-
STERNBERG, Christina, Martin RAIGEL, Tanja LIMBERGER, Karolína TRACHTOVÁ, Michaela SCHLEDERER, Desiree LINDNER, Petra KODAJOVA, Jiaye YANG, Roman ZIEGLER, Jessica KALLA, Stefan STOIBER, Saptaswa DEY, Daniela ZWOLANEK, Heidi A NEUBAUER, Monika OBERHUBER, Torben REDMER, Václav HEJRET, Boris TICHÝ, Martina TOMBERGER, Nora S HARBUSCH, Jan PENCIK, Simone TANGERMANN, Vojtěch BYSTRÝ, Jenny L PERSSON, Gerda EGGER, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Robert EFERL, Peter WOLF, Felix STERNBERG, Sandra HOGLER, Sabine LAGGER, Stefan ROSE-JOHN a Lukas KENNER. Cell-autonomous IL6ST activation suppresses prostate cancer development via STAT3/ARF/p53-driven senescence and confers an immune-active tumor microenvironment. Molecular Cancer. London: BMC, 2024, roč. 23, č. 1, s. 1-22. ISSN 1476-4598. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12943-024-02114-8.URL
angličtina.
Klíčová slova anglicky: Prostate cancer; IL6ST/STAT3 signaling; L-gp130; Senescence; Senescence-associated secretory phenotype; Tumor microenvironment; Immune cell infiltration; Cytotoxic T-cells
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 25. 11. 2024 09:21.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2454757/cs -
YAMOUNE, Amel, Markéta ŽĎÁRSKÁ, Thomas DEPAEPE, Anna RUDOLFOVÁ, Jan SKALÁK, Kenneth Wayne BERENDZEN, Virtudes MIRA-RODADO, Michael FITZ, Blanka PEKÁROVÁ, Katrina Leslie MALÁ, Paul TARR, Eliška ŠPAČKOVÁ, Lucia TOMOVIČOVÁ, Barbora PARIZKOVA, Abigail FRANCZYK, Ingrid KOVÁČOVÁ, Vladislav DOLGIKH, Elena ZEMLYANSKAYA, Markéta PERNISOVÁ, Ondrej NOVAK, Elliot MEYEROWITZ, Klaus HARTER, Dominique VAN DER STRAETEN a Jan HEJÁTKO. Cytokinins regulate spatially specific ethylene production to control root growth in Arabidopsis. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.xplc.2024.101013.URL
Název anglicky: Cytokinins regulate spatially specific ethylene production to control root growth in Arabidopsis
angličtina.
Klíčová slova anglicky: cytokinin, ethylene, ACC SYNTHASE, ACC OXIDASE, multistep phosphorelay, Arabidopsis
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 13. 8. 2024 13:33.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2421740/cs -
MARTINEK, Vlastimil, Jessica MARTIN, Cedric BELAIR, Matthew J PAYEA, Sulochan MALLA, Panagiotis ALEXIOU a Manolis MARAGKAKIS. Deep learning and direct sequencing of labeled RNA captures transcriptome dynamics. NAR Genomics and Bioinformatics. Oxford University Press (OUP), 2024, Vol. 6, Issue 3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nargab/lqae116.
Recenzováno: ano
Změnil: Mgr. Vlastimil Martinek, učo 445261. Změněno: 10. 9. 2024 12:38.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2431257/cs -
VETEŠNÍKOVÁ ŠIMKOVÁ, Andrea, Kristína KŘÍŽOVÁ, Kristýna VOŘÍŠKOVÁ, Lukáš VETEŠNÍK, Václav HEJRET, Lenka GETTOVÁ, Jiří VOREL, Nikol RESLOVÁ a Vojtěch BYSTRÝ. Heterosis versus breakdown in cyprinid hybrids associated with SVCV infection revealed by transcriptome profile analysis of head kidney. Aquaculture. AMSTERDAM: ELSEVIER, 2024, roč. 578, January, s. "740083", 14 s. ISSN 0044-8486. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.aquaculture.2023.740083.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Vetešníková Šimková, Andrea (203 Česká republika, garant, domácí) -- Křížová, Kristína (703 Slovensko, domácí) -- Voříšková, Kristýna (203 Česká republika, domácí) -- Vetešník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Hejret, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Gettová, Lenka (703 Slovensko, domácí) -- Vorel, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Reslová, Nikol (203 Česká republika, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Cyprinids; Cyprinus carpio; Carassius gibelio; SVCV; Hybridization; Hybrid heterosis; Hybrid breakdown; Transcriptome profile analysis
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 8. 3. 2024 07:44.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2333158/cs -
