-
OPÁLENÝ, Filip, Pavol ULBRICH, Joan PLANAS IGLESIAS, Jan BYŠKA, Jan ŠTOURAČ, David BEDNÁŘ, Katarína FURMANOVÁ a Barbora KOZLÍKOVÁ. Visual Support for the Loop Grafting Workflow on Proteins. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics. United States: IEEE Computer Society, 2025, roč. 31, č. 1, s. 580-590. ISSN 1077-2626. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/TVCG.2024.3456401.URL
Název anglicky: Visual Support for the Loop Grafting Workflow on Proteins
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Opálený, Filip (703 Slovensko, domácí) -- Ulbrich, Pavol (703 Slovensko, domácí) -- Planas Iglesias, Joan (724 Španělsko, domácí) -- Byška, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Furmanová, Katarína (703 Slovensko, domácí) -- Kozlíková, Barbora (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Proteins;Visualization;Enzymes;Three Dimensional Displays;Shape;Pipelines;Focusing;Protein Visualization;Protein Engineering;Loop Grafting;Abstract Views
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: doc. RNDr. Barbora Kozlíková, Ph.D., učo 60850. Změněno: 10. 1. 2025 13:49.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2419834/cs -
KANDRA, Mário, Tereza VÁŇOVÁ, Vincent Alexander JONGEN, Jakub POSPÍŠIL, Josef NOVAK, Václav CHOCHOLA, Tomas BURYSKA, Zbyněk PROKOP, Zdenek HODNY, Aleš HAMPL, Dáša BOHAČIAKOVÁ a Josef JAROŠ. A closed 3D printed microfluidic device for automated growth and differentiation of cerebral organoids from single-cell suspension. Biotechnology Journal. WEINHEIM: WILEY-V C H VERLAG GMBH, 2024, roč. 19, č. 8, s. 1-17. ISSN 1860-6768. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/biot.202400240.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Kandra, Mário (703 Slovensko, domácí) -- Váňová, Tereza (203 Česká republika, domácí) -- Jongen, Vincent Alexander (528 Nizozemské království, domácí) -- Pospíšil, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Novak, Josef (203 Česká republika) -- Chochola, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Buryska, Tomas (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Hodny, Zdenek (203 Česká republika) -- Hampl, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Bohačiaková, Dáša (703 Slovensko, domácí) -- Jaroš, Josef (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: 3D cell culture; microfluidics; organoids; pluripotent stem cells; tissue engineering
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 11. 9. 2024 13:23.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2431599/cs -
KHAN, Rayyan Tariq, Petra POKORNÁ, Jan DVORSKÝ, Simeon BORKO, Ihor AREFIEV, Joan PLANAS IGLESIAS, Adam DOBIÁŠ, José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, Veronika SZOTKOWSKÁ, Jaroslav ŠTĚRBA, Ondřej SLABÝ, Jiří DAMBORSKÝ, Stanislav MAZURENKO a David BEDNÁŘ. A computational workflow for analysis of missense mutations in precision oncology. JOURNAL OF CHEMINFORMATICS. ENGLAND: BMC, 2024, roč. 16, č. 1, s. 1-10. ISSN 1758-2946. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13321-024-00876-3.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Khan, Rayyan Tariq (586 Pákistán, domácí) -- Pokorná, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Dvorský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Borko, Simeon (703 Slovensko, domácí) -- Arefiev, Ihor (804 Ukrajina, domácí) -- Planas Iglesias, Joan (724 Španělsko, domácí) -- Dobiáš, Adam (703 Slovensko, domácí) -- Rangel Pamplona Pizarro Pinto, José Gaspar (620 Portugalsko, domácí) -- Szotkowská, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Štěrba, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Slabý, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Bioinformatics; Cancer; Function; High-performance computing; Machine learning; Molecular modelling; Oncology; Personalised medicine; Single nucleotide polymorphism; Stability; Treatment
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 16. 2. 2025 09:07.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2420857/cs -
PLANAS IGLESIAS, Joan, Simeon BORKO, Jan SWIATKOWSKI, Matej ELIAS, Martin HAVLÁSEK, Ondrej SALAMON, Ekaterina GRAKOVA, Antonín KUNKA, Tomas MARTINOVIC, Jiří DAMBORSKÝ, Jan MARTINOVIC a David BEDNÁŘ. AggreProt: a web server for predicting and engineering aggregation prone regions in proteins. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2024, roč. 52, W1, s. "W159"-"W169", 11 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkae420.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Planas Iglesias, Joan (724 Španělsko, domácí) -- Borko, Simeon (703 Slovensko, domácí) -- Havlásek, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Kunka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: SECONDARY STRUCTURE; BETA; DATABASE; DESIGN
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 21. 1. 2025 09:42.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2421847/cs -
KHAN, Rayyan Tariq, Petra POKORNÁ, Jan DVORSKÝ, Simeon BORKO, Adam DOBIÁŠ, Joan PLANAS IGLESIAS, Stanislav MAZURENKO, Ihor AREFIEV, José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, Veronika SZOTKOWSKÁ, Jaroslav ŠTĚRBA, Jiří DAMBORSKÝ, Ondřej SLABÝ a David BEDNÁŘ. Analysis of mutations in precision oncology using the automated, accurate, and user-friendly web tool PredictONCO. Computational and Structural Biotechnology Journal. AMSTERDAM: Elsevier, 2024, roč. 24, December 2024, s. 734-738. ISSN 2001-0370. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.csbj.2024.11.026.URL
Název anglicky: Analysis of mutations in precision oncology using the automated, accurate, and user-friendly web tool PredictONCO
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Khan, Rayyan Tariq (586 Pákistán, garant, domácí) -- Pokorná, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Dvorský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Borko, Simeon (703 Slovensko, domácí) -- Dobiáš, Adam (703 Slovensko, domácí) -- Planas Iglesias, Joan (724 Španělsko, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Arefiev, Ihor (804 Ukrajina, domácí) -- Rangel Pamplona Pizarro Pinto, José Gaspar (620 Portugalsko, domácí) -- Szotkowská, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Štěrba, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Slabý, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Precision oncology; Webserver; Mutation; Prediction; Treatment; Next-generation sequencing; Virtual screening; Oncogenicity; Automation; Machine learning
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 10. 2. 2025 09:27.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2464290/cs -
SLÁNSKÁ, Michaela, Lenka ŠTACKOVÁ, Sérgio Manuel MARQUES, Peter ŠTACKO, Marek MARTÍNEK, Luboš JÍLEK, Martin TOUL, Jiří DAMBORSKÝ, David BEDNÁŘ, Petr KLÁN a Zbyněk PROKOP. Azobenzene-Based Photoswitchable Substrates for Advanced Mechanistic Studies of Model Haloalkane Dehalogenase Enzyme Family. ACS Catalysis. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2024, roč. 14, č. 15, s. 11635-11645. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acscatal.4c03503.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Slánská, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Štacková, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Štacko, Peter (703 Slovensko, domácí) -- Martínek, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Jílek, Luboš (203 Česká republika, domácí) -- Toul, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Klán, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: photoswitch; azobezene; enzyme; transientkinetics; mechanism; haloalkane dehalogenase; time-resolved spectroscopy
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 10. 2. 2025 16:01.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2424817/cs -
FRUHAUF, Sebastian, Dominic PUHRINGER, Michaela THAMHESL, Patricia FAJTL, Elisavet KUNZ-VEKIRU, Andreas HOBARTNER-GUSSL, Gerd SCHATZMAYR, Gerhard ADAM, Jiří DAMBORSKÝ, Kristina DJINOVIC-CARUGO, Zbyněk PROKOP a Wulf-Dieter MOLL. Bacterial Lactonases ZenA with Noncanonical Structural Features Hydrolyze the Mycotoxin Zearalenone. ACS Catalysis. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2024, roč. 14, č. 5, s. 3392-3410. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acscatal.4c00271.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: zearalenone; mycotoxin; lactonase; carboxylesterase; hydrolase; kinetics; presteady-state; Rhodococcus erythropolis
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 6. 3. 2024 09:08.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2381699/cs -
VELECKÝ, Jan, Matej BEREZNÝ, Miloš MUSIL, Jiří DAMBORSKÝ, David BEDNÁŘ a Stanislav MAZURENKO. BenchStab: A tool for automated querying of web-based stability predictors. BIOINFORMATICS. ENGLAND: OXFORD UNIV PRESS, 2024, roč. 40, č. 9, s. 1-5. ISSN 1367-4803. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btae553.URL
Název anglicky: BenchStab: A tool for automated querying of web-based stability predictors
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Velecký, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Musil, Miloš (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: PROTEIN STABILITY; SERVER; MUTATIONS; CHALLENGES
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 26. 10. 2024 15:56.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2434258/cs -
Biochemical evidence for conformational variants in the anti-viral and pro-metastatic protein IFITM1NEKULOVÁ, Marta, Marta WYSZKOWSKA, Nela FRIEDLOVÁ, Lukáš UHRÍK, Filip ZAVADIL KOKÁŠ, Václav HRABAL, Lenka HERNYCHOVÁ, Bořivoj VOJTĚŠEK, Ted R. HUPP a Michał SZYMAŃSKI. Biochemical evidence for conformational variants in the anti-viral and pro-metastatic protein IFITM1. Biological Chemistry. GERMANY: Walter de Gruyter GmbH, 2024, roč. 405, č. 5, s. 311-324. ISSN 1431-6730. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1515/hsz-2023-0327.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Nekulová, Marta (203 Česká republika) -- Wyszkowska, Marta (616 Polsko) -- Friedlová, Nela (203 Česká republika, domácí) -- Uhrík, Lukáš (703 Slovensko) -- Zavadil Kokáš, Filip (203 Česká republika) -- Hrabal, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Hernychová, Lenka (203 Česká republika) -- Vojtěšek, Bořivoj (203 Česká republika) -- Hupp, Ted R. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Szymański, Michał (616 Polsko)
Klíčová slova anglicky: hydrogen deuterium exchange; IFITM proteins; oligomerization; protein conformation; protein structure
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 28. 1. 2025 10:06.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2422717/cs -
Calfitter 2.0 (software)KUNKA, Antonín, Dávid LACKO, Jan DVORSKÝ, Jiří DAMBORSKÝ, Zbyněk PROKOP a Stanislav MAZURENKO. Calfitter 2.0. 2024.URL
Název anglicky: Calfitter 2.0
RIV: Software. čeština. Česká republika.
Kunka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Lacko, Dávid (703 Slovensko, domácí) -- Dvorský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí)
Klíčová slova anglicky: protein: thermal denaturation: protein unfolding: aggregation; webserver; dataset
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 28. 1. 2025 08:10.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2471859/cs -
DE LA BOURDONNAYE, Gabin, Tereza GHAZALOVÁ, Petr FOJTÍK, Katerina KUTALKOVA, David BEDNÁŘ, Jiří DAMBORSKÝ, Vladimír ROTREKL, Veronika STEPANKOVA a Radka CHALOUPKOVÁ. Computer-aided engineering of stabilized fibroblast growth factor 21. Computational and Structural Biotechnology Journal. Elsevier, 2024, roč. 23, December 2024, s. 942-951. ISSN 2001-0370. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.csbj.2024.02.001.URL
Název anglicky: Computer-aided engineering of stabilized fibroblast growth factor 21
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
de La Bourdonnaye, Gabin (250 Francie, domácí) -- Ghazalová, Tereza (203 Česká republika, domácí) -- Fojtík, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Rotrekl, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Fibroblast growth factor 21; Protein engineering; Protein stabilization
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 16. 4. 2024 11:21.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2383957/cs -
MARQUES, Sérgio Manuel, Petr KOUBA, Anthony Thomas P LEGRAND, Jiri SEDLAR, Lucas DISSON, Joan PLANAS IGLESIAS, Zainab Kemi SANUSI, Antonín KUNKA, Jiří DAMBORSKÝ, Tomas PAJDLA, Zbyněk PROKOP, Stanislav MAZURENKO, Josef SIVIC a David BEDNÁŘ. CoVAMPnet: Comparative Markov State Analysis for Studying Effects of Drug Candidates on Disordered Biomolecules. JACS AU. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2024, roč. 4, č. 6, s. 2228-2245. ISSN 2691-3704. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jacsau.4c00182.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Kouba, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Legrand, Anthony Thomas P (250 Francie, domácí) -- Planas Iglesias, Joan (724 Španělsko, domácí) -- Sanusi, Zainab Kemi (566 Nigérie, domácí) -- Kunka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, garant, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: soft Markov state models; intrinsically disordered proteins; adaptive molecular dynamics; Alzheimer's disease; A beta 42 peptide; drug candidates; tramiprosate; 3-sulfopropanoic acid
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 21. 1. 2025 09:43.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2421650/cs -
NYKODÝMOVÁ, Daniela, Lenka MOLČANOVÁ, Jan KOTOUČEK, Josef MAŠEK a Jakub TREML. Determination of PPAR gamma agonistic activity of mimulone and diplacone in nanoparticle formulations. In PSE Trends in Natural Products 2024 Young Scientists' Meeting. 2024. ISBN 978-80-280-0559-7.PSE 2024: Book of abstracts
RIV: Prezentace na konferencích. angličtina. Česká republika.
Nykodýmová, Daniela (203 Česká republika, garant, domácí) -- Molčanová, Lenka (703 Slovensko, domácí) -- Kotouček, Jan (203 Česká republika) -- Mašek, Josef (203 Česká republika) -- Treml, Jakub (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: PPARγ; nanoparticles; flavanones
Změnila: Mgr. Bc. Daniela Nykodýmová, učo 40332. Změněno: 28. 6. 2024 17:33.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2415197/cs -
ATTAFI, Omar Abdelghani, Damiano CLEMENTEL, Konstantinos KYRITSIS, Emidio CAPRIOTTI, Gavin FARRELL, Styliani-Christina FRAGKOULI, Leyla Jael CASTRO, Andras HATOS, Tom LENAERTS, Stanislav MAZURENKO, Soroush MOZAFFARI, Franco PRADELLI, Patrick RUCH, Castrense SAVOJARDO, Paola TURINA, Federico ZAMBELLI, Damiano PIOVESAN, Alexander Miguel MONZON, Fotis PSOMOPOULOS a Silvio C. E. TOSATTO. DOME Registry: implementing community-wide recommendations for reporting supervised machine learning in biology. GigaScience. OXFORD: Oxford University Press, 2024, roč. 13, December 2024, s. 1-8. ISSN 2047-217X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/gigascience/giae094.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: machine learning; standards; transparency; reproducibility
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 14. 1. 2025 10:28.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2467859/cs -
EGHBALINEJAD, Mahleh, María del Rocío LÓPEZ CABEZA, Jan KOTOUČEK, Renato GRILLO, Marek KOUTNY, Zuzana HOCHMANOVÁ a Jakub HOFMAN. Effects of three tebuconazole nanopesticides on the survival of <i>Daphnia magna</i>. Environmental Science: Nano. CAMBRIDGE: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2024, roč. 11, č. 3, s. 1044-1059. ISSN 2051-8153. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/d3en00673e.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Eghbalinejad, Mahleh (364 Írán, domácí) -- López Cabeza, María del Rocío (724 Španělsko, domácí) -- Kotouček, Jan (203 Česká republika) -- Hochmanová, Zuzana (203 Česká republika, domácí) -- Hofman, Jakub (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: ENVIRONMENTAL RISK ASSESSMENTS; ACUTE TOXICITY; NANOPARTICLES; ATRAZINE; GENOTOXICITY; CYHALOTHRIN; PESTICIDES; HERBICIDE; STABILITY; EXPOSURE
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 7. 8. 2024 13:22.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2421897/cs -
MIČAN, Jan, Da 'san M. M. JARADAT, Weidong LIU, Gert WEBER, Stanislav MAZURENKO, Uwe T. BORNSCHEUER, Jiří DAMBORSKÝ, Ren WEI a David BEDNÁŘ. Exploring new galaxies: Perspectives on the discovery of novel PET-degrading enzymes. Applied Catalysis B: Environment and Energy. Amsterdam: Elsevier, 2024, roč. 342, March 2024, s. 1-16. ISSN 0926-3373. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.apcatb.2023.123404.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Mičan, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: PET recycling; Protein engineering; Enzymatic degradation; Microbial dark matter; AlphaFold; High -throughput screening
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 5. 3. 2024 10:36.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2367868/cs -
MUSIL, Miloš, Andrej JEZIK, Jana HORÁČKOVÁ, Simeon BORKO, Petr KABOUREK, Jiří DAMBORSKÝ a David BEDNÁŘ. FireProt 2.0: web-based platform for the fully automated design of thermostable proteins. Briefings in Bioinformatics. Oxford University Press, 2024, roč. 25, č. 1, s. 1-10. ISSN 1467-5463. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bib/bbad425.URL
Název anglicky: FireProt 2.0: web-based platform for the fully automated design of thermostable proteins
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Musil, Miloš (203 Česká republika, domácí) -- Horáčková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Borko, Simeon (703 Slovensko, domácí) -- Kabourek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: ancestral; back-to-consensus; B-factor; epistasis; evolution; force-field; multiple-point mutant; protein engineering; saturation mutagenesis; thermostability
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 25. 3. 2024 11:46.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2349701/cs -
SLÁNSKÁ, Michaela, Lenka ŠTACKOVÁ, Sérgio Manuel MARQUES, P. ŠTACKO, Marek MARTÍNEK, Luboš JÍLEK, Martin TOUL, Jiří DAMBORSKÝ, David BEDNÁŘ, Petr KLÁN a Zbyněk PROKOP. Fotoaktivovatelný substrát na bázi azobenzenu pro halogenalkandehalogenázy. 2024.URL
Název anglicky: Azobenzene-based photoswitchable substrates for haloalkane dehalogenases
RIV: Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). čeština. Česká republika.
Slánská, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Štacková, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Štacko, P. (703 Slovensko) -- Martínek, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Jílek, Luboš (203 Česká republika, domácí) -- Toul, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Klán, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: photoswitch; enzyme; probe; azobenzene; transient kinetics; mechanism; time-resolved spectroscopy
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 28. 1. 2025 11:27.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2471877/cs -
HARDING-LARSEN, David, Christian Degnbol MADSEN, David TEZE, Tiia KITTILA, Mads Rosander LANGHORN, Hani GHARABLI, Mandy HOBUSCH, Felipe Mejia OTALVARO, Onur KIRTEL, Gonzalo Nahuel BIDART, Stanislav MAZURENKO, Evelyn TRAVNIK a Ditte Hededam WELNER. GASP: A Pan-Specific Predictor of Family 1 Glycosyltransferase Acceptor Specificity Enabled by a Pipeline for Substrate Feature Generation and Large-Scale Experimental Screening. ACS Omega. WASHINGTON: American Chemical Society, 2024, roč. 9, č. 25, s. 27278-27288. ISSN 2470-1343. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acsomega.4c01583.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: BIOCATALYSTS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 5. 8. 2024 08:52.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2421641/cs -
ŠPAČKOVÁ, Anna, Ondřej VÁVRA, Tomáš RAČEK, Václav BAZGIER, David SEHNAL, Jiří DAMBORSKÝ, Radka SVOBODOVÁ, David BEDNÁŘ a Karel BERKA. ChannelsDB 2.0: a comprehensive database of protein tunnels and pores in AlphaFold era. Nucleic Acids Research. Oxford University Press, 2024, roč. 52, D1, s. "D413"-"D418", 6 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkad1012.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Vávra, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Raček, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Sehnal, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Svobodová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Berka, Karel (garant)
Klíčová slova anglicky: amino acids; databases; protein; software; biomacromolecules; 3D structure; organelle- and cell-sized models; visualization
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 8. 3. 2024 10:36.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2346238/cs -
MIKUŠOVÁ, Petra, Zuzana TOUŠOVÁ, Luděk SEHNAL, Jan KUTA, K. GRABICOVA, G. FEDOROVA, Martin MAREK, R. GRABIC a Klára HILSCHEROVÁ. Identification of new endocrine disruptive transthyretin ligands in polluted waters using pull-down assay coupled to non-target mass spectrometry. Journal of Hazardous Materials. Amsterdam: Elsevier Science BV., 2024, roč. 471, June 2024, s. 1-12. ISSN 0304-3894. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jhazmat.2024.134240.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Mikušová, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Toušová, Zuzana (203 Česká republika, domácí) -- Sehnal, Luděk (203 Česká republika, domácí) -- Kuta, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Hilscherová, Klára (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Protein expression; Affinity purification; Wastewater; Thyroid hormone signaling; Mixtures
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 8. 2024 12:54.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2423201/cs -
PUSHKAROVA, Nadiia, Jana HENNELOVA, Sérgio Manuel MARQUES, David BEDNÁŘ, Kamil PARUCH, Naresh AKAVARAM, L. SPICHAL, Jiří DAMBORSKÝ, A. YEMETS a Jan HEJÁTKO. IDENTIFICATION OF NOVEL CYTOKININS BY MOLECULAR DOCKING. In IV Conference for Young Scientists “Plant biology and biotechnology”. 2024.URL
RIV: Konferenční abstrakt. angličtina. Ukrajina.
Pushkarova, Nadiia (804 Ukrajina, domácí) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Paruch, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Akavaram, Naresh (356 Indie, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: cytokinins; receptors; Arabidopsis thaliana; ligand; affinity
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 7. 10. 2024 10:54.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2441137/cs -
SCHÄFER, Marco, Nicolas BRICH, Jan BYŠKA, Sérgio Manuel MARQUES, David BEDNÁŘ, Philipp THIEL, Barbora KOZLÍKOVÁ a Michael KRONE. InVADo: Interactive Visual Analysis of Molecular Docking Data. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics. IEEE Computer Society, 2024, roč. 30, č. 4, s. 1984-1997. ISSN 1077-2626. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/TVCG.2023.3337642.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Schäfer, Marco (276 Německo) -- Brich, Nicolas (276 Německo) -- Byška, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Thiel, Philipp (276 Německo) -- Kozlíková, Barbora (203 Česká republika, domácí) -- Krone, Michael (276 Německo, garant)
Klíčová slova anglicky: proteins; drugs; visualization; data visualization; three-dimensional displays; receptor (biochemistry); carbon
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 25. 3. 2024 11:40.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2345857/cs -
BOUDNÁ, Marie, Táňa MACHÁČKOVÁ, Petra VYCHYTILOVÁ, Karolína TRACHTOVÁ, Renata BARTOŠOVÁ, Tina CATELA IVKOVIĆ, Dagmar AL TUKMACHI, Robin JUGAS, Lucie PIFKOVÁ, Jana ORLÍČKOVÁ, Jan KOTOUČEK, Marketa PAVLIKOVA, Milana ŠACHLOVÁ, Lucia BOHOVICOVÁ, Teodor STANĚK, Jana HALÁMKOVÁ, Igor KISS, Tomáš GROLICH, Martin SVOBODA, Zdeněk KALA, Kamila SOUČKOVÁ a Ondřej SLABÝ. Investigation of long non-coding RNAs in extracellular vesicles from low-volume blood serum specimens of colorectal cancer patients. CLINICAL AND EXPERIMENTAL MEDICINE. MILAN: SPRINGER-VERLAG ITALIA SRL, 2024, roč. 24, č. 1, s. 1-14. ISSN 1591-8890. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10238-024-01323-1.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Itálie.
Boudná, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Macháčková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Vychytilová, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Trachtová, Karolína (203 Česká republika, domácí) -- Bartošová, Renata (203 Česká republika, domácí) -- Catela Ivković, Tina (191 Chorvatsko, domácí) -- Al Tukmachi, Dagmar (203 Česká republika, domácí) -- Jugas, Robin (203 Česká republika, domácí) -- Pifková, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Orlíčková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Kotouček, Jan (203 Česká republika) -- Pavlikova, Marketa (203 Česká republika) -- Šachlová, Milana (203 Česká republika) -- Bohovicová, Lucia (203 Česká republika, domácí) -- Staněk, Teodor (203 Česká republika, domácí) -- Halámková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Kiss, Igor (203 Česká republika, domácí) -- Grolich, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Svoboda, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Kala, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Součková, Kamila (203 Česká republika, domácí) -- Slabý, Ondřej (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Biomarker; Colorectal cancer; EVs; lncRNAs.
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 10. 6. 2024 08:05.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2403337/cs -
HADDADI, Faraneh, Ondřej VÁVRA, David BEDNÁŘ, Stanislav MAZURENKO a Jiří DAMBORSKÝ. Klasifikátor vazebných kapes v proteinech založený na strojovém učení. 2024.URL
Název anglicky: A machine learning-based classifier of binding pockets in proteins
RIV: Software. čeština. Česká republika.
Haddadi, Faraneh (364 Írán, domácí) -- Vávra, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: machine learning; protein; predictor; protein engineering; ligand binding; catalysis
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 28. 1. 2025 08:32.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2471867/cs -
DOMÍNGUEZ-ROMERO, Elena, Stanislav MAZURENKO, Martin SCHERINGER, Vítor A.P. MARTINS DOS SANTOS, Chris T. EVELO, Mihail ANTON, John M HANCOCK, Anže ŽUPANIČ a Maria SUAREZ-DIEZ. Kód fyziologického farmakokinetického modelu (PBPK) v MatLabu pro simulaci časově závislých koncentrací chemických látek v lidském těle. 2024.URL
Název anglicky: Physiologically Based Pharmacokinetic (PBPK) model code in MatLab for simulating time-dependent concentrations of a chemical in a human body
RIV: Software. čeština. Česká republika.
Domínguez-Romero, Elena (724 Španělsko) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, garant, domácí) -- Scheringer, Martin (276 Německo) -- Martins dos Santos, Vítor A.P. (528 Nizozemské království) -- Evelo, Chris T. (528 Nizozemské království) -- Anton, Mihail (642 Rumunsko) -- Hancock, John M (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Županič, Anže (705 Slovinsko) -- Suarez-Diez, Maria (724 Španělsko)
Klíčová slova anglicky: pharmacokinetics; xenobiotics; partition coefficients; interoperability; MatLab
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 28. 1. 2025 09:43.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2471875/cs -
VÁVRA, Ondřej, J. TYZACK, Faraneh HADDADI, Jan DVORSKÝ, Jiří DAMBORSKÝ, Stanislav MAZURENKO, J.M. THORNTON a David BEDNÁŘ. Large-scale annotation of biochemically relevant pockets and tunnels in cognate enzyme-ligand complexes. Journal of Cheminformatics. London: BIOMED CENTRAL LTD, 2024, roč. 16, č. 1, s. 1-14. ISSN 1758-2946. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13321-024-00907-z.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Vávra, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Haddadi, Faraneh (364 Írán, domácí) -- Dvorský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, garant, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Bottleneck; Cognate ligand; Cavity; Enzyme; Tunnel; Machine learning; Pocket; Transport
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 23. 1. 2025 13:08.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2449066/cs -
BUSHUIEV, Anton, Roman BUSHUIEV, Petr KOUBA, Anatolii FILKIN, Marketa GABRIELOVA, Michal GABRIEL, Jiri SEDLAR, Tomas PLUSKAL4, Jiří DAMBORSKÝ, Stanislav MAZURENKO a Josef SIVIC. Learning to design protein-protein interactions with enhanced generalization. Online. In 12th International Conference on Learning Representations 2024. 2024, 26 s.URL
angličtina.
Klíčová slova anglicky: protein-protein interactions; protein design; generalization; self-supervised learning; equivariant 3D representations
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 24. 4. 2024 10:22.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2396557/cs -
SMOLKO, Martin, Ondrej KOVÁČ, Anna VYHLÍDALOVÁ KOTRBOVÁ, Nina BÖHMEOVÁ, Anežka CELÁ, Jan KOTOUČEK, Karel SOUČEK, Vítězslav BRYJA a Vendula HLAVÁČKOVÁ POSPÍCHALOVÁ. Lipidomic analysis of tetraspanin-deficient extracellular vesicles. In XXVII. BIOLOGICKÉ DNY - TKÁŇOVÉ MIKROPROSTŘEDÍ. 2024.URL
Změnil: Bc. Martin Smolko, učo 499709. Změněno: 9. 9. 2024 12:10.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2430677/cs -
SMOLKO, Martin, Ondrej KOVÁČ, Anna VYHLÍDALOVÁ KOTRBOVÁ, Nina BÖHMEOVÁ, Anežka CELÁ, Jan KOTOUČEK, Karel SOUČEK, Vítězslav BRYJA a Vendula HLAVÁČKOVÁ POSPÍCHALOVÁ. Lipidomic profiling of extracellular vesicles from tetraspanin-deficient cell lines. In ASEV-CzeSEV Joint Meeting on Extracellular Vesicles. 2024.URL
Změnil: Bc. Martin Smolko, učo 499709. Změněno: 30. 9. 2024 08:44.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2438437/cs -
DOMINGUEZ ROMERO, Elena, Stanislav MAZURENKO, Martin SCHERINGER, Martins Vitor A. P. DOS SANTOS, Chris T. EVELO, Mihail ANTON, John M. HANCOCK, Anze ZUPANIC a Maria SUAREZ-DIEZ. Making PBPK models more reproducible in practice. Briefings in Bioinformatics. Oxford (UK): Oxford University Press, 2024, roč. 25, č. 6, s. 1-13. ISSN 1467-5463. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bib/bbae569.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Dominguez Romero, Elena (724 Španělsko, garant, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Scheringer, Martin (756 Švýcarsko, domácí)
Klíčová slova anglicky: systems biology; pharmacokinetics; model code; reproducibility; SBML; MATLAB
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 27. 1. 2025 10:34.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2471501/cs -
AKITA, Masaki, Paul GIRVAN, Mário ŠPÍREK, Jiří NOVÁČEK, David RUEDA, Zbyněk PROKOP a Lumír KREJČÍ. Mechanism of BCDX2-mediated RAD51 nucleation on short ssDNA stretches and fork DNA. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2024, roč. 52, č. 19, s. 11738-11752. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkae770.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Akita, Masaki (392 Japonsko, domácí) -- Špírek, Mário (703 Slovensko, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Lumír (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: HOMOLOGOUS RECOMBINATION; FANCONI-ANEMIA; NUCLEOPROTEIN FILAMENTS; CONFER SUSCEPTIBILITY; BRC REPEATS; REPAIR; MUTATIONS; IDENTIFICATION; REVERSAL; PARALOGS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 10. 1. 2025 09:47.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2434878/cs -
SITTE, Martin a Pavel DVOŘÁK. Mikrobiální fosfoketolázy a jejich využití v biotechnologiích. Bulletin Československé společnocti mikrobiologické. Praha: ČSSM, 2024, roč. LXV, č. 3, s. 45-58. ISSN 0009-0646.
Název česky: Mikrobiální fosfoketolázy a jejich využití v biotechnologiích
Název anglicky: Microbial phosphoketolases and their use in biotechnology
čeština. Česká republika.
Klíčová slova anglicky: Phosphoketolase, Synthetic pathway, Pseudomonas putida, Polyhydroxyalkanoates, Lignocellulose sugars, Metabolic engineering, Biotechnology
Změnil: Mgr. Martin Sitte, učo 499957. Změněno: 9. 1. 2025 08:52.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2466159/cs -
EGHBALINEJAD, Mahleh, Jakub HOFMAN, Jan KOTOUČEK, Renato GRILLO, Zuzana HOCHMANOVÁ, Nicola REIFF a Sebastian HOESS. Nano-enabled pesticides: a comprehensive toxicity assessment of tebuconazole nanoformulations with nematodes at single species and community level. Jakub Hofman, Jan Kotouček, Renato Grillo, Zuzana Hochmanová Bílková, Nicola Re. Environmental Sciences Europe. NEW YORK: Springer-Verlag, GmbH, Environmental Sciences Europe, 2024, roč. 36, č. 1, s. 1-16. ISSN 2190-4707. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12302-024-00879-9.URL
Název česky: Nano-enabled pesticides: a comprehensive toxicity assessment of tebuconazole nanoformulations with nematodes at single species and community level
Název anglicky: Nano-enabled pesticides: a comprehensive toxicity assessment of tebuconazole nanoformulations with nematodes at single species and community level
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Eghbalinejad, Mahleh (364 Írán, domácí) -- Hofman, Jakub (203 Česká republika, garant, domácí) -- Kotouček, Jan (203 Česká republika) -- Hochmanová, Zuzana (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Combined toxicity; Nanotoxicity; Caenorhabditis elegans; Microcosm; Poly-epsilon-caprolactone; Tripalmitin
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 28. 1. 2025 13:38.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2401937/cs -
BENEŠOVÁ, Iva, Rudolf NENUTIL, Adam Paulin URMINSKÝ, Erika LATTOVÁ, Lukas UHRIK, Peter GRELL, Filip Zavadil KOKAS, Jana HALÁMKOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Bořivoj VOJTĚŠEK, Miloš V NOVOTNÝ a Lenka HERNYCHOVÁ. N-glycan profiling of tissue samples to aid breast cancer subtyping. Scientific Reports. Nature Research, 2024, roč. 14, č. 1, s. 1-16. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-023-51021-3.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Benešová, Iva (203 Česká republika) -- Nenutil, Rudolf (203 Česká republika) -- Urminský, Adam Paulin (703 Slovensko, domácí) -- Lattová, Erika (703 Slovensko, domácí) -- Grell, Peter (703 Slovensko) -- Halámková, Jana (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Vojtěšek, Bořivoj (203 Česká republika) -- Hernychová, Lenka (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: breast cancer; N-glycan profiling; Matrix-Assisted Laser Desorption
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 28. 1. 2025 09:02.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2403277/cs -
MAJEROVÁ, Marika, Michal VAŠINA, Daniel PLUSKAL, Karolina SEDLÁČKOVÁ, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a Martin MAREK. Nová duální dehalogenáza-luciferáza z hvězdice křehké Amphiura filiformis. 2024.URL
Název anglicky: A new dual dehalogenase-luciferase enzyme from the brittle star Amphiura filiformis
RIV: Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). čeština. Česká republika.
Majerová, Marika (703 Slovensko, domácí) -- Vašina, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Pluskal, Daniel (203 Česká republika, domácí) -- Sedláčková, Karolina (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Luciferase; dehalogenase; bioluminescence; enzyme; biocatalysis; gene
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 28. 1. 2025 08:08.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2471862/cs -
MAJEROVÁ, Marika, Michal VAŠINA, Daniel PLUSKAL, Karolina SEDLÁČKOVÁ, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a Martin MAREK. Nová vysoce aktivní luciferáza z hvězdice křehké Amphiura filiformis. 2024.URL
Název anglicky: A new highly active luciferase from the brittle star Amphiura filiformis
RIV: Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). čeština. Česká republika.
Majerová, Marika (703 Slovensko, domácí) -- Vašina, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Pluskal, Daniel (203 Česká republika, domácí) -- Sedláčková, Karolina (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Luciferase; bioluminescence; enzyme; biocatalysis; gene
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 28. 1. 2025 08:23.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2471866/cs -
VYCHYTILOVÁ, Petra, Sára VILMANOVÁ, Lucie PIFKOVÁ, Tina CATELA IVKOVIĆ, Marie MĄDRZYK, Robin JUGAS, Táňa MACHÁČKOVÁ, Jan KOTOUČEK, Milana ŠACHLOVÁ, Lucia BOHOVICOVÁ, Teodor STANĚK, Jana HALÁMKOVÁ, Igor KISS a Ondřej SLABÝ. Optimized procedure for high-throughput transcriptome profiling of small extracellular vesicles isolated from low volume serum samples. Clinical Chemistry and Laboratory Medicine. Berlin: WALTER DE GRUYTER, 2024, roč. 62, č. 1, s. 157-167. ISSN 1434-6621. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1515/cclm-2023-0610.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Vychytilová, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Vilmanová, Sára (203 Česká republika, domácí) -- Pifková, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Catela Ivković, Tina (191 Chorvatsko, domácí) -- Mądrzyk, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Jugas, Robin (203 Česká republika, domácí) -- Macháčková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Kotouček, Jan (203 Česká republika) -- Šachlová, Milana (203 Česká republika) -- Bohovicová, Lucia (203 Česká republika, domácí) -- Staněk, Teodor (203 Česká republika, domácí) -- Halámková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Kiss, Igor (203 Česká republika, domácí) -- Slabý, Ondřej (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: colorectal cancer; high-throughput expression profiling; long non-coding RNAs; size exclusion chromatography; small extracellular vesicles; transcriptome
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 28. 1. 2025 10:08.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2311897/cs -
ŠTOURAČ, Jan, Simeon BORKO, Rayyan Tariq KHAN, Petra POKORNÁ, Adam DOBIÁŠ, Joan PLANAS IGLESIAS, Stanislav MAZURENKO, José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, Veronika SZOTKOWSKÁ, Jaroslav ŠTĚRBA, Ondřej SLABÝ, Jiří DAMBORSKÝ a David BEDNÁŘ. PredictONCO: a web tool supporting decision-making in precision oncology by extending the bioinformatics predictions with advanced computing and machine learning. Briefings in Bioinformatics. Oxford University Press, 2024, roč. 25, č. 1, s. 1-10. ISSN 1467-5463. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bib/bbad441.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Borko, Simeon (703 Slovensko, domácí) -- Khan, Rayyan Tariq (586 Pákistán, domácí) -- Pokorná, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Dobiáš, Adam (703 Slovensko, domácí) -- Planas Iglesias, Joan (724 Španělsko, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Rangel Pamplona Pizarro Pinto, José Gaspar (620 Portugalsko, domácí) -- Szotkowská, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Štěrba, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Slabý, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: cancer; oncology; personalized medicine; single-nucleotide polymorphism; targeted therapy
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 13. 2. 2025 15:05.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2349317/cs -
HARDING-LARSEN, David, Jonathan FUNK, Niklas Gesmar MADSEN, Hani GHARABLI, Carlos G. ACEVEDO-ROCHA, Stanislav MAZURENKO a Ditte Hededam WELNER. Protein representations: Encoding biological information for machine learning in biocatalysis. Biotechnology Advances. OXFORD: Elsevier, 2024, roč. 77, December 2024, s. 1-20. ISSN 0734-9750. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.biotechadv.2024.108459.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Machine learning; Biocatalysis; Protein representations; Enzyme engineering; Representation learning; Protein dynamics; Predictive models
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 14. 1. 2025 11:46.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2467908/cs -
RAKYTOVÁ, Janka, Martin SMOLKO, Anna VYHLÍDALOVÁ KOTRBOVÁ, Kristína GÖMÖRYOVÁ, Anežka CELÁ, Jan KOTOUČEK, Václav PUSTKA, Zbyněk ZDRÁHAL, Karel SOUČEK, Vítězslav BRYJA a Vendula HLAVÁČKOVÁ POSPÍCHALOVÁ. Proteomic analysis of tetraspanin-deficient extracellular vesicles. In ASEV-CzeSEV Joint Meeting on Extracellular Vesicles. 2024.URL
Změnil: Bc. Martin Smolko, učo 499709. Změněno: 30. 9. 2024 09:02.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2438457/cs -
LÓPEZ CABEZA, María del Rocío, Mahleh EGHBALINEJAD, Melanie KAH, Renato GRILLO, Zuzana HOCHMANOVÁ, Jan KOTOUČEK a Jakub HOFMAN. Release and stability of two tebuconazole nanoformulations in different aquatic media. Environmental Science: Nano. CAMBRIDGE: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2024, roč. 11, č. 4, s. 1612-1621. ISSN 2051-8153. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/d3en00790a.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
López Cabeza, María del Rocío (724 Španělsko, domácí) -- Eghbalinejad, Mahleh (364 Írán, domácí) -- Hochmanová, Zuzana (203 Česká republika, domácí) -- Kotouček, Jan (203 Česká republika) -- Hofman, Jakub (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: LIPID CARRIERS NLC; DRUG-RELEASE; DEPLETION STABILIZATION; NANOPARTICLES; SYSTEMS; HERBICIDE; DIALYSIS; EXPOSURE; SALT
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 8. 8. 2024 08:13.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2421960/cs -
BUSHUIEV, Anton, Roman BUSHUIEV, Jiri SEDLAR, Tomas PLUSKAL, Jiří DAMBORSKÝ, Stanislav MAZURENKO a Josef SIVIC. Revealing data leakage in protein interaction benchmarks. In ICLR 2024 Workshop on Generative and Experimental Perspectives for Biomolecular Design. 2024, 13 s.
angličtina.
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 24. 4. 2024 10:52.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2396577/cs -
MARTIN, Hector Garcia, Stanislav MAZURENKO a Huimin ZHAO. Special Issue on Artificial Intelligence for Synthetic Biology. ACS Synthetic Biology. American Chemical Society, 2024, roč. 13, č. 2, s. 408-410. ISSN 2161-5063. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acssynbio.3c00760.URL
angličtina. Spojené státy.
Klíčová slova anglicky: Genetics; Kinetic modeling; Optimization; Peptides and proteins; Synthetic biology
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 24. 4. 2024 11:00.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2396578/cs -
DE LA BOURDONNAYE, Gabin, Martin MAREK, Tereza GHAZALOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Petr PACHL, Jiri BRYNDA, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ a Radka CHALOUPKOVÁ. Structural analysis of the stable form of fibroblast growth factor 2 - FGF2-STAB. Journal of Structural Biology: X. AMSTERDAM: ELSEVIER, 2024, roč. 10, December 2024, s. 1-8. ISSN 2590-1524. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.yjsbx.2024.100112.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
de La Bourdonnaye, Gabin (250 Francie, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika, garant, domácí) -- Ghazalová, Tereza (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Štěpánková, Veronika (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Stabilized fibroblast growth factor 2; X-ray structural analysis; Protein flexibility
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 27. 1. 2025 09:06.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2471448/cs -
Successor Sequence Predictor (SSP) (software)KHAN, Rayyan Tariq, Pavel KOHOUT, Miloš MUSIL, Monika ROSÍNSKÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Stanislav MAZURENKO, David BEDNÁŘ a Jan VILÍM. Successor Sequence Predictor (SSP). 2024.URL
Název anglicky: Successor Sequence Predictor (SSP)
RIV: Software. čeština. Česká republika.
Khan, Rayyan Tariq (586 Pákistán, domácí) -- Kohout, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Musil, Miloš (203 Česká republika) -- Rosínská, Monika (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Vilím, Jan (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: Protein engineering; protein; mutation; thermostability; activity; solubility; prediction; descriptor
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 28. 1. 2025 09:13.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2471883/cs -
HAVLÁSEK, Martin, Jiří DAMBORSKÝ a David BEDNÁŘ. Upravená dehalogenáza LinB116 se zlepšenou termostabilitou. 2024.URL
Název anglicky: Engineered dehalogenase LinB116 with improved thermostability
RIV: Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). čeština. Česká republika.
Havlásek, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Enzyme; stabilization; aggregation; thermostability; protein engineerin; solubility
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 28. 1. 2025 09:03.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2471869/cs -
KOHOUT, Pavel, Jiří DAMBORSKÝ a David BEDNÁŘ. Variační nástroj založený na autoenkodéru pro návrh ancestrálních proteinů. 2024.Skripty v jazyce Python a datové sady jsou k dispozici na GitHubu
Název anglicky: Variational Autoencoder-based tool for design of ancestral proteins
RIV: Software. čeština. Česká republika.
Kohout, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: protein; sequence; ancestral protein; amino acid; variability; multiple sequence alignment; phylogenetic reconstruction
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 28. 1. 2025 09:38.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2471884/cs -
KUNKA, Antonín, Sérgio Manuel MARQUES, Martin HAVLÁSEK, Michal VAŠINA, Nikola VELÁTOVÁ, Lucia CENGELOVÁ, David KOVÁŘ, Jiří DAMBORSKÝ, Martin MAREK, David BEDNÁŘ a Zbyněk PROKOP. Advancing Enzyme's Stability and Catalytic Efficiency through Synergy of Force-Field Calculations, Evolutionary Analysis, and Machine Learning. ACS Catalysis. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2023, roč. 13, č. 19, s. 12506-12518. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acscatal.3c02575.URL
RIV/00216224:14310/23:00132030 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Kunka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Havlásek, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Vašina, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Velátová, Nikola (203 Česká republika, domácí) -- Cengelová, Lucia (703 Slovensko, domácí) -- Kovář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: biocatalysis; computational design; FireProt; machine learning; PROSS; proteinengineering; stabilization; thermostability
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 8. 4. 2024 07:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2329981/cs -
ŠNAJDAROVÁ, Karolína, Sérgio Manuel MARQUES, Jiří DAMBORSKÝ, David BEDNÁŘ a Martin MAREK. Atypical homodimerization revealed by the structure of the (S)-enantioselective haloalkane dehalogenase DmmarA from Mycobacterium marinum. Acta Crystallographica Section D: Structural Biology. Chester: International Union of Crystallography, 2023, roč. 79, November, s. 956-970. ISSN 2059-7983. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1107/S2059798323006642.URL
RIV/00216224:14310/23:00133095 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Šnajdarová, Karolína (203 Česká republika, domácí) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenases; Mycobacterium marinum; DmmarA; homodimerization; surface loops; enantioselectivity; X-ray crystallography; SAXS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 19. 1. 2024 09:05.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2362804/cs -
SMITH, Andrea, Martin TOUL, Daniel PLUSKAL, Racha BAATALLAH, Glwadys GAGNOT, José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, Vinicius T. T. SANTANA, Markéta STUCHLÁ, Petr NEUGEBAUER, Pimchai CHAIYEN, Jiří DAMBORSKÝ, David BEDNÁŘ, Yves L. L. JANIN, Zbyněk PROKOP a Martin MAREK. Catalytic mechanism for Renilla-type luciferases. Nature Catalysis. Nature Portfolio, 2023, roč. 6, č. 1, s. 23-38. ISSN 2520-1158. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41929-022-00895-z.URL
RIV/00216224:14310/23:00130829 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Smith, Andrea (703 Slovensko, domácí) -- Toul, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Pluskal, Daniel (203 Česká republika, domácí) -- Rangel Pamplona Pizarro Pinto, José Gaspar (620 Portugalsko, domácí) -- Stuchlá, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: CYPRIDINA LUCIFERIN; PROTEIN CRYSTALLIZATION; BIOLUMINESCENCE; RENIFORMIS; LIGHT; CHEMILUMINESCENCE; COELENTERAZINE; STABILITY; LUMINESCENCE; SPECIFICITY
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 8. 4. 2024 07:49.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2285204/cs -
POLJOVKA, Andrej, Miloš MUSIL, David BEDNÁŘ, Katarina CHOVANOVA, Vladena BAUEROVA-HLINKOVA, Jana BELLOVA, Lenka KOHUTOVA, Peter BARATH a Marcel ZAMOCKY. Comparison of Fungal Thermophilic and Mesophilic Catalase-Peroxidases for Their Antioxidative Properties. Antioxidants. Basel: MDPI, 2023, roč. 12, č. 7, s. 1-19. ISSN 2076-3921. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/antiox12071382.URL
RIV/00216224:14310/23:00131488 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Musil, Miloš (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: peroxidase-catalase superfamily; heme catalase; bifunctional enzyme; reactive oxygen species; oxidative stress
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 23. 8. 2023 21:12.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2303823/cs -
VILÍM, Jan, Tereza GHAZALOVÁ, Eliška PETULOVÁ, Aneta HORACKOVA, Veronika STEPANKOVA, Radka CHALOUPKOVÁ, David BEDNÁŘ, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Computer-assisted stabilization of fibroblast growth factor FGF-18. Computational and Structural Biotechnology Journal. AMSTERDAM: Elsevier, 2023, roč. 21, October 2023, s. 5144-5152. ISSN 2001-0370. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.csbj.2023.10.009.URL
RIV/00216224:14310/23:00133177 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Vilím, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Ghazalová, Tereza (203 Česká republika) -- Petulová, Eliška (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Computer-assisted stabilization; Fibroblast growth factor; Thermostability; Resistance to; Protease; Improved yield; FGF-18
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 30. 1. 2024 10:32.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2364863/cs -
SMOLKO, Martin, Anna VYHLÍDALOVÁ KOTRBOVÁ, Anežka CELÁ, Jan KOTOUČEK, Karel SOUČEK, Vítězslav BRYJA a Vendula HLAVÁČKOVÁ POSPÍCHALOVÁ. CRISPR CAS9 ENGINEERED TETRASPANIN DEFICIENT CELL LINES FOR THE ANALYSIS OF EXTRACELLULAR VESICLES. In 12th International Conference Analytical Cytometry. 2023.URL
angličtina. Česká republika.
Změnil: Bc. Martin Smolko, učo 499709. Změněno: 20. 4. 2024 17:53.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2395462/cs -
GAO, Tadeja, Jiří DAMBORSKÝ, Yves L. JANIN a Martin MAREK. Deciphering Enzyme Mechanisms with Engineered Ancestors and Substrate Analogues. ChemCatChem. WEINHEIM: WILEY-V C H VERLAG GMBH, 2023, roč. 15, č. 19, s. 1-16. ISSN 1867-3880. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cctc.202300745.URL
RIV/00216224:14310/23:00132027 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Gao, Tadeja (705 Slovinsko, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Janin, Yves L. (250 Francie) -- Marek, Martin (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: ancestral sequence reconstruction; azacoelenterazine; biocatalysis; bioluminescence; coelenterazine; luciferase; enzymes; FireProt ASR; reaction mechanism; substrate analogues
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 11. 2023 21:40.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2329942/cs -
NEMERGUT, Michal, Sérgio Manuel MARQUES, Lukáš UHRÍK, Tereza VÁŇOVÁ, Markéta NEZVEDOVÁ, Darshak Chandulal GADARA, Durga JHA, Jan TULIS, Veronika NOVÁKOVÁ, Joan PLANAS IGLESIAS, Antonín KUNKA, Anthony Thomas P LEGRAND, Hana HŘÍBKOVÁ, Veronika POSPÍŠILOVÁ, Jiří SEDMÍK, Jan RAŠKA, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ, Dáša BOHAČIAKOVÁ, Zdeněk SPÁČIL, Lenka HERNYCHOVÁ, David BEDNÁŘ a Martin MAREK. Domino-like effect of C112R mutation on ApoE4 aggregation and its reduction by Alzheimer’s Disease drug candidate. Molecular Neurodegeneration. England: BMC, 2023, roč. 18, č. 1, s. 1-25. ISSN 1750-1326. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13024-023-00620-9.URL
RIV/00216224:14310/23:00130923 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Nemergut, Michal (703 Slovensko, domácí) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Uhrík, Lukáš (703 Slovensko) -- Váňová, Tereza (203 Česká republika, domácí) -- Nezvedová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Gadara, Darshak Chandulal (356 Indie, domácí) -- Jha, Durga (356 Indie, domácí) -- Tulis, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Nováková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Planas Iglesias, Joan (724 Španělsko, domácí) -- Kunka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Legrand, Anthony Thomas P (250 Francie, domácí) -- Hříbková, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Sedmík, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Raška, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bohačiaková, Dáša (703 Slovensko, domácí) -- Spáčil, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Hernychová, Lenka (203 Česká republika) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Apolipoprotein E; Alzheimer’s disease; Neurodegeneration; Aggregation; Cerebral organoids; Molecular dynamics; HDX-MS; Protein crystallography; Proteomics; Lipidomics; Tramiprosate; 3-sulfopropanoic acid
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 21. 2. 2025 15:43.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2289318/cs -
ŠPAČKOVÁ, Anna, Ondřej VÁVRA, Tomáš RAČEK, Václav BAZGIER, David SEHNAL, Jiří DAMBORSKÝ, Radka SVOBODOVÁ a Karel BERKA. ChannelsDB 2.0: A Comprehensive Database of Protein Tunnels and Pores in AlphaFold Era. In 3D-BioInfo | ICSB 3D-SIG | ELIXIR Czech Republic Community Meeting in Structural Bioinformatics. 2023.URL
angličtina. Česká republika.
