Publication Records

MLČŮCHOVÁ, Natálie, Kateřina VYKLICKÁ, Michaela RUČKOVÁ, Sabina ŠEVČÍKOVÁ, Jan BÖHM, Monika VLACHOVÁ, Jiří DOLINA, Lumír KUNOVSKÝ, Radek KROUPA, Zdeněk PAVLOVSKÝ, Tereza DEISSOVÁ, Lydie IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ, Ondřej SLABÝ, Zdeněk KALA and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Asociace tkáňové exprese miR-196a s Barrettovým jícnem a adenokarcinomem jícnu (Association of tissue expression of miR-196a with Barrett's esophagus and esophageal adenocarcinoma). In ONCO Prague, 2023. 2023.

VACULOVÁ, Jitka, Lumír KUNOVSKÝ, Zdeněk KALA, Radek KROUPA, Jiří DOLINA, Vladimír PROCHÁZKA, Tomáš GROLICH, Zdeněk PAVLOVSKÝ, Natálie MLČŮCHOVÁ, Terezie SLÁMOVÁ, Petra BRENEROVÁ, Jan BÖHM, Petr ANDRLA, V. NAVRATIL, O. URBAN, T. HARUSTIAK, R. LISCHKE, Tereza DEISSOVÁ, Jan LOCHMAN, Lydie IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ, Ondřej SLABÝ and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Association of relative abundance of Helicobacteraceae in the stomach in patients with esophageal adenocarcinoma. In ESGE Days 2023. 2023. ISSN 0013-726X. Available from: https://dx.doi.org/10.1055/s-0043-1765429.

VYKLICKÁ, Kateřina, Jan BÖHM, Petra BRENEROVÁ, Břetislav LIPOVÝ and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Bacteriome of bronchoalveolar lavage in patients with inhalation injury during their hospitalization - a pilot study. In World of Microbiome. 2023.

MARINČÁK VRANKOVÁ, Zuzana, Petra BRENEROVÁ, Lenka BODOKYOVÁ, Jan BÖHM and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Bacteriomes of the dorsum of the tongue in children undergoing orthodontic treatment in relation to the mouth breathing. In Targeting Microbiota, Venice. 2023.

BARTOŠ, Michal, Milan URÍK, Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ, Lucie BUREŠOVÁ, Pavla HOLOCHOVÁ and eva BUDÍNSKÁ. Bakteriom středního ucha u dětí a mladých dospělých s retrakční kapsou a cholesteatomem (Bacterioma of the middle ear in children and young adults with retraction pocket and cholesteatoma). In Otologické dny. 2023.

MLČŮCHOVÁ, Natálie, Terezie SLÁMOVÁ, Petra BRENEROVÁ, Tereza DEISSOVÁ, Jan BÖHM, Lumír KUNOVSKÝ, Radek KROUPA, Jiří DOLINA, Vladimír PROCHÁZKA, Tomáš GROLICH, Jitka VACULOVÁ, Petr ANDRLA, Vít NAVRÁTIL, Ondřej URBAN, Tomáš HARUŠTIAK, Robert LISCHKE, Lydie IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ, Ondřej SLABÝ, Zdeněk KALA, Eva BUDINSKÁ and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Comparison of sequencing analyses targeting the V1/V2 and V3/V4 regions in the 16S rDNA gene – analysis of bacteriome in oral swabs and esophageal tissues. In Biologické dny, 2023. 2023.

BUJŇÁKOVÁ, Dobroslava, Katarína KUCKOVÁ, Zora VÁRADYOVÁ, Iveta PLACHÁ, Viola STROMPFOVÁ, Jan BÖHM, Lenka KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ and Klaudia ČOBANOVÁ. Effects of Dietary Zinc and/or an Herbal Mixture on Intestinal Microbiota and Barrier Integrity in Lambs. Agriculture. MDPI, 2023, vol. 13, No 9, p. 1-13. ISSN 2077-0472. Available from: https://dx.doi.org/10.3390/agriculture13091819.

KLVAŇOVÁ, Eva, Petra VÍDEŇSKÁ, Lucie BUREŠOVÁ, Milan URÍK, Soňa SMETANOVÁ, Stanislav SMATANA, Roman PROKEŠ, Barbara LÁNÍČKOVÁ, Eva BUDINSKÁ, Jana KLÁNOVÁ and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Enrichment of human nasopharyngeal bacteriome with bacteria from dust after short-term exposure to indoor environment. In Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2023.