ŠÁMALOVÁ, Markéta, Alesia MELNIKAVA, Kareem ELSAYAD, Alexis PEAUCELLE, Evelína GAHUROVÁ, Jaromír GUMULEC, Ioannis SPYROGLOU, Elena V ZEMLYANSKAYA, Elena V UBOGOEVA, Darina BALKOVÁ, Martin DEMKO, Nicolas BLAVET, Panagiotis ALEXIOU, Vladimir BENES, Gregory MOUILLE a Jan HEJÁTKO. Hormone-regulated expansins: Expression, localization, and cell wall biomechanics in Arabidopsis root growth. Plant Physiology. CARY: OXFORD UNIV PRESS INC, 2024, roč. 194, č. 1, s. 209-228. ISSN 0032-0889. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/plphys/kiad228.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Šámalová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Melnikava, Alesia (112 Bělorusko, domácí) -- Gahurová, Evelína (203 Česká republika, domácí) -- Gumulec, Jaromír (203 Česká republika, domácí) -- Spyroglou, Ioannis (300 Řecko, domácí) -- Balková, Darina (703 Slovensko, domácí) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Blavet, Nicolas (250 Francie, domácí) -- Alexiou, Panagiotis (300 Řecko, domácí) -- Benes, Vladimir (276 Německo) -- Mouille, Gregory (250 Francie) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: GENE-EXPRESSION; ORGAN INITIATION; ALPHA-EXPANSIN; CYTOKININ; STRESS; AUXIN
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Adéla Pešková, učo 143895. Změněno: 9. 10. 2024 13:25.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2294400/cs -
REDMER, Torben, Martin RAIGEL, Christina STERNBERG, Roman ZIEGLER, Clara PROBST, Desiree LINDNER, Astrid AUFINGER, Tanja LIMBERGER, Karolína TRACHTOVÁ, Petra KODAJOVA, Sandra HOEGLER, Michaela SCHLEDERER, Stefan STOIBER, Monika OBERHUBER, Marco BOLIS, Heidi A NEUBAUER, Sara MIRANDA, Martina TOMBERGER, Nora S HARBUSCH, Garces de los Fayos Alonso INES, Felix STERNBERG, Richard MORIGGL, Jean-Philippe THEURILLAT, Boris TICHÝ, Vojtěch BYSTRÝ, Jenny L PERSSON, Stephan MATHAS, Fritz ABERGER, Birgit STROBL, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Olaf MERKEL, Gerda EGGER, Sabine LAGGER a Lukas KENNER. JUN mediates the senescence associated secretory phenotype and immune cell recruitment to prevent prostate cancer progression. Molecular Cancer. LONDON: BioMed Central Ltd, 2024, roč. 23, č. 1, s. 1-21. ISSN 1476-4598. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12943-024-02022-x.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Trachtová, Karolína (203 Česká republika, domácí) -- Tichý, Boris (203 Česká republika, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Prostate cancer; AP-1 transcription factors; JUN; Senescence; SASP; Immune infiltration
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 18. 9. 2024 13:39.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2431578/cs -
SIKORA, Maciej, Eva KLIMENTOVÁ, Dawid UCHAL, Denisa ŠRÁMKOVÁ, Agata P PERLINSKA, Mai Lan NGUYEN, Marta KORPACZ, Roksana MALINOWSKA, Szymon NOWAKOWSKI, Pawel RUBACH, Petr ŠIMEČEK a Joanna I SULKOWSKA. Knot or not? Identifying unknotted proteins in knotted families with sequence-based Machine Learning model. Protein Science. HOBOKEN: WILEY, 2024, roč. 33, č. 7, s. 1-21. ISSN 0961-8368. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/pro.4998.URL
angličtina. Spojené státy.
Klíčová slova anglicky: AlphaFold; deep learning; knotted proteins; protein topology; SPOUT family proteins
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Maršálková, učo 469217. Změněno: 6. 8. 2024 08:32.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2420557/cs -
ŠIMONÍK, Jan, Pavla BOUCHALOVÁ, Kateřina JURÁSKOVÁ, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Vojtěch BYSTRÝ, Jiří NAVRÁTIL, Boris TICHÝ, Rudolf NENUTIL, Roman HRSTKA a Pavel BOUCHAL. Proteogenomic Classification of Triple-Negative Breast Cancer for Prognosis and Targeted therapy. In n Book of Abstracts of PhD Conference 2024, Brno, Česká republika 30.5. 2024, P7. 2024.
Název anglicky: Proteogenomic Classification of Triple-Negative Breast Cancer for Prognosis and Targeted therapy
angličtina. Česká republika.
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: Ing. Jan Šimoník, učo 473766. Změněno: 5. 12. 2024 14:15.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2457618/cs -
GREŠOVÁ, Katarína, Tomáš RAČEK, Vlastimil MARTINEK, David ČECHÁK, Radka SVOBODOVÁ a Panagiotis ALEXIOU. RBP-Tar – a searchable database for experimental RBP binding sites. F1000Research. 2024. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.12688/f1000research.131014.2.URL
angličtina.