Změnil: RNDr. Tomáš Raček, Ph.D., učo 324965. Změněno: 16. 11. 2023 12:07.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2339999/cs -
TOUL, Martin, Veronika SLONKOVÁ, Jan MIČAN, Adam Paulin URMINSKÝ, Maria TOMKOVA, Erik SEDLÁK, David BEDNÁŘ, Jiří DAMBORSKÝ, Lenka HERNYCHOVÁ a Zbyněk PROKOP. Identification, characterization, and engineering of glycosylation in thrombolytics. Biotechnology Advances. OXFORD: Elsevier, 2023, roč. 66, September 2023, s. 1-23. ISSN 0734-9750. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.biotechadv.2023.108174.URL
RIV/00216224:14310/23:00131494 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Toul, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Slonková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Mičan, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Urminský, Adam Paulin (703 Slovensko) -- sedlák, Erik (203 Česká republika) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Hernychová, Lenka (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Alteplase; Biopharmaceutical; Cell-free glycoprotein synthesis; Computational design; Desmoteplase; Glycosylation; Protein engineering; Tenecteplase; Thrombolytic; Urokinase
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 30. 1. 2024 10:31.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2304028/cs -
NEMERGUT, Michal, Daniel PLUSKAL, Jana HORÁČKOVÁ, Tereza ŠUSTROVÁ, Jan TULIS, Tomáš BÁRTA, Racha BAATALLAH, Glwadys GAGNOT, Veronika NOVÁKOVÁ, Marika MAJEROVÁ, Karolina SEDLÁČKOVÁ, Sérgio Manuel MARQUES, Martin TOUL, Jiří DAMBORSKÝ, Zbyněk PROKOP, David BEDNÁŘ, Yves L. JANIN a Martin MAREK. Illuminating the mechanism and allosteric behavior of NanoLuc luciferase. Nature Communications. Berlin: Nature, 2023, roč. 14, č. 1, s. 1-20. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-43403-y.URL
RIV/00216224:14310/23:00133132 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Nemergut, Michal (703 Slovensko, domácí) -- Pluskal, Daniel (203 Česká republika, domácí) -- Horáčková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Šustrová, Tereza (203 Česká republika, domácí) -- Tulis, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Bárta, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Nováková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Majerová, Marika (703 Slovensko, domácí) -- Sedláčková, Karolina (203 Česká republika, domácí) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Toul, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS; BIOLOGICAL MACROMOLECULES; CRYSTAL-STRUCTURE; BINDING PROTEIN; CDNA CLONING; BIOLUMINESCENCE; COELENTERAMIDE; INTEGRATION; PREDICTION; SUBSTRATE
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 8. 4. 2024 07:50.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2364223/cs -
GUERRA-SLOMPO, Eloise Pavao, Gisele Fernanda Assine PICCHI-CONSTANTE, Martin MAREK, Christophe ROMIER, Wolfgang SIPPL a Nilson Ivo Tonin ZANCHIN. In cellulo and in vivo assays for compound testing against Trypanosoma cruzi. STAR Protocols. United States: Cell Press, 2023, roč. 4, č. 1, s. 1-42. ISSN 2666-1667. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.xpro.2023.102058.URL
RIV/00216224:14310/23:00132246 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Marek, Martin (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Cell Biology; Cell-based Assays; High-throughput Screening; Microbiology; Model Organisms
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 25. 1. 2024 14:41.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2339437/cs -
VAŠINA, Michal, David KOVÁŘ, Jiří DAMBORSKÝ, Ding YUN, Tianjin YANG, Andrew DE MELLO, Stanislav MAZURENKO, Stavros STAVRAKIS a Zbyněk PROKOP. In-depth analysis of biocatalysts by microfluidics: An emerging source of data for machine learning. Biotechnology Advances. OXFORD: Elsevier, 2023, roč. 66, September 2023, s. 1-22. ISSN 0734-9750. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.biotechadv.2023.108171.URL
RIV/00216224:14310/23:00131491 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Vašina, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Kovář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Enzyme; Biochemical characterization; Biotechnology; Catalytic activity; Thermostability; Steady-state kinetics; Protein crystallography; Big data; Protein engineering; Artificial intelligence
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 30. 1. 2024 10:30.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2303827/cs -
KOUBA, Petr, Pavel KOHOUT, Faraneh HADDADI, Anton BUSHUIEV, Raman SAMUSEVICH, Jiri SEDLAR, Jiří DAMBORSKÝ, Tomáš PLUSKAL, Josef SIVIC a Stanislav MAZURENKO. Machine Learning-Guided Protein Engineering. ACS Catalysis. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2023, roč. 13, č. 21, s. 13863-13895. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acscatal.3c02743.URL
RIV/00216224:14310/23:00133331 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Kouba, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Kohout, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Haddadi, Faraneh (364 Írán, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Pluskal, Tomáš (203 Česká republika) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí)
Klíčová slova anglicky: activity; artificial intelligence; biocatalysis; deep learning; protein design
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 5. 4. 2024 16:07.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2367877/cs -
CHMELOVÁ, Klaudia, Tadeja GAO, Martin POLÁK, Andrea SMITH, Tristan I. CROLL, Tanvir SHAIKH, Jana ŠKAŘUPOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Kay DIEDERICHS, Randy J. READ, Jiří DAMBORSKÝ, Jiří NOVÁČEK a Martin MAREK. Multimeric structure of a subfamily III haloalkane dehalogenase-like enzyme solved by combination of cryo-EM and x-ray crystallography. Protein Science. Hoboken: Wiley, 2023, roč. 32, č. 10, s. 1-22. ISSN 0961-8368. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/pro.4751.URL
RIV/00216224:14310/23:00132287 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Chmelová, Klaudia (703 Slovensko, domácí) -- Gao, Tadeja (705 Slovinsko, domácí) -- Polák, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Smith, Andrea (703 Slovensko, domácí) -- Shaikh, Tanvir (840 Spojené státy, domácí) -- Škařupová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: catalysis; cryo-EM; DhmeA; haloalkane dehalogenase; Haloferax mediterranei; multimerization; x-ray crystallography
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 4. 2. 2025 08:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2339818/cs -
ČARNA, Maria, Isaac G. ONYANGO, Stanislav KATINA, Dušan HOLUB, Jan Sebastian NOVOTNY, Markéta NEZVEDOVÁ, Durga JHA, Zuzana NEDELSKA, Valentina LACOVICH, Thijs Vande VYVERE, Ruben HOUBRECHTS, Krystine GARCIA-MANSFIELD, Ritin SHARMA, Victoria DAVID-DIRGO, Martin VYHNALEK, Kateřina TEXLOVA, Hernan CHAVES, Nadine BAKKAR, Lucia PERTIERRA, Mojmír VINKLER, Hana MARKOVA, Jan LACZO, Kateřina SHEARDOVÁ, Marcela HORTOVA-KOHOUTKOVA, Jan FRIČ, Giancarlo FORTE, Petr KAŇOVSKY, Silvie BELAŠKOVA, Jiří DAMBORSKÝ, Jakub HORT, Nicholas T. SEYFRIED, Robert BOWSER, Gustavo SEVLEVER, Robert A. RISSMAN, Richard A. SMITH, Marian HAJDUCH, Patrick PIRROTTE, Zdeněk SPÁČIL, Eric B. DAMMER, Clara LIMBÄCK-STOKIN a Gorazd B. STOKIN. Pathogenesis of Alzheimer´s disease: Involvement of the choroid plexus. Alzheimer´s & Dementia. Wiley, 2023, roč. 19, č. 8, s. 3537-3554. ISSN 1552-5260. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/alz.12970.DOI
RIV/00216224:14310/23:00130379 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Katina, Stanislav (703 Slovensko, domácí) -- Nezvedová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Jha, Durga (356 Indie, domácí) -- Vinkler, Mojmír (203 Česká republika, domácí) -- Sheardová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Spáčil, Zdeněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: aging; Alzheimer's disease; cerebrospinal fluid; choroid plexus; pathology
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 27. 8. 2024 16:34.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2261937/cs -
BRHELOVÁ, Eliška, Veronika SLONKOVÁ, Martin TOUL, David KOVÁŘ, Sandra THALEROVÁ, Jana HLOŽKOVÁ, Peter SCHEER, Ahmet Davut AKSU, Radka OPATŘILOVÁ, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a Robert MIKULÍK. Poměr plazminogen/plazmin jako ukazatel bezpečnosti trombolytické léčby. In 50. pracovní konference "Komise experimentální kardiologie" 4.-6. října 2023, hotel Galant, Mikulov. 2023. ISBN 978-80-11-03840-3.Odborný program konference - sborník abstrakt
Název česky: Poměr plazminogen/plazmin jako ukazatel bezpečnosti trombolytické léčby
Název anglicky: Plasminogen/plasmin ratio as safety indicator of thrombolytic treatment
RIV/00216224:14160/23:00134658 Konferenční abstrakt. čeština. Česká republika.
Brhelová, Eliška (203 Česká republika, garant, domácí) -- Slonková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Toul, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Kovář, David (203 Česká republika, domácí) -- Thalerová, Sandra (203 Česká republika, domácí) -- Hložková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Scheer, Peter (203 Česká republika, domácí) -- Aksu, Ahmet Davut (792 Turecko, domácí) -- Opatřilová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Mikulík, Robert (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: plasminogen; thrombolysis
Změnil: MVDr. Peter Scheer, Ph.D., učo 245417. Změněno: 12. 10. 2023 11:37.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2323277/cs -
VÁVRA, Ondřej, Jakub BERANEK, Jan ŠTOURAČ, Martin SURKOVSKY, Jiří FILIPOVIČ, Jiří DAMBORSKÝ, Jan MARTINOVIC a David BEDNÁŘ. pyCaverDock: Python implementation of the popular tool for analysis of ligand transport with advanced caching and batch calculation support. Bioinformatics. Oxford: Oxford University Press, 2023, roč. 39, č. 8, s. 1-3. ISSN 1367-4803. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btad443.URL
RIV/00216224:14310/23:00131665 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Vávra, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Filipovič, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: WEB SERVER
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: doc. RNDr. Jiří Filipovič, Ph.D., učo 72898. Změněno: 30. 11. 2023 12:39.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2309997/cs -
PAPAGEORGIOU, Anna, Michaela POSPÍŠILOVÁ, Jakub CIBULKA, Raghib ASHRAF, Christopher WAUDBY, Pavel KADEŘÁVEK, Volha MAROZ, Karel KUBÍČEK, Zbyněk PROKOP, Lumír KREJČÍ a Konstantinos TRIPSIANES. Recognition and coacervation of G-quadruplexes by a multifunctional disordered region in RECQ4 helicase. Nature Communications. Berlin: Nature, 2023, roč. 14, č. 1, s. 1-19. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-42503-z.URL
RIV/00216224:14740/23:00134740 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Papageorgiou, Anna (300 Řecko, domácí) -- Pospíšilová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Cibulka, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Ashraf, Raghib (356 Indie, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Maroz, Volha (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Lumír (203 Česká republika, domácí) -- Tripsianes, Konstantinos (300 Řecko, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Biomolecular polyelectrolyte complexes; DNA helicase Q4; G-quadruplexes; intrinsically disordered regions; RPA protein
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 27. 10. 2024 15:27.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2344400/cs -
ULBRICH, Pavol, Manuela WALDNER, Katarína FURMANOVÁ, Sérgio Manuel MARQUES, David BEDNÁŘ, Barbora KOZLÍKOVÁ a Jan BYŠKA. sMolBoxes: Dataflow Model for Molecular Dynamics Exploration. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics. United States: IEEE Computer Society, 2023, roč. 29, č. 1, s. 581-590. ISSN 1077-2626. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/TVCG.2022.3209411.URL
RIV/00216224:14330/23:00130033 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Ulbrich, Pavol (703 Slovensko, garant, domácí) -- Waldner, Manuela (40 Rakousko) -- Furmanová, Katarína (703 Slovensko, domácí) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Kozlíková, Barbora (203 Česká republika, domácí) -- Byška, Jan (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Molecular dynamics;structure;node-based visualization;progressive analytics
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 25. 7. 2024 07:58.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2222179/cs -
UHRIK, Lukas, Tomas HENEK, Joan PLANAS IGLESIAS, Josef KUCERA, Jiří DAMBORSKÝ, Martin MAREK a Lenka HERNYCHOVA. Study of Protein Conformational Dynamics Using Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry. In Ângela Sousa, Luis Passarinha. Advanced Methods in Structural Biology. New York: Springer Nature, 2023, s. 293-318. 1. ISBN 978-1-0716-3146-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3147-8_18.URL
RIV/00216224:14310/23:00133541 Kapitola resp. kapitoly v odborné knize. angličtina. Spojené státy.
Planas Iglesias, Joan (724 Španělsko, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Ancestral luciferase; Hydrogen/deuterium exchange; LoopGrafter; Mass spectrometry; Protein dynamics; Protein engineering
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 15. 2. 2024 14:48.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2374292/cs -
PARUCH, Kamil, Benoit Jean-Pierre CARBAIN, Štěpán HAVEL, Jiří DAMBORSKÝ, Jan BREZOVSKÝ, Lukáš DANIEL, Alexandra SISÁKOVÁ, Fedor NIKULENKOV a Lumír KREJČÍ. Substituted aminothiazoles as inhibitors of nucleases. 2023. Patent. Číslo: IL277866. Vydavatel: Israel Patent Office. Místo vydání: Jerusalem. Název vlastníka: Masarykova univerzita. Datum registrace: 15. 4. 2019. Datum přijetí: 2. 12. 2023.Israel Patent Office URL
Název anglicky: Substituted aminothiazoles as inhibitors of nucleases
RIV/00216224:14310/23:00132705 Patent. židovština. Izrael.
Paruch, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Carbain, Benoit Jean-Pierre (250 Francie, domácí) -- Havel, Štěpán (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Daniel, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Sisáková, Alexandra (703 Slovensko, domácí) -- Nikulenkov, Fedor (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Lumír (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: DNA; propanamide; nuclease
Mezinárodní význam: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 6. 8. 2024 10:37.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2354730/cs -
PARUCH, Kamil, Benoit Jean-Pierre CARBAIN, Štěpán HAVEL, Jiří DAMBORSKÝ, Jan BREZOVSKÝ, Lukáš DANIEL, Alexandra SISÁKOVÁ, Fedor NIKULENKOV a Lumír KREJČÍ. Substituted aminothiazoles as inhibitors of nucleases. 2023. Patent. Číslo: US11584742. Vydavatel: United States Patent and Trademark Office. Místo vydání: Alexandria, Virginia. Název vlastníka: Masarykova univerzita. Datum registrace: 15. 4. 2019. Datum přijetí: 21. 2. 2023.URL
RIV/00216224:14310/23:00130560 Patent. angličtina. Spojené státy.
Paruch, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Carbain, Benoit Jean-Pierre (250 Francie, domácí) -- Havel, Štěpán (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Daniel, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Sisáková, Alexandra (703 Slovensko, domácí) -- Nikulenkov, Fedor (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Lumír (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: DNA; propanamide; nuclease
Mezinárodní význam: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 6. 8. 2024 10:39.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2273663/cs -
HOLOUBEK, Jakub, Břetislav LIPOVÝ, Martin KNOZ, Tomáš KEMPNÝ, Radka CHALOUPKOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ a Lucy VOJTOVÁ. The future for the application of fibroblast growth factor 2 in modern wound healing. BURNS. OXFORD: ELSEVIER SCI LTD, 2023, roč. 49, č. 2, s. 484-486. ISSN 0305-4179. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.burns.2022.10.007.URL
Název anglicky: The future for the application of fibroblast growth factor 2 in modern wound healing
RIV/00216224:14110/23:00134621 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Holoubek, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Lipový, Břetislav (203 Česká republika, domácí) -- Knoz, Martin (203 Česká republika, garant) -- Kempný, Tomáš (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Vojtová, Lucy (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: fibroblast growth factor 2; wound healing
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 26. 1. 2024 10:43.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2249016/cs -
FULNEČEK, Jaroslav, Eva KLIMENTOVÁ, Albert CAIRO CALZADA, Soňa BUKOVČÁKOVÁ, Panagiotis ALEXIOU, Zbyněk PROKOP a Karel ŘÍHA. The SAP domain of Ku facilitates its efficient loading onto DNA ends. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2023, roč. 51, č. 21, s. 11706-11716. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkad850.URL
RIV/00216224:14740/23:00132961 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Fulneček, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Klimentová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Cairo Calzada, Albert (724 Španělsko, domácí) -- Bukovčáková, Soňa (703 Slovensko, domácí) -- Alexiou, Panagiotis (300 Řecko, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Říha, Karel (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: STRAND BREAK REPAIR; TELOMERE LENGTH; ARABIDOPSIS; HETERODIMER; HYPERSENSITIVITY; PROTECTION; PATHWAYS; MUTANTS; FUSIONS; RNA
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 15. 10. 2024 14:55.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2359939/cs -
DVOŘÁK, Petr, Pavel KREJČÍ, Lukáš BÁLEK, Lívia EISELLEOVÁ, Žaneta KONEČNÁ, Pavel DVOŘÁK, David BEDNÁŘ, Jan BREZOVSKÝ, Eva ŠEBESTOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Pavel VAŇÁČEK, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a Michaela BOSÁKOVÁ. Thermostable FGF2 polypeptide, use thereof. 2023. Patent. Číslo: US11746135B2. Vydavatel: United States Patent and Trademark Office. Místo vydání: Alexandria (Virginie). Název vlastníka: Masarykova univerzita; Enantis s.r.o. Datum registrace: 3. 10. 2016. Datum přijetí: 5. 9. 2023.URL
RIV/00216224:14310/23:00132706 Patent. angličtina. Spojené státy.
Dvořák, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Bálek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Eiselleová, Lívia (703 Slovensko, domácí) -- Konečná, Žaneta (203 Česká republika, domácí) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Šebestová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bosáková, Michaela (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Fibroblast Growth Factor 2; FGF2
Mezinárodní význam: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 3. 4. 2024 12:08.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2354741/cs -
DVOŘÁK, Petr, Pavel KREJČÍ, Lukáš BÁLEK, Lívia EISELLEOVÁ, Žaneta KONEČNÁ, Pavel DVOŘÁK, David BEDNÁŘ, Jan BREZOVSKÝ, Eva ŠEBESTOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Pavel VAŇÁČEK, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a Michaela BOSÁKOVÁ. Thermostable FGF2 polypeptide, use thereof. 2023. Patent. Číslo: CA3006388. Vydavatel: Canadian Intellectual Property Office. Místo vydání: Gatineau, Quebec. Název vlastníka: Masarykova univerzita; Enantis s.r.o. Datum registrace: 3. 10. 2016. Datum přijetí: 9. 5. 2023.URL
RIV/00216224:14310/23:00130823 Patent. angličtina. Kanada.
Dvořák, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Bálek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Eiselleová, Lívia (703 Slovensko, domácí) -- Konečná, Žaneta (203 Česká republika, domácí) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Šebestová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bosáková, Michaela (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Fibroblast Growth Factor 2; FGF2
Mezinárodní význam: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 3. 4. 2024 13:44.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2285102/cs -
DVOŘÁK, Petr, Pavel KREJČÍ, Lukáš BÁLEK, Lívia EISELLEOVÁ, Žaneta KONEČNÁ, Pavel DVOŘÁK, David BEDNÁŘ, Jan BREZOVSKÝ, Eva ŠEBESTOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Pavel VAŇÁČEK, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a Michaela BOSÁKOVÁ. Thermostable FGF2 Polypeptide, Use Thereof. 2023. Patent. Číslo: IN485239. Vydavatel: Intellectual Property India. Místo vydání: Dwarka, New Delhi. Název vlastníka: Masarykova univerzita; Enantis s.r.o. Datum registrace: 3. 10. 2016. Datum přijetí: 19. 12. 2023.URL
Název anglicky: Thermostable FGF2 Polypeptide, Use Thereof
RIV/00216224:14310/23:00133874 Patent. hindština. Indie.
Dvořák, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Bálek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Eiselleová, Lívia (703 Slovensko, domácí) -- Konečná, Žaneta (203 Česká republika, domácí) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Šebestová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bosáková, Michaela (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Fibroblast Growth Factor 2; FGF2
Mezinárodní význam: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 6. 8. 2024 10:38.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2386677/cs -
PARUCH, Kamil, Benoit Jean-Pierre CARBAIN, Štěpán HAVEL, Jiří DAMBORSKÝ, Jan BREZOVSKÝ, Lukáš DANIEL, Alexandra SISÁKOVÁ, Fedor NIKULENKOV a Lumír KREJČÍ. ヌクレアーゼの阻害剤としての置換アミノチアゾール. 2022. Patent. Číslo: JP7175031. Vydavatel: Japan Patent Office (JPO). Místo vydání: Kasumigaseki Chiyoda-ku, Tokyo. Název vlastníka: Masarykova univerzita. Datum registrace: 15. 4. 2019. Datum přijetí: 10. 11. 2022.URL
Název anglicky: Substituted aminothiazoles as inhibitors of nucleases
RIV/00216224:14310/22:00128639 Patent. japonština. Japonsko.
Paruch, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Carbain, Benoit Jean-Pierre (250 Francie, domácí) -- Havel, Štěpán (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Daniel, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Sisáková, Alexandra (703 Slovensko, domácí) -- Nikulenkov, Fedor (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Lumír (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: DNA; propanamide; nuclease
Mezinárodní význam: ano
CHYBA! Není vyplněn teritoriální rozsah patentové ochrany.
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 14. 2. 2023 17:38.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2255558/cs -
DVOŘÁK, Petr, Pavel KREJČÍ, Lukáš BÁLEK, Lívia EISELLEOVÁ, Žaneta KONEČNÁ, Pavel DVOŘÁK, David BEDNÁŘ, Jan BREZOVSKÝ, Eva ŠEBESTOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Pavel VAŇÁČEK, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a Michaela BOSÁKOVÁ. 熱安定性ＦＧＦ２ポリペプチド及びその使用. 2022. Patent. Číslo: JP7131772. Vydavatel: Japan Patent Office (JPO). Místo vydání: Kasumigaseki Chiyoda-ku, Tokyo. Název vlastníka: Masarykova univerzita, Enantis, s.r.o. Datum registrace: 3. 10. 2016. Datum přijetí: 29. 8. 2022.URL
Název anglicky: Thermostable FGF2 polypeptide, use thereof
RIV/00216224:14310/22:00128920 Patent. japonština. Japonsko.
Dvořák, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Bálek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Eiselleová, Lívia (703 Slovensko, domácí) -- Konečná, Žaneta (203 Česká republika, domácí) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Šebestová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Štěpánková, Veronika (203 Česká republika) -- Vaňáček, Pavel (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bosáková, Michaela (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: FGF2; Stem cells; Drugs
CHYBA! Není vyplněn teritoriální rozsah patentové ochrany.
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 22. 3. 2023 14:14.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2269137/cs -
PARDO, Isabel, David BEDNÁŘ, Patricia CALERO, Daniel C VOLKE, Jiří DAMBORSKÝ a Pablo I. NIKEL. A Nonconventional Archaeal Fluorinase Identified by In SilicoMining for Enhanced Fluorine Biocatalysis br. ACS Catalysis. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2022, roč. 12, č. 11, s. 6570-6577. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acscatal.2c01184.URL
RIV/00216224:14310/22:00126369 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: fluorinase; fluorine; organofluorine; synthetic biology; biocatalysis; metabolic engineering; synthetic metabolism
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 3. 2023 22:49.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1883599/cs -
VAŠINA, Michal, Pavel VAŇÁČEK, Jiri HON, David KOVÁŘ, Hana FALDYNOVÁ, Antonín KUNKA, Tomáš BURYŠKA, Christoffel P. S. BADENHORST, Stanislav MAZURENKO, David BEDNÁŘ, Stavros STAVRAKIS, Uwe T. BORNSCHEUER, Andrew DEMELLO, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Advanced database mining of efficient haloalkane dehalogenases by sequence and structure bioinformatics and microfluidics. Chem Catalysis. Elsevier, 2022, roč. 2, č. 10, s. 2704-2725. ISSN 2667-1093. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.checat.2022.09.011.URL
RIV/00216224:14310/22:00128314 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Vašina, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáček, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Kovář, David (203 Česká republika, domácí) -- Faldynová, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Kunka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Buryška, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: enzyme mining; enzyme diversity; biocatalysts; microfluidics; bioinformatics; global data analysis; haloalkane dehalogenases; bioprospecting
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 27. 1. 2023 10:32.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2250027/cs -
KUNKA, Antonín, David LACKO, Jan ŠTOURAČ, Jiří DAMBORSKÝ, Zbyněk PROKOP a Stanislav MAZURENKO. CalFitter 2.0: Leveraging the power of singular value decomposition to analyse protein thermostability. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2022, roč. 50, W1, s. "W145"-"W151", 7 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkac378.URL
RIV/00216224:14310/22:00126370 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Kunka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí)
Klíčová slova anglicky: FLUORESCENCE; CALORIMETRY; RESOLUTION; STATE
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 3. 2023 22:51.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1883600/cs -
Caver Web 1.2 (software)MUSIL, Miloš, Andrej JEŽÍK, Marie HAMŠÍKOVÁ, Jan ŠTOURAČ, Jakub GALGONEK, jiří VONDÁŠEK, David BEDNÁŘ a Jiří DAMBORSKÝ. Caver Web 1.2. 2022.Caver Web 1.2 je nová verze webového serveru, která spojuje možnost stanovení proteinových tunelů s výpočtem trajektorie ligandů. Nová verze serveru CaverWeb byla rozšířena o možnost využít nové ligandy z Integrované databáze malých molekul (IDSM) a o zc
Název anglicky: Caver Web 1.2
RIV/00216224:14310/22:00127433 Software. čeština. Česká republika. obsah podléhá obchodnímu tajemství.
Musil, Miloš (203 Česká republika, domácí) -- Hamšíková, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Web serverů; proteins; ligand transport; tunnels and channels in proteins; virtuální skríning
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 13. 12. 2022 13:53.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2239439/cs -
NIKITIN, Dmitri, Jan MIČAN, Martin TOUL, David BEDNÁŘ, Michaela PEŠKOVÁ, Patrícia KITTOVÁ, Sandra THALEROVÁ, Jan VÍTEČEK, Jiří DAMBORSKÝ, Robert MIKULÍK, Sarel J. FLEISHMAN, Zbyněk PROKOP a Martin MAREK. Computer-aided engineering of staphylokinase toward enhanced affinity and selectivity for plasmin. Computational and Structural Biotechnology Journal. Amsterdam: Elsevier, 2022, roč. 20, May 2022, s. 1366-1377. ISSN 2001-0370. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.csbj.2022.03.004.URL
RIV/00216224:14310/22:00126020 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Nikitin, Dmitri (643 Rusko, domácí) -- Mičan, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Toul, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Pešková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Kittová, Patrícia (703 Slovensko, domácí) -- Thalerová, Sandra (203 Česká republika, domácí) -- Víteček, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Mikulík, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Acute myocardial infarction; Stroke treatments; Thrombolytics; Plasminogen activators; Staphylokinase; Rational design; Affinity engineering; Enzyme kinetics; AffiLib
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 21. 2. 2025 15:40.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1860499/cs -
ZÁMOCKÝ, Marcel, Miloš MUSIL, Maksym DANCHENKO, Peter FERIANC, Katarína CHOVANOVÁ, Peter BARÁTH, Andrej POLJOVKA a David BEDNÁŘ. Deep Insights into the Specific Evolution of Fungal Hybrid B Heme Peroxidases. BIOLOGY-BASEL. BASEL: MDPI, 2022, roč. 11, č. 3, s. 1-18. ISSN 2079-7737. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/biology11030459.URL
RIV/00216224:14310/22:00126021 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Musil, Miloš (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: hybrid B heme peroxidase; peroxidase-catalase superfamily; oxidative stress; enzymatic antioxidant; ancestral sequence reconstruction
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 3. 2023 22:05.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1860501/cs -
ONUŠČÁKOVÁ, Magdaléna, Hana PÍŽOVÁ, Tereza KAUEROVÁ, Marie HAMŠÍKOVÁ, David BEDNÁŘ, Peter KOLLÁR a Pavel BOBÁĽ. DESIGN AND SYNTHESIS OF N-HYDROXY-CINNAMAMIDE DERIVATES AS NOVEL HDAC INHIBITORS: EVALUATION OF BIOLOGICAL ACTIVITY IN CANCER CELLS. Online. In Radmila Řápková, Martin Fusek, Pavel Drašar. Czech Chemical Society Symposium Series. Pague, Czech republic: Czech Chemical Society, 2022, s. 28-29. ISSN 2336-7202.URL
Název anglicky: DESIGN AND SYNTHESIS OF N-HYDROXY-CINNAMAMIDE DERIVATES AS NOVEL HDAC INHIBITORS: EVALUATION OF BIOLOGICAL ACTIVITY IN CANCER CELLS
RIV/00216224:14160/22:00126649 Stať ve sborníku. angličtina. Česká republika.
Onuščáková, Magdaléna (703 Slovensko, garant, domácí) -- Pížová, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Kauerová, Tereza (203 Česká republika, domácí) -- Hamšíková, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Kollár, Peter (203 Česká republika, domácí) -- Bobáľ, Pavel (703 Slovensko, domácí)
Klíčová slova anglicky: HDAC inhibitors_N-Hydroxy-cinnamide_derivates cancer
Recenzováno: ano
Změnila: PharmDr. Magdaléna Onuščáková, učo 507453. Změněno: 13. 9. 2022 14:00.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2217368/cs -
YANG, Tianjin, Alessia VILLOIS, Antonín KUNKA, Fulvio GRIGOLATO, Paolo AROSIO, Zbyněk PROKOP, Andrew DEMELLO a Stavros STAVRAKIS. Droplet-Based Microfluidic Temperature-Jump Platform for the Rapid Assessment of Biomolecular Kinetics. Analytical chemistry. American Chemical Society, 2022, roč. 94, č. 48, s. 16675-16684. ISSN 0003-2700. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.analchem.2c03009.URL
RIV/00216224:14310/22:00128417 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Kunka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Biotechnology; Fluid dynamics; Kinetics; Liquids; Nanofibers
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 31. 1. 2023 08:46.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2251352/cs -
RAPP, Lea R., Sérgio Manuel MARQUES, Bernd NEBEL, Jiří DAMBORSKÝ a Bernhard HAUER. Engineering CYP153A(M.aq) to Oxyfunctionalize its Inhibitor Dodecylamine Using a LC/MS Based Rapid Flow Analysis Screening. ChemCatChem. WEINHEIM: WILEY-V C H VERLAG GMBH, 2022, roč. 14, č. 6, s. 1-5. ISSN 1867-3880. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cctc.202101648.URL
RIV/00216224:14310/22:00126696 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: biocatalysis; cytochrome P450; docking; enzyme engineering; molecular dynamics
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 9. 3. 2023 20:46.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2218244/cs -
TOUL, Martin, Dmitri NIKITIN, Martin MAREK, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Extended Mechanism of the Plasminogen Activator Staphylokinase Revealed by Global Kinetic Analysis: 1000-fold Higher Catalytic Activity than That of Clinically Used Alteplase. ACS Catalysis. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2022, roč. 12, č. 7, s. 3807-3814. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acscatal.1c05042.URL
RIV/00216224:14310/22:00126168 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Toul, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Nikitin, Dmitri (643 Rusko, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: staphylokinase; plasminogen activator; kinetic mechanism; global numerical analysis; rate-limiting step; catalytic activity; thrombolytic; fibrin
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 3. 4. 2023 09:28.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1863382/cs -
VÁVRA, Ondřej, Jiří DAMBORSKÝ a David BEDNÁŘ. Fast approximative methods for study of ligand transport and rational design of improved enzymes for biotechnologies. Biotechnology Advances. Elsevier, 2022, roč. 60, November, s. 1-12. ISSN 0734-9750. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.biotechadv.2022.108009.URL
RIV/00216224:14310/22:00126323 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Vávra, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: ART-RRT; Binding; Biotechnology; CaverDock; Catalysis; Cytochrome P450 CYP153A; Fe/a-ketoglutarate-dependent hydroxylase; GPathFinder; Channel; Docking; Ligand; MoMA-LigPath; Monoamine oxidase; Nanomotors; Protein engineering; SLITHER
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 3. 4. 2023 09:41.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1876163/cs -
HOŘÁK, Martin, DeLisa FAIRWEATHER, Piia Pauliina KOKKONEN, David BEDNÁŘ a Julie DOBROVOLNÁ. Follistatin-like 1 and its paralogs in heart development and cardiovascular disease. Heart Failure Reviews. New York: Springer US, 2022, roč. 27, č. 6, s. 2251-2265. ISSN 1382-4147. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10741-022-10262-6.URL
RIV/00216224:14310/22:00127632 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Hořák, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Kokkonen, Piia Pauliina (246 Finsko, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Dobrovolná, Julie (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: FSTL1; FSTL4; FSTL5; Heart failure; Inflammation
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 10. 8. 2023 09:32.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2243097/cs -
MUSIL, Miloš, Andrej JEŽÍK, Marie HAMŠÍKOVÁ, Jan ŠTOURAČ, Jakub GALGONEK, Saltuk Mustafa EYRILMEZ, Jiri VONDRASEK, Jiří DAMBORSKÝ a David BEDNÁŘ. Fully automated virtual screening pipeline of FDA-approved drugs using Caver Web. Computational and Structural Biotechnology Journal. Elsevier, 2022, roč. 20, November 2022, s. 6512-6518. ISSN 2001-0370. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.csbj.2022.11.031.URL
RIV/00216224:14310/22:00127528 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Musil, Miloš (203 Česká republika, domácí) -- Hamšíková, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Galgonek, Jakub (203 Česká republika) -- Eyrilmez, Saltuk Mustafa (792 Turecko, domácí) -- Vondrasek, Jiri (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Caver; CaverDock; FDA-approved drug; Channel; Tunnel; Virtual screening; Web
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 5. 4. 2023 08:25.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2241006/cs -
POSPÍŠIL, Jakub, Milos HRABOVSKY, Dáša BOHAČIAKOVÁ, Zuzana HOVADKOVA, Miroslav JURÁSEK, Jarmila MLČOUŠKOVÁ, Kamil PARUCH, Šárka NEVOLOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Aleš HAMPL a Josef JAROŠ. Geometric Control of Cell Behavior by Biomolecule Nanodistribution. ACS BIOMATERIALS SCIENCE & ENGINEERING. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2022, roč. 8, č. 11, s. 4789-4806. ISSN 2373-9878. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acsbiomaterials.2c00650.URL
RIV/00216224:14110/22:00127154 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Pospíšil, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Hrabovsky, Milos (203 Česká republika) -- Bohačiaková, Dáša (703 Slovensko, domácí) -- Hovadkova, Zuzana (203 Česká republika) -- Jurásek, Miroslav (203 Česká republika) -- Mlčoušková, Jarmila (203 Česká republika, domácí) -- Paruch, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Nevolová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Hampl, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Jaroš, Josef (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: nanopatterning; nanospacing; biomimetic surface; electron-beam lithography; cell-cell interaction; cell adhesion and spreading; ligand clustering
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Adéla Pešková, učo 143895. Změněno: 24. 10. 2024 11:02.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2231968/cs -
TOUL, Martin, Jan MIČAN, Veronika SLONKOVÁ, Dmitri NIKITIN, Martin MAREK, David BEDNÁŘ, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Hidden Potential of Highly Efficient and Widely Accessible Thrombolytic Staphylokinase. Stroke. Dallas: Lippincott Williams & Wilkins, 2022, roč. 53, č. 10, s. 3235-3237. ISSN 0039-2499. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1161/STROKEAHA.122.040219.URL
RIV/00216224:14310/22:00127971 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Toul, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Mičan, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Slonková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Nikitin, Dmitri (643 Rusko, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: alteplase; immunogenicity; kinetics; staphylokinase; stroke; thrombolysis
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 25. 1. 2023 12:38.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2246441/cs -
BENEŠOVÁ, Iva, Adam Paulin URMINSKÝ, Jana HALÁMKOVÁ a Lenka HERNYCHOVÁ. Changes of serum protein N-glycosylation in cancer. Časopis Klinická onkologie. Praha: Česká lékařská společnost J. E. Purkyně, 2022, roč. 35, č. 3, s. 174-180. ISSN 0862-495X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48095/ccko2022174.URL
Klíčová slova anglicky: glycommics; glycoproteomics; N-glycans; N-glycan profiling; glycopeptides; serum proteins;, mass spectrometry
Změnila: doc. MUDr. Jana Halámková, Ph.D., učo 19117. Změněno: 22. 5. 2024 11:40.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2403377/cs -
FRIEDLOVÁ, Nela, Lenka DOSEDĚLOVÁ, Filip ZAVADIL KOKÁŠ, Lenka HERNYCHOVÁ, Ted HUPP, Bořivoj VOJTĚŠEK a Marta NEKULOVÁ. IFITM PROTEINS REGULATE IMMUNE-RELATED CELL SURFACE MOLECULES IN CERVICAL CARCINOMA. 2022.
Klíčová slova anglicky: IFITM, interferon, cervical cancer, immunosurveillance,tumor progression
Druh účasti: aktivní účast
Změnila: Mgr. Nela Friedlová, učo 437252. Změněno: 5. 8. 2022 14:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1883505/cs -
FRIEDLOVÁ, Nela, Michaela GALIOVÁ VAŠINOVÁ, Kristýna BILAVČÍKOVÁ, Pavel COUFALÍK, Lenka HERNYCHOVÁ, Vlastimil TICHÝ, Ted HUPP, Bořivoj VOJTĚŠEK a Marta NEKULOVÁ. IFITM PROTEINS REGULATE SENSITIVITY OF CERVICAL CANCER CELLS TO CISPLATIN. In XXI. Interdisciplinary meeting of young life scientists. 2022. ISSN 2336-7202.
Druh účasti: aktivní účast
Změnila: Mgr. Nela Friedlová, učo 437252. Změněno: 5. 8. 2022 15:03.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1883508/cs -
DAVUT AKSU, Ahmet, Jana HLOŽKOVÁ, Peter SCHEER, Eliška BRHELOVÁ, Jan MIČAN, Martin TOUL, Jiří DAMBORSKÝ, Petr KAŠPÁREK, Jana DOLAŽALOVÁ a Robert MIKULÍK. IMPACT OF ADMINISTRATION METHOD OF THROMBOLYTICS ON THEIR THROMBOLYTIC EFFECTS. In Květinův Den 2022. 2022.URL
Název česky: IMPACT OF ADMINISTRATION METHOD OF THROMBOLYTICS ON THEIR THROMBOLYTIC EFFECTS
Název anglicky: IMPACT OF ADMINISTRATION METHOD OF THROMBOLYTICS ON THEIR THROMBOLYTIC EFFECTS
RIV/00216224:14160/22:00134617 Prezentace na konferencích. čeština. Česká republika.
Davut Aksu, Ahmet (792 Turecko, garant, domácí) -- Hložková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Scheer, Peter (203 Česká republika, domácí) -- Brhelová, Eliška (203 Česká republika, domácí) -- Mičan, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Toul, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Kašpárek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Mikulík, Robert (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: novel thrombolytics; pharmacodynamics; administration routes
Druh účasti: aktivní účast
Recenzováno: ano
Změnil: Mgr. Ahmet Davut Aksu, MSc, učo 528202. Změněno: 28. 6. 2024 16:18.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2211002/cs -
NĚMCOVÁ, Petra, Jana HOZZOVÁ a Jiří FILIPOVIČ. Improving ligand transport trajectory within flexible receptor in CaverDock. Online. In SAC '22: Proceedings of the 37th ACM/SIGAPP Symposium on Applied Computing. USA: Association for Computing Machinery, 2022, s. 619-626. ISBN 978-1-4503-8713-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1145/3477314.3506988.URL
RIV/00216224:14610/22:00125815 Stať ve sborníku. angličtina. Spojené státy.
Němcová, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Hozzová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Filipovič, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: CaverDock; ligand transport; flexible receptor; molecular docking; search heuristic; continuous space search
Druh sborníku: předkonferenční sborník
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 7. 2. 2024 16:11.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1853582/cs -
NEMERGUT, Michal, Tereza BÁŤKOVÁ, Dana VIGAŠOVÁ, Milan BARTOŠ, Martina HLOZANKOVA, Andrea SMITH, Barbora LIŠKOVÁ, Kateřina SHEARDOVÁ, Martin VYHNALEK, Jakub HORT, Jan LACZO, Ingrid KOVÁČOVÁ, Michal ŠITINA, Radoslav MATEJ, Radim JANČÁLEK, Martin MAREK a Jiří DAMBORSKÝ. Increased occurrence of Treponema spp. and double-species infections in patients with Alzheimer's disease. Science of the Total Environment. Amsterdam: Elsevier Science, 2022, roč. 844, October 2022, s. 1-7. ISSN 0048-9697. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.scitotenv.2022.157114.URL
RIV/00216224:14310/22:00127629 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Nemergut, Michal (703 Slovensko, domácí) -- Báťková, Tereza (203 Česká republika, domácí) -- Vigašová, Dana (703 Slovensko, domácí) -- Bartoš, Milan (203 Česká republika) -- Smith, Andrea (703 Slovensko, domácí) -- Lišková, Barbora (203 Česká republika, domácí) -- Sheardová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Kováčová, Ingrid (703 Slovensko) -- Šitina, Michal (203 Česká republika) -- Jančálek, Radim (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Alzheimer'sdisease; Treponemaspp; Microbialinfection; Pathogen; Serum; PCR
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 16. 3. 2023 21:13.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2243093/cs -
PLANAS IGLESIAS, Joan, Filip OPÁLENÝ, Pavol ULBRICH, Jan ŠTOURAČ, Zainab Kemi SANUSI, José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, Andrea SMITH, Jan BYŠKA, Jiří DAMBORSKÝ, Barbora KOZLÍKOVÁ a David BEDNÁŘ. LoopGrafter: a web tool for transplanting dynamical loops for protein engineering. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2022, roč. 50, W1, s. "W465"-"W473", 9 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkac249.URL
RIV/00216224:14310/22:00126367 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Planas Iglesias, Joan (724 Španělsko, domácí) -- Opálený, Filip (703 Slovensko, domácí) -- Ulbrich, Pavol (703 Slovensko, domácí) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Sanusi, Zainab Kemi (566 Nigérie, domácí) -- Rangel Pamplona Pizarro Pinto, José Gaspar (620 Portugalsko, domácí) -- Smith, Andrea (703 Slovensko, domácí) -- Byška, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Kozlíková, Barbora (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: EVOLUTION; DESIGN; SIMULATIONS; PREDICTION; MODEL
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 3. 4. 2023 09:43.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1883597/cs -
KOVÁŘ, David, Stanislav MAZURENKO, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. MAPityser 2.1 - Analyzátor dat pro mikrofluidní platformu MAPit. 2022.Software analyzuje sadu tisíců datových souborů vytvořených mikrofluidními autonomními platformami. Software představuje univerzální nástroj pro detekci píků signálu nebo zpracování a extrakci fluorescenčních spekter. Software pracuje jako samostatná apl
Název anglicky: MAPityser 2.1 - Data Analyser for the microfluidic platform MAPit
RIV/00216224:14310/22:00127434 Software. čeština. Česká republika. obsah podléhá obchodnímu tajemství.
Kovář, David (203 Česká republika, garant, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: software; data analysis; microfluidic autonomous platform
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 13. 12. 2022 13:54.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2239457/cs -
WEI, Ren, Gerlis VON HAUGWIT, Lara PFAFF, Jan MIČAN, Christoffel P. S. BADENHORST, Weidong LIU, Gert WEBER, Harry P. AUSTIN, David BEDNÁŘ, Jiří DAMBORSKÝ a Uwe T. BORNSCHEUER. Mechanism-Based Design of Efficient PET Hydrolases. ACS Catalysis. American Chemical Society, 2022, roč. 12, č. 6, s. 3382-3396. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acscatal.1c05856.URL
RIV/00216224:14310/22:00126169 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Mičan, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Hydrolase; enzymatic degradation; interfacial biocatalysis; plastic recycling; protein engineering; polyethylene terephthalate (PET); product inhibition; thermostability
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 3. 2023 22:07.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1863383/cs -
MARQUES, Sérgio Manuel, Michaela SLÁNSKÁ, Klaudia CHMELOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Martin MAREK, Spencer CLARK, Jiří DAMBORSKÝ, Eric T. KOOL, David BEDNÁŘ a Zbyněk PROKOP. Mechanism-Based Strategy for Optimizing HaloTag Protein Labeling. JACS AU. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2022, roč. 2, č. 6, s. 1324-1337. ISSN 2691-3704. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jacsau.2c00002.URL
RIV/00216224:14310/22:00126373 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Slánská, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Chmelová, Klaudia (703 Slovensko, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: HaloTag; enzyme kinetics; molecular modeling; reaction mechanism; ligand binding; nucleophilic substitution; protein engineering; access tunnel; numerical integration
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 3. 4. 2023 09:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1883607/cs -
PRAKINEE, Kridsadakorn, Aisaraphon PHINTHA, Surawit VISITSATTHAWONG, Narin LAWAN, Jeerus SUCHARITAKUL, Chadaporn KANTIWIRIYAWANITCH, Jiří DAMBORSKÝ, Penchit CHITNUMSUB, Van Pee KARL-HEINZ a Pimchai CHAIYEN. Mechanism-guided tunnel engineering to increase the efficiency of a flavin-dependent halogenase. NATURE CATALYSIS. ENGLAND: NATURE PORTFOLIO, 2022, roč. 5, č. 6, s. 534-544. ISSN 2520-1158. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41929-022-00800-8.URL
RIV/00216224:14310/22:00126374 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: TRYPTOPHAN 7-HALOGENASE; BIOCATALYTIC SCOPE; MOLECULAR-DYNAMICS; KINETIC MECHANISM; CHLORINATION; BIOSYNTHESIS; INTERMEDIATE; INSIGHTS; PHENOL; REBH
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 16. 3. 2023 21:52.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1883608/cs -
MicroPEX Data Analyser 1.0* (software)KOVÁŘ, David, Stanislav MAZURENKO, Michal VAŠINA, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. MicroPEX Data Analyser 1.0*. 2022.Tento softwarový kód byl vytvořen pro semimanuální správu a analýzu dat komplexních "dropletogramů" vytvořených s využitím mikrofluidního analyzátoru MicroPEX. Dropletogramy jsou rozděleny na klastry droplet představujících vzorky, kontroly nebo kalibrát
Název anglicky: MicroPEX Data Analyser 1.0
RIV/00216224:14310/22:00127436 Software. čeština. Česká republika. obsah podléhá obchodnímu tajemství.
Kovář, David (203 Česká republika, garant, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Vašina, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: software; microfluidics; data analysis; droplets
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 13. 12. 2022 13:51.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2239485/cs -
PFAFF, Lara, Jian GAO, Zhishuai LI, Anna JAECKERING, Gert WEBER, Jan MIČAN, Yinping CHEN, Weiliang DONG, Xu HAN, Christian G. FEILER, Yu-Fei AO, Christoffel P. S. BADENHORST, David BEDNÁŘ, Gottfried J. PALM, Michael LAMMERS, Jiří DAMBORSKÝ, Birgit STRODEL, Weidong LIU, Uwe T. BORNSCHEUER a Ren WEI. Multiple Substrate Binding Mode-Guided Engineering of a Thermophilic PET Hydrolase. ACS Catalysis. American Chemical Society, 2022, roč. 12, č. 15, s. 9790-9800. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acscatal.2c02275.URL
RIV/00216224:14310/22:00128798 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Mičan, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bornscheuer, Uwe T. (garant)
Klíčová slova anglicky: polyethylene terephthalate (PET); PET hydrolysis; thermophilic polyester hydrolase; enzyme engineering; crystallization; molecular dynamics; binding modes; kinetics
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 3. 4. 2023 12:34.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2263357/cs -
PLANAS IGLESIAS, Joan, Filip OPÁLENÝ, Pavol ULBRICH, Jan ŠTOURAČ, Zainab Kemi SANUSI, José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, A. SCHENKMAYEROVÁ, Jan BYŠKA, Jiří DAMBORSKÝ, Barbora KOZLÍKOVÁ a David BEDNÁŘ. Nástroj LoopGrafter. 2022.URL
Název anglicky: LoopGrafter software tool
RIV/00216224:14310/22:00129627 Projekty výzkumu a vývoje. čeština. Česká republika.
