. 1. vyd. Oslo: Springer, 2021, s. 302-316. ISBN 978-3-030-78119-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-78120-0_20.

ČEGAN, Jakub, Pavla VIZVÁRY, Vojtěch HAMERSKÝ, Natálie VELECKÁ a Vladimír ROHEL. Framework a postupy pro vzdělávání CSIRT týmů. 2021.

TOVARŇÁK, Daniel, Lukáš SADLEK a Pavel ČELEDA. Graph-Based CPE Matching for Identification of Vulnerable Asset Configurations. Online. In 2021 IFIP/IEEE International Symposium on Integrated Network Management (IM 2021). Washington DC, USA: IEEE, 2021, s. 986-991. ISBN 978-3-903176-32-4.

JIRSÍK, Tomáš a Petr VELAN. Host Behavior in Computer Network: One-Year Study. IEEE Transactions on Network and Service Management. 2021, roč. 18, č. 1, s. 822-838. ISSN 1932-4537. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/TNSM.2020.3036528.

DODA, M., Matej PIVOLUSKA a Martin PLESCH. Choice of mutually unbiased bases and outcome labeling affecting measurement outcome secrecy. Physical review A. New York: The American Physical Society, 2021, roč. 103, č. 3, s. 032206-32213. ISSN 2469-9926. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevA.103.032206.

S. SORZANO, Carlos Oscar, Amaya JIMÉNEZ-MORENO, David MALUENDA, Erney RAMÍREZ-APORTELA, Marta MARTÍNEZ, Ana CUERVO, Roberto MELERO, Jose Javier CONESA, Ruben SÁNCHEZ-GARCÍA, David STŘELÁK, Jiří FILIPOVIČ, Estrella FERNÁNDEZ-GIMÉNEZ, Federico DE ISIDRO-GÓMEZ, David HERREROS, Pablo CONESA, Laura DEL CAÑO, Yunior FONSECA, Jorge JIMÉNEZ DE LA MORENA, Jose Ramon MACÍAS, Patricia LOSANA, Roberto MARABINI a Jose-Maria CARAZO. Image Processing in Cryo-Electron Microscopy of Single Particles: The Power of Combining Methods. In Structural Proteomics. Clifton, N.J.: Springer US, 2021, s. 257-289. Methods in Molecular Biology. ISBN 978-1-0716-1405-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-1406-8_13.

PITNER, Tomáš, Karel SLAVÍČEK, Michal RANDÁK, Lukáš GROLIG, Bacem MBAREK, Petr ČÍKA, Martin ŠTŮSEK, Petr ILGNER, Marek SIKORA, P. HAVELKA, M. BEDNÁŘ a Z. POSPÍŠIL. Implementace komunikačních rozhraní v monitorovacích systémech přenosových soustav. 2021.

DOSTÁL, Otto, Karel SLAVÍČEK, Jaroslav LEDVINKA, COMIMPEX spol. s.r.o. DUŠAN PAROULEK, COMIMPEX spol. s.r.o. MICHAL STRNAD, Mediatrade s.r.o. PAVEL TÁBORSKÝ a VŠB-TUO MARTIN AUGUSTÝNEK. Integrovaný aktivní monitorovací systém pro pacienty s externími kardiostimulátory. 2021.

WITTNER, Rudolf, Petr HOLUB, Heimo MÜLLER, Joerg GEIGER, Carole GOBLE, Stian SOILAND-REYES, Luca PIREDDU, Francesca FREXIA, Cecilia MASCIA, Elliot FAIRWEATHER, Jason R SWEDLOW, Josh MOORE, Caterina STRAMBIO, David GRUNWALD a Hiroki NAKAE. ISO 23494: Biotechnology – Provenance Information Model for Biological Specimen And Data. In Lecture Notes in Computer Science. Cham: Springer, 2021, s. 222-225. ISBN 978-3-030-80959-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-80960-7_16.

PETROVIČ, Filip, Jiří FILIPOVIČ, David STŘELÁK, Jana HOZZOVÁ a Richard TREMBECKÝ. Kernel Tuning Toolkit 2.0. 2021.

ČEGAN, Jakub, Vladimír ROHEL, Milan ČERMÁK, Petr VELAN, Vojtěch HAMERSKÝ, Natálie VELECKÁ, Martin LEBEDA, Tomáš KACVINSKÝ a Zdeněk VYDRA. Kyberbezpečnost lékařských přístrojů. 2021.

ANTOL, Matej, Jaroslav OĽHA, Terézia SLANINÁKOVÁ a Vlastislav DOHNAL. Learned metric index - proposition of learned indexing for unstructured data. Information Systems. Elsevier, 2021, roč. 100, č. 101774, s. 1-12. ISSN 0306-4379. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.is.2021.101774.

BEÁTA SZABÓ-TAKÁCS, TAMÁS TAKÁCS a Aleš ROČEK. MeteoRead: Client Software for Inserting Observed Atmospheric Data into MySQL Database and Downloading them into Different File Format. Journal of Software Engineering and Applications. 2021, roč. 14, č. 10. ISSN 1945-3116. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.4236/jsea.2021.1410033.

ANTOL, Matej, Miriama JÁNOŠOVÁ a Vlastislav DOHNAL. Metric hull as similarity-aware operator for representing unstructured data. Pattern Recognition Letters. Amsterdam: Elsevier, 2021, roč. 149, September 2021, s. 91-98. ISSN 0167-8655. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.patrec.2021.05.011.

NEUMANN, S.P., T. SCHEIDL, M. SELIMOVIC, Matej PIVOLUSKA, B. LIU, M. BOHMANN a R. URSIN. Model for optimizing quantum key distribution with continuous-wave pumped entangled-photon sources. Physical review A. New York: The American Physical Society, 2021, roč. 104, č. 2, s. 022406-22416. ISSN 2469-9926. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevA.104.022406.

FAIRWEATHER, Elliot, Rudolf WITTNER, Martin CHAPMAN, Petr HOLUB a Vasa CURCIN. Non-repudiable provenance for clinical decision support systems. In Lecture Notes in Computer Science. Cham: Springer, 2021, s. 165-182. ISBN 978-3-030-80959-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-80960-7_10.

HU, X.M., C. ZHANG, Y. GUO, F.X. WANG, W.B. XING, C.X. HUANG, B.H. LIU, Y.F. HUANG, C.F. LI, G.C. GUO, X.Q. GAO, Matej PIVOLUSKA a M. HUBER. Pathways for Entanglement-Based Quantum Communication in the Face of High Noise. Physical Review Letters. COLLEGE PK: The American Physical Society, 2021, roč. 127, č. 11, s. 1-7. ISSN 0031-9007. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevLett.127.110505.

HORA, Tomáš, Jiří ČECH a Karel SLAVÍČEK. Prototyp IoT senzoru koncentrace CO2. 2021.

DODA, M., M. HUBER, G. MURTA, Matej PIVOLUSKA, Martin PLESCH a C. VLACHOU. Quantum Key Distribution Overcoming Extreme Noise: Simultaneous Subspace Coding Using High-Dimensional Entanglement. PHYSICAL REVIEW APPLIED. COLLEGE PK: AMER PHYSICAL SOC, 2021, roč. 15, č. 3, s. 034003-34017. ISSN 2331-7019. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevApplied.15.034003.

ŠEDA, Pavel, Jan VYKOPAL, Valdemar ŠVÁBENSKÝ a Pavel ČELEDA. Reinforcing Cybersecurity Hands-on Training With Adaptive Learning. Online. In 2021 IEEE Frontiers in Education Conference (FIE). New York, NY, USA: IEEE, 2021, s. 1-9. ISBN 978-1-6654-3851-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/FIE49875.2021.9637252.

VYKOPAL, Jan, Pavel ČELEDA, Pavel ŠEDA, Valdemar ŠVÁBENSKÝ a Daniel TOVARŇÁK. Scalable Learning Environments for Teaching Cybersecurity Hands-on. Online. In 2021 IEEE Frontiers in Education Conference (FIE). New York, NY, USA: IEEE, 2021, s. 1-9. ISBN 978-1-6654-3851-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/FIE49875.2021.9637180.

RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, José Gaspar, Ondřej VÁVRA, Sérgio Manuel MARQUES, Jiří FILIPOVIČ, David BEDNÁŘ a Jiří DAMBORSKÝ. Screening of world approved drugs against highly dynamical spike glycoprotein of SARS-CoV-2 using CaverDock and machine learning. Computational and Structural Biotechnology Journal. Amsterdam: Elsevier, 2021, roč. 19, May, s. 3187-3197. ISSN 2001-0370. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.csbj.2021.05.043.

HOZZOVÁ, Jana, Jiří FILIPOVIČ, Amin NEZARAT, Jaroslav OĽHA a Filip PETROVIČ. Searching CUDA code autotuning spaces with hardware performance counters: data from benchmarks running on various GPU architectures. Data in Brief. Elsevier, 2021, roč. 39, December, s. 1-12. ISSN 2352-3409. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2021.107631.

PIVOLUSKA, Matej, Martin PLESCH, M. FARKAS, Natália RUŽIČKOVÁ, C. FLEGEL, N.H. VALENCIA, W. MCCUTCHEON, M. MALIK a EA AGUILAR. Semi-device-independent random number generation with flexible assumptions. NPJ QUANTUM INFORMATION. BERLIN: NATURE RESEARCH, 2021, roč. 7, č. 1, s. 1-12. ISSN 2056-6387. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41534-021-00387-1.

MÍČ, Vladimír, Tomáš RAČEK, Aleš KŘENEK a Pavel ZEZULA. Similarity Search for an Extreme Application: Experience and Implementation. In Nora Reyes, Richard Connor, Nils Kriege, Daniyal Kazempour, Ilaria Bartolini, Erich Schubert, Jian-Jia Chen. Similarity Search and Applications: 14th International Conference, SISAP 2021, Dortmund, Germany, September 29 - October 1, 2021, Proceedings. Cham: Springer, 2021, s. 265-279. ISBN 978-3-030-89656-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-89657-7_20.

HOZZOVÁ, Jana, Ondřej VÁVRA, David BEDNÁŘ a Jiří FILIPOVIČ. Simulation of Ligand Transport in Receptors Using CaverDock. In Flavio Ballante. Protein-Ligand Interactions and Drug Design. New York: Humana, New York, NY, 2021, s. 105-124. Methods in Molecular Biology, vol 2266. ISBN 978-1-0716-1208-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-1209-5_6.

PITNER, Tomáš, Petr ČÍKA, Martin ŠTŮSEK, Petr ILGNER, Marek SIKORA, Karel SLAVÍČEK, Michal RANDÁK, Bacem MBAREK, Lukáš GROLIG, Petr HAVELKA, Michal BEDNÁŘ a Zdeněk POSPÍŠIL. Software pro generování datového provozu pro monitorovací a řídicí systémy TSO na protokolech ICCP-TASE.2 a IEC 60870-5-101. 2021.

ČELEDA, Pavel, Andrej TOMČI, Daniel IĽKOVIČ, Martin MADZIA, Jana ZIKOVÁ, Aleš SMRČKA, Tomáš FIEDOR, Martin HRUŠKA, Martin ŠVÉDA a Lubomír POSPÍŠIL. Software pro měření a vyhodnocení výkonnostních parametrů. 2021.

VELAN, Petr, Petr ŠPRINGL, Jan FRÜHBAUER, Tomáš JÁNSKÝ a Boris PARÁK. Software pro správu a řízení měření v cloudovém prostředí. 2021.

ČERMÁK, Milan a Pavel ČELEDA. Stream-Based IP Flow Analysis. Online. In Toufik Ahmed, Olivier Festor, Yacine Ghamri-Doudane, Joon-Myung Kang, Alberto E. Schaeffer-Filho, Radu State, Burkhard Stiller. IFIP/IEEE International Symposium on Integrated Network Management, IM 2021. Bordeaux, France: IFIP Open Digital Library, 2021, s. 736-741. ISBN 978-3-903176-32-4.

HUSÁK, Martin, Martin LAŠTOVIČKA a Daniel TOVARŇÁK. System for Continuous Collection of Contextual Information for Network Security Management and Incident Handling. Online. In ARES 2021: The 16th International Conference on Availability, Reliability and Security. Virtual Event: Association for Computing Machinery, 2021, s. 1-8. ISBN 978-1-4503-9051-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3465481.3470037.

CSABA, Virág, Jakub ČEGAN, Lieskovan TOMÁŠ a Merialdo MATTEO. The Current State of The Art and Future of European Cyber Range Ecosystem. Online. In 2021 IEEE International Conference on Cyber Security and Resilience (CSR). Rhodes: IEEE Xplore Digital Library, 2021, s. 390-395. ISBN 978-1-6654-0285-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/CSR51186.2021.9527931.

KYSELÁK, Martin, Zdeněk VYLEŽICH, Jiří VÁVRA, David GRENAR a Karel SLAVÍČEK. The Long Fiber Optic Paths to Power the Thermal Field Disturbance Sensor. Online. In Proceedings of SPIE. San Francisco: SPIE-INT SOC OPTICAL ENGINEERING, 2021, s. 1-7. ISBN 978-1-5106-4200-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1117/12.2575832.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar, Jan VYKOPAL, Daniel TOVARŇÁK a Pavel ČELEDA. Toolset for Collecting Shell Commands and Its Application in Hands-on Cybersecurity Training. Online. In 2021 IEEE Frontiers in Education Conference (FIE). New York, NY, USA: IEEE, 2021, s. 1-9. ISBN 978-1-6654-3851-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/FIE49875.2021.9637052.

GALANSKÁ, Katarína a Kamil MALINKA. Usable Security from IT Professional's Perspective. In Cyberspace 2021. 2021.

ČEGAN, Jakub, Tomáš KACVINSKÝ, Zdeněk VYDRA, Martin LEBEDA, Jakub Bartolomej KOŠUTH, Petr VELAN, Milan ČERMÁK, Andrej TOMČI, Ivo NUTÁR, Martin LAŠTOVIČKA, Natálie VELECKÁ, Pavla VIZVÁRY, Vojtěch HAMERSKÝ, Daniel KOUŘIL, Ondřej BUDAY, Martin KOTLÍK, Vladimír ROHEL, Jiří SÝKORA, Michal ZVÁNOVEC, Filip GRÉGR a Petr SLAVÍK. Virtualizované prostředí pro trénink CSIRT týmu. 2021.

MAREK, Tomáš. Vizualizace dat jako informační bariéra u nevidomých uživatelů. ProInflow. Brno: Masarykova univerzita, 2021, roč. 13, č. 2, s. 50-67. ISSN 1804-2406. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/ProIn2021-2-4.

ROČEK, Aleš, Michal JAVORNÍK, Karel SLAVÍČEK a Otto DOSTÁL. Zero Watermarking: Critical Analysis of Its Role in Current Medical Imaging. Journal of Digital Imaging. 2021, roč. 34, č. 1, s. 204-211. ISSN 0897-1889. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10278-020-00396-0.

LVOVSKÁ, Leni a Kamil MALINKA. 3D tisk a jeho uplatnění na základních a středních školách. Online. In Roman Hašek. Sborník příspěvků 10. konference Užití počítačů ve výuce matematiky. České Budějovice: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicíc, 2021, s. 94-103. ISBN 978-80-7394-906-8.

BRÁZDIL, Tomáš, David PORTEŠ, Jiří FILIPOVIČ, Jana HOZZOVÁ, Thomas EVANGELIDIS a Konstantinos TRIPSIANES. 4D-GRAPHS. 2021.

PETROVIČ, Filip, David STŘELÁK, Jana HOZZOVÁ, Jaroslav OĽHA, Richard TREMBECKÝ, Siegfried BENKNER a Jiří FILIPOVIČ. A benchmark set of highly-efficient CUDA and OpenCL kernels and its dynamic autotuning with Kernel Tuning Toolkit. Future Generation Computer Systems. Elsevier, 2020, roč. 108, July, s. 161-177. ISSN 0167-739X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.future.2020.02.069.

ČECH, Michal, Roman CHRENŠŤ, Daniel TOVARŇÁK a Tomáš PLESNÍK. Adaptér pro systém pro správu zdrojů. 2020.

KOTT, Alexander, Paul THERON, Luigi MANCINI, Edlira DUSHKU, Agostino PANICO, Martin DRAŠAR, Benoit LEBLANC, Paul LOSIEWICZ, Alessandro GUARINO, Mauno PIHELGAS a Krzysztof RZADCA. An introductory preview of Autonomous Intelligent Cyber-defense Agent reference architecture, release 2.0. The Journal of Defense Modeling and Simulation: Applications, Methodology, Technology. THOUSAND OAKS: SAGE PUBLICATIONS INC, 2020, roč. 17, č. 1, s. 51-54. ISSN 1548-5129. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1177/1548512919886163.

REBOK, Tomáš, Michal BATKO, Milan ČERMÁK, Martin DRAŠAR, Daniel TOVARŇÁK, Pavel ZEZULA, Martin MACÁK, Matúš GUOTH, Matej BABEJ, Dávid BRILLA a Martin KAŽIMÍR. ANALYZA – Datový sklad. 2020.

REBOK, Tomáš, Michal BATKO, Milan ČERMÁK, Martin DRAŠAR, Jarešová MIROSLAVA, Barbora KOZLÍKOVÁ, Kristína ZÁKOPČANOVÁ, Pavel ZEZULA, Katarína FURMANOVÁ, Marko ŘEHÁČEK, Jozef BÁTRNA a Daniel PLAKINGER. ANALYZA – Vizualizační komponenta – Visilant. 2020.

REBOK, Tomáš, Michal BATKO, Milan ČERMÁK, Barbora KOZLÍKOVÁ, Vladimír MÍČ, Filip NÁLEPA, David NOVÁK, Daniel TOVARŇÁK, Pavel ZEZULA, Jakub PESCHEL, Kasanič DENIS, Denisa ŠRÁMKOVÁ, Erik HRICIŠÁK, Vladimír LAZÁRIK a Kristián GUTIČ. ANALYZA – Výpočetní a orchestrační subsystém. 2020.

LHOTÁK, Marin, Martin DUDA, Andrea FOJTŮ, Jan HEJZL, Jan HUTAŘ, Filip KERSCH, Jana KŘÍŽOVÁ, Marek MELICHAR, Martina NEZBEDOVÁ, Miroslav PAVELKA, Eliška PAVLÁSKOVÁ, Jan POKORSKÝ, Michal PŠENIČKA, Ivana ŠLAPÁKOVÁ, Zdeněk TICHÝ, Miroslav BARTOŠEK, Jan BILWACHS, Lukáš HEJTMÁNEK, Zdeněk HRUŠKA, Václav JIROUŠEK, Pavlína KOČIŠOVÁ, Vlastimil KREJČÍŘ, Iveta LODROVÁ, Natalie OSTRÁKOVÁ, Michal RŮŽIČKA, Zdeněk VAŠEK a Petr ŽABIČKA. ARCLib. 2020.