Klíčová slova anglicky: RNA Binding Proteins; CLIP; RBP; Web-server
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 14. 11. 2024 12:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2451906/cs -
JACQUES, Florian, Tomáš TICHOPÁD, Martin DEMKO, Vojtěch BYSTRÝ, Kristína KŘÍŽOVÁ, Mária SEIFERTOVÁ, Kristýna VOŘÍŠKOVÁ, Md Mehedi Hasan FUAD, Lukáš VETEŠNÍK a Andrea VETEŠNÍKOVÁ ŠIMKOVÁ. Reproduction-associated pathways in females of gibel carp (Carassius gibelio) shed light on the molecular mechanisms of the coexistence of asexual and sexual reproduction. BMC Genomics. London: BioMed Central Ltd, 2024, roč. 25, č. 1, s. 1-22. ISSN 1471-2164. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12864-024-10462-4.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Jacques, Florian (250 Francie, garant, domácí) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Křížová, Kristína (703 Slovensko, domácí) -- Seifertová, Mária (703 Slovensko, domácí) -- Voříšková, Kristýna (203 Česká republika, domácí) -- Fuad, Md Mehedi Hasan (50 Bangladéš, domácí) -- Vetešník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Vetešníková Šimková, Andrea (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Carassius gibelio; Reproduction; Gynogenesis; Asexual reproduction; Evolution of sexual reproduction; Meiosis; Differential expression analysis; Oogenesis; Transcriptomics
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 21. 11. 2024 11:22.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2422337/cs -
KADLČÍK, Marek, Michal ŠTEFÁNIK, Ondřej SOTOLÁŘ a Vlastimil MARTINEK. Self-Training Language Models in Arithmetic Reasoning. In ICLR 2024 Workshop on Large Language Model (LLM) Agents. 2024.Openreview
angličtina. Česká republika.
Klíčová slova anglicky: language models, arithmetical reasoning, self-training, preference optimisation
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: Mgr. Michal Štefánik, učo 422237. Změněno: 12. 6. 2024 14:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2403039/cs -
HOFERKOVÁ, Eva, Václav ŠEDA, Soňa CESNÁRIKOVÁ, Jan VERNER, Tomáš LOJA, Květoslava MATULOVÁ, Hana SKUHROVÁ FRANCOVÁ, Eva ONDROUŠKOVÁ, Daniel FILIP, Nicolas BLAVET, Miroslav BOUDNÝ, Gabriela MLADONICKÁ PAVLASOVÁ, Josef VEČEŘA, Laura ONDRIŠOVÁ, Petra PAVELKOVÁ, Kryštof HLAVÁČ, Lenka KOŠŤÁLOVÁ, Androniki MICHAELOU, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jana DORAZILOVÁ, Václav CHOCHOLA, Josef JAROŠ, Michael DOUBEK, Marie JAROŠOVÁ, Aleš HAMPL, Lucy VOJTOVÁ, Leoš KŘEN, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. Stromal cells engineered to express T cell factors induce robust CLL cell proliferation in vitro and in PDX co-transplantations allowing the identification of RAF inhibitors as anti-proliferative drug. Leukemia. LONDON: SPRINGERNATURE, 2024, roč. 38, č. 8, s. 1-13. ISSN 0887-6924. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41375-024-02284-w.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Hoferková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Šeda, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Cesnáriková, Soňa (703 Slovensko, domácí) -- Verner, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Matulová, Květoslava (203 Česká republika, domácí) -- Skuhrová Francová, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Ondroušková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Filip, Daniel (703 Slovensko, domácí) -- Blavet, Nicolas (250 Francie, domácí) -- Boudný, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Mladonická Pavlasová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Večeřa, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Ondrišová, Laura (703 Slovensko, domácí) -- Pavelková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Hlaváč, Kryštof (203 Česká republika, domácí) -- Košťálová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Michaelou, Androniki (196 Kypr, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Dorazilová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Chochola, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Jaroš, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Doubek, Michael (203 Česká republika, domácí) -- Jarošová, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Hampl, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Vojtová, Lucy (203 Česká republika) -- Křen, Leoš (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Mráz, Marek (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: stromal cells; T cell factors; CLL cell proliferation
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 18. 9. 2024 10:58.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2412660/cs -
LYČKA, Martin, Michal BUBENÍK, Michal ZÁVODNÍK, Vratislav PESKA, Petr FAJKUS, Martin DEMKO, Jiří FAJKUS a Miloslava FOJTOVÁ. TeloBase: a community-curated database of telomere sequences across the tree of life. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2024, roč. 52, D1, s. "D311"-"D321", 11 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkad672.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Lyčka, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Bubeník, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Závodník, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Fajkus, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Fajkus, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Fojtová, Miloslava (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: ASPERGILLUS-ORYZAE; PLANT; EVOLUTION; REPEATS; IDENTIFICATION; LOCALIZATION; CONSERVATION; CHROMOSOMES; ARABIDOPSIS; DIVERSITY
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc., učo 28574. Změněno: 7. 8. 2024 14:01.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2368536/cs -
MACHELOVÁ, Adéla, Martina NEŠPOR DADEJOVÁ, Michal FRANEK, Guillaume MOUGEOT, Lauriane SIMON, Samuel LE GOFF, Celine DUC, Jasmin BASSLER, Martin DEMKO, Jana SCHWARZEROVA, Sophie DESSET, Aline V PROBST a Martina DVOŘÁČKOVÁ. The histone chaperones ASF1 and HIRA are required for telomere length and 45S rDNA copy number homeostasis. Plant Journal. Hoboken: Wiley, 2024, roč. 120, č. 3, s. 1125-1141. ISSN 0960-7412. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/tpj.17041.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Machelová, Adéla (203 Česká republika, domácí) -- Nešpor Dadejová, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Franek, Michal (703 Slovensko, domácí) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Dvořáčková, Martina (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: chromatin; telomeres; histone chaperones; ASF1; HIRA; 45S rDNA; Arabidopsis thaliana
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 11. 12. 2024 12:15.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2459442/cs -
ŠIMONÍK, Jan, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Lucia JANÁČOVÁ, Hlobilková ALICE, Kateřina JURÁSKOVÁ, Alexandr POPRACH, Hora MILAN, Fiala ONDŘEJ a Pavel BOUCHAL. Transmembrane glycoprotein GPNMB is a candidate predictive biomarker and potentially a therapeutic target in metastatic renal cell carcinoma. In In Book of Abstracts of 23rd Human Proteome Organization World Congress, Dresden, Germany 20.10.-24.10.2024, P-II-0679, 2024. 2024.URL
Název anglicky: Transmembrane glycoprotein GPNMB is a candidate predictive biomarker and potentially a therapeutic target in metastatic renal cell carcinoma
angličtina. Německo.