Planas Iglesias, Joan (724 Španělsko, domácí) -- Opálený, Filip (703 Slovensko, domácí) -- Ulbrich, Pavol (703 Slovensko, domácí) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Sanusi, Zainab Kemi (566 Nigérie, domácí) -- Rangel Pamplona Pizarro Pinto, José Gaspar (620 Portugalsko, domácí) -- Schenkmayerová, A. (703 Slovensko) -- Byška, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Kozlíková, Barbora (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: EVOLUTION; DESIGN; SIMULATIONS; PREDICTION; MODEL
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 5. 4. 2023 12:34.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2273367/cs -
VARADI, Mihaly, Stephen ANYANGO, David ARMSTRONG, John BERRISFORD, Preeti CHOUDHARY, Mandar DESHPANDE, Nurul NADZIRIN, Sreenatha S. NAIR, Lukas PRAVDA, Ahsan TANWEER, Bissan AL-LAZIKANI, Claudia ANDREINI, Geoffrey J. BARTON, David BEDNÁŘ, Karel BERKA, Tom BLUNDELL, Kelly P. BROCK, Jose MARIA CARAZO, Jiří DAMBORSKÝ, Alessia DAVID, Sucharita DEY, Roland DUNBRACK, Fernandez Juan RECIO, Franca FRATERNALI, Toby GIBSON, Manuela HELMER-CITTERICH, David HOKSZA, Thomas HOPF, David JAKUBEC, Natarajan KANNAN, Radoslav KRIVAK, Manjeet KUMAR, Emmanuel D. LEVY, Nir LONDON, Jose Ramon MACIAS, Madhusudhan M. SRIVATSAN, Debora S. MARKS, Lennart MARTENS, Stuart A. MCGOWAN, Jake E. MCGREIG, Vivek MODI, Gonzalo R. PARRA, Gerardo PEPE, Damiano PIOVESAN, Jaime PRILUSKY, Valeria PUTIGNANO, Leandro G. RADUSKY, Pathmanaban RAMASAMY, Atilio O. RAUSCH, Nathalie REUTER, Luis A. RODRIGUEZ, Nathan J. ROLLINS, Antonio ROSATO, Luis SERRANO, Gulzar SINGH, Petr SKODA, Carlos Oscar S. SORZANO, Jan ŠTOURAČ, Joanna I. SULKOWSKA, Radka SVOBODOVÁ, Natalia TICHSHENKO, Silvio C. E. TOSATTO, Wim VRANKEN, Mark N. WASS, Dandan XUE, Daniel ZAIDMAN, Janet THORNTON, Michael STERNBERG, Christine ORENGO a Sameer VELANKAR. PDBe-KB: collaboratively defining the biological context of structural data. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2022, roč. 50, D1, s. "D534"-"D542", 9 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkab988.URL
RIV/00216224:14310/22:00125998 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Svobodová, Radka (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: WEB SERVER; PROTEIN; PREDICT
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Monika Szurmanová, Ph.D., učo 466567. Změněno: 31. 10. 2024 10:24.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1860103/cs -
PredictSNP Onco 1.0 (software)ŠTOURAČ, Jan, Rayyan Tariq KHAN, Simeon BORKO, Petra POKORNÁ, Adam DOBIÁŠ, José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, Jaroslav ŠTĚRBA, Ondřej SLABÝ, Jiří DAMBORSKÝ a David BEDNÁŘ. PredictSNP Onco 1.0. 2022.URL
Název anglicky: PredictSNP Onco 1.0
RIV/00216224:14310/22:00127438 Software. čeština. Česká republika. obsah podléhá obchodnímu tajemství.
Štourač, Jan (203 Česká republika, garant, domácí) -- Khan, Rayyan Tariq (586 Pákistán, domácí) -- Borko, Simeon (703 Slovensko, domácí) -- Pokorná, Petra (203 Česká republika) -- Dobiáš, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Rangel Pamplona Pizarro Pinto, José Gaspar (620 Portugalsko, domácí) -- Štěrba, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Slabý, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Web server; cancer; medicine; mutation; protein; prediction
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 5. 4. 2023 11:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2239494/cs -
TRAPL, Dalibor, MArtin KRUPIČKA, Vladimír VIŠŇOVSKÝ, Jana HOZZOVÁ, Jaroslav OĽHA, Aleš KŘENEK a Vojtěch SPIWOK. Property Map Collective Variable as a Useful Tool for a Force Field Correction. Journal of Chemical Information and Modeling. American Chemical Society, 2022, roč. 62, č. 3, s. 567-576. ISSN 1549-9596. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jcim.1c00651.URL
Název česky: Property Map Collective Variable as a Useful Tool for a Force Field Correction
Název anglicky: Property Map Collective Variable as a Useful Tool for a Force Field Correction
RIV/00216224:14610/22:00129035 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Trapl, Dalibor (203 Česká republika) -- Krupička, MArtin (203 Česká republika) -- Višňovský, Vladimír (703 Slovensko, domácí) -- Hozzová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Oľha, Jaroslav (703 Slovensko, domácí) -- Křenek, Aleš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Spiwok, Vojtěch (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: collective variable; biased potential; force field
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Alena Mokrá, učo 362754. Změněno: 14. 3. 2023 15:51.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1839946/cs -
VELECKÝ, Jan, Marie HAMŠÍKOVÁ, Jan ŠTOURAČ, Miloš MUSIL, Jiří DAMBORSKÝ, David BEDNÁŘ a Stanislav MAZURENKO. SoluProtMutDB: A manually curated database of protein solubility changes upon mutations. Computational and Structural Biotechnology Journal. Elsevier, 2022, roč. 20, November 2022, s. 6339-6347. ISSN 2001-0370. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.csbj.2022.11.009.URL
RIV/00216224:14310/22:00130114 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Velecký, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Hamšíková, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Musil, Miloš (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, garant, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí)
Klíčová slova anglicky: Mutational database; Protein engineering; Soluble expression; Protein yield; Machine learning; Protein aggregation
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 5. 9. 2023 13:44.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2241002/cs -
VON HAUGWITZ, Gerlis, Xu HAN, Lara PFAFF, Qian LI, Hongli WEI, Jian GAO, Karen METHLING, Yufei AO, Yannik BRACK, Jan MIČAN, Christian G FEILER, Manfred S WEISS, David BEDNÁŘ, Gottfried J. PALM, Michael LALK, Michael LAMMERS, Jiří DAMBORSKÝ, Gert WEBER, Weidong LIU, Uwe T. BORNSCHEUER a Ren WEI. Structural Insights into (Tere)phthalate-Ester Hydrolysis by a Carboxylesterase and Its Role in Promoting PET Depolymerization. ACS Catalysis. American Chemical Society, 2022, roč. 12, č. 24, s. 15259-15270. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acscatal.2c03772.URL
RIV/00216224:14310/22:00127611 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Mičan, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Liu, Weidong (garant)
Klíčová slova anglicky: PET hydrolysis; plastic; dual enzyme system; carboxylesterase; structure; enzyme engineering
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 3. 4. 2023 11:17.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2242987/cs -
PARUCH, Kamil, Benoit Jean-Pierre CARBAIN, Štěpán HAVEL, Jiří DAMBORSKÝ, Jan BREZOVSKÝ, Lukáš DANIEL, Alexandra SISÁKOVÁ, Fedor NIKULENKOV a Lumír KREJČÍ. Substituted aminothiazoles as inhibitors of nucleases. 2022. Patent. Číslo: AU2019256670. Vydavatel: IP Australia. Místo vydání: Bowes Street, Phillip ACT, Australia. Název vlastníka: Masarykova univerzita. Datum registrace: 15. 4. 2019. Datum přijetí: 15. 12. 2022.URL
RIV/00216224:14310/22:00127657 Patent. angličtina. Austrálie.
Paruch, Kamil (203 Česká republika, garant, domácí) -- Carbain, Benoit Jean-Pierre (250 Francie, domácí) -- Havel, Štěpán (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Daniel, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Sisáková, Alexandra (703 Slovensko, domácí) -- Nikulenkov, Fedor (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Lumír (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: DNA; propanamide; nuclease
CHYBA! Není vyplněn teritoriální rozsah patentové ochrany.
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 14. 2. 2023 17:19.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2243417/cs -
VAŠINA, Michal, Jan VELECKÝ, Joan PLANAS IGLESIAS, Sérgio Manuel MARQUES, Jana ŠKAŘUPOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, David BEDNÁŘ, Stanislav MAZURENKO a Zbyněk PROKOP. Tools for computational design and high-throughput screening of therapeutic enzymes. ADVANCED DRUG DELIVERY REVIEWS. NETHERLANDS: ELSEVIER, 2022, roč. 183, April 2022, s. 1-16. ISSN 0169-409X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.addr.2022.114143.URL
RIV/00216224:14310/22:00126167 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Vašina, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Velecký, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Planas Iglesias, Joan (724 Španělsko, domácí) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Škařupová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Big data; Bioinformatics; Biopharmaceuticals; Biocatalysts; Enzyme characterization; Enzyme diversity; Machine learning; Microfluidics; Rational design
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 3. 4. 2023 09:28.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1863379/cs -
FILIPOVIČ, Jiří, Jana HOZZOVÁ, Amin NEZARAT, Jaroslav OĽHA a Filip PETROVIČ. Using hardware performance counters to speed up autotuning convergence on GPUs. Journal of Parallel and Distributed Computing. Elsevier, 2022, roč. 160, February, s. 16-35. ISSN 0743-7315. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jpdc.2021.10.003.URL
RIV/00216224:14610/22:00125022 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Filipovič, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Hozzová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Nezarat, Amin (364 Írán, domácí) -- Oľha, Jaroslav (703 Slovensko, domácí) -- Petrovič, Filip (703 Slovensko, domácí)
Klíčová slova anglicky: Auto-tuning; Search method; Performance counters; CUDA
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: doc. RNDr. Jiří Filipovič, Ph.D., učo 72898. Změněno: 20. 3. 2023 12:40.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1799520/cs -
RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, José Gaspar, Natalie M. HENDRIKSE, Jan ŠTOURAČ, Jiří DAMBORSKÝ a David BEDNÁŘ. Virtual screening of potential anticancer drugs based on microbial products. Seminars in Cancer Biology. London: Academic Press Ltd.-Elsevier Science Ltd., 2022, roč. 86, November 2022, s. 1207-1217. ISSN 1044-579X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.semcancer.2021.07.012.URL
RIV/00216224:14310/22:00127621 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Rangel Pamplona Pizarro Pinto, José Gaspar (76 Brazílie, domácí) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Databases; Microbial products; Virtual screening; Web tools; PredictSNP Onco
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 9. 3. 2023 19:58.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2243084/cs -
KNOZ, Martin, Břetislav LIPOVÝ, Lucy VOJTOVÁ, Jakub HOLOUBEK, Jan ŽÍDEK, Johana BABRNÁKOVÁ, Lucie VIŠTEJNOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Zdeněk PAVLOVSKÝ, Martin FALDYNA, Jiří DAMBORSKÝ a Vanessa HEARNDEN. Collagen/Chitosan dermal substitute enriched by hyperstable FGF2, 4 years of development. In 12th EPSRC Meeting 27th - 28th August 2021, Turku, Finland. 2021.
Název anglicky: Collagen/Chitosan dermal substitute enriched by hyperstable FGF2, 4 years of development
angličtina.
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: MUDr. Martin Knoz, Ph.D., učo 177146. Změněno: 3. 9. 2021 16:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1789697/cs -
VIŠŇOVSKÝ, Vladimír, Viktória SPIŠAKOVÁ, Jana HOZZOVÁ, Jaroslav OĽHA, Dalibor TRAPL, Vojtěch SPIWOK, Lukáš HEJTMÁNEK a Aleš KŘENEK. Complex simulation workflows in containerized high-performance environment. In Armenia S., Geril P. Proc. ESM 2021. Brusel: EUROSIS, 2021, s. 42-45. ISBN 978-94-92859-18-1.
Název anglicky: Complex simulation workflows in containerized high-performance environment
RIV/00216224:14610/21:00119698 Stať ve sborníku. angličtina. Belgie.
Višňovský, Vladimír (703 Slovensko, domácí) -- Spišaková, Viktória (703 Slovensko, domácí) -- Hozzová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Oľha, Jaroslav (703 Slovensko, domácí) -- Trapl, Dalibor (203 Česká republika) -- Spiwok, Vojtěch (203 Česká republika) -- Hejtmánek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Křenek, Aleš (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Docker; Jupyter notebook; Kubernetes; Molecular force field; Protein folding; Reproducibility; Workflow
Druh sborníku: předkonferenční sborník
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Alena Mokrá, učo 362754. Změněno: 30. 3. 2023 14:31.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1839944/cs -
PLANAS IGLESIAS, Joan, Sérgio Manuel MARQUES, José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, Miloš MUSIL, Jan ŠTOURAČ, Jiří DAMBORSKÝ a David BEDNÁŘ. Computational design of enzymes for biotechnological applications. Biotechnology Advances. OXFORD: Elsevier, 2021, roč. 47, March–April, s. 1-22. ISSN 0734-9750. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.biotechadv.2021.107696.URL
RIV/00216224:14310/21:00119844 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Planas Iglesias, Joan (724 Španělsko, domácí) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Rangel Pamplona Pizarro Pinto, José Gaspar (620 Portugalsko, domácí) -- Musil, Miloš (203 Česká republika, domácí) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Biocatalyst; Catalytic efficiency; Computational enzyme design; Enzyme biotechnologies; Protein engineering; Protein dynamics; Software; Solubility; Stability
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 23:22.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1790209/cs -
DAMBORSKÝ, Jiří, David BEDNÁŘ, Zbyněk PROKOP, Martin MAREK, Stanislav MAZURENKO, Jan ŠTOURAČ, Sérgio Manuel MARQUES, Gabriela Filipa FONSECA PINTO, Joan PLANAS IGLESIAS, Miloš MUSIL, Jiří HON, Ondřej VÁVRA, Rayyan Tariq KHAN, Jiří FILIPOVIČ a Barbora KOZLÍKOVÁ. Computational enzyme design for metabolic engineering. In The 45th FEBS Congress. 2021. ISSN 2211-5463.URL
angličtina.
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 26. 7. 2022 11:11.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1876012/cs -
MARKOVÁ, Klára, Antonín KUNKA, Klaudia CHMELOVÁ, Martin HAVLÁSEK, Petra BABKOVÁ, Sérgio Manuel MARQUES, Michal VAŠINA, Joan PLANAS IGLESIAS, Radka CHALOUPKOVÁ, David BEDNÁŘ, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a Martin MAREK. Computational Enzyme Stabilization Can Affect Folding Energy Landscapes and Lead to Catalytically Enhanced Domain-Swapped Dimers. ACS Catalysis. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2021, roč. 11, č. 21, s. 12864-12885. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acscatal.1c03343.URL
RIV/00216224:14310/21:00124052 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Marková, Klára (203 Česká republika, domácí) -- Kunka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Chmelová, Klaudia (703 Slovensko, domácí) -- Havlásek, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Babková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Vašina, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Planas Iglesias, Joan (724 Španělsko, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: protein folding; protein design; alpha/beta-hydrolase; haloalkane dehalogenase; domain swapping; energy landscape; oligonicrization; catalytic efficiency; substrate inhibition
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 23:13.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1831417/cs -
IERMAK, Iuliia, Oksana DEGTJARIK, Petra HAVLICKOVA, Michal KUTY, Radka CHALOUPKOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Tanyana PRUDNIKOVA a Ivana KUTA SMATANOVA. Description of Transport Tunnel in Haloalkane Dehalogenase Variant LinB D147C+L177C from Sphingobium japonicum. Catalysts. Basel: MDPI, 2021, roč. 11, č. 1, s. 1-15. ISSN 2073-4344. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/catal11010005.URL
RIV/00216224:14310/21:00119186 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Iermak, Iuliia (276 Německo) -- Degtjarik, Oksana (112 Bělorusko) -- Havlickova, Petra (203 Česká republika) -- Kuty, Michal (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prudnikova, Tanyana (112 Bělorusko) -- Kuta Smatanova, Ivana (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: bacterial enzyme; haloalkane dehalogenase; mutant form; crystallization; tertiary structure; disulfide bond; protein engineering; molecular dynamics; access tunnel; substrate specificity
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 16. 2. 2023 12:37.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1790201/cs -
MAREK, Martin, Jiří DAMBORSKÝ, David BEDNÁŘ, Daniel PLUSKAL, Marika MAJEROVÁ a Joan PLANAS IGLESIAS. Designované a syntetizované geny kódující nově zkonstruované proteinové katalyzátory (luciferázy) s ověřenými vlastnostmi. 2021.
Název anglicky: Designed and synthesized genes coding for new luciferase enzymes with confirmed properties
RIV/00216224:14310/21:00120030 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). čeština. Česká republika.
Marek, Martin (203 Česká republika, garant, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Pluskal, Daniel (203 Česká republika, domácí) -- Majerová, Marika (703 Slovensko, domácí) -- Planas Iglesias, Joan (724 Španělsko, domácí)
Klíčová slova anglicky: Bioluminescence; luciferase; optical assay; enzyme; catalysis
Změnil: Ing. RNDr. Martin Marek, Ph.D., MBA, učo 241182. Změněno: 7. 4. 2022 10:44.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1845522/cs -
NIKITIN, Dmitri, Seungbum CHOI, Jan MIČAN, Martin TOUL, Wi-Sun RYU, Jiří DAMBORSKÝ, Robert MIKULÍK a Dong-Eog KIM. Development and Testing of Thrombolytics in Stroke. JOURNAL OF STROKE. SEOUL: KOREAN STROKE SOC, 2021, roč. 23, č. 1, s. 12-36. ISSN 2287-6391. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5853/jos.2020.03349.URL
RIV/00216224:14310/21:00121798 Článek v odborném periodiku. angličtina. Korejská republika.
Nikitin, Dmitri (643 Rusko, domácí) -- Choi, Seungbum (410 Korejská republika) -- Mičan, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Toul, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Ryu, Wi-Sun (410 Korejská republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Mikulík, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Kim, Dong-Eog (410 Korejská republika)
Klíčová slova anglicky: Stroke; Thrombolytic therapy; Tissue plasminogen activator; Protein engineering
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 23:40.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1776761/cs -
TOUL, Martin, Andrea SMITH, José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, Martin MAREK, Lenka HERNYCHOVÁ, Veronika LIŠKOVÁ, Daniel PLUSKAL, Stephane EMOND, Mark DÖRR, Joan PLANAS IGLESIAS, Radka CHALOUPKOVÁ, David BEDNÁŘ, Zbyněk PROKOP, Uwe T. BORNSCHEUER, Florian HOLLFELDER a Jiří DAMBORSKÝ. Engineering protein dynamics for the understanding of divergent evolution of the Renilla luciferase. In The 45th FEBS Congress. 2021. ISSN 2211-5463.URL
angličtina.
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 26. 7. 2022 10:59.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1876006/cs -
SCHENKMAYEROVÁ, Andrea, José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, Martin TOUL, Martin MAREK, Lenka HERNYCHOVÁ, Joan PLANAS IGLESIAS, Veronika LIŠKOVÁ, Daniel PLUSKAL, Michal VAŠINA, Stephane EMOND, Mark DÖRR, Radka CHALOUPKOVÁ, David BEDNÁŘ, Zbyněk PROKOP, Florian HOLLFELDER, Uwe T. BORNSCHEUER a Jiří DAMBORSKÝ. Engineering the protein dynamics of an ancestral luciferase. Nature Communications. London: Nature Publishing Group, 2021, roč. 12, č. 1, s. 3616-3631. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-021-23450-z.URL
RIV/00216224:14310/21:00119329 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Schenkmayerová, Andrea (703 Slovensko, domácí) -- Rangel Pamplona Pizarro Pinto, José Gaspar (620 Portugalsko, domácí) -- Toul, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Hernychová, Lenka (203 Česká republika) -- Planas Iglesias, Joan (724 Španělsko, domácí) -- Lišková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Pluskal, Daniel (203 Česká republika, domácí) -- Vašina, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Enzymes; Hydrolases; Protein design; X-ray crystallography
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 23:35.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1802217/cs -
HESS, David, Veronika DOČKALOVÁ, Piia Pauliina KOKKONEN, David BEDNÁŘ, Jiří DAMBORSKÝ, Andrew DEMELLO, Zbyněk PROKOP a Stavros STAVRAKIS. Exploring mechanism of enzyme catalysis by on-chip transient kinetics coupled with global data analysis and molecular modeling. Chem. Cambridge: Cell Press, 2021, roč. 7, č. 4, s. 1066-1079. ISSN 2451-9294. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.chempr.2021.02.011.URL
RIV/00216224:14310/21:00122285 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Hess, David (756 Švýcarsko) -- Dočkalová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Kokkonen, Piia Pauliina (246 Finsko, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- DeMello, Andrew (756 Švýcarsko) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Stavrakis, Stavros (300 Řecko)
Klíčová slova anglicky: HALOALKANE DEHALOGENASES; MICROFLUIDIC DEVICES; WATER; BIOCATALYSIS; DROPLETS; ENTROPY; BINDING
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 23:26.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1790417/cs -
MUSIL, Miloš, Rayyan Tariq KHAN, Andy BEIER, Jan ŠTOURAČ, Hannes KONEGGER, Jiří DAMBORSKÝ a David BEDNÁŘ. FireProt(ASR): A Web Server for Fully Automated Ancestral Sequence Reconstruction. Briefings in Bioinformatics. OXFORD: Oxford University Press, 2021, roč. 22, č. 4, s. 1-11. ISSN 1467-5463. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bib/bbaa337.URL
RIV/00216224:14310/21:00119693 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Musil, Miloš (203 Česká republika, domácí) -- Khan, Rayyan Tariq (586 Pákistán, domácí) -- Beier, Andy (276 Německo, domácí) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Konegger, Hannes (40 Rakousko, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: ancestral sequence reconstruction; ancestral enzymes; evolution; phylogeny-based analysis; protein stability
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 23:36.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1839328/cs -
ŠTOURAČ, Jan, Juraj DUBRAVA, Miloš MUSIL, Jana HORÁČKOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Stanislav MAZURENKO a David BEDNÁŘ. FireProt(DB): database of manually curated protein stability data. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2021, roč. 49, D1, s. "D319"-"D324", 6 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkaa981.URL
RIV/00216224:14310/21:00119185 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Dubrava, Juraj (203 Česká republika) -- Musil, Miloš (203 Česká republika, domácí) -- Horáčková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: SEQUENCE; PREDICTION; VARIANTS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 23:21.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1790157/cs -
KHAN, Rayyan Tariq, Miloš MUSIL, Jan DVORSKÝ, Jiří DAMBORSKÝ a David BEDNÁŘ. Fully Automated Ancestral Sequence Reconstruction using FireProtASR. Current Protocols. Wiley, 2021, roč. 1, č. 2, s. e30, 13 s. ISSN 2691-1299. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cpz1.30.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Khan, Rayyan Tariq (586 Pákistán, domácí) -- Musil, Miloš (203 Česká republika, domácí) -- Dvorský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: ancestral sequence reconstruction; automation; protein engineering; protein evolution; thermostability
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
CHYBA! Nesprávný formát rozsahu stran. CHYBA!
CHYBA! Nesprávný formát rozsahu stran.
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 16. 10. 2024 11:30.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2377419/cs -
SABANDO, María Virginia, Pavol ULBRICH, Matías SELZER, Jan BYŠKA, Jan MIČAN, Ignacio PONZONI, Axel J. SOTO, María Luján GANUZA a Barbora KOZLÍKOVÁ. ChemVA: Interactive Visual Analysis of Chemical Compound Similarity in Virtual Screening. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics. IEEE, 2021, roč. 27, č. 2, s. 891-901. ISSN 1077-2626. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/TVCG.2020.3030438.URL
Název anglicky: ChemVA: Interactive Visual Analysis of Chemical Compound Similarity in Virtual Screening
RIV/00216224:14330/21:00118764 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Sabando, María Virginia (32 Argentina) -- Ulbrich, Pavol (703 Slovensko, domácí) -- Selzer, Matías (32 Argentina) -- Byška, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Mičan, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Ponzoni, Ignacio (32 Argentina) -- Soto, Axel J. (32 Argentina) -- Ganuza, María Luján (32 Argentina) -- Kozlíková, Barbora (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Virtual screening;visual analysis;dimensionality reduction;coordinated views;cheminformatics
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: doc. RNDr. Barbora Kozlíková, Ph.D., učo 60850. Změněno: 24. 7. 2023 09:26.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1681816/cs -
Kernel Tuning Toolkit 2.0 (software)PETROVIČ, Filip, Jiří FILIPOVIČ, David STŘELÁK, Jana HOZZOVÁ a Richard TREMBECKÝ. Kernel Tuning Toolkit 2.0. 2021.Kernel Tuning Toolkit
RIV/00216224:14610/21:00122282 Software. angličtina. Česká republika.
Petrovič, Filip (703 Slovensko, domácí) -- Filipovič, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Střelák, David (203 Česká republika, domácí) -- Hozzová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Trembecký, Richard (703 Slovensko, domácí)
Klíčová slova anglicky: autotuning; OpenCL; CUDA; global optimization
Změnil: doc. RNDr. Jiří Filipovič, Ph.D., učo 72898. Změněno: 7. 9. 2021 14:29.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1790347/cs -
VIGAŠOVÁ, Dana, Michal NEMERGUT, Barbora LIŠKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Multi-pathogen infections and Alzheimer's disease. Microbial Cell Factories. London: BioMed Central Ltd, 2021, roč. 20, č. 1, s. 25-37. ISSN 1475-2859. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12934-021-01520-7.URL
RIV/00216224:14310/21:00119789 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Vigašová, Dana (703 Slovensko, garant, domácí) -- Nemergut, Michal (703 Slovensko, domácí) -- Lišková, Barbora (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Alzheimer’s disease; Antibacterial; Anti-biofilm; Antifungal; Antiviral; Bacteria; Infectious burden; Parasites; Pathogens; Viruses
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 23:38.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1739777/cs -
CLASON, Christian, Stanislav MAZURENKO a Tuomo VALKONEN. Primal-Dual Proximal Splitting and Generalized Conjugation in Non-smooth Non-convex Optimization. Applied Mathematics and Optimization. New York: Springer, 2021, roč. 84, č. 2, s. 1239-1284. ISSN 0095-4616. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00245-020-09676-1.URL
RIV/00216224:14310/21:00120832 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Clason, Christian (garant) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí)
Klíčová slova anglicky: Nonsmooth optimization; Primal-dual method; Non-convex-concave saddle-points; Generalized conjugate; Potts model; Nash equilibria
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 22. 11. 2021 14:43.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1700577/cs -
SCHUITEN, Eva D., Christoffel P. S. BADENHORST, Gottfried J. PALM, Leona BERNDT, Michael LAMMERS, Jan MIČAN, David BEDNÁŘ, Jiří DAMBORSKÝ a Uwe T. BORNSCHEUER. Promiscuous Dehalogenase Activity of the Epoxide Hydrolase CorEH from Corynebacterium sp. C12. ACS Catalysis. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2021, roč. 11, č. 10, s. 6113-6120. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acscatal.1c00851.URL
RIV/00216224:14310/21:00121799 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Schuiten, Eva D. (276 Německo) -- Badenhorst, Christoffel P. S. (276 Německo) -- Palm, Gottfried J. (276 Německo) -- Berndt, Leona (276 Německo) -- Lammers, Michael (276 Německo) -- Mičan, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bornscheuer, Uwe T. (276 Německo)
Klíčová slova anglicky: catalytic promiscuity; Corynebacterium; epoxide hydrolase; haloalkane dehalogenase; dual activity
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 21. 2. 2023 14:15.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1776763/cs -
MARQUES, Sérgio Manuel, Lucie ŠUPOLÍKOVÁ, Lenka MOLČANOVÁ, Karel ŠMEJKAL, David BEDNÁŘ a Iva SLANINOVÁ. Screening of Natural Compounds as P-Glycoprotein Inhibitors against Multidrug Resistance. BIOMEDICINES. BASEL: MDPI, 2021, roč. 9, č. 4, s. 1-22. ISSN 2227-9059. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/biomedicines9040357.URL
RIV/00216224:14110/21:00121577 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Šupolíková, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Molčanová, Lenka (703 Slovensko, domácí) -- Šmejkal, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Slaninová, Iva (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: flavonoids; molecular dynamics; molecular docking; multidrug resistance; natural compounds; P-glycoprotein; structure-based virtual screening
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 23:15.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1768219/cs -
RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, José Gaspar, Ondřej VÁVRA, Sérgio Manuel MARQUES, Jiří FILIPOVIČ, David BEDNÁŘ a Jiří DAMBORSKÝ. Screening of world approved drugs against highly dynamical spike glycoprotein of SARS-CoV-2 using CaverDock and machine learning. Computational and Structural Biotechnology Journal. Amsterdam: Elsevier, 2021, roč. 19, May, s. 3187-3197. ISSN 2001-0370. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.csbj.2021.05.043.URL
RIV/00216224:14310/21:00119270 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Rangel Pamplona Pizarro Pinto, José Gaspar (620 Portugalsko, domácí) -- Vávra, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Filipovič, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: CaverDock; CaverWeb; Protein dynamics; Machine learning; Tunnel; Virtual screening
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 23:29.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1797399/cs -
HOZZOVÁ, Jana, Jiří FILIPOVIČ, Amin NEZARAT, Jaroslav OĽHA a Filip PETROVIČ. Searching CUDA code autotuning spaces with hardware performance counters: data from benchmarks running on various GPU architectures. Data in Brief. Elsevier, 2021, roč. 39, December, s. 1-12. ISSN 2352-3409. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2021.107631.URL
RIV/00216224:14610/21:00123013 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Hozzová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Filipovič, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Nezarat, Amin (364 Írán, domácí) -- Oľha, Jaroslav (703 Slovensko, domácí) -- Petrovič, Filip (703 Slovensko, domácí)
Klíčová slova anglicky: Auto-tuning; Tuning spaces; Performance counters; CUDA
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: doc. RNDr. Jiří Filipovič, Ph.D., učo 72898. Změněno: 2. 2. 2022 14:05.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1805266/cs -
HOZZOVÁ, Jana, Ondřej VÁVRA, David BEDNÁŘ a Jiří FILIPOVIČ. Simulation of Ligand Transport in Receptors Using CaverDock. In Flavio Ballante. Protein-Ligand Interactions and Drug Design. New York: Humana, New York, NY, 2021, s. 105-124. Methods in Molecular Biology, vol 2266. ISBN 978-1-0716-1208-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-1209-5_6.URL
RIV/00216224:14610/21:00118914 Kapitola resp. kapitoly v odborné knize. angličtina. Spojené státy.
Hozzová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Vávra, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Filipovič, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Tunnel analysis; Ligand transport; Molecular docking; Drug design; Enzyme engineering; Ligand screening
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 9. 9. 2021 15:31.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1757928/cs -
HON, Jiří, Martin MARUSIAK, Tomas MARTINEK, Antonín KUNKA, Jaroslav ZENDULKA, David BEDNÁŘ a Jiří DAMBORSKÝ. SoluProt: prediction of soluble protein expression in Escherichia coli. Bioinformatics. Oxford: Oxford University Press, 2021, roč. 37, č. 1, s. 23-28. ISSN 1367-4803. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btaa1102.URL
RIV/00216224:14310/21:00119188 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Hon, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Marusiak, Martin (203 Česká republika) -- Martinek, Tomas (203 Česká republika) -- Kunka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Zendulka, Jaroslav (203 Česká republika) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: SOLUBILITY; WEBSERVER; TOPOLOGY; ACCURATE
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 15. 2. 2024 09:29.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1790211/cs -
MAREK, Martin, E. RAMOS-MORALES, G.F.A. PICCHI-CONSTANTE, T. BAYER, C. NORSTROM, D. HERP, P.A. SALES, E.P. GUERRA-SLOMPO, K. HAUSMANN, A. CHAKRABARTI, T.B. SHAIK, A. MERZ, E. TROESCH, K. SCHMIDTKUNZ, S. GOLDENBERG, R.J. PIERCE, MM MOURAO, M.M. JUNG, J. SCHULTZ, W. SIPPL, N.I.T. ZANCHIN a C. ROMIER. Species-selective targeting of pathogens revealed by the atypical structure and active site of Trypanosoma cruzi histone deacetylase DAC2. Cell Reports. CAMBRIDGE: Cell Press, 2021, roč. 37, č. 12, s. 1-17, "e1-e9", 26 s. ISSN 2211-1247. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.celrep.2021.110129.URL
RIV/00216224:14310/21:00124414 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Marek, Martin (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: LYSINE ACETYLATION; HDAC INHIBITORS; IN-VITRO; PARASITES; POTENT; EPIGENETICS; EXPRESSION; MECHANISM; INSIGHTS; FEATURES
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 16. 5. 2022 12:46.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1841382/cs -
SHAPOSHNIKOVA, Anastasiia, Michal KUTY, Radka CHALOUPKOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Ivana KUTA SMATANOVA, Babak MINOFAR a Tanyana PRUDNIKOVA. Stabilization of Haloalkane Dehalogenase Structure by Interfacial Interaction with Ionic Liquids. Crystals. MDPI, 2021, roč. 11, č. 9, s. 1-16. ISSN 2073-4352. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/cryst11091052.URL
RIV/00216224:14310/21:00122906 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Shaposhnikova, Anastasiia (203 Česká republika) -- Kuty, Michal (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Kuta Smatanova, Ivana (203 Česká republika) -- Minofar, Babak (364 Írán) -- Prudnikova, Tanyana (112 Bělorusko)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase (HLD); ionic liquids (ILs); molecular dynamics (MD) simulations; protein stability; 2-hydroxyethylammonium acetate ([ETA][ACC]); 1-butyl-3-methylimidazolium methyl sulfate ([EMIM][CHS])
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 16. 2. 2023 12:44.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1804677/cs -
MAZUR, Andrii, Pavel GRINKEVICH, Radka CHALOUPKOVÁ, Petra HAVLICKOVA, Barbora KASCAKOVA, Michal KUTY, Jiří DAMBORSKÝ, Ivana KUTA SMATANOVA a Tatyana PRUDNIKOVA. Structural Analysis of the Ancestral Haloalkane Dehalogenase AncLinB-DmbA. International Journal of Molecular Sciences. Basel: Multidisciplinary Digital Publishing Institute, 2021, roč. 22, č. 21, s. 1-14. ISSN 1422-0067. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/ijms222111992.URL
RIV/00216224:14310/21:00124370 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase; ancestral sequence reconstruction; structural analysis; halogenated pollutants
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 16. 2. 2023 12:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1839329/cs -
GORECKI, Lukas, Anna MISIACHNA, Jiří DAMBORSKÝ, Rafael DOLEZAL, Jan KORABECNY, Lada CEJKOVA, Kristina HAKENOVA, Marketa CHVOJKOVA, Jana KARASOVA ZDAROVA, Lukas PRCHAL, Martin NOVAK, Marharyta KOLCHEVA, Stepan KORTUS, Karel VALES, Martin HORAK a Ondřej SOUKUP. Structure-activity relationships of dually-acting acetylcholinesterase inhibitors derived from tacrine on N-methyl-D-Aspartate receptors. European Journal of Medicinal Chemistry. PARIS: ELSEVIER FRANCE-EDITIONS SCIENTIFIQUES MEDICALES ELSEVIER, 2021, roč. 219, July 2021, s. 1-16. ISSN 0223-5234. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.ejmech.2021.113434.URL
RIV/00216224:14310/21:00122286 Článek v odborném periodiku. angličtina. Francie.
Gorecki, Lukas (203 Česká republika) -- Misiachna, Anna (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Dolezal, Rafael (203 Česká republika) -- Korabecny, Jan (203 Česká republika) -- Cejkova, Lada (203 Česká republika) -- Hakenova, Kristina (203 Česká republika) -- Chvojkova, Marketa (203 Česká republika) -- Karasova Zdarova, Jana (203 Česká republika) -- Prchal, Lukas (203 Česká republika) -- Novak, Martin (203 Česká republika) -- Kolcheva, Marharyta (203 Česká republika) -- Kortus, Stepan (203 Česká republika) -- Vales, Karel (203 Česká republika) -- Horak, Martin (203 Česká republika) -- Soukup, Ondřej (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: QSAR; Acetylcholinesterase; Electrophysiology; Glutamate receptor; Ion channel; Pharmacology; in vivo; Tacrine
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 16. 2. 2023 12:42.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1790420/cs -
PARUCH, Kamil, Benoit Jean-Pierre CARBAIN, Štěpán HAVEL, Jiří DAMBORSKÝ, Jan BREZOVSKÝ, Lukáš DANIEL, Alexandra SISÁKOVÁ, Fedor NIKULENKOV a Lumír KREJČÍ. SUBSTITUTED AMINOTHIAZOLES AS INHIBITORS OF NUCLEASES. 2021. Patent. Číslo: EP3556755B1. Vydavatel: European Patent Office. Místo vydání: Mnichov. Název vlastníka: Masarykova Univerzita. Datum registrace: 17. 4. 2018. Datum přijetí: 17. 11. 2021.URL
RIV/00216224:14310/21:00124423 Patent. angličtina. Německo.
Paruch, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Carbain, Benoit Jean-Pierre (250 Francie, domácí) -- Havel, Štěpán (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Daniel, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Sisáková, Alexandra (703 Slovensko, domácí) -- Nikulenkov, Fedor (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Lumír (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Antineoplastic agents; not condensed and containing further heterocyclic rings; condensed with carbocyclic rings; directly linked by a ring-member-to-ring-member bond; linked by a chain containing hetero atoms as chain links
CHYBA! Není vyplněn teritoriální rozsah patentové ochrany.
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 23. 3. 2022 09:59.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1842202/cs -
RAPP, Lea R., Sérgio Manuel MARQUES, Erna ZUKIC, Benjamin ROWLINSON, Mahima SHARMA, Gideon GROGAN, Jiří DAMBORSKÝ a Bernhard HAUER. Substrate Anchoring and Flexibility Reduction in CYP153A(M.aq) Leads to Highly Improved Efficiency toward Octanoic Acid. ACS Catalysis. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2021, roč. 11, č. 5, s. 3182-3189. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acscatal.0c05193.URL
RIV/00216224:14310/21:00122271 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Rapp, Lea R. (276 Německo) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Zukic, Erna (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Rowlinson, Benjamin (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Sharma, Mahima (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Grogan, Gideon (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Hauer, Bernhard (276 Německo)
Klíčová slova anglicky: biocatalysis; enzyme engineering; molecular dynamics; computational chemistry; cytochrome P450
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 16. 2. 2023 12:40.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1790205/cs -
KOKKONEN, Piia Pauliina, Andy BEIER, Stanislav MAZURENKO, Jiří DAMBORSKÝ, David BEDNÁŘ a Zbyněk PROKOP. Substrate inhibition by the blockage of product release and its control by tunnel engineering. RSC Chemical Biology. Cambridge: Royal Society of Chemistry, 2021, roč. 2, č. 2, s. 645-655. ISSN 2633-0679. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/d0cb00171f.URL
RIV/00216224:14310/21:00122273 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Kokkonen, Piia Pauliina (246 Finsko, domácí) -- Beier, Andy (276 Německo, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: MOLECULAR-DYNAMICS; CATALYTIC MECHANISM; DEHYDROGENASE; KINETICS; VALIDATION
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 11. 1. 2022 10:30.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1790207/cs -
RAMOS-MORALES, Elizabeth, Efil BAYAM, Jordi DEL-POZO-RODRIGUEZ, Thalia SALINAS-GIEGE, Martin MAREK, Ramos-Morales, E (Ramos- TILLY, Philippe WOLFF, Edouard TROESCH, Eric ENNIFAR, Laurence DROUARD, Juliette D. GODIN a Christophe ROMIER. The structure of the mouse ADAT2/ADAT3 complex reveals the molecular basis for mammalian tRNA wobble adenosine-to-inosine deamination. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2021, roč. 49, č. 11, s. 6529-6548. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkab436.URL
RIV/00216224:14310/21:00124051 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Ramos-Morales, Elizabeth (250 Francie) -- Bayam, Efil (250 Francie) -- Del-Pozo-Rodriguez, Jordi (250 Francie) -- Salinas-Giege, Thalia (250 Francie) -- Marek, Martin (203 Česká republika, garant, domácí) -- Tilly, Ramos-Morales, E (Ramos- (250 Francie) -- Wolff, Philippe (250 Francie) -- Troesch, Edouard (250 Francie) -- Ennifar, Eric (250 Francie) -- Drouard, Laurence (250 Francie) -- Godin, Juliette D. (250 Francie) -- Romier, Christophe (250 Francie)
Klíčová slova anglicky: CRYSTAL-STRUCTURE; INTELLECTUAL DISABILITY; ESCHERICHIA-COLI; TADA; ANTICODON; SPECIFICITY; POSITION; FEATURES; DATABASE; ENZYMES
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 4. 2. 2022 21:20.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1831398/cs -
MAZUR, Andrii, Tanyana PRUDNIKOVA, Pavel GRINKEVICH, Jeroen R. MESTERS, Daria MRAZOVA, Radka CHALOUPKOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Michal KUTY, Petr KOLENKO a Ivana KUTA SMATANOVA. The tetrameric structure of the novel haloalkane dehalogenase DpaA from Paraglaciecola agarilytica NO2. Acta Crystallographica Section D: Structural Biology. Chester: International Union of Crystallography, 2021, roč. 77, March 2021, s. 347-356. ISSN 2059-7983. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1107/S2059798321000486.URL
RIV/00216224:14310/21:00119187 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Mazur, Andrii (203 Česká republika) -- Prudnikova, Tanyana (112 Bělorusko) -- Grinkevich, Pavel (203 Česká republika) -- Mesters, Jeroen R. (276 Německo) -- Mrazova, Daria (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Kuty, Michal (203 Česká republika) -- Kolenko, Petr (203 Česká republika) -- Kuta Smatanova, Ivana (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: DpaA; crystallization; haloalkane dehalogenases; halogenated pollutants; tetrameric structure; oligomerization
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 16. 2. 2023 12:41.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1790208/cs -
DVOŘÁK, Petr, Pavel KREJČÍ, Lukáš BÁLEK, Lívia EISELLEOVÁ, Žaneta KONEČNÁ, Pavel DVOŘÁK, David BEDNÁŘ, Jan BREZOVSKÝ, Eva ŠEBESTOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Pavel VAŇÁČEK, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a Michaela BOSÁKOVÁ. Thermostable FGF2 polypeptide, use thereof. 2021. Patent. Číslo: AU2016359722. Vydavatel: Australian Patent Office. Místo vydání: Australia. Název vlastníka: Masarykova Univerzita; Enantis s.r.o. Datum registrace: 3. 10. 2016. Datum přijetí: 7. 1. 2021.URL
RIV/00216224:14310/21:00124498 Patent. angličtina. Austrálie.
Dvořák, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Bálek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Eiselleová, Lívia (703 Slovensko, domácí) -- Konečná, Žaneta (203 Česká republika, domácí) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Šebestová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bosáková, Michaela (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: FGF2; Stem cells; Drugs
Mezinárodní význam: ano
CHYBA! Není vyplněn teritoriální rozsah patentové ochrany.
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 7. 4. 2022 14:09.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1845598/cs -
DVOŘÁK, Petr, Pavel KREJČÍ, Lukáš BÁLEK, Lívia EISELLEOVÁ, Žaneta KONEČNÁ, Pavel DVOŘÁK, David BEDNÁŘ, Jan BREZOVSKÝ, Eva ŠEBESTOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Pavel VAŇÁČEK, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a Michaela BOSÁKOVÁ. Thermostable FGF2 Polypeptide, Use Thereof. 2021. Patent. Číslo: SG11201804402W. Vydavatel: Intellectual Property Office of Singapore (IPOS). Místo vydání: Singapur. Název vlastníka: Masarykova univerzita; Enantis s.r.o. Datum registrace: 3. 10. 2016. Datum přijetí: 5. 4. 2021.URL
RIV/00216224:14310/21:00121632 Patent. angličtina. Singapur.
Dvořák, Petr (203 Česká republika, garant, domácí) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Bálek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Eiselleová, Lívia (703 Slovensko, domácí) -- Konečná, Žaneta (203 Česká republika, domácí) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Šebestová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bosáková, Michaela (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Fibroblast Growth Factor 2; FGF2
CHYBA! Není vyplněn teritoriální rozsah patentové ochrany.
Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 31. 5. 2022 17:00.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1770461/cs -
FRIEDLOVÁ, Nela, Lenka DOSEDĚLOVÁ, Filip ZAVADIL KOKÁŠ, Lenka HERNYCHOVÁ, Bořivoj VOJTĚŠEK a Marta NEKULOVÁ. Vliv IFITM1 na „surfaceom“ buněk cervikálního karcinomu. In Brněnské onkologické dny. 2021. ISSN 0862-495X.
Druh účasti: aktivní účast
Změnila: Mgr. Nela Friedlová, učo 437252. Změněno: 24. 3. 2022 13:43.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1842877/cs -
BRŮŽA, Vojtěch, Jan BYŠKA, Jan MIČAN a Barbora KOZLÍKOVÁ. VRdeo: Creating engaging educational material for asynchronous student-teacher exchange using virtual reality. COMPUTERS & GRAPHICS-UK. OXFORD: PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD, 2021, roč. 98, August 2021, s. 280-292. ISSN 0097-8493. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.cag.2021.06.009.URL
RIV/00216224:14330/21:00122288 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Brůža, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Byška, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Mičan, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Kozlíková, Barbora (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Virtual reality; Video authoring; Educational material
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: doc. RNDr. Barbora Kozlíková, Ph.D., učo 60850. Změněno: 24. 7. 2023 09:24.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1790442/cs -
KNOZ, Martin, Břetislav LIPOVÝ, Jakub HOLOUBEK, Jan ŽÍDEK, Johana BABRNÁKOVÁ, Veronika PAVLIŇÁKOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Zdeněk PAVLOVSKÝ, Martin FALDYNA, Eduard GOPFERT, Jiří DAMBORSKÝ, Vanessa HEARNDEN, Lucy VOJTOVÁ a Michaela CVANOVÁ. Vývoj dermální náhrady, kvalitativní testování na zvířecích modelech. In II. Česko-slovenský kongres "Mezioborové přístupy v hojení ran". 2021.
Název česky: Vývoj dermální náhrady, kvalitativní testování na zvířecích modelech
Recenzováno: ano
Změnil: MUDr. Martin Knoz, Ph.D., učo 177146. Změněno: 30. 12. 2021 11:05.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1814819/cs -
MARQUES, Sérgio Manuel, Joan PLANAS IGLESIAS a Jiří DAMBORSKÝ. Web-based tools for computational enzyme design. Current Opinion in Structural Biology. London: Elsevier Science Ltd., 2021, roč. 69, August 2021, s. 19-34. ISSN 0959-440X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.sbi.2021.01.010.URL
RIV/00216224:14310/21:00119876 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Planas Iglesias, Joan (724 Španělsko, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: PROTEIN; STABILITY; DYNAMICS; VIEW
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 23:41.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1804663/cs -
4D-GRAPHS (software)BRÁZDIL, Tomáš, David PORTEŠ, Jiří FILIPOVIČ, Jana HOZZOVÁ, Thomas EVANGELIDIS a Konstantinos TRIPSIANES. 4D-GRAPHS. 2021.URL
Název česky: 4D-GRAPHS
RIV/00216224:14330/21:00121312 Software. angličtina. Česká republika.
Brázdil, Tomáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Porteš, David (203 Česká republika, domácí) -- Filipovič, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Hozzová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Evangelidis, Thomas (300 Řecko, domácí) -- Tripsianes, Konstantinos (300 Řecko, domácí)
Klíčová slova anglicky: NMR; NOESY; assignment
Mezinárodní význam: ano
Změnil: doc. RNDr. Jiří Filipovič, Ph.D., učo 72898. Změněno: 8. 6. 2021 15:15.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1756437/cs -
PETROVIČ, Filip, David STŘELÁK, Jana HOZZOVÁ, Jaroslav OĽHA, Richard TREMBECKÝ, Siegfried BENKNER a Jiří FILIPOVIČ. A benchmark set of highly-efficient CUDA and OpenCL kernels and its dynamic autotuning with Kernel Tuning Toolkit. Future Generation Computer Systems. Elsevier, 2020, roč. 108, July, s. 161-177. ISSN 0167-739X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.future.2020.02.069.URL
Název česky: Sada benchmarků vysoce efektivních CUDA a OpenCL kernelů a její dynamický autotuning za pomocí Kernel Tuning Toolkit
RIV/00216224:14610/20:00115375 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Petrovič, Filip (703 Slovensko, domácí) -- Střelák, David (203 Česká republika, domácí) -- Hozzová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Oľha, Jaroslav (703 Slovensko, domácí) -- Trembecký, Richard (703 Slovensko, domácí) -- Benkner, Siegfried (40 Rakousko) -- Filipovič, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Dynamic autotuning; OpenCL; CUDA; Performance optimization; Autotuning benchmark set
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Alena Mokrá, učo 362754. Změněno: 25. 3. 2021 10:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1630456/cs -
CHMELOVÁ, Klaudia, Eva ŠEBESTOVÁ, Veronika LIŠKOVÁ, Andy BEIER, David BEDNÁŘ, Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. A Haloalkane Dehalogenase from Saccharomonospora viridis Strain DSM 43017, a Compost Bacterium with Unusual Catalytic Residues, Unique (S)-Enantiopreference, and High Thermostability. Applied and Environmental Microbiology. Washington, D.C.: American Society for Microbiology, 2020, roč. 86, č. 17, s. 1-12. ISSN 0099-2240. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1128/AEM.02820-19.URL
RIV/00216224:14310/20:00114589 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Chmelová, Klaudia (703 Slovensko, domácí) -- Šebestová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Lišková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Beier, Andy (276 Německo, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase; (S)-enantiopreference; thermophilic bacterium; catalytic residues; halide-stabilizing residues; dehalogenase; enantioselectivity; haloalkane; kinetics; mutagenesis; structure; substrate specificity; thermostability
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:57.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1711938/cs -
ASLAN-UZEL, Askin S., Andy BEIER, David KOVÁŘ, Clemens CZIEGLER, Santosh K. PADHI, Eva D. SCHUITEN, Mark DORR, Dominique BOTTCHER, Frank HOLLMANN, Florian RUDROFF, Marko D. MIHOVILOVIC, Tomáš BURYŠKA, Jiří DAMBORSKÝ, Zbyněk PROKOP, Christoffel P. S. BADENHORST a Uwe T. BORNSCHEUER. An Ultrasensitive Fluorescence Assay for the Detection of Halides and Enzymatic Dehalogenation. ChemCatChem. WEINHEIM: WILEY-V C H VERLAG GMBH, 2020, roč. 12, č. 7, s. 2032-2039. ISSN 1867-3880. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cctc.201901891.URL
RIV/00216224:14310/20:00115467 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Aslan-Uzel, Askin S. (276 Německo) -- Beier, Andy (276 Německo, domácí) -- Kovář, David (203 Česká republika, domácí) -- Cziegler, Clemens (40 Rakousko) -- Padhi, Santosh K. (356 Indie) -- Schuiten, Eva D. (276 Německo) -- Dorr, Mark (276 Německo) -- Bottcher, Dominique (276 Německo) -- Hollmann, Frank (528 Nizozemské království) -- Rudroff, Florian (40 Rakousko) -- Mihovilovic, Marko D. (40 Rakousko) -- Buryška, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Badenhorst, Christoffel P. S. (276 Německo) -- Bornscheuer, Uwe T. (276 Německo)
Klíčová slova anglicky: dehalogenase; fluorescence; halides; haloalkane; haloperoxidase
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 16. 2. 2023 12:32.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1640717/cs -
FILIPOVIČ, Jiří, Ondřej VÁVRA, Jan PLHÁK, David BEDNÁŘ, Sérgio Manuel MARQUES, Jan BREZOVSKÝ, Luděk MATYSKA a Jiří DAMBORSKÝ. CaverDock: A Novel Method for the Fast Analysis of Ligand Transport. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. Los Alamitos: IEEE Computer Society, 2020, roč. 17, č. 5, s. 1625-1638. ISSN 1545-5963. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/TCBB.2019.2907492.URL
Název česky: CaverDock: nová metoda pro rychlou analýzu transportu ligandu
RIV/00216224:14610/20:00115044 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Filipovič, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Vávra, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Plhák, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Matyska, Luděk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: molecular docking; tunnel analysis; ligand transport; drug design; numerical optimization; restrained force field; volume discretization
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 17. 2. 2023 20:52.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1514116/cs -
SEDLÁČKOVÁ, Jitka a Kenneth HOLMQVIST. Deaf learners' processing of English textbook material : An eye-tracking study. In 11th Brno International Conference of English, American and Canadian Studies : "Breaking the Boundaries : In Between Texts, Cultures and Conventions", 12–14 February, 2020, Brno, Faculty of Arts, Masaryk University. 2020.URL
Název anglicky: Deaf learners' processing of English textbook material : An eye-tracking study
angličtina. Česká republika.
