Filtrování publikací

    2024

    1. ISHEMGULOVA, Aygul, Liya MUKHAMEDOVA, Zuzana TREBICHALSKÁ, Veronika ŠEMBEROVÁ RÁJECKÁ, Pavel PAYNE, Lenka ŠMERDOVÁ, Jana MORAVCOVÁ, Dominik HREBÍK, David BUCHTA, Karel ŠKUBNÍK, Tibor FÜZIK, Štěpánka VAŇÁČOVÁ, Jiří NOVÁČEK a Pavel PLEVKA. Endosome rupture enables enteroviruses from the family <i>Picornaviridae</i> to infect cells. Communications Biology. BERLIN: Nature Research, 2024, roč. 7, č. 1, s. 1-12. ISSN 2399-3642. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s42003-024-07147-9.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Mukhamedova, Liya (643 Rusko, domácí) -- Trebichalská, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Šemberová Rájecká, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Payne, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Šmerdová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Moravcová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Hrebík, Dominik (703 Slovensko, domácí) -- Buchta, David (203 Česká republika, domácí) -- Škubník, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Füzik, Tibor (703 Slovensko, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: HUMAN RHINOVIRUS SEROTYPE-2; CLATHRIN-MEDIATED ENDOCYTOSIS; INDUCED CONFORMATIONAL-CHANGE; COMMON COLD VIRUS; N-WASP; ENTRY-INTERMEDIATE; POLIOVIRUS TYPE-2; ANTIVIRAL AGENTS; ARP2/3 COMPLEX; RECEPTOR
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 15. 2. 2025 20:25.
    2. ZHOU, You, Miona COROVIC, Peter HOCH-KRAFT, Nathalie MEISER, Mikhail MESITOV, Nadine KOERTEL, Hannah BACK, Vries Isabel S NAARMANN-DE, Kritika Suresh KATTI, Aleš OBRDLÍK, Anke BUSCH, Christoph DIETERICH, Štěpánka VAŇÁČOVÁ, Martin HENGESBACH, Kathi ZARNACK a Julian KOENIG. m6A sites in the coding region trigger translation-dependent mRNA decay. Molecular Cell. Cambridge: Cell Press, 2024, roč. 84, č. 23, s. 1-31. ISSN 1097-2765. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.molcel.2024.10.033.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Katti, Kritika Suresh (356 Indie, domácí) -- Obrdlík, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, domácí) -- Koenig, Julian (garant)
      Klíčová slova anglicky: CODON OPTIMALITY; QUALITY-CONTROL; TRANSCRIPTOME; METHYLATION; REVEALS; PURIFICATION; ELONGATION; SELECTION
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 27. 1. 2025 17:07.

    2023

    1. HEJRET, Václav, Nandan Mysore VARADARAJAN, Eva KLIMENTOVÁ, Katarína GREŠOVÁ, Ilektra-Chara GIASSA, Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Panagiotis ALEXIOU. Analysis of chimeric reads characterises the diverse targetome of AGO2-mediated regulation. Scientific Reports. Nature Research, 2023, roč. 13, č. 1, s. 1-9. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-023-49757-z.
      URL
      RIV/00216224:14740/23:00133649 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Hejret, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Varadarajan, Nandan Mysore (356 Indie, domácí) -- Klimentová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Grešová, Katarína (703 Slovensko, domácí) -- Giassa, Ilektra-Chara (300 Řecko, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, domácí) -- Alexiou, Panagiotis (300 Řecko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Data processing; Machine learning; miRNAs
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 25. 10. 2024 13:15.
    2. VAŇÁČOVÁ, Štěpánka a Šárka FAJTLOVÁ. EMBO workshop - Eukaryotic RNA turnover and viral biology. 2023.
      URL
      RIV/00216224:14740/23:00133579 Uspořádání konference. angličtina. Česká republika.
      Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Fajtlová, Šárka (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: viruses; structure; RNA interactions and modifications; translation and replication; virus infections; antiviral therapies; virus host interactions
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 5. 3. 2024 17:36.
    3. RODRIGUEZ-GALAN, Ana, Sara G DOSIL, Anna VLČKOVÁ, Lola FERNANDEZ-MESSINA, Zuzana FEKETOVÁ, Julie POKORNÁ, Irene FERNANDEZ-DELGADO, Emilio CAMAFEITA, Manuel Jose GOMEZ, Marta RAMIREZ-HUESCA, Cristina GUTIERREZ-VAZQUEZ, Fatima SANCHEZ-CABO, Jesus VAZQUEZ, Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Francisco SANCHEZ-MADRID. ISG20L2: an RNA nuclease regulating T cell activation. Cellular and molecular life sciences. BASEL: BIRKHAUSER VERLAG AG, 2023, roč. 80, č. 9, s. 1-19. ISSN 1420-682X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00018-023-04925-2.
      URL
      RIV/00216224:14740/23:00133564 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Vlčková, Anna (203 Česká republika, domácí) -- Feketová, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Pokorná, Julie (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, domácí) -- Sanchez-Madrid, Francisco (garant)
      Klíčová slova anglicky: Exonuclease; T cell; Immunoregulatory
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 1. 8. 2024 13:50.
    4. FARIA ZENI, Pedro, Michaela MEDKOVÁ, K. TRACHTOVÁ, L. JANSKÁ, Václav ŠEDA, Eva HOFERKOVÁ, Nandan Mysore VARADARAJAN, Sonali SHARMA, Aleš OBRDLÍK, Štěpánka VAŇÁČOVÁ, A. MAIQUES-DIAZ, JI. MARTÍN-SUBERO a Marek MRÁZ. The role of long non-coding RNAs in BCR-mediated CLL activation. In CEITEC PhD Conference, Brno. 2023.
      URL
      RIV/00216224:14740/23:00132967 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Faria Zeni, Pedro (76 Brazílie, domácí) -- Medková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Šeda, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Hoferková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Varadarajan, Nandan Mysore (356 Indie, domácí) -- Sharma, Sonali (356 Indie, domácí) -- Obrdlík, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, domácí) -- Mráz, Marek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: B cell Receptor; chronic lymphocytic leukemia; BCR inhibitors; non-coding RNAs
      Druh účasti: aktivní účast
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 27. 3. 2024 00:14.

    2022

    1. CAVALLIN, Ivana, Marek BARTOŠOVIČ, Tomáš SKALICKÝ, Praveenkumar RENGARAJ, Martin DEMKO, Martina Christina SCHMIDT-DENGLER, Aleksej DRINO, Mark HELM a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. HITS-CLIP analysis of human ALKBH8 reveals interactions with fully processed substrate tRNAs and with specific noncoding RNAs. RNA. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2022, roč. 28, č. 12, s. 1568-1581. ISSN 1355-8382. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1261/rna.079421.122.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00128510 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Cavallin, Ivana (203 Česká republika, domácí) -- Bartošovič, Marek (703 Slovensko, domácí) -- Skalický, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Rengaraj, Praveenkumar (356 Indie, domácí) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: ALKBH8; Trm9; wobble uridine modification; mcm(5)U; mcm(5)s(2)U; HITS-CLIP
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 25. 10. 2024 12:23.
    2. HEJRET, Václav, Nandan Mysore VARADARAJAN, Eva KLIMENTOVÁ, Ilektra-Chara GIASSA, Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Panagiotis ALEXIOU. Noncanonical small RNA chimeras identified by AGO2-CLASH. In 16th Microsymposium on RNA Biology. 2022.
      Název anglicky: Noncanonical small RNA chimeras identified by AGO2-CLASH
      angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Václav Hejret, učo 408320. Změněno: 21. 9. 2022 16:02.
    3. MARTINO, Fabiana, Nandan Mysore VARADARAJAN, Ana Rubina PERESTRELO, Václav HEJRET, Helena DURIKOVA, Dragana VUKIĆ, Vladimir HORVATH, Francesca CAVALIERI, Frank CARUSO, Waleed S ALBIHLAL, Andre P GERBER, Mary Anne O'CONNELL, Štěpánka VAŇÁČOVÁ, Stefania PAGLIARI a Giancarlo FORTE. The mechanical regulation of RNA binding protein hnRNPC in the failing heart. Science Translational Medicine. Washington: American Association for the Advancement of Science, 2022, roč. 14, č. 672, s. 1-17. ISSN 1946-6234. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1126/scitranslmed.abo5715.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00128822 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Martino, Fabiana (380 Itálie, domácí) -- Varadarajan, Nandan Mysore (356 Indie, domácí) -- Hejret, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Vukić, Dragana (688 Srbsko, domácí) -- O'Connell, Mary Anne (372 Irsko, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Extracellular Matrix; Heart Failure; Heterogeneous-Nuclear Ribonucleoprotein Group C; Humans
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 31. 10. 2024 11:59.

    2021

    1. MAROOFIAN, Reza, Jiří SEDMÍK, Neda MAZAHERI, Marcello SCALA, Maha S. ZAKI, Liam KEEGAN, Reza AZIZIMALAMIRI, Mahmoud ISSA, Gholamreza SHARIATI, Alireza SEDAGHAT, Christian BEETZ, Peter BAUER, Hamid GALEHDARI, Mary Anne O'CONNELL a Henry HOULDEN. Biallelic variants in ADARB1, encoding a dsRNA-specific adenosine deaminase, cause a severe developmental and epileptic encephalopathy. Journal of Medical Genetics. London (UK): BMJ Publishing Group, 2021, roč. 58, č. 7, s. 495-504. ISSN 0022-2593. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1136/jmedgenet-2020-107048.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00118751 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Sedmík, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Keegan, Liam (372 Irsko, domácí) -- O'Connell, Mary Anne (372 Irsko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: epilepsymutationmissenseDNAsequence analysisnervous system diseases
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Adéla Pešková, učo 143895. Změněno: 9. 10. 2024 13:00.
    2. FEDOROVÁ, Veronika, Tereza VÁŇOVÁ, Veronika POSPÍŠILOVÁ, Jan RAŠKA, Jiří SEDMÍK, Simona VOCHYÁNOVÁ, Hana HŘÍBKOVÁ a Dáša BOHAČIAKOVÁ. Glioblastom a cerebrální organoidy: zavedení a analýza in vitro modelu. In XXIV. Biologické dny 2021, Brno, 6.-7. 9. 2021. 2021.
      Název česky: Glioblastom a cerebrální organoidy: zavedení a analýza in vitro modelu.

      Změnila: Ing. Nicole Ludikovská, učo 358847. Změněno: 17. 2. 2022 11:24.
    3. RENGARAJ, Praveenkumar, Aleš OBRDLÍK, Dragana VUKIĆ, Nandan Mysore VARADARAJAN, Liam KEEGAN, Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Mary Anne O'CONNELL. Interplays of different types of epitranscriptomic mRNA modifications. RNA Biology. Philadelphia: Taylor & Francis Inc, 2021, roč. 18, S1, s. 19-30. ISSN 1547-6286. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/15476286.2021.1969113.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00124288 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Rengaraj, Praveenkumar (356 Indie, domácí) -- Obrdlík, Aleš (276 Německo, domácí) -- Vukić, Dragana (688 Srbsko, domácí) -- Varadarajan, Nandan Mysore (356 Indie, domácí) -- Keegan, Liam (372 Irsko, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, domácí) -- O'Connell, Mary Anne (372 Irsko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Inosine; m(6)A; m(6)A(m); m(5)C; m(1)A; pseudouridine; epitranscriptome; ADAR
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 25. 2. 2022 10:43.
    4. URL
      Název česky: Open Week
      Název anglicky: Open Week
      RIV/00216224:14740/21:00124525 Popularizační texty a aktivity. čeština. Česká republika.
      Fajtlová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Rektor, Ivan (203 Česká republika, domácí) -- Šmída, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: online; lectures; discussion; open week

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 12. 4. 2022 15:15.
    5. COVELO MOLARES, Helena, Aleš OBRDLÍK, I. POSTULKOVA, Michaela DOHNÁLKOVÁ, Pavlína GREGOROVÁ, Sri Ranjani GANJI, David POTĚŠIL, L. GAWRIYSKI, M. VARJOSALO a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. The comprehensive interactomes of human adenosine RNA methyltransferases and demethylases reveal distinct functional and regulatory features. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2021, roč. 49, č. 19, s. 10895-10910. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkab900.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00119659 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Covelo Molares, Helena (724 Španělsko, domácí) -- Obrdlík, Aleš (276 Německo, domácí) -- Dohnálková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Gregorová, Pavlína (703 Slovensko, domácí) -- Ganji, Sri Ranjani (356 Indie, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: PRE-MESSENGER-RNA; SINGLE-STRANDED-DNA; POLYMERASE-II; NUCLEAR-RNA; M(6)A METHYLTRANSFERASE; GENE-EXPRESSION; 7SK SNRNP; P-TEFB; METHYLATION; PROTEIN
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 2. 11. 2024 20:47.