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnil: Ing. Jan Šimoník, učo 473766. Změněno: 5. 12. 2024 13:37.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2445901/cs -
FUAD, Md Mehedi Hasan, Tomas TICHOPAD, Marketa ONDRACKOVA, Kristína KŘÍŽOVÁ, Mária SEIFERTOVÁ, Kristýna VOŘÍŠKOVÁ, Martin DEMKO, Lukáš VETEŠNÍK a Andrea VETEŠNÍKOVÁ ŠIMKOVÁ. Trematode Diplostomum pseudospathaceum inducing differential immune gene expression in sexual and gynogenetic gibel carp (Carassius gibelio): parasites facilitating the coexistence of two reproductive forms of the invasive species. Frontiers in immunology. LAUSANNE: Frontiers Media S.A., 2024, roč. 15, June, s. "1392569", 16 s. ISSN 1664-3224. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3389/fimmu.2024.1392569.URL
RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Fuad, Md Mehedi Hasan (50 Bangladéš, domácí) -- Křížová, Kristína (703 Slovensko, domácí) -- Seifertová, Mária (703 Slovensko, domácí) -- Voříšková, Kristýna (203 Česká republika, domácí) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Vetešník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Vetešníková Šimková, Andrea (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: parasites; fish; RNA seq; differential gene expression; immunity-associated pathways; invasive species; asexual and sexual reproduction
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Lucie Jarošová, DiS., učo 205746. Změněno: 28. 8. 2024 10:26.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2426257/cs -
HEJRET, Václav, Nandan Mysore VARADARAJAN, Eva KLIMENTOVÁ, Katarína GREŠOVÁ, Ilektra-Chara GIASSA, Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Panagiotis ALEXIOU. Analysis of chimeric reads characterises the diverse targetome of AGO2-mediated regulation. Scientific Reports. Nature Research, 2023, roč. 13, č. 1, s. 1-9. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-023-49757-z.URL
RIV/00216224:14740/23:00133649 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Hejret, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Varadarajan, Nandan Mysore (356 Indie, domácí) -- Klimentová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Grešová, Katarína (703 Slovensko, domácí) -- Giassa, Ilektra-Chara (300 Řecko, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, domácí) -- Alexiou, Panagiotis (300 Řecko, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Data processing; Machine learning; miRNAs
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 25. 10. 2024 13:15.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2378640/cs -
KADLČÍK, Marek, Michal ŠTEFÁNIK, Ondřej SOTOLÁŘ a Vlastimil MARTINEK. Calc-X and Calcformers: Empowering Arithmetical Chain-of-Thought through Interaction with Symbolic Systems. Online. In Houda Bouamor, Juan Pino, Kalika Bali. Proceedings of the 2023 Conference on Empirical Methods in Natural Language Processing: Main track. Singapore: Association for Computational Linguistics, 2023, s. 12101-12108. ISBN 979-8-89176-060-8. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.18653/v1/2023.emnlp-main.742.Manuscript in proceedings
RIV/00216224:14330/23:00131954 Stať ve sborníku. angličtina. Spojené státy.
Kadlčík, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Štefánik, Michal (703 Slovensko, garant, domácí) -- Sotolář, Ondřej (203 Česká republika) -- Martinek, Vlastimil (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: language models; dataset; arithmetic reasoning; multistep reasoning
Druh sborníku: postkonferenční sborník
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: Mgr. Michal Štefánik, učo 422237. Změněno: 21. 5. 2024 08:54.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2327138/cs -
ZÁVACKÁ, Kristýna, Petr TAUŠ, Karol PÁL, Jakub Paweł PORC, Šárka PAVLOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Kamila STRÁNSKÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Boris TICHÝ, Nicolas BLAVET, Anna PANOVSKÁ, Michael DOUBEK, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Karla PLEVOVÁ. Clonal competition and disrupted molecular processes in chronic lymphocytic leukemia. In XXVIIth Biochemistry congress. 2023. ISBN 978-80-8240-048-2.URL
RIV/00216224:14740/23:00131784 Konferenční abstrakt. angličtina. Slovensko.