Klíčová slova anglicky: ELT; deaf and hard of hearing learners; eye tracking; reading
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnila: Mgr. Jana Pelclová, Ph.D., učo 39970. Změněno: 22. 2. 2021 17:07.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1626116/cs -
MARKOVÁ, Klára, Klaudia CHMELOVÁ, Sérgio Manuel MARQUES, Philippe CARPENTIER, David BEDNÁŘ, Jiří DAMBORSKÝ a Martin MAREK. Decoding the intricate network of molecular interactions of a hyperstable engineered biocatalyst. Chemical Science. Cambridge: Royal Society of Chemistry, 2020, roč. 11, č. 41, s. 11162-11178. ISSN 2041-6520. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/d0sc03367g.URL
RIV/00216224:14310/20:00117258 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Marková, Klára (203 Česká republika, domácí) -- Chmelová, Klaudia (703 Slovensko, domácí) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Carpentier, Philippe (250 Francie) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Small-angle scattering; Candida antarctica lipase B
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:54.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1705576/cs -
FURMANOVÁ, Katarína, Ondřej VÁVRA, Barbora KOZLÍKOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Vojtěch VONÁSEK, David BEDNÁŘ a Jan BYŠKA. DockVis: Visual Analysis of Molecular Docking Trajectories. Computer Graphics Forum. Wiley-Blackwell, 2020, roč. 39, č. 6, s. 452-464. ISSN 0167-7055. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/cgf.14048.URL
RIV/00216224:14330/20:00114201 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Furmanová, Katarína (703 Slovensko, domácí) -- Vávra, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Kozlíková, Barbora (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Vonásek, Vojtěch (203 Česká republika) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Byška, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: visual analysis; molecular docking; trajectory; ligand
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 17. 2. 2023 20:54.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1664236/cs -
HON, Jiří, Simeon BORKO, Jan ŠTOURAČ, Zbyněk PROKOP, Jaroslav ZENDULKA, David BEDNÁŘ, Tomas MARTINEK a Jiří DAMBORSKÝ. EnzymeMiner: automated mining of soluble enzymes with diverse structures, catalytic properties and stabilities. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2020, roč. 48, W1, s. "W104"-"W109", 6 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkaa372.URL
RIV/00216224:14310/20:00117412 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Hon, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Borko, Simeon (203 Česká republika) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Zendulka, Jaroslav (203 Česká republika) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Martinek, Tomas (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: PROTEIN; SEARCH
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:56.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1711916/cs -
BEZDÍČEK, Matěj, Markéta NYKRÝNOVÁ, Kristýna DUFKOVÁ, Kristina PLEVOVÁ, Iva KOCMANOVÁ a Martina LENGEROVÁ. Epidemiology typing and molecular analysis of vancomycin-resistant Enterococcus foeclum in haemato-oncological patients. In 30th ECCMID 2020. 2020.
Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 9. 4. 2021 08:55.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1722480/cs -
OĽHA, Jaroslav, Jana HOZZOVÁ, Jan FOUSEK a Jiří FILIPOVIČ. Exploiting historical data: Pruning autotuning spaces and estimating the number of tuning steps. CONCURRENCY AND COMPUTATION-PRACTICE & EXPERIENCE. HOBOKEN: WILEY, 2020, roč. 32, č. 21, s. 1-15. ISSN 1532-0626. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cpe.5962.URL
RIV/00216224:14610/20:00116267 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Oľha, Jaroslav (703 Slovensko, garant, domácí) -- Hozzová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Fousek, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Filipovič, Jiří (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: autotuning; prediction of tuning cost; sensitivity analysis; tuning space pruning
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 30. 8. 2022 14:20.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1675386/cs -
VAŠINA, Michal, Pavel VAŇÁČEK, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Exploration of enzyme diversity: High-throughput techniques for protein production and microscale biochemical characterization. Online. In Dan S. Tawfik. Methods in Enzymology - Enzyme Engineering and Evolution: General Methods. Neuveden: Elsevier Inc, 2020, s. 51-85. ISBN 978-0-12-821149-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/bs.mie.2020.05.004.URL
RIV/00216224:14310/20:00117531 Kapitola resp. kapitoly v odborné knize. angličtina. Nizozemské království.
Vašina, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáček, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Enzyme diversity Genomic databases Metagenomics Directed evolution High-throughput protein production Microscale characterization Microfluidics
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 23:02.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1717557/cs -
KŘENEK, Aleš, Jana HOZZOVÁ, Jaroslav OĽHA, Dalibor TRAPL a Vojtěch SPIWOK. Exploring Protein Folding Space with Neural Network Guided Simulations. In Alexandre Nketsa. MODELLING AND SIMULATION 2020. Brusel: EUROSIS-ETI, 2020, s. 305-309. ISBN 978-94-92859-12-9.program konference
Název česky: Prohledávání prostoru foldování proteinů simulacemí řízenými neuronovou sítí
Název anglicky: Exploring Protein Folding Space with Neural Network Guided Simulations
RIV/00216224:14610/20:00114384 Stať ve sborníku. angličtina. Belgie.
Křenek, Aleš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Hozzová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Oľha, Jaroslav (703 Slovensko, domácí)
Klíčová slova anglicky: metadyamic; protein folding; netural network
Druh sborníku: předkonferenční sborník
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Alena Mokrá, učo 362754. Změněno: 29. 4. 2021 10:58.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1686702/cs -
DOČKALOVÁ, Veronika, Esther Maria MARQUEZ SANCHEZ - CARNERERO, Zuzana DUNAJOVÁ, Eduardo PALAO UTIEL, Michaela SLÁNSKÁ, Tomáš BURYŠKA, Jiří DAMBORSKÝ, Petr KLÁN a Zbyněk PROKOP. Fluorescent substrates for haloalkane dehalogenases: Novel probes for mechanistic studies and protein labeling. Computational and Structural Biotechnology Journal. Amsterdam: Elsevier, 2020, roč. 18, č. 2020, s. 922-932. ISSN 2001-0370. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.csbj.2020.03.029.URL
RIV/00216224:14310/20:00114731 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Dočkalová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Marquez Sanchez - Carnerero, Esther Maria (724 Španělsko, domácí) -- Dunajová, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Palao Utiel, Eduardo (724 Španělsko, domácí) -- Slánská, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Buryška, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Klán, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Haloalkane dehalogenase; Fluorescent substrate; Enzyme kinetics; Mechanism; Protein labeling
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 23:04.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1735017/cs -
TÓTHOVÁ, Lenka a Jitka SEDLÁČKOVÁ. Fostering autonomy in learners with special needs: a specialized e-learning course. In CercleS 2020. Language Centres at a Crossroads: Open Directions for New Generations of Learners. 2020.URL
Název anglicky: Fostering autonomy in learners with special needs: a specialized e-learning course
RIV/00216224:14750/20:00117738 Prezentace na konferencích. angličtina. Česká republika.
Tóthová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Sedláčková, Jitka (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: e-learning; higher education students with special needs; deaf; hard of hearing; mobilities; autonomy; feedback provision; social interaction;
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnila: Mgr. et Mgr. Lenka Tóthová, Ph.D., učo 133415. Změněno: 13. 1. 2021 15:29.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1727670/cs -
MAZURENKO, Stanislav, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Machine Learning in Enzyme Engineering. ACS Catalysis. Washington, D.C.: American Chemical Society, 2020, roč. 10, č. 2, s. 1210-1223. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acscatal.9b04321.URL
RIV/00216224:14310/20:00114835 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: artificial intelligence; enantioselectivity; function; mechanism; protein engineering; structure-function; solubility; stability
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 23:01.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1640721/cs -
TÓTHOVÁ, Lenka, Jitka SEDLÁČKOVÁ a Eva BARNOVÁ. Online English for International Mobilities: A course for students. In The LangSkills project closing conference. 2020.A conference presentation delivered at the LangSkills project closing conference held online.
Název anglicky: Online English for International Mobilities: A course for students
RIV/00216224:14750/20:00117735 Prezentace na konferencích. angličtina. Česká republika.
Tóthová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Sedláčková, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Barnová, Eva (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: e-learning; higher education students with special needs; deaf; hard of hearing; studying abroad; reading comprehension; writing; teacher feedback;
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnila: Mgr. et Mgr. Lenka Tóthová, Ph.D., učo 133415. Změněno: 13. 1. 2021 14:48.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1727656/cs -
MAZURENKO, Stanislav. Predicting protein stability and solubility changes upon mutations: data perspective. ChemCatChem. Weinheim: Wiley-VCH GmbH, 2020, roč. 12, č. 22, s. 5590-5598. ISSN 1867-3880. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cctc.202000933.URL
RIV/00216224:14310/20:00117450 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Database; Machine learning; Protein design; Protein engineering; Protein modifications
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 17. 4. 2021 21:42.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1712656/cs -
MAZURENKO, Stanislav, Jyrki JAUHIAINEN a Tuomo VALKONEN. Primal-dual block-proximal splitting for a class of non-convex problems. Electronic Transactions on Numerical Analysis. Kent: Kent State University, 2020, roč. 52, č. 2020, s. 509-552. ISSN 1068-9613. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1553/etna_vol52s509.URL
RIV/00216224:14310/20:00118171 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: primal-dual algorithms; convex optimization; non-smooth optimization; step length
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 15. 2. 2021 17:04.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1742276/cs -
TÓTHOVÁ, Lenka, Jitka SEDLÁČKOVÁ a Eva BARNOVÁ. Seminář pro učitele angličtiny pracující s neslyšícími a nedoslýchavými studenty. 2020.URL
Název česky: Seminář pro učitele angličtiny pracující s neslyšícími a nedoslýchavými studenty
Název anglicky: Seminar for English teachers working with Deaf, deaf and hard of hearing students
RIV/00216224:14750/20:00117740 Uspořádání workshopu. čeština. Česká republika.
Tóthová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Sedláčková, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Barnová, Eva (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Deaf; hard of hearing; English teachers; EFl learners; motivation; e-learning
Změnila: Mgr. et Mgr. Lenka Tóthová, Ph.D., učo 133415. Změněno: 15. 2. 2021 10:42.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1727677/cs -
MAREK, Martin, Radka CHALOUPKOVÁ, Tanyana PRUDNIKOVA, Yukari SATO, Pavlina REZACOVA, Yuji NAGATA, Ivana SMATANOVA KUTA a Jiří DAMBORSKÝ. Structural and catalytic effects of surface loop-helix transplantation within haloalkane dehalogenase family. Computational and Structural Biotechnology Journal. Amsterdam: Elsevier, 2020, roč. 18, December 2020, s. 1352-1362. ISSN 2001-0370. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.csbj.2020.05.019.URL
RIV/00216224:14310/20:00114750 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Marek, Martin (203 Česká republika, garant, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prudnikova, Tanyana (112 Bělorusko) -- Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Rezacova, Pavlina (203 Česká republika) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Smatanova Kuta, Ivana (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Haloalkane dehalogenase (HLD); Biocatalysis; Loop-helix transplantation; X-ray crystallography; Enantioselectivity; Access tunnel; Enzyme engineering; Protein design
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 23:11.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1746098/cs -
Structures of hyperstable ancestral haloalkane dehalogenases show restricted conformational dynamicsBABKOVÁ, Petra, Zuzana DUNAJOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, David BEDNÁŘ a Martin MAREK. Structures of hyperstable ancestral haloalkane dehalogenases show restricted conformational dynamics. Computational and Structural Biotechnology Journal. Amsterdam: Elsevier, 2020, roč. 18, č. 2020, s. 1497-1508. ISSN 2001-0370. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.csbj.2020.06.021.URL
RIV/00216224:14310/20:00114742 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Babková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Dunajová, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Enzyme; Haloalkane dehalogenase; Ancestral sequence reconstruction; Thermostability; X-ray crystallography; Protein simulations; Conformational flexibility; Protein design
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:53.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1742376/cs -
KOKKONEN, Piia Pauliina, Michaela SLÁNSKÁ, Veronika DOČKALOVÁ, José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, Esther Maria MARQUEZ SANCHEZ - CARNERERO, Jiří DAMBORSKÝ, Petr KLÁN, Zbyněk PROKOP a David BEDNÁŘ. The impact of tunnel mutations on enzymatic catalysis depends on the tunnel-substrate complementarity and the rate-limiting step. Computational and Structural Biotechnology Journal. Amsterdam: Elsevier, 2020, roč. 18, č. 2020, s. 805-813. ISSN 2001-0370. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.csbj.2020.03.017.URL
RIV/00216224:14310/20:00118046 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Kokkonen, Piia Pauliina (246 Finsko, domácí) -- Slánská, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Dočkalová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Rangel Pamplona Pizarro Pinto, José Gaspar (620 Portugalsko, domácí) -- Marquez Sanchez - Carnerero, Esther Maria (724 Španělsko, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Klán, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Enzyme kinetics; Enzyme mutation; Substrate specificity
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:59.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1734897/cs -
DVOŘÁK, Petr, Pavel KREJČÍ, Lukáš BÁLEK, Lívia EISELLEOVÁ, Žaneta KONEČNÁ, Pavel DVOŘÁK, David BEDNÁŘ, Jan BREZOVSKÝ, Eva ŠEBESTOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Pavel VAŇÁČEK, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a Michaela BOSÁKOVÁ. Thermostable FGF2 Polypeptide, Use Thereof. 2020. Patent. Číslo: EP3380508. Vydavatel: European Patent Office. Místo vydání: Munich. Název vlastníka: Masarykova univerzita; Enantis s.r.o. Datum registrace: 3. 10. 2016. Datum přijetí: 22. 7. 2020.URL
RIV/00216224:14310/20:00114963 Patent. Biochemie. angličtina. Německo.
Dvořák, Petr (203 Česká republika, garant, domácí) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Bálek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Eiselleová, Lívia (203 Česká republika, domácí) -- Konečná, Žaneta (203 Česká republika, domácí) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Šebestová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Štěpánková, Veronika (203 Česká republika) -- Vaňáček, Pavel (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bosáková, Michaela (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Fibroblast Growth Factor 2; FGF2
CHYBA! Není vyplněn teritoriální rozsah patentové ochrany.
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 8. 4. 2021 18:16.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1339462/cs -
LAHAM-KARAM, Nihay, José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, Antti POSO a Piia Pauliina KOKKONEN. Transcription and Translation Inhibitors in Cancer Treatment. Frontiers in Chemistry. Lausanne: Frontiers Media SA, 2020, roč. 8, April 2020, s. 1-24. ISSN 2296-2646. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3389/fchem.2020.00276.URL
RIV/00216224:14310/20:00116116 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Laham-Karam, Nihay (246 Finsko) -- Rangel Pamplona Pizarro Pinto, José Gaspar (620 Portugalsko, garant, domácí) -- Poso, Antti (246 Finsko) -- Kokkonen, Piia Pauliina (246 Finsko)
Klíčová slova anglicky: cancer; drug; inhibitor; translation; transcription
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 16. 2. 2023 13:40.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1672938/cs -
NÁLEŽINSKÁ, Monika, DUBSKÁ L ZDRAŽILOVÁ, Dalibor VALÍK, Lenka HERNYCHOVÁ, T PAVLÍK, M MAZALOVÁ, Josef CHOVANEC a Vuk FAIT. Úskalí laboratorních metod v ovariálním skríninku - doba "-omická"? Czech Yearbook of Public & Private International Law (Vol.11) - 2020 Read more: https://www.cyil.eu/contents-cyil-2020/. Praha: Czech Society of International Law, 2020.
Změnila: MUDr. Monika Náležinská, učo 465704. Změněno: 16. 1. 2022 07:17.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1822082/cs -
CLASON, Christian, Stanislav MAZURENKO a Tuomo VALKONEN. ACCELERATION AND GLOBAL CONVERGENCE OF A FIRST-ORDER PRIMAL-DUAL METHOD FOR NONCONVEX PROBLEMS. SIAM JOURNAL ON OPTIMIZATION. PHILADELPHIA: SIAM PUBLICATIONS, 2019, roč. 29, č. 1, s. 933-963. ISSN 1052-6234. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1137/18M1170194.URL
RIV/00216224:14310/19:00113487 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Clason, Christian (garant) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí)
Klíčová slova anglicky: acceleration; convergence; global; primal-dual; first order; nonconvex
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 1. 4. 2020 22:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1641978/cs -
BYŠKA, Jan, Thomas TRAUTNER, Sérgio Manuel MARQUES, Jiří DAMBORSKÝ, Barbora KOZLÍKOVÁ a Manuela WALDNER. Analysis of Long Molecular Dynamics Simulations Using Interactive Focus+Context Visualization. Computer Graphics Forum. Wiley-Blackwell, 2019, roč. 38, č. 3, s. 441-453. ISSN 0167-7055. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/cgf.13701.URL
Název anglicky: Analysis of Long Molecular Dynamics Simulations Using Interactive Focus+Context Visualization
RIV/00216224:14330/19:00107361 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Byška, Jan (203 Česká republika, garant, domácí) -- Trautner, Thomas (40 Rakousko) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Kozlíková, Barbora (203 Česká republika, domácí) -- Waldner, Manuela (40 Rakousko)
Klíčová slova anglicky: Molecular Visualization;Design Studies;Focus + Context Techniques
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 17. 2. 2023 20:49.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1521596/cs -
KNOZ, Martin, Břetislav LIPOVÝ, Jakub HOLOUBEK, Jan ŽÍDEK, Johana BABRNÁKOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Zdeněk PAVLOVSKÝ, Martin FALDYNA, Eduard GÖPFERT, Jiří DAMBORSKÝ, Vanessa HEARNDEN a Lucy VOJTOVÁ. Bilaminární kožní dermální náhrada: Vliv stabilního FGF2 na kapilární denzitu sledovanou pomocí modelů ex-ovo a in vivo. In Bioimplantologie 2019. 2019.
Název česky: Bilaminární kožní dermální náhrada: Vliv stabilního FGF2 na kapilární denzitu sledovanou pomocí modelů ex-ovo a in vivo
Změnil: MUDr. Martin Knoz, Ph.D., učo 177146. Změněno: 14. 4. 2019 17:52.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1520158/cs -
ŠTOURAČ, Jan, O. VAVRA, Piia Pauliina KOKKONEN, Jiří FILIPOVIČ, Gabriela Filipa FONSECA PINTO, Andrea SCHENKMAYEROVÁ, Jiří DAMBORSKÝ a David BEDNÁŘ. Caver web: identification of tunnels and channels in proteins and analysis of ligand transport. In European Biotechnology Congress. 2019. ISSN 0168-1656. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jbiotec.2019.05.251.URL
RIV/00216224:14310/19:00113698 Konferenční abstrakt. angličtina. Nizozemské království.
Štourač, Jan (203 Česká republika, garant, domácí) -- Kokkonen, Piia Pauliina (246 Finsko, domácí) -- Filipovič, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Fonseca Pinto, Gabriela Filipa (620 Portugalsko) -- Schenkmayerová, Andrea (703 Slovensko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Caver web
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 20. 4. 2020 19:44.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1647656/cs -
ŠTOURAČ, Jan, Ondřej VÁVRA, Piia Pauliina KOKKONEN, Jiří FILIPOVIČ, José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, Jan BREZOVSKÝ, Jiří DAMBORSKÝ a David BEDNÁŘ. Caver Web 1.0: identification of tunnels and channels in proteins and analysis of ligand transport. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2019, roč. 47, W1, s. 414-422. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkz378.Full Text
Název česky: Caver Web 1.0: identifikace tunelů a kanálů v proteinech a analýza transportu ligandu
RIV/00216224:14310/19:00110115 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Vávra, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Kokkonen, Piia Pauliina (246 Finsko, domácí) -- Filipovič, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Rangel Pamplona Pizarro Pinto, José Gaspar (620 Portugalsko, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: BINDING; STABILITY; MECHANISM; MYOGLOBIN; MIGRATION; DYNAMICS; KINETICS; PATHWAY; ENZYMES; SERVER
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:14.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1544938/cs -
VÁVRA, Ondřej, Jiří FILIPOVIČ, Jan PLHÁK, David BEDNÁŘ, Sérgio Manuel MARQUES, Jan BREZOVSKÝ, Jan ŠTOURAČ, Luděk MATYSKA a Jiří DAMBORSKÝ. CaverDock: a molecular docking-based tool to analyse ligand transport through protein tunnels and channels. Bioinformatics. Oxford: Oxford University Press, 2019, roč. 35, č. 23, s. 4986-4993. ISSN 1367-4803. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btz386.Full Text
Název česky: CaverDock: na molekulovém dokingu založený nástroj k analýze transportu ligandu skrz tunely a kanály v proteinech
RIV/00216224:14310/19:00110114 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Vávra, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Filipovič, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Plhák, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Matyska, Luděk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: HALOALKANE DEHALOGENASE LINB; ENERGY LANDSCAPE; ACTIVE-SITE; DYNAMICS; MECHANISM; BINDING; RECOGNITION; KINETICS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:12.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1544936/cs -
LIPOVÝ, Břetislav, Lucy VOJTOVÁ, Jakub HOLOUBEK, Jana ZÍDEK, Martin KNOZ, Johana BABRNAKOVA, Veronika PAVLIŇÁKOVÁ, Lucie VIŠTĚJNOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Eva FILOVÁ, Zdeněk PAVLOVSKÝ, Martin FALDYNA, Eduard GÖPFERT, Jiří DAMBORSKÝ a Vanessa HEARNDEN. Collagen-based dermal substitute with stable fibroblast growth factor 2 (FGF2): ex ovo and in vivo impact on neovascularization. In 12th Asia Pacific Burn Congress. 2019. ISSN 2321-3876. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s41038-019-0164-1.
čeština. Česká republika.
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. MUDr. Břetislav Lipový, Ph.D., MBA, LL.M., učo 60248. Změněno: 19. 8. 2019 11:19.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1549689/cs -
MUSIL, Miloš, Hannes KONEGGER, Jiří HON, David BEDNÁŘ a Jiří DAMBORSKÝ. Computational Design of Stable and Soluble Biocatalysts. ACS Catalysis. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2019, roč. 9, č. 2, s. 1033-1054. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acscatal.8b03613.URL
RIV/00216224:14310/19:00113346 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Musil, Miloš (203 Česká republika, domácí) -- Konegger, Hannes (40 Rakousko, domácí) -- Hon, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: aggregation; computational design; force field; expressibility; machine learning; phylogenetic analysis; enzyme stability; enzyme solubility
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:29.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1638956/cs -
DEMKO, Martin, Lukáš CHRÁST, Pavel DVOŘÁK, Jiří DAMBORSKÝ a David ŠAFRÁNEK. Computational Modelling of Metabolic Burden and Substrate Toxicity in Escherichia coli Carrying a Synthetic Metabolic Pathway. Microorganisms. Basel: MDPI, 2019, roč. 7, č. 11, s. 553-581. ISSN 2076-2607. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/microorganisms7110553.Full Text
Název anglicky: Computational Modelling of Metabolic Burden and Substrate Toxicity in Escherichia coli Carrying a Synthetic Metabolic Pathway
RIV/00216224:14310/19:00107775 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Demko, Martin (703 Slovensko, garant, domácí) -- Chrást, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Šafránek, David (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: biodegradation; computational modelling; population growth; metabolic burden; environmental pollutants
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:51.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1577678/cs -
MARQUES, Sérgio Manuel, David BEDNÁŘ a Jiří DAMBORSKÝ. Computational Study of Protein-Ligand Unbinding for Enzyme Engineering. FRONTIERS IN CHEMISTRY. LAUSANNE: FRONTIERS MEDIA SA, 2019, roč. 6, JAN 2019, s. 1-15. ISSN 2296-2646. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3389/fchem.2018.00650.URL
RIV/00216224:14310/19:00113203 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: unbinding kinetics; protein engineering; molecular dynamics; metadynamics; adaptive sampling; CaverDock
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:27.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1632601/cs -
BURYŠKA, Tomáš, Michal VAŠINA, Fabrice GIELEN, Pavel VAŇÁČEK, Liisa VAN VLIET, Jan JEZEK, Zdenek PILAT, Pavel ZEMÁNEK, Jiří DAMBORSKÝ, Florian HOLLFELDER a Zbyněk PROKOP. Controlled Oil/Water Partitioning of Hydrophobic Substrates Extending the Bioanalytical Applications of Droplet-Based Microfluidics. Analytical Chemistry. Washington, D.C.: AMER CHEMICAL SOC, 2019, roč. 91, č. 15, s. 10008-10015. ISSN 0003-2700. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.analchem.9b01839.Full Text
RIV/00216224:14310/19:00110640 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Buryška, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Vašina, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáček, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Zemánek, Pavel (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: ENZYME-KINETICS; PLATFORM; CHIP; COMPARTMENTS; SENSITIVITY; ABSORBENCY; EVOLUTION; TRANSPORT; ASSAYS; SPACE
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1555283/cs -
TRATSIAK, K., Tanyana PRUDNIKOVA, Ivana DRIENOVSKÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Jiří BRYNDA, Petr PACHL, Michal KUTÝ, Radka CHALOUPKOVÁ, P. REZACOVA a I.K. SMATANOVA. Crystal structure of the cold-adapted haloalkane dehalogenase DpcA from Psychrobacter cryohalolentis K5. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS. CHESTER: INT UNION CRYSTALLOGRAPHY, 2019, roč. 75, MAY 2019, s. 324-331. ISSN 2053-230X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1107/S2053230X19002796.URL
RIV/00216224:14310/19:00108194 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Prudnikova, Tanyana (112 Bělorusko) -- Drienovská, Ivana (703 Slovensko, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Brynda, Jiří (203 Česká republika) -- Pachl, Petr (203 Česká republika) -- Kutý, Michal (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase; alpha/beta-hydrolase; X-ray diffraction; psychrophiles; structural analysis; Psychrobacter cryohalolentis
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 16. 2. 2023 12:24.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1638976/cs -
PRUDNIKOVA, T., B. KASCAKOVA, J.R. MESTERS, P. GRINKEVICH, P. HAVLICKOVA, A. MAZUR, A. SHAPOSHNIKOVA, Radka CHALOUPKOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, M. KUTY a I.K. SMATANOVA. Crystallization and Crystallographic Analysis of a Bradyrhizobium Elkanii USDA94 Haloalkane Dehalogenase Variant with an Eliminated Halide-Binding Site. CRYSTALS. BASEL: MDPI, 2019, roč. 9, č. 7, s. 1-12. ISSN 2073-4352. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/cryst9070375.URL
RIV/00216224:14310/19:00108205 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Haloalkane dehalogenase; halide-binding site; random microseeding
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 16. 2. 2023 12:26.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1639538/cs -
CHRÁST, Lukáš, K. TRATSIAK, Joan PLANAS IGLESIAS, Lukáš DANIEL, T. PRUDNIKOVA, Jan BREZOVSKÝ, David BEDNÁŘ, I.K. SMATANOVA, Radka CHALOUPKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Deciphering the Structural Basis of High Thermostability of Dehalogenase from Psychrophilic Bacterium Marinobacter sp. ELB17. Microorganisms. Basel: MDPI, 2019, roč. 7, č. 11, s. 1-20. ISSN 2076-2607. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/microorganisms7110498.URL
RIV/00216224:14310/19:00108215 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Chrást, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Planas Iglesias, Joan (724 Španělsko, domácí) -- Daniel, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase; thermostability; psychrophile; access tunnel; dimer; catalytic pentad; enantiselectivity
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:39.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1640679/cs -
HOLOUBEK, Jakub, Břetislav LIPOVÝ, Martin KNOZ, Lucy VOJTOVÁ, Johana BABRNÁKOVÁ, Veronika PAVLINAKOVA, Lucie VISTEJNOVA, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Eva FILOVA, Zdeněk PAVLOVSKÝ, Martin FALDYNA, Eduard GÖPFERT, Jiří DAMBORSKÝ a Vanessa HEARNDEN. Development of an innovative nanostructured dermal matrix in combination with a hyperstable form of growth factor for fibroblasts (FGF2): Ex ovo and in vivo study. In 10th Congress of World Society for Reconstructive Microsurgery, Bologna, Italy. 2019.
Změnil: MUDr. Jakub Holoubek, Ph.D., učo 356980. Změněno: 5. 7. 2019 18:57.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1544363/cs -
NEVOLOVÁ, Šárka, Elisabet MAŇÁSKOVÁ, Stanislav MAZURENKO, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Development of Fluorescent Assay for Monitoring of Dehalogenase Activity. Biotechnology Journal. WEINHEIM: WILEY-V C H VERLAG GMBH, 2019, roč. 14, č. 3, s. 1-6. ISSN 1860-6768. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/biot.201800144.URL
RIV/00216224:14310/19:00108192 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Nevolová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Maňásková, Elisabet (203 Česká republika, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: activity screening; enzyme assay; fluorescence; haloalkane dehalogenase; sulfur mustard
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:46.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1638600/cs -
KOKKONEN, Piia Pauliina, David BEDNÁŘ, G. PINTO, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Engineering enzyme access tunnels. BIOTECHNOLOGY ADVANCES. OXFORD: PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD, 2019, roč. 37, č. 6, s. 1-13. ISSN 0734-9750. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.biotechadv.2019.04.008.URL
RIV/00216224:14310/19:00113351 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Kokkonen, Piia Pauliina (246 Finsko, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Tunnel; Channel; Ligand binding; Pathway; Pore; Product release; Protein design; Protein engineering; Substrate entry; Dynamics
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:37.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1639257/cs -
JINDAL, Garima, Kateřina SLÁNSKÁ, Veselin KOLEV, Jiří DAMBORSKÝ, Zbyněk PROKOP a Arieh WARSHEL. Exploring the challenges of computational enzyme design by rebuilding the active site of a dehalogenase. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. WASHINGTON: NATL ACAD SCIENCES, 2019, roč. 116, č. 2, s. 389-394. ISSN 0027-8424. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1073/pnas.1804979115.URL
RIV/00216224:14310/19:00108175 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Jindal, Garima (356 Indie) -- Slánská, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Kolev, Veselin (840 Spojené státy) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Warshel, Arieh (840 Spojené státy)
Klíčová slova anglicky: enzyme design; EVB; transient kinetics; dehalogenase; nucleophilic substitution
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 16. 2. 2023 12:12.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1632620/cs -
RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, José Gaspar, Ondřej VÁVRA, Jiří FILIPOVIČ, Jan ŠTOURAČ, David BEDNÁŘ a Jiří DAMBORSKÝ. Fast Screening of Inhibitor Binding/Unbinding using Novel Software Tool CaverDock. FRONTIERS IN CHEMISTRY. LAUSANNE: FRONTIERS MEDIA SA, 2019, roč. 7, OCT 29 2019, s. 1-14. ISSN 2296-2646. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3389/fchem.2019.00709.Full Text
RIV/00216224:14310/19:00111903 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Rangel Pamplona Pizarro Pinto, José Gaspar (620 Portugalsko, domácí) -- Vávra, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Filipovič, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: binding; docking; channel; unbinding; virtual screening; inhibitors; substrates; tunnel
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:25.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1596878/cs -
KOLEDOVÁ, Zuzana, Jakub SUMBAL, Anas RABATA, Gabin DE LA BOURDONNAYE, Radka CHALOUPKOVÁ, Barbara HRDLIČKOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ a Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ. Fibroblast Growth Factor 2 Protein Stability Provides Decreased Dependence on Heparin for Induction of FGFR Signaling and Alters ERK Signaling Dynamics. Frontiers in Cell and Developmental Biology. Lausanne: Frontiers Media S.A., 2019, roč. 7, č. 331, s. 1-15. ISSN 2296-634X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3389/fcell.2019.00331.URL
RIV/00216224:14110/19:00108169 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Koledová, Zuzana (703 Slovensko, garant, domácí) -- Sumbal, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Rabata, Anas (760 Sýrie, domácí) -- de La Bourdonnaye, Gabin (250 Francie, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Hrdličková, Barbara (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Štěpánková, Veronika (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: extracellular-signal-regulated kinase (ERK); fibroblasts; fibroblast growth factor; fibroblast growth factor receptor; heparin; primary fibroblasts; signaling
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 17. 2. 2023 20:51.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1628497/cs -
HORVÁTH, Peter, Peter ŠEBEJ, David KOVÁŘ, Jiří DAMBORSKÝ, Zbyněk PROKOP a Petr KLÁN. Fluorescent pH Indicators for Neutral to Near-Alkaline Conditions Based on 9-Iminopyronin Derivatives. ACS Omega. WASHINGTON: American Chemical Society, 2019, roč. 4, č. 3, s. 5479-5485. ISSN 2470-1343. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acsomega.9b00362.URL
RIV/00216224:14310/19:00107543 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Horváth, Peter (703 Slovensko, domácí) -- Šebej, Peter (703 Slovensko, domácí) -- Kovář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Klán, Petr (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: HALOALKANE DEHALOGENASES; PROBE; FLUOROPHORES; ANALOGS; DYES; QUANTITATION; CELL
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 17. 2. 2023 20:58.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1548608/cs -
Foreign Language Learning Experiences of Deaf and Severely Hard-of-Hearing Czech University StudentsSEDLÁČKOVÁ, Jitka a Edit H. KONTRA. Foreign Language Learning Experiences of Deaf and Severely Hard-of-Hearing Czech University Students. Pedagogická orientace. Česká pedagogická společnost o.s., 2019, roč. 29, č. 3, s. 336-358. ISSN 1211-4669.URL
Název česky: Zkušenosti neslyšících a těžce sluchově postižených českých univerzitních studentů s učením se cizím jazykům
Název anglicky: Foreign Language Learning Experiences of Deaf and Severely Hard-of-Hearing Czech University Students
RIV/00216224:14750/19:00115551 Článek v odborném periodiku. angličtina. Česká republika.
Sedláčková, Jitka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Kontra, Edit H. (348 Maďarsko)
Klíčová slova anglicky: deaf; foreign language learning and teaching; motivation; learner autonomy; teacher education
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Jitka Sedláčková, Ph.D., učo 40134. Změněno: 15. 8. 2020 23:42.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1647356/cs -
SCHENKMAYEROVA, A., G. PINTO, Martin MAREK, Martin TOUL, Lenka HERNYCHOVÁ, Veronika LIŠKOVÁ, S. EMOND, David BEDNÁŘ, Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ, F. HOLLFELDER a U.T. BORNSCHEUER. Functional switching based on altered enzyme flexibility via InDel mutagenesis of a reconstructed ancestor. In European Biotechnology Congress. 2019. ISSN 0168-1656. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jbiotec.2019.05.118.URL
RIV/00216224:14310/19:00113697 Konferenční abstrakt. angličtina. Nizozemské království.
Marek, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Toul, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Hernychová, Lenka (203 Česká republika) -- Lišková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: enzyme
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 20. 4. 2020 19:25.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1647638/cs -
SVATOŇ, Roman, Zdeněk KALA, Vladimír PROCHÁZKA, Michal EID, Tomáš ANDRAŠINA, Karolina POREDSKÁ, Jana STRENKOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ a Lumír KUNOVSKÝ. Gastrointestinální stromální tumory rekta - hodnocení dat národního registru s ohledem na využití v klinické praxi. Klinická onkologie. Praha: Ambit Media, 2019, roč. 32, č. 2, s. 117-123. ISSN 0862-495X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.14735/amko2019117.URL
Název anglicky: Gastrointestinal Stromal Tumours of the Rectum - Evaluating the National Registry Data with Respect to its Use in Clinical Practice
RIV/00216224:14110/19:00110079 Článek v odborném periodiku. čeština. Česká republika.
Svatoň, Roman (703 Slovensko, domácí) -- Kala, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Procházka, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Eid, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Andrašina, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Poredská, Karolina (203 Česká republika, domácí) -- Strenková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Kunovský, Lumír (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: gastrointestinal stromal tumour (GIST); rectum; therapy; resection
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 11. 5. 2020 09:24.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1544217/cs -
CHALOUPKOVÁ, Radka, Veronika LIŠKOVÁ, Martin TOUL, Klára MARKOVÁ, Eva ŠEBESTOVÁ, Lenka HERNYCHOVÁ, Martin MAREK, José Gaspar RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO, Daniel PLUSKAL, Jitka WATERMAN, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Light-Emitting Dehalogenases: Reconstruction of Multifunctional Biocatalysts. ACS Catalysis. Washington, D.C.: AMER CHEMICAL SOC, 2019, roč. 9, č. 6, s. 4810-4823. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acscatal.9b01031.Full Text
RIV/00216224:14310/19:00107511 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Lišková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Toul, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Marková, Klára (203 Česká republika, domácí) -- Šebestová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Hernychová, Lenka (203 Česká republika) -- Marek, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Rangel Pamplona Pizarro Pinto, José Gaspar (620 Portugalsko, domácí) -- Pluskal, Daniel (203 Česká republika, domácí) -- Waterman, Jitka (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: catalytic promiscuity; ancestral reconstruction; haloalkane dehalogenase; monooxygenase; luciferase; emergence of biological function
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:42.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1545949/cs -
HOVÁDKOVÁ, Zuzana, Milos HRABOVSKÝ, Rostislav VÁŇA, Jakub POSPÍŠIL, Josef JAROŠ, Jiří DAMBORSKÝ, Kamil PARUCH a Aleš HAMPL. Nanopatterning Glass Surface For Localization Of Embryonic Stem Cells. In Microscopy Conference, 1-5.9.2019, Berlin, Germany. 2019.
angličtina. Německo.
Klíčová slova anglicky: nanopattern, surface modification, EBL, electron microscopy
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: Ing. Josef Jaroš, Ph.D., učo 100474. Změněno: 31. 1. 2020 11:07.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1615296/cs -
LIPOVÝ, Břetislav, Lucy VOJTOVÁ, Jakub HOLOUBEK, Martin KNOZ, Jan ZÍDEK, Johana BABRŇAKOVA, Veronika PAVLIŇÁKOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Zdeněk PAVLOVSKÝ, Martin FALDYNA, Eduard GÖPFERT, Jiří DAMBORSKÝ a Vanessa HEARNDEN. New collagen foam with nanotechnological modification as bi-layer dermal substitute: Influence of stable FGF2 on capillary density in different animal models. In The 8th International Conference on Biomedical Engineering and Biotechnology (ICBEB). 2019.
čeština. Česká republika.
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. MUDr. Břetislav Lipový, Ph.D., MBA, LL.M., učo 60248. Změněno: 24. 10. 2019 19:32.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1572996/cs -
ZESSIN, M., Z. KUTIL, M. MELESHIN, Z. NOVAKOVA, E. GHAZY, D. KALBAS, Martin MAREK, C. ROMIER, W. SIPPL, C. BARINKA a M. SCHUTKOWSKI. One-Atom Substitution Enables Direct and Continuous Monitoring of Histone Deacylase Activity. Biochemistry. Washington: American Chemical Society, 2019, roč. 58, č. 48, s. 4777-4789. ISSN 0006-2960. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.biochem.9b00786.URL
RIV/00216224:14310/19:00113392 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Marek, Martin (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: FLUORESCENCE QUENCHING PROBES; EPSILON-THIOACETYL-LYSINE; DEACETYLASE ASSAY; SIR2 FAMILY; POSTTRANSLATIONAL MODIFICATIONS; PEPTIDE ARRAYS; DECROTONYLASE ACTIVITY; SUBSTRATE-SPECIFICITY; THIOAMIDE SUBSTRATE; CATALYTIC-ACTIVITY
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: RNDr. Kateřina Nováková, Ph.D., učo 64015. Změněno: 30. 3. 2020 21:01.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1640657/cs -
VONÁSEK, Vojtěch, Adam JURČÍK, Katarína FURMANOVÁ a Barbora KOZLÍKOVÁ. Sampling-based Motion Planning for Tracking Evolution of Dynamic Tunnels in Molecular Dynamics Simulations. Journal of Intelligent & Robotic Systems. 2019, roč. 93, 3-4, s. 763-785. ISSN 0921-0296. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10846-018-0877-6.URL
Název anglicky: Sampling-based Motion Planning for Tracking Evolution of Dynamic Tunnels in Molecular Dynamics Simulations
RIV/00216224:14330/19:00107165 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Vonásek, Vojtěch (203 Česká republika, garant) -- Jurčík, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Furmanová, Katarína (703 Slovensko, domácí) -- Kozlíková, Barbora (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Sampling-based motion planning;Rapidly exploring random tree;Protein tunnel detection
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 29. 4. 2019 17:20.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1418319/cs -
LIPOVÝ, Břetislav, Lucy VOJTOVA, Veronika STEPANKOVA, Jakub HOLOUBEK, Martin KNOZ, Radka CHALOUPKOVÁ, Zdenek PAVLOVSKY, Martin FALDYNA, Eduard GOPFERT a Vanessa HEARNDEN. Stable fibroblast growth factors in burn medicine research. In Workshop of the European Club for Pediatric Burns. 2019.
čeština. Česká republika.
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. MUDr. Břetislav Lipový, Ph.D., MBA, LL.M., učo 60248. Změněno: 24. 5. 2019 20:18.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1533796/cs -
MIČAN, Jan, Martin TOUL, David BEDNÁŘ a Jiří DAMBORSKÝ. Structural Biology and Protein Engineering of Thrombolytics. Computational and Structural Biology Journal. Amsterdam: Elsevier, 2019, roč. 17, č. 2019, s. 917-938. ISSN 2001-0370. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.csbj.2019.06.023.Full Text
Název česky: Strukturní biologie a proteinové inženýrství trombolytik
RIV/00216224:14310/19:00108351 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Mičan, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Toul, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, garant, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Fibrinolysis; Staphylokinase; Streptokinase; Thrombolysis; Tissue plasminogen activator; Urokinase
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:19.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1545297/cs -
KOKKONEN, Piia Pauliina, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Lukáš DANIEL, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Structure-Function Relationships and Engineering of Haloalkane Dehalogenases. In Aerobic Utilization of Hydrocarbons, Oils, and Lipids. Cham: Springer, 2019, s. 367-387. 1. ISBN 978-3-319-50417-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-50418-6_15.URL
RIV/00216224:14310/19:00119131 Kapitola resp. kapitoly v odborné knize. angličtina. Švýcarsko.
Kokkonen, Piia Pauliina (246 Finsko, garant, domácí) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Daniel, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase; protein engineering
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 16. 8. 2021 13:12.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1786517/cs -
PILAT, Zdenek, Jan JEZEK, Martin KIZOVSKY, Tereza KLEMENTOVA, Stanislav KRATKY, Jaroslav SOBOTA, Ota SAMEK, Pavel ZEMANEK, Tomáš BURYŠKA, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Surface-enhanced Raman Spectroscopy in Microfluidic Chips for Directed Evolution of Enzymes and Environmental Monitoring. In 2019 PHOTONICS & ELECTROMAGNETICS RESEARCH SYMPOSIUM - SPRING (PIERS-SPRING). New York: IEEE, 2019, s. 1301-1309. ISBN 978-1-7281-3403-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/PIERS-Spring46901.2019.9017521.URL
RIV/00216224:14310/19:00114704 Stať ve sborníku. angličtina. Spojené státy.
Buryška, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Raman Spectroscopy; 4-Aminothiophenol; Plasmonics
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 29. 4. 2021 13:07.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1731040/cs -
KNOZ, Martin, Břetislav LIPOVÝ, Jakub HOLOUBEK, Zdeněk PAVLOVSKÝ, Johana BABRNÁKOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Martin FALDYNA, Jiří DAMBORSKÝ a Lucy VOJTOVÁ. Testování bilaminární kožní náhrady obohacené stabilním FGF2 na ex ovo a in vivo modelech. In Mezioborové přístupy v hojení ran, Lednice na Moravě. 2019.
Název česky: Testování bilaminární kožní náhrady obohacené stabilním FGF2 na ex ovo a in vivo modelech
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: MUDr. Martin Knoz, Ph.D., učo 177146. Změněno: 4. 12. 2019 19:30.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1587936/cs -
BEIER, Andy, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Transhalogenation Catalysed by Haloalkane Dehalogenases Engineered to Stop Natural Pathway at Intermediate. ADVANCED SYNTHESIS & CATALYSIS. WEINHEIM: WILEY-V C H VERLAG GMBH, 2019, roč. 361, č. 11, s. 2438-2442. ISSN 1615-4150. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/adsc.201900132.URL
RIV/00216224:14310/19:00113347 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Beier, Andy (276 Německo, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: enzyme catalysis; halide exchange; haloalkane dehalogenase; nucleophilic substitution; redirection of reaction; transhalogenation
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:41.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1638979/cs -
JURČÍK, Adam, Katarína FURMANOVÁ, Jan BYŠKA, Vojtěch VONÁSEK, Ondřej VÁVRA, Pavol ULBRICH, Helwig HAUSER a Barbora KOZLÍKOVÁ. Visual Analysis of Ligand Trajectories in Molecular Dynamics. Online. In IEEE Pacific Visualization Symposium 2019. Bangkok, Thailand: IEEE, 2019, s. 212-221. ISBN 978-1-5386-9226-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/PacificVis.2019.00032.
RIV/00216224:14330/19:00107231 Stať ve sborníku. angličtina. Thajsko.
Jurčík, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Furmanová, Katarína (703 Slovensko, domácí) -- Byška, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Vonásek, Vojtěch (203 Česká republika) -- Vávra, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Ulbrich, Pavol (703 Slovensko, domácí) -- Kozlíková, Barbora (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: trajectory;ligand;protein;molecular dynamics;visualization;visual analysis
Druh sborníku: postkonferenční sborník
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 27. 4. 2020 22:32.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1486438/cs -
BURYŠKA, Tomáš, Petra BABKOVÁ, Ondřej VÁVRA, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. A Haloalkane Dehalogenase From a Marine Microbial Consortium Possessing Exceptionally Broad Substrate Specificity. APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY. American Society for Microbiology, 2018, roč. 84, č. 2, s. 1-13. ISSN 0099-2240.
RIV/00216224:14310/18:00100776 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Buryška, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Babková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Vávra, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: biotechnology; cosolvents; enzyme; haloalkane dehalogenase; marine; microbial; stability; substrate specificity
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 26. 2. 2018 07:51.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1402018/cs -
SIMOBEN, Conrad V., Dina ROBAA, Alokta CHAKRABARTI, Karin SCHMIDTKUNZ, Martin MAREK, Julien LANCELOT, Srinivasaraghavan KANNAN, Jelena MELESINA, Tajith B. SHAIK, Raymond J. PIERCE, Christophe ROMIER, Manfred JUNG a Wolfgang SIPPL. A Novel Class of Schistosoma mansoni Histone Deacetylase 8 (HDAC8) Inhibitors Identified by Structure-Based Virtual Screening and In Vitro Testing. Molecules. BASEL: Mayer und Muller, 2018, roč. 23, č. 3, s. 1-14. ISSN 1420-3049. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/molecules23030566.URL
RIV/00216224:14310/18:00106139 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Simoben, Conrad V. (276 Německo) -- Robaa, Dina (276 Německo) -- Chakrabarti, Alokta (276 Německo) -- Schmidtkunz, Karin (276 Německo) -- Marek, Martin (203 Česká republika, garant, domácí) -- Lancelot, Julien (250 Francie) -- Kannan, Srinivasaraghavan (702 Singapur) -- Melesina, Jelena (276 Německo) -- Shaik, Tajith B. (250 Francie) -- Pierce, Raymond J. (250 Francie) -- Romier, Christophe (250 Francie) -- Jung, Manfred (276 Německo) -- Sippl, Wolfgang (276 Německo)
Klíčová slova anglicky: epigenetics; crystal structure; docking; histone deacetylase (HDAC) inhibitors; schistosomiasis; virtual screening
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 9. 2. 2019 20:14.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1495516/cs -
TÓTHOVÁ, Lenka a Jitka SEDLÁČKOVÁ. Academic mobilities of students with hearing impairment: Welcoming the challenges with specialized online course of written English. In 14th ESSE Conference. 2018.URL
Název anglicky: Academic mobilities of students with hearing impairment: Welcoming the challenges with specialized online course of written English
RIV/00216224:14750/18:00104462 Prezentace na konferencích. angličtina. Česká republika.
Tóthová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Sedláčková, Jitka (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: literacy skills; mobilities; higher education students with special needs; teacher feedback
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnila: Mgr. Jitka Sedláčková, Ph.D., učo 40134. Změněno: 10. 1. 2019 12:09.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1467798/cs -
MAZURENKO, Stanislav, Jan ŠTOURAČ, Antonín KUNKA, S. NEDELJKOVIC, David BEDNÁŘ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. CalFitter: a web server for analysis of protein thermal denaturation data. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2018, roč. 46, W1, s. "W344"-"W349", 6 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gky358.URL
RIV/00216224:14310/18:00101753 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Kunka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Nedeljkovic, S. (643 Rusko) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: DIFFERENTIAL SCANNING CALORIMETRY; THEORETICAL-ANALYSIS; STABILITY; STATE; TEMPERATURE; 3-STATE; ENZYME; RATES
Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 23. 4. 2024 14:21.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1503349/cs -
JURČÍK, Adam, David BEDNÁŘ, Jan BYŠKA, Sérgio Manuel MARQUES, Katarína FURMANOVÁ, Lukáš DANIEL, Piia Pauliina KOKKONEN, Jan BREZOVSKÝ, Ondřej STRNAD, Jan ŠTOURAČ, Antonín PAVELKA, Martin MANAK, Jiří DAMBORSKÝ a Barbora KOZLÍKOVÁ. CAVER Analyst 2.0: Analysis and Visualization of Channels and Tunnels in Protein Structures and Molecular Dynamics Trajectories. Bioinformatics. 2018, roč. 34, č. 20, s. 3586-3588. ISSN 1367-4803. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/bty386.URL
Název anglicky: CAVER Analyst 2.0: Analysis and Visualization of Channels and Tunnels in Protein Structures and Molecular Dynamics Trajectories
RIV/00216224:14330/18:00100952 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Jurčík, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Byška, Jan (203 Česká republika) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Furmanová, Katarína (703 Slovensko, domácí) -- Daniel, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Kokkonen, Piia Pauliina (246 Finsko, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Strnad, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Pavelka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Manak, Martin (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Kozlíková, Barbora (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: protein;tunnel;software;visualization
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 31. 5. 2022 17:34.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1418320/cs -
MIČAN, Jan, David BEDNÁŘ a Jiří DAMBORSKÝ. Computational Enzyme Design of Haloalkane Dehalogenases for Yperite Degradation. In XV Discussions in Structural Molecular Biology. 2018. ISSN 1805-4382.