    2020

    1. ROITHOVA, A., Zuzana FEKETOVÁ, Štěpánka VAŇÁČOVÁ a D. STANEK. DIS3L2 and LSm proteins are involved in the surveillance of Sm ring-deficient snRNAs. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2020, roč. 48, č. 11, s. 6184-6197. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkaa301.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00114751 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Feketová, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: MESSENGER-RNA; DEGRADATION PATHWAY; NONCODING RNAS; TRANSLATION FACTORS; STRUCTURAL BASIS; TRUNCATED FORMS; QUALITY-CONTROL; CAJAL BODIES; CORE DOMAIN; COMPLEX
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 2. 2021 12:30.
    2. SINIGAGLIA, Ketty, Janka MELICHEROVÁ, Stanislav STEJSKAL, Liam KEEGAN a Mary Anne O'CONNELL. Elucidating the Biological Role of ADAR1 in the Innate immunity Response. In CEITEC PhD Conference. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00118412 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Sinigaglia, Ketty (380 Itálie, domácí) -- Melicherová, Janka (703 Slovensko, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Keegan, Liam (372 Irsko, domácí) -- O'Connell, Mary Anne (372 Irsko, domácí)
      Klíčová slova anglicky: ADAR1
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 17. 3. 2021 14:55.
    3. YADAV, Deepak Kumar, Dagmar ZIGÁČKOVÁ, Maria ZLOBINA, Tomáš KLUMPLER, Christelle BEAUMONT, Monika KUBÍČKOVÁ, Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Peter LUKAVSKY. Staufen1 reads out structure and sequence features in ARF1 dsRNA for target recognition. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2020, roč. 48, č. 4, s. 2091-2106. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkz1163.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00114622 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Yadav, Deepak Kumar (356 Indie, domácí) -- Zigáčková, Dagmar (203 Česká republika, domácí) -- Zlobina, Maria (643 Rusko, domácí) -- Klumpler, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Beaumont, Christelle (250 Francie, domácí) -- Kubíčková, Monika (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Lukavsky, Peter (40 Rakousko, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DOUBLE-STRANDED-RNA; NMR STRUCTURE DETERMINATION; LARGE-SCALE PREPARATION; BICOID MESSENGER-RNA; SECONDARY STRUCTURES; BINDING PROTEIN; DOMAIN; PURIFICATION; NOESY; LOCALIZATION
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 27. 10. 2024 15:12.

    2019

    1. YADAV, Deepak Kumar, Dagmar ZIGÁČKOVÁ, Maria ZLOBINA, Tomáš KLUMPLER, Christelle BEAUMONT, Monika KUBÍČKOVÁ, Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Peter LUKAVSKY. Staufen1 reads out structure and sequence features in ARF1 dsRNA for target recognition. In FEBS Congress 2019. 2019. ISSN 2211-5463.
      URL
      RIV/00216224:14740/19:00108212 Konferenční abstrakt. angličtina. Spojené státy.
      Yadav, Deepak Kumar (356 Indie, domácí) -- Zigáčková, Dagmar (203 Česká republika, domácí) -- Zlobina, Maria (643 Rusko, domácí) -- Klumpler, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Beaumont, Christelle (250 Francie, domácí) -- Kubíčková, Monika (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, domácí) -- Lukavsky, Peter (40 Rakousko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Staufen1; ARF1 dsRNA
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 30. 3. 2020 14:19.
    2. RÁJECKÁ, Veronika, Tomáš SKALICKÝ a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. The role of RNA adenosine demethylases in the control of gene expression. Biochimica et biophysica acta - Gene regulatory mechanisms. Amsterdam: Elsevier, 2019, roč. 1862, č. 3, s. 343-355. ISSN 1874-9399. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bbagrm.2018.12.001.
      URL
      RIV/00216224:14740/19:00109891 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Rájecká, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Skalický, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: m(6)A; m(6)A(m); RNA demethylase; FTO; ALKBH5; RNA modification
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 4. 3. 2020 14:41.

    2018

    1. JAROŠOVÁ, Petra, Petr PAROULEK, Michal RÁJECKÝ, Veronika RÁJECKÁ, Eva TÁBORSKÁ, R. ERITJA, A. AVINO, S. MAZZINI, R. GARGALLO a Petr TÁBORSKÝ. Naturally occurring quaternary benzo[c]phenanthridine alkaloids selectively stabilize G-quadruplexes. Physical Chemistry Chemical Physics. CAMBRIDGE: Royal Society of Chemistry, 2018, roč. 20, č. 33, s. 21772-21782. ISSN 1463-9076. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c8cp02681e.
      URL
      RIV/00216224:14310/18:00103741 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Jarošová, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Paroulek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Rájecký, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Rájecká, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Táborská, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Eritja, R. (724 Španělsko) -- Avino, A. (724 Španělsko) -- Mazzini, S. (380 Itálie) -- Gargallo, R. (724 Španělsko) -- Táborský, Petr (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: HUMAN TELOMERIC DNA; ANTIPROLIFERATIVE ACTIVITY; PROMOTER REGION; SMALL MOLECULES; DRUG DESIGN; K+ SOLUTION; IN-VIVO; BINDING; BENZOPHENANTHRIDINE; OLIGONUCLEOTIDES
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 23. 4. 2024 12:29.
    2. JANTSCH, M.F., A. QUATTRONE, Mary Anne O'CONNELL, M. HELM, M. FRYE, M. MACIAS-GONZALES, M. OHMAN, S. AMERES, L. WILLEMS, F. FUKS, A. OULAS, Štěpánka VAŇÁČOVÁ, H. NIELSEN, C. BOUSQUET-ANTONELLI, Y. MOTORIN, J.Y. ROIGNANT, N. BALATSOS, A. DINNYES, P. BARANOV, V. KELLY, A. LAMM, G. RECHAVI, M. PELIZZOLA, J. LIEPINS, I.H. KHOLODNYUK, V. ZAMMIT, D. AYERS, F. DRABLOS, J.A. DAHL, J. BUJNICKI, C. JERONIMO, R. ALMEIDA, M. NEAGU, M. COSTACHE, J. BANKOVIC, B. BANOVIC, J. KYSELOVIC, L.M. VALOR, S. SELBERT, P. PIR, T. DEMIRCAN, V. COWLING, M. SCHAFER, W. ROSSMANITH, D. LAFONTAINE, A. DAVID, C. CARRE, F. LYKO, R. SCHAFFRATH, S. SCHWARTZ, A. VERDEL, A. KLUNGLAND, E. PURTA, G. TIMOTIJEVIC, F. CARDONA, A. DAVALOS, E. BALLANA, D. O CARROLL, J. ULE a R. FRAY. Positioning Europe for the EPITRANSCRIPTOMICS challenge. RNA BIOLOGY. PHILADELPHIA: TAYLOR & FRANCIS INC, 2018, roč. 15, č. 6, s. 829-831. ISSN 1547-6286. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/15476286.2018.1460996.
      URL
      angličtina. Spojené státy.
      Klíčová slova anglicky: database of Modification; detection of RNA modification; epitranscriptomics; European funding; model systems
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 22. 3. 2019 14:46.
    3. COVELO MOLARES, Helena, Marek BARTOŠOVIČ a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. RNA methylation in nuclear pre-mRNA processing. Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA. Hoboken, USA: WILEY-BLACKWELL, 2018, roč. 9, č. 6, s. 1489-1505. ISSN 1757-7004. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/wrna.1489.
      URL
      RIV/00216224:14740/18:00101444 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Covelo Molares, Helena (724 Španělsko, domácí) -- Bartošovič, Marek (703 Slovensko, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RNA demethylase; RNA methylase; RNA processing
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 16:51.
    4. VAŇÁČOVÁ, Štěpánka. Summer course on RNA protein interaction. 2018.
      URL
      RIV/00216224:14740/18:00106833 Uspořádání workshopu. angličtina. Česká republika.
      Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RNA biophysical and functional properties; RNA protein interaction

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 23. 4. 2019 10:31.
    5. SOVÁKOVÁ, Pavla, Alžbeta MAGDOLENOVÁ, Klára KONEČNÁ, Veronika RÁJECKÁ, Jiří FAJKUS a Miloslava FOJTOVÁ. Telomere elongation upon transfer to callus culture reflects the reprogramming of telomere stability control in Arabidopsis. Plant Molecular Biology. Kluwer Academic Publishers, 2018, roč. 98, 1-2, s. 81-99. ISSN 0167-4412. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s11103-018-0765-2.
      URL
      RIV/00216224:14310/18:00101539 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Sováková, Pavla (203 Česká republika, domácí) -- Magdolenová, Alžbeta (703 Slovensko, domácí) -- Konečná, Klára (203 Česká republika, domácí) -- Rájecká, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Fajkus, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Fojtová, Miloslava (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Arabidopsis thaliana; Callus; Chromosome stability; Epigenetics; Regenerated plants; Telomere
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 9. 6. 2022 11:30.
    6. ZIGÁČKOVÁ, Dagmar a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. The role of 3 ' end uridylation in RNA metabolism and cellular physiology. PHILOSOPHICAL TRANSACTIONS OF THE ROYAL SOCIETY B-BIOLOGICAL SCIENCES. LONDON: ROYAL SOC, 2018, roč. 373, č. 1762, s. 20180171-20180184. ISSN 0962-8436. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1098/rstb.2018.0171.
      URL
      RIV/00216224:14740/18:00101443 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Zigáčková, Dagmar (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RNA uridylation; tutase; RNA modification; RNA surveillance; RNA processing; RNA degradation
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 17:13.

    2017

    1. SKALICKÝ, Tomáš, E. DOBAKOVA, R.J. WHEELER, M. TESAROVA, P. FLEGONTOV, D. JIRSOVA, J. VOTYPKA, V. YURCHENKO, F.J. AYALA a J. LUKES. Extensive flagellar remodeling during the complex life cycle of Paratrypanosoma, an early-branching trypanosomatid. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. WASHINGTON: National Academy of Sciences, 2017, roč. 114, č. 44, s. 11757-11762. ISSN 0027-8424. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1073/pnas.1712311114.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00100392 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Skalický, Tomáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Dobakova, E. (203 Česká republika) -- Wheeler, R.J. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Tesarova, M. (203 Česká republika) -- Flegontov, P. (203 Česká republika) -- Jirsova, D. (56 Belgie) -- Votypka, J. (203 Česká republika) -- Yurchenko, V. (203 Česká republika) -- Ayala, F.J. (840 Spojené státy) -- Lukes, J. (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: trypanosomatid; evolution; flagellar remodeling; haptomonads; cytostome
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 16. 3. 2018 10:42.
    2. BARTOŠOVIČ, Marek, Helena COVELO MOLARES, Pavlína GREGOROVÁ, Dominika HROŠŠOVÁ, G. KUDLA a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. N6-methyladenosine demethylase FTO targets pre-mRNAs and regulates alternative splicing and 3'-end processing. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2017, roč. 45, č. 19, s. 11356-11370. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkx778.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00095526 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Bartošovič, Marek (703 Slovensko, domácí) -- Covelo Molares, Helena (724 Španělsko, domácí) -- Gregorová, Pavlína (703 Slovensko, domácí) -- Hroššová, Dominika (703 Slovensko, domácí) -- Kudla, G. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: EMBRYONIC STEM-CELLS; BLOCKED 5' TERMINI; SEX DETERMINATION; COMPREHENSIVE ANALYSIS; NUCLEAR-RNA; METHYLATION; DROSOPHILA; REVEALS; OBESITY; N-6-METHYLADENOSINE
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 28. 2. 2018 09:11.