HOMOLIAK, Ivan, Kamil MALINKA a Petr HANÁČEK. ASNM Datasets: A Collection of Network Attacks for Testing of Adversarial Classifiers and Intrusion Detectors. IEEE Access. PISCATAWAY: IEEE Xplore Digital Library, 2020, roč. 8, s. 112427-112453. ISSN 2169-3536. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ACCESS.2020.3001768.

DUDOVÁ, Zdenka, Alice HÁLOVÁ, Dalibor VALÍK a Petr HOLUB. BBMRI-CZ as a Partner for Personalized Medicine and Translational Medical Research. In RANK 2020. 2020. ISBN 978-80-87436-17-2.

HOLUB, Petr, Lukasz KOZERA, Francesco FLORINDI, Esther van ENCKEVORT, Morris SWERTZ, Robert REIHS, Andrea WUTTE, Dalibor VALÍK a Michaela Th MAYRHOFER. BBMRI-ERIC’s contributions to research and knowledge exchange on COVID-19. European Journal of Human Genetics. London: Nature Publishing Group, 2020, roč. 28, č. 6, s. 728-731. ISSN 1018-4813. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41431-020-0634-8.

VYKOPAL, Jan, Valdemar ŠVÁBENSKÝ a Ee-Chien CHANG. Benefits and Pitfalls of Using Capture The Flag Games in University Courses. Online. In Proceedings of the 51st ACM Technical Symposium on Computer Science Education (SIGCSE '20). New York, NY, USA: ACM, 2020, s. 752-758. ISBN 978-1-4503-6793-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3328778.3366893.

KYSELÁK, Martin, Jan MASCHKE, Marco PANASCI, Karel SLAVÍČEK, Otto DOSTÁL, David GRENAR, Milan ČUČKA a Miloslav FILKA. Birefringence influence on polarization changes and frequency on optical fiber. Online. In Proceedings of SPIE. online: SPIE, 2020, s. 1-13. ISBN 978-1-5106-3889-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1117/12.2573696.

FILIPOVIČ, Jiří, Ondřej VÁVRA, Jan PLHÁK, David BEDNÁŘ, Sérgio Manuel MARQUES, Jan BREZOVSKÝ, Luděk MATYSKA a Jiří DAMBORSKÝ. CaverDock: A Novel Method for the Fast Analysis of Ligand Transport. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. Los Alamitos: IEEE Computer Society, 2020, roč. 17, č. 5, s. 1625-1638. ISSN 1545-5963. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/TCBB.2019.2907492.

JIRSÍK, Tomáš a Pavel ČELEDA. Cyber Situation Awareness via IP Flow Monitoring. Online. In 2020 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium (NOMS 2020). Hungary: IEEE Xplore Digital Library, 2020, s. 1-6. ISBN 978-1-7281-4973-8.

HUSÁK, Martin, Martin ŽÁDNÍK, Václav BARTOŠ a Pavol SOKOL. Dataset of intrusion detection alerts from a sharing platform. Data in Brief. Elsevier, 2020, roč. 33, December, s. 1-12. ISSN 2352-3409. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2020.106530.

JAVORNÍK, Michal, Jana KOMÁRKOVÁ, Lukáš SADLEK a Martin HUSÁK. Decision Support for Mission-Centric Network Security Management. Online. In NOMS 2020 - 2020 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium. Budapest, Hungary: IEEE, 2020, s. 1-6. ISBN 978-1-7281-4973-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS47738.2020.9110261.

CATCHPOOLE, Daniel R, Francesco FLORINDI, Caitlin AHERN, Debra Leiolani GARCIA, Piper MULLINS, Esther Van ENCKEVORT, Andy ZAAYENGA, Michaela Th MAYRHOFER a Petr HOLUB. Expanding the BBMRI-ERIC Directory into a Global Catalogue of COVID-19–Ready Collections: A Joint Initiative of BBMRI-ERIC and ISBER. Biopreservation and Biobanking. 2020, roč. 18, č. 5, s. 479-480. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1089/bio.2020.29075.drc.

HU, Xiao-Min, WB. XING, C. ZHANG, BH. LIU, Matej PIVOLUSKA, M. HUBER, YF. HUANG, CF. LI a GC. GUO. Experimental creation of multi-photon high-dimensional layered quantum states. NPJ QUANTUM INFORMATION. BERLIN: NATURE RESEARCH, 2020, roč. 6, č. 1, s. 1-5. ISSN 2056-6387. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41534-020-00318-6.

OĽHA, Jaroslav, Jana HOZZOVÁ, Jan FOUSEK a Jiří FILIPOVIČ. Exploiting historical data: Pruning autotuning spaces and estimating the number of tuning steps. CONCURRENCY AND COMPUTATION-PRACTICE & EXPERIENCE. HOBOKEN: WILEY, 2020, roč. 32, č. 21, s. 1-15. ISSN 1532-0626. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cpe.5962.

BERAN, Michal, František HRDINA, Daniel KOUŘIL, Radek OŠLEJŠEK a Kristína ZÁKOPČANOVÁ. Exploratory Analysis of File System Metadata for Rapid Investigation of Security Incidents. Online. In 2020 IEEE Symposium on Visualization for Cyber Security (VizSec). Salt Lake City, US: IEEE, 2020, s. 11-20. ISBN 978-1-7281-8262-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/VizSec51108.2020.00008.

KŘENEK, Aleš, Jana HOZZOVÁ, Jaroslav OĽHA, Dalibor TRAPL a Vojtěch SPIWOK. Exploring Protein Folding Space with Neural Network Guided Simulations. In Alexandre Nketsa. MODELLING AND SIMULATION 2020. Brusel: EUROSIS-ETI, 2020, s. 305-309. ISBN 978-94-92859-12-9.

STŘELÁK, David, Jiří FILIPOVIČ, Amaya JIMÉNEZ-MORENO, Jose María CARAZO a Carlos Óscar SÁNCHEZ SORZANO. FlexAlign: An Accurate and Fast Algorithm for Movie Alignment in Cryo-Electron Microscopy. Electronics. Switzerland: MDPI, 2020, roč. 9, č. 6, s. 1-25. ISSN 2079-9292. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/electronics9061040.

KYSELÁK, Martin, Čestmír VLČEK, Jiří VÁVRA, Karel SLAVÍČEK a David GRENAR. Frequency Changes Due to Birefringence in the Optical Polarization Maintaining Fibre Sensor. Hyatt Regency Vancouver, Vancouver, Brit: OSA, 2020, s. 1-6. ISBN 978-1-943580-78-1.

HUSÁK, Martin. Graph-based models in prediction and projection of cyber attacks. In The 1st International Workshop on Graph-based network Security. 2020.

VALENCIA, N.H., V. SRIVASTAV, Matej PIVOLUSKA, M. HUBER, N. FRIIS, W. MCCUTCHEON a M. MALIK. High-Dimensional Pixel Entanglement: Efficient Generation and Certification. QUANTUM. WIEN: VEREIN FORDERUNG OPEN ACCESS PUBLIZIERENS QUANTENWISSENSCHAF, 2020, roč. 4, December, s. 376-394. ISSN 2521-327X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.22331/q-2020-12-24-376.

ČELEDA, Pavel, Jan VYKOPAL, Valdemar ŠVÁBENSKÝ a Karel SLAVÍČEK. KYPO4INDUSTRY: A Testbed for Teaching Cybersecurity of Industrial Control Systems. Online. In Proceedings of the 51st ACM Technical Symposium on Computer Science Education (SIGCSE '20). New York, NY, USA: ACM, 2020, s. 1026-1032. ISBN 978-1-4503-6793-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3328778.3366908.

HRUBÁ, Marika. Library advocacy ve vysokoškolské knihovně. 2020.

FRIÁK, Martin, Dušan LAGO, Nikola KOUTNÁ, David HOLEC, Tomáš REBOK a Mojmír ŠOB. Multi-phase ELAStic Aggregates (MELASA) software tool for modeling anisotropic elastic properties of lamellar composites. Computer Physics Communications. Amsterdam: Elsevier, 2020, roč. 247, FEB 2020, s. 1-9. ISSN 0010-4655. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.cpc.2019.106863.

ČELEDA, Pavel, Andrej TOMČI, Daniel IĽKOVIČ, Matěj GROMAN a Lubomír POSPÍŠIL. Nástroj pro simulaci chování průmyslových komponent. 2020.

PLESNÍK, Tomáš a Vít RUSŇÁK. Nettmap2 - Interaktivní nástroj pro zobrazení síťové topologie vizualizující data z Flowmon řešení. 2020.

LAŠTOVIČKA, Martin, Martin HUSÁK a Lukáš SADLEK. Network Monitoring and Enumerating Vulnerabilities in Large Heterogeneous Networks. Online. In NOMS 2020 - 2020 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium. Budapest, Hungary: IEEE Xplore Digital Library, 2020, s. 1-6. ISBN 978-1-7281-4973-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS47738.2020.9110394.

VELAN, Petr a Tomáš JIRSÍK. On the Impact of Flow Monitoring Configuration. Online. In 2020 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium (NOMS 2020). Budapešť: IEEE Xplore Digital Library, 2020, s. 1-7. ISBN 978-1-7281-4973-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS47738.2020.9110361.

JELÍNEK, Kamil, Jan ŠLESINGER a Michal PROCHÁZKA. Právní aspekty sdílení dat v rámci informačních technologií konceptu Smart City v dopravě a jejich dopady do práva veřejných zakázek. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, Právnická fakulta, 2020, 91 s. Edice Scientia, sv. 702. ISBN 978-80-210-9777-3.

HUSÁK, Martin a Pavel ČELEDA. Predictions of Network Attacks in Collaborative Environment. Online. In NOMS 2020 - 2020 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium. Budapest, Hungary: IEEE, 2020, s. 1-6. ISBN 978-1-7281-4973-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS47738.2020.9110472.

HUSÁK, Martin, Tomáš BAJTOŠ, Jaroslav KAŠPAR, Elias BOU-HARB a Pavel ČELEDA. Predictive Cyber Situational Awareness and Personalized Blacklisting: A Sequential Rule Mining Approach. ACM Transactions on Management Information Systems. Association for Computing Machinery, 2020, roč. 11, č. 4, s. 1-16. ISSN 2158-656X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3386250.

DUDOVÁ, Zdenka, Dalibor VALÍK, Kristína GREPLOVÁ a Alice HÁLOVÁ. Představení BBMRI-CZ jako partnera pro výzkum v oblasti translační medicíny. In 41. Imunoanalytické dny 2020. 2020. ISBN 978-80-88120-28-5.

THERON, Paul, Alexander KOTT, Martin DRAŠAR, Krzysztof RZADCA, Benoît LEBLANC, Mauno PIHELGAS, Luigi MANCINI a Fabio DE GASPARI. Reference Architecture of an Autonomous Agent for Cyber Defense of Complex Military Systems. Online. In Sushil Jajodia, George Cybenko, V.S. Subrahmanian, Vipin Swarup, Cliff Wang, Michael Wellman. Adaptive Autonomous Secure Cyber Systems. Cham: Springer International Publishing, 2020, s. 1-21. ISBN 978-3-030-33432-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-33432-1_1.

OČENÁŠ, Martin, Ivan HOMOLIAK, Kamil MALINKA a Petr HANÁČEK. Security and Encryption at Modern Databases. In 2020 4TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON CRYPTOGRAPHY, SECURITY AND PRIVACY (ICCSP 2020). NEW YORK: ASSOC COMPUTING MACHINERY, 2020, s. 19-23. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3377644.3377662.

MAREK, Jiří. Seminář Open Science. 2020.

DRAŠAR, Martin, Stephen MOSKAL, Shanchieh Jay YANG a Pavol ZAŤKO. Session-level Adversary Intent-Driven Cyberattack Simulator. Online. In Dusan Maga, Jiri Haek. DS-RT '20: Proceedings of the IEEE/ACM 24th International Symposium on Distributed Simulation and Real Time Applications. Praha: IEEE, 2020, s. 7-15. ISBN 978-1-7281-7343-6.

ČELEDA, Pavel, Kamil ANDONIADIS, Attila FARKAS, Jana ZIKOVÁ, Martin MADZIA, Matěj GROMAN, Andrej TOMČI a Lubomír POSPÍŠIL. Simulační prostředí pro testování průmyslových aplikací. 2020.

ŠPAČEK, Stanislav a Milan ŽIARAN. Software pro aplikaci reaktivních opatření na prvcích aktivní obrany počítačové sítě. 2020.

LAŠTOVIČKA, Martin, Jakub Bartolomej KOŠUTH, Daniel FILAKOVSKÝ, Antonín DUFKA a Martin HUSÁK. Software pro evidenci zranitelností v počítačové síti. 2020.

VELAN, Petr, Petr ŠPRINGL, Jan FRÜHBAUER, Tomáš JÁNSKÝ a Boris PARÁK. Software pro generování IP toků v cloudovém prostředí. 2020.

SADLEK, Lukáš, Michal JAVORNÍK a Martin HUSÁK. Software pro podporu rozhodování při řešení bezpečnostního incidentu. 2020.

VELAN, Petr, Petr ŠPRINGL, Jan FRÜHBAUER a Miloš DOLINSKÝ. Software pro sběr dat z vestavěných monitorovacích služeb cloudových platforem. 2020.

HUSÁK, Martin, Tomáš JIRSÍK a Shanchieh Jay YANG. SoK: Contemporary Issues and Challenges to Enable Cyber Situational Awareness for Network Security. Online. In Proceedings of the 15th International Conference on Availability, Reliability and Security. New York, NY, United States: Association for Computing Machinery, 2020, s. 1-10. ISBN 978-1-4503-8833-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3407023.3407062.

PLESCH, Martin, Samuel PLESNIK a Natália RUŽIČKOVÁ. The IYPT and the 'Ring Oiler' problem. European Journal of Physics. BRISTOL: Institute of Physics Publishing, 2020, roč. 41, č. 3, s. 1-12. ISSN 0143-0807. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1088/1361-6404/ab6414.

TOVARŇÁK, Daniel, Stanislav ŠPAČEK a Jan VYKOPAL. Traffic and Log Data Captured During a Cyber Defense Exercise. Data in Brief. 2020, roč. 31, August, s. 1-11. ISSN 2352-3409. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2020.105784.

LAŠTOVIČKA, Martin, Stanislav ŠPAČEK, Petr VELAN a Pavel ČELEDA. Using TLS Fingerprints for OS Identification in Encrypted Traffic. Online. In 2020 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium (NOMS 2020). Budapešť, Maďarsko: IEEE Xplore Digital Library, 2020, s. 1-6. ISBN 978-1-7281-4973-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS47738.2020.9110319.

HRUBÁ, Marika. Úvod do library advocacy pro veřejné knihovny : e-learningový kurz. Online. 2020.

MATTA, Lukáš a Martin HUSÁK. Webová aplikace pro vizualizaci bezpečnostní situace v počítačové síti. 2020.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar, Jan VYKOPAL a Pavel ČELEDA. What Are Cybersecurity Education Papers About? A Systematic Literature Review of SIGCSE and ITiCSE Conferences. Online. In Proceedings of the 51st ACM Technical Symposium on Computer Science Education (SIGCSE '20). New York, NY, USA: ACM, 2020, s. 2-8. ISBN 978-1-4503-6793-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3328778.3366816.

VODÁK, Rostislav, Michal BÍL, Tomáš SVOBODA, Zuzana KŘIVÁNKOVÁ, Jan KUBEČEK, Tomáš REBOK a Petr HLINĚNÝ. A deterministic approach for rapid identification of the critical links in networks. PLOS ONE. United States: Public Library of Science, 2019, roč. 14, č. 7, s. 1-18. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0219658.

STŘELÁK, David, Carlos Óscar S. SORZANO, José María CARAZO a Jiří FILIPOVIČ. A GPU acceleration of 3-D Fourier reconstruction in cryo-EM. The International Journal of High Performance Computing Applications. SAGE Publishing, 2019, roč. 33, č. 5, s. 948-959. ISSN 1094-3420. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1177/1094342019832958.

HUSÁK, Martin a Jaroslav KAŠPAR. AIDA Framework: Real-Time Correlation and Prediction of Intrusion Detection Alerts. Online. In Proceedings of the 14th International Conference on Availability, Reliability and Security (ARES 2019). New York: ACM, 2019, s. "81:1"-"81:8", 8 s. ISBN 978-1-4503-7164-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3339252.3340513.

TOVARŇÁK, Daniel. An Algorithm for Message Type Discovery in Unstructured Log Data. Online. In Proceedings of the 14th International Conference on Software Technologies - Volume 1: ICSOFT. Prague: SciTePress, 2019, s. 665-676. ISBN 978-989-758-379-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0007919806650676.

VELAN, Petr a Pavel ČELEDA. Application-Aware Flow Monitoring. Online. In 2019 IFIP/IEEE Symposium on Integrated Network and Service Management (IM). Washington DC, USA: IEEE, 2019, s. 701-706. ISBN 978-1-72810-618-2.

SMERIGA, Juraj a Tomáš JIRSÍK. Behavior-Aware Network Segmentation using IP Flows. Online. In Proceedings of the 14th International Conference on Availability, Reliability and Security. New York, NY, USA: ACM, 2019, s. 1-9. ISBN 978-1-4503-7164-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3339252.3339265.

REBOK, Tomáš. Big Data - overview, basic concepts and practical use in research. In Alliance4Life 5th project meeting. 2019.

BOU-HARB, Elias, Martin HUSÁK, Mourad DEBBABI a Chadi ASSI. Big Data Sanitization and Cyber Situational Awareness: A Network Telescope Perspective. IEEE Transactions on Big Data. IEEE, 2019, roč. 5, č. 4, s. 439-453. ISSN 2332-7790. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/TBDATA.2017.2723398.

ŠTOURAČ, Jan, O. VAVRA, Piia Pauliina KOKKONEN, Jiří FILIPOVIČ, Gabriela Filipa FONSECA PINTO, Andrea SCHENKMAYEROVÁ, Jiří DAMBORSKÝ a David BEDNÁŘ. Caver web: identification of tunnels and channels in proteins and analysis of ligand transport. In European Biotechnology Congress. 2019. ISSN 0168-1656. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jbiotec.2019.05.251.