Název česky: Výpočetní design haloalkan dehalogenas pro detoxikaci yperitu
Název anglicky: Computational Enzyme Design of Haloalkane Dehalogenases for Yperite Degradation
Druh účasti: aktivní účast
Recenzováno: ano
Změnil: MUDr. Jan Mičan, učo 459597. Změněno: 24. 3. 2018 15:08.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1412216/cs -
DVOŘÁK, Pavel, David BEDNÁŘ, Pavel VAŇÁČEK, Lukáš BÁLEK, Lívia EISELLEOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Eva ŠEBESTOVÁ, Michaela BOSÁKOVÁ, Žaneta KONEČNÁ, Stanislav MAZURENKO, Antonín KUNKA, Tereza VÁŇOVÁ, Karolína ZOUFALOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Jan BREZOVSKÝ, Pavel KREJČÍ, Zbyněk PROKOP, Petr DVOŘÁK a Jiří DAMBORSKÝ. Computer-assisted engineering of hyperstable fibroblast growth factor 2. Biotechnology and Bioengineering. New York: Wiley, 2018, roč. 115, č. 4, s. 850-862. ISSN 0006-3592. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/bit.26531.One Library Wiley
RIV/00216224:14310/18:00100936 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáček, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Bálek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Eiselleová, Lívia (703 Slovensko, domácí) -- Štěpánková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Šebestová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Bosáková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Konečná, Žaneta (203 Česká republika, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Kunka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Váňová, Tereza (203 Česká republika, domácí) -- Zoufalová, Karolína (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Dvořák, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: computational design; embryonic stem cells; fibroblast growth factor; focused directed evolution; protein engineering; protein stability
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 30. 4. 2019 08:58.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1417222/cs -
KOKKONEN, Piia Pauliina, David BEDNÁŘ, Veronika DOČKALOVÁ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Conformational changes allow processing of bulky substrates by a haloalkane dehalogenase with a small and buried active site. Journal of Biological Chemistry. Bethesda, USA: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2018, roč. 293, č. 29, s. 11505-11512. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.RA117.000328.URL
RIV/00216224:14310/18:00106486 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Kokkonen, Piia Pauliina (246 Finsko, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Dočkalová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: enzyme kinetics; enzyme mechanism; protein conformation; molecular dynamics; molecular evolution; active site; conformational change; enzyme catalysis; haloalkane dehalogenase; dichloroethane degradation; ethylene dichloride;
Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 23. 4. 2024 14:21.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1503344/cs -
PILAT, Z., M. KIZOVSKY, J. JEZEK, S. KRATKY, J. SOBOTA, Martin ŠILER, O. SAMEK, Tomáš BURYŠKA, Pavel VAŇÁČEK, Jiří DAMBORSKÝ, Zbyněk PROKOP a P. ZEMANEK. Detection of Chloroalkanes by Surface-Enhanced Raman Spectroscopy in Microfluidic Chips. Sensors. Basel: MDPI AG, 2018, roč. 18, č. 10, s. 1-18. ISSN 1424-8220. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/s18103212.URL
RIV/00216224:14310/18:00101751 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Pilat, Z. (203 Česká republika) -- Kizovsky, M. (203 Česká republika) -- Jezek, J. (203 Česká republika) -- Kratky, S. (203 Česká republika) -- Sobota, J. (203 Česká republika) -- Šiler, Martin (203 Česká republika) -- Samek, O. (203 Česká republika) -- Buryška, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáček, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Zemanek, P. (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: surface enhanced Raman spectroscopy; microfluidics; Klarite 312; chloroalkane; 1; 2; 3-trichloropropane
Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 23. 4. 2024 14:19.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1503339/cs -
PROKOP, Zbyněk, A. GHOSE, Piia Pauliina KOKKONEN, J. SYKORA, David BEDNÁŘ, M. AMARO, Šárka NEVOLOVÁ, M. HOF a Jiří DAMBORSKÝ. Engineering of enzyme gating driven by molecular dynamics, transient kinetics, and single molecule spectroscopy. In The 43rd FEBS Congress. 2018. ISSN 2211-5463.URL
angličtina. Spojené státy.
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 27. 7. 2020 15:48.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1672018/cs -
BEERENS, Koen, Stanislav MAZURENKO, Antonín KUNKA, Sérgio Manuel MARQUES, N. HANSEN, Miloš MUSIL, Radka CHALOUPKOVÁ, Jitka WATERMAN, Jan BREZOVSKÝ, David BEDNÁŘ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Evolutionary Analysis As a Powerful Complement to Energy Calculations for Protein Stabilization. ACS Catalysis. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2018, roč. 8, č. 10, s. 9420-9428. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acscatal.8b01677.URL
RIV/00216224:14310/18:00101752 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Beerens, Koen (56 Belgie, domácí) -- Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Kunka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Hansen, N. (276 Německo) -- Musil, Miloš (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Waterman, Jitka (203 Česká republika) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: protein stabilization; thermostability; evolutionary analysis; force-field calculations; computational tools; entropy; enthalpy; thermodynamic integration
Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 23. 4. 2024 14:20.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1503342/cs -
VAŇÁČEK, Pavel, Eva ŠEBESTOVÁ, Petra BABKOVÁ, Šárka NEVOLOVÁ, Lukáš DANIEL, Pavel DVOŘÁK, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Jan BREZOVSKÝ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Exploration of Enzyme Diversity by Integrating Bioinformatics with Expression Analysis and Biochemical Characterization. ACS Catalysis. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2018, roč. 8, č. 3, s. 2402-2412, 21 s. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acscatal.7b03523.URL
RIV/00216224:14310/18:00101756 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Vaňáček, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Šebestová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Babková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Nevolová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Daniel, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Štěpánková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: diversity; sequence space; bioinformatics; biocatalyst; biochemical characterization; activity; substrate specificity; haloalkane dehalogenases
Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 23. 4. 2024 14:23.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1503358/cs -
KUNKA, Antonín, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Haloalkane Dehalogenases From Marine Organisms. MARINE ENZYMES AND SPECIALIZED METABOLISM, PT B. SAN DIEGO: ELSEVIER ACADEMIC PRESS INC, 2018, roč. 605, č. 1, s. 203-251. ISSN 0076-6879. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/bs.mie.2018.03.005.URL
RIV/00216224:14310/18:00101755 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Kunka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: BIOCHEMICAL-CHARACTERIZATION; GAMMA-HEXACHLOROCYCLOHEXANE; BRADYRHIZOBIUM-JAPONICUM; DEGRADING BACTERIUM; EXPERIMENTAL-DESIGN; COLORIMETRIC ASSAY; PROTEIN STABILITY; ACCESS TUNNELS; STEADY-STATE; GEN. NOV.
Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 23. 4. 2024 14:23.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1503356/cs -
SUMBALOVÁ, Lenka, Jan ŠTOURAČ, Tomáš MARTÍNEK, David BEDNÁŘ a Jiří DAMBORSKÝ. HotSpot Wizard 3.0: web server for automated design of mutations and smart libraries based on sequence input information. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2018, roč. 46, W1, s. "W356"-"W362", 7 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gky417.URL
RIV/00216224:14310/18:00101754 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Sumbalová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Martínek, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: PROTEIN-STRUCTURE PREDICTION; DIRECTED EVOLUTION; HALOALKANE DEHALOGENASE
Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 23. 4. 2024 14:21.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1503351/cs -
MAREK, Martin, Tajith B. SHAIK, Tino HEIMBURG, Alokta CHAKRABARTI, Julien LANCELOT, Elizabeth RAMOS-MORALES, Cyrielle DA VEIGA, Dmitrii KALININ, Jelena MELESINA, Dina ROBAA, Karin SCHMIDTKUNZ, Takayoshi SUZUKI, Ralph HOLL, Eric ENNIFAR, Raymond J. PIERCE, Manfred JUNG, Wolfgang SIPPL a Christophe ROMIER. Characterization of Histone Deacetylase 8 (HDAC8) Selective Inhibition Reveals Specific Active Site Structural and Functional Determinants. Journal of Medicinal Chemistry. Washington: American Chemical Society, 2018, roč. 61, č. 22, s. 10000-10016. ISSN 0022-2623. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jmedchem.8b01087.URL
RIV/00216224:14310/18:00106140 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Marek, Martin (203 Česká republika, garant, domácí) -- Shaik, Tajith B. (250 Francie) -- Heimburg, Tino (276 Německo) -- Chakrabarti, Alokta (276 Německo) -- Lancelot, Julien (250 Francie) -- Ramos-Morales, Elizabeth (250 Francie) -- Da Veiga, Cyrielle (250 Francie) -- Kalinin, Dmitrii (276 Německo) -- Melesina, Jelena (276 Německo) -- Robaa, Dina (276 Německo) -- Schmidtkunz, Karin (276 Německo) -- Suzuki, Takayoshi (392 Japonsko) -- Holl, Ralph (276 Německo) -- Ennifar, Eric (250 Francie) -- Pierce, Raymond J. (250 Francie) -- Jung, Manfred (276 Německo) -- Sippl, Wolfgang (276 Německo) -- Romier, Christophe (250 Francie)
Klíčová slova anglicky: EFFICIENT GENERATION; SCHISTOSOMA-MANSONI; CANCER EPIGENETICS; CRYSTAL-STRUCTURE; MOLECULAR-BASIS; AM1-BCC MODEL; ACETYLATION; MECHANISM; TRANSCRIPTION; CORNELIA
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 9. 2. 2019 20:50.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1495536/cs -
KAUSHIK, Shubhangi, Sérgio Manuel MARQUES, Prashant Kumar KHIRSARIYA, Kamil PARUCH, Lenka LIBICHOVÁ, Jan BREZOVSKÝ, Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Impact of the access tunnel engineering on catalysis is strictly ligand-specific. the FEBS Journal. 2018, roč. 285/2018, č. 8, s. 1456-1476. ISSN 1742-464X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/febs.14418.URL
Název anglicky: Impact of the access tunnel engineering on catalysis is strictly ligand-specific
RIV/00216224:14310/18:00100915 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Kaushik, Shubhangi (356 Indie, domácí) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Khirsariya, Prashant Kumar (356 Indie, domácí) -- Paruch, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Libichová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: de novo protein design; enzyme catalysis;enzyme tunnels engineering; haloalkanedehalogenases; protein engineering
Mezinárodní význam: ano
Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 30. 4. 2019 08:55.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1415292/cs -
LECOINTRE, Bertrand, Remy NAROZNY, Maria Teresa BORRELLO, Johanna SENGER, Alokta CHAKRABARTI, Manfred JUNG, Martin MAREK, Christophe ROMIER, Jelena MELESINA, Wolfgang SIPPL, Laurent BISCHOFF a A. GANESAN. Isoform-selective HDAC1/16/8 inhibitors with an imidazo-ketopiperazine cap containing stereochemical diversity. PHILOSOPHICAL TRANSACTIONS OF THE ROYAL SOCIETY B-BIOLOGICAL SCIENCES. LONDON: ROYAL SOC, 2018, roč. 373, č. 1748, s. 1-7. ISSN 0962-8436. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1098/rstb.2017.0364.URL
RIV/00216224:14310/18:00106141 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Lecointre, Bertrand (250 Francie) -- Narozny, Remy (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Borrello, Maria Teresa (250 Francie) -- Senger, Johanna (276 Německo) -- Chakrabarti, Alokta (276 Německo) -- Jung, Manfred (276 Německo) -- Marek, Martin (203 Česká republika, garant, domácí) -- Romier, Christophe (250 Francie) -- Melesina, Jelena (276 Německo) -- Sippl, Wolfgang (276 Německo) -- Bischoff, Laurent (250 Francie) -- Ganesan, A. (826 Velká Británie a Severní Irsko)
Klíčová slova anglicky: zinc metalloenzymes; epigenetics; histone deacetylases; enzyme inhibitors; peptidomimetics
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 9. 2. 2019 21:03.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1495537/cs -
KOKKONEN, Piia Pauliina, J. SYKORA, Zbyněk PROKOP, A. GHOSE, David BEDNÁŘ, M. AMARO, Koen BEERENS, Šárka NEVOLOVÁ, Michaela SLÁNSKÁ, Jan BREZOVSKÝ, Jiří DAMBORSKÝ a M. HOF. Molecular Gating of an Engineered Enzyme Captured in Real Time. Journal of the American Chemical Society. Washington: American Chemical Society, 2018, roč. 140, č. 51, s. 17999-18008. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jacs.8b09848.URL
RIV/00216224:14310/18:00101750 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Kokkonen, Piia Pauliina (246 Finsko, domácí) -- Sykora, J. (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Ghose, A. (356 Indie) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Amaro, M. (620 Portugalsko) -- Beerens, Koen (56 Belgie, domácí) -- Nevolová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Slánská, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Hof, M. (276 Německo)
Klíčová slova anglicky: PHOTOINDUCED ELECTRON-TRANSFER; CONFORMATIONAL DYNAMICS; CATALYTIC MECHANISM; PROTEIN DYNAMICS; NUCLEIC-ACIDS; ACTIVE-SITE; FORCE-FIELD; EVOLUTION; MOTIONS; SIMULATION
Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 23. 4. 2024 14:18.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1503337/cs -
PILAT, Z., J. JEZEK, O. SAMEK, P. ZEMANEK, Tomáš BURYŠKA, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. OPTOFLUIDIC TECHNIQUES FOR DIRECTED EVOLUTION OF ENZYMES. In 16th International Seminar of the Institute-of-Scientific-Instruments-The-Czech-Academy-of-Sciences. 2018. ISBN 978-80-87441-23-7.URL
RIV/00216224:14310/18:00108256 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Pilat, Z. (garant) -- Buryška, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Optics; enzymes
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 30. 4. 2020 00:58.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1644818/cs -
MAZURENKO, Stanislav, Šárka NEVOLOVÁ, Markéta KOTLÁNOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Sensitive operation of enzyme-based biodevices by advanced signal processing. Plos one. San Francisco: Public Library of Science, 2018, roč. 13, č. 6, s. 1-16. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0198913.URL
RIV/00216224:14310/18:00106487 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Nevolová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Kotlánová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: SPHINGOMONAS-PAUCIMOBILIS UT26; HALOALKANE DEHALOGENASE; BIOSENSORS; CALIBRATION; SENSORS; EQUATION; TRENDS; TOXINS
Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 23. 4. 2024 14:22.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1503354/cs -
PILAT, Z., M. KIZOVSKY, J. JEZEK, S. KRATKY, J. SOBOTA, M. SILER, O. SAMEK, Tomáš BURYŠKA, Pavel VAŇÁČEK, Jiří DAMBORSKÝ, Zbyněk PROKOP a Pavel ZEMANEK. Surface-enhanced Raman spectroscopy of chloroalkanes in microfluidic chips. Online. In Zemanek, P. 21ST CZECH-POLISH-SLOVAK OPTICAL CONFERENCE ON WAVE AND QUANTUM ASPECTS OF CONTEMPORARY OPTICS. BELLINGHAM: SPIE-INT SOC OPTICAL ENGINEERING, 2018, s. 1-7. ISBN 978-1-5106-2608-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1117/12.2518393.URL
RIV/00216224:14310/18:00108257 Stať ve sborníku. angličtina. Spojené státy.
Pilat, Z. (garant) -- Buryška, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáček, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Surface enhanced Raman spectroscopy; microfluidics; Klarite 312; chloroalkane; 1.2.3-trichloropropane
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 29. 4. 2020 12:14.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1644839/cs -
CHAMONIKOLASOVÁ, Jana, Ivona SCHÖFROVÁ, Jiří RAMBOUSEK, Kateřina BLAŽKOVÁ, Michael Matthew KAYLOR, Filip KRAJNÍK, Jiří LUKL, Jana PELCLOVÁ, Jitka SEDLÁČKOVÁ a Thomas Donaldson SPARLING. 14th ESSE Conference. 2018.Mezinárodní konference Evropské asociace anglistů uspořádaná Katedrou anglistiky a amerikanistiky FF MU a Českou asociací anglistů
Název česky: 14. konference ESSE
RIV/00216224:14210/18:00105892 Uspořádání konference. angličtina. Česká republika.
Chamonikolasová, Jana (203 Česká republika, garant, domácí) -- Schöfrová, Ivona (203 Česká republika, domácí) -- Rambousek, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Blažková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Kaylor, Michael Matthew (840 Spojené státy, domácí) -- Krajník, Filip (203 Česká republika, domácí) -- Lukl, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Pelclová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Sedláčková, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Sparling, Thomas Donaldson (124 Kanada, domácí)
Klíčová slova anglicky: English Studies; European Society for the Study of English; ESSE; Czech Association for the Study of English; CZASE
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Jana Pelclová, Ph.D., učo 39970. Změněno: 2. 7. 2019 14:05.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1490559/cs -
BABKOVÁ, Petra, Eva ŠEBESTOVÁ, Jan BREZOVSKÝ, Radka CHALOUPKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Ancestral Haloalkane Dehalogenases Show Robustness and Unique Substrate Specificity. CHEMBIOCHEM. 2017, roč. 18, č. 14, s. 1448-1456. ISSN 1439-4227. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cbic.201700197.URL
RIV/00216224:14310/17:00095408 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Babková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Šebestová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: ancestral sequence reconstruction; haloalkane dehalogenase; protein engineering; robustness; substrate specificity
Změnila: Ing. Nicole Zrilić, učo 240776. Změněno: 28. 3. 2018 15:36.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1403840/cs -
MOSKALÍKOVÁ, Hana, Markéta KOTLÁNOVÁ, Zbyněk PROKOP a Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ. Biosensorická špička s DgpA pro detekci v nízké teplotě 10 oC. 2017.URL
Název anglicky: The biosensor tip with DgpA for detection at low temperature, 10°C
RIV/00216224:14310/17:00094388 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Moskalíková, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Kotlánová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Štěpánková, Veronika (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: biosensor tip
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 14. 12. 2017 08:03.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1399138/cs -
MOSKALÍKOVÁ, Hana, Markéta KOTLÁNOVÁ, Zbyněk PROKOP a Jaroslav ŘEZÁČ. Biosensorická špička s DhmeA pro detekci v alkalických podmínkách pH 10. 2017.URL
Název anglicky: The biosensor tip for detection of halogenated pollutants (eg 1,2-dibromoethane) in the alkaline conditions, pH 10.
RIV/00216224:14310/17:00094389 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Moskalíková, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Kotlánová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Řezáč, Jaroslav (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: The biosensor tip
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 14. 12. 2017 08:10.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1399140/cs -
MOSKALÍKOVÁ, Hana, Markéta KOTLÁNOVÁ, Zbyněk PROKOP a Jaroslav ŘEZÁČ. Biosensorická špička s LinA a LinB pro detekci beta-HCH. 2017.URL
Název anglicky: The biosensor tip with LinA and LinB for detection beta-HCH
RIV/00216224:14310/17:00094390 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Moskalíková, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Kotlánová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Řezáč, Jaroslav (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: The biosensor tip
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 14. 12. 2017 08:09.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1399143/cs -
CalFitter 1.0 (software)MAZURENKO, Stanislav, Antonín KUNKA, Koen BEERENS, Christopher JOHNSON, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. CalFitter 1.0. 2017.URL
RIV/00216224:14310/17:00100391 Software. angličtina. Česká republika.
Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Kunka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Beerens, Koen (56 Belgie, domácí) -- Johnson, Christopher (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Protein stability; CalFitter; Calorimetry; DSC; protein unfolding; re-heating
Změnila: Mgr. Martina Damborská, učo 8324. Změněno: 16. 3. 2018 07:59.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1411358/cs -
MARQUES, Sérgio Manuel, Zuzana DUNAJOVÁ, Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ, Jan BREZOVSKÝ a Jiří DAMBORSKÝ. Catalytic Cycle of Haloalkane Dehalogenases Toward Unnatural Substrates Explored by Computational Modeling. JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING. DC USA: AMER CHEMICAL SOC, 2017, roč. 57, č. 8, s. 1970-1989. ISSN 1549-9596. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jcim.7b00070.URL
RIV/00216224:14310/17:00095517 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Dunajová, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS; FORCE-FIELD; DIRECTED EVOLUTION; SYNTHETIC PATHWAY; PRODUCT RELEASE; MECHANISM; KINETICS; LINB; BIODEGRADATION; PARAMETERS
Změnila: Ing. Nicole Zrilić, učo 240776. Změněno: 29. 3. 2018 23:17.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1409089/cs -
CaverDock 1.0 (software)FILIPOVIČ, Jiří, Ondřej VÁVRA, Jan PLHÁK, David BEDNÁŘ, Sérgio Manuel MARQUES, Jan BREZOVSKÝ, Luděk MATYSKA a Jiří DAMBORSKÝ. CaverDock 1.0. 2017.URL
Název česky: CaverDock 1.0
Název anglicky: CaverDock 1.0
RIV/00216224:14610/17:00098438 Software. Informatika. angličtina. Česká republika.
Filipovič, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Vávra, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Plhák, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Matyska, Luděk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: CaverDock;transport processes in proteins
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 1. 3. 2019 11:24.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1396336/cs -
LIŠKOVÁ, Veronika, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, David BEDNÁŘ, Jan BREZOVSKÝ, Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Different Structural Origins of the Enantioselectivity of Haloalkane Dehalogenases toward Linear beta-Haloalkanes: Open–Solvated versus Occluded–Desolvated Active Sites. Angewandte Chemie International Edition. WEINHEIM, GERMANY: WILEY-V C H VERLAG, 2017, roč. 56, č. 17, s. 4719-4723. ISSN 1433-7851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/anie.201611193.URL
RIV/00216224:14310/17:00095409 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Lišková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Štěpánková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: enantioselectivity; enzyme catalysis; enzymes; molecular modeling; protein engineering
Změnila: Ing. Nicole Zrilić, učo 240776. Změněno: 1. 4. 2018 09:39.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1403848/cs -
MARQUES, Sérgio Manuel, Lukáš DANIEL, Tomáš BURYŠKA, Zbyněk PROKOP, Jan BREZOVSKÝ a Jiří DAMBORSKÝ. Enzyme Tunnels and Gates As Relevant Targets in Drug Design. MEDICINAL RESEARCH REVIEWS. Hoboken, USA: WILEY, 2017, roč. 37, č. 5, s. 1095-1139. ISSN 0198-6325. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/med.21430.URL
RIV/00216224:14310/17:00095541 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Daniel, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Buryška, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: drug design; protein tunnels; protein gates; drug binding; selectivity; specificity
Změnila: Ing. Nicole Zrilić, učo 240776. Změněno: 3. 4. 2018 14:38.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1410057/cs -
MAZURENKO, Stanislav, Antonín KUNKA, Koen BEERENS, Christopher M. JOHNSON, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Exploration of Protein Unfolding by Modelling Calorimetry Data from Reheating. Scientific Reports. London: NATURE PUBLISHING GROUP, 2017, roč. 7, November, s. nestránkováno, 14 s. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-017-16360-y.URL
RIV/00216224:14310/17:00095387 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Kunka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Beerens, Koen (56 Belgie, domácí) -- Johnson, Christopher M. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: DIFFERENTIAL SCANNING CALORIMETRY; THERMAL-DENATURATION; THEORETICAL-ANALYSIS; AGGREGATION; STABILITY; LYSOZYME; STABILIZATION; SPECTROSCOPY; TRANSITIONS; PROFILES
Změnila: Ing. Nicole Zrilić, učo 240776. Změněno: 3. 4. 2018 15:36.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1403068/cs -
MUSIL, Miloš, Jan ŠTOURAČ, Jaroslav BENDL, Jan BREZOVSKÝ, Zbyněk PROKOP, Jaroslav ZENDULKA, Tomáš MARTÍNEK, David BEDNÁŘ a Jiří DAMBORSKÝ. FireProt: Web Server for Automated Design of Thermostable Proteins. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2017, roč. 45, W1, s. "W393"-"W399", 7 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkx285.URL
RIV/00216224:14310/17:00095410 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Musil, Miloš (203 Česká republika, domácí) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Bendl, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Zendulka, Jaroslav (203 Česká republika) -- Martínek, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: MULTIPLE SEQUENCE ALIGNMENTS; CORRELATED MUTATIONS; STABILITY CHANGES; EVOLUTIONARY CONSERVATION; HALOALKANE DEHALOGENASE; STATISTICAL POTENTIALS; PATHWAYS; BIOCATALYSTS; PREDICTION; FAMILIES
Změnila: Ing. Nicole Zrilić, učo 240776. Změněno: 3. 4. 2018 16:05.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1403851/cs -
FireProt 1.0 (software)MUSIL, Miloš, Jan ŠTOURAČ, Jaroslav BENDL, Jan BREZOVSKÝ, Zbyněk PROKOP, J. ZENDULKA, Tomáš MARTÍNEK, David BEDNÁŘ a Jiří DAMBORSKÝ. FireProt 1.0. 2017.URL
RIV/00216224:14310/17:00100360 Software. angličtina. Česká republika.
Musil, Miloš (203 Česká republika, domácí) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Bendl, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Zendulka, J. (203 Česká republika) -- Martínek, Tomáš (203 Česká republika) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: protein engineering; thermostable proteins; multiple-point mutant prediction; protein stability
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 14. 3. 2018 11:06.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1411131/cs -
CHIU, Flora W. Y., David KOVÁŘ, Stavros STAVRAKIS, Simon BERGER, Andrew J. DEMELLO, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. High-throughput screening of haloalkane dehalogenase libraries based on a pH- sensitive assay using droplet-based microfluidics. 2017.Physics and Chemistry of Microfluidics // Gordon Research Conference
Název anglicky: High-throughput screening of haloalkane dehalogenase libraries based on a pH- sensitive assay using droplet-based microfluidics
Mezinárodní význam: ano
Změnil: Mgr. David Kovář, Ph.D., učo 150685. Změněno: 13. 3. 2018 10:22.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1410978/cs -
HTS 1.0 (software)HON, Jiří, David BEDNÁŘ, Tomáš MARTÍNEK a Jiří DAMBORSKÝ. HTS 1.0. 2017.URL
RIV/00216224:14310/17:00094400 Software. Informatika. angličtina. Česká republika.
Hon, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Martínek, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: sequences for gene synthesis
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 14. 12. 2017 08:56.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1399155/cs -
FARKA, Zdeněk, Tomáš JUŘÍK, Matěj PASTUCHA, David KOVÁŘ a Petr SKLÁDAL. Immunosensors for detection of pathogenic bacteria. In From structures to optical functions: Layered materials serving biosensing. 2017.URL
Analytická chemie, separace. angličtina. Česká republika.
Klíčová slova anglicky: Immunosensor; Biosensor; Surface Plasmon Resonance; Electrochemical Impedance Spectroscopy; Quartz Crystal Microbalance
Druh účasti: vyžádaná přednáška
Mezinárodní význam: ano
Změnil: doc. Mgr. Zdeněk Farka, Ph.D., učo 357740. Změněno: 25. 10. 2017 10:06.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1393560/cs -
SEDLÁČKOVÁ, Jitka. Individuální rozdíly v učení se cizím jazykům: specifická situace neslyšících. Komenský. Masarykova univerzita, 2017, roč. 141, č. 3, s. 38-42. ISSN 0323-0449.
Název anglicky: Individual differences in foreign language learning: the specific situation of the deaf
Klíčová slova anglicky: deaf, English as a foreign language, individual differences in foreign language learning
Změnila: Mgr. Jitka Sedláčková, Ph.D., učo 40134. Změněno: 10. 4. 2017 18:29.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1378096/cs -
FURMANOVÁ, Katarína, Miroslava JAREŠOVÁ, Jan BYŠKA, Adam JURČÍK, Julius PARULEK, Helwig HAUSER a Barbora KOZLÍKOVÁ. Interactive Exploration of Ligand Transportation through Protein Tunnels. BMC Bioinformatics. BioMed Central, 2017, roč. 18, č. 22, s. 1-16. ISSN 1471-2105. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12859-016-1448-0.URL
RIV/00216224:14330/17:00095871 Článek v odborném periodiku. Informatika. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Furmanová, Katarína (703 Slovensko, domácí) -- Jarešová, Miroslava (203 Česká republika, domácí) -- Byška, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Jurčík, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Parulek, Julius (703 Slovensko) -- Hauser, Helwig (40 Rakousko) -- Kozlíková, Barbora (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: ligand transportation;protein;visualization;visual analysis
Změnil: RNDr. Jan Byška, Ph.D., učo 207879. Změněno: 26. 10. 2020 18:11.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1352180/cs -
KAUSHIK, Shubhangi, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a Radka CHALOUPKOVÁ. Kinetics of Binding of Fluorescent Ligands to Enzymes with Engineered Access Tunnels. FEBS Journal. Hoboken, NJ USA: WILEY-BLACKWELL, 2017, roč. 284, č. 1, s. 134-148. ISSN 1742-464X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/febs.13957.URL
RIV/00216224:14310/17:00095411 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Kaushik, Shubhangi (356 Indie, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: binding kinetics; fluorescence polarization; haloalkane dehalogenases; HaloTag ligands; modified access tunnels
Změnila: Ing. Nicole Zrilić, učo 240776. Změněno: 5. 4. 2018 22:46.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1403852/cs -
KOTÍK, Martin, Pavel VAŇÁČEK, Antonín KUNKA, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Metagenome-derived Haloalkane Dehalogenases with Novel Catalytic Properties. APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY. New York: Springer, 2017, roč. 101, č. 16, s. 6385-6397. ISSN 0175-7598. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00253-017-8393-3.URL
RIV/00216224:14310/17:00095407 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Kotík, Martin (203 Česká republika) -- Vaňáček, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Kunka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Haloalkane dehalogenase; Metagenomic DNA; Heterologous production; Substrate specificity; Protein stability
Změnila: Ing. Nicole Zrilić, učo 240776. Změněno: 9. 4. 2018 10:36.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1403838/cs -
MAZURENKO, Stanislav, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Multi-Enzyme Pathway Optimisation Through Star-Shaped Reachable Sets. In Rocha M.,De Paz J.F.,Pinto T.,Fdez-Riverola. 11th International Conference on Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics. Německo: Springer International Publishing, 2017, s. 9-17. ISBN 978-3-319-60816-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-60816-7_2.URL
RIV/00216224:14310/17:00099434 Stať ve sborníku. angličtina. Portugalsko.
Mazurenko, Stanislav (643 Rusko, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Enzyme kinetics; Optimal control; Synthetic biology; Metabolic networks; Non-linear dynamics
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 23. 4. 2020 14:57.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1403832/cs -
FARKA, Zdeněk, Tomáš JUŘÍK, David KOVÁŘ, Libuše TRNKOVÁ a Petr SKLÁDAL. Nanoparticle-Based Immunochemical Biosensors and Assays: Recent Advances and Challenges. Chemical Reviews. Washington, D.C., USA: American Chemical Society, 2017, roč. 117, č. 15, s. 9973-10042. ISSN 0009-2665. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.chemrev.7b00037.URL
RIV/00216224:14740/17:00097309 Článek v odborném periodiku. Analytická chemie, separace. angličtina. Spojené státy.
Farka, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Juřík, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Kovář, David (203 Česká republika, domácí) -- Trnková, Libuše (203 Česká republika, domácí) -- Skládal, Petr (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Immunosensor; Immunoassay; Nanoparticle; Antibody
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 23. 4. 2020 17:29.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1386732/cs -
SCHWARTE, Andreas, Maika GENZ, Lilly SKALDEN, Alberto NOBILI, Clare VICKERS, Okke MELSE, Remko KUIPERS, Henk_jan JOOSTEN, Jan ŠTOURAČ, Jaroslav BENDL, Jon BLACK, Peter HAASE, Coos BAAKMAN, Jiří DAMBORSKÝ, Uwe BORNSCHEUER, Gert VRIEND a Hanka VENSELAAR. NewProt – a Protein Engineering Portal. PROTEIN ENGINEERING, DESIGN & SELECTION. Oxford: OXFORD UNIV PRESS, 2017, roč. 30, č. 6, s. 441-447. ISSN 1741-0126. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/protein/gzx024.URL
RIV/00216224:14310/17:00099438 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Schwarte, Andreas (276 Německo) -- Genz, Maika (276 Německo) -- Skalden, Lilly (276 Německo) -- Nobili, Alberto (276 Německo) -- Vickers, Clare (276 Německo) -- Melse, Okke (276 Německo) -- Kuipers, Remko (528 Nizozemské království) -- Joosten, Henk_jan (528 Nizozemské království) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Bendl, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Black, Jon (528 Nizozemské království) -- Haase, Peter (276 Německo) -- Baakman, Coos (528 Nizozemské království) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bornscheuer, Uwe (276 Německo) -- Vriend, Gert (528 Nizozemské království) -- Venselaar, Hanka (528 Nizozemské království)
Klíčová slova anglicky: mutant analysis; portal; protein design; protein engineering; web server
Změnila: Ing. Nicole Zrilić, učo 240776. Změněno: 9. 4. 2018 16:36.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1403839/cs -
NewProt 1.0 (software)SCHWARTE, A., M. GENZ, L. SKALDEN, A. NOBILI, C. VICKERS, O. MELSE, R. KUIPERS, H. JOOSTEN, Jan ŠTOURAČ, Jaroslav BENDL, J. BLACK, P. HAASE, C. BAAKMAN, Jiří DAMBORSKÝ, Uwe BORNSCHEUER, G. VRIEND a H. VENSELAAR. NewProt 1.0. 2017.URL
RIV/00216224:14310/17:00100413 Software. angličtina. Česká republika.
Schwarte, A. (276 Německo) -- Genz, M. (276 Německo) -- Skalden, L. (276 Německo) -- Nobili, A. (276 Německo) -- Vickers, C. (276 Německo) -- Melse, O. (276 Německo) -- Kuipers, R. (528 Nizozemské království) -- Joosten, H. (528 Nizozemské království) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Bendl, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Black, J. (528 Nizozemské království) -- Haase, P. (276 Německo) -- Baakman, C. (528 Nizozemské království) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bornscheuer, Uwe (276 Německo) -- Vriend, G. (528 Nizozemské království) -- Venselaar, H. (528 Nizozemské království)
Klíčová slova anglicky: mutant analysis; portal; protein design; protein engineering; web server
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 19. 3. 2018 12:27.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1411773/cs -
KOVÁŘ, David, Aneta MALÁ, Jitka VAŇÁČKOVÁ, Michal KALINA, Zdenka FOHLEROVÁ, Antonín HLAVÁČEK, Zdeněk FARKA, Petr SKLÁDAL, Zenon STARČUK, Radovan JIŘÍK, Ondřej SLABÝ a Jaromír HUBÁLEK. Preparation and Characterisation of Highly Stable Iron Oxide Nanoparticles for Magnetic Resonance Imaging. Journal of Nanomaterials. London: Hindawi Publishing Corporation, 2017, roč. 2017, neuvedeno, s. nestránkováno, 8 s. ISSN 1687-4110. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1155/2017/7859289.URL
RIV/00216224:14740/17:00094662 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Kovář, David (203 Česká republika, domácí) -- Malá, Aneta (203 Česká republika) -- Vaňáčková, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Kalina, Michal (203 Česká republika) -- Fohlerová, Zdenka (203 Česká republika) -- Hlaváček, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Farka, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Skládal, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Starčuk, Zenon (203 Česká republika) -- Jiřík, Radovan (203 Česká republika) -- Slabý, Ondřej (203 Česká republika, garant, domácí) -- Hubálek, Jaromír (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: ATOMIC-FORCE MICROSCOPY; CONTRAST AGENTS; ONE-STEP; MEDIA; MRI; SEPARATION; PARTICLES; SILICA; PROBES; CHARGE
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 1. 6. 2017 14:10.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1374448/cs -
VALUCHOVÁ, Soňa, Jaroslav FULNEČEK, Zbyněk PROKOP, Peggy STOLT-BERGNER, Eliška JANOUŠKOVÁ, Ctirad HOFR a Karel ŘÍHA. Protection of Arabidopsis Blunt-Ended Telomeres Is Mediated by a Physical Association with the Ku Heterodimer. Plant Cell. ROCKVILLE: AMER SOC PLANT BIOLOGISTS, 2017, roč. 29, č. 6, s. 1533-1545. ISSN 1040-4651. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1105/tpc.17.00064.URL
RIV/00216224:14740/17:00095562 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Valuchová, Soňa (703 Slovensko, domácí) -- Fulneček, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Stolt-Bergner, Peggy (40 Rakousko) -- Janoušková, Eliška (203 Česká republika, domácí) -- Hofr, Ctirad (203 Česká republika, domácí) -- Říha, Karel (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: STRAND BREAK REPAIR; INDUCED FLUORESCENCE ENHANCEMENT; SINGLE DNA END; MAMMALIAN TELOMERES; PROTEIN; LENGTH; COMPLEX; DAMAGE; FUSIONS; YEAST
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 15. 3. 2018 10:49.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1410576/cs -
BEDNÁŘ, David, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant enzyme gamma-hexachlorocyclohexane dehydrochlorinase LinA01 carrying thermostabilizing mutations by energy-based approach. 2017.URL
RIV/00216224:14310/17:00094391 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: enzyme haloalkane dehalogenase
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 14. 12. 2017 08:18.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1399146/cs -
BEDNÁŘ, David, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DhaA101 carrying thermostabilizing mutations by evolution-based approach. 2017.URL
RIV/00216224:14310/17:00094392 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase DhaA101
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 14. 12. 2017 08:22.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1399147/cs -
BEDNÁŘ, David, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DhaA112 carrying thermostabilizing mutations by energy-based approach. 2017.URL
RIV/00216224:14310/17:00094393 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase DhaA112
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 14. 12. 2017 08:26.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1399148/cs -
BEDNÁŘ, David, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DhaA115 carrying thermostabilizing mutations by combine approach. 2017.URL
RIV/00216224:14310/17:00094394 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase DhaA115
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 14. 12. 2017 08:29.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1399149/cs -
KOTÍK, M., Pavel VAŇÁČEK, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase eHLD2. 2017.URL
RIV/00216224:14310/17:00094398 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Kotík, M. (203 Česká republika) -- Vaňáček, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase eHLD2
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 14. 12. 2017 08:50.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1399153/cs -
KOTÍK, M., Pavel VAŇÁČEK, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase eHLD3. 2017.URL
RIV/00216224:14310/17:00094399 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Kotík, M. (203 Česká republika) -- Vaňáček, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase eHLD3
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 14. 12. 2017 08:52.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1399154/cs -
BABKOVÁ, Petra, Radka CHALOUPKOVÁ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase LinB116 carrying thermostabilizing mutations by FRESCO with removed disulphide bridge. 2017.URL
RIV/00216224:14310/17:00094384 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Babková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase LinB104
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 14. 12. 2017 07:49.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1398923/cs -
VAŇÁČEK, Pavel, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant enzyme halohydrin dehalogenase HheC01 carrying thermostabilizing mutations. 2017.URL
RIV/00216224:14310/17:00094395 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Vaňáček, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: halohydrin dehalogenase HheC01
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 14. 12. 2017 08:32.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1399150/cs -
BEDNÁŘ, David, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant enzyme halohydrin dehalogenase HheC-DJ carrying thermostabilizing mutations. 2017.URL
RIV/00216224:14310/17:00094401 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: enzyme halohydrin dehalogenase HheC-DJ
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 14. 12. 2017 15:34.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1399228/cs -
VAŇÁČEK, Pavel, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant enzyme halohydrin dehalogenase HheC-LT01 carrying thermostabilizing mutations. 2017.URL
RIV/00216224:14310/17:00094396 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Vaňáček, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: halohydrin dehalogenase HheC-LT01
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 14. 12. 2017 15:24.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1399151/cs -
BEDNÁŘ, David, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant enzyme halohydrin dehalogenase HheC-LT02 carrying thermostabilizing mutations. 2017.URL
RIV/00216224:14310/17:00094397 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: halohydrin dehalogenase HheC-LT02
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 14. 12. 2017 15:27.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1399152/cs -
KOKKONEN, Piia Pauliina, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Lukáš DANIEL, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Structure-function Relationships and Engineering of Haloalkane Dehalogenases. Online. In Rojo, Fernando. HANDBOOK OF HYDROCARBON AND LIPID MICROBIOLOGY SERIES. AEROBIC UTILIZATION OF HYDROCARBONS, OILS, AND LIPIDS. Heidelberg: Springer, Cham, 2017, s. 1-21. ISBN 978-3-319-50419-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-39782-5.URL
RIV/00216224:14310/17:00100792 Kapitola resp. kapitoly v odborné knize. angličtina. Švýcarsko.
Kokkonen, Piia Pauliina (246 Finsko, domácí) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Daniel, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Biodegradation Hydrocarbons Bacteria Yeasts Alkanes Gasoline Aromatic hydrocarbons Degradation of lipids Fatty acids
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 5. 3. 2019 13:15.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1403855/cs -
VAD, Viktor, Jan BYŠKA, Adam JURČÍK, Ivan VIOLA, Eduard M. GRÖLLER, Helwig HAUSER, Sérgio Manuel MARQUES, Jiří DAMBORSKÝ a Barbora KOZLÍKOVÁ. Watergate: Visual Exploration of Water Trajectories in Protein Dynamics. Online. In S. Bruckner, A. Hennemuth, and B. Kainz. Eurographics Workshop on Visual Computing for Biology and Medicine. Bremen, Germany: Eurographics Workshop on Visual Computing for Biology and Medicine, 2017, s. 33-42. ISBN 978-3-03868-036-9.
RIV/00216224:14330/17:00094923 Stať ve sborníku. Informatika. angličtina.
Vad, Viktor (348 Maďarsko) -- Byška, Jan (203 Česká republika) -- Jurčík, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Viola, Ivan (703 Slovensko) -- Gröller, Eduard M. (40 Rakousko) -- Hauser, Helwig (40 Rakousko) -- Marques, Sérgio Manuel (620 Portugalsko, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Kozlíková, Barbora (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Protein;water molecule;trajectory;visualization
Druh sborníku: postkonferenční sborník
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: doc. RNDr. Barbora Kozlíková, Ph.D., učo 60850. Změněno: 26. 4. 2018 12:43.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1389119/cs -
JURČÍK, Adam, Julius PARULEK, Jiří SOCHOR a Barbora KOZLÍKOVÁ. Accelerated Visualization of Transparent Molecular Surfaces in Molecular Dynamics. In IEEE Pacific Visualization Symposium 2016. Taipei, Taiwan: IEEE, 2016, s. 112-119. ISBN 978-1-5090-1451-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/PACIFICVIS.2016.7465258.
RIV/00216224:14330/16:00089793 Stať ve sborníku. Informatika. angličtina. Tchaj-wan.
Jurčík, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Parulek, Julius (703 Slovensko) -- Sochor, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Kozlíková, Barbora (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Computational Geometry and Object Modeling;Boundary representations; Three-Dimensional Graphics and Realism;Visible line/surface algorithms
Druh sborníku: předkonferenční sborník
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 14. 5. 2020 15:20.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1343724/cs -
PROKOP, Zbyněk, Anežka NEČASOVÁ, Jana KLÁNOVÁ a Pavel ČUPR. Bioavailability and mobility of organic contaminants in soil: new three-step ecotoxicological evaluation. Environmental Science and Pollution Research. HEIDELBERG (GERMANY): SPRINGER HEIDELBERG, 2016, roč. 23, č. 5, s. 4312-4319. ISSN 0944-1344. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s11356-015-5555-7.URL
RIV/00216224:14310/16:00089236 Článek v odborném periodiku. Vliv životního prostředí na zdraví. angličtina. Německo.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Nečasová, Anežka (203 Česká republika, domácí) -- Klánová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Čupr, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Bioavailability; Mobility; Ecotoxicological evaluation; Toxicity; Soil contamination; Bioremediation; Risk identification/assessment
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 19. 4. 2016 13:53.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1322836/cs -
BIDMANOVÁ, Šárka, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ, A. DÜRKOP a O.S. WOLFBEIS. Device for Detection of Halogenated Hydrocarbons. 2016. Patent. Číslo: 15196591. Název vlastníka: MU. Datum registrace: 26. 11. 2015.
Biochemie. angličtina. Česká republika. obsah je utajovanou skutečností.
Klíčová slova anglicky: Halogenated Hydrocarbons
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 17. 3. 2016 09:16.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1339461/cs -
BURYŠKA, Tomáš, Lukáš DANIEL, Antonín KUNKA, Jan BREZOVSKÝ, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Discovery of Novel Haloalkane Dehalogenase Inhibitors. Applied and Environmental Microbiology. WASHINGTON, DC (USA): AMER SOC MICROBIOLOGY, 2016, roč. 82, č. 6, s. 1958-1965. ISSN 0099-2240. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1128/AEM.03916-15.URL
RIV/00216224:14310/16:00087944 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Buryška, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Daniel, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Kunka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: SPHINGOMONAS-PAUCIMOBILIS UT26; AMBER FORCE-FIELD; MYCOBACTERIUM-TUBERCULOSIS; GENERALIZED BORN; SCORING FUNCTION; GAMMA-HEXACHLOROCYCLOHEXANE; BRADYRHIZOBIUM-JAPONICUM; CRYSTAL-STRUCTURE; PURIFICATION; SEQUENCE
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 3. 4. 2017 12:24.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1345850/cs -
BREZOVSKÝ, Jan, Petra BABKOVÁ, Oksana DEGTJARIK, Andrea FOŘTOVÁ, Artur Wiktor GÓRA, L. IERMAK, Petra ŘEZÁČOVÁ, Pavel DVOŘÁK, Ivana KUTÁ-SMATANOVÁ, Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Engineering a de Novo Transport Tunnel. ACS Catalysis. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2016, roč. 6, č. 11, s. 7597-7610. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acscatal.6b02081.URL
RIV/00216224:14310/16:00088545 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Babková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Degtjarik, Oksana (112 Bělorusko) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Góra, Artur Wiktor (616 Polsko, domácí) -- Iermak, L. (804 Ukrajina) -- Řezáčová, Petra (203 Česká republika) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Kutá-Smatanová, Ivana (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: transport tunnel; protein engineering; protein design; activity; specificity; substrate inhibition; stability; substrate binding; product release; water dynamics
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 5. 4. 2017 13:35.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1367541/cs -
BIDMANOVÁ, Šárka, M.S. STEINER, Martina STEPAN, Kamila VYMAZALOVA, M.A. GRUBER, A. DUERKOP, Jiří DAMBORSKÝ, Zbyněk PROKOP a O.S. WOLFBEIS. Enzyme Based Test Stripes for the Visual or Photographic Detection and Quantitation of Gaseous Sulfur Mustard. ANALYTICAL CHEMISTRY. 2016, roč. 88, č. 11, s. 6044-6049. ISSN 0003-2700. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.analchem.6b01272.URL
RIV/00216224:14310/16:00087645 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Bidmanová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Steiner, M.S. (276 Německo) -- Stepan, Martina (203 Česká republika) -- Vymazalova, Kamila (203 Česká republika) -- Gruber, M.A. (276 Německo) -- Duerkop, A. (276 Německo) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Wolfbeis, O.S. (276 Německo)
Klíčová slova anglicky: PH; OXYGEN; TEMPERATURE; SMARTPHONE; SENSOR
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 5. 4. 2017 17:55.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1367557/cs -
BIDMANOVÁ, Šárka, Markéta KOTLÁNOVÁ, T. RATAJ, Jiří DAMBORSKÝ, Martina TRTILEK a Zbyněk PROKOP. Fluorescence-Based Biosensor for Monitoring of Environmental Pollutants: From Concept to Field Application. Biosensors & bioelectronics : the international journal for the professional involved with research, technology and applications of biosensors and related devices. Elsevier Science, 2016, roč. 84, October, s. 97-105. ISSN 0956-5663. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bios.2015.12.010.URL
RIV/00216224:14310/16:00087646 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Bidmanová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Kotlánová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Rataj, T. (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Trtilek, Martina (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Dehydrochlorinase; Environmental monitoring; Field-testing; Haloalkane dehalogenase; Halogenated pollutant; Optical biosensor
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 6. 4. 2017 16:34.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1368260/cs -
FARKA, Zdeněk, Tomáš JUŘÍK, Pavel PODEŠVA, David KOVÁŘ, František FORET a Petr SKLÁDAL. Gelatin-templated Nanostructured Gold for Electrochemical Detection of Glucose in Serum. In 67th Annual Meeting of the International Society of Electrochemistry. 2016.URL
Elektrochemie. angličtina. Nizozemské království.
Klíčová slova anglicky: Gold nanostructures; Gelatin template; Glucose electrooxidation; Non-enzymatic sensor; Blood analysis
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnil: doc. Mgr. Zdeněk Farka, Ph.D., učo 357740. Změněno: 30. 8. 2016 15:48.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1352748/cs -
BENDL, J., Jan ŠTOURAČ, Eva ŠEBESTOVÁ, Ondřej VÁVRA, Miloš MUSIL, Jan BREZOVSKÝ a Jiří DAMBORSKÝ. HotSpot Wizard 2.0: Automated Design of Site-Specific Mutations and Smart Libraries in Protein Engineering. Nucleic Acids Research. Oxford University Press, 2016, roč. 44, W1, s. "W479"-"W487", 9 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkw416.URL
RIV/00216224:14310/16:00088547 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Bendl, J. (203 Česká republika) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Šebestová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Vávra, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Musil, Miloš (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: MULTIPLE SEQUENCE ALIGNMENTS; FUNCTIONALLY IMPORTANT RESIDUES; FOCUSED DIRECTED EVOLUTION; SATURATION MUTAGENESIS; CORRELATED MUTATIONS; ENZYME PROPERTIES; THERMOSTABILITY; IDENTIFICATION; CONSERVATION; BINDING
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 6. 4. 2017 18:39.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1367555/cs -
FARKA, Zdeněk, David KOVÁŘ, Tomáš JUŘÍK a Petr SKLÁDAL. Imunosensory pro rychlou detekci patogenních mikroorganismů. In XVI. mezioborové setkání mladých biologů, biochemiků a chemiků. 2016. ISSN 2336-7202.URL
Biochemie. čeština. Česká republika.