    2016

    1. KUČERA, Jiří, Ondrej ŠEDO, David POTĚŠIL, Oldřich JANICZEK, Zbyněk ZDRÁHAL a Martin MANDL. Comparative proteomic analysis of sulfur-oxidizing Acidithiobacillus ferrooxidans CCM 4253 cultures having lost the ability to couple anaerobic elemental sulfur oxidation with ferric iron reduction. Research in Microbiology. Amsterdam: Elsevier Science, 2016, roč. 167, č. 7, s. 587-594. ISSN 0923-2508. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.resmic.2016.06.009.
      Název česky: Srovnávací proteomická analýza sirných kultur Acidithiobacillus ferrooxidans CCM 4253, které ztratily schopnost propojit anaerobní oxidaci elementární síry s redukcí železa(III)
      Název anglicky: Comparative proteomic analysis of sulfur-oxidizing Acidithiobacillus ferrooxidans CCM 4253 cultures having lost the ability to couple anaerobic elemental sulfur oxidation with ferric iron reduction
      RIV/00216224:14310/16:00088101 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Kučera, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika) -- Janiczek, Oldřich (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika) -- Mandl, Martin (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Acidithiobacillus ferrooxidans; Anaerobic respiratory pathway; Sulfur metabolism; Ferric iron reduction; Proteomics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 26. 4. 2017 22:13.
    2. ŠKORPÍKOVÁ, Lucie, Jana ILGOVÁ, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Martin DEMKO, Jan OPPELT, Milan GELNAR a Martin KAŠNÝ. Deep insight into secretome and transcriptome of Trichinella spiralis and Trichinela pseudospiralis. In EMOP XII – the 12th European Multicolloquium of Parasitology. 2016.
      URL
      Název česky: Detailní pohled na sekretom a transkriptom Trichinella spiralis a Trichinela pseudospiralis
      Název anglicky: Deep insight into secretome and transcriptome of Trichinella spiralis and Trichinela pseudospiralis
      RIV/00216224:14310/16:00090454 Vyžádané přednášky. Zoologie. angličtina. Česká republika.
      Škorpíková, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Ilgová, Jana (703 Slovensko) -- Potěšil, David (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika) -- Demko, Martin (703 Slovensko) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika) -- Gelnar, Milan (203 Česká republika) -- Kašný, Martin (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Eudiplozoon; serpin
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: RNDr. Martin Kašný, Ph.D., učo 11259. Změněno: 24. 3. 2017 22:32.
    3. ČERVENKA, Igor, Jana VALNOHOVÁ, Ondřej BERNATÍK, Jakub HARNOŠ, Matěj RÁDSETOULAL, Kateřina ŠEDOVÁ, Kateřina HANÁKOVÁ, David POTĚŠIL, Miroslava SEDLÁČKOVÁ, Alena SALAŠOVÁ, Zachary STEINHART, Stephane ANGERS, Gunnar SCHULTE, Aleš HAMPL, Zbyněk ZDRÁHAL a Vítězslav BRYJA. Dishevelled is a NEK2 kinase substrate controlling dynamics of centrosomal linker proteins. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Washington: National Academy of Sciences, 2016, roč. 113, č. 33, s. 9304-9309. ISSN 0027-8424. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1073/pnas.1608783113.
      RIV/00216224:14310/16:00088644 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Červenka, Igor (703 Slovensko, domácí) -- Valnohová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Bernatík, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Harnoš, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Rádsetoulal, Matěj (203 Česká republika, domácí) -- Šedová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Hanáková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Sedláčková, Miroslava (203 Česká republika, domácí) -- Salašová, Alena (203 Česká republika, domácí) -- Steinhart, Zachary (124 Kanada) -- Angers, Stephane (124 Kanada) -- Schulte, Gunnar (276 Německo, domácí) -- Hampl, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Wnt signaling; centrosome; Dishevelled; NEK2; linker proteins
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Lucie Jarošová, DiS., učo 205746. Změněno: 13. 3. 2018 15:33.
    4. BREZOVSKÝ, Jan, Petra BABKOVÁ, Oksana DEGTJARIK, Andrea FOŘTOVÁ, Artur Wiktor GÓRA, L. IERMAK, Petra ŘEZÁČOVÁ, Pavel DVOŘÁK, Ivana KUTÁ-SMATANOVÁ, Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Engineering a de Novo Transport Tunnel. ACS Catalysis. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2016, roč. 6, č. 11, s. 7597-7610. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acscatal.6b02081.
      URL
      RIV/00216224:14310/16:00088545 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Babková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Degtjarik, Oksana (112 Bělorusko) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Góra, Artur Wiktor (616 Polsko, domácí) -- Iermak, L. (804 Ukrajina) -- Řezáčová, Petra (203 Česká republika) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Kutá-Smatanová, Ivana (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: transport tunnel; protein engineering; protein design; activity; specificity; substrate inhibition; stability; substrate binding; product release; water dynamics

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 5. 4. 2017 13:35.
    5. ROUDNICKÝ, Pavel, Jiří VOREL, Jana ILGOVÁ, Libor MIKEŠ, Lucie JEDLIČKOVÁ, John DALTON, Jan DVOŘÁK, Zbyněk ZDRÁHAL, David POTĚŠIL, Lubomír JANDA, Adam NOREK, Milan GELNAR a Martin KAŠNÝ. Eudiplozoon nipponicum (Heteronchoinea: Diplozoidae): insight into composition of E/S products and basic characterization of serpin. 2016. ISBN 978-80-210-8373-8.
      RIV/00216224:14310/16:00088448 Prezentace na konferencích. Zoologie. angličtina. Česká republika.
      Roudnický, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Vorel, Jiří (203 Česká republika) -- Ilgová, Jana (703 Slovensko) -- Mikeš, Libor (203 Česká republika) -- Jedličková, Lucie (203 Česká republika) -- Dalton, John (372 Irsko) -- Dvořák, Jan (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika) -- Norek, Adam (203 Česká republika) -- Gelnar, Milan (203 Česká republika) -- Kašný, Martin (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Monogenea; Eudiplozoon; nipponicum; serpin; excretory; secretory;

      Změnil: RNDr. Martin Kašný, Ph.D., učo 11259. Změněno: 24. 3. 2017 22:28.
    6. VERLANDE, Amandine, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Michaela KRAFČÍKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, Karel SOUČEK, Jan TRNKA, W KOLCH a M ELKALAF. KSR proteins link metabolic changes to the MAPK/ERK pathway. In EACR 24: from basic research to precision medicine, Central Convention Complex, Manchester, UK, July 9-12, 2016, poster presentation. 2016.
      Název anglicky: KSR proteins link metabolic changes to the MAPK/ERK pathway
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Změnila: Mgr. Martina Vráblíková, učo 10839. Změněno: 18. 12. 2017 11:10.
    7. JEDLIČKOVÁ, Lucie, Hana DVOŘÁKOVÁ, Martin KAŠNÝ, Jana ILGOVÁ, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL a Libor MIKEŠ. Major acid endopeptidases of the blood-feeding monogenean Eudiplozoon nipponicum (Heteronchoinea: Diplozoidae). Parasitology. NEW YORK: CAMBRIDGE UNIV PRESS, 2016, roč. 143, č. 4, s. 494-506. ISSN 0031-1820. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1017/S0031182015001808.
      URL
      RIV/00216224:14740/16:00087768 Článek v odborném periodiku. Zoologie. angličtina. Spojené státy.
      Jedličková, Lucie (203 Česká republika) -- Dvořáková, Hana (203 Česká republika) -- Kašný, Martin (203 Česká republika, garant, domácí) -- Ilgová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Mikeš, Libor (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: cysteine peptidase; aspartic peptidase; protease; haematophagous monogenea; cathepsin L; cathepsin B; cathepsin D; fish parasite; common carp

      Změnila: Mgr. Lucie Jarošová, DiS., učo 205746. Změněno: 5. 3. 2018 14:31.
    8. SAID, Hafidh, David POTĚŠIL, Jan FÍLA, Věra ČAPKOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL a David HONYS. Quantitative proteomics of the tobacco pollen tube secretome identifies novel pollen tube guidance proteins important for fertilization. Genome Biology. London: BIOMED CENTRAL LTD, 2016, roč. 17, May, s. nestránkováno, 29 s. ISSN 1465-6906. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13059-016-0928-x.
      URL
      Název anglicky: Quantitative proteomics of the tobacco pollen tube secretome identifies novel pollen tube guidance proteins important for fertilization
      RIV/00216224:14740/16:00088078 Článek v odborném periodiku. Botanika. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Said, Hafidh (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Fíla, Jan (203 Česká republika) -- Čapková, Věra (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Honys, David (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Protein secretion; Pollen tube guidance; Cell-cell signaling; Double fertilization

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 14. 3. 2017 16:43.
    9. USTIANENKO, Dmytro, Josef PASULKA, Zuzana FEKETOVÁ, Lukáš BEDNAŘÍK, Dagmar ZIGÁČKOVÁ, Andrea FOŘTOVÁ, Mihaela ZAVOLAN a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. TUT-DIS3L2 is a mammalian surveillance pathway for aberrant structured non-coding RNAs. EMBO JOURNAL. Hoboken: Wiley-Blackwell, 2016, roč. 35, č. 20, s. 2179-2191. ISSN 0261-4189. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.15252/embj.201694857.
      URL
      RIV/00216224:14740/16:00088170 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Ustianenko, Dmytro (804 Ukrajina, domácí) -- Pasulka, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Feketová, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Bednařík, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Zigáčková, Dagmar (203 Česká republika, domácí) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Zavolan, Mihaela (756 Švýcarsko) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DIS3L2; RNA surveillance; TSSa; ncRNAs; uridylation

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 22. 2. 2017 13:52.