ŠTOURAČ, Jan, Ondřej VÁVRA, Piia Pauliina KOKKONEN, Jiří FILIPOVIČ, José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, Jan BREZOVSKÝ, Jiří DAMBORSKÝ a David BEDNÁŘ. Caver Web 1.0: identification of tunnels and channels in proteins and analysis of ligand transport. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2019, roč. 47, W1, s. 414-422. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkz378.

VÁVRA, Ondřej, Jiří FILIPOVIČ, Jan PLHÁK, David BEDNÁŘ, Sérgio Manuel MARQUES, Jan BREZOVSKÝ, Jan ŠTOURAČ, Luděk MATYSKA a Jiří DAMBORSKÝ. CaverDock: a molecular docking-based tool to analyse ligand transport through protein tunnels and channels. Bioinformatics. Oxford: Oxford University Press, 2019, roč. 35, č. 23, s. 4986-4993. ISSN 1367-4803. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btz386.

DRAŠAR, Martin, Ádám RUMAN, Adam SKRÁŠEK a Matúš GALBA. CEP-Server: Software pro vyhodnocování a dotazování komplexních událostí v doméně ITOA. 2019.

ŠPAČEK, Stanislav, Martin LAŠTOVIČKA, Martin HORÁK a Tomáš PLESNÍK. Current Issues of Malicious Domains Blocking. Online. In 2019 IFIP/IEEE Symposium on Integrated Network and Service Management (IM). Washington DC: IEEE, 2019, s. 551-556. ISBN 978-1-7281-0618-2.

POLČÁK, Radim. Datenschutz - Tschechien. In Forgo, Helfrich, Schneider. Betrieblicher Datenschutz. 3. vyd. München: C. H. Beck, 2019, s. 1537-1543. Rechtshandbuch. ISBN 978-3-406-72579-1.

JAVORNÍK, Michal, Jana KOMÁRKOVÁ a Martin HUSÁK. Decision Support for Mission-Centric Cyber Defence. Online. In Proceedings of the 14th International Conference on Availability, Reliability and Security (ARES 2019). New York: ACM, 2019, s. "34:1"-"34:8", 8 s. ISBN 978-1-4503-7164-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3339252.3340522.

KYSELÁK, Martin, Miloslav FILKA, DAvid GRENAR, Karel SLAVÍČEK, Čestmír VLČEK, Milan ČUČKA a Jiří VÁVRA. Defensive perimeter detection by polarization change of the fibre optic signal. In SPIE Remote Sensing Technologies and Applications in Urban Environments. Online. In SPIE Remote Sensing Technologies and Applications in Urban Environments IV. 2019. Strasbourg: SPIE, 2019, s. 1-6. ISBN 978-1-5106-3017-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1117/12.2532529.

ŠPAČEK, Stanislav, Vít RUSŇÁK a Anna-Marie DOMBAJOVÁ. DNS Firewall Data Visualization. Online. In 2019 IFIP/IEEE Symposium on Integrated Network and Service Management (IM). Washington DC: IEEE, 2019, s. 743-744. ISBN 978-1-7281-0618-2.

ČELEDA, Pavel, Petr VELAN, Benjamin KRÁL a Ondřej KOZÁK. Enabling SSH Protocol Visibility in Flow Monitoring. Online. In 2019 IFIP/IEEE Symposium on Integrated Network and Service Management (IM). Washington DC, USA: IEEE, 2019, s. 569-574. ISBN 978-1-72810-618-2.

SLAVÍČEK, Karel a Otto DOSTÁL. Ensuring security of a telemedicine project in compliance with GDPR. 2019.

KOŠČÍK, Michal, Radim POLČÁK, Václav STUPKA, Matěj MYŠKA, Pavel LOUTOCKÝ a Jan ZIBNER. European ICT law - thirteenth edition. Plzeň: Vydavatelství Aleš Čeněk, 2019.

OĽHA, Jaroslav, Jana HOZZOVÁ, Jan FOUSEK a Jiří FILIPOVIČ. Exploiting historical data: pruning autotuning spaces and estimating the number of tuning steps. In Ulrich Schwardmann, Christian Boehme, Dora B. Heras, Valeria Cardellini, Emmanuel Jeannot, Antonio Salis, Claudio Schifanella, Ravi Reddy Manumachu, Dieter Schwamborn, Laura Ricci, Oh Sangyoon, Thomas Gruber, Laura Antonelli, Stephen L. Scott. Lecture Notes in Computer Science. Cham, Switzerland: Springer, Cham, 2019, s. 295-307. ISBN 978-3-030-48339-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-48340-1_23.

RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, José Gaspar, Ondřej VÁVRA, Jiří FILIPOVIČ, Jan ŠTOURAČ, David BEDNÁŘ a Jiří DAMBORSKÝ. Fast Screening of Inhibitor Binding/Unbinding using Novel Software Tool CaverDock. FRONTIERS IN CHEMISTRY. LAUSANNE: FRONTIERS MEDIA SA, 2019, roč. 7, OCT 29 2019, s. 1-14. ISSN 2296-2646. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3389/fchem.2019.00709.

MAMULA, Ondřej, David HRYCEJ, Martin STŘELEC, Tomáš PITNER, František KASL, Václav STUPKA a Filip PROCHÁZKA. Flexibilita známá a neznámá. All for Power. Praha: AF POWER agency, a.s., 2019, roč. 13, č. 4, s. 57-61. ISSN 1802-8535.

HORÁK, Martin, Václav STUPKA a Martin HUSÁK. GDPR Compliance in Cybersecurity Software: A Case Study of DPIA in Information Sharing Platform. Online. In Proceedings of the 14th International Conference on Availability, Reliability and Security (ARES 2019). New York: ACM, 2019, s. "36:1"-"36:8", 8 s. ISBN 978-1-4503-7164-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3339252.3340516.

DRAŠAR, Martin a Tomáš JIRSÍK. IT Operations Analytics: Root Cause Analysis via Complex Event Processing. Online. In 2019 IFIP/IEEE Symposium on Integrated Network and Service Management (IM). Washington DC, USA: IEEE, 2019, s. 741-742. ISBN 978-1-72810-618-2.

POLČÁK, Radim. Legitimita automatizovaného zpracování judikatury. Revue pro právo a technologie. Brno: Masarykova univerzita, 2019, roč. 10, č. 20, s. 41-63. ISSN 1804-5383. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/RPT2019-2-2.

HRUBÁ, Marika. Library advocacy– efektivní prosazování zájmů knihoven : představení e-learningového kurzu „Úvod do library advocacy pro veřejné knihovny". Praha: Sdružení knihoven ČR, 2019.

MAJOR, Juraj, František BLAHOUDEK, Jan STREJČEK, Miriama JÁNOŠOVÁ a Tatiana ZBONČÁKOVÁ. ltl3tela: LTL to Small Deterministic or Nondeterministic Emerson-Lei Automata. Online. In Yu-Fang Chen, Chih-Hong Cheng, Javier Esparza. Automated Technology for Verification and Analysis - 17th International Symposium, ATVA 2019, Taipei, Taiwan, October 28-31, 2019, Proceedings. Cham (Switzerland): Springer, 2019, s. 357-365. ISBN 978-3-030-31783-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-31784-3_21.

DOSTÁL, Otto, Karel SLAVÍČEK a Otto DOSTÁL. MeDiMed. Elektrorevue. International Society for Science and Engineering o.s., 2019, roč. 21, č. 4, s. 114-119. ISSN 1213-1539.

HORA, Tomáš, Pavel PIPERIS a Karel SLAVÍČEK. Měřící modul pro testování závislosti spektrální citlivosti fotodetektoru na prostředí. 2019.

RŮŽIČKA, Michal, Andrea MIRANDA, Lukáš HEJTMÁNEK, Zdeněk VAŠEK, Vlastimil KREJČÍŘ a Miroslav BARTOŠEK. Metodika bitové ochrany digitálních dat. 2019.

HORA, Tomáš, Pavel PIPERIS a Karel SLAVÍČEK. Modul pro měření závislosti optickcýh vlastností infračervené diody na prostředí. 2019.

ČELEDA, Pavel, Jakub ČEGAN, Martin MACHÁČ, Jana MEDKOVÁ, Ivo NUTÁR, Tomáš PLESNÍK, Daniel TOVARŇÁK a Martin VIZVÁRY. Nástroj pro zmírňování a potlačování útoků na kritickou informační infrastrukturu. 2019.

ČELEDA, Pavel, Jakub ČEGAN, Martin DRAŠAR, Ivo NUTÁR, Jiří RÁJA, Tomáš REBOK, Andrej TOMČI a Daniel TOVARŇÁK. Nástroje pro ověřování bezpečnosti SW/HW a simulaci útoků na prvky kritické informační infrastruktury. 2019.

TOVARŇÁK, Daniel a Tomáš PITNER. Normalization of Unstructured Log Data into Streams of Structured Event Objects. Online. In 2019 IFIP/IEEE Symposium on Integrated Network and Service Management (IM). Washington DC, USA: IEEE, 2019, s. 671-676. ISBN 978-1-72810-618-2.

HRUBÁ, Marika. Pozvání do kurzu Úvod do library advocacy pro veřejné knihovny. Duha. Brno: Moravská zemská knihovna, 2019, roč. 33, č. 4, s. 30-31. ISSN 0862-1985.

POLČÁK, Radim. Procedural and Institutional Backing of Transparency in Algorithmic Processing of Rights. Masaryk University Journal of Law and Technology. Brno: Masarykova univerzita, 2019, roč. 13, č. 2, s. 401-414. ISSN 1802-5943. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/MUJLT2019-2-11.

POLČÁK, Radim. Procesní aspekty elektronické identifikace dle nařízení eIDAS. Zpravodaj Jednoty českých právníků. Praha: Jednota českých právníků, 2019, roč. 29, č. 4, s. 32-51. ISSN 2464-5982.

POLČÁK, Radim. Procesní aspekty elektronické identifikace dle nařízení eIDAS. In Karlovarské právnické dny Společnost českých, německých, slovenských a rakouských právníků, z. s. XXVII. Karlovarské právnické dny. 1. vyd. Praha: Leges, 2019, s. 210-229. ISBN 978-80-7502-359-9.

LHOTÁK, Martin, Zdeněk VAŠEK a Michal RŮŽIČKA. Projekt ARCLib – vývoj open-source řešení pro dlouhodobou archivaci digitálních dokumentů pro knihovny a další paměťové instituce – aktuální stav. In LTP 2019: Nové trendy a východiská pri budovaní LTP archívov: zborník príspevkov zo 4. medzinárodnej konferencie o dlhodobej archivácii. Bratislava: Univerzitná knižnica v Bratislave, 2019, s. 53-63. ISBN 978-80-89303-77-9.

JIRSÍK, Tomáš, Štěpán TRČKA a Pavel ČELEDA. Quality of Service Forecasting with LSTM Neural Network. Online. In 2019 IFIP/IEEE Symposium on Integrated Network and Service Management (IM). Washington DC, USA: IEEE, 2019, s. 251-260. ISBN 978-1-72810-618-2.

FRIÁK, Martin, Yvonna JIRÁSKOVÁ, David HOLEC, Nikola KOUTNÁ, Ivana MIHÁLIKOVÁ, Anton SLÁVIK, Naděžda PIZÚROVÁ, Ferdinand DOBEŠ, Petr DYMÁČEK, Petr ŠESTÁK, Jan FIKAR, Sabina KOVAŘÍKOVÁ OWEIS, Monika VŠIANSKÁ, Jana PAVLŮ, Vilma BURŠÍKOVÁ, Jörg NEUGEBAUER a Mojmír ŠOB. Quantum-mechanical study of Fe-Al-based intermetallic compounds. In Intermetallics 2019. 2019. ISBN 978-3-948023-07-2.

ČERMÁK, Milan, Martin LAŠTOVIČKA a Tomáš JIRSÍK. Real-time Pattern Detection in IP Flow Data using Apache Spark. Online. In 2019 IFIP/IEEE Symposium on Integrated Network and Service Management (IM). Washington DC, USA: IEEE, 2019, s. 521-526. ISBN 978-1-7281-0618-2.

GRENAR, David, Martin KYSELÁK a Karel SLAVÍČEK. Sensor system for measuring temperature changes using alternative detection of polarization changes. Online. In SPIE Future Sensing Technologies. Tokyo: SPIE, 2019, s. 1-3. ISBN 978-1-5106-3111-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1117/12.2547319.

ČELEDA, Pavel, Jakub ČEGAN, Kamil ANDONIADIS, Michal BERAN, František HRDINA, Tomáš JIRSÍK, Daniel KOUŘIL, Michal MAZOUREK, Radek OŠLEJŠEK, Michal PROCHÁZKA, Daniel TOVARŇÁK, Petr VELAN, Martin VIZVÁRY, Vadim JANOVSKIJ a Kristína ZÁKOPČANOVÁ. Software pro detekci a analýzu napadení KII. 2019.

HUSÁK, Martin, Jaroslav KAŠPAR a Milan ŽIARAN. Software pro inteligentní analýzu bezpečnostních událostí (iABU). 2019.

ČELEDA, Pavel, Jakub ČEGAN, Karolína DOČKALOVÁ BURSKÁ, Jan DUDA, Martin HAMERNÍK, Miroslava JAREŠOVÁ, Erik KOČAMBA, Radek OŠLEJŠEK, Vít RUSŇÁK, Daniel TOVARŇÁK, Hai Duong TRAN, Jan VYKOPAL a Kristína ZÁKOPČANOVÁ. Software pro provádění bezpečnostních cvičení a školení. 2019.

ČELEDA, Pavel, Jakub ČEGAN, Kamil ANDONIADIS, Milan ČERMÁK, Jan DUDA, Vlastimil HOLER, Ľuboš HYŽÁK, Boris JADUŠ, Jakub KADAŠI, David LEŠKA, Martin MACHÁČ, Ivo NUTÁR, Radek OŠLEJŠEK, Dominik PILÁR, Tomáš PLESNÍK, Michal PROCHÁZKA, Tomáš REBOK, Vít RUSŇÁK, Miloslav STANĚK, Pavel ŠEDA, Valdemar ŠVÁBENSKÝ, Daniel TOVARŇÁK, Petr VELAN, Martin VIZVÁRY, Jan VYKOPAL a Tatiana ZBONČÁKOVÁ. Software pro simulaci obecných i kritických informačních infrastruktur. 2019.

HUSÁK, Martin, Jana KOMÁRKOVÁ, Elias BOU-HARB a Pavel ČELEDA. Survey of Attack Projection, Prediction, and Forecasting in Cyber Security. IEEE Communications Surveys & Tutorials. IEEE, 2019, roč. 21, č. 1, s. 640-660. ISSN 1553-877X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/COMST.2018.2871866.

BARTOŠ, Václav, Martin ŽÁDNÍK, Pavel KROBOT, Lukáš HUTÁK, Martin HUSÁK, Jaroslav KAŠPAR a Petr VELAN. Systém pro sdílení a analýzu bezpečnostních událostí. 2019.

VALÍK, Dalibor, Alice HÁLOVÁ, Kristína GREPLOVÁ a Zdenka DUDOVÁ. The Biobanking Research Infrastructure BBMRI-CZ as a Critical Tool to Enhance Translational Cancer Research. In XXXX. Imunoanalytické dny. 2019.

POLČÁK, Radim. The Digitization of czech Cultural Heritage amd New Forms of Information Exclusivity. In Mira T. Sundara Rajan. Intellectual Property in Central and Eastern Europe. Cambridge: Cambridge University Press, 2019, s. 195-207. Cambidge Handbook. ISBN 978-1-107-15636-4.

VELAN, Petr. The Future of Network Flow Monitoring. 2019.

BUDÍK, Pavel. The taming of Masaryk University websites. In EUNIS 2019 Trondheim. 2019.

ŠOB, Mojmír, Martin FRIÁK, Petr ŠESTÁK, Petr ŘEHÁK, Miroslav ČERNÝ, Monika VŠIANSKÁ, Jana PAVLŮ, Ivana MIHÁLIKOVÁ, Anton SLÁVIK, Martina MAZALOVÁ, Vojtěch KOPECKÝ a Nikola KOUTNÁ. THERMODYNAMIC STABILITY AND ELASTIC PROPERTIES OF Fe-Al-BASED SUPERALLOYS. In Karina Pešatová, Barbora Poláková, John Cawley, Zuzana Červenková. SUPERCOMPUTING IN SCIENCE AND ENGINEERING 2017–18. 1. vyd. Ostrava: VSB – Technical University of Ostrava, 2019, s. 106-109. ISBN 978-80-248-4289-9.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar, Jan VYKOPAL a Pavel ČELEDA. Towards Learning Analytics in Cybersecurity Capture the Flag Games. In Proceedings of the 50th ACM Technical Symposium on Computer Science Education (SIGCSE’19). 2019. ISBN 978-1-4503-5890-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3287324.3293816.

ČERMÁK, Milan. Trace-Share: Towards Provable Network Traffic Measurement and Analysis. 2019.

MAMULA, Ondřej, David HRYCEJ, Martin STŘELEC, Tomáš PITNER, František KASL, Václav STUPKA a Filip PROCHÁZKA. Uplatnění agregované flexibility pro PpS a na trzích s energiemi bez negativního vlivu na provozní parametry sítí. Energetika. Praha: Český svaz zaměstnavatelů v energetice, 2019, roč. 69, č. 5, s. 308-311. ISSN 0375-8842.

COLLETT, Dominika, Radim POLČÁK, Michal ŠALOMOUN a Terezie VOJTÍŠKOVÁ. Value Gap. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2019, 52 s. n/a.

POLČÁK, Radim, František KASL, Pavel LOUTOCKÝ, Jakub MÍŠEK a Václav STUPKA. Virtualizace právních vztahů a nové regulatorní metody v pozitivním právu. Právník. AV ČR, Ústav státu a práva, 2019, roč. 158, č. 1, s. 86-98. ISSN 0231-6625.

OŠLEJŠEK, Radek, Vít RUSŇÁK, Karolína BURSKÁ, Valdemar ŠVÁBENSKÝ a Jan VYKOPAL. Visual Feedback for Players of Multi-Level Capture the Flag Games: Field Usability Study. Online. In Gove R., Arendt D., Kohlhammer J., Angelini M., Lyn Paul, C., Bryan C. McKenna S., Prigent N., Najafi P., Sopan A. 2019 IEEE Symposium on Visualization for Cyber Security (VizSec). Vancouver, BC, Canada: IEEE, 2019, s. 1-11. ISBN 978-1-7281-3876-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/VizSec48167.2019.9161386.