Druh účasti: aktivní účast
Recenzováno: ano
Změnil: doc. Mgr. Zdeněk Farka, Ph.D., učo 357740. Změněno: 31. 8. 2016 12:17.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1345373/cs -
PROKOP, Zbyněk, Pavel VAŇÁČEK a Jiří DAMBORSKÝ. Mikrofluidní čip pro teplotní gradient. 2016.
Název anglicky: Microfluidic chip for temperature gradient
RIV/00216224:14310/16:00087654 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Vaňáček, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: microfluidics;temperature gradient;chip
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 24. 3. 2017 12:36.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1373446/cs -
BENDL, Jaroslav, Miloš MUSIL, Jan ŠTOURAČ, Jaroslav ZENDULKA, Jiří DAMBORSKÝ a Jan BREZOVSKÝ. PredictSNP2: A Unified Platform for Accurately Evaluating SNP Effects by Exploiting the Different Characteristics of Variants in Distinct Genomic Regions. PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY 12: e100496. 2016, roč. 12, č. 5, s. "nestrankovano", 18 s. ISSN 1553-734X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1004962.URL
RIV/00216224:14310/16:00092839 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Bendl, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Musil, Miloš (203 Česká republika, domácí) -- Štourač, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Zendulka, Jaroslav (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: GENETIC-VARIATION; REGULATORY VARIANTS; SEQUENCE VARIATION; PROTEIN FUNCTION; CAUSAL VARIANTS; COMPLEX TRAITS; MUTATIONS; DISEASE; CANCER; ELEMENTS
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 9. 4. 2017 15:35.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1367553/cs -
FARKA, Zdeněk, Tomáš JUŘÍK, Matěj PASTUCHA, David KOVÁŘ, Karel LACINA a Petr SKLÁDAL. Rapid Immunosensing of Salmonella Typhimurium Using Electrochemical Impedance Spectroscopy: the Effect of Sample Treatment. Electroanalysis. Weinheim: Wiley, 2016, roč. 28, č. 8, s. 1803-1809. ISSN 1040-0397. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/elan.201600093.URL
RIV/00216224:14740/16:00090535 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Německo.
Farka, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Juřík, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Pastucha, Matěj (203 Česká republika, domácí) -- Kovář, David (203 Česká republika, domácí) -- Lacina, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Skládal, Petr (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Atomic force microscopy; Biosensor; Immunosensor; Label-free detection; Salmonella Typhimurium
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: doc. Mgr. Zdeněk Farka, Ph.D., učo 357740. Změněno: 28. 9. 2017 11:01.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1351272/cs -
GROSS, J., Zbyněk PROKOP, D. JANSSEN, Kurt FABER a M. HALL. Regio- and Enantioselective Sequential Dehalogenation of rac-1,3-Dibromobutane by Haloalkane Dehalogenase LinB. CHEMBIOCHEM. WILEY-V C H VERLAG GMBH, 2016, roč. 17, č. 15, s. 1437-1441. ISSN 1439-4227. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cbic.201600227.URL
RIV/00216224:14310/16:00088568 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Německo.
Gross, J. (40 Rakousko) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Janssen, D. (528 Nizozemské království) -- Faber, Kurt (40 Rakousko) -- Hall, M. (40 Rakousko)
Klíčová slova anglicky: biocatalysis; enantioselectivity; haloalkane dehalogenase; hydrolysis; LinB; regioselectivity
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 8. 4. 2020 14:01.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1368405/cs -
GLOSER, Vít, Halyna KOROVETSKA, Ana Isabel Martín VERTEDOR, Martina HÁJÍČKOVÁ, Zbyněk PROKOP, Sally WILKINSON a William DAVIES. The Dynamics of Xylem Sap pH under Drought: a Universal Response in Herbs? PLANT AND SOIL. Springer, 2016, roč. 409, 1-2, s. 259-272. ISSN 0032-079X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s11104-016-2962-6.
RIV/00216224:14310/16:00092836 Článek v odborném periodiku. Fyziologie. angličtina. Nizozemské království.
Gloser, Vít (203 Česká republika, garant, domácí) -- Korovetska, Halyna (804 Ukrajina, domácí) -- Vertedor, Ana Isabel Martín (724 Španělsko, domácí) -- Hájíčková, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Wilkinson, Sally (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Davies, William (826 Velká Británie a Severní Irsko)
Klíčová slova anglicky: Soil drying; Xylem sap; Nitrate; Malate
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 14. 4. 2017 14:14.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1367538/cs -
LIŠKOVÁ, Veronika, David BEDNÁŘ, T. PRUDNIKOVA, P. REZACOVA, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Eva ŠEBESTOVÁ, I., KUTA- SMATANOVÁ, Jan BREZOVSKÝ, Radka CHALOUPKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Balancing the Stability-Activity Trade-off by Fine-Tuning Dehalogenase Access Tunnels. ChemCatChem. 2015, roč. 7, č. 4, s. 648-659. ISSN 1867-3880. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cctc.201402792.URL
RIV/00216224:14310/15:00080815 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Německo.
Lišková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Prudnikova, T. (112 Bělorusko) -- Rezacova, P. (203 Česká republika) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Šebestová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Kuta- Smatanová, I., (203 Česká republika) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase DhaA;access tunnel
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 21. 3. 2017 07:51.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1300087/cs -
Název anglicky: Enzymatic Stripes
RIV/00216224:14310/15:00080422 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Bidmanová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Enzymatic Stripes; Yperire
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 31. 3. 2016 13:46.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1339423/cs -
ŠARMÍROVÁ, Klaudia, Radka CHALOUPKOVÁ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. DsvA from Saccharomonospora viridis DSM 43017. 2015.
RIV/00216224:14310/15:00080426 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Šarmírová, Klaudia (703 Slovensko, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: DsvA
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 31. 3. 2016 13:48.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1339430/cs -
CHRÁST, Lukáš, Radka CHALOUPKOVÁ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Enzyme haloalkane dehalogenase DmxA from Marinobacter sp. ELB17 purified to homogeneity. 2015.
RIV/00216224:14310/15:00080427 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Chrást, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Enzyme haloalkane dehalogenase
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 31. 3. 2016 13:50.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1339431/cs -
DVOŘÁK, Pavel, Lukáš CHRÁST, Pablo Ivan NIKEL, Radek FEDR, Karel SOUČEK, Miroslava SEDLÁČKOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Víctor LORENZO DE, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Exacerbation of Substrate Toxicity by IPTG in Escherichia coli BL21(DE3) Carrying a Synthetic Metabolic Pathway. Microbial Cell Factories. London: BioMed Central, 2015, roč. 14, December, s. "nestrankovano", 15 s. ISSN 1475-2859. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12934-015-0393-3.URL
RIV/00216224:14310/15:00081393 Článek v odborném periodiku. Mikrobiologie, virologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Chrást, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Nikel, Pablo Ivan (32 Argentina) -- Fedr, Radek (203 Česká republika) -- Souček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Sedláčková, Miroslava (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Lorenzo de, Víctor (724 Španělsko) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Metabolic burden; Substrate toxicity; Escherichia coli; Heterologous metabolic pathway; Isopropyl beta-D-1-thiogalactopyranoside; Lactose; 1.2.3-trichloropropane; Metabolic engineering
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 21. 3. 2017 07:57.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1322825/cs -
BEDNÁŘ, David, Koen BEERENS, Eva ŠEBESTOVÁ, Jaroslav BENDL, S. KHARE, Radka CHALOUPKOVÁ, Zbyněk PROKOP, Jan BREZOVSKÝ, D. BAKER a Jiří DAMBORSKÝ. FireProt: Energy- and Evolution-Based Computational Design of Thermostable Multiple-Point Mutants. PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY. 2015, roč. 11, č. 11, s. "nestrankovano", 20 s. ISSN 1553-734X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1004556.URL
RIV/00216224:14310/15:00081399 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Beerens, Koen (56 Belgie, domácí) -- Šebestová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Bendl, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Khare, S. (364 Írán) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Baker, D. (840 Spojené státy) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: FireProt;haloalkane dehalogenase
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 21. 3. 2017 07:46.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1322952/cs -
Firmware k ovládání biosensoru (software)POLACH, Petr a Zbyněk PROKOP. Firmware k ovládání biosensoru. 2015.
Název anglicky: Firmware for controlling the biosensor
RIV/00216224:14310/15:00080464 Software. Využití počítačů, robotika a její aplikace. čeština. Česká republika.
Polach, Petr (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Software; measurement
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 13. 4. 2016 09:54.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1342207/cs -
GIELEN, Fabrice, Tomáš BURYŠKA, Liisa VAN VLIET, Maren BUTZ, Jiří DAMBORSKÝ, Zbyněk PROKOP a Florian HOLLFELDER. Interfacing Microwells with Nanoliter Compartments: A Sampler Generating High-Resolution Concentration Gradients for Quantitative Biochemical Analyses in Droplets. Analytical Chemistry. 2015, roč. 87, č. 1, s. 624-632. ISSN 0003-2700. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ac503336g.URL
RIV/00216224:14310/15:00082195 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Gielen, Fabrice (250 Francie) -- Buryška, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Van Vliet, Liisa (840 Spojené státy) -- Butz, Maren (756 Švýcarsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Hollfelder, Florian (276 Německo)
Klíčová slova anglicky: microfluidic; haloalkane dehalogenase DbjA
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 21. 3. 2017 07:50.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1213476/cs -
DANIEL, Lukáš, Tomáš BURYŠKA, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a Jan BREZOVSKÝ. Mechanism-Based Discovery of Novel Substrates of Haloalkane Dehalogenases using in Silico Screening. Journal of Chemical Information and Modeling. 2015, roč. 55, č. 1, s. 54-62. ISSN 1549-9596. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ci500486y.URL
RIV/00216224:14310/15:00081404 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Daniel, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Buryška, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: in Silico Screening;Haloalkane Dehalogenases
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 7. 4. 2016 10:10.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1323004/cs -
SHRIVASTAVA, Nidhi, Zbyněk PROKOP a Ashwani KUMAR. Novel LinA Type 3 delta-Hexachlorocyclohexane Dehydrochlorinase. Applied and Environmental Microbiology. WASHINGTON, DC (USA): AMER SOC MICROBIOLOGY, 2015, roč. 81, č. 21, s. 7553-7559. ISSN 0099-2240. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1128/AEM.01683-15.URL
RIV/00216224:14310/15:00085588 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Shrivastava, Nidhi (356 Indie) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Kumar, Ashwani (356 Indie, garant)
Klíčová slova anglicky: HALOALKANE DEHALOGENASE LINB; SPHINGOBIUM-INDICUM B90A; GAMMA-HEXACHLOROCYCLOHEXANE; BETA-HEXACHLOROCYCLOHEXANE; ALPHA-HEXACHLOROCYCLOHEXANE; DEGRADATION; TRANSFORMATION; ISOMERS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 17. 3. 2016 14:09.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1322953/cs -
BABKOVÁ, Petra, Radka CHALOUPKOVÁ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant ancestral enzyme ancDbjA-DbeA NOD1. 2015.
RIV/00216224:14310/15:00080430 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Babková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Recombinant ancestral enzyme
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 16. 3. 2016 08:53.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1339437/cs -
BABKOVÁ, Petra, Radka CHALOUPKOVÁ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant ancestral enzyme ancDbjA-DbeA NOD2. 2015.
RIV/00216224:14310/15:00080431 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Babková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Recombinant ancestral enzyme
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 31. 3. 2016 13:52.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1339439/cs -
BABKOVÁ, Petra, Radka CHALOUPKOVÁ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant ancestral enzyme ancDbjA-DbeA NOD3. 2015.
RIV/00216224:14310/15:00080432 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Babková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Recombinant ancestral enzyme
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 31. 3. 2016 13:53.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1339441/cs -
BABKOVÁ, Petra, Radka CHALOUPKOVÁ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant ancestral enzyme ancDbjA-DbeA NOD4. 2015.
RIV/00216224:14310/15:00080433 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Babková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Recombinant ancestral enzyme
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 31. 3. 2016 13:54.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1339442/cs -
BABKOVÁ, Petra, Radka CHALOUPKOVÁ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant ancestral enzyme ancDbjA-DbeA NOD5. 2015.
RIV/00216224:14310/15:00080434 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Babková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Recombinant ancestral enzyme
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 31. 3. 2016 13:55.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1339443/cs -
BABKOVÁ, Petra, Radka CHALOUPKOVÁ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant ancestral enzyme ancHLD-Rluc. 2015.
RIV/00216224:14310/15:00080428 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Babková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Recombinant ancestral enzyme
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 31. 3. 2016 13:56.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1339433/cs -
BABKOVÁ, Petra, Radka CHALOUPKOVÁ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant ancestral enzyme ancLinB-DmbA. 2015.
RIV/00216224:14310/15:00080429 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Babková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Recombinant ancestral enzyme
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 31. 3. 2016 13:58.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1339435/cs -
AMARO, M., Jan BREZOVSKÝ, Silvia KOVÁČOVÁ, J. SYKORA, David BEDNÁŘ, Václav NĚMEC, Veronika LIŠKOVÁ, Nagendra Prasad KURUMBANG, Koen BEERENS, Radka CHALOUPKOVÁ, Kamil PARUCH, Martina HOF a Jiří DAMBORSKÝ. Site-specific Analysis of Protein Hydration Based on Unnatural Amino Acid Fluorescence. Journal of the American Chemical Society. 2015, roč. 137, č. 15, s. 4988-4992. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jacs.5b01681.URL
RIV/00216224:14310/15:00080814 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Amaro, M. (620 Portugalsko) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Kováčová, Silvia (703 Slovensko, domácí) -- Sykora, J. (203 Česká republika) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Němec, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Lišková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Kurumbang, Nagendra Prasad (524 Nepál, domácí) -- Beerens, Koen (56 Belgie, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Paruch, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Hof, Martina (276 Německo) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: dehalogenases;fluorescence spectroscopy;molecular dynamics simulations
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 21. 3. 2017 07:53.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1300082/cs -
Caver Analyst 1.0 (software)KOZLÍKOVÁ, Barbora, Eva ŠEBESTOVÁ, Vilém ŠUSTR, Jan BREZOVSKÝ, Ondřej STRNAD, Lukáš DANIEL, David BEDNÁŘ, Antonín PAVELKA, Martin MAŇÁK, Martin BEZDĚKA, Petr BENEŠ, Matúš KOTRY, Artur Wiktor GORA, Jiří DAMBORSKÝ a Jiří SOCHOR. Caver Analyst 1.0. 2014.URL
Název anglicky: Caver Analyst 1.0
RIV/00216224:14330/14:00074483 Software. Informatika. angličtina. Česká republika.
Kozlíková, Barbora (203 Česká republika, garant, domácí) -- Šebestová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Šustr, Vilém (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika) -- Strnad, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Daniel, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika) -- Pavelka, Antonín (203 Česká republika) -- Maňák, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Bezděka, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Beneš, Petr (203 Česká republika) -- Kotry, Matúš (703 Slovensko, domácí) -- Gora, Artur Wiktor (616 Polsko, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Sochor, Jiří (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Software; interactive visualization; tunnels; channels; cavities; protein structures.
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 13. 1. 2022 11:14.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1231908/cs -
KOZLÍKOVÁ, Barbora, Eva ŠEBESTOVÁ, Vilém ŠUSTR, Jan BREZOVSKÝ, Ondřej STRNAD, Lukáš DANIEL, David BEDNÁŘ, Antonín PAVELKA, Martin MANAK, Martin BEZDĚKA, Petr BENEŠ, Matúš KOTRY, Artur Wiktor GORA, Jiří DAMBORSKÝ a Jiří SOCHOR. CAVER Analyst 1.0: Graphic tool for interactive visualization and analysis of tunnels and channels in protein structures. Bioinformatics. Oxford University Press, 2014, roč. 30, č. 18, s. 2684-2685. ISSN 1367-4803. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btu364.
Název česky: CAVER Analyst 1.0: Grafický nástroj pro interaktivní vizualizaci a analýzu tunelů a kanálů v proteinech
Název anglicky: CAVER Analyst 1.0: Graphic tool for interactive visualization and analysis of tunnels and channels in protein structures
RIV/00216224:14330/14:00073649 Článek v odborném periodiku. Informatika. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Kozlíková, Barbora (203 Česká republika, domácí) -- Šebestová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Šustr, Vilém (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Strnad, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Daniel, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Pavelka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Manak, Martin (203 Česká republika) -- Bezděka, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Beneš, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Kotry, Matúš (703 Slovensko, domácí) -- Gora, Artur Wiktor (616 Polsko, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Sochor, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: protein; visualization; tunnel; cavity
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Ing. Jiří Sochor, CSc., učo 2446. Změněno: 21. 6. 2015 20:05.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1184047/cs -
Computer-Assisted Engineering of Synthetic Pathway for Biodegradation of Toxic Persistent Pollutant.KURUMBANG, Nagendra Prasad, Pavel DVOŘÁK, Jaroslav BENDL, Jan BREZOVSKÝ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Computer-Assisted Engineering of Synthetic Pathway for Biodegradation of Toxic Persistent Pollutant. ACS Synthetic Biology. 2014, roč. 3, č. 3, s. 172-181. ISSN 2161-5063. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/sb400147n.
RIV/00216224:14310/14:00074211 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Kurumbang, Nagendra Prasad (524 Nepál, domácí) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Bendl, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: activity; enantioselectivity; kinetic modeling; protein and metabolic engineering;synthetic pathway; toxicity
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 21. 3. 2017 08:03.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1213471/cs -
SYKORA, J., Jan BREZOVSKÝ, Táňa KOUDELÁKOVÁ, M. LAHODA, Andrea FOŘTOVÁ, T. CHERNOVETS, Radka CHALOUPKOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Zbyněk PROKOP, I. KUTA SMATANOVA, M. HOF a Jiří DAMBORSKÝ. Dynamics and Hydration Explain Failed Functional Transformation in Dehalogenase Design. Nature Chemical Biology. 2014, roč. 10, č. 6, s. 428-430. ISSN 1552-4450.
RIV/00216224:14310/14:00074209 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Sykora, J. (203 Česká republika) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Lahoda, M. (112 Bělorusko) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Chernovets, T. (112 Bělorusko) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Štěpánková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Kuta Smatanova, I. (203 Česká republika) -- Hof, M. (276 Německo) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 21. 3. 2017 08:04.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1213468/cs -
DVOŘÁK, Pavel, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Geneticky modifikovaná bakterie degradující toxické environmentalní polutanty Ps. putida CF4 deg31. 2014.
Název anglicky: Engineered bacterium degrading toxic environmental pollutant Ps. putida CF4 deg31 –glpR
RIV/00216224:14310/14:00073326 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Ps. putida; Engineered bacterium
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 3. 4. 2015 20:10.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1231889/cs -
DVOŘÁK, Pavel, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Geneticky modifikovaná bakterie Pseudomonas putida CF4 deg 31 pro degradaci toxického environmentálního polutantu 1,2,3-trichlorpropanu na chromosomu. 2014.
Název anglicky: Engineered bacterium degrading toxic environmental pollutant Ps. putida CF4 deg31 chromosome
RIV/00216224:14310/14:00073327 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Pseudomonas putida CF4 deg 31
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 5. 4. 2015 10:51.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1231891/cs -
DVOŘÁK, Pavel, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Geneticky modifikovaná bakterie Pseudomonas putida CF4 pro degradaci toxického environmentálního polutantu 1,2,3-trichlorpropanu na plasmidu. 2014.
Název anglicky: Engineered bacterium degrading toxic environmental pollutant Ps. putida CF4 deg31 plasmid
RIV/00216224:14310/14:00073328 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Pseudomonas putida CF4;1-2-3-trichloropropane
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 5. 4. 2015 10:51.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1231896/cs -
DVOŘÁK, Pavel, Šárka BIDMANOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Immobilized Synthetic Pathway for Biodegradation of Toxic Recalcitrant Pollutant 1,2,3-Trichloropropane. Environmental Science & Technology. 2014, roč. 48, č. 12, s. 6859-6866. ISSN 0013-936X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/es500396r.
RIV/00216224:14310/14:00074204 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Bidmanová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: 1;2;3-trichloropropane; engineered haloalkane dehalogenase; Rhodococcus rhodochrous;
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 21. 3. 2017 08:00.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1213449/cs -
DVOŘÁK, Pavel, Nagendra Prasad KURUMBANG, Jaroslav BENDL, Jan BREZOVSKÝ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Maximizing the Efficiency of Multi-enzyme Process by Stoichiometry Optimization. ChemBioChem. WEINHEIM: WILEY-VCH, 2014, roč. 15, č. 13, s. 1891-1895. ISSN 1439-4227. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cbic.201402265.
RIV/00216224:14310/14:00074203 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Německo.
Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Kurumbang, Nagendra Prasad (524 Nepál, domácí) -- Bendl, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: biocatalysis; engineered enzymes
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 21. 3. 2017 07:35.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1213428/cs -
BIDMANOVÁ, Šárka, Eva HRDLIČKOVÁ, Josef JAROŠ, Ladislav ILKOVICS, Aleš HAMPL, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Microscopic Monitoring Provides Information on Structure and Properties During Biocatalyst Immobilisation. Biotechnology Journal. WEINHEIM, GERMANY: WILEY-V C H VERLAG GMBH, 2014, roč. 9, č. 6, s. 852-860. ISSN 1860-6768. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/biot.201300049.
RIV/00216224:14310/14:00074208 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Německo.
Bidmanová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Hrdličková, Eva (203 Česká republika) -- Jaroš, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Ilkovics, Ladislav (203 Česká republika, domácí) -- Hampl, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Cross-linked enzyme aggregates; Immobilization; Microscopy; Polyvinyl alcohol; Structure
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 21. 3. 2017 08:05.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1213465/cs -
VAŇÁČEK, Pavel, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Rekombinantní enzym haloalkane dehalogenase HTS001. 2014.
Název česky: Rekombinantní enzym haloalkane dehalogenase HTS001
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase HTS001
RIV/00216224:14310/14:00073319 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Vaňáček, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase; HTS001
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 5. 4. 2015 10:52.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1231875/cs -
VAŇÁČEK, Pavel, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Rekombinantní enzym haloalkane dehalogenase HTS003. 2014.
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase HTS003
RIV/00216224:14310/14:00073320 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Vaňáček, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase; HTS003
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 5. 4. 2015 10:52.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1231876/cs -
VAŇÁČEK, Pavel, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Rekombinantní enzym haloalkane dehalogenase HTS004. 2014.
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase HTS004
RIV/00216224:14310/14:00073321 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Vaňáček, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase; HTS004
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 5. 4. 2015 10:53.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1231877/cs -
VAŇÁČEK, Pavel, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Rekombinantní enzym haloalkane dehalogenase HTS005. 2014.
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase HTS005
RIV/00216224:14310/14:00073322 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Vaňáček, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase; HTS005
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 5. 4. 2015 10:54.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1231879/cs -
VAŇÁČEK, Pavel, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Rekombinantní enzym haloalkane dehalogenase HTS006. 2014.
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase HTS006
RIV/00216224:14310/14:00073324 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Vaňáček, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase; HTS006
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 5. 4. 2015 10:54.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1231884/cs -
VAŇÁČEK, Pavel, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Rekombinantní enzym haloalkane dehalogenase HTS010. 2014.
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase HTS010
RIV/00216224:14310/14:00073323 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Vaňáček, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase; HTS010
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 5. 4. 2015 10:55.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1231883/cs -
VAŇÁČEK, Pavel, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Rekombinantní enzym haloalkane dehalogenase HTS013. 2014.
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase HTS013
RIV/00216224:14310/14:00073325 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Vaňáček, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase; HTS013
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 5. 4. 2015 10:55.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1231886/cs -
MORIUCHI, Ryota, Hiroki TANAKA, Yuki NIKAWADORI, Mayuko ISHITSUKA, Michihiro ITO, Yoshiyuki OHTSUBO, Masataka TSUDA, Jiří DAMBORSKÝ, Zbyněk PROKOP a Yuji NAGATA. Stepwise Enhancement of Catalytic Performance of Haloalkane Dehalogenase LinB towards Beta-Hexachlorocyclohexane. Applied Microbiology and Biotechnology Express. London: Springer, 2014, roč. 4, č. 72, s. 1-10. ISSN 2191-0855. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13568-014-0072-5.Full Text
RIV/00216224:14310/14:00074201 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Moriuchi, Ryota (392 Japonsko) -- Tanaka, Hiroki (392 Japonsko) -- Nikawadori, Yuki (392 Japonsko) -- Ishitsuka, Mayuko (392 Japonsko) -- Ito, Michihiro (392 Japonsko) -- Ohtsubo, Yoshiyuki (392 Japonsko) -- Tsuda, Masataka (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko)
Klíčová slova anglicky: beta -Hexachlorocyclohexane; Xenobiotics; Biodegradation; Haloalkane dehalogenase; Protein evolution
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 6. 12. 2019 09:14.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1213423/cs -
Structural and Functional Analysis of a Novel Haloalkane Dehalogenase with Two Halide-Binding Sites.CHALOUPKOVÁ, Radka, T. PRUDNIKOVA, P. REZACOVA, Zbyněk PROKOP, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Lukáš DANIEL, Jan BREZOVSKÝ, W. IKEDA-OHTSUBO, Y. SATO, M. KUTY, Y. NAGATA, I. KUTA SMATANOVA a Jiří DAMBORSKÝ. Structural and Functional Analysis of a Novel Haloalkane Dehalogenase with Two Halide-Binding Sites. Acta Crystallographica D. 2014, roč. 70, July, s. 1884-1897. ISSN 0907-4449. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1107/S1399004714009018.
RIV/00216224:14310/14:00074206 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prudnikova, T. (112 Bělorusko) -- Rezacova, P. (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Daniel, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Ikeda-Ohtsubo, W. (392 Japonsko) -- Sato, Y. (392 Japonsko) -- Kuty, M. (203 Česká republika) -- Nagata, Y. (392 Japonsko) -- Kuta Smatanova, I. (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase DbeA from Bradyrhizobium elkanii USDA94
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 11. 4. 2015 15:07.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1213460/cs -
DVOŘÁK, Pavel, Jan BREZOVSKÝ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. E. coli degWT upravená bakterie degradující toxické environmentální polutanty. 2013.
Název anglicky: Engineered bacterium degrading toxic environmental pollutant E. coli degWT
RIV/00216224:14310/13:00065837 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Escherichia coli; 1/2-3-trichlorpropanu.
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 7. 4. 2014 13:46.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1173299/cs -
DVOŘÁK, Pavel, Jan BREZOVSKÝ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. E. coli degWT-opt- upravená bakterie degradující toxické environmentální polutanty. 2013.
Název česky: E. coli degWT-opt- upravená bakterie degradující toxické environmentální polutanty.
Název anglicky: Engineered bacterium degrading toxic environmental pollutant E. coli degWT-opt
RIV/00216224:14310/13:00065838 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: 1-2-3-trichloropropane; metabolic pathway
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 7. 4. 2014 13:46.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1173301/cs -
DVOŘÁK, Pavel, Jan BREZOVSKÝ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. E. coli deg31 upravená bakterie degradující toxické environmentální polutanty. 2013.
Název anglicky: Engineered bacterium degrading toxic environmental pollutant E. coli deg31
RIV/00216224:14310/13:00065841 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: 1/2/3-trichlorpropan; synthetic metabolic pathway
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 7. 4. 2014 13:47.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1173308/cs -
DVOŘÁK, Pavel, Jan BREZOVSKÝ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. E. coli deg31-opt upravená bakterie degradující toxické environmentální polutanty. 2013.
Název anglicky: Engineered bacterium degrading toxic environmental pollutant E. coli deg31-opt
RIV/00216224:14310/13:00065842 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: 1/2/3-trichlorpropan; degradation; Escherichia coli
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 7. 4. 2014 13:47.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1173313/cs -
DVOŘÁK, Pavel, Jan BREZOVSKÝ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. E. coli deg90R upravená bakterie degradující toxické environmentální polutanty. 2013.
Název anglicky: Engineered bacterium degrading toxic environmental pollutant E. coli deg90R
RIV/00216224:14310/13:00065839 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Escherichia coli; degradation; 1/2/3-trichlorpropanu
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 7. 4. 2014 13:48.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1173303/cs -
DVOŘÁK, Pavel, Jan BREZOVSKÝ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. E. coli deg90R-opt upravená bakterie degradující toxické environmentální polutanty. 2013.
Název anglicky: Engineered bacterium degrading toxic environmental pollutant E. coli deg90R-opt
RIV/00216224:14310/13:00065840 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: 1/2/3-trichlorpropan; modified bacterium Escherichia coli
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 7. 4. 2014 13:48.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1173306/cs -
KOUDELÁKOVÁ, Táňa, Radka CHALOUPKOVÁ, Jan BREZOVSKÝ, Zbyněk PROKOP, Eva ŠEBESTOVÁ, M. HESSELER, M. KHABIRI, M. PLEVAKA, D. KULIK, I. KUTA SMATANOVA, P. REZACOVA, R. ETTRICH, U.T. BORNSCHEUER a Jiří DAMBORSKÝ. Engineering Enzyme Stability and Resistance to an Organic Cosolvent by Modification of Residues in the Access Tunnel. Angewandte Chemie International Edition. Verlag Chemie, 2013, roč. 52, č. 7, s. 1959-1963. ISSN 1433-7851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/anie.201206708.
RIV/00216224:14310/13:00066682 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Německo.
Koudeláková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Šebestová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Hesseler, M. (203 Česká republika) -- Khabiri, M. (364 Írán) -- Plevaka, M. (203 Česká republika) -- Kulik, D. (203 Česká republika) -- Kuta Smatanova, I. (203 Česká republika) -- Rezacova, P. (203 Česká republika) -- Ettrich, R. (276 Německo) -- Bornscheuer, U.T. (276 Německo) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkan dehalogenases
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Šebestová, Ph.D., učo 40707. Změněno: 26. 6. 2014 12:58.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1138880/cs -
ŠTĚPÁNKOVÁ, Veronika, M. KHABIRI, Jan BREZOVSKÝ, Antonín PAVELKA, J. SYKORA, M. AMARO, B. MINOFAR, Zbyněk PROKOP, M. HOF, R. ETTRICH, Radka CHALOUPKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Expansion of Access Tunnels and Active-Site Cavities Influence Activity of Haloalkane Dehalogenases in Organic Cosolvents. ChemBioChem. WEINHEIM: WILEY-VCH, 2013, roč. 14, č. 7, s. 890-897. ISSN 1439-4227. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cbic.201200733.
RIV/00216224:14310/13:00065821 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Německo.
Štěpánková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Khabiri, M. (364 Írán) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Pavelka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Sykora, J. (203 Česká republika) -- Amaro, M. (364 Írán) -- Minofar, B. (364 Írán) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Hof, M. (203 Česká republika) -- Ettrich, R. (276 Německo) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenases
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Zdeňka Rašková, učo 140529. Změněno: 29. 4. 2014 14:21.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1138864/cs -
KOUDELÁKOVÁ, Táňa, Šárka BIDMANOVÁ, Pavel DVOŘÁK, Antonín PAVELKA, Radka CHALOUPKOVÁ, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Haloalkane dehalogenases: Biotechnological applications. Biotechnology Journal. HOBOKEN: WILEY-BLACKWELL, 2013, roč. 8, č. 1, s. 32-45, 15 s. ISSN 1860-6768. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/biot.201100486.
RIV/00216224:14310/13:00066570 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Koudeláková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Bidmanová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Pavelka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Biocatalysis; Biodegradation; Biosensors; Cell imaging; Protein analysis
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 4. 4. 2014 12:37.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1132126/cs -
BIDMANOVÁ, Šárka, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Immobilization of Haloalkane Dehalogenase LinB from Sphingobium japonicum UT26 for Biotechnological Applications. Journal of Biocatalysis & Biotransformation. 2013, roč. 2, č. 2, s. 1-7. ISSN 2324-9099.
RIV/00216224:14310/13:00065829 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Bidmanová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Haloalkane Dehalogenase
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 10. 1. 2014 10:48.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1139332/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, F. OPLUŠTIL, Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2013. Patent. Číslo: EP 1899022. Název vlastníka: MU. Datum přijetí: 9. 10. 2013.
RIV/00216224:14310/13:00072743 Patent. Biochemie. angličtina. Německo.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Opluštil, F. (203 Česká republika) -- Jesenská, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko)
Klíčová slova anglicky: yperite; haloalkane dehalogenases
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 19. 5. 2014 12:42.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1173285/cs -
DAMBORSKÝ, Jiří, Zbyněk PROKOP, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Eva CHOVANCOVÁ, Jan BREZOVSKÝ a Artur Wiktor GORA. Method of Thermostabilization of a Protein And/or Stabilization Towards Organic Solvents. 2013. Patent. Číslo: US 8,580,932. Vydavatel: USTPO (Úřad pro patenty a ochranné známky USA). Název vlastníka: MU. Datum registrace: 5. 9. 2012. Datum přijetí: 12. 11. 2013.
RIV/00216224:14310/13:00072736 Patent. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Štěpánková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Chovancová, Eva (203 Česká republika) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Gora, Artur Wiktor (616 Polsko)
Klíčová slova anglicky: Thermostabilization; Protein Stabilization; Organic Solvents
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 25. 3. 2014 18:21.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1173264/cs -
Název anglicky: Miniaturized portable fluorimeter
RIV/00216224:14310/13:00065835 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Bidmanová, Šárka (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: fluorimeter; haloalkane dehalogenases
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 7. 4. 2014 13:49.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1173290/cs -
NIHARIKA, Neha, Hana MOSKALÍKOVÁ, Jasvinder KAUR, Miroslava SEDLÁČKOVÁ, Aleš HAMPL, Jiří DAMBORSKÝ, Zbyněk PROKOP a Rup LAL. Novosphingobium barchaimii sp nov., isolated from hexachlorocyclohexane-contaminated soil. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. SOC GENERAL MICROBIOLOGY, 2013, roč. 63, Part 2, s. 667-672. ISSN 1466-5026. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1099/ijs.0.039826-0.
RIV/00216224:14310/13:00065825 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Niharika, Neha (356 Indie) -- Moskalíková, Hana (203 Česká republika) -- Kaur, Jasvinder (356 Indie) -- Sedláčková, Miroslava (203 Česká republika, domácí) -- Hampl, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Lal, Rup (356 Indie)
Klíčová slova anglicky: IDENTIFICATION; MICROORGANISMS; SPHINGOMONAS; SPHINGOBIUM; ACID
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 5. 3. 2014 15:33.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1138890/cs -
PROKOP, Zbyněk, Radka CHALOUPKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Rekombinantní enzym haloalkan dehalogenáza DatA. 2013.
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DatA
RIV/00216224:14310/13:00065843 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase DatA;
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 7. 4. 2014 13:50.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1173314/cs -
CHALOUPKOVÁ, Radka, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Rekombinantní enzym haloalkan dehalogenáza DspA. 2013.
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DspA.
RIV/00216224:14310/13:00065844 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. čeština. Česká republika.
Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase DspA
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 7. 4. 2014 13:50.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1173317/cs -
HLADILKOVA, J., Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ a P. JUNGWIRTH. Release of Halide Ions from the Buried Active Site of the Haloalkane Dehalogenase LinB Revealed by Stopped-Flow Fluorescence Analysis and Free Energy Calculations. Journal of Physical Chemistry B. 2013, roč. 117, č. 46, s. 14329–14335. ISSN 1520-6106. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jp409040u.
RIV/00216224:14310/13:00067017 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
Hladilkova, J. (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Jungwirth, P. (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Haloalkane Dehalogenase LinB
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 9. 4. 2014 11:42.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1170226/cs -
KAUR, Jasvinder, Hana MOSKALÍKOVÁ, Neha NIHARIKA, Miroslava SEDLÁČKOVÁ, Aleš HAMPL, Jiří DAMBORSKÝ, Zbyněk PROKOP a Rup LAL. Sphingobium baderi sp nov., isolated from a hexachlorocyclohexane dump site. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. SOC GENERAL MICROBIOLOGY, 2013, roč. 63, Part 2, s. 673-678. ISSN 1466-5026. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1099/ijs.0.039834-0.
RIV/00216224:14310/13:00065826 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Kaur, Jasvinder (356 Indie) -- Moskalíková, Hana (203 Česká republika) -- Niharika, Neha (356 Indie) -- Sedláčková, Miroslava (203 Česká republika, domácí) -- Hampl, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Lal, Rup (356 Indie)
Klíčová slova anglicky: SPHINGOMONAS; DEGRADATION; MICROORGANISMS; IDENTIFICATION; SEQUENCE; STRAIN; ACID
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 5. 3. 2014 15:40.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1138893/cs -
NIHARIKA, Neha, Hana MOSKALÍKOVÁ, Jasvinder KAUR, Fazlurrahman KHAN, Miroslava SEDLÁČKOVÁ, Aleš HAMPL, Jiří DAMBORSKÝ, Zbyněk PROKOP a Rup LAL. Sphingobium czechense sp nov., isolated from a hexachlorocyclohexane dump site. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. SOC GENERAL MICROBIOLOGY, 2013, roč. 63, Part 2, s. 723-728. ISSN 1466-5026. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1099/ijs.0.039396-0.
RIV/00216224:14310/13:00065824 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Niharika, Neha (356 Indie) -- Moskalíková, Hana (203 Česká republika) -- Kaur, Jasvinder (356 Indie) -- Khan, Fazlurrahman (356 Indie) -- Sedláčková, Miroslava (203 Česká republika, domácí) -- Hampl, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Lal, Rup (356 Indie)
Klíčová slova anglicky: LIN GENES; SPHINGOMONAS; IDENTIFICATION; DEGRADATION; ACID; MICROORGANISMS; PHYLOGENY; BACTERIA; STRAIN; SOILS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 5. 3. 2014 15:22.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1138887/cs -
ŠTĚPÁNKOVÁ, Veronika, Šárka BIDMANOVÁ, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Strategies for Stabilization and Activation of Biocatalysts in Organic Solvents. ACS Catalysis. 2013, roč. 3, č. 12, s. 2823-2836. ISSN 2155-5435. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/cs400684x.
RIV/00216224:14310/13:00067016 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Štěpánková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Bidmanová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: biocatalysis;enzyme stability; organic solvents; chemical modi fi cations; enzyme immobilization; protein engineering
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 29. 4. 2014 11:24.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1170225/cs -
HASAN, Khomaini, Artur Wiktor GORA, Jan BREZOVSKÝ, Radka CHALOUPKOVÁ, Hana MOSKALÍKOVÁ, Andrea FOŘTOVÁ, Yuji NAGATA, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. The Effect of a Unique Halide-Stabilising Residue on the Catalytic Properties of Haloalkane Dehalogenase DatA from Agrobacterium tumefaciens C58. FEBS Journal. Blackwell, 2013, roč. 280, č. 13, s. 3149-3159. ISSN 1742-464X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/febs.12238.
RIV/00216224:14310/13:00065822 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Hasan, Khomaini (360 Indonésie, domácí) -- Gora, Artur Wiktor (616 Polsko, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Moskalíková, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Haloalkane Dehalogenase
Změnila: Ing. Zdeňka Rašková, učo 140529. Změněno: 29. 4. 2014 14:23.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1138865/cs -
BIEDERMANNOVÁ, Lada, Zbyněk PROKOP, Artur Wiktor GORA, Eva CHOVANCOVÁ, Mihály KOVÁCS, Jiří DAMBORSKÝ a Rebecca C. WADE. A Single Mutation in a Tunnel to the Active Site Changes the Mechanism and Kinetics of Product Release in Haloalkane Dehalogenase LinB. The Journal of Biological Chemistry. USA, 2012, roč. 287, č. 34, s. 29062-29074. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.M112.377853.
RIV/00216224:14310/12:00057142 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
Biedermannová, Lada (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Gora, Artur Wiktor (616 Polsko, domácí) -- Chovancová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Kovács, Mihály (348 Maďarsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Wade, Rebecca C. (276 Německo)
Klíčová slova anglicky: HLD; haloalkane dehalogenase; MD; molecular dynamics; RAMD; random acceleration molecular dynamics; ABF; adaptive biasing force; RC; reaction coordinate; FEP; free energy perturbation; NATA; N-acetyltryptophan amide
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 22. 4. 2013 15:09.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1082672/cs -
BIDMANOVÁ, Šárka, Antonín HLAVÁČEK, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Conjugation of 5(6)-carboxyfluorescein and 5(6)-carboxynaphthfluorescein with bovine serum albumin and their immobilization for optical pH sensing. SENSORS AND ACTUATORS B: CHEMICAL. 2012, roč. 161, č. 1, s. 93-99. ISSN 0925-4005. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.snb.2011.09.046.
RIV/00216224:14310/12:00062930 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Švýcarsko.
Bidmanová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Hlaváček, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: pH indicator Fluorescence Optical sensor Immobilization Conjugation Fluorescein
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 22. 4. 2013 15:19.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1082690/cs -
CHALOUPKOVÁ, Radka, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a Táňa KOUDELÁKOVÁ. Engineered recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DhaA57. 2012.
RIV/00216224:14310/12:00064436 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase;DhaA57
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 8. 4. 2013 12:37.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1092397/cs -
CHALOUPKOVÁ, Radka, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a Táňa KOUDELÁKOVÁ. Engineered recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DhaA61. 2012.
RIV/00216224:14310/12:00064437 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase;DhaA61
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 8. 4. 2013 12:38.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1092398/cs -
CHALOUPKOVÁ, Radka, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a Táňa KOUDELÁKOVÁ. Engineered recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DhaA63. 2012.
RIV/00216224:14310/12:00064438 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase;DhaA63
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 8. 4. 2013 12:39.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1092399/cs -
CHALOUPKOVÁ, Radka, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a Táňa KOUDELÁKOVÁ. Engineered recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DhaA80. 2012.
RIV/00216224:14310/12:00064439 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase; DhaA80
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 8. 4. 2013 12:40.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1092401/cs -
CHALOUPKOVÁ, Radka, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a Táňa KOUDELÁKOVÁ. Engineered recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DhaA82. 2012.
RIV/00216224:14310/12:00064440 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase;DhaA82
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 9. 4. 2014 13:37.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1092402/cs -
CHALOUPKOVÁ, Radka, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a Táňa KOUDELÁKOVÁ. Engineered recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DhaA85. 2012.
RIV/00216224:14310/12:00064441 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase; DhaA85
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 8. 4. 2013 12:41.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1092403/cs -
CHALOUPKOVÁ, Radka, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a Táňa KOUDELÁKOVÁ. Engineered recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DhaA88. 2012.
RIV/00216224:14310/12:00064442 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase;DhaA88
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 8. 4. 2013 12:42.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1092405/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, F. OPLUŠTIL, Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2012. Patent. Číslo: CA 2610024. Název vlastníka: MU. Datum přijetí: 26. 6. 2012.
RIV/00216224:14310/12:00072742 Patent. Biochemie. angličtina. Kanada.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Opluštil, F. (203 Česká republika) -- Jesenská, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko)
Klíčová slova anglicky: yperite; haloalkane dehalogenases
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 19. 5. 2014 12:51.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1173282/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, F. OPLUŠTIL, Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2012. Patent. Číslo: IL 186596. Název vlastníka: MU. Datum přijetí: 1. 5. 2012.
RIV/00216224:14310/12:00072741 Patent. Biochemie. angličtina. Izrael.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Opluštil, F. (203 Česká republika) -- Jesenská, Andrea (203 Česká republika) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko)
Klíčová slova anglicky: yperite; haloalkane dehalogenases
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 19. 5. 2014 12:50.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1173281/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, Filip OPLUŠTIL, Andrea FOŘTOVÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2012. Patent. Číslo: IL 186596. Vydavatel: Israeli Patent Office. Místo vydání: Israel. Název vlastníka: Masarykova univerzita. Datum registrace: 11. 10. 2007. Datum přijetí: 31. 1. 2012.
Název anglicky: Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases
Biochemie. angličtina. Izrael. obsah podléhá obchodnímu tajemství.
Klíčová slova anglicky: yperite; haloalkane dehalogenases
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 7. 4. 2014 13:36.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/978445/cs -
SEDLACEK, Jiri, Šárka BIDMANOVÁ, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ, Bretislav MIKEL a Jaromir HUBALEK. Analyzer for Fluorescent Biosensing Application. Online. In Franz, M Nicolics, J Pietrikova, A. 2011 34TH INTERNATIONAL SPRING SEMINAR ON ELECTRONICS TECHNOLOGY (ISSE 2011) - NEW TRENDS IN MICRO/NANOTECHNOLOGY. NEW YORK: IEEE, 2011, s. 600-603. ISBN 978-1-4577-2110-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/ISSE.2011.6053958.URL
RIV: Stať ve sborníku. angličtina. Spojené státy.
Bidmanová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Biosensing applications; Fluorescence analyzer; Fluorescence emission
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 31. 8. 2020 10:24.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1676316/cs -
DAMBORSKÝ, Jiří, Pavel DVOŘÁK, Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ, Martina PAVLOVÁ, Martin KLVAŇA, Michal OTYEPKA, R .C. WADE, Z. NAGATA, Eva HRDLIČKOVÁ a R. STLOUKAL. Biodegradation of 1,2,3-Trichloropropane. In Recent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexachlorocyclohexane (HCH) & Other Chlorinated Contaminants. 2011.
RIV/00216224:14310/11:00049449 Vyžádané přednášky. Biochemie. angličtina. Indonésie.
Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Pavlová, Martina (203 Česká republika) -- Klvaňa, Martin (203 Česká republika) -- Otyepka, Michal (203 Česká republika) -- Wade, R .C. (276 Německo) -- Nagata, Z. (392 Japonsko) -- Hrdličková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Stloukal, R. (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: 1.2.3-Trichloropropane; degradation
Druh účasti: vyžádaná přednáška
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 12. 12. 2011 11:40.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/947520/cs -
HASAN, Khomaini, Andrea FOŘTOVÁ, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, M. ISHITSUKA, Yuji NAGATA, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Biochemical Characteristics of the Novel Haloalkane Dehalogenase DatA Isolated from the Plant Pathogen Agrobacterium tumefaciens C58. Applied and Environmental Microbiology. 2011, roč. 77, č. 5, s. 1881-1884. ISSN 0099-2240. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1128/AEM.02109-10.
RIV/00216224:14310/11:00049448 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Hasan, Khomaini (360 Indonésie, domácí) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Ishitsuka, M. (392 Japonsko) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Novel Haloalkane Dehalogenase DatA ;Agrobacterium tumefaciens C58
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 20. 4. 2012 10:38.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/947515/cs -
BIEDERMANNOVÁ, Lada, Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ, Pavel DVOŘÁK, Jiří DAMBORSKÝ a R. WAADE. Biology and Bioinformatics. 2011.
RIV/00216224:14310/11:00049442 Prezentace na konferencích. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Biedermannová, Lada (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Waade, R. (276 Německo)
Klíčová slova anglicky: molecular modelling; protein engineering; bioinformatics
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 1. 2012 14:32.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/947500/cs -
DAMBORSKÝ, Jiří, Pavel DVOŘÁK, Radka CHALOUPKOVÁ a Zbyněk PROKOP. Construction of pollutant-degrading bacteria by protein and metabolic engineering. 2011.
RIV/00216224:14310/11:00049444 Vyžádané přednášky. Biochemie. angličtina. Švýcarsko.
Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Protein Engineering; Enzymes; Pollutant;
Druh účasti: vyžádaná přednáška
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 1. 2012 14:34.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/947504/cs -
Název česky: Dekontaminační kit Yperzym
RIV/00216224:14310/11:00056627 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Yperzyme Kit; LinB; Sphingobium japonicum UT26
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 13. 6. 2013 14:36.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/977471/cs -
HUBÁLEK, Jaromír, Jiří SEDLÁČEK, Zbyněk PROKOP, Šárka BIDMANOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Fluorimetr pro biosensorové měření. 2011.
Název anglicky: Fluorimetr for biosensing measurements
RIV/00216224:14310/11:00056634 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Optika, masery a lasery. čeština. Česká republika.
Hubálek, Jaromír (203 Česká republika) -- Sedláček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bidmanová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Fluorimetr; measurements
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 13. 6. 2013 14:31.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/977510/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, Eva HRDLIČKOVÁ a Pavel TRTÍLEK. HaloPen. 2011.
Název česky: HaloPen
Název anglicky: HaloPen
RIV/00216224:14310/11:00056635 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Optika, masery a lasery. angličtina. Česká republika.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Hrdličková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Trtílek, Pavel (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: monitoring; halogenated hydrocarbons;
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 13. 6. 2013 14:32.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/977511/cs -
DVOŘÁK, Pavel, Zbyněk PROKOP, Jan BREZOVSKÝ, David BEDNÁŘ, Šárka BIDMANOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. In vitro protein and metabolic engineering of a biodegradation pathway. In Biotrans 2011. 2011.
RIV/00216224:14310/11:00049445 Prezentace na konferencích. Biochemie. angličtina. Itálie.
Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Bednář, David (203 Česká republika, domácí) -- Bidmanová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: protein; metabolic engineering; haloakan dehalogenases
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 1. 2012 14:40.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/947505/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, František OPLUŠTIL, Andrea FOŘTOVÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2011. Patent. Číslo: US 7,888,103. Vydavatel: Úřad pro patenty a ochranné známky USA. Místo vydání: USA. Název vlastníka: MU. Datum registrace: 1. 6. 2006. Datum přijetí: 15. 2. 2011.
Název česky: Způsob detoxikace sulfidického yperitu působením halogenalkandehalogenáz
Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Klíčová slova anglicky: yperite; haloalkane dehalogenases
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 7. 4. 2014 13:44.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/952460/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, F. OPLUŠTIL, Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases,. 2011. Patent. Číslo: US 7,888,103. Název vlastníka: MU. Datum přijetí: 15. 2. 2011.
RIV/00216224:14310/11:00072740 Patent. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Opluštil, F. (203 Česká republika) -- Jesenská, Andrea (203 Česká republika) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko)
Klíčová slova anglicky: yperite; haloalkane dehalogenases
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 19. 5. 2014 12:50.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1173280/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, František OPLUŠTIL, Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases,. 2011. Patent. Číslo: JP 4793947. Vydavatel: Japonský patentový úřad. Místo vydání: Japonsko. Název vlastníka: MU. Datum registrace: 1. 6. 2006. Datum přijetí: 5. 8. 2011.