    2015

    1. LATTOVÁ, Erika, Adéla BRABCOVÁ, Veronika BÁRTOVÁ, David POTĚŠIL, Jan BÁRTA a Zbyněk ZDRÁHAL. N-Glycome Profiling of Patatins from Different Potato Species of Solanum Genus. JOURNAL OF AGRICULTURAL AND FOOD CHEMISTRY. Washington D.C.: American Chemical Society, 2015, roč. 63, č. 12, s. 3243-3250. ISSN 0021-8561. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jafc.5b00426.
      Full Text
      Název anglicky: N-Glycome Profiling of Patatins from Different Potato Species of Solanum Genus
      RIV/00216224:14740/15:00082929 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Lattová, Erika (703 Slovensko, domácí) -- Brabcová, Adéla (203 Česká republika) -- Bártová, Veronika (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Bárta, Jan (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: glycans; mass speetrometry; patatin; plants; potato; Solanum
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 20. 1. 2020 16:42.
    2. PERNIKÁŘOVÁ, Vendula, Vojtěch SEDLÁČEK, David POTĚŠIL, Iva PROCHÁZKOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Pavel BOUCHAL a Igor KUČERA. Proteome-wide dataset generated by iTRAQ-3DLCMS/MS technique for studying the role of FerB protein in oxidative stress in Paracoccus denitrificans. Data in Brief. Amsterdam: Elsevier, 2015, roč. 4, September, s. 390-394. ISSN 2352-3409. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2015.06.015.
      RIV/00216224:14310/15:00080961 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Pernikářová, Vendula (203 Česká republika, domácí) -- Sedláček, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Procházková, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Bouchal, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Kučera, Igor (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Paracoccus denitrificans; 3DLC proteomics; FerB; iTRAQ; Microbial proteomics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Igor Kučera, DrSc., učo 911. Změněno: 20. 7. 2019 14:20.
    3. PERNIKÁŘOVÁ, Vendula, Vojtěch SEDLÁČEK, David POTĚŠIL, Iva PROCHÁZKOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Pavel BOUCHAL a Igor KUČERA. Proteomic responses to a methyl viologen-induced oxidative stress in the wild type and FerB mutant strains of Paracoccus denitrificans. Journal of Proteomics. Amsterdam: ELSEVIER SCIENCE BV, 2015, roč. 125, July, s. 68-75. ISSN 1874-3919. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jprot.2015.05.002.
      URL
      Název česky: Proteomická odezva na oxidační stres vyvolaný methylviologenem u divokého a FerB-mutentního kmene Paracoccus denitrificans
      RIV/00216224:14310/15:00080836 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Pernikářová, Vendula (203 Česká republika, domácí) -- Sedláček, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Procházková, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Bouchal, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Kučera, Igor (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Paracoccus denitrificans; methyl viologen; oxidative stress; flavoprotein; flavin reductase; microbial proteomics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Igor Kučera, DrSc., učo 911. Změněno: 20. 7. 2019 14:21.
    4. FAKTOR, Jakub, Lucia KNOPFOVÁ, David POTĚŠIL, Petr BENEŠ, Jan ŠMARDA, Bořivoj VOJTĚŠEK a Pavel BOUCHAL. Proteomická analýza potencionálnych prometastatických cieľov odvodených z porovnania bunečných línií s rôznym migračným potenciálom. In XXXIX. brněnské onkologické dny. 2015. ISSN 0862-495X.
      Název česky: Proteomická analýza potenciálních prometastatických cílů odvozených z porovnání buněčných linii s různým migračním potenciálem
      Název anglicky: Proteomic analysis of potential prometastatic targets derived from comparison of cell lines with different migration capability
      Biochemie. slovenština. Česká republika.
      Změnil: Mgr. Jakub Faktor, Ph.D., učo 269105. Změněno: 1. 10. 2015 09:27.
    5. HROŠŠOVÁ, Dominika, Tomáš ŠIKORSKÝ, David POTĚŠIL, Marek BARTOŠOVIČ, Josef PASULKA, Zbyněk ZDRÁHAL, Richard ŠTEFL a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. RBM7 subunit of the NEXT complex binds U-rich sequences and targets 3 '-end extended forms of snRNAs. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2015, roč. 43, č. 8, s. 4236-4248. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkv240.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00081028 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Hroššová, Dominika (703 Slovensko, domácí) -- Šikorský, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Bartošovič, Marek (703 Slovensko, domácí) -- Pasulka, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RNA-POLYMERASE-II; CRYPTIC UNSTABLE TRANSCRIPTS; STRUCTURAL BASIS; SPLICING REGULATION; POLY(A) POLYMERASE; PROTEOMIC ANALYSIS; PROTEIN-STRUCTURE; QUALITY-CONTROL; EXOSOME; RECOGNITION
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 18. 11. 2015 13:02.
    6. KAŠNÝ, Martin, Lucie ŠKORPÍKOVÁ, Jana ILGOVÁ, Břetislav KOUDELA, Milan GELNAR, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Peter THOMPSON a Dante ZARLENGA. The comparison of functional molecules from excretory-secretory products of two Trichinella species. In 14th International Conference on Trichinellosis in Berlin. 2015.
      Zoologie. angličtina. Německo.
      Klíčová slova anglicky: Trichinella spiralis; Trichinella pseudospiralis; excretory-secretory products; mass spectrometry
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. et Mgr. Jana Ilgová, Ph.D., učo 223075. Změněno: 16. 10. 2015 12:26.

    2014

    1. FAKTOR, Jakub, Lucia KNOPFOVÁ, David POTĚŠIL, Petr BENEŠ, Jan ŠMARDA a Pavel BOUCHAL. Analysis of potential prometastatic targets derived from proteomic comparison of MDA-MB-231 breast cancer cell lines with different migration capability. In 8th Summer Course for Mass Spectrometry in Biotechnology and Medicine. 2014.
      Biochemie. angličtina. Chorvatsko.
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Jakub Faktor, Ph.D., učo 269105. Změněno: 14. 9. 2015 15:33.
    2. LACINA, Karel, Martin KONHEFR, Jan NOVOTNÝ, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL a Petr SKLÁDAL. Combining ferrocene, thiophene and a boronic acid: a hybrid ligand for reagentless electrochemical sensing of cis-diols. Tetrahedron Letters. Oxford: Pergamon Press, 2014, roč. 55, č. 21, s. 3235-3238. ISSN 0040-4039. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.tetlet.2014.04.036.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00073706 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Lacina, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Konhefr, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Novotný, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Skládal, Petr (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: SELF-ASSEMBLED MONOLAYER; PHENYLBORONIC ACID; ELECTRODE SURFACE; GOLD ELECTRODE; SACCHARIDES; RECOGNITION; SENSORS; BINDING; SUGARS; DEHYDROGENASE
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 22. 10. 2014 16:54.
    3. POTĚŠIL, David, Stanislav STEJSKAL, Marek BORSKÝ, Pavel ŠIMARA, Martina HAVELKOVÁ, Filip RÁZGA, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ, Dana DVOŘÁKOVÁ, Jiří MAYER, Zdeněk RÁČIL a Zbyněk ZDRÁHAL. Determination of Imatinib in the Blood Cells of Chronic Myelogenous Leukemia Patients by Ion-Trap Mass Spectrometry. Analytical Letters. PHILADELPHIA: TAYLOR & FRANCIS INC, 2014, roč. 47, č. 6, s. 944-957. ISSN 0003-2719. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/00032719.2013.860538.
      URL
      Název anglicky: Determination of Imatinib in the Blood Cells of Chronic Myelogenous Leukemia Patients by Ion-Trap Mass Spectrometry
      RIV/00216224:14110/14:00073663 Článek v odborném periodiku. Analytická chemie, separace. angličtina. Spojené státy.
      Potěšil, David (203 Česká republika, garant, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Borský, Marek (203 Česká republika) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Havelková, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Rázga, Filip (703 Slovensko) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, domácí) -- Dvořáková, Dana (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Ráčil, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Mass spectrometry; Flow cytometry; Cell isolation technique; Chronic myelogenous leukemia; Imatinib; Peripheral blood
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 5. 3. 2015 16:16.
    4. ŠEBEJOVÁ, Ludmila, Marek BORSKÝ, Zuzana JAŠKOVÁ, David POTĚŠIL, Veronika NAVRKALOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Martin ŠRÁMEK, Michael DOUBEK, Tomáš LOJA, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jiří MAYER a Martin TRBUŠEK. Distinct in vitro sensitivity of p53-mutated and ATM-mutated chronic lymphocytic leukemia cells to ofatumumab and rituximab. Experimental Hematology. New York: Elsevier Science Inc, 2014, roč. 42, č. 10, s. 867-874. ISSN 0301-472X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.exphem.2014.06.003.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00078349 Článek v odborném periodiku. Onkologie a hematologie. angličtina. Spojené státy.
      Šebejová, Ludmila (203 Česká republika, domácí) -- Borský, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Jašková, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Navrkalová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Malčíková, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Šrámek, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Doubek, Michael (203 Česká republika, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Trbušek, Martin (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: COMPLEMENT-DEPENDENT CYTOTOXICITY; P53 TUMOR-SUPPRESSOR; MONOCLONAL-ANTIBODIES; ATAXIA-TELANGIECTASIA; CD20 EXPRESSION; TP53 MUTATION; 11Q DELETION; FLUDARABINE; CHEMOIMMUNOTHERAPY; DYSFUNCTION
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 28. 1. 2015 13:52.
    5. SYKORA, J., Jan BREZOVSKÝ, Táňa KOUDELÁKOVÁ, M. LAHODA, Andrea FOŘTOVÁ, T. CHERNOVETS, Radka CHALOUPKOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Zbyněk PROKOP, I. KUTA SMATANOVA, M. HOF a Jiří DAMBORSKÝ. Dynamics and Hydration Explain Failed Functional Transformation in Dehalogenase Design. Nature Chemical Biology. 2014, roč. 10, č. 6, s. 428-430. ISSN 1552-4450.
      RIV/00216224:14310/14:00074209 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Sykora, J. (203 Česká republika) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Lahoda, M. (112 Bělorusko) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Chernovets, T. (112 Bělorusko) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Štěpánková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Kuta Smatanova, I. (203 Česká republika) -- Hof, M. (276 Německo) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase

      Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 21. 3. 2017 08:04.
    6. HAFIDH, Said, David POTĚŠIL, Jan FÍLA, Jana FECÍKOVÁ, Věra ČAPKOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL a David HONYS. In search of ligands and receptors of the pollen tube: the missing link in pollen tube perception. BIOCHEMICAL SOCIETY TRANSACTIONS. LONDON: PORTLAND PRESS LTD, 2014, roč. 42, April, s. 388-394. ISSN 0300-5127. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1042/BST20130204.
      URL
      Název anglicky: In search of ligands and receptors of the pollen tube: the missing link in pollen tube perception
      RIV/00216224:14740/14:00073698 Článek v odborném periodiku. Botanika. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Hafidh, Said (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Fíla, Jan (203 Česká republika) -- Fecíková, Jana (203 Česká republika) -- Čapková, Věra (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Honys, David (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: GPI-ANCHORED PROTEIN; PLANT SECRETOME; ARABIDOPSIS; GROWTH; GUIDANCE; GERMINATION; ATTRACTANT; COMPONENTS; MAIZE; CELL
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 10. 3. 2015 17:33.
    7. TUDEK, Agnieszka, Odil Porrua FUERTE, Tomasz KABZINSKI, Michael LIDSCHREIBER, Karel KUBÍČEK, Andrea FOŘTOVÁ, Francoise LACROUTE, Štěpánka VAŇÁČOVÁ, Patrick CRAMER, Richard ŠTEFL a Domenico LIBRI. Molecular Basis for Coordinating Transcription Termination with Noncoding RNA Degradation. Molecular Cell. CAMBRIDGE: CELL PRESS, 2014, roč. 55, č. 3, s. 467-481. ISSN 1097-2765. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.molcel.2014.05.031.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00073613 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Spojené státy.
      Tudek, Agnieszka (250 Francie) -- Fuerte, Odil Porrua (724 Španělsko) -- Kabzinski, Tomasz (616 Polsko, domácí) -- Lidschreiber, Michael (276 Německo) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Lacroute, Francoise (250 Francie) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, domácí) -- Cramer, Patrick (276 Německo) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí) -- Libri, Domenico (380 Itálie)
      Klíčová slova anglicky: CRYPTIC UNSTABLE TRANSCRIPTS; POLYMERASE-II TRANSCRIPTS; BINDING PROTEINS NRD1; QUALITY-CONTROL; SACCHAROMYCES-CEREVISIAE; PERVASIVE TRANSCRIPTION; BIDIRECTIONAL PROMOTERS; POLY(A) POLYMERASE; NUCLEAR EXOSOME; TRAMP COMPLEX
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 29. 10. 2014 09:37.
    8. RÁČIL, Zdeněk, Filip RÁZGA, Hana KLAMOVA, Jaroslava VOGLOVÁ, Petra BELOHLAVKOVA, Ludmila MALÁSKOVÁ, David POTĚŠIL, Jan MUŽÍK, Daniela ŽÁČKOVÁ, Katerina Machova POLAKOVA, Zbyněk ZDRÁHAL, Jana MALAKOVA, Jiri SUTTNAR, Jan DYR a Jiří MAYER. No clinical evidence for performing trough plasma and intracellular imatinib concentrations monitoring in patients with chronic myelogenous leukaemia. Hematological Oncology. Hoboken: WILEY-BLACKWELL, 2014, roč. 32, č. 2, s. 87-93. ISSN 0278-0232. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/hon.2091.
      Full Text
      RIV/00216224:14740/14:00074752 Článek v odborném periodiku. Onkologie a hematologie. angličtina. Spojené státy.
      Ráčil, Zdeněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Rázga, Filip (703 Slovensko) -- Klamova, Hana (203 Česká republika) -- Voglová, Jaroslava (203 Česká republika) -- Belohlavkova, Petra (203 Česká republika) -- Malásková, Ludmila (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Mužík, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Žáčková, Daniela (203 Česká republika, domácí) -- Polakova, Katerina Machova (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Malakova, Jana (203 Česká republika) -- Suttnar, Jiri (203 Česká republika) -- Dyr, Jan (203 Česká republika) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CML; imatinib; plasma concentration; cell-asscociated concentration
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 17. 12. 2019 10:25.
    9. FAKTOR, Jakub, Lucia KNOPFOVÁ, David POTĚŠIL, Petr BENEŠ, Jan ŠMARDA a Pavel BOUCHAL. Proteomics analysis of cell surface proteins associated with migration of MDA-MB-231 breast cancer cells. In 5th RECAMO joint meeting – Through cancer research towards applied molecular oncology. 2014. ISBN 978-80-86793-33-7.
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Změnil: Mgr. Jakub Faktor, Ph.D., učo 269105. Změněno: 14. 9. 2015 15:39.
    10. BAČÍKOVÁ, Veronika, Josef PASULKA, Karel KUBÍČEK a Richard ŠTEFL. Structure and semi-sequence-specific RNA binding of Nrd1. Nucleic Acids Research. United Kingdom: Oxford University Press, 2014, roč. 42, č. 12, s. 8024-8038. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gku446.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00073612 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Bačíková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Pasulka, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: protein Nrd1; RNA; untranslated RNA; fluorescence analysis; RNA processing; transcription termination; RNA surveillance; RNA recognition motif
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 3. 12. 2014 10:24.
    11. ŠRÁMOVÁ, Eliška, Jana ILGOVÁ, Lucie ŠKORPÍKOVÁ, Břetislav KOUDELA, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Petr HORÁK, Milan GELNAR a Martin KAŠNÝ. The protein composition of excretory-secretory products of three Trichinella species. In 13th ICOPA. 2014.
      RIV/00216224:14310/14:00076505 Konferenční abstrakt. Zoologie. angličtina. Mexiko.
      Šrámová, Eliška (203 Česká republika, domácí) -- Ilgová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Škorpíková, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Koudela, Břetislav (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Horák, Petr (203 Česká republika) -- Gelnar, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Kašný, Martin (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Excretory-secretory products; trichinella; mass spectrometry
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. et Mgr. Jana Ilgová, Ph.D., učo 223075. Změněno: 19. 9. 2014 14:02.
    12. DVOŘÁKOVÁ, Monika, David POTĚŠIL, Bořivoj VOJTĚŠEK a Pavel BOUCHAL. Úloha transgelinu v migraci a apoptóze buněk. In XXI. Biologické dny, Brno, 4.-5.9.2014. 2014. ISBN 978-80-260-6793-1.
      Název česky: Úloha transgelinu v migraci a apoptóze buněk
      Biochemie. čeština. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757. Změněno: 16. 8. 2016 15:32.