MORRIS, Chris, Paolo ANDREETTO, Lucia BANCI, Alexandre M J J BONVIN, Grzegorz CHOJNOWSKI, Laura del CANO, José Marıa CARAZO, Pablo CONESA, Susan DAENKE, George DAMASKOS, Andrea GIACHETTI, Natalie E C HALEY, Maarten L HEKKELMAN, Philipp HEUSER, Robbie P JOOSTEN, Daniel KOUŘIL, Aleš KŘENEK, Tomáš KULHÁNEK, Victor S LAMZIN, Nurul NADZIRIN, Anastassis PERRAKIS, Antonio ROSATO, Fiona SANDERSON, Joan SEGURA, Joerg SCHAARSCHMIDT, Egor SOBOLEV, Sergio TRALDI, Mikael E TRELLET, Sameer VELANKAR, Marco VERLATO a Martyn WINN. West-Life: A Virtual Research Environment for structural biology. Journal of Structural Biology: X. 2019, roč. 1, January - March 2019, s. 1-8. ISSN 2590-1524. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.yjsbx.2019.100006.

PAZÚRIKOVÁ, Jana, Jaroslav OĽHA, Aleš KŘENEK a Vojtěch SPIWOK. Acceleration of Mean Square Distance Calculations with Floating Close Structure in Metadynamics Simulations. arXiv, 2018, 22 s. arXiv:1801.02362.

HARAŠTA, Jakub, Jaromír ŠAVELKA, František KASL, Adéla KOTKOVÁ, Pavel LOUTOCKÝ, Jakub MÍŠEK, Daniela PROCHÁZKOVÁ, Helena PULLMANNOVÁ, Petr SEMENIŠÍN, Tamara ŠEJNOVÁ, Nikola ŠIMKOVÁ, Michal VOSINEK, Lucie ZAVADILOVÁ a Jan ZIBNER. Annotated Corpus of Czech Case Law for Reference Recognition Tasks. Online. In Sojka, P., Horák, A., Kopeček, I., Pala, K. Text, Speech, and Dialogue: 21st International Conference. Cham: Springer Nature Switzerland AG, 2018, s. 239-250. ISBN 978-3-030-00793-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-00794-2_26.

HUSÁK, Martin, Nataliia NESHENKO, Morteza SAFAEI POUR, Elias BOU-HARB a Pavel ČELEDA. Assessing Internet-wide Cyber Situational Awareness of Critical Sectors. Online. In Proceedings of the 13th International Conference on Availability, Reliability and Security. Hamburg: ACM, 2018, s. "29:1"-"29:6", 6 s. ISBN 978-1-4503-6448-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3230833.3230837.

LINDEN, Mikael, Michal PROCHÁZKA, Ilkka LAPPALAINEN, Dominik František BUČÍK, Pavel VYSKOČIL, Martin KUBA, Sami SILÉN, Peter BELMANN, Alexander SCZYRBA, Steven NEWHOUSE, Luděk MATYSKA a Tommi NYRÖNEN. Common ELIXIR Service for Researcher Authentication and Authorisation. F1000Research. F1000 Research Ltd., 2018, roč. 7, č. 2018, s. 1-16. ISSN 2046-1402. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.12688/f1000research.15161.1.

KOMÁRKOVÁ, Jana, Lukáš SADLEK a Martin LAŠTOVIČKA. Community Based Platform for Vulnerability Categorization. Online. In NOMS 2018 - 2018 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium. Taipei, Taiwan: IEEE Xplore Digital Library, 2018, s. nestránkováno, 2 s. ISBN 978-1-5386-3416-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS.2018.8406125.

KNÍŽEK, Jiří, Lubomír PAVLIŠKA, Václav PROCHÁZKA, Adéla VRTKOVÁ, Ladislav BERÁNEK, Pavel BOUCHAL, Bořivoj VOJTĚŠEK, Rudolf NENUTIL a Martin KUBA. Computation of Identification of a Gnostical Regression Model, Robust to Both Input and Output Disturbances with the Help of Parallel Computing–Basic Version. International Journal of Mathematics and Computation™. CESER, 2018, roč. 29, č. 2, s. 29-58. ISSN 0974-5718.

KLODWIG, Jakub. Cookies nowadays situation. In Cyberspace 2018. 2018.

PORTESI, Silvia, Václav STUPKA, Philip ANDERSON, François BEAUVOIS, Efthymios LALAS, Catalin PATRASCU, Andreas SFAKIANAKIS, Silvia SIGNORATO a Koen VAN IMPE. Cooperation between CSIRTs and Law Enforcement: interaction with the Judiciary. Greece: European Union Agency for Network and Information Security, 2018, 102 s. ISBN 978-92-9204-259-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.2824/274312.

KOMÁRKOVÁ, Jana, Martin HUSÁK, Martin LAŠTOVIČKA a Daniel TOVARŇÁK. CRUSOE: Data Model for Cyber Situation Awareness. Online. In Proceedings of the 13th International Conference on Availability, Reliability and Security. Hamburg: ACM, 2018, s. "36:1"-"36:10", 10 s. ISBN 978-1-4503-6448-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3230833.3232798.

STŘELÁK, David a Jiří FILIPOVIČ. cuFFTAdvisor. 2018.

LOUTOCKÝ, Pavel, Jakub MÍŠEK a František KASL. Czech Republic. Online. In J.L. da Cruz Vilaça, R. L. Vasconcelos, M. Gorjão-Henriques, A. Saavedra. The internal market and the digital economy: XXVIII FIDE Congress Lisbon/Estoril (23-26 may 2018) Congress proceedings Vol. 1. Coimbra: Almedina, 2018, s. 285-315. Congress proceedings Vol. 1. ISBN 978-972-40-7478-8.

NESHENKO, Nataliia, Martin HUSÁK, Elias BOU-HARB, Pavel ČELEDA, Sameera AL-MULLA a Claude FACHKHA. Data-Driven Intelligence for Characterizing Internet-scale IoT Exploitations. Online. In 2018 IEEE Globecom Workshops. Abu Dhabi: IEEE, 2018, s. 1-7. ISBN 978-1-5386-4920-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/GLOCOMW.2018.8644468.

RUSŇÁK, Vít, Caroline APPERT, Olivier CHAPUIS a Emmanuel PIETRIGA. Designing Coherent Gesture Sets for Multi-scale Navigation on Tabletops. Online. In Proceedings of the 2018 CHI Conference on Human Factors in Computing Systems. ACM, 2018, 12 s. ISBN 978-1-4503-5620-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3173574.3173716.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar, Jan VYKOPAL, Milan ČERMÁK a Martin LAŠTOVIČKA. Enhancing Cybersecurity Skills by Creating Serious Games. Online. In Proceedings of the 23rd Annual ACM Conference on Innovation and Technology in Computer Science Education (ITiCSE'18). Larnaca, Cyprus: ACM, 2018, s. 194-199. ISBN 978-1-4503-5707-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3197091.3197123.

KOŠČÍK, Michal, Radim POLČÁK, Václav STUPKA, Matěj MYŠKA, Pavel LOUTOCKÝ a Jan ZIBNER. European ICT Law 2018: Texts, Cases, Materials. Brno: Masarykova univerzita, 2018, 404 s.

OŠLEJŠEK, Radek, Jan VYKOPAL, Karolína BURSKÁ a Vít RUSŇÁK. Evaluation of Cyber Defense Exercises Using Visual Analytics Process. Online. In Proceedings of the 48th IEEE Frontiers in Education Conference (FIE'18). San Jose, California, USA: IEEE, 2018, s. 1-9. ISBN 978-1-5386-1173-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/FIE.2018.8659299.

SOROKIN, Dmitry, Igor PETERLÍK, Vladimír ULMAN, David SVOBODA, Tereza NEČASOVÁ, Katsiarina MORGAENKO, Lívia EISELLEOVÁ, Lenka TESAŘOVÁ a Martin MAŠKA. FiloGen: A Model-Based Generator of Synthetic 3-D Time-Lapse Sequences of Single Motile Cells with Growing and Branching Filopodia. IEEE Transactions on Medical Imaging. IEEE, 2018, roč. 37, č. 12, s. 2630-2641. ISSN 0278-0062. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/TMI.2018.2845884.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar a Jan VYKOPAL. Gathering Insights from Teenagers' Hacking Experience with Authentic Cybersecurity Tools. Online. In 2018 IEEE Frontiers in Education Conference (FIE). San Jose, California, USA: IEEE, 2018, s. 1414-1417. ISBN 978-1-5386-1175-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/FIE.2018.8658840.

ŠVÁBENSKÝ, Valdemar a Jan VYKOPAL. Challenges Arising from Prerequisite Testing in Cybersecurity Games. Online. In Proceedings of the 49th ACM Technical Symposium on Computer Science Education (SIGCSE’18). Baltimore, Maryland, USA: ACM, 2018, s. 56-61. ISBN 978-1-4503-5103-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3159450.3159454.

VELAN, Petr. Improving Network Flow Definition: Formalization and Applicability. Online. In NOMS 2018 - 2018 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium. Taipei, Taiwan: IEEE Xplore Digital Library, 2018, s. 1-5. ISBN 978-1-5386-3416-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS.2018.8406203.

KREJČÍŘ, Vlastimil. Indexování a vyhledávání matematických formulí. Online. Praha: Albertina icome Praha, 2018, 6 s. ISSN 1801-2213.

SALOMONI, Davide, Luciano GAIDO, Isabel Campos PLASENCIA, Jesus E Marco de LUCAS, Peter SOLAGNA, Jorge GOMES, Luděk MATYSKA, P FUHRMAN, Marcus HARDT, Giacinto DONVITO, L DUTKA, Marcin Pl o CIENNIK, Roberto BARBERA, Cristina AIFTIMIEI, Ignacio BLANQUER, Andrea CECCANTI, Mario DAVID, Alvaro Lopez GARCIA, German MOLTO, P ORVIZ, Zdeněk SUSTR, M VILJOEN, Fernando AGUILAR, L ALVES, Alexandre BONVING, Riccardo BRUNO, D DAVIDOVIC, Marco FARGETTA, Yen CHEN, Sandro FIORE, Z KURKCUOGLU, L LLORET, J MARTINS, Alessandra NUZZO, Paola NASSISI, J PINA, Eva SCIACCA, Daniele SPIGA, M TANGARO, Michal URBANIAK, Bas WEGH a T ZOK. INDIGO-DataCloud: A platform to facilitate seamless access to e-infrastructures. Journal of Grid Computing. Springer Science+Business Media B.V., 2018, roč. 16, č. 3, s. 381-408. ISSN 1570-7873. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10723-018-9453-3.

KOTT, Alexander, Paul THERÓN, Luigi V MANCINI, Martin DRAŠAR, Edlira DUSHKU, Günther HEIKO, Markus KONT, Benoît LEBLANC, Agostino PANICO, Mauno PIHELGAS a Krzysztof RZADCA. Initial Reference Architecture of an Intelligent Autonomous Agent for Cyber Defense. 2018.

MYŠKA, Matěj, Michal KOŠČÍK a Jakub MÍŠEK. Intellectual Property On-Line - Exceptions and Limitations. 2018.

PETROVIČ, Filip, Jiří FILIPOVIČ, David STŘELÁK a Jana PAZÚRIKOVÁ. Kernel Tuning Toolkit. 2018.

PIVOLUSKA, Matej, Marcus HUBER a Mehul MALIK. Layered quantum key distribution. Physical Review A. 2018, roč. 97, č. 3, s. "032312:1"-"032312:10", 10 s. ISSN 2469-9926. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevA.97.032312.

PLESCH, Martin a Matej PIVOLUSKA. Loss of information in quantum guessing game. New Journal of Physics. IOP publishing, 2018, roč. 20, 07 02 2018, s. "023018:1"-"023018:10", 10 s. ISSN 1367-2630. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1088/1367-2630/aaa5f8.

LAŠTOVIČKA, Martin, Antonín DUFKA a Jana KOMÁRKOVÁ. Machine Learning Fingerprinting Methods in Cyber Security Domain: Which one to Use?. Online. In IEEE. Proceedings of the 14th International Wireless Communications and Mobile Computing Conference. Limassol, Cyprus: IEEE Xplore Digital Library, 2018, s. 542-547. ISBN 978-1-5386-2070-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/IWCMC.2018.8450406.

SZCZEPANIK, Petr, Pavel ZAHRÁDKA, Radim POLČÁK, Jakub MACEK, Ivan DAVID, Dominika GALAJDOVÁ, Johana KOTIŠOVÁ, Rudolf LEŠKA, Petr LUPAČ, Tomáš KARGER a Štěpán ŽÁDNÍK. Mapa audiovizuálního pole v České republice z hlediska digitalizace a strategie pro jednotný digitální trh. 1. vyd. Olomouc: Univerzita Palackého v Olomouci, 2018, 93 s. ISBN 978-80-244-5450-4.

BAVARESCO, Jessica, Natalia Herrera VALENCIA, Claude KLÖCKL, Matej PIVOLUSKA, Paul ERKER, Nicolai FRIIS, Mehul MALIK a Marcus HUBER. Measurements in two bases are sufficient for certifying high-dimensional entanglement. Nature Physics. Nature Publishing Group, 2018, roč. 14, č. 10, s. 1032-1040. ISSN 1745-2473. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41567-018-0203-z.

POLČÁK, Radim, Leoš ŠEVČÍK, Michal KOŠČÍK, Jakub KLODWIG a Petr HOLUB. Metodika aplikace GDPR na výzkumná data v prostředí vysokých škol v ČR. 1. vydání. Brno: Neuveden, 2018, 156 s. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5281/zenodo.2532860.

SOJKA, Petr, Michal RŮŽIČKA a Vít NOVOTNÝ. MIaS: Math-Aware Retrieval in Digital Mathematical Libraries. Online. In Proceedings of the 27th ACM International Conference on Information and Knowledge Management (CIKM '18). Torino, Italy: Association for Computing Machinery, 2018, s. 1923-1926. ISBN 978-1-4503-6014-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3269206.3269233.

PETERLÍK, Igor, David SVOBODA, Vladimír ULMAN, Dmitry SOROKIN a Martin MAŠKA. Model-Based Generation of Synthetic 3D Time-Lapse Sequences of Multiple Mutually Interacting Motile Cells with Filopodia. Online. In Simulation and Synthesis in Medical Imaging. Cham: Springer, 2018, s. 71-79. ISBN 978-3-030-00535-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-00536-8_8.

SOROKIN, Dmitry, Igor PETERLÍK, Marco TEKTONIDIS, Karl ROHR a Pavel MATULA. Non-rigid Contour-Based Registration of Cell Nuclei in 2-D Live Cell Microscopy Images Using a Dynamic Elasticity Model. IEEE Transactions on Medical Imaging. IEEE, 2018, roč. 37, č. 1, s. 173-184. ISSN 0278-0062. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/TMI.2017.2734169.

POLČÁK, Radim. Odpovědnost umělé inteligence a budoucnost průmyslu 4.0. In Docuride 2018, Praha. 2018.

POLČÁK, Radim. Odpovědnost umělé inteligence a informační útvary bez právní subjektivity. Bulletin advokacie. Česká advokátní komora, 2018, roč. 2018, č. 11, s. 21-28. ISSN 1210-6348.

MÍŠEK, Jakub. Otevřená data a jejich licencování v České republice. In Licencie Creative Commons a ich vyuzitie v praxi. 2018.

MÍŠEK, Jakub. Otevřená data: Současný stav a doporučení pro otevírání. In Otevřená data a otevřené vzdělávací zdroje. 2018.

LAŠTOVIČKA, Martin, Tomáš JIRSÍK, Pavel ČELEDA, Stanislav ŠPAČEK a Daniel FILAKOVSKÝ. Passive OS Fingerprinting Methods in the Jungle of Wireless Networks. Online. In NOMS 2018 - 2018 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium. Taipei, Taiwan: IEEE Xplore Digital Library, 2018, s. nestránkováno, 9 s. ISBN 978-1-5386-3416-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS.2018.8406262.

LAŠTOVIČKA, Martin a Daniel FILAKOVSKÝ. Passive OS Fingerprinting Prototype Demonstration. Online. In NOMS 2018 - 2018 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium. Taipei, Taiwan: IEEE Xplore Digital Library, 2018, s. nestránkováno, 2 s. ISBN 978-1-5386-3416-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS.2018.8406128.

STŘELÁK, David a Jiří FILIPOVIČ. Performance analysis and autotuning setup of the cuFFT library. Online. In ACM International Conference Proceeding Series. Limassol, Cyprus: ACM, 2018, s. nestránkováno, 6 s. ISBN 978-1-4503-6591-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3295816.3295817.

MAREK, Martin, Matej BADIN a Martin PLESCH. Physics of the mechanical toy Gee-Haw Whammy Diddle. Scientific Reports. 2018, roč. 8, č. 1, s. 1-10. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-018-22079-1.

KLODWIG, Jakub. Právní teorie a praxe cookies. In České právo a informační technologie 2018. 2018.

POLČÁK, Radim, Matěj MYŠKA, Petr HOSTAŠ, František KASL, Tereza KYSELOVSKÁ, Tomáš LECHNER, Pavel LOUTOCKÝ, Jakub MÍŠEK, Jan TOMÍŠEK, Václav STUPKA a Miroslav UŘIČAŘ. Právo informačních technologií. Praha: Wolters Kluwer, 2018, 656 s. Právní monografie. ISBN 978-80-7598-045-8.

MÍŠEK, Jakub. Privacy in Public Space: Conceptual and Regulatory Challenges. Timan, T.; Newell, B. C.; Koops, B.-J. (eds.). Masaryk University Journal of Law and Technology. Masarykova univerzita, 2018, roč. 12, č. 1, s. 75-80. ISSN 1802-5943. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/MUJLT2018-1-4.

MÍŠEK, Jakub a Jan TOMÍŠEK. Privacy risks of internet advertising and how they are and should be addressed by GDPR and ePrivacy. In Cyberspace 2018. 2018.

KLODWIG, Jakub. Prolomení internetové anonymity aneb Vím, kdo jsi a co máš rád. Brno: Právo21, z.s., 2018. ISSN 2570-8813.

GALAJDOVÁ, Dominika, František KASL, Pavel LOUTOCKÝ, Jakub MÍŠEK, Tereza NOVOTNÁ, Jan ZIBNER a Veronika ŽOLNERČÍKOVÁ. Přehled aktuální judikatury II/2018. Brno: Masarykova univerzita, 2018, s. 65-91.

