Publication Records

VACULOVÁ, Jitka, Lumír KUNOVSKÝ, Zdeněk KALA, Radek KROUPA, Jiří DOLINA, Vladimír PROCHÁZKA, Tomáš GROLICH, Zdeněk PAVLOVSKÝ, Natálie MLČŮCHOVÁ, Terezie SLÁMOVÁ, Petra BRENEROVÁ, Jan BÖHM, Petr ANDRLA, V. NAVRATIL, O. URBAN, T. HARUSTIAK, R. LISCHKE, Tereza DEISSOVÁ, Jan LOCHMAN, Lydie IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ, Ondřej SLABÝ and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Association of relative abundance of Helicobacteraceae in the stomach in patients with esophageal adenocarcinoma. In ESGE Days 2023. 2023. ISSN 0013-726X. Available from: https://dx.doi.org/10.1055/s-0043-1765429.

SZÁRAZ, Dávid, Zdeněk DANĚK, Petr ANDRLA, Eva BUDINSKÁ, Tereza DEISSOVÁ, Daniela GACHOVÁ, Natálie MLČŮCHOVÁ, Ctirad MACHÁČEK and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Cílená detekce somatických mutací u pacientů s ameloblastomem: série případů (Targeted detection of somatic mutations in patients with ameloblastoma: a case series). In ONCO Prague, 2023. 2023.

MLČŮCHOVÁ, Natálie, Terezie SLÁMOVÁ, Petra BRENEROVÁ, Tereza DEISSOVÁ, Jan BÖHM, Lumír KUNOVSKÝ, Radek KROUPA, Jiří DOLINA, Vladimír PROCHÁZKA, Tomáš GROLICH, Jitka VACULOVÁ, Petr ANDRLA, Vít NAVRÁTIL, Ondřej URBAN, Tomáš HARUŠTIAK, Robert LISCHKE, Lydie IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ, Ondřej SLABÝ, Zdeněk KALA, Eva BUDINSKÁ and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Comparison of sequencing analyses targeting the V1/V2 and V3/V4 regions in the 16S rDNA gene – analysis of bacteriome in oral swabs and esophageal tissues. In Biologické dny, 2023. 2023.

BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ, Petra, Eva KLVAŇOVÁ, Michal BARTOŠ, Milan URÍK, Zuzana MARINČÁK VRANKOVÁ, Pavel HORNÍK, Petra BRENEROVÁ, Lenka BODOKYOVÁ, Pavla HOLOCHOVÁ, Jana VRZALOVÁ, Jan BÖHM, Vojtěch BARTOŇ, Petra RŮŽIČKOVÁ and Jana KLÁNOVÁ. Laboratoře analýzy mikrobiomu - ušní, nasální a orální bakteriom (Laboratories for microbiome analysis - ear, nasal, and oral bacteriome). In Otologický den. 2023.

MAREČKOVÁ, Klára, Anna PAČÍNKOVÁ, Radek MAREČEK, Ludmila ŠEBEJOVÁ, Lydie IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ, Jana KLÁNOVÁ, Milan BRÁZDIL and Yuliya S. NIKOLOVA. Longitudinal study of epigenetic aging and its relationship with brain aging and cognitive skills in young adulthood. frontiers in aging neuroscience. LAUSANNE: FRONTIERS MEDIA SA, 2023, vol. 15, August 2023, p. 1-9. ISSN 1663-4365. Available from: https://dx.doi.org/10.3389/fnagi.2023.1215957.

GACHOVÁ, Daniela, Zdeněk DANĚK, Ctirad MACHÁČEK, Soňa SMETANOVÁ, Petr ANDRLA, Eva BUDINSKÁ and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Orální bakteriom u pacientů s dlaždicobuněčným karcinomem dle stavu jejich dentice: pilotní studie (Oral bacterioma in patients with squamous cell carcinoma based on their gingival status: a pilot study). In ONCO Prague, 2023. 2023.

BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ, Petra, Natálie MLČŮCHOVÁ, Jan BÖHM, Petra BRENEROVÁ, Vojtěch BARTOŇ, Adam MAJER, Zdeněk PAVLOVSKÝ, Lumír KUNOVSKÝ, Radek KROUPA, Jiří DOLINA, Ondřej URBAN, Vít NAVRÁTIL, Tomáš HARUŠTIAK, Robert LISCHKE, Tomáš GROLICH, Vladimír PROCHÁZKA, Lydie IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ, Martina ZAPLETALOVÁ, Jan LOCHMAN, Ondřej SLABÝ, Eva BUDINSKÁ and Zdeněk KALA. Transcriptomic analysis of esophageal tissues and potential biomarkers for differential diagnostics of Barrett´s mucosa and esophageal adenocarcinoma. In Cancer Science, 2023. 2023.

BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ, Petra, Petra BRENEROVÁ, Pavla HOLOCHOVÁ, Jana VRZALOVÁ, Vojtěch BARTOŇ, Jan BÖHM, Eva BUDINSKÁ, Petra PŘIBYLOVÁ, Petra RŮŽIČKOVÁ, Jana KLÁNOVÁ and Břetislav LIPOVÝ. Výzkumná infrastruktura RECETOX – metagenomické analýzy a hojení ran (Research infrastructure RECETOX - metagenomic analyses and wound healing). In III. Česko - Slovenský kongres mezioborové přístupy hojení ran. 2023.