    2013

    1. FAKTOR, Jakub, David POTĚŠIL, Lucia KNOPFOVÁ, Jan ŠMARDA, Petr BENEŠ a Pavel BOUCHAL. Analysis of cell surface proteome of two variants of MDA-MB 231 breast cancer cells with different migration properties. In 7th European Summer School Advanced Proteomics. 2013.
      Biochemie. angličtina. Německo.
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Jakub Faktor, Ph.D., učo 269105. Změněno: 14. 9. 2015 12:33.
    2. ŠIMARA, Pavel, Stanislav STEJSKAL, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ, David POTĚŠIL, Lenka TESAŘOVÁ, Michaela POTĚŠILOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL a Jiří MAYER. Apoptosis in chronic myeloid leukemia cells transiently treated with imatinib or dasatinib is caused by residual BCR-ABL kinase inhibition. American Journal of Hematology. NJ 07030-577 United States: John Wiley & Sons, 2013, roč. 88, č. 5, s. 385-393. ISSN 0361-8609. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/ajh.23419.
      PubMed
      RIV/00216224:14330/13:00066079 Článek v odborném periodiku. Onkologie a hematologie. angličtina. Spojené státy.
      Šimara, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Potěšilová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Chronic Myeloid Leukemia; Imatinib; Dasatinib

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 29. 3. 2019 14:00.
    3. NAVRKALOVÁ, Veronika, Ludmila ŠEBEJOVÁ, Jana ZEMANOVÁ, Jana KMÍNKOVÁ, Blanka KUBEŠOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Marek MRÁZ, Jana ŠMARDOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Michael DOUBEK, Yvona BRYCHTOVÁ, David POTĚŠIL, Veronika NÉMETHOVÁ, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Martin TRBUŠEK. ATM mutations uniformly lead to ATM dysfunction in chronic lymphocytic leukemia: application of functional test using doxorubicin. Haematologica. Pavia, Italy: Ferrata-Storti Foundation, 2013, roč. 98, č. 7, s. 1124-1131. ISSN 0390-6078. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3324/haematol.2012.081620.
      Název česky: ATM mutace jednotně vést k ATM dysfunkce u chronické lymfocytární leukemie: aplikace funkčního testu pomocí doxorubicin
      RIV/00216224:14740/13:00065621 Článek v odborném periodiku. Onkologie a hematologie. angličtina. Itálie.
      Navrkalová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Šebejová, Ludmila (203 Česká republika, domácí) -- Zemanová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Kmínková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Kubešová, Blanka (203 Česká republika, domácí) -- Malčíková, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Mráz, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Šmardová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Pavlová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Doubek, Michael (203 Česká republika, domácí) -- Brychtová, Yvona (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Némethová, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Trbušek, Martin (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: ATM mutations; CLL; ATM dysfunction; doxorubicin
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 3. 4. 2014 03:52.
    4. VORÁČOVÁ, Ivona, Jakub VANĚK, Josef PASULKA, Zora STŘELCOVÁ, Přemysl LUBAL a Petr HERMANN. Dissociation kinetics study of copper(II) complexes of DO3A, DOTA and its monosubstituted derivatives. Polyhedron. OXFORD: Elsevier Science Ltd., 2013, roč. 61, Sep, s. 99-104. ISSN 0277-5387. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.poly.2013.05.042.
      URL
      RIV/00216224:14740/13:00066398 Článek v odborném periodiku. Anorganická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Voráčová, Ivona (203 Česká republika) -- Vaněk, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Pasulka, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Střelcová, Zora (203 Česká republika, domácí) -- Lubal, Přemysl (203 Česká republika, garant, domácí) -- Hermann, Petr (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Macrocyclic ligands; Cyclen derivatives; Phosphonate complexes; Phosphinate complexes; Pyridine-N-oxide complexes; Copper complexes; Dissociation kinetics; Rate constants; Radiopharmaceuticals
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 11. 4. 2014 00:45.
    5. FOŘTOVÁ, Andrea, Eva ŠEBESTOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Lenka PÁLKOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ a Radka CHALOUPKOVÁ. DspA from Strongylocentrotus purpuratus: the First Biochemically Characterized Haloalkane Dehalogenase of Non-Microbial Origin. Biochimie. Elsevier, 2013, roč. 95, č. 11, s. 2091-2096. ISSN 0300-9084. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.biochi.2013.07.025.
      RIV/00216224:14310/13:00065807 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Fořtová, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Šebestová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Štěpánková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Pálková, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Haloalkane Dehalogenase
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Šebestová, Ph.D., učo 40707. Změněno: 26. 6. 2014 12:59.
    6. KUČERA, Jiří, Pavel BOUCHAL, Jan LOCHMAN, David POTĚŠIL, Oldřich JANICZEK, Zbyněk ZDRÁHAL a Martin MANDL. Ferrous iron oxidation by sulfur-oxidizing Acidithiobacillus ferrooxidans and analysis of the process at the levels of transcription and protein synthesis. Antonie van Leeuwenhoek International Journal of General and Molecular Microbiology. Dordrecht: Springer, 2013, roč. 103, č. 4, s. 905-919. ISSN 0003-6072. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10482-012-9872-2.
      Název česky: Oxidace železa(II) síru oxidující bakterií Acidithiobacillus ferrooxidans a analýza procesu na úrovni transkripce a syntézy proteinů
      RIV/00216224:14310/13:00066107 Článek v odborném periodiku. Mikrobiologie, virologie. angličtina. Nizozemské království.
      Kučera, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bouchal, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Lochman, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Janiczek, Oldřich (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Mandl, Martin (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Acidithiobacillus ferrooxidans; elemental sulfur oxidation; ferrous iron oxidation; pyrite oxidation; proteomics; reverse-transcription quantitative PCR
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: doc. Ing. Martin Mandl, CSc., učo 1408. Změněno: 13. 1. 2016 14:26.
    7. USTIANENKO, Dmytro, Dominika HROŠŠOVÁ, David POTĚŠIL, Kateřina CHALUPNÍKOVÁ, Kristýna HRAZDILOVÁ, Jiří PACHERNÍK, Kateřina CETKOVSKÁ, Stjepan ULDRIJAN, Zbyněk ZDRÁHAL a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. Mammalian DIS3L2 exoribonuclease targets the uridylated precursors of let-7 miRNAs. RNA. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2013, roč. 19, č. 12, s. 1632-1638. ISSN 1355-8382. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1261/rna.040055.113.
      URL
      RIV/00216224:14740/13:00066446 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Ustianenko, Dmytro (804 Ukrajina, domácí) -- Hroššová, Dominika (703 Slovensko, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Chalupníková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Hrazdilová, Kristýna (203 Česká republika, domácí) -- Pacherník, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Cetkovská, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Uldrijan, Stjepan (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DIS3L2; RNA degradation; RNA uridylation; let-7 miRNA
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 17. 1. 2014 15:38.
    8. PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, F. OPLUŠTIL, Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2013. Patent. Číslo: EP 1899022. Název vlastníka: MU. Datum přijetí: 9. 10. 2013.
      RIV/00216224:14310/13:00072743 Patent. Biochemie. angličtina. Německo.
      Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Opluštil, F. (203 Česká republika) -- Jesenská, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko)
      Klíčová slova anglicky: yperite; haloalkane dehalogenases

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 19. 5. 2014 12:42.
    9. DVOŘÁKOVÁ, Monika, David POTĚŠIL, Juraj LENČO, Rudolf NENUTIL, Bořivoj VOJTĚŠEK a Pavel BOUCHAL. Multiple roles of cytoskeletal proteins transgelins in breast cancer development and metastasis. In 4th RECAMO joint meeting. Brno, 30.9.-3.10.2013. 2013. ISBN 978-80-86793-28-3.
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757. Změněno: 25. 8. 2016 09:43.
    10. ŠEBEJOVÁ, Ludmila, Martin ŠRÁMEK, Zuzana JAŠKOVÁ, Marek BORSKÝ, David POTĚŠIL, Veronika NAVRKALOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Martin TRBUŠEK. Mutace v genu TP53 jsou spojeny s vyšší rezistencí CLL buněk na ofatumumab a rituximab in vitro. In Pražský hematologický den. 2013.
      Onkologie a hematologie. čeština. Česká republika.
      Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 25. 11. 2013 11:36.
    11. ŽĎÁRSKÁ, Markéta, Pavlína ZATLOUKALOVÁ, Mariana BENITEZ KEINRAD, Ondrej ŠEDO, David POTĚŠIL, Ondřej NOVÁK, Jana SVAČINOVÁ, Bedřich PEŠEK, Jiří MALBECK, Jana VAŠÍČKOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL a Jan HEJÁTKO. Proteome Analysis in Arabidopsis Reveals Shoot- and Root-Specific Targets of Cytokinin Action and Differential Regulation of Hormonal Homeostasis. Plant Physiology. USA: American Society of Plant Physiologists, 2013, roč. 161, č. 2, s. 918-930. ISSN 0032-0889. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1104/pp.112.202853.
      Plant Physiology website
      Název anglicky: Proteome Analysis in Arabidopsis Reveals Shoot- and Root-Specific Targets of Cytokinin Action and Differential Regulation of Hormonal Homeostasis
      RIV/00216224:14740/13:00066058 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Žďárská, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Zatloukalová, Pavlína (203 Česká republika, domácí) -- Benitez Keinrad, Mariana (484 Mexiko, domácí) -- Šedo, Ondrej (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Novák, Ondřej (203 Česká republika) -- Svačinová, Jana (203 Česká republika) -- Pešek, Bedřich (203 Česká republika) -- Malbeck, Jiří (203 Česká republika) -- Vašíčková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Arabidopsis; proteome; cytokinin; ethylene; crosstalk
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 16. 5. 2014 16:29.
    12. FAKTOR, Jakub, Lucia KNOPFOVÁ, David POTĚŠIL, Petr BENEŠ, Jan ŠMARDA a Pavel BOUCHAL. Proteomics analysis of cell surface proteins associated with migration of MDAMB-231 breast cancer cells. In IntegRECAMO Summer school 2013 "Methods of basic and translational cancer reasearch". 2013.