GALAJDOVÁ, Dominika, František KASL, Pavel LOUTOCKÝ, Jakub MÍŠEK, Anna ŠTEFANIDESOVÁ a Jan ZIBNER. Přehled aktuální judikatury I/2018. Brno: Masarykova univerzita, 2018, s. 59-89.

VELAN, Petr, Martin HUSÁK a Daniel TOVARŇÁK. Rapid Prototyping of Flow-Based Detection Methods Using Complex Event Processing. Online. In NOMS 2018 - 2018 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium. Taipei, Taiwan: IEEE Xplore Digital Library, 2018, s. 1-3. ISBN 978-1-5386-3416-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS.2018.8406121.

KLUSÁČEK, Dalibor, Boris PARÁK, Václav CHLUMSKÝ a Lukáš HEJTMÁNEK. Real-life Experience with Private Cloud hosting Heterogeneous Scientific Workloads. Online. In 2018 IEEE/ACM INTERNATIONAL CONFERENCE ON UTILITY AND CLOUD COMPUTING COMPANION (UCC COMPANION). NEW YORK: IEEE, 2018, s. 115-120. ISBN 978-1-72810-359-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/UCC-Companion.2018.00044.

JIRSÍK, Tomáš. Stream4Flow: Real-time IP Flow Host Monitoring using Apache Spark. Online. In NOMS 2018 - 2018 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium. Taipei, Taiwan: IEEE, 2018, s. 1-2. ISBN 978-1-5386-3416-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS.2018.8406132.

MÍŠEK, Jakub. Sui generis database right: Internal and External exceptions and limitations. In Cyberspace 2018. 2018.

ŠPAČEK, Stanislav a Pavel ČELEDA. Threat Detection Through Correlation of Network Flows and Logs. Online. In Burkhard Stiller. Proceedings of the 12th International Conference on Autonomous Infrastructure, Management and Security (AIMS 2018). Neuveden: IFIP, 2018, s. 6-10. ISBN 978-3-903176-12-6.

JIRSÍK, Tomáš, Štěpán TRČKA a Pavol ZAŤKO. Time Series Analyzer: Software for analysis of performance time series. 2018.

VYKOPAL, Jan, Radek OŠLEJŠEK, Karolína BURSKÁ a Kristína ZÁKOPČANOVÁ. Timely Feedback in Unstructured Cybersecurity Exercises. Online. In Proceedings of Special Interest Group on Computer Science Education, Baltimore, Maryland, USA, February 21–24, 2018(SIGCSE’18). New York, NY, USA: ACM, 2018, s. 173-178. ISBN 978-1-4503-5103-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3159450.3159561.

JIRSÍK, Tomáš a Pavel ČELEDA. Toward Real-time Network-wide Cyber Situational Awareness. Online. In NOMS 2018 - 2018 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium. Taipei, Taiwan: IEEE, 2018, s. 1-7. ISBN 978-1-5386-3416-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS.2018.8406166.

THERON, Paul, Alexander KOTT, Martin DRAŠAR, Krzysytof RZADCA, Benoît LEBLANC, Mauno PIHELGAS, Luigi MANCINI a Agostino PANICO. Towards an active, autonomous and intelligent cyber defense of military systems: The NATO AICA reference architecture. Online. In 2018 International Conference on Military Communications and Information Systems (ICMCIS). Warsaw, Poland: IEEE, 2018, s. 1-9. ISBN 978-1-5386-4559-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ICMCIS.2018.8398730.

HUSÁK, Martin a Jaroslav KAŠPAR. Towards Predicting Cyber Attacks Using Information Exchange and Data Mining. Online. In 2018 14th International Wireless Communications & Mobile Computing Conference (IWCMC). Limassol: IEEE, 2018, s. 536-541. ISBN 978-1-5386-2070-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/IWCMC.2018.8450512.

ČERMÁK, Milan, Tomáš JIRSÍK, Petr VELAN, Jana KOMÁRKOVÁ, Stanislav ŠPAČEK, Martin DRAŠAR a Tomáš PLESNÍK. Towards Provable Network Traffic Measurement and Analysis via Semi-Labeled Trace Datasets. Online. In 2018 Network Traffic Measurement and Analysis Conference (TMA). Vienna, Austria: IEEE, 2018, s. 1-8. ISBN 978-3-903176-09-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.23919/TMA.2018.8506498.

POLČÁK, Radim. Zpracování osobních údajů v justici. Zpravodaj Jednoty českých právníků. 2018, roč. 28, č. 4, s. 39-51. ISSN 2464-5982.

MÍŠEK, Jakub. Zvláštní práva pořizovatele databáze a výjimka úředního díla. In Konference o šedé literatuře a repozitářích. 2018.

PROYNOVA, Rumyana, Diogo ALEXANDRE, Martin LABLANS, David VAN ENCKEVORT, Sebastian MATE, Niina EKLUND, Kaisa SILANDER, Michael HUMMEL, Petr HOLUB a Frank ÜCKERT. A Decentralized IT Architecture for Locating and Negotiating Access to Biobank Samples. Stud Health Technol Inform. Netherlands: IOS Press, 2017, roč. 243, s. 75-79, 6 s. ISSN 0926-9630. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3233/978-1-61499-808-2-75.

HUSÁK, Martin a Milan ČERMÁK. A Graph-based Representation of Relations in Network Security Alert Sharing Platforms. Online. In Prosper Chemouil, Edmundo Monteiro, Marinos Charalambides, Edmundo Madeira, Paulo Simões, Stefano Secci, Luciano Paschoal Gaspary, Carlos Raniery P. dos Santos. 2017 IFIP/IEEE Symposium on Integrated Network and Service Management (IM). Lisbon: IEEE, 2017, s. 891-892. ISBN 978-3-901882-89-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.23919/INM.2017.7987399.

ŠPAČEK, Stanislav, Pavel ČELEDA, Martin DRAŠAR a Martin VIZVÁRY. Analyzing an Off-the-Shelf Surveillance Software: Hacking Team Case Study. In Jaroslav Dočkal, Milan Jirsa, Josef Kaderka. SPI 2017 - Security and Protection of Information 2017. Brno: Univerzita obrany, 2017, s. 143-158. ISBN 978-80-7231-414-0.

FILIPOVIČ, Jiří, Filip PETROVIČ a Siegfried BENKNER. Autotuning of OpenCL Kernels with Global Optimizations. Online. In 1st Workshop on Autotuning and Adaptivity Approaches for Energy Efficient HPC Systems (ANDARE'2017). Portland (USA): ACM, 2017, s. nestránkováno, 6 s. ISBN 978-1-4503-5363-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3152821.3152877.

FILIPOVIČ, Jiří, Ondřej VÁVRA, Jan PLHÁK, David BEDNÁŘ, Sérgio Manuel MARQUES, Jan BREZOVSKÝ, Luděk MATYSKA a Jiří DAMBORSKÝ. CaverDock 1.0. 2017.

KNÍŽEK, Jiří, Ladislav BERÁNEK, Pavel BOUCHAL, Bořivoj VOJTĚŠEK, Rudolf NENUTIL, Martin KUBA, Lubomír PAVLIŠKA a Václav PROCHÁZKA. Computation of Kovanic's Expectedness Distributions with the Help of Parallel Computing - Basic Version (with Special References of Health and Environment). INTERNATIONAL JOURNAL OF ECOLOGICAL ECONOMICS & STATISTICS. UTTARAKHAND: CENTRE ENVIRONMENT SOCIAL & ECONOMIC RESEARCH PUBL-CESER, 2017, roč. 38, č. 1, s. 96-119. ISSN 0973-1385.

HANYCH, Monika, Markéta ŠTĚPÁNÍKOVÁ, Michal MALANÍK, Martin ŠKOP, Terezie SMEJKALOVÁ, Pavel LOUTOCKÝ a Jakub MÍŠEK. Conference ARGUMENTATION 2017. 2017.

SÝKORA, Martin, Karel SLAVÍČEK a Štěpán GRABOVSKÝ. Dohledový systém satelitní MESH sítě. 2017.

LOUTOCKÝ, Pavel, Tomáš ABELOVSKÝ, Jakub HARAŠTA, František KASL, Alžběta KRAUSOVÁ, Tereza KYSELOVSKÁ, Jakub MÍŠEK, Matěj MYŠKA, Radim POLČÁK, Lucie STRAKOVÁ a Václav STUPKA. Dokumenty ke studiu práva informačních a komunikačních technologií. 2017.

DRAŠAR, Martin a Jana KOMÁRKOVÁ. Estimating Parameters of Target's Detection Methods. Online. In Michal Pechoucek, Alexander Kott. Proceedings of the NATO IST-152 Workshop on Intelligent Autonomous Agents for Cyber Defence and Resilience. Praha: CEUR Workshop Proceedings, 2017, s. 84-89. ISSN 1613-0073.

KOŠČÍK, Michal, Radim POLČÁK, Václav STUPKA, Matěj MYŠKA a Pavel LOUTOCKÝ. European ICT Law 2017: Texts, Cases, Materials. 2017.

VÝTVAROVÁ, Eva a Jan FOUSEK. Evaluation of community detection algorithms applied to time-series connectivity networks with dynamical structure. In CompleNet'17, Dubrovnik, Croatia. 2017.

HUSÁK, Martin, Milan ČERMÁK, Martin LAŠTOVIČKA a Jan VYKOPAL. Exchanging Security Events: Which And How Many Alerts Can We Aggregate?. Online. In Prosper Chemouil, Edmundo Monteiro, Marinos Charalambides, Edmundo Madeira, Paulo Simões, Stefano Secci, Luciano Paschoal Gaspary, Carlos Raniery P. dos Santos. 2017 IFIP/IEEE Symposium on Integrated Network and Service Management (IM). Lisbon: IEEE, 2017, s. 604-607. ISBN 978-3-901882-89-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.23919/INM.2017.7987340.

RUČKA, Lukáš a Igor PETERLÍK. Fast reconstruction of image deformation field using radial basis function. Online. In 2017 IEEE 14th International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI). Neuveden: IEEE, 2017, s. 1146-1150. ISBN 978-1-5090-1171-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ISBI.2017.7950719.

MÍŠEK, Jakub. Fialová E. Bezkontaktní čipy a ochrana soukromí. Revue pro právo a technologie. Masarykova univerzita, 2017, roč. 8, č. 15, s. 109-115. ISSN 1804-5383.

VYKOPAL, Jan a Jakub ČEGAN. Finding Exercise Equilibrium: How to Support the Game Balance at the Very Beginning? 2017. ISBN 978-1-4503-4698-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3017680.3022409.

RŮŽIČKA, Michal, Vít NOVOTNÝ, Petr SOJKA, Jan POMIKÁLEK a Radim ŘEHŮŘEK. Flexible Similarity Search of Semantic Vectors Using Fulltext Search Engines. Online. In CEUR Workshop Proceedings, Vol. 1923. Vienna, Austria: Neuveden, 2017, s. 1-12. ISSN 1613-0073.

HENDRIKS, Luuk, Petr VELAN, Ricardo DE O. SCHMIDT, Pieter-Tjerk DE BOER a Aiko PRAS. Flow-Based Detection of IPv6-specific Network Layer Attacks. In Daphne Tuncer, Robert Koch, Rémi Badonnel, Burkhard Stiller. AIMS 2017 - 11th IFIP WG 6.6 International Conference on Autonomous Infrastructure, Management, and Security. Zurich, Switzerland: Springer International Publishing, 2017, s. 137-142. ISBN 978-3-319-60774-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-60774-0_11.

JIMÉNEZ, Rafael C, Mateusz KUZAK, Monther ALHAMDOOSH, Michelle BARKER, Bérénice BATUT, Mikael BORG, Salvador CAPELLA-GUTIERREZ, Neil Chue HONG, Martin COOK, Manuel CORPAS, Madison FLANNERY, Leyla GARCIA, Josep Ll GELPÍ, Simon GLADMAN, Carole GOBLE, Montserrat González FERREIRO, Alejandra GONZALEZ-BELTRAN, Philippa C GRIFFIN, Björn GRÜNING, Jonas HAGBERG, Petr HOLUB, Rob HOOFT, Jon ISON, Daniel S KATZ, Brane LESKOŠEK, Federico López GÓMEZ, Luis J OLIVEIRA, David MELLOR, Rowland MOSBERGEN, Nicola MULDER, Yasset PEREZ-RIVEROL, Robert PERGL, Horst PICHLER, Bernard POPE, Ferran SANZ, Maria V SCHNEIDER, Victoria STODDEN, Radosław SUCHECKI, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Harry-Anton TALVIK, Ilian TODOROV, Andrew TRELOAR, Sonika TYAGI, Maarten van GOMPEL, Daniel VAUGHAN, Allegra VIA, Xiaochuan WANG, Nathan S WATSON-HAIGH a Crouch STEVE. Four simple recommendations to encourage best practices in research software. F1000Research. 2017, roč. 6, JUN, s. 876-888. ISSN 2046-1402. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.12688/f1000research.11407.1.

MEDKOVÁ, Jana, Martin HUSÁK, Martin VIZVÁRY a Pavel ČELEDA. Honeypot Testbed for Network Defence Strategy Evaluation. Online. In Prosper Chemouil, Edmundo Monteiro, Marinos Charalambides, Edmundo Madeira, Paulo Simões, Stefano Secci, Luciano Paschoal Gaspary, Carlos Raniery P. dos Santos. 2017 IFIP/IEEE Symposium on Integrated Network and Service Management (IM). Lisbon: IEEE, 2017, s. 887-888. ISBN 978-3-901882-89-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.23919/INM.2017.7987397.

SOKOL, Pavol, Jakub MÍŠEK a Martin HUSÁK. Honeypots and honeynets: issues of privacy. EURASIP Journal on Information Security. London: Springer Open, 2017, roč. 10, č. 4, s. 1-9. ISSN 1687-4161. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13635-017-0057-4.

POPOVICI, Vlad, Aleš KŘENEK a Eva BUDINSKÁ. Identification of "BRAF-Positive" Cases Based on Whole-Slide Image Analysis. Biomed Research International. New York: HINDAWI LTD, 2017, Neuveden, April, s. nestránkováno, 7 s. ISSN 2314-6133. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1155/2017/3926498.

PETERLÍK, Igor, Nazim HAOUCHINE, Lukáš RUČKA a Stéphane COTIN. Image-driven Stochastic Identification of Boundary Conditions for Predictive Simulation. Online. In Descoteaux M., Maier-Hein L., Franz A., Jannin P., Collins D., Duchesne S. Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention − MICCAI 2017: 20th International Conference, Quebec City, QC, Canada, September 11-13, 2017, Proceedings, Part II. Cham: Springer, 2017, s. 548-556. ISBN 978-3-319-66184-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-66185-8_62.

POLČÁK, Radim. Information Society Between Orwell and Zapata: A Czech Perspective on Safe Harbours. In Graeme B. Dinwoodie. Secondary Liability of Internet Service Providers. Heidelberg: Springer International Publishing, 2017, s. 255-273. Ius Comparatum - Global Studies in Comparative Law. ISBN 978-3-319-55028-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-55030-5.

POLČÁK, Radim a Dan Jerker B. SVANTESSON. Information Sovereignty - Data Privacy, Sovereign Powers and the Rule of Law. 1. vyd. Cheltenham: Edward Elgar Publishing, 2017, 268 s. 2017936584. ISBN 978-1-78643-921-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.4337/9781786439222.

VÝTVAROVÁ, Eva, Jan FOUSEK, Michal MIKL, Irena REKTOROVÁ a Eva HLADKÁ. Investigating Community Detection Algorithms and their Capacity as Markers of Brain Diseases. Online. In International Symposium on Grids and Clouds (ISGC) 2017. Academia Sinica, Taipei, Taiwan: Proceedings of Science. Taipei; Taiwan: Sissa Medialab Srl, 2017, s. 1-14. ISSN 1824-8039. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.22323/1.293.0018.

MÍŠEK, Jakub. Is the Definition of Personal Data Flawed? Hyperlink as Personal Data (Processing). In Dan Svantesson, Dariusz Kloza. Trans-Atlantic Data Privacy Relations as a Challenge for Democracy. Cambridge: Intersentia, 2017, s. 331-346. European Integration and Democracy Series, 4. ISBN 978-1-78068-434-5.

MÍŠEK, Jakub a Pavel LOUTOCKÝ. Kitsch in Legal Argumentation. In Law and Literature Conference. 2017.

VYKOPAL, Jan, Radek OŠLEJŠEK, Pavel ČELEDA, Martin VIZVÁRY a Daniel TOVARŇÁK. KYPO Cyber Range: Design and Use Cases. Online. In Cardoso J.,Cardoso J.,Maciaszek L.,Maciaszek L.,van Sinderen M.,Cabello E. Proceedings of the 12th International Conference on Software Technologies - Volume 1: ICSOFT. Madrid, Spain: SciTePress, 2017, s. 310-321. ISBN 978-989-758-262-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0006428203100321.

VÝTVAROVÁ, Eva, Radek MAREČEK, Jan FOUSEK, Ondřej STRÝČEK a Ivan REKTOR. Large-scale cortico-subcortical functional networks in focal epilepsies: The role of the basal ganglia. NeuroImage-Clinical. Oxford: Elsevier BV, 2017, roč. 2017, č. 14, s. 28-36. ISSN 2213-1582. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.nicl.2016.12.014.

VYKOPAL, Jan, Martin VIZVÁRY, Radek OŠLEJŠEK, Pavel ČELEDA a Daniel TOVARŇÁK. Lessons Learned From Complex Hands-on Defence Exercises in a Cyber Range. Online. In 2017 IEEE Frontiers in Education Conference. Indianapolis, IN, USA: IEEE, 2017, s. 1-8. ISBN 978-1-5090-5919-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/FIE.2017.8190713.

RŮŽIČKA, Michal. Math Information Retrieval for Digital Libraries. Brno: Masaryk University, Faculty of Informatics, 2017, 144 s. Doctoral Thesis.

KREJČÍŘ, Vlastimil. Mathematics Index and Search in DSpace. In OAI10 DSpace user group meeting (Pre-conference of OAI 10 - The CERN - UNIGE Workshop on Innovations in Scholarly Communication). 2017.

SÝKORA, Martin, Karel SLAVÍČEK a Štěpán GRABOVSKÝ. MESH satelitní terminál. 2017.