VYKLICKÁ, Kateřina, Jan BÖHM, Petr ANDRLA, Eva BUDINSKÁ, Břetislav LIPOVÝ and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. 16S rDNA sequencing analysis of low-abundance samples spiked with bacterial mock community. In III. ČESKO-SLOVENSKÝ KONGRES MEZIOBOROVÉ PŘÍSTUPY V HOJENÍ RAN. 2023.

BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ, Petra, Iva KOTÁSKOVÁ, Petra ŠPLÍCHALOVÁ, Daniela GACHOVÁ, Dávid SZÁRAZ, Sabina CERULOVÁ, Ctirad MACHÁČEK, Petr ANDRLA, Jan LOCHMAN, Danuše FRIDRICHOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Petra VÍDEŇSKÁ and Zdeněk DANĚK. Comparative bacteriome analysis of tooth and cystic fluid in patients with apical periodontitis and radicular cyst – pilot study. In FEBS, 2022. 2022. Available from: https://dx.doi.org/10.1002/2211-5463.13440.

BARTOŇ, Vojtěch and Helena SKUTKOVA. Data Transformation for Clustering Utilization for Feature Detection in Mass Spectrometry. In Rojas I., Valenzuela O., Rojas F., Herrera L.J., Ortuño F. Bioinformatics and Biomedical Engineering (IWBBIO 2022) : Lecture Notes in Computer Science, vol 13347. Cham: Springer, 2022, p. 288-299. ISBN 978-3-031-07801-9. Available from: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-07802-6_24.

PIVRNCOVÁ, Eliška, Iva KOTÁSKOVÁ, Lucie BUREŠOVÁ, Hana VESPALCOVÁ, Petr ANDRLA, Stanislav SMATANA, Lenka ANDRÝSKOVÁ, Pavel PILER, Petr JANKŮ, Ivo BOREK, Jana KLÁNOVÁ, Tomáš FREIBERGER, Petra VÍDEŇSKÁ, Eva BUDINSKÁ and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Effect of mode of delivery and intrapartum antibiotic prophylaxis on gut bacteriome of newborns in the first days of their life: a case-control study. In Setkání biochemiků a molekulárních biologů, 2022. 2022.

SLÁMOVÁ, Terezie, Natálie MLČŮCHOVÁ, Zdeněk KALA, Zdeněk PAVLOVSKÝ, Jan BÖHM, Radek KROUPA, Jiří DOLINA, Vladimír PROCHÁZKA, Tomáš GROLICH, Jitka VACULOVÁ, Lumír KUNOVSKÝ, Petra BRENEROVÁ, Petr ANDRLA, Ondřej URBAN, Vít NAVRÁTIL, Tomáš HARUSTIAK, Robert LISCHKE, Tereza DEISSOVÁ, Jan LOCHMAN, Lydie IZAKOVIČOVÁ HOLLÁ, Ondřej SLABÝ, Eva BUDINSKÁ and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Helicobacter analysis in gastric mucosa samples – comparison of two methodical approaches. In Setkání biochemiků a molekulárních biologů, 2022. 2022.

GACHOVÁ, Daniela, Zdeněk DANĚK, Ctirad MACHÁČEK, Soňa SMETANOVÁ, Petr ANDRLA, Eva BUDINSKÁ and Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ. Komparace bakteriomu z tumoru a ze sliznic dutiny ústní u pacientů s orálním dlaždicobuněčným karcinomem (Comparison of bacterioma from tumor and oral mucosa in patients with oral squamous cell carcinoma). In Biologické dny 2022. 2022.

HUA, Qing, Ondřej ADAMOVSKÝ, Hana VESPALCOVÁ, Jonna BOYDA, Jordan T. SCHMIDT, Marianne KOZUCH, Serena L. M. CRAFT, Pamela E. GINN, Stanislav SMATANA, Eva BUDINSKÁ, Maria PERSICO, Joseph H., Jr. BISESI and Christopher J. MARTYNIUK. Microbiome analysis and predicted relative metabolomic turnover suggest bacterial heme and selenium metabolism are altered in the gastrointestinal system of zebrafish (Danio rerio) exposed to the organochlorine dieldrin. Environmental Pollution. Elsevier Ltd., 2021, vol. 268, January 2021, p. 1-11. ISSN 0269-7491. Available from: https://dx.doi.org/10.1016/j.envpol.2020.115715.

MICENKOVÁ, Lenka, Juraj BOSÁK, Stanislav SMATANA, Adam NOVOTNÝ, Eva BUDINSKÁ and David ŠMAJS. Administration of the Probiotic Escherichia coli Strain A0 34/86 Resulted in a Stable Colonization of the Human Intestine During the First Year of Life. Probiotics and Antimicrobial Proteins. New York: Springer New York LLC, 2020, vol. 12, No 2, p. 343-350. ISSN 1867-1306. Available from: https://dx.doi.org/10.1007/s12602-019-09548-3.

ADAMOVSKÝ, Ondřej, Amanda N. BUERGER, Hana VESPALCOVÁ, Shahadur R. SOHAG, Amy T. HANLON, Pamela E. GINN, Serena L. CRAFT, Stanislav SMATANA, Eva BUDINSKÁ, Maria PERSICO, Joseph H., Jr. BISESI and Christopher J. MARTYNIUK. Evaluation of Microbiome-Host Relationships in the Zebrafish Gastrointestinal System Reveals Adaptive Immunity Is a Target of Bis(2-ethylhexyl) Phthalate (DEHP) Exposure. Environmental Science & Technology. Washington, D.C.: American Chemical Society, 2020, vol. 54, No 9, p. 5719-5728. ISSN 0013-936X. Available from: https://dx.doi.org/10.1021/acs.est.0c00628.