      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Jakub Faktor, Ph.D., učo 269105. Změněno: 23. 8. 2016 16:20.
    13. STEJSKAL, Karel, David POTĚŠIL a Zbyněk ZDRÁHAL. SUPPRESION OF PROTEIN SAMPLE LOSSES IN AUTOSAMPLER VIALS. CHEMICKÉ LISTY. Praha: Česká společnost chemická, 2013, roč. 107, č. 2013, s. "S324"-"S326", 3 s. ISSN 0009-2770.
      RIV/00216224:14740/13:00107015 Článek v odborném periodiku. angličtina. Česká republika.
      Stejskal, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RECOVERY; PEPTIDES
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 30. 4. 2020 10:12.
    14. STEJSKAL, Karel, David POTĚŠIL a Zbyněk ZDRÁHAL. Suppression of Peptide Sample Losses in Autosampler Vials. Journal of Proteome Research. Washington, USA: ACS, 2013, roč. 12, č. 6, s. 3057-3062. ISSN 1535-3893. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/pr400183v.
      URL
      RIV/00216224:14740/13:00066299 Článek v odborném periodiku. Analytická chemie, separace. angličtina. Spojené státy.
      Stejskal, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: MASS-SPECTROMETRY ANALYSIS; LIQUID-CHROMATOGRAPHY; RECOVERY; PROTEIN; QUANTIFICATION; OPTIMIZATION; PURIFICATION; SURFACTANTS; ADSORPTION; PROTEOMICS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 5. 4. 2014 08:00.
    15. HASAN, Khomaini, Artur Wiktor GORA, Jan BREZOVSKÝ, Radka CHALOUPKOVÁ, Hana MOSKALÍKOVÁ, Andrea FOŘTOVÁ, Yuji NAGATA, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. The Effect of a Unique Halide-Stabilising Residue on the Catalytic Properties of Haloalkane Dehalogenase DatA from Agrobacterium tumefaciens C58. FEBS Journal. Blackwell, 2013, roč. 280, č. 13, s. 3149-3159. ISSN 1742-464X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/febs.12238.
      RIV/00216224:14310/13:00065822 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Hasan, Khomaini (360 Indonésie, domácí) -- Gora, Artur Wiktor (616 Polsko, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Moskalíková, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Haloalkane Dehalogenase

      Změnila: Ing. Zdeňka Rašková, učo 140529. Změněno: 29. 4. 2014 14:23.
    16. ŠEBEJOVÁ, Ludmila, Martin ŠRÁMEK, Zuzana JAŠKOVÁ, Marek BORSKÝ, David POTĚŠIL, Veronika NAVRKALOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Martin TRBUŠEK. TP53 mutations associate with higher in vitro resistance of CLL cells to ofatumumab and rituximab. In XV iwCLL, Cologne, Německo. 2013.
      Onkologie a hematologie. angličtina. Německo.
      Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 25. 11. 2013 13:26.

    2012

    1. ČINČÁROVÁ, Lenka, Gabriela LOCHMANOVÁ, Kateřina NOVÁKOVÁ, Pavla ŠILEROVÁ, Hana KONEČNÁ, Lenka FAJKUSOVÁ, Jiří FAJKUS a Zbyněk ZDRÁHAL. A combined approach for the study of histone deacetylase inhibitors. Molecular BioSystems. Cambridge: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2012, roč. 8, č. 11, s. 2937-2945. ISSN 1742-206X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c2mb25136a.
      URL
      RIV/00216224:14740/12:00060968 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Činčárová, Lenka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Lochmanová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Nováková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Šilerová, Pavla (203 Česká republika, domácí) -- Konečná, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Fajkusová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Fajkus, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: histone acetylation; inhibitors of histone deacetylases; MALDI-MS; LC-MS/MS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 16. 5. 2014 16:33.
    2. HOLUB, Peter, Jana LALÁKOVÁ, Hana ČERNÁ, Josef PASULKA, Marie SÁRAZOVÁ, Kristýna HRAZDILOVÁ, Maria SAŇUDO ARCE, Fruzsina HÓBOR, Richard ŠTEFL a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. Air2p is critical for the assembly and RNA-binding of the TRAMP complex and the KOW domain of Mtr4p is crucial for exosome activation. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2012, roč. 40, č. 12, s. 5679-5693. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gks223.
      URL
      RIV/00216224:14740/12:00057391 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Holub, Peter (203 Česká republika, domácí) -- Laláková, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Černá, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Pasulka, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Sárazová, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Hrazdilová, Kristýna (203 Česká republika, domácí) -- Saňudo Arce, Maria (724 Španělsko, domácí) -- Hóbor, Fruzsina (348 Maďarsko, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RNA recognition; binding; RNA processing; RNA-protein interaction
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 7. 4. 2013 12:25.
    3. PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, F. OPLUŠTIL, Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2012. Patent. Číslo: CA 2610024. Název vlastníka: MU. Datum přijetí: 26. 6. 2012.
      RIV/00216224:14310/12:00072742 Patent. Biochemie. angličtina. Kanada.
      Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Opluštil, F. (203 Česká republika) -- Jesenská, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko)
      Klíčová slova anglicky: yperite; haloalkane dehalogenases

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 19. 5. 2014 12:51.
    4. PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, F. OPLUŠTIL, Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2012. Patent. Číslo: IL 186596. Název vlastníka: MU. Datum přijetí: 1. 5. 2012.
      RIV/00216224:14310/12:00072741 Patent. Biochemie. angličtina. Izrael.
      Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Opluštil, F. (203 Česká republika) -- Jesenská, Andrea (203 Česká republika) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko)
      Klíčová slova anglicky: yperite; haloalkane dehalogenases

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 19. 5. 2014 12:50.
    5. PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, Filip OPLUŠTIL, Andrea FOŘTOVÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2012. Patent. Číslo: IL 186596. Vydavatel: Israeli Patent Office. Místo vydání: Israel. Název vlastníka: Masarykova univerzita. Datum registrace: 11. 10. 2007. Datum přijetí: 31. 1. 2012.
      Název anglicky: Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases
      Biochemie. angličtina. Izrael. obsah podléhá obchodnímu tajemství.
      Klíčová slova anglicky: yperite; haloalkane dehalogenases

      Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 7. 4. 2014 13:36.
    6. LOCHMANOVÁ, Gabriela, Lenka JEDLIČKOVÁ, David POTĚŠIL, Alexandra TOMANCOVÁ, Jan VERNER, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Zbyněk ZDRÁHAL. Potential biomarkers for early detection of acute graft-versus-host disease. Proteomics : clinical applications. Weinheim: WILEY-VCH Verlag, 2012, roč. 6, 7-8, s. 351-363. ISSN 1862-8346. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/prca.201100104.
      URL
      Název anglicky: Potential biomarkers for early detection of acute graft-versus-host disease
      RIV/00216224:14740/12:00064911 Článek v odborném periodiku. Onkologie a hematologie. angličtina. Spojené státy.
      Lochmanová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Jedličková, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Tomancová, Alexandra (203 Česká republika, domácí) -- Verner, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Doubek, Michael (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: BONE-MARROW-TRANSPLANTATION; STEM-CELL TRANSPLANTATION; C-REACTIVE PROTEIN; SERUM CYTOKINE LEVELS; NECROSIS-FACTOR-ALPHA; ACUTE GVHD; SOLUBLE INTERLEUKIN-2-RECEPTOR; QUANTITATIVE PROTEOMICS; MAJOR COMPLICATIONS; PLASMA BIOMARKERS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 12. 4. 2013 04:05.
    7. ŠIKORSKÝ, Tomáš, Fruzsina HÓBOR, Eva KRIŽANOVÁ, Josef PASULKA, Karel KUBÍČEK a Richard ŠTEFL. Recognition of asymmetrically dimethylated arginine by TDRD3. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2012, roč. 40, č. 22, s. 11748-11755. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gks929.
      URL
      Název česky: Recognition of asymmetrically dimethylated arginine by TDRD3
      Název anglicky: Recognition of asymmetrically dimethylated arginine by TDRD3
      RIV/00216224:14740/12:00057639 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Šikorský, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Hóbor, Fruzsina (348 Maďarsko, domácí) -- Križanová, Eva (703 Slovensko, domácí) -- Pasulka, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: tudor; assymetric dimethylarginine; histone; C-terminal domain of RNA polymerase II; recognition mark; nuclear magnetic resonance
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 12. 4. 2013 08:01.
    8. KUBÍČEK, Karel, Hana ČERNÁ, Peter HOLUB, Josef PASULKA, Dominika HROŠŠOVÁ, Frank LOEHR, Ctirad HOFR, Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Richard ŠTEFL. Serine phosphorylation and proline isomerization in RNAP II CTD control recruitment of Nrd1. Genes & Development. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2012, roč. 26, č. 17, s. 1891-1896. ISSN 0890-9369. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1101/gad.192781.112.
      URL
      RIV/00216224:14740/12:00057508 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Spojené státy.
      Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Černá, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Holub, Peter (203 Česká republika, domácí) -- Pasulka, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Hroššová, Dominika (703 Slovensko, domácí) -- Loehr, Frank (276 Německo) -- Hofr, Ctirad (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RNA polymerase II; CTD code; phosphorylation; proline isomerization; RNA processing and degradation; NMR spectroscopy; structure
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 7. 4. 2013 04:28.
    9. HOLUB, Peter a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. TRAMP Stimulation of Exosome. Online. In Guillaume F. Chanfreau; Fuyuhiko Tamanoi. The Enzymes: Eukaryotic RNases and their Partners in RNA Degradation and Biogenesis, Part A. Burlington: Elsevier Inc., 2012, s. 77-95. "Vol. 31"; Part A. ISBN 978-0-12-404740-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/B978-0-12-404740-2.00004-5.
      URL
      RIV/00216224:14740/12:00065939 Kapitola resp. kapitoly v odborné knize. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Holub, Peter (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: TRAMP; Noncanonical polyadenylation; RNA degradation; RNA surveillance;Trf4; Zinc knuckle proteins; Air1; Mtr4; Noncoding RNAs
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 30. 4. 2014 04:08.