SOROKIN, Dmitry, Igor PETERLÍK, Vladimír ULMAN, David SVOBODA a Martin MAŠKA. Model-Based Generation of Synthetic 3D Time-Lapse Sequences of Motile Cells with Growing Filopodia. Online. In 14th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging. Melbourne: IEEE, 2017, s. 822-826. ISBN 978-1-5090-1172-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ISBI.2017.7950644.

BARTOŠEK, Miroslav, Michal RŮŽIČKA a Václav STUPKA. Nařízení GDPR a jeho implementace na vysokých školách v ČR – jak na to. In EUNIS-CZ. Dopad zavedení novely VŠ zákona do IS vysokých škol. 1. vyd. Plzeň: Západočeská univerzita v Plzni, 2017, s. 5-14. ISBN 978-80-261-0713-2.

MEDKOVÁ, Jana, Martin HUSÁK a Martin DRAŠAR. Network Defence Strategy Evaluation: Simulation vs. Live Network. Online. In Prosper Chemouil, Edmundo Monteiro, Marinos Charalambides, Edmundo Madeira, Paulo Simões, Stefano Secci, Luciano Paschoal Gaspary, Carlos Raniery P. dos Santos. 2017 IFIP/IEEE Symposium on Integrated Network and Service Management (IM). Lisbon: IEEE, 2017, s. 81-88. ISBN 978-3-901882-89-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.23919/INM.2017.7987267.

HUSÁK, Martin, Jaroslav KAŠPAR, Elias BOU-HARB a Pavel ČELEDA. On the Sequential Pattern and Rule Mining in the Analysis of Cyber Security Alerts. Online. In Proceedings of the 12th International Conference on Availability, Reliability and Security. Reggio Calabria: ACM, 2017, s. "22:1"-"22:10", 10 s. ISBN 978-1-4503-5257-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3098954.3098981.

MÍŠEK, Jakub. Open data v. Personal data protection in Czechia. In Cyberspace 2017. 2017.

DRAŠAR, Martin a Pavel MINAŘÍK. Overview and Evaluation of Methods and Tools for Complex Event Processing. 2017, 11 s.

MOLEK, Pavel a Radim POLČÁK. Poskytnout nebo chránit? Brno: Nejvyšší správní soud, 2017, 293 s. ACA Europe. ISBN 978-80-270-1645-7.

MÍŠEK, Jakub a Jakub KLÍMEK. Poskytování otevřených dat z rejstříků osob. In České právo a informační technologie 2017. 2017.

DOSTÁL, Otto, Otto DOSTÁL a Michal JAVORNÍK. Právní limity nakládání s údaji o zdravotním stavu. In XIII. mezinárodní kongres informačních technologií ve zdravotnictví. 2017.

STUPKA, Václav, Martin HORÁK a Martin HUSÁK. Protection of personal data in security alert sharing platforms. Online. In Proceedings of the 12th International Conference on Availability, Reliability and Security. Reggio Calabria: ACM, 2017, s. "65:1"-"65:8", 8 s. ISBN 978-1-4503-5257-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3098954.3105822.

GALAJDOVÁ, Dominika, František KASL, Pavel LOUTOCKÝ, Jakub MÍŠEK, Helena PULLMANNOVÁ, Anna ŠTEFANIDESOVÁ a Jan ZIBNER. Přehled aktuální judikatury II/2017. Brno: Masarykova univerzita, 2017, 15 s. Revue pro právo a technologie, roč. 8, č. 16. ISSN 1804-5383.

KASL, František, Pavel LOUTOCKÝ, Jakub MÍŠEK, Anna SLÁNSKÁ, Lucie STRAKOVÁ a Anna ŠTEFANIDESOVÁ. Přehled aktuální judikatury I/2017. Brno: Masarykova univerzita, 2017, 24 s. Revue pro právo a technologie, roč. 8, č. 15. ISSN 1804-5383.

PAZÚRIKOVÁ, Jana, Aleš KŘENEK, Vojtěch SPIWOK a Mária ŠIMKOVÁ. Reducing the number of mean-square deviation calculations with floating close structure in metadynamics. Journal of Chemical Physics. Melville: American Institute of Physics, 2017, roč. 146, č. 11, s. "115101:1"-"115101:8", 8 s. ISSN 0021-9606. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1063/1.4978296.

ROČEK, Aleš, Michal JAVORNÍK, Karel SLAVÍČEK a Otto DOSTÁL. Reversible Watermarking in Medical Imaging with Zero Distortion in ROI. Online. In Proceedings of 24th IEEE International Conference on Electronics, Circuits and Systems (ICECS 2017). New York: IEEE, 2017, s. 356-359. ISBN 978-1-5386-1911-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ICECS.2017.8292071.

HARAŠTA, Jakub, Jakub MÍŠEK, Monika HANYCH, Pavel LOUTOCKÝ, Michal MALANÍK, Jaromír ŠAVELKA, Markéta ŠTĚPÁNÍKOVÁ a Matěj MYŠKA. Rozměry citací v právu a anotační konvence. Revue pro právo a technologie. Masarykova univerzita, 2017, roč. 8, č. 15, s. 51-73. ISSN 1804-5383. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/RPT2017-1-4.

RYGL, Jan, Jan POMIKÁLEK, Radim ŘEHŮŘEK, Michal RŮŽIČKA, Vít NOVOTNÝ a Petr SOJKA. Semantic Vector Encoding and Similarity Search Using Fulltext Search Engines. Online. In Proceedings of the 2nd Workshop on Representation Learning for NLP, RepL4NLP 2017 c/o ACL 2017. Vancouver, Canada: Association for Computational Linguistics, ACL, 2017, s. 81-90. ISBN 978-1-945626-62-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.18653/v1/W17-2611.

KLUSÁČEK, Dalibor, Boris PARÁK a Lukáš HEJTMÁNEK. Scheduling Challenges in a Shared Private Cloud Infrastructure. CGW Workshop'17 Proceedings. 2017, roč. 2017, č. 1, s. 23-24.

LAŠTOVIČKA, Martin a Pavel ČELEDA. Situational Awareness: Detecting Critical Dependencies and Devices in a Network. In Daphne Tuncer, Robert Koch, Rémi Badonnel, Burkhard Stiller. AIMS 2017 - 11th IFIP WG 6.6 International Conference on Autonomous Infrastructure, Management, and Security. Zurich (Switzerland): Springer, 2017, s. 173-178. ISBN 978-3-319-60773-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-60774-0_17.

POLČÁK, Radim. Stock Exchange Interconnections and Legal Issues in Data Exchange. Masaryk University Journal of Law and Technology. 2017, roč. 7, č. 1, s. 351-362. ISSN 1802-5943. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/MUJLT2017-2-7.

ŽÁDNÍK, Martin, Jan WRONA, Pavel KROBOT, Pavel MINAŘÍK, Jan BARIENČÍK, Tomáš JIRSÍK, Milan ČERMÁK a Daniel TOVARŇÁK. Systém pro sběr, uchování a analýzu síťových dat velkého rozsahu. 2017.

VÝTVAROVÁ, Eva, Jan FOUSEK, Marek BARTOŇ, Radek MAREČEK, Martin GAJDOŠ, Martin LAMOŠ, Marie NOVÁKOVÁ, Tomáš SLAVÍČEK, Igor PETERLÍK a Michal MIKL. The Impact of Diverse Preprocessing Pipelines on Brain Functional Connectivity. Online. In 25th European Signal Processing Conference (EUSIPCO), Kos, Greece. Kos, Greece: IEEE, 2017, s. 2644-2648. ISBN 978-0-9928626-7-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.23919/EUSIPCO.2017.8081690.

HENDRIKS, Luuk, Petr VELAN, Ricardo DE O SCHMIDT, Pieter-Tjerk DE BOER a Aiko PRAS. Threats and Surprises behind IPv6 Extension Headers. Online. In 2017 Network Traffic Measurement and Analysis Conference (TMA). Dublin, Ireland: IEEE Xplore Digital Library, 2017, s. 1-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.23919/TMA.2017.8002912.

JIRSÍK, Tomáš, Milan ČERMÁK, Daniel TOVARŇÁK a Pavel ČELEDA. Toward Stream-Based IP Flow Analysis. IEEE Communications Magazine. IEEE, 2017, roč. 55, č. 7, s. 70-76. ISSN 0163-6804. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/MCOM.2017.1600972.

PITNER, Tomáš, Jan MINISTR, Daniel TOVARŇÁK, Filip KŠENZULIAK a Adam KUČERA. Towards a Common Logging and Monitoring Framework for Critical Infrastructures. In Radek Němec, Lucie Chytilová. Strategic Management and its Support by Information Systems (SMSIS). Ostrava: VŠB - Technical University of Ostrava, 2017, s. 488-495. ISBN 978-80-248-4046-8.

KOŠČÍK, Michal, Radim POLČÁK, Matěj MYŠKA a Jakub HARAŠTA. Výzkumná data a výzkumné databáze. Právní rámec zpracování a sdílení vědeckých poznatků. 1. vyd. Praha: Wolters Kluwer, 2017, 164 s. Právní monografie. ISBN 978-80-7552-952-7.

PLESCH, Martin, Marcin PAWLOWSKI a Matej PIVOLUSKA. 1-out-of-2 oblivious transfer using a flawed bit-string quantum protocol. Physical Review A. 2017, roč. 95, č. 4, s. "042324-1"-"042324-6", 6 s. ISSN 2469-9926. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevA.95.042324.

ROČEK, Aleš, Karel SLAVÍČEK, Otto DOSTÁL a Michal JAVORNÍK. A new approach to fully-reversible watermarking in medical imaging with breakthrough visibility parameters. Biomedical Signal Processing and Control. Elsevier, 2016, roč. 29, č. 7, s. 44-52. ISSN 1746-8094. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bspc.2016.05.005.

ČERMÁK, Milan, Daniel TOVARŇÁK, Martin LAŠTOVIČKA a Pavel ČELEDA. A Performance Benchmark of NetFlow Data Analysis on Distributed Stream Processing Systems. In Sema Oktug, Mehmet Ulema, Cicek Cavdar, Lisandro Zambenedetti Granville, Carlos Raniery P. dos Santos. NOMS 2016 - 2016 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium. Istanbul, Turkey: IEEE Xplore Digital Library, 2016, s. 919-924. ISBN 978-1-5090-0223-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS.2016.7502926.

FILIPOVIČ, Jiří, Jana PAZÚRIKOVÁ, Aleš KŘENEK a Vojtěch SPIWOK. Accelerated RMSD Calculation for Molecular Metadynamics. In José Évora-Gómez and José Juan Hernandéz-Cabrera. Proceedings of the 2016 European Simulation and Modelling Conference. Ghent, Belgie: EUROSIS - ETI, 2016, s. 278-280. ISBN 978-90-77381-95-3.

POLČÁK, Radim, Jakub MÍŠEK, Pavel LOUTOCKÝ, Jakub HARAŠTA, Václav STUPKA a Tomáš ABELOVSKÝ. Access to Telecommunication Data in Criminal Justice in Czech Republic and Slovakia. In Sieber, U., von zur Mühlen, N (eds.) Access to Telecommunication Data in Criminal Justice. 1. vyd. Berlin: Duncker & Humblot, 2016, s. 247-435. Strafrechtliche Forschungsberichte. ISBN 978-3-428-15143-1.

FOUSEK, Jan, Eva VÝTVAROVÁ, Adam MERTEL, Aleš CHALUPA a Eva HLADKÁ. Agent-Based Modelling And Simulation For The Geospatial Network Model Of The Roman World. Online. In International Symposium on Grids and Clouds (ISGC) 2016. Taipei, Taiwan: Proceedings of Science, 2016, s. 1-9. ISSN 1824-8039.

STUPKA, Václav. AMM and Legal Implications for the Electricity Market. Online. In Björn Johansson, Filip Vencovský. BIR 2016 Workshops and Doctoral Consortium. 1684. vyd. CEUR-WS.org, 2016. ISSN 1613-0073.

PIVOLUSKA, Matej a Martin PLESCH. An explicit classical strategy for winning a CHSHq game. New Journal of Physics. IOP publishing, 2016, roč. 18, FEB 11 2016, s. nestránkováno, 10 s. ISSN 1367-2630. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1088/1367-2630/18/2/025013.

STUPKA, Václav. Analýza datového provozu jako prevence kybernetických bezpečnostních incidentů. Data Security Management. Praha: TATE International s.r.o., 2016, roč. 2016, č. 3, s. 44-48. ISSN 1211-8737.

MAYRHOFER, Michaela Th., Petr HOLUB, Andrea WUTTE a Jan-Eric LITTON. BBMRI-ERIC: the novel gateway to biobanks. Bundesgesundheitsblatt - Gesundheitsforschung - Gesundheitsschutz. 2016, roč. 2016, s. 1-6. ISSN 1437-1588. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00103-015-2301-8.

LOUTOCKÝ, Pavel a Kamil MALINKA. Bezpečnost ICT ve vnitřních předpisech a školení zaměstnanců. Revue pro právo a technologie. Masarykova univerzita, 2016, roč. 7, č. 14, s. 45-64. ISSN 1804-5383.

VÝTVAROVÁ, Eva, Radek MAREČEK, Jan FOUSEK a Ivan REKTOR. Combining network and partial least square analyses: epilepsy case study. In 12. Mezinárodní workshop funkční magnetické rezonance, Olomouc. 2016.

RUSŇÁK, Vít, Pavel TROUBIL, Svatoslav ONDRA, Tomáš SKLENÁK, Desana DAXNEROVÁ, Eva HLADKÁ, Pavel KAJABA, Matej MINÁRIK, Peter NOVÁK, Christoph DAMM a Jaromír KALA. CoUnSiL: Collaborative Universe for Remote Interpreting of Sign Language in Higher Education. Online. In Klaus Miesenberger. Computers Helping People with Special Needs: 15th International Conference, ICCHP 2016, Linz, Austria, July 13-15, 2016, Proceedings, Part II. ICCHP 2016. Neuveden: Springer International Publishing, 2016, s. 392-399. ISBN 978-3-319-41267-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-41267-2_55.

RUSŇÁK, Vít. CoUnSiL: Videoconferencing Environment for Remote Interpreting of Sign Language in Higher Education. In Sign Languages in Tertiary Education and Scholarly Publications in Sign Languages. 2016.

KOUKAL, Pavel a Radim POLČÁK. Česko-slovenské symposium Ochranné známky a průmyslové vzory. 2016.

ČERMÁK, Milan a Pavel ČELEDA. Detecting Advanced Network Threats Using a Similarity Search. In Badonnel, Rémi and Koch, Robert and Pras, Aiko and Drašar, Martin and Stiller, Burkhard. Management and Security in the Age of Hyperconnectivity. 9701. vyd. Munich, Germany: Springer International Publishing, 2016, s. 137-141. ISBN 978-3-319-39813-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-39814-3_14.

KŘENEK, Aleš, Tomáš RAČEK a Jana PAZÚRIKOVÁ. Direct SAXS Curve Fitting with an Ensable of Conformations. In Molecular Machines 2016. 2016.

VÝTVAROVÁ, Eva, Jan FOUSEK a Michal MIKL. Dynamic connectivity. In Educational course NeuroImaging: Mapping the function and structure of brain, Brno. 2016.

MIKL, Michal, Eva VÝTVAROVÁ, Jan FOUSEK, Marek BARTOŇ, Martin GAJDOŠ, Martin LAMOŠ, Tomáš SLAVÍČEK a Radek MAREČEK. Effect of Preprocessing Pipeline on Functional Connectivity Analysis. In 22nd Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM), Geneva, Switzerland. 2016.

KOŠČÍK, Michal, Radim POLČÁK, Václav STUPKA, Matěj MYŠKA, Pavel LOUTOCKÝ a Libor KYNCL. European ICT Law 2016: Texts, Cases, Materials. 2016.

VELAN, Petr. EventFlow: Network Flow Aggregation Based on User Actions. In Sema Oktug, Mehmet Ulema, Cicek Cavdar, Lisandro Zambenedetti Granville, Carlos Raniery P. dos Santos. IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium 2016 (NOMS 2016). Istanbul, Turkey: IEEE Xplore Digital Library, 2016, s. 767-771. ISBN 978-1-5090-0222-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS.2016.7502895.

PAZÚRIKOVÁ, Jana, Aleš KŘENEK a Luděk MATYSKA. Guided Optimization Method for Fast and Accurate Atomic Charges Computation. In José Évora-Gómez and José Juan Hernandéz-Cabrera. Proceedings of the 2016 European Simulation and Modelling Conference. Ghent, Belgicko: EUROSIS - ETI, 2016, s. 267-274. ISBN 978-90-77381-95-3.

KABÁT, Milan, Vojtěch DAVID, Petr HOLUB a Martin PULEC. High-performance forward error correction: Enabling multi-gigabit flows and beyond on commodity GPU and CPU hardware in presence of packet loss. Future Generation Computer Systems. Amsterdam, The Netherlands: Elsevier Science, 2016, roč. 54, č. 1, s. 326 - 335. ISSN 0167-739X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.future.2015.04.007.

HUSÁK, Martin, Milan ČERMÁK, Tomáš JIRSÍK a Pavel ČELEDA. HTTPS Traffic Analysis and Client Identification Using Passive SSL/TLS Fingerprinting. EURASIP Journal on Information Security. 2016, roč. 2016, č. 1, s. 1-14. ISSN 2510-523X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13635-016-0030-7.

GAJDOŠ, Martin, Michal MIKL, Eva VÝTVAROVÁ a Jan FOUSEK. Impact of ROI coverage on representative signals in atlas based parcellations. In 22nd Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM), Geneva, Switzerland. 2016.

POLČÁK, Radim. Informace a data v právu. Revue pro právo a technologie. Masarykova univerzita, 2016, roč. 7, č. 13, s. 67-91. ISSN 1804-5383.

POLČÁK, Radim, Jakub MÍŠEK, Václav STUPKA, Pavel LOUTOCKÝ a Tomáš ABELOVSKÝ. Interception of electronic communications in the Czech Republic and Slovakia. 1. vyd. Brno: Masaryk University, Faculty of Law, 2016, 241 s. Publications of the Masaryk University, theoretical series, edition Scientia, File No. 573. ISBN 978-80-210-8423-0.

POLČÁK, Radim, Jakub MÍŠEK, Václav STUPKA, Pavel LOUTOCKÝ a Tomáš ABELOVSKÝ. Interception of electronic communications in the Czech Republic and Slovakia. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2016, 241 s. Spisy Právnické fakulty MU (řada teoretická), č. 573. ISBN 978-80-210-8423-0.