VYDRÁŘ, David, Svatava SNOPKOVÁ, Radek SVAČINKA, Petr HUSA, Lenka KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ, Jan BÖHM and Petr HUSA. Gut microbiota changes - dysbiotic senescence pattern in the context of viral suppression. In EACS 2023. 2023.

BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ, Petra, Eva KLVAŇOVÁ, Michal BARTOŠ, Milan URÍK, Zuzana MARINČÁK VRANKOVÁ, Pavel HORNÍK, Petra BRENEROVÁ, Lenka BODOKYOVÁ, Pavla HOLOCHOVÁ, Jana VRZALOVÁ, Jan BÖHM, Vojtěch BARTOŇ, Petra RŮŽIČKOVÁ and Jana KLÁNOVÁ. Laboratoře analýzy mikrobiomu - ušní, nasální a orální bakteriom (Laboratories for microbiome analysis - ear, nasal, and oral bacteriome). In Otologický den. 2023.

SNOPKOVÁ, Svatava, Radek SVAČINKA, Petr HUSA, Lenka KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ, Jan BÖHM and Petr HUSA. Luminální mikrobiota u lidí žijících s HIV – deplece producentů SCFA (Luminal microbiota in people living with HIV - depletion of SCFA producers). In KMINE 2023 – IX. Kongres klinické mikrobiologie, infekčních nemocí a epidemiologie. 2023.

GACHOVÁ, Daniela, Zdeněk DANĚK, Ctirad MACHÁČEK, Soňa SMETANOVÁ, Petr ANDRLA, Eva BUDINSKÁ and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Orální bakteriom u pacientů s dlaždicobuněčným karcinomem dle stavu jejich dentice: pilotní studie (Oral bacterioma in patients with squamous cell carcinoma based on their gingival status: a pilot study). In ONCO Prague, 2023. 2023.

HUSA, Petr, Petr HUSA, Svatava SNOPKOVÁ, David VYDRÁŘ, Lenka KOSEČKOVÁ MICENKOVÁ and Jan BÖHM. Střevní mikrobiota u splenektomovaných pacientů (Intestinal microbiota after splenectomy). In Kongres klinické mikrobiologie, infekčního lékařství a epidemiologie (KMINE). 2023.

PIVRNCOVÁ, Eliška, Iva KOTÁSKOVÁ, Lucie BUREŠOVÁ, Lenka ANDRÝSKOVÁ, Pavel PILER, Petr JANKŮ, Ivo BOREK, Jana KLÁNOVÁ, Petra VÍDEŇSKÁ, Eva BUDINSKÁ and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. The effect of intrapartum antibiotics prophylaxis on neonatal gut and oral bacteriome. In RECETOX PhD Conference 2023. 2023.

PIVRNCOVÁ, Eliška, Iva KOTÁSKOVÁ, Lucie BUREŠOVÁ, Lenka ANDRÝSKOVÁ, Pavel PILER, Petr JANKŮ, Ivo BOREK, Jana KLÁNOVÁ, Petra VÍDEŇSKÁ, Eva BUDINSKÁ and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. The effect of intrapartum antibiotics prophylaxis on oral bacteriome in neonates in the first week of theri life - i pilot study. In World of Microbiome. 2023.

BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ, Petra, Natálie MLČŮCHOVÁ, Jan BÖHM, Petra BRENEROVÁ, Vojtěch BARTOŇ, Adam MAJER, Zdeněk PAVLOVSKÝ, Lumír KUNOVSKÝ, Radek KROUPA, Jiří DOLINA, Ondřej URBAN, Vít NAVRÁTIL, Tomáš HARUŠTIAK, Robert LISCHKE, Tomáš GROLICH, Vladimír PROCHÁZKA, Lydie IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ, Martina ZAPLETALOVÁ, Jan LOCHMAN, Ondřej SLABÝ, Eva BUDINSKÁ and Zdeněk KALA. Transcriptomic analysis of esophageal tissues and potential biomarkers for differential diagnostics of Barrett´s mucosa and esophageal adenocarcinoma. In Cancer Science, 2023. 2023.

BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ, Petra, Petra BRENEROVÁ, Pavla HOLOCHOVÁ, Jana VRZALOVÁ, Vojtěch BARTOŇ, Jan BÖHM, Eva BUDINSKÁ, Petra PŘIBYLOVÁ, Petra RŮŽIČKOVÁ, Jana KLÁNOVÁ and Břetislav LIPOVÝ. Výzkumná infrastruktura RECETOX – metagenomické analýzy a hojení ran (Research infrastructure RECETOX - metagenomic analyses and wound healing). In III. Česko - Slovenský kongres mezioborové přístupy hojení ran. 2023.

VYKLICKÁ, Kateřina, Jan BÖHM, Petr ANDRLA, Eva BUDINSKÁ, Břetislav LIPOVÝ and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. 16S rDNA sequencing analysis of low-abundance samples spiked with bacterial mock community. In III. ČESKO-SLOVENSKÝ KONGRES MEZIOBOROVÉ PŘÍSTUPY V HOJENÍ RAN. 2023.

CVANOVÁ, Michaela, Filip RŮŽIČKA, Martina KUKLETOVÁ, Břetislav LIPOVÝ, Daniela GACHOVÁ, Lydie IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ, Zdeněk DANĚK, Veronika HOLÁ, Michaela BARTOŠOVÁ, Jiří JARKOVSKÝ, Ladislav DUŠEK and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Candida dubliniensis and Candida albicans associated with early childhood caries in preschool children - a case-control study. In ESPID 2022. 2022.

CVANOVÁ, Michaela, Filip RŮŽIČKA, Martina KUKLETOVÁ, Břetislav LIPOVÝ, Daniela GACHOVÁ, Lydie IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ, Zdeněk DANĚK, Veronika HOLÁ, Michaela BARTOŠOVÁ, Jiří JARKOVSKÝ, Ladislav DUŠEK and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Candida species and selected behavioral factors co-associated with severe early childhood caries: Case-control study. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. Lausanne: Frontiers, 2022, vol. 12, July 2022, p. 1-15. ISSN 2235-2988. Available from: https://dx.doi.org/10.3389/fcimb.2022.943480.

BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ, Petra, Ondřej ZENDULKA, Jaroslav JANOSEK, Natálie MLČŮCHOVÁ, Michaela CVANOVÁ, Zdeněk DANĚK, Radek KROUPA, Ladislava BARTOŠOVÁ and Břetislav LIPOVÝ. CYP2C19 Gene Profiling as a Tool for Personalized Stress Ulcer Prophylaxis With Proton Pump Inhibitors in Critically Ill Patients-Recommendations Proposal. Frontiers in Medicine. Laussane: Frontiers, 2022, vol. 9, July 2022, p. 1-9. ISSN 2296-858X. Available from: https://dx.doi.org/10.3389/fmed.2022.854280.

PIVRNCOVÁ, Eliška, Iva KOTÁSKOVÁ, Lucie BUREŠOVÁ, Hana VESPALCOVÁ, Petr ANDRLA, Stanislav SMATANA, Lenka ANDRÝSKOVÁ, Pavel PILER, Petr JANKŮ, Ivo BOREK, Jana KLÁNOVÁ, Tomáš FREIBERGER, Petra VÍDEŇSKÁ, Eva BUDINSKÁ and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Effect of mode of delivery and intrapartum antibiotic prophylaxis on gut bacteriome of newborns in the first days of their life: a case-control study. In Setkání biochemiků a molekulárních biologů, 2022. 2022.

SLÁMOVÁ, Terezie, Natálie MLČŮCHOVÁ, Zdeněk KALA, Zdeněk PAVLOVSKÝ, Jan BÖHM, Radek KROUPA, Jiří DOLINA, Vladimír PROCHÁZKA, Tomáš GROLICH, Jitka VACULOVÁ, Lumír KUNOVSKÝ, Petra BRENEROVÁ, Petr ANDRLA, Ondřej URBAN, Vít NAVRÁTIL, Tomáš HARUSTIAK, Robert LISCHKE, Tereza DEISSOVÁ, Jan LOCHMAN, Lydie IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ, Ondřej SLABÝ, Eva BUDINSKÁ and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Helicobacter analysis in gastric mucosa samples – comparison of two methodical approaches. In Setkání biochemiků a molekulárních biologů, 2022. 2022.