    2011

    1. STRUHÁROVÁ, Iva, Pavel BOUCHAL, Jiří JARKOVSKÝ, Kristýna HRAZDILOVÁ, Monika DVOŘÁKOVÁ, Lenka HERNYCHOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Petr SOVA a Bořivoj VOJTĚŠEK. An induction of Retinol Binding Protein 4 by new platinum-based anticancer agent LA-12. In "2nd RECAMO joint meeting": Role of p53, MDM2, AGR2/3 and ubiquitin/chaperone system in tumour biology. 2011. ISBN 978-80-86793-20-7.
      Název anglicky: An induction of Retinol Binding Protein 4 by new platinum-based anticancer agent LA-12
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: proteomics, LA-12, RBP4
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757. Změněno: 19. 12. 2011 20:47.
    2. HASAN, Khomaini, Andrea FOŘTOVÁ, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, M. ISHITSUKA, Yuji NAGATA, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Biochemical Characteristics of the Novel Haloalkane Dehalogenase DatA Isolated from the Plant Pathogen Agrobacterium tumefaciens C58. Applied and Environmental Microbiology. 2011, roč. 77, č. 5, s. 1881-1884. ISSN 0099-2240. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1128/AEM.02109-10.
      RIV/00216224:14310/11:00049448 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Hasan, Khomaini (360 Indonésie, domácí) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Ishitsuka, M. (392 Japonsko) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Novel Haloalkane Dehalogenase DatA ;Agrobacterium tumefaciens C58

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 20. 4. 2012 10:38.
    3. STSIAPANAVA, Alena, Radka CHALOUPKOVÁ, Andrea FOŘTOVÁ, J. BRYNDA, M. S. WEISS, Jiří DAMBORSKÝ a I. KUTÁ-SMATANOVÁ. Crystallization and Preliminary Crystallographic Analysis of Rhodococcus rhodochrous Wild-type DhAa Protein and its Variant DhaA13 Complexed with Different Ligands. In IX. Discussions in Structural Molecular Biology and Bioinformatics. 2011.
      RIV/00216224:14310/11:00049452 Prezentace na konferencích. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Stsiapanava, Alena (112 Bělorusko) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Brynda, J. (203 Česká republika) -- Weiss, M. S. (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Kutá-Smatanová, I. (703 Slovensko)
      Klíčová slova anglicky: DhAa; Crystallization; Rhodococcus rhodochrous
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 12. 8. 2011 12:49.
    4. STSIAPANAVA, Alena, Radka CHALOUPKOVÁ, Andrea FOŘTOVÁ, J. BRYNDA, M. S. WEISS, Jiří DAMBORSKÝ a Ivana KUTÁ-SMATANOVÁ. Crystallization and Preliminary X-ray Diffraction Analysis of the Wild-Type Haloalkane Dehalogenase DhaA and its Variant DhaA13 Complexed with Different Ligands. Acta Crystallographica F. 2011, roč. 67, č. 67, s. 253-257. ISSN 1744-3091. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1107/S1744309110051286.
      RIV/00216224:14310/11:00049440 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Stsiapanava, Alena (112 Bělorusko, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Brynda, J. (203 Česká republika) -- Weiss, M. S. (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Kutá-Smatanová, Ivana (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Crystallization; X-ray Diffraction Analysis; Haloalkane Dehalogenase DhaA

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 20. 4. 2012 10:35.
    5. ČINČÁROVÁ, Lenka, Gabriela LOCHMANOVÁ, Hana KONEČNÁ, Kateřina NOVÁKOVÁ, Lenka FAJKUSOVÁ, Jiří FAJKUS a Zbyněk ZDRÁHAL. Effects of histone deacetylases inhibitors on histone H4 acetylation state of MEC-1 cells. In 5th Central and Eastern European Proteomic Conference. 2011.

      Klíčová slova anglicky: hdac inhibitors, proteomics, post-translational modifications
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Gabriela Lochmanová, Ph.D., učo 15496. Změněno: 10. 4. 2012 21:29.
    6. PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, František OPLUŠTIL, Andrea FOŘTOVÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2011. Patent. Číslo: US 7,888,103. Vydavatel: Úřad pro patenty a ochranné známky USA. Místo vydání: USA. Název vlastníka: MU. Datum registrace: 1. 6. 2006. Datum přijetí: 15. 2. 2011.
      Název česky: Způsob detoxikace sulfidického yperitu působením halogenalkandehalogenáz
      Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Klíčová slova anglicky: yperite; haloalkane dehalogenases

      Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 7. 4. 2014 13:44.
    7. PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, F. OPLUŠTIL, Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases,. 2011. Patent. Číslo: US 7,888,103. Název vlastníka: MU. Datum přijetí: 15. 2. 2011.
      RIV/00216224:14310/11:00072740 Patent. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Opluštil, F. (203 Česká republika) -- Jesenská, Andrea (203 Česká republika) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko)
      Klíčová slova anglicky: yperite; haloalkane dehalogenases

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 19. 5. 2014 12:50.
    8. PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, František OPLUŠTIL, Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases,. 2011. Patent. Číslo: JP 4793947. Vydavatel: Japonský patentový úřad. Místo vydání: Japonsko. Název vlastníka: MU. Datum registrace: 1. 6. 2006. Datum přijetí: 5. 8. 2011.
      Název česky: Způsov detoxikace sulfidického yperitupůsobením halogenalkandehalogenáz
      RIV/00216224:14310/11:00053385 Patent. Biochemie. angličtina. Japonsko.
      Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Opluštil, František (203 Česká republika) -- Jesenská, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko)
      Klíčová slova anglicky: yperite; haloalkane dehalogenases

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 19. 5. 2014 12:49.
    9. HÓBOR, Fruzsina, Roberto PERGOLI, Karel KUBÍČEK, Dominika HROŠŠOVÁ, Veronika BAČÍKOVÁ, Michal ZIMMERMANN, Josef PASULKA, Ctirad HOFR, Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Richard ŠTEFL. Recognition of transcription termination signal by the nuclear polyadenylated RNA-binding (Nab)3 protein. The Journal of Biological Chemistry. Am. Soc. for Biochem. and Mol. Biol., 2011, roč. 286, č. 5, s. 3645-3657. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.M110.158774.
      RIV/00216224:14740/11:00049398 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Hóbor, Fruzsina (348 Maďarsko, domácí) -- Pergoli, Roberto (380 Itálie, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Hroššová, Dominika (703 Slovensko, domácí) -- Bačíková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Zimmermann, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Pasulka, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Hofr, Ctirad (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR; Protein structure; RNA processing; RNA-protein interaction; Transcription termination
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 25. 3. 2012 05:35.
    10. KOUDELÁKOVÁ, Táňa, Eva CHOVANCOVÁ, Jan BREZOVSKÝ, Marta MONINCOVÁ, Andrea FOŘTOVÁ, Jiří JARKOVSKÝ a Jiří DAMBORSKÝ. Substrate Specificity of Haloalkane Dehalogenases. Biochemical Journal. 2011, roč. 435, č. 435, s. 345-354. ISSN 0264-6021. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1042/BJ20101405.
      Název česky: Substrátová specifita haloalkan dehalogenáz
      RIV/00216224:14310/11:00049439 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Koudeláková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Chovancová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Monincová, Marta (203 Česká republika) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Jarkovský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: substrate specificity; haloalkane dehalogenases; halogenated compounds

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 20. 4. 2012 10:34.
    11. STRUHÁROVÁ, Iva, Pavel BOUCHAL, Jiří JARKOVSKÝ, Kristýna HRAZDILOVÁ, Monika DVOŘÁKOVÁ, Lenka HERNYCHOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Petr SOVA a Bořivoj VOJTĚŠEK. The new platinum anticancer agent LA-12 induces Retinol Bionding Protein 4 in vivo. In 5th European Summer School in "Proteomics Basics". 2011.
      Biochemie. angličtina. Itálie.
      Klíčová slova anglicky: proteomics, retinol binding protein 4, RBP4, LA-12
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757. Změněno: 1. 12. 2011 15:24.
    12. BOUCHAL, Pavel, Jiří JARKOVSKÝ, Kristýna HRAZDILOVÁ, Monika DVOŘÁKOVÁ, Iva STRUHÁROVÁ, Lenka HERNYCHOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Petr SOVA a Bořivoj VOJTĚŠEK. The new platinum-based anticancer agent LA-12 induces retinol binding protein 4 in vivo. Proteome Science. BioMed Central, 2011, roč. 9, č. 68, s. "nestránkováno", 9 s. ISSN 1477-5956. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/1477-5956-9-68.
      URL
      Název česky: Nové platinové cytostatikum LA-12 indukuje retinol-vázající protein 4 in vivo
      Název anglicky: The new platinum-based anticancer agent LA-12 induces retinol binding protein 4 in vivo
      RIV/00216224:14310/11:00050153 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Bouchal, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Jarkovský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Hrazdilová, Kristýna (203 Česká republika) -- Dvořáková, Monika (203 Česká republika, domácí) -- Struhárová, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Hernychová, Lenka (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Sova, Petr (203 Česká republika) -- Vojtěšek, Bořivoj (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: (OC-6-43)-bis(acetato)(1-adamantylamine)amminedichloroplatinum (IV) (LA-12); plasma retinol-binding protein 4; RBP4; cisplatin; adamantylamine; proteomics
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 7. 4. 2012 15:48.
    13. KUBÍČEK, Karel, Josef PASULKA, Hana ČERNÁ, Frank LÖHR a Richard ŠTEFL. 1H, 13C, and 15N resonance assignments for the CTD-Interacting Domain of Nrd1 bound to Ser5-phosphorylated CTD of RNA Polymerase II. Biomolecular NMR Assignments. Netherlands: Springer Netherlands, 2011, roč. 5, č. 2, s. 203-205. ISSN 1874-2718. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s12104-011-9300-y.
      URL
      Název česky: Přířazení 1H, 13C, 15N rezonančních frekvencí CTD interagující domény proteinu Nrd1 v komplexu s 5pSer CTD RNA polymerázy II
      RIV/00216224:14740/11:00049411 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Nizozemské království.
      Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Pasulka, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Černá, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Löhr, Frank (276 Německo) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CTD-interacting domain (CID); CTD; RNA-processing; transcription termination
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 28. 3. 2012 00:08.

    2010

    1. PASULKA, Josef, Jaroslav KOČA a Richard ŠTEFL. The computational view inside the dynamical behavior of the RNA-binding motive. In 8th Discussions in Structural Molecular Biology, Nove Hrady, March 18 - 20, 2010. 2010. ISSN 1211-5894.
      Název česky: The computational view inside the dynamical behavior of the RNA-binding motive
      Název anglicky: The computational view inside the dynamical behavior of the RNA-binding motive
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: molecular dynamics; RNA-binding motive; ADAR2; RNA recognition

      Změnil: Mgr. Josef Pasulka, Ph.D., učo 105979. Změněno: 30. 12. 2010 11:55.
    2. PERGOLI, Roberto, Karel KUBÍČEK, Fruzsina HÓBOR, Josef PASULKA a Richard ŠTEFL. (1)H, (13)C, and (15)N chemical shift assignments for the RNA recognition motif of Nab3. Biomolecular NMR Assignments. UNITED STATES: SPRINGER, 2010, roč. 4, č. 1, s. 119-121. ISSN 1874-2718. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s12104-010-9221-1.
      URL
      Název česky: Přiřazení (1)H, (13)C a (15)N rezonančních frekvencí RNA-rozpoznávacího motivu proteinu Nab3
      Název anglicky: (1)H, (13)C, and (15)N chemical shift assignments for the RNA recognition motif of Nab3.
      RIV/00216224:14310/10:00040504 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Nizozemské království.
      Pergoli, Roberto (380 Itálie, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Hóbor, Fruzsina (348 Maďarsko, domácí) -- Pasulka, Josef (203 Česká republika) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nab3 - RNA-binding motif - RRM - Transcription termination
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD., učo 20563. Změněno: 17. 1. 2012 16:46.
    3. SAŇUDO ARCE, Maria, Martin JACKO, Christiane RAMMELT, Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Richard ŠTEFL. 1H, 13C, and 15N chemical shift assignments of ZCCHC9. Biomolecular NMR Assignments. SPRINGER, 2010, roč. 5, č. 1, s. 19-21. ISSN 1874-2718. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s12104-010-9257-2.
      URL
      RIV/00216224:14310/10:00040608 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Saňudo Arce, Maria (724 Španělsko, domácí) -- Jacko, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Rammelt, Christiane (756 Švýcarsko) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, domácí) -- Štefl, Richard (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: ZCCHC9; Zinc knuckle; CCHC; RNA degradation
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 19. 4. 2013 14:19.