Název česky: Způsov detoxikace sulfidického yperitupůsobením halogenalkandehalogenáz
RIV/00216224:14310/11:00053385 Patent. Biochemie. angličtina. Japonsko.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Opluštil, František (203 Česká republika) -- Jesenská, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko)
Klíčová slova anglicky: yperite; haloalkane dehalogenases
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 19. 5. 2014 12:49.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/952456/cs -
SATO, Yukari, Zbyněk PROKOP, Jan BREZOVSKÝ, Ryo NATSUME, Yuji NAGATA, Jiří DAMBORSKÝ a Toshiya SENDA. Molecular bases of enantioselectivity of haloalkane dehalogenase DbjA. In Annual Meeting of American Crystallographic Association, New Orleans, USA,. 2011.
RIV/00216224:14310/11:00052843 Prezentace na konferencích. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Sato, Yukari (392 Japonsko, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Natsume, Ryo (392 Japonsko) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Senda, Toshiya (392 Japonsko)
Klíčová slova anglicky: Haloalkan Dehalogenases; Enantioselektivity
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 1. 2012 14:44.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/947507/cs -
ŠTĚPÁNKOVÁ, Veronika, Radka CHALOUPKOVÁ, M. KHABIRI, Jan BREZOVSKÝ, Zbyněk PROKOP, Rudiger ETTRICH a Jiří DAMBORSKÝ. Molecular mechanisms of the effects of organic solvents on activity of haloalkane dehalogenases. 2011.
Název česky: Molekulární mechanismy účinků organických rozpouštědel na aktivitu haloalkan dehalogenáz.
RIV/00216224:14310/11:00050323 Prezentace na konferencích. Biochemie. angličtina. Itálie.
Štěpánková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Khabiri, M. (364 Írán) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Ettrich, Rudiger (276 Německo) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Molecular mechanisms;haloalkane dehalogenases
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 1. 2012 09:53.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/964619/cs -
ŠTĚPÁNKOVÁ, Veronika, Radka CHALOUPKOVÁ, Morteza KHABIRI, Jan BREZOVSKÝ, Zbyněk PROKOP, Rudiger ETTRICH a Jiří DAMBORSKÝ. Molekulární podstata působení organických rozpouštědel na strukturu a funkci haloalkandehalogenáz. 2011.
Název anglicky: Molecular mechanisms of the effects of organic solvents on activity of haloalkane dehalogenases
RIV/00216224:14310/11:00049503 Prezentace na konferencích. Biochemie. čeština. Česká republika.
Štěpánková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Khabiri, Morteza (364 Írán) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Ettrich, Rudiger (276 Německo) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenases; organic solvents
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 1. 2012 10:04.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/964622/cs -
DAMBORSKÝ, Jiří, Zbyněk PROKOP a Hana MOSKALÍKOVÁ. Novosphingobium barchaimii LL02 sp. nov. 2011.
Název anglicky: Novosphingobium barchaimii LL02 sp. nov
RIV/00216224:14310/11:00065783 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Mikrobiologie, virologie. angličtina. Česká republika.
Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Moskalíková, Hana (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Novosphingobium barchaimii
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 11. 4. 2014 14:01.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/977479/cs -
DAMBORSKÝ, Jiří, Radka CHALOUPKOVÁ a Zbyněk PROKOP. Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DmxA. 2011.
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DmxA
RIV/00216224:14310/11:00056628 Poloprovoz, ověřená technologie, odrůda, plemeno. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase; Marinobacter sp. ELB17;
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 13. 6. 2013 14:33.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/977472/cs -
DAMBORSKÝ, Jiří, Radka CHALOUPKOVÁ a Zbyněk PROKOP. Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DpcA. 2011.
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DpcA
RIV/00216224:14310/11:00056631 Poloprovoz, ověřená technologie, odrůda, plemeno. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase; DpcA
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 13. 6. 2013 14:34.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/977476/cs -
DAMBORSKÝ, Jiří, Radka CHALOUPKOVÁ a Zbyněk PROKOP. Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase Spur. 2011.
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase Spur
RIV/00216224:14310/11:00056629 Poloprovoz, ověřená technologie, odrůda, plemeno. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase; Spur
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 13. 6. 2013 14:35.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/977474/cs -
DAMBORSKÝ, Jiří, Zbyněk PROKOP a Hana MOSKALÍKOVÁ. Sphingobium baderi LL03 sp. nov. 2011.
Název anglicky: Sphingobium baderi LL03 sp. nov
RIV/00216224:14310/11:00065784 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Mikrobiologie, virologie. angličtina. Česká republika.
Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Moskalíková, Hana (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Sphingobium baderi
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 11. 4. 2014 14:01.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/977482/cs -
DAMBORSKÝ, Jiří, Zbyněk PROKOP a Hana MOSKALÍKOVÁ. Sphingobium czechense LL01 sp. nov. 2011.
Název anglicky: Sphingobium czechense LL01 sp. nov
RIV/00216224:14310/11:00065782 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Mikrobiologie, virologie. angličtina. Česká republika.
Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Moskalíková, Hana (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Sphingobium czechense
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 11. 4. 2014 14:02.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/977477/cs -
CHALOUPKOVÁ, Radka, Zbyněk PROKOP, Yukari SATO, Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Stereoselectivity and Conformational Stability of Haloalkane Dehalogenase DbjA from Bradyrhizobium japonicum USDA110: The Effect of pH and Temperature. FEBS Journal. 2011, roč. 278, č. 15, s. 2728-2738. ISSN 1742-464X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/j.1742-4658.2011.08203.x.
RIV/00216224:14310/11:00049446 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Sato, Yukari (392 Japonsko, domácí) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: DbJA; Enantioselectivity;Haloalkane Dehalogenase
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 20. 4. 2012 10:36.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/947512/cs -
MOZGA, Tomáš, T. PRUDNIKOVA, Radka CHALOUPKOVÁ, P. REZACOVA, Yukari SATO, Michal KUTÝ, Zbyněk PROKOP, Yuji NAGATA, Ivana KUTÁ-SMATANOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Biochemical and structural characterization of novel haloalkane dehalogenase DbeA from Bradyrhizobium elkani USDA94 possesing two halide binding sites. In 8th Discussion in Structural Molecular Biology and Bioinformatics. 2010.
Název anglicky: Biochemical and structural characterization of novel haloalkane dehalogenase DbeA from Bradyrhizobium elkani USDA94 possesing two halide binding sites
RIV/00216224:14310/10:00040602 Prezentace na konferencích. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Mozga, Tomáš (203 Česká republika) -- Prudnikova, T. (112 Bělorusko) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Rezacova, P. (203 Česká republika) -- Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Kutý, Michal (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Kutá-Smatanová, Ivana (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: Biochemical and structural characterization; haloalkane dehalogenase DbeA ; Bradyrhizobium elkani USDA94; halide binding sites
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 14. 10. 2010 10:28.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/902423/cs -
BIDMANOVÁ, Šárka, Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. CONSTRUCTION AND CHARACTERIZATION OF FIBER-OPTIC BIOSENSOR BASED ON HALOALKANE DEHALOGENASE. In Europt(r)ode X. 2010.
Název anglicky: CONSTRUCTION AND CHARACTERIZATION OF FIBER-OPTIC BIOSENSOR BASED ON HALOALKANE DEHALOGENASE
RIV/00216224:14310/10:00045109 Prezentace na konferencích. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Bidmanová, Šárka (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: HALOALKANE DEHALOGENASE; FIBER-OPTIC BIOSENSOR
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 19. 10. 2010 10:18.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/903198/cs -
LITERÁKOVÁ, Petra, Jan LOCHMAN, Zbyněk ZDRÁHAL, Zbyněk PROKOP, Vladimír MIKEŠ a Tomáš KAŠPAROVSKÝ. Determination of capsidiol in tobacco cells culture by HPLC. Journal of Chromatographic Science. 2010, roč. 48, č. 6, s. 436-440. ISSN 0021-9665.
Název česky: Stanovení capsidiolu v kalusových kulturách tabáku pomocí HPLC
RIV/00216224:14310/10:00042276 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Literáková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Lochman, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Mikeš, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Kašparovský, Tomáš (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Capsidiol Tobacco HPLC
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D., učo 10078. Změněno: 8. 12. 2015 09:34.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/815033/cs -
BIDMANOVÁ, Šárka, Radka CHALOUPKOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Development of an enzymatic fiber-optic biosensor for detection of halogenated hydrocarbons. Analytical and Bioanalytical Chemistry. Springer-Verlag, 2010, roč. 10, č. 1007, s. 1891-1898. ISSN 1618-2642.URL
Název anglicky: Development of an enzymatic fiber-optic biosensor for detection of halogenated hydrocarbons.
RIV/00216224:14310/10:00040599 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Německo.
Bidmanová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Enzyme-based biosensor; Haloalkane dehalogenase; Halogenated hydrocarbons; Optical biosensor; pH indicator
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 23. 3. 2012 10:58.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/902296/cs -
BIDMANOVÁ, Šárka, Michal POHANKA, J. CABAL, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. Early Warning Biosensors for Detection of Chemical Warfare Agents. CHEMICKE LISTY. Česká republika, 2010, roč. 104, č. 104, s. 302-308. ISSN 0009-2770.URL
Název česky: Biosenzory včasného varování pro detekci bojových chemických látek
Název anglicky: Early Warning Biosensors for Detection of Chemical Warfare Agents.
RIV/00216224:14310/10:00040597 Článek v odborném periodiku. Biochemie. čeština. Česká republika.
Bidmanová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Pohanka, Michal (203 Česká republika) -- Cabal, J. (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Chemical warfare agents;toxic compounds;biosensors
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 23. 3. 2012 10:56.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/902060/cs -
ŠTĚPÁNKOVÁ, Veronika, Radka CHALOUPKOVÁ, Morteza KHABIRI, Minofar BABÁK, Zbyněk PROKOP, R. ETTRICH a Jiří DAMBORSKÝ. Effect of organic solvents on structure and function of haloalkane dehalogenases. In 8th Discussion in Structural Molecular Biology and Bioinformatics. 2010.
Název anglicky: Effect of organic solvents on structure and function of haloalkane dehalogenases
RIV/00216224:14310/10:00040603 Prezentace na konferencích. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Štěpánková, Veronika (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Khabiri, Morteza (364 Írán) -- Babák, Minofar (364 Írán) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Ettrich, R. (276 Německo) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenases; organic solvents; structure and function
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 14. 10. 2010 10:43.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/902428/cs -
PROKOP, Zbyněk, Yukari SATO, Jan BREZOVSKÝ, Tomáš MOZGA, Radka CHALOUPKOVÁ, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Petr JEŘÁBEK, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Ryo NATSUME, J.G.E LEEUWEN, D.B. JANSSEN, Jan FLORIAN, Yuji NAGATA, Toshiya SENDA a Jiří DAMBORSKÝ. Enantioselectivity of Haloalkane Dehalogenases and its Modulation by Surface Loop Engineering. In Trends in Enzymology. 2010.
Název anglicky: Enantioselectivity of Haloalkane Dehalogenases and its Modulation by Surface Loop Engineering
RIV/00216224:14310/10:00045068 Vyžádané přednášky. Biochemie. angličtina. Švýcarsko.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika) -- Mozga, Tomáš (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika) -- Jeřábek, Petr (203 Česká republika) -- Štěpánková, Veronika (203 Česká republika) -- Natsume, Ryo (392 Japonsko) -- Leeuwen, J.G.E (528 Nizozemské království) -- Janssen, D.B. (528 Nizozemské království) -- Florian, Jan (203 Česká republika) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Senda, Toshiya (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: Haloalkane Dehalogenases; Protein engineering; Surface Loop
Druh účasti: vyžádaná přednáška
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 15. 10. 2010 12:29.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/902522/cs -
PROKOP, Zbyněk, Yukari SATO, Jan BREZOVSKÝ, Tomáš MOZGA, Radka CHALOUPKOVÁ, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Petr JEŘÁBEK, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Rio NATSUME, J.G.E. LEEWEN, D,B. JANSSEN, J. FLORIAN, Yuji NAGATA, T. SENDA a Jiří DAMBORSKÝ. Enantioselectivity of Haloalkane Dehalogenases and its Modulation by Surface Loop Engineering. Angewandte Chemie International Edition. Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinhe, 2010, roč. 49, č. 35, s. 6111-6115. ISSN 1433-7851.URL
Název anglicky: Enantioselectivity of Haloalkane Dehalogenases and its Modulation by Surface Loop Engineering
RIV/00216224:14310/10:00040598 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Německo.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Mozga, Tomáš (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Jeřábek, Petr (203 Česká republika) -- Štěpánková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Natsume, Rio (392 Japonsko) -- Leewen, J.G.E. (528 Nizozemské království) -- Janssen, D,B. (528 Nizozemské království) -- Florian, J. (203 Česká republika) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Senda, T. (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Enantioselectivity; Haloalkane Dehalogenases; protein engineering
Změnil: Mgr. Jan Brezovský, Ph.D., učo 64097. Změněno: 11. 5. 2011 11:32.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/902208/cs -
PROKOP, Zbyněk, Andrea FOŘTOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Martina PAVLOVÁ, Eva CHOVANCOVÁ, Jan BREZOVSKÝ, Martin KLVAŇA, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Tomáš MOZGA, Antonín PAVELKA, Pavel DVOŘÁK, Monika STRAKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Engineering of Biocatalysts by Modification of Access Tunnels. In Novel Enzymes. 2010.
Název česky: Inženýrství biokatalyzátorů pomocí modifikace vstupních tunelů.
RIV/00216224:14310/10:00040606 Vyžádané přednášky. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Pavlová, Martina (203 Česká republika) -- Chovancová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Klvaňa, Martin (203 Česká republika) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Mozga, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Pavelka, Antonín (203 Česká republika, domácí) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Straková, Monika (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Access Tunnels; Enzymes ; Protein Engineering
Druh účasti: vyžádaná přednáška
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 16. 12. 2010 14:29.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/902451/cs -
DAMBORSKÝ, Jiří, Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ, Eva CHOVANCOVÁ, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Jan BREZOVSKÝ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, Antonín PAVELKA a Pavel DVOŘÁK. Engineering of Enzymes by Modification of Access Tunnels. In GEM 2010. 2010.
Název česky: Inženýrství enzymů pomocí modelování vstupních tunelů.
RIV/00216224:14310/10:00045058 Vyžádané přednášky. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Chovancová, Eva (203 Česká republika) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika) -- Brezovský, Jan (203 Česká republika) -- Štěpánková, Veronika (203 Česká republika) -- Pavelka, Antonín (203 Česká republika) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Access Tunnels; Engineering;
Druh účasti: vyžádaná přednáška
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 14. 10. 2010 13:59.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/902450/cs -
HASAN, Khomaini, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Andrea FOŘTOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Yuji NAGATA, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Haloalkane dehalogenase from Agrobacterium tumefaciens C58 with new halide-stabilising residues and unique kinetics. In Trends in Enzymology. 2010.
RIV/00216224:14310/10:00045117 Prezentace na konferencích. Biochemie. angličtina. Švýcarsko.
Hasan, Khomaini (360 Indonésie) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Enzymology; Haloalkane dehalogenase ;
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 19. 10. 2010 12:33.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/903238/cs -
BIEDERMANNOVÁ, Lada, Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ, Pavel DVOŘÁK, Jiří DAMBORSKÝ a R. WADE. Investigation of Ligand Passage in Proteins Investigation of Ligand Passage in Proteins. In Computational Chemistry. 2010.
RIV/00216224:14310/10:00045118 Prezentace na konferencích. Biochemie. angličtina. Švýcarsko.
Biedermannová, Lada (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Wade, R. (276 Německo)
Klíčová slova anglicky: Proteins; Ligand Passage; protein engineering
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 12. 8. 2011 11:26.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/903239/cs -
HASAN, Khomaini, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Andrea FOŘTOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Yuji NAGATA, Jiří DAMBORSKÝ a Zbyněk PROKOP. Kinetics and enantioselectivity of haloalkane dehalogenase from Agrobacterium tumefaciens c58. In XIV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2010.
RIV/00216224:14310/10:00045121 Prezentace na konferencích. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Hasan, Khomaini (360 Indonésie) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Kinetics; enantioselectivity; haloalkane dehalogenase
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 19. 10. 2010 13:36.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/903252/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, F. OPLUŠTIL, Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2010. Patent. Číslo: AU 2006254625. Název vlastníka: MU. Datum přijetí: 4. 2. 2010.
RIV/00216224:14310/10:00072738 Patent. Biochemie. angličtina. Austrálie.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Opluštil, F. (203 Česká republika) -- Jesenská, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko)
Klíčová slova anglicky: yperite; haloalkane dehalogenases
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 19. 5. 2014 12:48.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1173277/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, František OPLUŠTIL, Andrea FOŘTOVÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2010. Patent. Číslo: AU 2006254625 B2. Vydavatel: Patentový úřad Austrálie. Místo vydání: Austrálie. Název vlastníka: MU. Datum registrace: 1. 6. 2006. Datum přijetí: 4. 2. 2010.
Název česky: Způsob detoxikace sulfidického yperitu působením halogenalkandehalogenáz
Biochemie. angličtina. Austrálie.
Klíčová slova anglicky: yperite; haloalkane dehalogenases
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 7. 4. 2014 13:41.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/952466/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, František OPLUŠTIL, Andrea FOŘTOVÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2010. Patent. Číslo: NZ 564218. Vydavatel: Patentový úřad Nový Zéland. Místo vydání: Nový Zěland. Název vlastníka: MU. Datum registrace: 1. 6. 2006. Datum přijetí: 9. 9. 2010.
Název česky: Způsob detoxikace sulfidického yperitu působením halogenalkandehalogenáz
Biochemie. angličtina. Nový Zéland.
Klíčová slova anglicky: yperite; haloalkane dehalogenases
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 12. 4. 2012 07:57.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/952464/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, F. OPLUŠTIL, Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases,. 2010. Patent. Číslo: NZ 564218. Název vlastníka: MU. Datum přijetí: 9. 9. 2010.
RIV/00216224:14310/10:00072739 Patent. Biochemie. angličtina. Nový Zéland.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Opluštil, F. (203 Česká republika) -- Jesenská, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko)
Klíčová slova anglicky: yperite; haloalkane dehalogenases
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 19. 5. 2014 12:47.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1173279/cs -
BIDMANOVÁ, Šárka, Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Optical biosensor based on haloalkane dehalogenase for detection of halogenated hydrocarbons in the environment. In Biosensors. 2010.
RIV/00216224:14310/10:00045110 Prezentace na konferencích. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Bidmanová, Šárka (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase; optical biosensor
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 19. 10. 2010 10:24.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/903202/cs -
ŠTĚPÁNKOVÁ, Veronika, Radka CHALOUPKOVÁ, Morteza KHABIRI, Minofar BABAK, Zbyněk PROKOP, R. ETTRICH a Jiří DAMBORSKÝ. Struktura a funkce haloalkándehalogenas v organických rozpouštědlech. 2010.
Název anglicky: Structure and funczional of haloalkandehalogenases in the organics solvents.
RIV/00216224:14310/10:00045115 Prezentace na konferencích. Biochemie. čeština. Česká republika.
Štěpánková, Veronika (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Khabiri, Morteza (364 Írán) -- Babak, Minofar (364 Írán) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Ettrich, R. (276 Německo) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: haloalkan dehalogenses; structure; protein engineering
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 19. 10. 2010 12:12.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/903231/cs -
JESENSKÁ, Andrea, Marta MONINCOVÁ, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Khomaini HASAN, Radka CHALOUPKOVÁ, Zbyněk PROKOP, Z. GEERLOF a Jiří DAMBORSKÝ. Characterization of Haloalkane Dehalogenases DrbA and DmbC: Representatives of Novel Subfamily. Applied and Environmental Microbilogy. 2009, roč. 75, č. 15, s. 5157-5160. ISSN 0099-2240.URL
Název česky: Biochemická charakterizace haloalkán dehalogenázy DrbA a DmbC: zastupců nové subrodiny.
Název anglicky: Biochemical Characterization of Haloalkane Dehalogenases DrbA and DmbC: Representatives of Novel Subfamily.
RIV/00216224:14310/09:00032482 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Jesenská, Andrea (203 Česká republika) -- Monincová, Marta (203 Česká republika) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika) -- Hasan, Khomaini (360 Indonésie) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Geerlof, Z. (276 Německo) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: Isolation; Biochemical Characterization; Haloalkane Dehalogenases; DrbA and DmbC; Subfamily.
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 22. 3. 2010 09:24.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/727101/cs -
MOZGA, Tomáš, Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Chiral Aliphatic Hydroxy Compounds in Nature: a Review of Biological Functions and Practical Applications. Collection of Czechoslovak chemical communications. 2009, roč. 74, 7-8, 83 s. ISSN 0010-0765.
Název česky: Chirální alifatické hydroxy sloučeniny v přírodě: review biologických funkcí a praktických aplikací.
RIV/00216224:14310/09:00028728 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Mozga, Tomáš (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: Alcohols; Drugs; Pheromones; Odours; Chiral compounds; Hydroxy compounds; Chemical communication; Enantioselective enzymes; Natural products; Chiral pool.
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 6. 1. 2010 13:31.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/862932/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, F. OPLUŠTIL, Andrea JESENSKÁ a J. NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2009. Patent. Číslo: RU11311. Vydavatel: ROSPATENT. Místo vydání: Rusko. Název vlastníka: MU. Datum registrace: 1. 6. 2006. Datum přijetí: 27. 2. 2009.
Název anglicky: Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases,
RIV/00216224:14310/09:00072737 Patent. Biochemie. angličtina. Rusko.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Opluštil, F. (203 Česká republika) -- Jesenská, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Nagata, J. (392 Japonsko)
Klíčová slova anglicky: yperite; haloalkane dehalogenases
Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 19. 5. 2014 12:46.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1173271/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, František OPLUŠTIL, Andrea FOŘTOVÁ a Yuji NAGATA. Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases. 2009. Patent. Číslo: RU 11311. Vydavatel: Patentový úřad Ruska. Místo vydání: Ruska federace. Název vlastníka: MU. Datum registrace: 1. 6. 2006. Datum přijetí: 27. 2. 2009.
Název česky: Způsob detoxikace sulfidického yperitu působením halogenalkandehalogenáz
Biochemie. angličtina. Rusko.
Klíčová slova anglicky: yperite; haloalkane dehalogenases
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 7. 4. 2014 13:39.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/952467/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, Yuji NAGATA a D. B. JANSSEN. Method of Production of Optically Active Hydrocarbons and Alcohols Using Hydrolytic Dehalogenation Catalysed by Haloalkane Dehalogenases. 2009. Patent. Číslo: US 7,632,666. Vydavatel: USTPO Úřad pro patenty a ochranné známky USA. Místo vydání: USA. Název vlastníka: MU. Datum registrace: 24. 7. 2007. Datum přijetí: 15. 12. 2009.
Název anglicky: Method of Production of Optically Active Hydrocarbons and Alcohols Using Hydrolytic Dehalogenation Catalysed by Haloalkane Dehalogenases.
RIV/00216224:14310/09:00056742 Patent. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Janssen, D. B. (528 Nizozemské království)
Klíčová slova anglicky: Haloalkane Dehalogenases;Optically Active Hydrocarbons
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 5. 4. 2012 13:00.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/978554/cs -
KLVAŇA, Martin, Martina PAVLOVÁ, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Pavel DVOŘÁK, Zbyněk PROKOP, A. STSIAPANAVA, Michal KUTÝ, Ivana KUTÁ-SMATANOVÁ, J. DOHNÁLEK, Petr KULHÁNEK, R. WADE a Jiří DAMBORSKÝ. Pathways and Mechanisms for Product Release in the Engineered Haloalkane Dehalogenases Explored using Classical and Random Acceleration Molecular Dynamics Simulations. JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY. 2009, roč. 2009, č. 00, s. 0000-0000, 10 s. ISSN 0022-2836.
Název česky: Cesta a mechanismus vzniku produktu v inženýrství haloalkán dehalogenáz použitím klasické a zrychlené molekulárně-dynamické simulace.
Název anglicky: Pathways and Mechanisms for Product Release in the Engineered Haloalkane Dehalogenases Explored using Classical and Random Acceleration Molecular Dynamics Simulations.
RIV/00216224:14310/09:00028564 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Klvaňa, Martin (203 Česká republika) -- Pavlová, Martina (203 Česká republika) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Stsiapanava, A. (804 Ukrajina) -- Kutý, Michal (203 Česká republika) -- Kutá-Smatanová, Ivana (203 Česká republika) -- Dohnálek, J. (203 Česká republika) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika) -- Wade, R. (276 Německo) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: DhaA haloalkane dehalogenase; mutations; ubstrate 1.2.3-trichloropropane
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 11. 8. 2009 13:26.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/841928/cs -
PROKOP, Zbyněk a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DbeA. 2009.URL
Název česky: Rekombinantní enzym halogenalkandehalogenasa DbeA
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DbeA
RIV/00216224:14310/09:00036176 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: enzyme hydrolytic dehalogenation
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 26. 3. 2010 10:12.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/839703/cs -
PROKOP, Zbyněk a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DmbC. 2009.URL
Název česky: Rekombinantní enzym halogenalkandehalogenasa DmbC
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DmbC
RIV/00216224:14310/09:00036173 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: enzyme hydrolytic dehalogenation
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 26. 3. 2010 10:26.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/839700/cs -
PROKOP, Zbyněk a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DrbA. 2009.URL
Název česky: Rekombinantní enzym halogenalkandehalogenasa DrbA
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DrbA
RIV/00216224:14310/09:00036175 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: enzyme hydrolytic dehalogenation
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 26. 3. 2010 10:27.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/839702/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, Yuji NAGATA a D. JANSSEN. Způsob výroby opticky aktivních halogenalkanů a alkoholů hydrolytickou dehalogenací katalyzovanou halogenalkandehalogenázami. 2009. Patent. Číslo: 301290. Vydavatel: Patentový úřad ČR. Název vlastníka: Masarykova univerzita. Datum registrace: 27. 12. 2004. Datum přijetí: 20. 11. 2009.
Název anglicky: Method of Production of Optically Active Hydrocarbons and Alcohols Using Hydrolytic Dehalogenation Catalysed by Haloalkane Dehalogenases.
RIV/00216224:14310/09:00072735 Patent. Biochemie. čeština. Česká republika.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Janssen, D. (528 Nizozemské království)
Klíčová slova anglicky: Haloalkane Dehalogenases; Optically Active Hydrocarbons
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 31. 3. 2014 17:52.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1173258/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, Yuji NAGATA a Dick JANSSEN. Způsob výroby opticky aktivních halogenalkanů a alkoholů hydrolytickou dehalogenací katalyzovanou halogenalkandehalogenázami. 2009. Patent. Číslo: 301290. Vydavatel: UPVCR Úřad průmyslového vlastnictví České republiky. Místo vydání: Česká republika. Název vlastníka: MU. Datum registrace: 27. 12. 2004. Datum přijetí: 20. 11. 2009.
Název anglicky: Production method of optically active alcohols of halogenalkan and hydrolytic dehalogenation catalyzed by halogenalkandehalogenases
Biochemie. čeština. Česká republika.
Klíčová slova anglicky: optically active alcohols; halogenalkandehalogenases
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 12. 4. 2012 07:59.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/952469/cs -
PROKOP, Zbyněk, František OPLUŠTIL a Jiří DAMBORSKÝ. Decontamination of chemical warfare agent sulphur mustard. 2008.
Název česky: Dekontaminace chemické bojové látky yperit
Název anglicky: Decontamination of chemical warfare agent sulphur mustard
RIV/00216224:14310/08:00028118 Poloprovoz, ověřená technologie, odrůda, plemeno. Vojenství. angličtina. Česká republika.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Opluštil, František (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: suplhur mustard decontamination technology enzymes
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 18. 1. 2012 11:12.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/839662/cs -
TVRZOVÁ, Ludmila, Jiří NEČA, Zbyněk ZDRÁHAL, Danuška HORÁKOVÁ, Miroslav NĚMEC a Zbyněk PROKOP. Degradation of 4 Nitroguaiacol and Other Nitroaromatic Compounds by Strains of Arthrobacter nitroguajacolicus. Archives of Microbiology. 2008, roč. 00, č. 00, s. 00-00, 10 s. ISSN 0302-8933.
Název česky: Degradace 4-Nitroguaiacolu a dalších nitroaromatů pomocí kmenů bakterie Arthrobacter nitroguajacolicus.
Název anglicky: Degradation of 4 Nitroguaiacol and Other Nitroaromatic Compounds by Strains of Arthrobacter nitroguajacolicus.
RIV/00216224:14310/08:00025648 Článek v odborném periodiku. Mikrobiologie, virologie. angličtina. Spojené státy.
Tvrzová, Ludmila (203 Česká republika) -- Neča, Jiří (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika) -- Horáková, Danuška (203 Česká republika) -- Němec, Miroslav (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: xxx
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 11. 2007 14:47.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/727130/cs -
BIDMANOVÁ, Šárka, Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ, G. KUNCOVÁ, J. BOLYÓ a Jiří DAMBORSKÝ. Development of Enzyme Biosensors for Detection of Toxic Halogenated Compounds. 2008.URL URL
Název česky: Vývoj enzymových biosenzorů na stanovení toxických halogenovaných sloučenin.
Název anglicky: Development of Enzyme Biosensors for Detection of Toxic Halogenated Compounds
RIV/00216224:14310/08:00026139 Audiovizuální tvorba. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Bidmanová, Šárka (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Kuncová, G. (203 Česká republika) -- Bolyó, J. (380 Itálie) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: Enzyme; Biosensors; Halogenated Compounds
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 24. 10. 2008 21:26.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/770493/cs -
MIKELOVÁ, Radka, Zbyněk PROKOP, Karel STEJSKAL, Vojtěch ADAM, Miroslava BEKLOVÁ, Libuše TRNKOVÁ, Bohumila KULICHOVÁ, A. HORNA, Radka CHALOUPKOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ a René KIZEK. Enzymatic reaction coupled with flow-injection analysis with charged aerosol, coulometric, or amperometric detection for estimation of contamination of the environment by pesticides. Chromatographia. 2008, roč. 67, č. 01, s. 47-53. ISSN 0009-5893.URL
Název česky: Enzymtaická reakce ve spojení s průtokovou injekční analýzou charged aerosol, coulometrickým a amperometrickým detektorem pro stanovení kontaminace životního prostředí pesticidy
Název anglicky: Enzymatic reaction coupled with flow-injection analysis with charged aerosol, coulometric, or amperometric detection for estimation of contamination of the environment by pesticides
RIV/00216224:14310/08:00025647 Článek v odborném periodiku. Analytická chemie, separace. angličtina. Spojené státy.
Mikelová, Radka (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Stejskal, Karel (203 Česká republika) -- Adam, Vojtěch (203 Česká republika) -- Beklová, Miroslava (203 Česká republika) -- Trnková, Libuše (203 Česká republika) -- Kulichová, Bohumila (203 Česká republika) -- Horna, A. (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant) -- Kizek, René (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Halides; Coulometric; Amperometric; Pesticides
Změnil: prof. RNDr. Vojtěch Adam, Ph.D., učo 63820. Změněno: 8. 7. 2009 17:53.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/727128/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ a Thomas SCHEPER. Fluorescence spectrophotometer TUH-01. 2008.URL
Název česky: Fluorescenční spectrofotometr pro biosensing TUH-01
Název anglicky: Fluorescence spectrophotometer TUH-01
RIV/00216224:14310/08:00028121 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Optika, masery a lasery. angličtina. Česká republika.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika) -- Scheper, Thomas (276 Německo)
Klíčová slova anglicky: spetrophotometer optical biosensing
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 2. 7. 2009 16:57.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/839705/cs -
HASAN, Khomaini, Marta MONINCOVÁ, Andrea JESENSKÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Táňa KOUDELÁKOVÁ a Zbyněk PROKOP. Characterization of Haloalkane Dehalogenase DmbC from Mycobacterium tubercul.sis H37Rv,. 2008.URL
Název česky: Charakterizace haloalkán dehalogenázy DmbC y bakterie Mycobacterium tuberculosis H37Rv.
Název anglicky: Characterization of Haloalkane Dehalogenase DmbC from Mycobacterium tuberculosis H37Rv.
Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 23. 6. 2008 14:14.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/770498/cs -
PROKOP, Zbyněk, Martina PAVLOVÁ, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Martin KLVAŇA, Tomáš MOZGA, Radka CHALOUPKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Inženýrství stereoselektivity enzymů pro aplikace biokatalýzy. 2008.URL
Název česky: Inženýrství stereoselektivity enzymů pro aplikace biokatalýzy
Název anglicky: Engineering of Enzymes Stereoselectivity for aplication of biocatalyses.
RIV/00216224:14310/08:00026604 Prezentace na konferencích. Biochemie. čeština. Česká republika.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Pavlová, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Klvaňa, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Mozga, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Enzymes; Stereoselectivity; biocatalyses
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 29. 4. 2011 09:21.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/786935/cs -
BREZOVSKÝ, Jan, Zbyněk PROKOP, Yukari SATO, J. FLORIÁN, Tomáš MOZGA, Radka CHALOUPKOVÁ, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Petr JEŘÁBEK, Rio NATSUME, D.B. JANSSEN, Yuji NAGATA, T. SENDA a Jiří DAMBORSKÝ. Modulation of Enantioselectivity in Haloalkane Dehalogenase DbjA by Engineering of a Surface Loop. 2008.URL
Název česky: Modulace enantioselektivitz v haloalkán dehalogenáze DbjA změnou povrchové kličky.
Název anglicky: Modulation of Enantioselectivity in Haloalkane Dehalogenase DbjA by Engineering of a Surface Loop
RIV/00216224:14310/08:00026606 Audiovizuální tvorba. Biochemie. angličtina. Španělsko.
Brezovský, Jan (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Florián, J. (203 Česká republika) -- Mozga, Tomáš (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika) -- Jeřábek, Petr (203 Česká republika) -- Natsume, Rio (392 Japonsko) -- Janssen, D.B. (528 Nizozemské království) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Senda, T. (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: Enantioselectivity; Haloalkane Dehalogenase DbjA ; Engineering; Surface Loop
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 24. 10. 2008 21:24.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/786954/cs -
HOLUB, Peter, Martina PAVLOVÁ, Martin KLVAŇA, Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ, Aaron OAKLEY, M. TSUDA, Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Protein Engineering of Haloalkane Dehalogenases: Towards the Change of Reaction Mechanism. 2008.URL
Název česky: Proreinové inženýrství haloalkan dehalogenáz:směrem k změně reakčního mechanismu.
Název anglicky: Protein Engineering of Haloalkane Dehalogenases: Towards the Change of Reaction Mechanism
RIV/00216224:14310/08:00026137 Audiovizuální tvorba. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Holub, Peter (203 Česká republika) -- Pavlová, Martina (203 Česká republika) -- Klvaňa, Martin (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Oakley, Aaron (36 Austrálie) -- Tsuda, M. (392 Japonsko) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: Protein Engineering; Haloalkane Dehalogenases; Reaction Mechanism
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 24. 10. 2008 21:32.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/770204/cs -
BREZOVSKÝ, Jan, Marta MONINCOVÁ, Zbyněk PROKOP, Yukari SATO, T. SENDA, Yuji NAGATA, R.C. WADE a Jiří DAMBORSKÝ. Quantitative Comparison of Binding Sites within the Protein Family of Haloalkane Dehalogenases,. 2008.URL
Název česky: Kvantitativní srivnaní vazebných míst v uvnitř proteinové rodiny haloalkán dehalogenáz.
Název anglicky: Quantitative Comparison of Binding Sites within the Protein Family of Haloalkane Dehalogenases,
RIV/00216224:14310/08:00026140 Audiovizuální tvorba. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Brezovský, Jan (203 Česká republika) -- Monincová, Marta (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Senda, T. (392 Japonsko) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Wade, R.C. (276 Německo) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: Binding Sites; Protein Family; Haloalkane Dehalogenases
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 24. 10. 2008 21:31.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/770497/cs -
PROKOP, Zbyněk a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DbjA. 2008.URL
Název česky: Rekombinantní enzym halogenalkandehalogenasa DbjA
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DbjA
RIV/00216224:14310/08:00036169 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: enzyme hydrolytic dehalogenation
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 2. 7. 2009 16:06.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/839696/cs -
PROKOP, Zbyněk a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DhaA. 2008.URL
Název česky: Rekombinantní enzym halogenalkandehalogenasa DhaA
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DhaA
RIV/00216224:14310/08:00036168 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: enzyme hydrolytic dehalogenation
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 2. 7. 2009 15:34.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/839694/cs -
PROKOP, Zbyněk a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DhmA. 2008.URL
Název česky: Rekombinantní enzym halogenalkandehalogenasa DhmA
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DhmA
RIV/00216224:14310/08:00036171 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: enzyme hydrolytic dehalogenation
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 2. 7. 2009 16:23.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/839698/cs -
PROKOP, Zbyněk a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DmbA. 2008.URL
Název česky: Rekombinantní enzym halogenalkandehalogenasa DmbA
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DmbA
RIV/00216224:14310/08:00036170 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: enzyme hydrolytic dehalogenation
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 2. 7. 2009 16:15.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/839697/cs -
PROKOP, Zbyněk a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DmbB. 2008.URL
Název česky: Rekombinantní enzym halogenalkandehalogenasa DmbB
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase DmbB
RIV/00216224:14310/08:00036172 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: enzyme hydrolytic dehalogenation
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 2. 7. 2009 16:19.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/839699/cs -
PROKOP, Zbyněk a Jiří DAMBORSKÝ. Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase LinB. 2008.URL
Název česky: Rekombinantní enzym halogenalkandehalogenasa LinB
Název anglicky: Recombinant enzyme haloalkane dehalogenase LinB
RIV/00216224:14310/08:00036158 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). Biochemie. angličtina. Česká republika.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: enzyme hydrolytic dehalogenation
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 2. 7. 2009 14:15.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/839666/cs -
DVOŘÁK, Pavel, Martina PAVLOVÁ, Martin KLVAŇA, Zbyněk PROKOP a Yuji NAGATA. Semi-Rational Engineering of Haloalkane Dehalogenases DHAA Towards Improved Activity with 1,2-Dichloroethane. In XII. Working Meeting of Biochemists and Molecular Biologists. 2008.URL
Název česky: Inženýrství haloalkán dehalogenáz DHAA směrem k zlepšení aktivity s 1,2-dichloroethanem.
Název anglicky: Semi-Rational Engineering of Haloalkane Dehalogenases DHAA Towards Improved Activity with 1,2-Dichloroethane
Biochemie. angličtina. Česká republika.
Klíčová slova anglicky: s
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 23. 6. 2008 13:32.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/770494/cs -
CHALOUPKOVÁ, Radka, Zbyněk PROKOP, Tomáš MOZGA, Yukari SATO, Táňa KOUDELÁKOVÁ, D.B. JANSSEN, Yuji NAGATA, T. SENDA a Jiří DAMBORSKÝ. Thermodynamic Analysis of Enantioselectivity of Haloalkane Dehalogenase DbjA and its Variants DbjA and DbjA+H139A towards Brominated Esters and substituted Bromoalkanes. 2008.URL
Název česky: Termodynamická analýzy enantioselektivity haloalkan dehalogenázy DbjA a její Varianty DbjA a DbjAH139A ve vztahu k bromovaným esterům a A-substituovaným bromoalkanům
Název anglicky: Thermodynamic Analysis of Enantioselectivity of Haloalkane Dehalogenase DbjA and its Variants DbjA and DbjA+H139A towards Brominated Esters and substituted Bromoalkanes
RIV/00216224:14310/08:00026634 Prezentace na konferencích. Biochemie. angličtina. Španělsko.
Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Mozga, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Janssen, D.B. (528 Nizozemské království) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Senda, T. (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Thermodynamic Analysis; Enantioselectivity; Haloalkane Dehalogenase; DbjA; +H139A
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 29. 4. 2011 09:43.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/788380/cs -
Comparative Binding Energy Analysis of Haloalkane Dehalogenase from Bradyrhizobium japonicum USDA110BREZOVSKÝ, Jan, Marta MONINCOVÁ, Zbyněk PROKOP, Yukari SATO, Yuji NAGATA, R.C. WADE a Jiří DAMBORSKÝ. Comparative Binding Energy Analysis of Haloalkane Dehalogenase from Bradyrhizobium japonicum USDA110. 2007.URL
Název česky: Analýza srovnávání vazebných energii u haloalkan dehalogenázy z bakterie Bradyrhizobium japonicum USDA110
Název anglicky: Comparative Binding Energy Analysis of Haloalkane Dehalogenase from Bradyrhizobium japonicum USDA110
RIV/00216224:14310/07:00022825 Prezentace na konferencích. Biochemie. angličtina. Itálie.
Brezovský, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Monincová, Marta (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Wade, R.C. (276 Německo) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: binding energy; Haloalkane Dehalogenase; Bradyrhizobium japonicum USDA110
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 29. 4. 2011 09:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/727148/cs -
BREZOVSKÝ, Jan, Marta MONINCOVÁ, Zbyněk PROKOP, Yukari SATO, Yuji NAGATA, R.C. WADE a Jiří DAMBORSKÝ. Comparative Binding Energy (COMBINE) Analysis of the Substrate Specificity of Haloalkane Dehalogenase from Bradyrhizobium japonicum USDA110. 2007.URL
Název česky: COMBINE analýzy substrátové specifity Haloalkáne Dehalogenázy z bakterie Bradyrhizobium japonicum USDA110.
RIV/00216224:14310/07:00022820 Audiovizuální tvorba. Biochemie. angličtina. Rakousko.
Brezovský, Jan (203 Česká republika) -- Monincová, Marta (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Wade, R.C. (276 Německo) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: COMBINE; Substrate Specificity; Haloalkane Dehalogenase ; Bradyrhizobium japonicum USDA110
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 11. 2007 15:28.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/727136/cs -
ITO, M., Zbyněk PROKOP, Martin KLVAŇA, Y. OTSUBO, M. TSUDA, Jiří DAMBORSKÝ a Yuji NAGATA. Degradation of Beta-Hexachlorocyclohexane by Haloalkane Dehalogenase LinB from Hexachlorocyclohexane-Utilizing Bacterium Sphingobium sp. MI1205. ARCHIVES IN MICROBIOLOGY. 2007, roč. 188, č. 4, s. 313-325. ISSN 0302-8933.URL
Název česky: Degradace Beta-Hexachlorocyclohexanu pomocí haloalkan dehalogenázy LinB získané bakterie využívajícící Hexachlorocyclohexan- Bacterium Sphingobium sp. MI1205
Název anglicky: Degradation of Beta-Hexachlorocyclohexane by Haloalkane Dehalogenase LinB from Hexachlorocyclohexane-Utilizing Bacterium Sphingobium sp. MI1205
RIV/00216224:14310/07:00022810 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Ito, M. (392 Japonsko) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Klvaňa, Martin (203 Česká republika) -- Otsubo, Y. (392 Japonsko) -- Tsuda, M. (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko)
Klíčová slova anglicky: hexachlorocyclohexane (HCH); Sphingobium japonicum UT26; Sphingobium sp. MI1205; haloalkane dehalogenase LinB
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 19. 3. 2010 12:25.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/727102/cs -
TVRZOVÁ, Ludmila, Jiří NEČA, Zbyněk ZDRÁHAL, Danuška HORÁKOVÁ, Miroslav NĚMEC a Zbyněk PROKOP. Degradation of 4 Nitroguaiacol and Other Nitroaromatic Compounds by Strains of Arthrobacter nitroguajacolicus. Archives of Microbiology. 2007, roč. 00, č. 00, s. 00-00, 10 s. ISSN 0302-8933.
Název česky: Degradace 4-Nitroguaiacolu a dalších nitroaromatů pomocí kmenů bakterie Arthrobacter nitroguajacolicus.
Název anglicky: Degradation of 4 Nitroguaiacol and Other Nitroaromatic Compounds by Strains of Arthrobacter nitroguajacolicus.
RIV/00216224:14310/07:00022816 Článek v odborném periodiku. Mikrobiologie, virologie. angličtina. Spojené státy.
Tvrzová, Ludmila (203 Česká republika) -- Neča, Jiří (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika) -- Horáková, Danuška (203 Česká republika) -- Němec, Miroslav (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: xxx
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 11. 2007 12:58.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/727126/cs -
BIDMANOVÁ, Šárka, Zbyněk PROKOP, G. KUNCOVÁ, J. BOLYÓ a Jiří DAMBORSKÝ. Development of Enzymatic Biosensors for Detection of Halogenated Environmental Pollutants. 2007.URL
Název česky: Vývoj enzymatických biosensorů pro stanovení halogenovaných polutantů v životním prostředí
Název anglicky: Development of Enzymatic Biosensors for Detection of Halogenated Environmental Pollutants
RIV/00216224:14310/07:00022826 Audiovizuální tvorba. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Bidmanová, Šárka (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Kuncová, G. (203 Česká republika) -- Bolyó, J. (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: Enzymatic Biosensors; Detection; Halogenated Environmental Pollutants
Změnila: Mgr. Šárka Nevolová, Ph.D., učo 77580. Změněno: 9. 4. 2008 16:17.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/727150/cs -
DAMBORSKÝ, Jiří, Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ, Veronika ŠTĚPÁNKOVÁ, M. OLŠANSKÁ a F. OPLUŠTIL. Enzymatic Detoxification of Sulfur Mustard by Haloalkane Dehalogenases. 2007.URL
Název česky: Emzymatická detoxifikace yperitu pomocí haloalkan dehalogenáz.
Název anglicky: Enzymatic Detoxification of Sulfur Mustard by Haloalkane Dehalogenases
RIV/00216224:14310/07:00022831 Audiovizuální tvorba. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Štěpánková, Veronika (203 Česká republika) -- Olšanská, M. (203 Česká republika) -- Opluštil, F. (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: sulfur mustard; detoxification; enzymes; haloalkan dehalogenases
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 11. 2007 19:36.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/727159/cs -
PROKOP, Zbyněk, Yukari SATO, Tomáš MOZGA, Petr JEŘÁBEK, Rio NATSUME, J. FLORIÁN, M. TSUDA, Yuji NAGATA, T. SENDA a Jiří DAMBORSKÝ. Haloalkane Dehalogenases Possess Two Different Structural Bases for Their Enantioselectivity. 2007.URL
Název česky: Haloalkan dehalogenázy vykazují dvě rozdílné báze pro jejich enantioselektivitu.
RIV/00216224:14310/07:00022819 Audiovizuální tvorba. Biochemie. angličtina. Španělsko.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Mozga, Tomáš (203 Česká republika) -- Jeřábek, Petr (203 Česká republika) -- Natsume, Rio (392 Japonsko) -- Florián, J. (203 Česká republika) -- Tsuda, M. (392 Japonsko) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Senda, T. (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: enantioselectivity; haloalkan dehalogenases;
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 11. 2007 15:21.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/727135/cs -
DAMBORSKÝ, Jiří a Zbyněk PROKOP. Keyhole-Lock-Key Model of Enzymatic Catalysis: Engineering of Tunnels in Proteins with Buried Active Sites. 2007.URL
Název česky: Model enzymatické katalýzy "Zámek-klíčová dírka-klíč": Inženýrství tunelů v proteinech se skrytým aktivním místem.
RIV/00216224:14310/07:00022822 Audiovizuální tvorba. Biochemie. angličtina. Kanada.
Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: buried active site; proteins; tunnels; keyhole-lock-key model
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 11. 2007 15:52.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/727141/cs -
KŘÍŽKOVÁ, Soňa, Jan HRADECKÝ, V. ŠUPÁLKOVÁ, Zbyněk PROKOP, Libuše TRNKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. LinB Enzyme for Detection of Chlorinated Pesticides- Suggestion Design of a New Biosensor. 2007.URL
Název česky: Enzym LinB na stanovení chlorovaných pesticidů-návrh designu nového biosenzoru.
Název anglicky: LinB Enzyme for Detection of Chlorinated Pesticides- Suggestion Design of a New Biosensor
RIV/00216224:14310/07:00022834 Audiovizuální tvorba. Kontaminace a dekontamin. půdy vč. pesticidů. angličtina. Česká republika.
Křížková, Soňa (203 Česká republika) -- Hradecký, Jan (203 Česká republika) -- Šupálková, V. (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Trnková, Libuše (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: LinB Enzyme; Detection of Chlorinated Pesticides; New Biosensor
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 11. 2007 20:00.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/727163/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, D.B. JANSSEN a Yuji NAGATA. Method of Production of Optically Active Hydrocarbons and Alcohols Using Hydrolytic Dehalogenation Catalysed by Haloalkane Dehalogenases. 2007. Patent. Číslo: US 7,632,666 B2. Vydavatel: The Director of the United States Patent and Trademark Office. Místo vydání: USA. Název vlastníka: MU. Datum registrace: 23. 12. 2005. Datum přijetí: 14. 2. 2007.
Název anglicky: Method of Production of Optically Active Hydrocarbons and Alcohols Using Hydrolytic Dehalogenation Catalysed by Haloalkane Dehalogenases.
Biochemie. angličtina. Spojené státy. obsah podléhá obchodnímu tajemství.
Klíčová slova anglicky: Optically Active Hydrocarbons
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 5. 4. 2012 12:49.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/877580/cs -
CHROUST, Karel, Martina PAVLOVÁ, Zbyněk PROKOP, Jan MENDEL, Kateřina BOŽKOVÁ, Zdeněk KUBÁT, Věra ZAJÍČKOVÁ a Jiří DAMBORSKÝ. Quantitative Structure-Activity Relationships for Toxicity and Genotoxicity of Halogenated Aliphatic Compounds: Wing Spot Test of Drosophila melanogaster. CHEMOSPHERE. 2007, roč. 67, č. 1, s. 152-159. ISSN 0045-6535.URL
Název česky: QSAR pro toxicitu a genotoxicitu halogenovaných alifatických sloučenin:"Wing Spot Test" na Drosophila melanogaster.
Název anglicky: Quantitative Structure-Activity Relationships for Toxicity and Genotoxicity of Halogenated Aliphatic Compounds: Wing Spot Test of Drosophila melanogaster.