HELÁN, Radek, František URBAN a Karel SLAVÍČEK. Jednotka pro vyhodnocování optického inklinometru. 2016.

VÝTVAROVÁ, Eva, Jan FOUSEK a Michal MIKL. Komunitní struktura a předzpracování v sítích funkční konektivity. In 63. Společný sjezd české a slovenské společnosti pro klinickou neurofyziologii, Praha. 2016.

STUPKA, Václav. Kybernetická bezpečnost a ochrana kritických energetických infrastruktur. In 13. Letní škola aplikované informatiky Bedřichov. 2016.

KOZEL, Jiří, Andrea KÝNOVÁ, Petr KOVÁCS, Pavel BOHUMEL a Jan SIKORA. Mapová knihovna munimap. 2016.

RŮŽIČKA, Michal, Petr SOJKA a Martin LÍŠKA. Math Indexer and Searcher under the Hood: Fine-Tuning Query Expansion and Unification Strategies. Online. In Noriko Kando and Kazuaki Kishida and Makoto P. Kato and Shuhei Yamamoto. Proceedings of the 12th NTCIR Conference on Evaluation of Information Access Technologies. Tokyo: National Institute of Informatics, 2-1-2 Hitotsubashi, Chiyoda-ku, Tokyo 101-8430 Japan, 2016, s. 331-337. ISBN 978-4-86049-071-3.

KREJČÍŘ, Vlastimil. Memento – cestování časem na webu. Online. In INFORUM 2016: 22. ročník konference o profesionálních informačních zdrojích. Praha: Albertina icome Praha, 2016, s. nestránkováno, 11 s. ISSN 1801-2213.

RAČEK, Tomáš, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Aleš KŘENEK, Jana PAZÚRIKOVÁ, Stanislav GEIDL a Jaroslav KOČA. NEEMP – nástroj pro parametrizaci EEM. In ENBIK2016. 2016. ISBN 978-80-7080-960-0.

RAČEK, Tomáš, Jana PAZÚRIKOVÁ, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Stanislav GEIDL, Aleš KŘENEK, Francesco Luca FALGINELLA, Vladimír HORSKÝ, Václav HEJRET a Jaroslav KOČA. NEEMP: software for validation, accurate calculation and fast parameterization of EEM charges. Journal of Cheminformatics. London: BIOMED CENTRAL LTD, 2016, roč. 8, October, s. nestránkováno, 14 s. ISSN 1758-2946. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13321-016-0171-1.

POLČÁK, Radim. Nejdůležitější dopady všeobecného nařízení o ochraně osobních údajů (GDPR). Data Security Management. TATE International s.r.o., 2016, roč. 2016, č. 4, s. 22-26. ISSN 1211-8737.

MEDKOVÁ, Jana a Pavel ČELEDA. Network Defence Using Attacker-Defender Interaction Modelling. In Badonnel, R., Koch, R., Pras, A., Drašar, M., Stiller, B. IFIP International Conference on Autonomous Infrastructure, Management and Security. Munich, Germany: Springer International Publishing, 2016, s. 127-131. ISBN 978-3-319-39813-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-39814-3_12.

VELAN, Petr, Jana MEDKOVÁ, Tomáš JIRSÍK a Pavel ČELEDA. Network Traffic Characterisation Using Flow-Based Statistics. In Sema Oktug, Mehmet Ulema, Cicek Cavdar, Lisandro Zambenedetti Granville, Carlos Raniery P. dos Santos. IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium 2016 (NOMS 2016). Istanbul, Turkey: IEEE Xplore Digital Library, 2016, s. 907-912. ISBN 978-1-5090-0223-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS.2016.7502924.

SEDLÁŘ, Milan, Bin JI, Tomáš KRÁTKÝ, Tomáš REBOK a Rostislav HUZLÍK. Numerical and experimental investigation of three-dimensional cavitating flow around the straight NACA2412 hydrofoil. Ocean Engineering. Elsevier Ltd., 2016, roč. 123, č. 123, s. 357-382. ISSN 0029-8018. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.oceaneng.2016.07.030.

JIRSÍK, Tomáš, Milan ČERMÁK a Pavel ČELEDA. On Information Value of Top N Statistics. In 2016 6th International Conference on IT Convergence and Security (ICITCS). USA: Institute of Electrical and Electronic Engineers, 2016, s. 255-259. ISBN 978-1-5090-3764-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ICITCS.2016.7740357.

VYKOPAL, Jan a Miloš BARTÁK. On the Design of Security Games: From Frustrating to Engaging Learning. 2016.

PAZÚRIKOVÁ, Jana, Tomáš RAČEK, Stanislav GEIDL, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ a Aleš KŘENEK. Parametrizace ekvalizace elektronegativity metodou diferenciální evoluce. In ENBIK 2016. 2016.

PLANTEFÈVE, Rosalie, Igor PETERLÍK, Nazim HAOUCHINE a Stéphane COTIN. Patient-Specific Biomechanical Modeling for Guidance During Minimally-Invasive Hepatic Surgery. ANNALS OF BIOMEDICAL ENGINEERING. NEW YORK: SPRINGER, 2016, roč. 44, č. 1, s. 139-153. ISSN 0090-6964. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10439-015-1419-z.

STUPKA, Václav. Pojetí počítačového systému v trestním právu a jeho důsledky pro zajišťování elektronických důkazů. In Vybrané aspekty kybernetické kriminality. 2016.

TOVARŇÁK, Daniel. Practical Multi-pattern Matching Approach for Fast and Scalable Log Abstraction. In ICSOFT-EA 2016 - Proceedings of the 11th International Joint Conference on Software Technologies. Lisbon, Portugal: SCITEPRESS, 2016, s. 319-329. ISBN 978-989-758-194-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5220/0006006603190329.

POLČÁK, Radim. Práva k datům spravovaným veřejnými knihovnami ve světle změn informačního zákona. Knihovna. Praha: Národní knihovna ČR, 2016, roč. 27, č. 1, s. 61-73. ISSN 1801-3252.

MALINKA, Kamil a Jakub HARAŠTA. Právní aspekty sledování využití výpočetní techniky zaměstnancem. Data Security Management. Praha: Tate International, 2016, roč. 2016, č. 4, s. 44-49. ISSN 1211-8737.

POLČÁK, Radim, Jakub HARAŠTA a Václav STUPKA. Právní problémy kybernetické bezpečnosti. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, Právnická fakulta, 2016, 215 s. Spisy PF MU, řada teoretická, Editio Scientia; sv. č. 576. ISBN 978-80-210-8426-1.

POLČÁK, Radim, Jakub HARAŠTA a Václav STUPKA. Právní problémy kybernetické bezpečnosti. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2016. Spisy PF MU, řada teoretická, Editio Scientia; sv. č. 576. ISBN 978-80-210-8426-1.

HAMZÉ, Noura, Igor PETERLÍK, Stéphane COTIN a Caroline ESSERT. Preoperative trajectory planning for percutaneous procedures in deformable environments. Computerized Medical Imaging and Graphics. Elsevier, 2016, roč. 47, č. 1, s. 16-28. ISSN 0895-6111. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.compmedimag.2015.10.002.

MELICHAR, Marek, Jan HUTAŘ, Michal RŮŽIČKA, Zdeněk HRUŠKA, Zdeněk VAŠEK, Miroslav BARTOŠEK a Martin LHOTÁK. Projekt ArcLib – budování systému pro dlouhodobou archivaci digitálních dat v českých knihovnách. IT lib. Bratislava: Centrum vedecko-technických informácií SR, 2016, roč. 20, č. 2, s. 13-17. ISSN 1335-793X.

KAČINETZ, Alan a Karel SLAVÍČEK. Prototyp virtualizovatelné řídící platformy. 2016.

ČERMÁK, Milan, Tomáš JIRSÍK a Martin LAŠTOVIČKA. Real-time Analysis of NetFlow Data for Generating Network Traffic Statistics using Apache Spark. In Sema Oktug, Mehmet Ulema, Cicek Cavdar, Lisandro Zambenedetti Granville, Carlos Raniery P. dos Santos. NOMS 2016 - 2016 IEEE/IFIP Network Operations and Management Symposium. Istanbul, Turkey: IEEE Xplore Digital Library, 2016, s. 1019-1020. ISBN 978-1-5090-0223-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS.2016.7502952.

ROČEK, Aleš, Karel SLAVÍČEK a Michal JAVORNÍK. RONI Size and another Attributes of Representative Sample of Medical Images in Common Hospital Operation, Related to Securing by Watermarking Methods. In Prof. Osama Mohamed Mohamed Ahamed. International Conference on Image Processing, Production and Computer Science (ICIPCS'16). London: URENG, 2016, s. 44-51. ISBN 978-93-84422-62-2.

RYGL, Jan, Petr SOJKA, Michal RŮŽIČKA a Radim ŘEHŮŘEK. ScaleText: The Design of a Scalable, Adaptable and User-Friendly Document System for Similarity Searches : Digging for Nuggets of Wisdom in Text. In Aleš Horák, Pavel Rychlý, Adam Rambousek. Proceedings of the Tenth Workshop on Recent Advances in Slavonic Natural Language Processing, RASLAN 2016. Brno: Tribun EU, 2016, s. 79-87. ISBN 978-80-263-1095-2.

JIRSÍK, Tomáš, Milan ČERMÁK, Daniel TOVARŇÁK, Jakub Samuel PAULOVIČ a Michal ŠTEFÁNIK. Stream4Flow: Software for mining and analysis of the large volumes of network traffic. 2016.

PITNER, Tomáš, Zbyněk KOCUR, Tomáš HÉGR, Václav STUPKA a Barbora BÜHNOVÁ. Studie pro bezpečné poskytování dat z elektroměru zákazníkovi v místě spotřeby. 1. vyd. Brno: Česká sdružení regulovaných energetických společností, 2016, 88 s. (není).

SÝKORA, Martin a Karel SLAVÍČEK. Systém detekce polohy. 2016.

SÝKORA, Martin a Karel SLAVÍČEK. Systém orientace antény satelitního terminálu. 2016.

MACHAČ, Zdeněk, Petr LÁZNICKÝ, Jaromír OCELKA a Pavel BOHUMEL. Telefonní síť MU. 2016.

KNÍŽEK, Jiří, Pavel BOUCHAL, Vendula PÁRALOVÁ, Bořivoj VOJTĚŠEK, Rudolf NENUTIL, Ladislav BERÁNEK a Martin KUBA. Tests of Hypotheses in a Set of LC-MS Profiles. International Journal of Engineering and Future Technology. 2016, roč. 2, č. 1, s. 45-54. ISSN 2455-6432.

KNÍŽEK, Jiří, Jiří ŠINDELÁŘ, Pavel BOUCHAL, Bořivoj VOJTĚŠEK, Rudolf NENUTIL, Ladislav BERÁNEK a Martin KUBA. Tests of Hypotheses in a Set of Spectral Courses Alias Marker Statistics. Int J Stat Econ. 2016, roč. 17, č. 1, s. 50-72. ISSN 0975-556X.

VÝTVAROVÁ, Eva, Jan FOUSEK, Radek MAREČEK, Martin GAJDOŠ, Marek BARTOŇ, Martin LAMOŠ, Tomáš SLAVÍČEK a Michal MIKL. The effects of different preprocessing pipelines on network measures of functional connectivity. In Resting State and Brain Connectivity, Austria, Vienna. 2016.

ŠŤAVOVÁ, Vlasta, Václav MATYÁŠ a Kamil MALINKA. The Challenge of Increasing Safe Response of Antivirus Software Users. In Jan Kofroň, Tomáš Vojnar. Mathematical and Engineering Methods in Computer Science. Švýcarsko: Springer International Publishing,, 2016, s. 133-143. ISBN 978-3-319-29816-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-29817-7_12.

PIVOLUSKA, Matej, Marcin PAWLOWSKI a Martin PLESCH. Tight bound on the classical value of generalized Clauser-Horne-Shimony-Holt games. Physical Review A. 2016, roč. 94, č. 2, s. 022338-22342. ISSN 2469-9926. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevA.94.022338.

RUSŇÁK, Vít, Lukáš RUČKA a Petr HOLUB. Toward Natural Multi-User Interaction in Advanced Collaborative Display Environments. Future Generation Computer Systems. Amsterdam, The Netherlands: Elsevier Science, 2016, roč. 54, January 2016, s. 313-325. ISSN 0167-739X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.future.2015.03.019.

MERINO-MARTINEZ, Roxana, Loreana NORLIN, David VAN ENCKEVORT, Gabriele ANTON, Simone SCHUFFENHAUER, Kaisa SILANDER, Linda MOOK, Petr HOLUB, Raffael BILD, Morris SWERTZ a Jan-Eric LITTON. Towards Global Biobank Integration by Implementation of the Minimum Information About Biobank data Sharing (MIABIS 2.0 Core). Biopreservation and Biobanking. 2016. ISSN 1947-5535. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1089/bio.2015.0070.

BARTOŠEK, Miroslav. Uchování digitálního dědictví a systém Archivematica. ITlib. Infotmačné technológie a knižnice. Bratislava: Centrum vedecko-technických informácií SR, 2016, roč. 2016, č. 2, s. 32-35. ISSN 1335-793X.

JAKUBIČKA, Martin a Michal PROCHÁZKA. Univerzitní systém pro správu osobních digitálních certifikátů. Plzeň, Česká republika: Západočeská univerzita v Plzni, 2016, s. 10-18, 8 s. ISBN 978-80-261-0625-8.

BARTOŠEK, Miroslav. Vývoj postoje k vědeckým informacím a modelu otevřeného přístupu. In Petra Dědičová, Pavla Rygelová, Jiří Marek, Jan Skůpa. Otevřený přístup k vědeckým informacím : současný stav v České republice a ve světě. První vydání. Brno: Nakladatelství VUTIUM, 2016, s. 14-22. ISBN 978-80-214-5282-4.

STUPKA, Václav. Zajištění a uchování dat. In České právo a informační technologie 2016. 2016.

VELAN, Petr, Milan ČERMÁK, Pavel ČELEDA a Martin DRAŠAR. A Survey of Methods for Encrypted Traffic Classification and Analysis. International Journal of Network Management. John Wiley & Sons, Ltd., 2015, roč. 25, č. 5, s. 355-374. ISSN 1055-7148. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/nem.1901.

KŘENEK, Aleš, Karel KUBÍČEK, Richard ŠTEFL a Jiří FILIPOVIČ. Accurate Fitting SAXS Curves with NMR Structure Ensembles. Online. In Simon Lin, Vicky Huang. Proceedings of International Symposium on Grids and Clouds 2015. Pissa: Proceedings of Science, 2015, s. nestránkováno, 9 s. ISSN 1824-8039.

VYKOPAL, Jan. Break your network. Responsibly. 2015.

STACHOŇ, Zdeněk, Jiří KOZEL a Jan RUSSNÁK. Certifikovaná metodika pro tvorbu metadat pro indexy mapových děl. 2015.

SOKOL, Pavol, Martin HUSÁK a František LIPTÁK. Deploying Honeypots and Honeynets: Issue of Privacy. In 2015 10th International Conference on Availability, Reliability and Security. Toulouse: IEEE, 2015, s. 397-403. ISBN 978-1-4673-6590-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ARES.2015.91.

BARTÁK, Miloš a Jan VYKOPAL. Detekce zranitelností a útoků pomocí NetFlow dat, validace zranitelností na systému FlowMon. Brno: INVEA-TECH a.s., 2015, 25 s. 20151113.

KOZEL, Jiří, Pavel BOHUMEL, Petr KOVÁCS a Andrea KÝNOVÁ. GIS of Traditional Folk Culture. Geomatics Workbooks. Politecnico di Milano, 2015, roč. 12, July 2015, s. 113-120. ISSN 1591-092X.

PUŠ, Viktor, Petr VELAN, Lukáš KEKELY, Jan KOŘENEK a Pavel MINAŘÍK. Hardware Accelerated Flow Measurement of 100G Ethernet. Online. In Remi Badonnel, Jin Xiao, Shingo Ata, Filip De Turck, Voicu Groza, Carlos Raniery P. dos Santos. IFIP/IEEE International Symposium on Integrated Network Management (IM 2015). Ottawa, Canada: IEEE Xplore Digital Library, 2015, s. 1147-1148. ISBN 978-3-901882-76-0.

VELAN, Petr a Viktor PUŠ. High-Density Network Flow Monitoring. Online. In Remi Badonnel, Jin Xiao, Shingo Ata, Filip De Turck, Voicu Groza, Carlos Raniery P. dos Santos. IFIP/IEEE International Symposium on Integrated Network Management (IM 2015). Ottawa, Canada: IEEE Xplore Digital Library, 2015, s. 996-1001. ISBN 978-3-901882-76-0.

GEIDL, Stanislav, Tomáš BOUCHAL, Tomáš RAČEK, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Václav HEJRET, Aleš KŘENEK, Ruben ABAGYAN a Jaroslav KOČA. High-quality and universal empirical atomic charges for chemoinformatics applications. Journal of Cheminformatics. London: BIOMED CENTRAL LTD, 2015, roč. 7, DEC, s. 1-10. ISSN 1758-2946. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13321-015-0107-1.

TOMÁŠ, Martin, Tomáš REBOK a Christos EFSTATHIOU. Iterative Optimization of a Multi-compartmental Air Quality Modelling System. In Jan Kofroň and Tomáš Vojnar. Tenth Doctoral Workshop on Mathematical and Engineering Methods in Computer Science (MEMICS 2015). první. Brno: MEMICS 2015, 2015, s. 70-81. ISBN 978-80-214-5254-1.

ČELEDA, Pavel, Jakub ČEGAN, Jan VYKOPAL a Daniel TOVARŇÁK. KYPO – A Platform for Cyber Defence Exercises. Online. In STO-MP-MSG-133: M&S Support to Operational Tasks Including War Gaming, Logistics, Cyber Defence. Munich (Germany): NATO Science and Technology Organization, 2015, s. nestránkováno, 12 s. ISBN 978-92-837-2020-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.14339/STO-MP-MSG-133-08-doc.

ČEGAN, Jakub, Pavel ČELEDA, Tomáš JIRSÍK, Tomáš PLESNÍK, Michal PROCHÁZKA, Petr VELAN, Jan VYKOPAL, Martin VIZVÁRY, Radek OŠLEJŠEK, Zdenek EICHLER, Dalibor TOTH, Milan ČERMÁK, Jan SOUKAL, Tomáš REBOK, Václav RAČANSKÝ, Ivo NUTÁR a Dušan LAGO. KYPO - Kybernetický polygon. 2015.