Závacká, Kristýna (203 Česká republika, domácí) -- Tauš, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Pál, Karol (703 Slovensko, domácí) -- Porc, Jakub Paweł (616 Polsko, domácí) -- Pavlová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Malčíková, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Stránská, Kamila (203 Česká republika, domácí) -- Ženatová, Marcela (203 Česká republika, domácí) -- Tichý, Boris (203 Česká republika, domácí) -- Blavet, Nicolas (250 Francie, domácí) -- Panovská, Anna (203 Česká republika, domácí) -- Doubek, Michael (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Plevová, Karla (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Chronic lymphocytic leukemia; TP53 gene;
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 24. 3. 2024 12:54.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2317919/cs -
PESCHELOVÁ, Helena, Veronika MANČÍKOVÁ, Lenka DOSTÁLOVÁ, Adriana LADUNGOVÁ, Dominika ŠKRNOVÁ, Václav HEJRET a Michal ŠMÍDA. CRISPR/Cas9 technology as a useful tool in the study of chornic lymphocytic leukemia. In CRISPR as a research tool in cancer and regenerative medicine, Stockholm, Švédsko. 2023.URL
RIV/00216224:14740/23:00132785 Konferenční abstrakt. angličtina. Švédsko.
Peschelová, Helena (203 Česká republika, domácí) -- Mančíková, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Dostálová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Ladungová, Adriana (703 Slovensko, domácí) -- Škrnová, Dominika (203 Česká republika, domácí) -- Hejret, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Šmída, Michal (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Chronic lymphocytic leukemia; CRISPR/Cas9 in CLL-derived HG3 and MEC1 cells;
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 24. 3. 2024 13:30.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2356320/cs -
PESCHELOVÁ, Helena, Veronika KOZLOVÁ, Veronika MANČÍKOVÁ, Lenka DOSTÁLOVÁ, Adriana LADUNGOVÁ, Dominika ŠKRNOVÁ, Václav HEJRET a Michal ŠMÍDA. CRISPR/Cas9 technology as a useful tool in the study of chronic lymphocytic leukemia. In PhD and PostDoc RETREAT, Sněžné, Milovy. 2023.URL
RIV/00216224:14740/23:00132849 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Peschelová, Helena (203 Česká republika, domácí) -- Kozlová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Mančíková, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Dostálová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Ladungová, Adriana (703 Slovensko, domácí) -- Škrnová, Dominika (203 Česká republika, domácí) -- Hejret, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Šmída, Michal (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Chronic lymphocytic leukemia; somatic mutations; CRISPR/Cas9 screening
Druh účasti: aktivní účast
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 30. 3. 2024 14:06.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2357977/cs -
MANČÍKOVÁ, Veronika, Michaela PEŠOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Robert HELMA, Kristýna ZÁVACKÁ, Václav HEJRET, Petr TAUŠ, Jakub HYNŠT, Karla PLEVOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Distinct p53 phosphorylation patterns in chronic lymphocytic leukemia patients are reflected in the activation of circumjacent pathways upon DNA damage. MOLECULAR ONCOLOGY. ENGLAND: WILEY, 2023, roč. 17, č. 1, s. 82-97. ISSN 1574-7891. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/1878-0261.13337.URL
RIV/00216224:14740/23:00130102 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Mančíková, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Pešová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Pavlová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Helma, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Závacká, Kristýna (203 Česká republika, domácí) -- Hejret, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Tauš, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Hynšt, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Plevová, Karla (203 Česká republika, domácí) -- Malčíková, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: CLL; p53; phosphorylation
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 15. 10. 2024 14:53.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2239430/cs -
PEŠOVÁ, Michaela, Veronika MANČÍKOVÁ, Robert HELMA, Šárka PAVLOVÁ, Václav HEJRET, Petr TAUŠ, Jakub HYNŠT, Karla PLEVOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Distinct p53 Phosphorylation Patterns in Chronic Lymphocytic Leukemia: Where They Come from and How They Affect p53 Function. In PhD and PostDoc RETREAT, Sněžné, Milovy. 2023.URL
RIV/00216224:14740/23:00132847 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Pešová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Mančíková, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Helma, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Pavlová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Hejret, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Tauš, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Hynšt, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Plevová, Karla (203 Česká republika, domácí) -- Kotašková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Malčíková, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Protein p53; tumor suppression; chronic lymphocytic leukemia;