RIV/00216224:14310/07:00021727 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Chroust, Karel (203 Česká republika) -- Pavlová, Martina (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Mendel, Jan (203 Česká republika) -- Božková, Kateřina (203 Česká republika) -- Kubát, Zdeněk (203 Česká republika) -- Zajíčková, Věra (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: Halogenated aliphatic compounds; toxic; genotoxic effects; Drosophila melanogaster
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 19. 3. 2010 11:50.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/700042/cs -
CHALOUPKOVÁ, Radka, Zbyněk PROKOP, Monika STRAKOVÁ, Tomáš MOZGA a Jiří DAMBORSKÝ. Stereoselectivity and Conformational Stability of Haloalkane Dehalogenase DbjA from Bradyrhizobium japonicum USDA110: The effect of temperature and pH. 2007.URL
Název česky: Stereoselektivita a konformační stabilita haloalkan dehelogenázy Dehalogenase DbjA z bakterie Bradyrhizobium japonicum USDA110: význam pH a teploty.
RIV/00216224:14310/07:00022817 Prezentace na konferencích. Biochemie. angličtina. Itálie.
Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Straková, Monika (203 Česká republika, domácí) -- Mozga, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: stereoselectivity; conformational stability; haloalkan dehalogenases
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 29. 4. 2011 09:52.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/727132/cs -
CHALOUPKOVÁ, Radka, Zbyněk PROKOP, Monika STRAKOVÁ, Yukari SATO, Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Stereoselektivita a konformační stabilita halogenalkan dehalogenázy DbjA z Bradyrhizobium japonicum USDA110,. 2007.URL
Název česky: Stereoselektivita a konformační stabilita halogenalkan dehalogenázy DbjA z Bradyrhizobium japonicum USDA110,
Název anglicky: Stereoselectivity and Conformational Stability of Haloalkane Dehalogenase DbjA from Bradyrhizobium japonicum USDA110: The Effect of pH and Temperature
RIV/00216224:14310/07:00022827 Audiovizuální tvorba. Biochemie. čeština. Slovensko.
Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Straková, Monika (203 Česká republika, domácí) -- Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Stereoselektivity; halogenalkan dehalogenases DbjA; Conformational Stability; Bradyrhizobium japonicum USDA110
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 29. 4. 2011 09:55.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/727153/cs -
PAVLOVÁ, Martina, Martin KLVAŇA, Andrea JESENSKÁ, Zbyněk PROKOP, Hana KONEČNÁ, Yukari SATO, M. TSUDA, Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. The Identification of Catalytic Pentad in the Haloalkane Dehalogenase DhmA from Mycobacterium avium N85: Reaction Mechanism and Molecular Evolution. Journal of Structural Biology. 2007, roč. 157, č. 2, s. 384-392. ISSN 1047-8477.URL
Název česky: Identifikace katalytickych pentad v haloalkán dehalogenaze DhmA z kmene Mycobacterium avium N85: Reakční mechanismus a molekulární evoluce.
Název anglicky: The Identification of Catalytic Pentad in the Haloalkane Dehalogenase DhmA from Mycobacterium avium N85: Reaction Mechanism and Molecular Evolution
RIV/00216224:14310/07:00022383 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Pavlová, Martina (203 Česká republika) -- Klvaňa, Martin (203 Česká republika) -- Jesenská, Andrea (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Konečná, Hana (203 Česká republika) -- Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Tsuda, M. (392 Japonsko) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: Catalytic Pentad; Haloalkane Dehalogenase; DhmA Mycobacterium avium N85
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 22. 3. 2010 09:10.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/721200/cs -
PROKOP, Zbyněk, Radka CHALOUPKOVÁ, Martina PAVLOVÁ, Marta MONINCOVÁ, Michal STROUHAL, V. VELEBNÝ a Jiří DAMBORSKÝ. Využití enzymů ve farmaceutických výrobách. 2007.URL
Název česky: Využití enzymů ve farmaceutických výrobách
Název anglicky: Development of Enzymes in the Farmaceuticals Industry.
RIV/00216224:14310/07:00022828 Audiovizuální tvorba. Biochemie. čeština. Česká republika.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Pavlová, Martina (203 Česká republika) -- Monincová, Marta (203 Česká republika) -- Strouhal, Michal (203 Česká republika) -- Velebný, V. (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: proteins; enzymes; farmaceutical;
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 11. 2007 16:47.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/727154/cs -
MONINCOVÁ, Marta, Zbyněk PROKOP, Jitka VEVODOVÁ, Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Weak Activity of Haloalkane Dehalogenase LinB with 1,2,3-Trichloropropane Revealed by X-ray Crystallography and Microcalorimetry. Applied and Environmental Microbiology. 2007, roč. 73, č. 6, s. 2005-2008. ISSN 0099-2240.URL
Název česky: Slabá aktivita haloalkan dehalogenázy LinB s 1,2,3-Trichloropropanem srovnávání pomocí X-ray Krystalografie a Microkalorimetrie.
Název anglicky: Weak Activity of Haloalkane Dehalogenase LinB with 1,2,3-Trichloropropane Revealed by X-ray Crystallography and Microcalorimetry
RIV/00216224:14310/07:00022815 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Monincová, Marta (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Vevodová, Jitka (203 Česká republika) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: 1;2;3-trichloropropane (TCP); Haloalkane dehalogenases; LinB from Sphingobium japonicum UT26; X-ray crystallography; microcalorimetry
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 19. 3. 2010 12:25.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/727112/cs -
KOUDELÁKOVÁ, Táňa, Zbyněk PROKOP, Yukari SATO, Marta MONINCOVÁ, Andrea JESENSKÁ, Lucie GRODECKÁ, T. SENDA, Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Změna enantioselektivity a substrátové specifity haloalkan dehalogenázy proteinovým inženýrstvím. 2007.URL
Název česky: Change of Enantioselectivity and Substrate Specifity od Haloalkan Dehalogenases by Protein Engineering.
Název anglicky: Change of Enantioselectivity and Substrate Specifity od Haloalkan Dehalogenases by Protein Engineering.
RIV/00216224:14310/07:00022824 Audiovizuální tvorba. Biochemie. čeština. Česká republika.
Koudeláková, Táňa (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Monincová, Marta (203 Česká republika) -- Jesenská, Andrea (203 Česká republika) -- Grodecká, Lucie (203 Česká republika) -- Senda, T. (392 Japonsko) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: proteins; engineering; substrate specifity; enantioselectivity
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 11. 2007 16:16.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/727147/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, František OPLUŠTIL, Andrea FOŘTOVÁ a Yuji NAGATA. ZPŮSOB DETOXIKACE SULFIDICKÉHO YPERITU ÚČINKEM HALOGENALKANDEHALOGENÁZ. 2007. Patent. Číslo: 298287. Vydavatel: Úřad průmyslového vlastnictví ČR. Místo vydání: ČR. Název vlastníka: MU. Datum registrace: 3. 6. 2005. Datum přijetí: 4. 7. 2007.
Název anglicky: Method of Detoxification of Yperite by using Haloalkane Dehalogenases
RIV: Patent. Biochemie. čeština. Česká republika.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Opluštil, František (203 Česká republika) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko)
Klíčová slova anglicky: Yperite; Haloalkane Dehalogenases
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 27. 3. 2018 14:12.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/978449/cs -
MIKELOVÁ, Radka, Zbyněk PROKOP, Jan HRADECKÝ, Libuše TRNKOVÁ, Vojtěch ADAM, Jiří DAMBORSKÝ a René KIZEK. A suggestion of enzymatic biosensor for determination of chlorinated pesticides. In 11th International conference on electroanalysis. první. Bordeaux: European Society for ElectroAnalytical Chemistry, 2006, s. 1-45, 300 s.
Název česky: Návrh enzymatického biosenzoru pro detekci chlorovaných pesticidů
Název anglicky: A suggestion of enzymatic biosensor for determination of chlorinated pesticides
RIV/00216224:14310/06:00020011 Stať ve sborníku. Elektrochemie. angličtina. Francie.
Mikelová, Radka (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Hradecký, Jan (203 Česká republika) -- Trnková, Libuše (203 Česká republika, garant) -- Adam, Vojtěch (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika) -- Kizek, René (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: silver electrode; carbon past electrode; modification; chloride; chlorinated hydrocarbon; electrochemistry
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 26. 7. 2007 16:20.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/637914/cs -
HRADECKÝ, Jan, Radka MIKELOVÁ, Zbyněk PROKOP, Libuše TRNKOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Vojtěch ADAM, Jitka PETRLOVÁ a René KIZEK. A suggestion of enzymatic biosensor for determination of chlorinated pesticides. 2006.URL
Název česky: Návrh enzymatického biosenzoru na stanovení chlorovaných pesticidů.
Název anglicky: A suggestion of enzymatic biosensor for determination of chlorinated pesticides.
RIV/00216224:14310/06:00017461 Audiovizuální tvorba. Kontaminace a dekontamin. půdy vč. pesticidů. angličtina. Česká republika.
Hradecký, Jan (203 Česká republika) -- Mikelová, Radka (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Trnková, Libuše (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant) -- Adam, Vojtěch (203 Česká republika) -- Petrlová, Jitka (203 Česká republika) -- Kizek, René (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: biosensor; degradation; chlorinated pesticides
Změnila: Ing. Radka Mikelová, Ph.D., učo 176915. Změněno: 19. 12. 2006 17:25.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/700062/cs -
MIKELOVÁ, Radka, Jan HRADECKÝ, Libuše TRNKOVÁ, David POTĚŠIL, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ, Jaroslav HUBÁLEK, Vojtěch ADAM a René KIZEK. Analýza chlorovaných uhlovodíků s využitím stříbrné a uhlíkové pastové elektrody. In XXVI. Moderní elektrochemické metody. První. Praha: Česká společnost chemická, 2006, s. 51-56, 154 s. ISBN 80-86238-98-9.
Název česky: Analýza chlorovaných uhlovodíků s využitím stříbrné a uhlíkové pastové elektrody
Název anglicky: Analysis of chlorinated hydrocarbons using silver and carbon paste electrodes
RIV/00216224:14310/06:00015332 Stať ve sborníku. Elektrochemie. čeština. Česká republika.
Mikelová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Hradecký, Jan (203 Česká republika) -- Trnková, Libuše (203 Česká republika, garant, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Hubálek, Jaroslav (203 Česká republika) -- Adam, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Kizek, René (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: silver electrode; carbon past electrode; modification; chloride; chlorinated hydrocarbon; electrochemistry;
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 29. 4. 2011 10:02.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/635204/cs -
TVRZOVÁ, Ludmila, Zbyněk PROKOP, Jitka NAVRÁTILOVÁ, Radka MULLEROVÁ a Jiří NEČA. Development of a microtiter plate-based method for determination of degradation profile of nitrophenolic compounds. Journal of Microbiological Methods. Amsterdam: Elsevier Science B.V., 2006, roč. 65, č. 3, s. 551-556. ISSN 0167-7012.URL
Název česky: Vývoj mikrodestičkové metody pro determinaci degradačního profilu nitrofenolů
Název anglicky: Development of a microtiter plate-based method for determination of degradation profile of nitrophenolic compounds
RIV/00216224:14310/06:00016572 Článek v odborném periodiku. Mikrobiologie, virologie. angličtina. Česká republika.
Tvrzová, Ludmila (203 Česká republika, garant) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Navrátilová, Jitka (203 Česká republika) -- Mullerová, Radka (203 Česká republika) -- Neča, Jiří (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: nitrophenolic; Rhodococcus; microtitre; degradation
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: RNDr. Ludmila Tvrzová, Ph.D., učo 2075. Změněno: 30. 6. 2007 16:28.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/585902/cs -
HRADECKÝ, Jan, Radka MIKELOVÁ, Zbyněk PROKOP, Libuše TRNKOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Vojtěch ADAM, Jana PETRLOVÁ a René KIZEK. Development of biosensor for determination of chlorinated pesticides. 2006.URL
Název česky: Vývoj biosenzoru pro stanovení chlorovaných pesticidů.
Název anglicky: Development of biosensor for determination of chlorinated pesticides.
RIV/00216224:14310/06:00017458 Audiovizuální tvorba. Znečištění a kontrola vody. angličtina. Česká republika.
Hradecký, Jan (203 Česká republika) -- Mikelová, Radka (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Trnková, Libuše (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant) -- Adam, Vojtěch (203 Česká republika) -- Petrlová, Jana (203 Česká republika) -- Kizek, René (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: biosensor; chlorinated pesticides
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 11. 2006 13:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/700059/cs -
MIKELOVÁ, Radka, Zbyněk PROKOP, Jan HRADECKÝ, Libuše TRNKOVÁ, Vojtěch ADAM, Miroslava BEKLOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ a René KIZEK. Development of Enzymatic Biosensor for Determination of Chlorinated Pesticides. 2006.URL
Název česky: Vývoj enzymatického biosenzoru na stanovení chlorovaných pesticidů.
Název anglicky: Development of Enzymatic Biosensor for Determination of Chlorinated Pesticides
RIV/00216224:14310/06:00017473 Audiovizuální tvorba. Biochemie. angličtina. Francie.
Mikelová, Radka (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Hradecký, Jan (203 Česká republika) -- Trnková, Libuše (203 Česká republika) -- Adam, Vojtěch (203 Česká republika) -- Beklová, Miroslava (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant) -- Kizek, René (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: biosensor; enzymes; chlorinated pesticid
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 11. 2006 18:42.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/700085/cs -
PROKOP, Zbyněk, Yukari SATO, Tomáš MOZGA, D.B. JANSSEN, Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Discovery of Stereoselective Haloalkane Dehalogenases: New Tool for Asymmetric Syntheses. 2006.URL
Název česky: Objev stereoselektivních haloalkan dehalogenáz: nový nástroj pro asymetrické syntézy.
Název anglicky: Discovery of Stereoselective Haloalkane Dehalogenases: New Tool for Asymmetric Syntheses.
RIV/00216224:14310/06:00017468 Audiovizuální tvorba. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Mozga, Tomáš (203 Česká republika) -- Janssen, D.B. (528 Nizozemské království) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: stereoselectivity; haloalkan dehalogenases; asymetric syntheses
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 14. 11. 2006 13:21.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/700077/cs -
MIKELOVÁ, Radka, Libuše TRNKOVÁ, Jan HRADECKÝ, Vojtěch ADAM, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ a René KIZEK. Elektrochemické stanovení chloridů na uhlíkových elektrodách. In Sborník příspěvků VI. Pracovního setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. Brno: Masarykova universita, 2006, s. 70-71, 125 s. ISBN 80-210-3943-4.
Název česky: Elektrochemické stanovení chloridů na uhlíkových elektrodách
Název anglicky: Electrochemical determination of chlorides on surfaces of carbon electrodes
RIV/00216224:14310/06:00015599 Stať ve sborníku. Elektrochemie. čeština. Česká republika.
Mikelová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Trnková, Libuše (203 Česká republika, garant, domácí) -- Hradecký, Jan (203 Česká republika) -- Adam, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Kizek, René (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Electrochemical determination; chlorides; carbon electrodes
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 29. 4. 2011 10:14.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/624545/cs -
KOUDELÁKOVÁ, Táňa, Zbyněk PROKOP, Marta MONINCOVÁ, Andrea JESENSKÁ, Lucie GRODECKÁ, Yukari SATO, Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Engineering of enantioselective enzyme by cumulative mutagenesis. 2006.URL
Název česky: Inženýrství enantioselektivních enzymů pomocí kumulativní mutageneze.
Název anglicky: Engineering of enantioselective enzyme by cumulative mutagenesis.
RIV/00216224:14310/06:00017460 Audiovizuální tvorba. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Koudeláková, Táňa (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Monincová, Marta (203 Česká republika) -- Jesenská, Andrea (203 Česká republika) -- Grodecká, Lucie (203 Česká republika) -- Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: mutagenesis; engineering; enzymes
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 11. 2006 14:50.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/700061/cs -
KOUDELÁKOVÁ, Táňa, Yukari SATO, Zbyněk PROKOP, Marta MONINCOVÁ, Andrea JESENSKÁ, Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Engineering of Enantioselective Haloalkane Dehalogenase by Cumulative Mutagenesis. 2006.URL
Název česky: Inženýrství enantioselektivních haloalkan dehalogenáz pomocí kumulativní mutageneze.
Název anglicky: Engineering of Enantioselective Haloalkane Dehalogenase by Cumulative Mutagenesis
RIV/00216224:14310/06:00017467 Audiovizuální tvorba. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Koudeláková, Táňa (203 Česká republika) -- Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Monincová, Marta (203 Česká republika) -- Jesenská, Andrea (203 Česká republika) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: haloalkan dehalogenases; enantioselectivity; cumulative mutagenesis
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 11. 2006 17:18.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/700074/cs -
KOUDELÁKOVÁ, Táňa, Zbyněk PROKOP, Yukari SATO, Marta MONINCOVÁ, Andrea FOŘTOVÁ, Lucie GRODECKÁ, T. SENDA, Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Engineering of Haloalkane Dehalogenase DhaA from Rhodococcus rhodochrous NCIMB 13064 Towards Higher Enantioselectivity. 2006.URL
Název česky: Inženýrství haloalkán dehalogenázy DhaA y bakterie Rhodococcus rhodochrous NCIMB 13064 k zvýšení enantioselectivity.
Název anglicky: Engineering of Haloalkane Dehalogenase DhaA from Rhodococcus rhodochrous NCIMB 13064 Towards Higher Enantioselectivity
RIV/00216224:14310/06:00017478 Prezentace na konferencích. Biochemie. angličtina. Německo.
Koudeláková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Monincová, Marta (203 Česká republika, domácí) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Grodecká, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Senda, T. (392 Japonsko) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Engineering; Haloalkane Dehalogenase; DhaA ;Rhodococcus rhodochrous; Enantioselectivity
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 29. 4. 2011 10:22.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/700489/cs -
PROKOP, Zbyněk, František OPLUŠTIL, J. DEFRANK a Jiří DAMBORSKÝ. Enzymes Fight Chemicals Weapons. Biotechnology Journal. 2006, roč. 1, č. 12, s. 1370-1380. ISSN 1860-6768.
Název česky: Enzymy bojují s chemickými zbraněmi.
Název anglicky: Enzymes Fight Chemicals Weapons.
RIV/00216224:14310/06:00017451 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Německo.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Opluštil, František (203 Česká republika) -- DeFrank, J. (840 Spojené státy) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: Enzymes; chemicals; degradation
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 17. 4. 2009 14:55.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/700046/cs -
HRADECKÝ, Jan, Radka MIKELOVÁ, Zbyněk PROKOP, Libuše TRNKOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Vojtěch ADAM, Jitka PETRLOVÁ a René KIZEK. Enzymový Biosenzor pro detekci chlorovaných pesticidů. In Sborník příspěvků X. pracovního setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Masarykova Universita, 2006, s. 66-67. ISBN 0-00-000000-0.
Název česky: Enzymový Biosenzor pro detekci chlorovaných pesticidů
Název anglicky: A suggestion of Enzymatic Biosensor for determination of chlorinated pesticides
RIV/00216224:14310/06:00015605 Stať ve sborníku. Elektrochemie. čeština. Česká republika.
Hradecký, Jan (203 Česká republika) -- Mikelová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Trnková, Libuše (203 Česká republika, garant, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Adam, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Petrlová, Jitka (203 Česká republika) -- Kizek, René (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Enzymatic Biosensor; determination; chlorinated pesticides; electrochemistry
Druh sborníku: postkonferenční sborník
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 29. 4. 2011 10:36.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/624731/cs -
NAKAMURA, Takashi, Marcel ZAMOCKY, Zbyněk ZDRÁHAL, Radka CHALOUPKOVA, Marta MONINCOVÁ, Zbyněk PROKOP, Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Expression of Glycosylated Haloalkane Dehalogenase LinB in Pichia pastoris. PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION. 2006, roč. 1/2006, č. 46, s. 85-91. ISSN 1046-5928.URL
Název česky: Exprese glykosylovane haloalkan dehalogenazy LinB v Pichia pastoris.
Název anglicky: Expression of Glycosylated Haloalkane Dehalogenase LinB in Pichia pastoris.
RIV/00216224:14310/06:00017437 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Nakamura, Takashi (392 Japonsko) -- Zamocky, Marcel (703 Slovensko) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika) -- Chaloupkova, Radka (203 Česká republika) -- Monincová, Marta (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: Dehalogenation; Pichia pastoris; Heterologous expression; Glycosylation; Thermal stability; Catalytic activity
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr., učo 34759. Změněno: 26. 6. 2009 10:34.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/699933/cs -
NAKAMURA, T., Marcel ZÁMOCKÝ, Zbyněk ZDRÁHAL, Radka CHALOUPKOVÁ, Marta MONINCOVÁ, Zbyněk PROKOP, Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Expression of Haloalkane Dehalogenase LinB in Pichia pastoris. 2006.URL
Název česky: Exprese haloalkan dehalogenázy LinB v Pichia pastoris
Název anglicky: Expression of Haloalkane Dehalogenase LinB in Pichia pastoris
RIV/00216224:14310/06:00017470 Audiovizuální tvorba. Biochemie. angličtina. Japonsko.
Nakamura, T. (392 Japonsko) -- Zámocký, Marcel (703 Slovensko) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Monincová, Marta (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: expression; haloalkan dehalogenases; LinB; Pichia pastoris
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 11. 2006 17:37.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/700080/cs -
MONINCOVÁ, Marta, Andrea FOŘTOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Yukari SATO, Zbyněk PROKOP a Jiří DAMBORSKÝ. High-throughput characterization of enzymes from genomic and proteomic projects-multivariate statistical approach. In Materials Structure in Chemistry, Biology, Physics and Technology. 2006.
Název česky: Rychlá charakteristika enzymů z genomických a proteomických projektů-využití vícerozměrné statistiky
Název anglicky: High-throughput characterization of enzymes from genomic and proteomic projects-multivariate statistical approach
RIV/00216224:14310/06:00017056 Prezentace na konferencích. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Monincová, Marta (203 Česká republika, domácí) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase; substrate specificity; screening; multivariate statistics
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 29. 4. 2011 10:54.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/692354/cs -
DAMBORSKÝ, Jiří, Zbyněk PROKOP, Táňa KOUDELÁKOVÁ, Tomáš MOZGA, Petr JEŘÁBEK, Yukari SATO, Yuji NAGATA a T. SENDA. Natural and Engineered Enantioselective Haloalkane Dehalogenases. 2006.URL
Název česky: Přirozená a získáná enantioselektivita haloalkan dehalogenáz.
Název anglicky: Natural and Engineered Enantioselective Haloalkane Dehalogenases
RIV/00216224:14310/06:00017476 Audiovizuální tvorba. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Koudeláková, Táňa (203 Česká republika) -- Mozga, Tomáš (203 Česká republika) -- Jeřábek, Petr (203 Česká republika) -- Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Senda, T. (392 Japonsko)
Klíčová slova anglicky: Enyzmes; Proteins; Enantioselectivity; Modelling
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 5. 11. 2006 10:49.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/700486/cs -
HRADECKÝ, Jan, Radka MIKELOVÁ, Zbyněk PROKOP, Libuše TRNKOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Vojtěch ADAM, Jitka PETRLOVÁ a René KIZEK. Navržení Biosenzoru pro detekci chlorovaných pesticidů. In Sborník příspěvků VI. Pracovního setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. Brno: Masarykova universita, 2006, s. 50-51, 125 s. ISBN 80-210-3943-4.
Název česky: Navržení Biosenzoru pro detekci chlorovaných pesticidů
Název anglicky: Development of Biosensor for determination of chlorinated pesticides
RIV/00216224:14310/06:00015597 Stať ve sborníku. Elektrochemie. čeština. Česká republika.
Hradecký, Jan (203 Česká republika) -- Mikelová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Trnková, Libuše (203 Česká republika, garant, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Adam, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Petrlová, Jitka (203 Česká republika) -- Kizek, René (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Biosensor; determination; chlorinated pesticides
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 29. 4. 2011 11:05.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/624534/cs -
CHALOUPKOVÁ, Radka, Zbyněk PROKOP, Monika STRAKOVÁ, Tomáš MOZGA a Jiří DAMBORSKÝ. Physical Variables as a Control of Enzyme Stereoselectivity. 2006.URL
Název česky: Fyzikální změny jako kontrola stereoselektivity enzymů.
Název anglicky: Physical Variables as a Control of Enzyme Stereoselectivity
RIV/00216224:14310/06:00017465 Audiovizuální tvorba. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Straková, Monika (203 Česká republika) -- Mozga, Tomáš (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: Enzymes; stereoslektivity; physical variables
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 11. 2006 16:58.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/700070/cs -
MONINCOVÁ, Marta, Yuji NAGATA, Radka CHALOUPKOVÁ, Zbyněk PROKOP, Andrea FOŘTOVÁ, Martina PAVLOVÁ, Masataka TSUDA a Jiří DAMBORSKÝ. Protein engineering of haloalkane dehalogenase LinB: reconstruction of active site and modification of entrance tunnel. In Book of Abstracts, 10th International Symposium of the Genetics of Industrial Microorganisms. 1. vyd. Praha: Institute of Microbiology ASCR, 2006, s. 160-161. ISBN 80-239-7323-1.
Název česky: Proteinové inženýrství haloalkán dehalogenázy LinB: rekonstrukce aktivního místa a modifikace vstupního tunelu.
Název anglicky: Protein engineering of haloalkane dehalogenase LinB: reconstruction of active site and modification of entrance tunnel
RIV/00216224:14310/06:00017059 Stať ve sborníku. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Monincová, Marta (203 Česká republika, domácí) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Fořtová, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Pavlová, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Tsuda, Masataka (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenase; protein engineering; entrance tunnel; active site
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 29. 4. 2011 11:05.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/692362/cs -
CHALOUPKOVÁ, Radka, Zbyněk PROKOP, Monika STRAKOVÁ, Tomáš MOZGA a Jiří DAMBORSKÝ. Řízení stereoselektivity enzymu fyzikálně-chemickými parametry. 2006.URL
Název česky: Řízení stereoselektivity enzymu fyzikálně-chemickými parametry
Název anglicky: Direction of Enzymes Stereoselectivity by physical-chemical Parameters.
RIV/00216224:14310/06:00017475 Audiovizuální tvorba. Biochemie. čeština. Česká republika.
Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Straková, Monika (203 Česká republika) -- Mozga, Tomáš (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: Enzymes; stereoselectivity;
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 5. 11. 2006 10:42.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/700485/cs -
PAPAJAK, Ewa, Zbyněk PROKOP, Radka CHALOUPKOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ a Piotr PANETH. Solvent Isotope Effects on Haloalkane Dehalogenase LinB. 2006.URL
Název česky: Efekty isotopu na haloalkan dehalogenázu LinB.
Název anglicky: Solvent Isotope Effects on Haloalkane Dehalogenase LinB.
RIV/00216224:14310/06:00017463 Audiovizuální tvorba. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Papajak, Ewa (616 Polsko) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant) -- Paneth, Piotr (616 Polsko)
Klíčová slova anglicky: isotope; solvent; haloalkan dehalogenases; LinB
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 4. 11. 2006 16:38.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/700066/cs -
MONINCOVÁ, Marta, Radka CHALOUPKOVÁ, Yuji NAGATA, Zbyněk PROKOP, Soňa MARVANOVÁ, Jana SÝKOROVÁ, Andrea JESENSKÁ, Martina PAVLOVÁ, M. TSUDA a Jiří DAMBORSKÝ. Structure-Based Engineering of Haloalkane Dehalogenase. 2006.URL
Název česky: Inženýrství založené na změně struktury haloalkán dehalogenáz.
Název anglicky: Structure-Based Engineering of Haloalkane Dehalogenase
RIV/00216224:14310/06:00017477 Audiovizuální tvorba. Biochemie. angličtina. Česká republika.
Monincová, Marta (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Marvanová, Soňa (203 Česká republika) -- Sýkorová, Jana (203 Česká republika) -- Jesenská, Andrea (203 Česká republika) -- Pavlová, Martina (203 Česká republika) -- Tsuda, M. (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: Haloalkan dehalogenases; engineering; structure
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 5. 11. 2006 10:56.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/700488/cs -
PAVLOVÁ, Martina, Martin KLVAŇA, Andrea JESENSKÁ, Zbyněk PROKOP, Hana KONEČNÁ, T. SATO, M. TSUDA, Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. The Identification of Catalytic Pentad in the Haloalkane Dehalogenase DhmA from Mycobacterium avium N85: Reaction Mechanism and Molecular Evolution. JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY. 2006, roč. 1/2006, č. 1, s. 9999-10007. ISSN 1047-8477.URL
Název česky: Identifikace katalytických pentád v haloalkán dehalogenáze DhmA y bakterie Mycobacterium avium N85:reakční mechanismus a molekulární evoluce.
Název anglicky: The Identification of Catalytic Pentad in the Haloalkane Dehalogenase DhmA from Mycobacterium avium N85: Reaction Mechanism and Molecular Evolution
RIV/00216224:14310/06:00017450 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Pavlová, Martina (203 Česká republika) -- Klvaňa, Martin (203 Česká republika) -- Jesenská, Andrea (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Konečná, Hana (203 Česká republika) -- Sato, T. (392 Japonsko) -- Tsuda, M. (392 Japonsko) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: Haloalkane dehalogenase DhmA; Mycobacterium avium N85; expression ; Site-directed mutagenesis
Recenzováno: ano
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 19. 3. 2010 12:17.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/700044/cs -
CHALOUPKOVÁ, Radka, Zbyněk PROKOP, Monika STRAKOVÁ, Tomáš MOZGA a Jiří DAMBORSKÝ. The stereoselectivity and Conformational Stability of Haloalkane Dehalogenase DbjA from Bradyrhizobium japonicum USDA110: The Effect of Temperature and pH. 2006.URL
Název česky: Stereoselektivita a konformační stabilita haloalkán dehalogenázy DbjA z bakaterie Bradyrhizobium japonicum USDA110: význam teploty a pH.
Název anglicky: The stereoselectivity and Conformational Stability of Haloalkane Dehalogenase DbjA from Bradyrhizobium japonicum USDA110: The Effect of Temperature and pH
RIV/00216224:14310/06:00017479 Prezentace na konferencích. Biochemie. angličtina. Německo.
Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Straková, Monika (203 Česká republika, domácí) -- Mozga, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Stereoselectivity; Conformational Stability; Haloalkane Dehalogenase; Temperature; pH
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 29. 4. 2011 11:20.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/700490/cs -
HRADECKÝ, Jan, Radka MIKELOVÁ, Zbyněk PROKOP, Libuše TRNKOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Vojtěch ADAM a René KIZEK. Vyvoj enzymoveho biosenzoru pro detekci chlorovanych pesticidu. In VI. Mezioborove setkani mladych biologu, biochemiku a chemiku; Sigma-Aldrich. první. Praha: Ceska spolecnost chemicka, 2006, s. 384-385. ISSN 0009-2770.
Název česky: Vyvoj enzymoveho biosenzoru pro detekci chlorovanych pesticidu
Název anglicky: A suggestion of enzymatic biosensor for determination of chlorinated pesticides
RIV/00216224:14310/06:00015744 Stať ve sborníku. Elektrochemie. čeština. Česká republika.
Hradecký, Jan (203 Česká republika) -- Mikelová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Trnková, Libuše (203 Česká republika, garant, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Adam, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Kizek, René (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: silver electrode; carbon past electrode; modification; chloride; chlorinated hydrocarbon; electrochemistry
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 29. 4. 2011 11:23.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/638526/cs -
NAGATA, Yuji, Zbyněk PROKOP, Yukari SATO, Petr JEŘÁBEK, Ashawi KUMAR, Yoshiyuhi OHTSUBO, Masataka TSUDA a Jiří DAMBORSKÝ. Degradation of b-Hexachlorocyclohexane by Haloalkane Dehalogenase LinB from Sphingomonas paucimobilis UT26. Applied and Environmental Microbiology. USA, 2005, roč. 71, č. 4, s. 2183-2185. ISSN 0099-2240.URL
Název česky: Degradace b-Hexachlorocyclohexanu haloalkan dehalogenázou LinB z bakterie Sphingomonas paucimobilis UT26.
Název anglicky: Degradation of b-Hexachlorocyclohexane by Haloalkane Dehalogenase LinB from Sphingomonas paucimobilis UT26.
RIV/00216224:14330/05:00013656 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Jeřábek, Petr (203 Česká republika) -- Kumar, Ashawi (356 Indie) -- Ohtsubo, Yoshiyuhi (392 Japonsko) -- Tsuda, Masataka (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: b-hexachlorocyclohexane; degradation; haloalkane dehalogenase LinB; HCH; UT26
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 19. 3. 2010 12:32.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/569726/cs -
JESENSKÁ, Andrea, Martina PAVLOVÁ, Michal STROUHAL, Radka CHALOUPKOVÁ, Iva TĚŠÍNSKÁ, Marta MONINCOVÁ, Zbyněk PROKOP, Milan BARTOŠ, Ivo PAVLÍK, Ivan RYCHLÍK, Petra MOBIUS, Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Mycobacterial Haloalkane Dehalogenases: Cloning, Biochemical Properties and distribution. Applied and Environmental Microbiology. 2005, roč. 71, č. 11, s. 6736-6745. ISSN 0099-2240.URL
Název česky: Mykobakteriální haloalkán dehalogenázy:klonování, biochemické vlastnosti a distribuce.
Název anglicky: Mycobacterial Haloalkane Dehalogenases: Cloning, Biochemical Properties and distribution.
RIV/00216224:14310/05:00014724 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Jesenská, Andrea (203 Česká republika) -- Pavlová, Martina (203 Česká republika) -- Strouhal, Michal (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Těšínská, Iva (203 Česká republika) -- Monincová, Marta (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Bartoš, Milan (203 Česká republika) -- Pavlík, Ivo (203 Česká republika) -- Rychlík, Ivan (203 Česká republika) -- Mobius, Petra (276 Německo) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: haloalkane dehalogenases; mycobacterium; cloning;
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 19. 3. 2010 12:17.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/620146/cs -
SATO, Yukari, Marta MONINCOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Zbyněk PROKOP, Yoshiyuki OHTSUBO, Kiwamu MINAMISAWA, Masataka TSUDA, Jiří DAMBORSKÝ a Yuji NAGATA. Two Rhizobial Strains, Mesorhizobium loti MAFF303099 and Bradyrhizobium japonicum USDA110, Encode Haloalkane Dehalogenases with Novel Structures and Substrate Specificities. APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY. 2005, roč. 71, č. 8, s. 43724379-43724386. ISSN 0099-2240.URL
Název česky: Dva rhiyobiální Kkeny Mesorhizobium loti MAFF303099 and Bradyrhizobium japonicum USDA110,kódující haloalkán dehalogenázy s novou strukturou a substrátovou specifitou.
Název anglicky: Two Rhizobial Strains, Mesorhizobium loti MAFF303099 and Bradyrhizobium japonicum USDA110, Encode Haloalkane Dehalogenases with Novel Structures and Substrate Specificities
RIV/00216224:14310/05:00014120 Článek v odborném periodiku. Mikrobiologie, virologie. angličtina. Spojené státy.
Sato, Yukari (392 Japonsko) -- Monincová, Marta (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Ohtsubo, Yoshiyuki (392 Japonsko) -- Minamisawa, Kiwamu (392 Japonsko) -- Tsuda, Masataka (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko)
Klíčová slova anglicky: Haloalkane dehalogenases;rhizobial strains;Mesorhizobium loti MAFF303099 and Bradyrhizobium japonicum USDA110;
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 19. 3. 2010 12:32.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/586887/cs -
HRADECKÝ, Jan, Radka MIKELOVÁ, Zbyněk PROKOP, Libuše TRNKOVÁ, Jiří DAMBORSKÝ, Vojtěch ADAM, Jitka PETRLOVÁ a René KIZEK. Vývoj enzymového biosenzoru pro detekci chlorovaných pesticidů. In Sborník příspěvků: MendelNet 2005. Brno: Mendelova zemedelska a lesnicka univerzita v Brně, 2005, s. 61-61, 139 s. ISBN 80-7157-905-X.
Název česky: Vývoj enzymového biosenzoru pro detekci chlorovaných pesticidů
Název anglicky: Development of enzym biosenzor for detection of chlorinated pesticides
RIV/00216224:14310/05:00013236 Stať ve sborníku. Elektrochemie. čeština. Česká republika.
Hradecký, Jan (203 Česká republika) -- Mikelová, Radka (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Trnková, Libuše (203 Česká republika, garant) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika) -- Adam, Vojtěch (203 Česká republika) -- Petrlová, Jitka (203 Česká republika) -- Kizek, René (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: enzym; biosenzor; chlorinated pesticides; toxic
Změnila: prof. RNDr. Libuše Trnková, CSc., učo 1027. Změněno: 6. 2. 2006 18:30.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/622445/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, František OPLUŠTIL, Andrea JESENSKÁ a Yuji NAGATA. Způsob detoxikace sulfidického yperitu psobením halogenalkandehalogenázami. 2005. Patent. Číslo: PV2005/352. Vydavatel: Masarykova univerzita, rektorát. Místo vydání: Brno, Česká republika. Název vlastníka: Masarykova univerzita, rektorát. Datum registrace: 3. 6. 2005. Datum přijetí: 3. 6. 2005.
Název česky: Způsob detoxikace sulfidického yperitu psobením halogenalkandehalogenázami
Název anglicky: Method of detoxification of yperite by using haloalkane dehalogenases
Biochemie. čeština. Česká republika.
Klíčová slova anglicky: yperite; method for detoxification ;haloalkane dehalogenases
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 8. 4. 2009 14:51.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/620625/cs -
PROKOP, Zbyněk, Jiří DAMBORSKÝ, Dick JANSSEN a Yuji NAGATA. Způsob výroby opticky aktivních halogenalkanů a alkoholů hydrolytickou dehalogenací katalyzovanou halogenalkandehalogenázami. 2005. Patent. Číslo: PCT/CZ2005/000099. Vydavatel: Masarykova univerzita, rektorát. Místo vydání: Brno, Česká Republika. Název vlastníka: Masarykova univerzita, rektorát. Datum registrace: 27. 12. 2004. Datum přijetí: 27. 12. 2004.
Název česky: Způsob výroby opticky aktivních halogenalkanů a alkoholů hydrolytickou dehalogenací katalyzovanou halogenalkandehalogenázami
Název anglicky: METHOD OF PRODUCTION OF OPTICALLY ACTIVE HALOHYDROCARBONS AND ALCOHOLS USING HYDROLYTIC DEHALOGENATION CATALYSED BY HALOALKANE DEHALOGENASES
Biochemie. čeština. Česká republika.
Klíčová slova anglicky: haloalkanes; haloalcohols; alcohols; halopolyols and polyols; enzymes;haloalkane dehalogenases
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 2. 2. 2006 10:59.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/620605/cs -
MONINCOVÁ, Marta, Yukari SATO, Iva TĚŠÍNSKÁ, Zbyněk PROKOP, Yuji NAGATA a Jiri DAMBORSKY. Substrátová specifita haloalkandehalogenáz. In Sborník abstraktů, STUDENTSKÁ VĚDECKÁ KONFERENCE v oboru chemie a biochemie. 1. vyd. Brno: Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity v Brně, 2004, s. 40.
Název anglicky: Substrate specificity of haloalkane dehalogenases
Biochemie. čeština. Česká republika.
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 18. 5. 2004 14:05.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/554426/cs -
PROKOP, Zbyněk, Marta MONINCOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Martin KLVAŇA, Yuji NAGATA, Dick B. JANSSEN a Jiří DAMBORSKÝ. Catalytic mechanism of the haloalkane dehalogenase LinB from Sphingomonas paucimobilis UT26. Journal of Biological Chemistry. 2003, roč. 278, č. 46, s. 45094-45100. ISSN 0021-9258.URL
Název anglicky: Catalytic mechanism of the haloalkane dehalogenase LinB from Sphingomonas paucimobilis UT26
RIV/00216224:14310/03:00009155 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant) -- Monincová, Marta (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Klvaňa, Martin (203 Česká republika) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Janssen, Dick B. (528 Nizozemské království) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: ENZYME; KINETICS; MECHANISM; LINB; HALOALKANE DEHALOGENASE
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 19. 3. 2010 11:05.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/490382/cs -
STRELTSOV, Victor, Zbyněk PROKOP, Jiří DAMBORSKÝ, Yuji NAGATA, Aaron OAKLEY a Matthew C.J. WILCE. Haloalkane dehalogenase LinB from Sphingomonas paucimobilis UT26: X-ray crystallographic studies of dehalogenation of brominated substrates. Biochemistry. 2003, roč. 42, č. 34, s. 10104-10112. ISSN 0006-2960.URL
Název anglicky: Haloalkane dehalogenase LinB from Sphingomonas paucimobilis UT26: X-ray crystallographic studies of dehalogenation of brominated substrates
RIV/00216224:14310/03:00008998 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Streltsov, Victor (36 Austrálie) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Oakley, Aaron (36 Austrálie) -- Wilce, Matthew C.J. (36 Austrálie)
Klíčová slova anglicky: DEHALOGENASE X-RAY GC-MS
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 19. 3. 2010 11:05.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/489638/cs -
PROKOP, Zbyněk, Pavel ČUPR, V. ZLEVOROVÁ-ZLÁMALÍKOVÁ, Josef KOMÁREK, Ladislav DUŠEK a Ivan HOLOUBEK. Mobility, bioavailability and toxic effects of cadmium in soil samples. Environmental Research. 2003, roč. 91, -, s. 119-126. ISSN 0013-9351.
Název česky: mobilita, biodostupnost a toxické efekty kadmia v půdě
Název anglicky: Mobility, bioavailability and toxic effects of cadmium in soil samples.
RIV/00216224:14310/03:00008644 Článek v odborném periodiku. Vliv životního prostředí na zdraví. angličtina. Nizozemské království.
Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, garant) -- Čupr, Pavel (203 Česká republika) -- Zlevorová-Zlámalíková, V. (203 Česká republika) -- Komárek, Josef (203 Česká republika) -- Dušek, Ladislav (203 Česká republika) -- Holoubek, Ivan (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Mobility; bioavailability and toxic effects of cadmium in soil samples.
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: doc. RNDr. Pavel Čupr, Ph.D., učo 16144. Změněno: 14. 8. 2008 09:22.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/554111/cs -
CHALOUPKOVÁ, Radka, Jana SÝKOROVÁ, Zbyněk PROKOP, Andrea JESENSKÁ, Marta MONINCOVÁ, Martina PAVLOVÁ, Masataka TSUDA, Yuji NAGATA a Jiří DAMBORSKÝ. Modification of Activity and Specificity of Haloalkane Dehalogenase from Sphingomonas paucimobilis UT26 by Engineering of its Entrance Tunnel. Journal of Biological Chemistry. 2003, roč. 278, č. 52, s. 52622-52628. ISSN 1083-351X.URL
Název anglicky: Modification of Activity and Specificity of Haloalkane Dehalogenase from Sphingomonas paucimobilis UT26 by Engineering of its Entrance Tunnel
RIV/00216224:14310/03:00009370 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Sýkorová, Jana (203 Česká republika) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Jesenská, Andrea (203 Česká republika) -- Monincová, Marta (203 Česká republika) -- Pavlová, Martina (203 Česká republika) -- Tsuda, Masataka (392 Japonsko) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: DEHALOGENASE MUTAGENESIS SPECIFICITY
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 19. 3. 2010 11:05.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/491667/cs -
NAGATA, Yuji, Zbyněk PROKOP, Soňa MARVANOVÁ, Jana SÝKOROVÁ, Marta MONINCOVÁ, Masataka TSUDA a Jiří DAMBORSKÝ. Re-construction of mycobacterial dehalogenase Rv2579 by cumulative mutagenesis of haloalkane dehalogenase LinB. Applied and Environmental Microbiology. 2003, roč. 69, č. 4, s. 2349-2355. ISSN 1098-5336.URL
Název česky: Re-konstrukce mycobakteriální dehalogenázy Rv2579 kumulativní mutagenezí haloalkán dehalogenázy LinB
Název anglicky: Re-construction of mycobacterial dehalogenase Rv2579 by cumulative mutagenesis of haloalkane dehalogenase LinB
RIV/00216224:14310/03:00009851 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Marvanová, Soňa (203 Česká republika) -- Sýkorová, Jana (203 Česká republika) -- Monincová, Marta (203 Česká republika) -- Tsuda, Masataka (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: MUTANT; EVOLUTION; MYCOBACTERIUM; DEHALOGENATION; BIODEGRADATION
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 19. 3. 2010 11:05.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/485836/cs -
MONINCOVÁ, Marta, Yuji NAGATA, Zbyněk PROKOP, Soňa MARVANOVÁ, Jana SÝKOROVÁ, Masataka TSUDA a Jiří DAMBORSKÝ. Validation of Putative Enzymes from Genomic Projects: Confirmation of Dehalogenation ARv2ctivity for Mycobacterial Protein 579. In Management and Control of (Undesirable) Microorganisms, IBBS/IBRG Meeting Abstracts. Manchester, UK: IBBS/IBRG, 2003, s. 28.
Název česky: Validace Enzymů:Zjištění dehalogenační aktivity Mzkobakteriálního proteinu 579.
Název anglicky: Validation of Putative Enzymes from Genomic Projects: Confirmation of Dehalogenation Activity for Mycobacterial Protein Rv2579
RIV: Stať ve sborníku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Monincová, Marta (203 Česká republika) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Marvanová, Soňa (203 Česká republika) -- Sýkorová, Jana (203 Česká republika) -- Tsuda, Masataka (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: dehalogenase; halogenated hydrocarbons; site-directed mutagenesis
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 20. 6. 2008 13:14.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/491513/cs -
OAKLEY, Aaron, Zbyněk PROKOP, Michal BOHÁČ, Jan KMUNÍČEK, Tomáš JEDLIČKA, Marta MONINCOVÁ, Ivana KUTÁ-SMATANOVÁ, Yuji NAGATA, Jiří DAMBORSKÝ a Matthew WILCE. Exploring the structure and activity of haloalkane dehalogenase from Sphingomonas paucimobilis UT26: evidence for product and water mediated inhibition. Biochemistry. 2002, roč. 41, č. 15, s. 4847-4855. ISSN 0006-2960.URL
Název anglicky: Exploring the structure and activity of haloalkane dehalogenase from Sphingomonas paucimobilis UT26: evidence for product and water mediated inhibition
RIV/00216224:14310/02:00006262 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Oakley, Aaron (36 Austrálie) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Boháč, Michal (203 Česká republika) -- Kmuníček, Jan (203 Česká republika) -- Jedlička, Tomáš (203 Česká republika) -- Monincová, Marta (203 Česká republika) -- Kutá-Smatanová, Ivana (203 Česká republika) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant) -- Wilce, Matthew (36 Austrálie)
Klíčová slova anglicky: X-RAY; DEHALOGENATION; ENZYME; PROTEIN ENGINEERING; INHIBITION
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 19. 3. 2010 10:54.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/404587/cs -
BOHÁČ, Michal, Yuji NAGATA, Zbyněk PROKOP, Martin PROKOP, Marta MONINCOVÁ, Masataka TSUDA, Jaroslav KOČA a Jiri DAMBORSKÝ. Halide-stabilizing residues of haloalkane dehalogenases studied by quantum mechanic calculations and site-directed mutagenesis. Biochemistry. 2002, roč. 41, č. 48, s. 14272-14280. ISSN 0006-2960.URL
Název anglicky: Halide-stabilizing residues of haloalkane dehalogenases studied by quantum mechanic calculations and site-directed mutagenesis
RIV/00216224:14310/02:00006914 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
Boháč, Michal (203 Česká republika) -- Nagata, Yuji (392 Japonsko) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika) -- Prokop, Martin (203 Česká republika) -- Monincová, Marta (203 Česká republika) -- Tsuda, Masataka (392 Japonsko) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika) -- Damborský, Jiri (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: QUANTUM MECHANICS; HALIDE; MUTANT; PROTEIN ENGINEERING; STABILISATION
Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 19. 3. 2010 10:54.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/407283/cs -
ČUPR, Pavel, Zbyněk PROKOP, Alan GAVEL, Alena ANSORGOVá a I HOLOUBEK. Bioavailability and mobility of organic contaminants in soil and sediment samples: a three-step ecotoxicology evaluation. In 6th SECOTOX World Conagress and 6th European Conference on Ecotoxicology and Environmental Safety. Krakow : Art-Tekst, 2001, s. 253. ISBN 83-88316-10-9.
Změnil: doc. RNDr. Pavel Čupr, Ph.D., učo 16144. Změněno: 7. 3. 2010 18:23.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/389241/cs -
PROKOP, Zbyněk a Ivan HOLOUBEK. The use of a microbial contact toxicity test for evaluating cadmium bioavailability in soil. J. Soils and Sediments. 2001, roč. 1, č. 1, s. 21-24.
Název anglicky: The use of a microbial contact toxicity test for evaluating cadmium bioavailability in soil
RIV/00216224:14310/01:00005287 Článek v odborném periodiku. Vliv životního prostředí na zdraví. angličtina. Nizozemské království.
Změnil: prof. RNDr. Luděk Bláha, Ph.D., učo 15473. Změněno: 15. 1. 2002 08:27.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/388871/cs -
PROKOP, Zbyněk, Pavel ČUPR a Ivan HOLOUBEK. Hodnocení biodostupnosti organických látek půdním mikroorganismům kontaktními testy toxicity. In Hodnocení rizik pro životní prostředí - ERA 2000. Brno: Masarykova univerzita & TOCOEN, s.r.o., 2000, s. 188-189. ISBN 80-210-2328-7.
Název anglicky: Evaluation of bioassassment to soil microorganisms by contact toxicity tests
RIV/00216224:14310/00:00000100 Stať ve sborníku. Vliv životního prostředí na zdraví. čeština. Česká republika.
Změnil: prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D., učo 23696. Změněno: 10. 7. 2000 09:59.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/323931/cs -
ČUPR, Pavel, Zbyněk PROKOP, Michal ŠKAREK, Alan GAVEL, Blahoslav MARŠÁLEK, Karel CHROUST a Ivan HOLOUBEK. Screeningové hodnocení environmentálních rizik v sedimentech regionu Zlín. In Hodnocení rizik pro životní prostředí - ERA 2000. Brno: Masarykova univerzita & TOCOEN, s.r.o., 2000, s. 174-176. ISBN 80-210-2328-7.
Název anglicky: Screening assessment of environmental risks in Zlín region
RIV/00216224:14310/00:00000099 Stať ve sborníku. Vliv životního prostředí na zdraví. čeština. Česká republika.
Změnil: prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D., učo 23696. Změněno: 10. 7. 2000 09:56.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/323914/cs
2025
2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
2016
2015
2014
2013
2012
2011
2010
2009
2008
2007
2006
2005
2004
2003
2002
2001
2000
Zobrazeno: 21. 2. 2025 23:19