DOSTÁL, Otto, Otto DOSTÁL a Michal JAVORNÍK. Legislativní aspekty dalšího rozvoje v oblasti telemedicíny. In XI. mezinárodní kongres informačních technologií ve zdravotnictví. 2015.

ČEGAN, Jakub a Martin VIZVÁRY. Lessons Learned from KYPO – Cyber Exercise & Research Platform Project. Online. In Milan Jirsa, Josef Kaderka, Ladislav Hagara, Jaroslav Dočkal. Security and Protection of Information. Brno: University of Defence, 2015, s. 15-26. ISSN 2336-5587.

MALACH, Roman, Daniel DRÁPALA, Roman DOUŠEK, Alena KŘÍŽOVÁ, Martina PAVLICOVÁ, Miroslav VÁLKA, Jitka SPURNÁ, Andrea KÝNOVÁ, Petr KOVÁCS, Pavel BOHUMEL, Jiří KOZEL, Jana MALECKÁ, Marie NOVOTNÁ, Terézia GABRHELOVÁ, Anna HORÁKOVÁ, Daniela KOSTRHOUNOVÁ, Veronika KUTHANOVÁ, Barbora MACHOVÁ, Eva ŠIPÖCZOVÁ a Barbora VALEŠOVÁ. Mapa bibliografických informací tradiční lidové kultury. 2015.

TROUBIL, Pavel, Hana RUDOVÁ a Petr HOLUB. Multicast Routing for High-Quality Multimedia Environments: Deployment and New Problems. Online. In Ingo Schwab, Leo van Moergestel, Gil Gonçalves. INTELLI 2015, The Fourth International Conference on Intelligent Systems and Applications. USA: IARIA, 2015, s. 61-65. ISBN 978-1-61208-437-4.

RUSŇÁK, Vít, Lukáš RUČKA, Pavel KAJABA, Desana DAXNEROVÁ, Matej MINÁRIK, Jiří KAREŠ, Michal BÁBEL a Petr HOLUB. MUSE framework 2.0. 2015.

HUSÁK, Martin, Milan ČERMÁK, Tomáš JIRSÍK a Pavel ČELEDA. Network-based HTTPS Client Identification Using SSL/TLS Fingerprinting. In 2015 10th International Conference on Availability, Reliability and Security. Toulouse: IEEE, 2015, s. 389-396. ISBN 978-1-4673-6590-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ARES.2015.35.

SPIWOK, Vojtěch, Pavel OBORSKÝ, Jana PAZÚRIKOVÁ, Aleš KŘENEK a Blanka KRÁLOVÁ. Nonlinear vs. linear biasing in Trp-cage folding simulations. Journal of the chemical society. Faraday transactions II, Journal of chemical physics. London: Chemical society, 2015, roč. 142, č. 11, s. nestránkováno, 8 s. ISSN 0021-9606. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1063/1.4914828.

HELÁN, Radek, František URBAN a Karel SLAVÍČEK. Optický vláknový inklinometr s Braggovými mřížkami. 2015.

FILIPOVIČ, Jiří, Matúš MADZIN, Jan FOUSEK a Luděk MATYSKA. Optimizing CUDA code by kernel fusion: application on BLAS. The Journal of Supercomputing. Springer US, 2015, roč. 71, č. 10, s. 3934-3957. ISSN 0920-8542. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s11227-015-1483-z.

POLČÁK, Radim, Zdeněk ŘÍHA a Kamil MALINKA. Právní aspekty interních instrukcí – část II. Data Security Management. Praha: TATE International s.r.o., 2015, XIX., 3., s. 36-38. ISSN 1211-8737.

POLČÁK, Radim, Zdeněk ŘÍHA a Kamil MALINKA. Právní aspekty interních směrnic – část I. Data Security Management. Praha: TATE International s.r.o., 2015, XIX., 2., s. 36-39. ISSN 1211-8737.

PROCHÁZKA, Filip, Tomáš REBOK a Aleš FARDA. První návrh cílové infrastruktury pro provoz systému IRIS. 2015.

NGUYEN, Filip, Tomáš REBOK, Richard LUDVIGH a Václav TUNKA. Ruby Benchmark Suite using Docker. Online. In M. Ganzha, L. Maciaszek, M. Paprzycki. Annals of Computer Science and Information Systems, Volume 5. 2015. vyd. Poland: IEEE, 2015, s. 947-952. ISBN 978-83-60810-66-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.15439/2015F99.

HUSÁK, Martin, Petr VELAN a Jan VYKOPAL. Security Monitoring of HTTP Traffic Using Extended Flows. In 2015 10th International Conference on Availability, Reliability and Security. Toulouse: IEEE, 2015, s. 258-265. ISBN 978-1-4673-6590-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ARES.2015.42.

ČEGAN, Jakub, Pavel ČELEDA, Tomáš JIRSÍK, Tomáš PLESNÍK, Michal PROCHÁZKA, Petr VELAN, Jan VYKOPAL, Martin VIZVÁRY, Milan ČERMÁK, Jan SOUKAL, Tomáš REBOK, Ivo NUTÁR a Dušan LAGO. Software pro konfiguraci a monitorování virtuálního prostředí KYPO. 2015.

OŠLEJŠEK, Radek, Zdenek EICHLER, Dalibor TOTH, Pavel ČELEDA, Jakub ČEGAN, Tomáš JIRSÍK, Tomáš PLESNÍK, Michal PROCHÁZKA, Petr VELAN, Martin VIZVÁRY a Jan VYKOPAL. Software pro vizualizaci virtuálního prostředí KYPO. 2015.

STACHOŇ, Zdeněk, Milan KONEČNÝ a Jiří KOZEL. Specializovaná mapa s odborným obsahem - Klady listů vybraných mapových děl na území ČR. 2015.

PAVOL, Sokol, Kleinová LENKA a Martin HUSÁK. Study of attack using honeypots and honeynets lessons learned from time-oriented visualization. Online. In EUROCON 2015 - International Conference on Computer as a Tool (EUROCON), IEEE. Salamanca, Spain: IEEE, 2015, s. 225-230. ISBN 978-1-4799-8569-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/EUROCON.2015.7313713.

JANČA, Radim, Kamil MALINKA a Vlasta ŠŤAVOVÁ. Systém pro distribuci dotazníků v počítačových učebnách. 2015.

KOUŘIL, Daniel, Marcel POUL a Michal PROCHÁZKA. Using PKI to Provide Credential Delegation in non Web-based Federations. In Proceedings of the International Conference on Information Science and Applications, Lecture Notes in Electrical Engineering. Pattaya, Thailand: Springer Berlin Heidelberg, 2015, s. 525-532. ISBN 978-3-662-46577-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-662-46578-3_62.

PŘENOSIL, Václav, František CVACHOVEC, Pavel ČELEDA a Martin VEŠKRNA. Uspořádání vícecestného dvouparametrického spektrometrického systému. 2015.

SLOVÁK, Petr, Petr HOLUB a Pavel TROUBIL. Videokonferenční prostředí pro komunikaci vzdálených skupin a způsob komunikace vzdálených skupin v systému videokonferenčního prostředí. 2015. Patent. Číslo: 305294. Vydavatel: Úřad průmyslového vlastnictví. Místo vydání: Praha, ČR. Název vlastníka: Masarykova Univerzita & CESNET. Datum registrace: 3. 6. 2009. Datum přijetí: 10. 6. 2015.

DOSTÁL, Otto a Petr BĚLÍK. Výzkum a vývoj integrace kamerových systémů do medicínského prostředí (C-MED). 2015.

DOSTÁL, Otto a Petr BĚLÍK. Výzkum a vývoj integrace kamerových systémů do medicínského prostředí (C-MED). 2015.

JAVORNÍK, Michal, Otto DOSTÁL a Aleš ROČEK. Watermarking in Regional Medical Imaging. Online. In Valeri Mladenov, Elias Giacoumidis, Jinlong Wei. Proceedings of the 13th International Conference on Data Networks, Communications, Computers. Hungary: World Scientific and Engineering Academy and Society, 2015, s. 222-226. ISBN 978-1-61804-355-9.

PROCHÁZKA, Michal. Závěrečná zpráva STORK e-Academia pilot. Brno: Masarykova univerzita, 2015, 29 s.

JIRSÍK, Tomáš, Martin HUSÁK, Pavel ČELEDA a Zdenek EICHLER. Cloud-based Security Research Testbed: A DDoS Use Case. In Hanan Lutfiyya and Piotr Cholda. Proceedings of the Network Operations and Management Symposium (NOMS 2014). Krakow, Poland: IEEE Xplore Digital Library, 2014, s. 1-2. ISBN 978-1-4799-0912-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS.2014.6838272.

KOUŘIL, Daniel, Tomáš REBOK, Tomáš JIRSÍK, Jakub ČEGAN, Martin DRAŠAR, Martin VIZVÁRY a Jan VYKOPAL. Cloud-based Testbed for Simulation of Cyber Attacks. In Hanan Lutfiyya and Piotr Cholda. Proceedings of the Network Operations and Management Symposium (NOMS 2014). Krakow, Poland: IEEE Xplore Digital Library, 2014, s. 1-6. ISBN 978-1-4799-0913-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/NOMS.2014.6838298.

ČERMÁK, Milan, Pavel ČELEDA a Jan VYKOPAL. Detection of DNS Traffic Anomalies in Large Networks. In Yvon Kermarrec. Advances in Communication Networking, Lecture Notes in Computer Science, Vol. 8846. Heidelberg: Springer International Publishing, 2014, s. 215-226. ISBN 978-3-319-13487-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-13488-8_20.

PIVOLUSKA, Matej a Martin PLESCH. Device Independent Random Number Generation. Acta physica slovaca. Bratislava: Institute of Physics, SAS, 2014, roč. 64, č. 6, s. 601-665. ISSN 0323-0465. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.2478/apsrt-2014-0006.

PLESCH, Martin a Matej PIVOLUSKA. Device-independent randomness amplification with a single device. Physics Letters A. Elsevier, 2014, roč. 378, č. 40, s. 2938-2944. ISSN 0375-9601. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.physleta.2014.08.007.

BOUDA, Jan, M. PAWLOWSKI, Matej PIVOLUSKA a Martin PLESCH. Device-independent randomness extraction for arbitrarily weak min-entropy source. Online. In Gruneisen, MT Dusek, M Rarity, JG Lewis, KL Hollins, RC Merlet, TJ Toet, A. EMERGING TECHNOLOGIES IN SECURITY AND DEFENCE II AND QUANTUM-PHYSICS-BASED INFORMATION SECURITY III. BELLINGHAM: SPIE-INT SOC OPTICAL ENGINEERING, 2014, s. "SPIE"-"5", 6 s. ISBN 978-1-62841-317-5. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1117/12.2071568.

BOUDA, Jan, Marcin PAWLOWSKI, Matej PIVOLUSKA a Martin PLESCH. Device-independent randomness extraction from an arbitrarily weak min-entropy source. Phys. Rev. A. USA: The American Physical Society, 2014, roč. 90, č. 3, s. 032313-32318. ISSN 1050-2947. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevA.90.032313.

SLAVÍČEK, Karel, Otto DOSTÁL a Vladimír SCHINDLER. DWY Time Series Decomposition Model. In International Conference on Software, Electronics & Industrial Engineering. Pattaya, Thailand: Planetary Scientific Research Centre, 2014, s. 27-30. ISBN 978-93-84468-10-1.

DRAŠAR, Martin, Tomáš JIRSÍK a Martin VIZVÁRY. Enhancing Network Intrusion Detection by Correlation of Modularly Hashed Sketches. In Sperotto, Anna and Doyen, Guillaume and Latré, Steven and Charalambides, Marinos and Stiller, Burkhard. Monitoring and Securing Virtualized Networks and Services, Lecture Notes in Computer Science, Vol. 8508. Berlin: Springer Berlin Heidelberg, 2014, s. 160-172. ISBN 978-3-662-43861-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-662-43862-6_19.

JIRSÍK, Tomáš a Pavel ČELEDA. Enhancing Network Security: Host Trustworthiness Estimation. In Anna Sperotto, Guillaume Doyen, Steven Latré, Marinos Charalambides, Burkhard Stiller. Monitoring and Securing Virtualized Networks and Services, Lecture Notes in Computer Science, Vol. 8508. Heidelberg: Springer Berlin / Heidelberg, 2014, s. 63-68. ISBN 978-3-662-43861-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-662-43862-6_8.

HOFSTEDE, Rick, Pavel ČELEDA, Brian TRAMMELL, Idilio DRAGO, Ramin SADRE, Anna SPEROTTO a Aiko PRAS. Flow Monitoring Explained: From Packet Capture to Data Analysis With NetFlow and IPFIX. IEEE COMMUNICATIONS SURVEYS AND TUTORIALS. PISCATAWAY: IEEE-INST ELECTRICAL ELECTRONICS ENGINEERS INC, 2014, roč. 16, č. 4, s. 2037-2064. ISSN 1553-877X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/COMST.2014.2321898.

PLESCH, Martin, Oscar DAHLSTEN, John GOOLD a Vlatko VEDRAL. Maxwell's Daemon: Information versus Particle Statistics. Scientific Reports. LONDON: Nature Publishing Group, 2014, roč. 4, č. 1, s. 1-20, 7 s. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/srep06995.

VELAN, Petr a Pavel ČELEDA. Next Generation Application-Aware Flow Monitoring. In Anna Sperotto, Guillaume Doyen, Steven Latré, Marinos Charalambides, Burkhard Stiller. Monitoring and Securing Virtualized Networks and Services, Lecture Notes in Computer Science, Vol. 8508. Heidelberg: Springer Berlin / Heidelberg, 2014, s. 173-178. ISBN 978-3-662-43861-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-662-43862-6_20.

DRAŠAR, Martin, Martin VIZVÁRY a Jan VYKOPAL. Similarity as a central approach to flow-based anomaly detection. International Journal of Network Management. John Wiley & Sons, Ltd., 2014, roč. 24, č. 4, s. 318-336. ISSN 1055-7148. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/nem.1867.

GHAFIR, Ibrahim, Jakub SVOBODA a Václav PŘENOSIL. Tor-based Malware and Tor Connection Detection. In Proceedings of International Conference on Frontiers of Communications, Networks and Applications. Kuala Lumpur, Malaysia: IET, 2014, s. 1-6. ISBN 978-1-78561-072-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1049/cp.2014.1411.

SLAVÍČEK, Karel, Otto DOSTÁL, Michal JAVORNÍK, Aleš ROČEK, Vladimír ZATLOUKAL a Petr SEDLÁK. Zálohovací a dohledový systém pro InstantPACS. 2014.

DOSTÁL, Otto, Karel SLAVÍČEK, Vladimír SCHINDLER, Daniel TOVARŇÁK, Filip PROCHÁZKA a Miroslav GURIČAN. Analýza vývoje telekomunikací pro ČEZ Distribuční služby, s.r.o. Brno: ČEZ Distribuční služby, s.r.o., 2013, 55 s. Výzkumná zpráva 112013.

PLESCH, Martin, Oscar DAHLSTEN, John GOOLD a Vlatko VEDRAL. Comment on “Quantum Szilard Engine”. Physical Review Letters. New York: American Physical Society, 2013, roč. 111, č. 18, s. 188901. ISSN 0031-9007. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevLett.111.188901.

JAVORNÍK, Michal, Karel SLAVÍČEK a Otto DOSTÁL. Integration Concept in Regional Medical Imaging. In Joyce deng. Koncept integrace regionálního zpracování medicínských obrazových informací. Singapore: IACSIT Press, 2013, s. 26-31. ISBN 978-981-07-8391-4.

SLAVÍČEK, Karel, Vladimír SCHINDLER, Otto DOSTÁL a Martin SÝKORA. Kalman filter improvement for gyroscopic mouse movement smoothing. In Z. Thaweesak, P.S. Sandhu. IIE Int'l Proceedings of International Conference on Research in Science, Engineering and Technology. Kuala Lumpur: International Institute of Engineers, 2013, s. 43-48. ISBN 978-93-82242-47-5.

SLAVÍČEK, Karel, Michal JAVORNÍK a Otto DOSTÁL. MEDIMED Shared Regional PACS Center. In Dongqing Wang. COMPUTED TOMOGRAPHY. 1. vyd. Croatia: InTech, 2013, s. 43-62. ISBN 978-953-51-1102-3.

BOUDA, Jan, Matej PIVOLUSKA, Martin PLESCH a Colin WILMOTT. Encryption with weakly random keys using a quantum ciphertext. In Proceedings of The 12th Asian Conference on Quantum Information Science (AQIS 2012), 2012. 2012.

SLAVÍČEK, Karel, Michal JAVORNÍK a Otto DOSTÁL. Extension of the Shared Regional PACS CenterMeDiMed to Smaller Healthcare Institutions. In Pascal Lorenz; Tibor Gyires; Iwona Pozniak-Koszalka. The Eleventh International Conference on Networks. Saint Gilles, Reunion Island: IARIA, 2012, s. 83-87. ISBN 978-1-61208-183-0.

DOSTÁL, Otto, Karel SLAVÍČEK, Michal JAVORNÍK a Pavel BUDIŠ. ICT Systems Monitoring. Saarbrucken: LAMBERT Academic Publishing, 2012, 167 s. ISBN 978-3-8473-7231-8.

BOUDA, Jan, Matej PIVOLUSKA a Martin PLESCH. Improving the Hadamard extractor. Theoretical Computer Science. Amsterdam: Elsevier, 2012, roč. 459, 9 Nov 2012, s. 69-76. ISSN 0304-3975. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.tcs.2012.07.030.

JAVORNÍK, Michal, Karel SLAVÍČEK a Otto DOSTÁL. Sharing of knowledge and resources in regional medical imaging. In 2nd International Conference on Biomedical Engineering & Assistive Technologies. Jalandhar: Dr. B. R. AMBEDKAR NATIONAL INSTITUTE OF TECHNOLOGY JALANDHAR – 144 011, India, 2012, s. 304-308. ISBN 978-81-925454-1-7.

BOUDA, Jan, Matej PIVOLUSKA, Martin PLESCH a Colin WILMOTT. Weak randomness completely trounces the security of QKD. In Proceedings of The 12th Asian Conference on Quantum Information Science (AQIS 2012). 2012.

BOUDA, Jan, Matej PIVOLUSKA, Martin PLESCH a Colin WILMOTT. Weak randomness seriously limits the security of quantum key distribution. Physical Review A. New York: American physical society, 2012, roč. 86, č. 6, s. 0623081-0623085. ISSN 1050-2947. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevA.86.062308.