Druh účasti: aktivní účast
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 24. 3. 2024 13:38.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2357974/cs -
SOUČKOVÁ, Kamila, Matej JASÍK, Iva SOVADINOVÁ, Alexandr SEMBER, Eliška SYCHROVÁ, Anna KONIECZNA, Vojtěch BYSTRÝ, Iva DYKOVÁ, Radim BLAŽEK, Karolína LUKŠÍKOVÁ, Tomáš PAVLICA, Marek JANKÁSEK, Marie ALTMANOVÁ, Jakub ŽÁK, Adriána ZBONČÁKOVÁ, Martin REICHARD a Ondřej SLABÝ. From fish to cells: Establishment of continuous cell lines from embryos of annual killifish Nothobranchius furzeri and N. kadleci. Aquatic Toxicology. Elsevier, 2023, roč. 259, June, s. 1-16. ISSN 0166-445X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.aquatox.2023.106517.URL
Název anglicky: From fish to cells: Establishment of continuous cell lines from embryos of annual killifish Nothobranchius furzeri and N. kadleci
RIV/00216224:14740/23:00130645 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Součková, Kamila (203 Česká republika, domácí) -- Jasík, Matej (703 Slovensko, domácí) -- Sovadinová, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Sychrová, Eliška (203 Česká republika, domácí) -- Konieczna, Anna (203 Česká republika, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Dyková, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Blažek, Radim (203 Česká republika, domácí) -- Lukšíková, Karolína (203 Česká republika) -- Pavlica, Tomáš (203 Česká republika) -- Jankásek, Marek (203 Česká republika) -- Altmanová, Marie (203 Česká republika) -- Žák, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Zbončáková, Adriána (703 Slovensko, domácí) -- Reichard, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Slabý, Ondřej (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Killifish; Embryo; Nothobranchius; Cell line; 3-D spheroid; Karyotype
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 21. 3. 2024 09:54.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2277988/cs -
GREŠOVÁ, Katarína, Vlastimil MARTINEK, David ČECHÁK, Petr ŠIMEČEK a Panagiotis ALEXIOU. Genomic benchmarks: a collection of datasets for genomic sequence classification. BMC Genomic Data. 2730-6844: BMC, 2023, roč. 24, č. 1, s. 1-9. ISSN 2730-6844. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12863-023-01123-8.URL
RIV/00216224:14740/23:00131330 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Grešová, Katarína (703 Slovensko, domácí) -- Martinek, Vlastimil (203 Česká republika, domácí) -- Čechák, David (203 Česká republika, domácí) -- Šimeček, Petr (203 Česká republika, garant, domácí) -- Alexiou, Panagiotis (300 Řecko, domácí)
Klíčová slova anglicky: Genomics; Dataset; Benchmark; Deep learning; Convolutional neural network
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 8. 4. 2024 10:34.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2300026/cs -
BALAKHONOVA, Veronika, Tereza DOBISOVÁ, Zuzana BENEDIKTY, Klara PANZAROVA, Jaromir PYTELA, Radka KOCI, Ioannis SPYROGLOU, Ingrid KOVÁČOVÁ, Dominique ARNAUD, Jan SKALÁK, Martin TRTILEK a Jan HEJÁTKO. iReenCAM: automated imaging system for kinetic analysis of photosynthetic pigment biosynthesis at high spatiotemporal resolution during early deetiolation. Frontiers in Plant Science. Frontiers Media SA, 2023, roč. 14, April, s. 1-15. ISSN 1664-462X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3389/fpls.2023.1093292.URL
RIV/00216224:14740/23:00132886 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Balakhonova, Veronika (643 Rusko, domácí) -- Dobisová, Tereza (203 Česká republika, domácí) -- Spyroglou, Ioannis (300 Řecko, domácí) -- Kováčová, Ingrid (703 Slovensko, domácí) -- Arnaud, Dominique (250 Francie, domácí) -- Skalák, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: de-etiolation; chlorophyll biosynthesis; fluorescence; iReenCAM; cytokinins; ethylene; Arabidopsis
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 18. 3. 2024 14:50.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2358577/cs -
ATANASOVA, Velina S, Crhistian de Jesus CARDONA, Václav HEJRET, Andreas TIEFENBACHER, Theresia MAIR, Loan TRAN, Janette PFNEISSL, Kristina DRAGANIC, Carina BINDER, Julijan KABILJO, Janik CLEMENT, Katharina WOERAN, Barbara NEUDERT, Sabrina WOHLHAUPTER, Astrid HAASE, Sandra DOMAZET, Markus HENGSTSCHLAEGER, Markus MITTERHAUSER, Leonhard MUELLAUER, Boris TICHÝ, Michael BERGMANN, Gabriele SCHWEIKERT, Markus HARTL, Helmut DOLZNIG a Gerda EGGER. Mimicking Tumor Cell Heterogeneity of Colorectal Cancer in a Patient-derived Organoid-Fibroblast Model. CELLULAR AND MOLECULAR GASTROENTEROLOGY AND HEPATOLOGY. UNITED STATES: ELSEVIER INC, 2023, roč. 15, č. 6, s. 1391-1419. ISSN 2352-345X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jcmgh.2023.02.014.URL
RIV/00216224:14740/23:00133185 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Hejret, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Tichý, Boris (203 Česká republika, domácí) -- Egger, Gerda (garant)
Klíčová slova anglicky: Colorectal Cancer; Fibroblasts; Organoids; targeted therapy
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 8. 4. 2024 09:34.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2365017/cs -