    2009

    1. SAN PAOLO, Salvatore, Štěpánka VAŇÁČOVÁ, L. SCHENK, T. SCHERRER, Diana BLANK, Walter KELLER a Andre P. GERBER. Distinct roles of non-canonical poly(A) polymerases in RNA metabolism. PLoS Genetics. Public Library of Science, 2009, roč. 5, č. 7, s. e1000555, 17 s. ISSN 1553-7390.
      URL
      Název česky: Distinct roles of non-canonical poly(A) polymerases in RNA metabolism
      Název anglicky: Distinct roles of non-canonical poly(A) polymerases in RNA metabolism
      RIV/00216224:14310/09:00036231 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      San Paolo, Salvatore (380 Itálie) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant) -- Schenk, L. (756 Švýcarsko) -- Scherrer, T. (756 Švýcarsko) -- Blank, Diana (756 Švýcarsko) -- Keller, Walter (276 Německo) -- Gerber, Andre P. (756 Švýcarsko)
      Klíčová slova anglicky: TRAMP; polyadenylation; RNA degradation; RNA quality control; Trf4; Trf5
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: prof. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D., učo 105562. Změněno: 29. 3. 2010 15:41.
    2. VAŇÁČOVÁ, Štěpánka. Distinct Roles of TRAMP complexes in yeast RNA Metabolism. In Messenger RNA 3' ends and gene expression - EMBO workshop. 2009.
      URL
      Název česky: Distinct Roles of TRAMP complexes in yeast RNA Metabolism
      Název anglicky: Distinct Roles of TRAMP complexes in yeast RNA Metabolism
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Klíčová slova anglicky: Messenger RNA 3 prime end formation provides a clear paradigm for such an interconnection point as it represents the cross-over between transcribing a gene and translating its messenger RNA.
      Druh účasti: vyžádaná přednáška
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: prof. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D., učo 105562. Změněno: 9. 4. 2010 10:56.
    3. HOLUB, Peter a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. Functional characterization of TRAMP complex and its subunits. In EMBO Young Investigator Programme PhD course. 2009.
      URL
      Biochemie. angličtina. Německo.
      Klíčová slova anglicky: RNA quality control
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: prof. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D., učo 105562. Změněno: 9. 4. 2010 10:57.
    4. HROŠŠOVÁ, Dominika, Stjepan ULDRIJAN, Aleš HAMPL, Zbyněk ZDRÁHAL a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. Characterization of a specific 3'- end RNA modification and specific RNA- binding proteins. In RNA Club 2009. 2009. ISSN 1214-8598.
      URL
      Název česky: Characterization of a specific 3'- end RNA modification and specific RNA- binding proteins
      Název anglicky: Characterization of a specific 3'- end RNA modification and specific RNA- binding proteins
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: RNA Club
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: prof. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D., učo 105562. Změněno: 9. 4. 2010 10:57.
    5. VAŇÁČOVÁ, Štěpánka. RNA Club 2009. 2009.
      URL
      Název česky: RNA Club 2009
      Název anglicky: RNA Club 2009
      RIV/00216224:14310/09:00039798 Uspořádání konference. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: RNA Club
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: prof. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D., učo 105562. Změněno: 9. 4. 2010 10:59.
    6. VAŇÁČOVÁ, Štěpánka. RNA substrate selection by the TRAMP complex. In 9th EMBO Young Investigator Programme Meeting. 2009.
      URL
      Název česky: RNA substrate selection by the TRAMP complex
      Název anglicky: RNA substrate selection by the TRAMP complex
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Turecko.
      Klíčová slova anglicky: EMBO YIP meeting
      Druh účasti: vyžádaná přednáška
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: prof. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D., učo 105562. Změněno: 9. 4. 2010 10:58.
    7. LALÁKOVÁ, Jana a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. TRAMP-mediated spliceosomal intron turnover. In RNA Club 2009. 2009. ISSN 1214-8598.
      URL
      Název česky: TRAMP-mediated spliceosomal intron turnover
      Název anglicky: TRAMP-mediated spliceosomal intron turnover
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: RNA Club
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: prof. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D., učo 105562. Změněno: 9. 4. 2010 10:59.

    2008

    1. HOLČÁKOVÁ, Jitka, Lenka HERNYCHOVÁ, Pavel BOUCHAL, Kristýna BROŽKOVÁ, Jan ŽALOUDÍK, Dalibor VALÍK, Rudolf NENUTIL a Bořivoj VOJTĚŠEK. Identification of alphaB-crystallin, a biomarker of renal cell carcinoma by SELDI-TOF MS. The International Journal of Biological Markers. Itálie: Wichtig editore, 2008, roč. 23, č. 1, s. 48-53. ISSN 0393-6155.
      Název česky: Identifikace alfaB-krystalinu, biomarkeru renálního karcinomu, metodou SELDI-TOF MS
      RIV/00216224:14310/08:00026753 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Itálie.
      Holčáková, Jitka (203 Česká republika, garant) -- Hernychová, Lenka (203 Česká republika) -- Bouchal, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Brožková, Kristýna (203 Česká republika, domácí) -- Žaloudík, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Valík, Dalibor (203 Česká republika, domácí) -- Nenutil, Rudolf (203 Česká republika, domácí) -- Vojtěšek, Bořivoj (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: alphaB-crystallin; biomarker; ProteinChip; renal cell carcionoma; SELDI-TOF MS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757. Změněno: 1. 2. 2012 09:53.
    2. BROŽKOVÁ, Kristýna, Eva BUDINSKÁ, Pavel BOUCHAL, Lenka HERNYCHOVÁ, Dana KNOFLÍČKOVÁ, Dalibor VALÍK, Rostislav VYZULA, Bořivoj VOJTĚŠEK a Rudolf NENUTIL. Surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight proteomic profiling of breast carcinomas identifies clinicopathologically relevant groups of patients similar to previously defined clusters from cDNA expression. Breast Cancer Research. London, Great Britain: Biomed Central Ltd., 2008, roč. 10, č. 3, s. R48, 11 s. ISSN 1465-5411. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/bcr2101.
      Název česky: Proteinové profilování karcinomů prsu metodou SELDI-TOF MS odhaluje klinickopatologicky relevantní skupiny pacientů stejně jako dříve definované klastry na základě exprese cDNA
      RIV/00216224:14310/08:00028249 Článek v odborném periodiku. Onkologie a hematologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Brožková, Kristýna (203 Česká republika, domácí) -- Budinská, Eva (703 Slovensko, domácí) -- Bouchal, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Hernychová, Lenka (203 Česká republika) -- Knoflíčková, Dana (203 Česká republika) -- Valík, Dalibor (203 Česká republika, domácí) -- Vyzula, Rostislav (203 Česká republika, domácí) -- Vojtěšek, Bořivoj (203 Česká republika) -- Nenutil, Rudolf (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: breast cancer; SELDI-TOF MS; cDNA clusters
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757. Změněno: 1. 2. 2012 09:55.
    3. BOUCHAL, Pavel, Lenka HERNYCHOVÁ, Monika MUDROCHOVÁ, Kristýna BROŽKOVÁ, Jarmila SOBOTKOVÁ, Spiros D. GARBIS, Petr NOVÁK, Rostislav VYZULA, Rudolf NENUTIL a Bořivoj VOJTĚŠEK. The ways leading to identification of potential biomarkers in SELDI-TOF MS based proteomic studies. In 8th Siena Meeting: From Genome To Proteome: Integration and Proteome Completion. Siena, Italy: The University of Siena, 2008, s. 153.
      Název česky: Způsoby identifikace potenciálních biomarkerů detekovaných v proteomických studiích na bázi SELDI-TOF MS
      Biochemie. angličtina. Itálie.
      Klíčová slova anglicky: SELDI-TOF MS; biomarkers; protein isolation and identification; mass spectrometry
      Druh sborníku: postkonferenční sborník

      Změnil: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757. Změněno: 13. 11. 2008 18:19.

    2007

    1. CARLTON, Jane, R.P. HIRT, J.C. SILVA, A.L. DELCHER, M. SCHATZ, Q. ZHAO, J.R. WORTMAN, S.L. BIDWELL, U.C. ALSMARK, S. BESTEIRO, T. SICHERITZ-PONTEN, C.J. NOEL, J.B. DACKS, P.G. FOSTER, C. SIMILLION, Y. VAN DE PEER, D. MIRANDA-SAAVEDRA, G.J. BARTON, G.D. WESTROP, S. MULLER, D. DESSI, P.L. FIORI, Q. REN, I. PAULSEN, H. ZHANG, F.D. BASTIDA-CORCUERA, A. SIMOES-BARBOSA, M.T. BROWN, R. HAYES, M. MUKHERJEE, C.Y. OKUMURA, R. SCHNEIDER, A.J. SMITH, Štěpánka VAŇÁČOVÁ, M. VILLALVAZO, B.J. HAAS, M. PERTEA, T. FELDBLYUM, T.R. UTTERBACK, Chung-Li SHU, K. OSOEGAWA, P.J. DE JONG, Ivan HRDY, Lenka HORVATHOVA, Zuzana ZUBACOVA, Pavel DOLEZAL, S.B. MALIK, J.Jr. LOGSDON, K. HENZE, A. GUPTA, C.C. WANG, R.L. DUNNE, J.A. UPCROFT, Peter UPCROFT, Owen WHITE, S.L. SALZBERG, P. TANG, Cheng-Hsun CHIU, Ying-Shiung LEE, T.M. EMBLEY, G.H. COOMBS, J.C. MOTTRAM, Jan TACHEZY, C. FRASER-LIGGETT a Patricia J. JOHNSON. Draft genome sequence of the sexually transmitted pathogen Trichomonas vaginalis. Science. 2007, roč. 315, č. 5809, s. 207-212. ISSN 0036-8075.
      Název česky: Draft genome sequence of the sexually transmitted pathogen Trichomonas vaginalis
      Název anglicky: Draft genome sequence of the sexually transmitted pathogen Trichomonas vaginalis
      RIV/00216224:14310/07:00036232 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Carlton, Jane (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Hirt, R.P. (756 Švýcarsko) -- Silva, J.C. (620 Portugalsko) -- Delcher, A.L. (840 Spojené státy) -- Schatz, M. (276 Německo) -- Zhao, Q. (156 Čína) -- Wortman, J.R. (840 Spojené státy) -- Bidwell, S.L. (840 Spojené státy) -- Alsmark, U.C. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Besteiro, S. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Sicheritz-Ponten, T. (208 Dánsko) -- Noel, C.J. (250 Francie) -- Dacks, J.B. (124 Kanada) -- Foster, P.G. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Simillion, C. (56 Belgie) -- Van de Peer, Y. (56 Belgie) -- Miranda-Saavedra, D. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Barton, G.J. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Westrop, G.D. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Muller, S. (276 Německo) -- Dessi, D. (380 Itálie) -- Fiori, P.L. (380 Itálie) -- Ren, Q. (840 Spojené státy) -- Paulsen, I. (840 Spojené státy) -- Zhang, H. (840 Spojené státy) -- Bastida-Corcuera, F.D. (724 Španělsko) -- Simoes-Barbosa, A. (76 Brazílie) -- Brown, M.T. (840 Spojené státy) -- Hayes, R. (840 Spojené státy) -- Mukherjee, M. (840 Spojené státy) -- Okumura, C.Y. (840 Spojené státy) -- Schneider, R. (840 Spojené státy) -- Smith, A.J. (840 Spojené státy) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant) -- Villalvazo, M. (840 Spojené státy) -- Haas, B.J. (840 Spojené státy) -- Pertea, M. (840 Spojené státy) -- Feldblyum, T. (840 Spojené státy) -- Utterback, T.R. (840 Spojené státy) -- Shu, Chung-Li (156 Čína) -- Osoegawa, K. (840 Spojené státy) -- de Jong, P.J. (840 Spojené státy) -- Hrdy, Ivan (203 Česká republika) -- Horvathova, Lenka (203 Česká republika) -- Zubacova, Zuzana (703 Slovensko) -- Dolezal, Pavel (203 Česká republika) -- Malik, S.B. (840 Spojené státy) -- Logsdon, J.Jr. (840 Spojené státy) -- Henze, K. (276 Německo) -- Gupta, A. (840 Spojené státy) -- Wang, C.C. (840 Spojené státy) -- Dunne, R.L. (840 Spojené státy) -- Upcroft, J.A. (36 Austrálie) -- Upcroft, Peter (36 Austrálie) -- White, Owen (840 Spojené státy) -- Salzberg, S.L. (840 Spojené státy) -- Tang, P. (158 Tchaj-wan) -- Chiu, Cheng-Hsun (158 Tchaj-wan) -- Lee, Ying-Shiung (158 Tchaj-wan) -- Embley, T.M. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Coombs, G.H. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Mottram, J.C. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Tachezy, Jan (203 Česká republika) -- Fraser-Liggett, C. (840 Spojené státy) -- Johnson, Patricia J. (840 Spojené státy)
      Klíčová slova anglicky: Trichomonas; genome; protozoa; transposon elements; hydrogenosome: mitochondria
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: prof. Mgr. Štěpánka Vaňáčová, Ph.D., učo 105562. Změněno: 29. 3. 2010 15:39.
Zobrazeno: 21. 2. 2025 23:02