GACHOVÁ, Daniela, Zdeněk DANĚK, Ctirad MACHÁČEK, Soňa SMETANOVÁ, Petr ANDRLA, Eva BUDINSKÁ and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Komparace bakteriomu z tumoru a ze sliznic dutiny ústní u pacientů s orálním dlaždicobuněčným karcinomem (Comparison of bacterioma from tumor and oral mucosa in patients with oral squamous cell carcinoma). In Biologické dny 2022. 2022.

DEISSOVÁ, Tereza, Michaela CVANOVÁ, Zdeněk KALA, Zuzana JIRASKOVA ZAKOSTELSKA, Jiří DOLINA, Lumír KUNOVSKÝ, Radek KROUPA, Zdeněk PAVLOVSKÝ, Břetislav LIPOVÝ, Zdeněk DANĚK, Lydie IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ, Ondrej URBAN, Vit NAVRATIL, Robert LISCHKE, Tomas HARUSTIAK, Tomáš GROLICH, Vladimír PROCHÁZKA, Ondřej SLABÝ and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Lack of Association between Epidermal Growth Factor or Its Receptor and Reflux Esophagitis, Barrett’s Esophagus, and Esophageal Adenocarcinoma: A Case-Control Study. Disease Markers. LONDON: HINDAWI LTD, 2022, vol. 2022, August, p. 1-13. ISSN 0278-0240. Available from: https://dx.doi.org/10.1155/2022/8790748.

MLČŮCHOVÁ, Natálie, Břetislav LIPOVÝ, Zdeněk DANĚK, Lumír KUNOVSKÝ, Ondřej ZENDULKA, Ondřej PEŠ, Jan BÖHM, Radek KROUPA, Jitka VACULOVÁ, Tomáš GROLICH, Vladimír PROCHÁZKA, Vít NAVRÁTIL, Ondřej URBAN, Tomáš HARUŠTIAK, Robert LISCHKE, Lydie IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ, Zdeněk KALA and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Pharmacogenetics of proton pump inhibitors and prevalence of the CYP2C19*2 and *17 variants in the Central European population. In Setkání biochemiků a molekulárních biologů, 2022. 2022.

MARTYNIUK, Christopher J., Amanda N. BUERGER, Hana VESPALCOVÁ, Barbora RUDZANOVÁ, Shahadur R. SOHAG, Amy T. HANLON, Pamela E. GINN, Serena L. CRAFT, Soňa SMETANOVÁ, Eva BUDINSKÁ, Joseph H. Jr. BISESI and Ondřej ADAMOVSKÝ. Sex-dependent host-microbiome dynamics in zebrafish: Implications for toxicology and gastrointestinal physiology. Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics. NEW YORK: ELSEVIER SCIENCE INC, 2022, vol. 42, June 2022, p. 1-9. ISSN 1744-117X. Available from: https://dx.doi.org/10.1016/j.cbd.2022.100993.

AUST, Anne-Christine, Eliška BENEŠOVÁ, Veronika VIDOVÁ, Kateřina COUFALÍKOVÁ, Soňa SMETANOVÁ, Ivo BOREK, Petr JANKŮ, Eva BUDINSKÁ, Jana KLÁNOVÁ, Vojtěch THON and Zdeněk SPÁČIL. Profiling Tryptophan Catabolites of Human Gut Microbiota and Acute-Phase Protein Levels in Neonatal Dried Blood Specimens. Frontiers in Microbiology. Switzerland: Frontiers Research Foundation, 2021, vol. 12, October 2021, p. 1-16. ISSN 1664-302X. Available from: https://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2021.665743.

KNOZ, Martin, Břetislav LIPOVÝ, Jakub HOLOUBEK, Jan ŽÍDEK, Johana BABRNÁKOVÁ, Veronika PAVLIŇÁKOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Zdeněk PAVLOVSKÝ, Martin FALDYNA, Eduard GOPFERT, Jiří DAMBORSKÝ, Vanessa HEARNDEN, Lucy VOJTOVÁ and Michaela CVANOVÁ. Vývoj dermální náhrady, kvalitativní testování na zvířecích modelech. In II. Česko-slovenský kongres "Mezioborové přístupy v hojení ran". 2021.