HRACHOVINOVÁ, Šárka, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Kateřina JURÁSKOVÁ, Vojtěch BYSTRÝ, Boris TICHÝ, Rudolf NENUTIL, Roman HRSTKA a Pavel BOUCHAL. Proteogenomic Classification of Triple-Negative Breast Cancer for Prognosis and Targeted Therapy. In Abstract Book of Doctoral conference 2023, Brno, CZ, 1.6.2023. 2023.URL
Název česky: Proteogenomická klasifikace trojitě-negativních karcinomů prsu pro stanovení prognózy a cílené terapie
RIV/00216224:14310/23:00132896 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Hrachovinová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Bouchalová, Pavla (203 Česká republika, domácí) -- Lapčík, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Jurásková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Tichý, Boris (203 Česká republika, domácí) -- Nenutil, Rudolf (203 Česká republika, domácí) -- Hrstka, Roman (203 Česká republika, domácí) -- Bouchal, Pavel (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: triple-negative breast cancer; classification; proteomics; genomics; transcriptomics; subtypes
Druh účasti: aktivní účast
Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 5. 4. 2024 10:00.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2358757/cs -
SPIELVOGEL, Clemens P, Stefan STOIBER, Laszlo PAPP, Denis KRAJNC, Marko GRAHOVAC, Elisabeth GURNHOFER, Karolína TRACHTOVÁ, Vojtěch BYSTRÝ, Asha LEISSER, Bernhard JANK, Julia SCHNOELL, Lorenz KADLETZ, Gregor HEIDUSCHKA, Thomas BEYER, Marcus HACKER, Lukas KENNER a Alexander R HAUG. Radiogenomic markers enable risk stratification and inference of mutational pathway states in head and neck cancer. European Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging. NEW YORK: SPRINGER, 2023, roč. 50, č. 2, s. 546-558. ISSN 1619-7070. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00259-022-05973-9.URL
RIV/00216224:14740/23:00133757 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Trachtová, Karolína (203 Česká republika, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Kenner, Lukas (garant)
Klíčová slova anglicky: Head and neck cancer; Biomarkers; Radiomics; Machine learning; Artificial intelligence; Cancer genomics
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 15. 10. 2024 14:52.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2383197/cs -
LUKAVSKY, Peter, Dalibor BLAŽEK, Vojtěch BYSTRÝ, Anna HELÁNOVÁ a Barbora TRUKSOVÁ. RNA Summer School 2023. 2023.URL
RIV/00216224:14740/23:00133607 Uspořádání konference. angličtina. Česká republika.
Lukavsky, Peter (40 Rakousko, domácí) -- Blažek, Dalibor (203 Česká republika, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Helánová, Anna (203 Česká republika, domácí) -- Truksová, Barbora (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: RNA Summer School; Master's and PhD students; RNA field; presentation; discussions
Mezinárodní význam: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 23. 2. 2024 12:53.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2376897/cs -
FULNEČEK, Jaroslav, Eva KLIMENTOVÁ, Albert CAIRO CALZADA, Soňa BUKOVČÁKOVÁ, Panagiotis ALEXIOU, Zbyněk PROKOP a Karel ŘÍHA. The SAP domain of Ku facilitates its efficient loading onto DNA ends. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2023, roč. 51, č. 21, s. 11706-11716. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkad850.URL
RIV/00216224:14740/23:00132961 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Fulneček, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Klimentová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Cairo Calzada, Albert (724 Španělsko, domácí) -- Bukovčáková, Soňa (703 Slovensko, domácí) -- Alexiou, Panagiotis (300 Řecko, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Říha, Karel (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: STRAND BREAK REPAIR; TELOMERE LENGTH; ARABIDOPSIS; HETERODIMER; HYPERSENSITIVITY; PROTECTION; PATHWAYS; MUTANTS; FUSIONS; RNA
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 15. 10. 2024 14:55.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2359939/cs -
JEDLIČKOVÁ, Veronika, Václav HEJRET, Martin DEMKO, Pavel JEDLIČKA, Marie ŠTEFKOVÁ a Helene ROBERT BOISIVON. Transcriptome analysis of thermomorphogenesis in ovules and during early seed development in Brassica napus. BMC Genomics. London: BioMed Central Ltd, 2023, roč. 24, č. 1, s. 1-15. ISSN 1471-2164. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12864-023-09316-2.URL
RIV/00216224:14740/23:00130715 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Jedličková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Hejret, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Jedlička, Pavel (203 Česká republika) -- Štefková, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Robert Boisivon, Helene (250 Francie, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: TEMPERATURE-INDUCED LIPOCALIN; HEAT-STRESS; OIL ACCUMULATION; OXIDATIVE STRESS; ARABIDOPSIS; THERMOTOLERANCE; PHOTOSYNTHESIS; BIOSYNTHESIS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 8. 4. 2024 10:17.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2279918/cs -
VETEŠNÍKOVÁ ŠIMKOVÁ, Andrea, Kristína KŘÍŽOVÁ, Kristýna VOŘÍŠKOVÁ, Lukáš VETEŠNÍK, Vojtěch BYSTRÝ a Martin DEMKO. Transcriptome Profile Analyses of Head Kidney in Roach (Rutilus rutilus), Common Bream (Abramis brama) and Their Hybrids: Does Infection by Monogenean Parasites in Freshwater Fish Reveal Differences in Fish Vigour among Parental Species and Their Hybrids? Biology. Basel: MDPI, 2023, roč. 12, č. 9, s. 1-29. ISSN 2079-7737. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/biology12091199.URL
RIV/00216224:14310/23:00131742 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Vetešníková Šimková, Andrea (203 Česká republika, garant, domácí) -- Křížová, Kristína (703 Slovensko, domácí) -- Voříšková, Kristýna (203 Česká republika, domácí) -- Vetešník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí)
Klíčová slova anglicky: Monogenea; Paradiplozoon homoion; freshwater fish; hybridization; RNA seq; differential gene expression; hybrid heterosis; hybrid breakdown
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 8. 4. 2024 10:34.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2314057/cs -
PÍREK, Pavlína, Karolína KRYŠTOFOVÁ, Ingrid KOVÁČOVÁ, Anna KROMEROVÁ, Dagmar ZACHOVÁ, Ondřej HELIA, Klara PANZAROVA, Jiří FAJKUS, Zbyněk ZDRÁHAL, Gabriela LOCHMANOVÁ a Miloslava FOJTOVÁ. Unraveling Epigenetic Changes in A. thaliana Calli: Impact of HDAC Inhibitors. PLANTS-BASEL. BASEL: MDPI, 2023, roč. 12, č. 24, s. 1-16. ISSN 2223-7747. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/plants12244177.URL
RIV/00216224:14740/23:00132929 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Pírek, Pavlína (203 Česká republika, domácí) -- Kryštofová, Karolína (203 Česká republika, domácí) -- Kováčová, Ingrid (703 Slovensko, domácí) -- Kromerová, Anna (203 Česká republika, domácí) -- Zachová, Dagmar (203 Česká republika, domácí) -- Helia, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Panzarova, Klara (203 Česká republika) -- Fajkus, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Lochmanová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Fojtová, Miloslava (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Arabidopsis thaliana; callus formation; epigenetics; histone posttranslational modifications; mass spectrometry; trichostatin A; sodium butyrate
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 2. 11. 2024 21:21.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2359157/cs -
ČERMÁK, Milan, Tatiana FRITZOVÁ, Vít RUSŇÁK a Denisa ŠRÁMKOVÁ. Using relational graphs for exploratory analysis of network traffic data. Forensic Science International: Digital Investigation. 2023, roč. 45, S, s. 1-10. ISSN 2666-2825. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.fsidi.2023.301563.URL
RIV/00216224:14610/23:00130589 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Čermák, Milan (203 Česká republika, garant, domácí) -- Fritzová, Tatiana (703 Slovensko, domácí) -- Rusňák, Vít (203 Česká republika, domácí) -- Šrámková, Denisa (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Relational analytics;Network forensics;Visual analytics;Granef;Cybersecurity
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Alena Mokrá, učo 362754. Změněno: 5. 4. 2024 11:08.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2275258/cs -
DRÁBOVÁ, Klára, Petra POKORNÁ, Hana PÁLOVÁ, Sabina ADAMCOVÁ, Vojtěch BYSTRÝ, Robin JUGAS, Ondřej SLABÝ a Jaroslav ŠTĚRBA. Výsledky celoexomového sekvenování germinální DNA u dětských pacientů se solidními tumory. In Kaprasův den 2023, Praha. 2023.
Název anglicky: Results of whole-exome sequencing of germline DNA in pediatric patients with solid tumors
RIV/00216224:14110/23:00134647 Konferenční abstrakt. čeština. Česká republika.
Drábová, Klára (203 Česká republika, domácí) -- Pokorná, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Pálová, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Adamcová, Sabina (203 Česká republika, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Jugas, Robin (203 Česká republika, domácí) -- Slabý, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Štěrba, Jaroslav (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: germline DNA; whole-exome sequencing; solid tumors; pediatric patients
Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 22. 4. 2024 14:25.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2309898/cs -
SKLENÁŘ, Vladimír, Radovan FIALA, Jiří NOVÁČEK, Josef HOUSER, Jan PŘIBYL, Zbyněk ZDRÁHAL, Milan EŠNER, Michal MIKL, Boris TICHÝ, Vojtěch BYSTRÝ a Radka SVOBODOVÁ. CF Day Meeting. 2022.URL
Název anglicky: CF Day Meeting
RIV/00216224:14740/22:00128659 Popularizační texty a aktivity. čeština. Česká republika.
Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Houser, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Přibyl, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Ešner, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Mikl, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Tichý, Boris (203 Česká republika, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Svobodová, Radka (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: CF day; Core Facilities; instruments; services
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 15. 2. 2023 14:04.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2256059/cs -
DOSTÁLOVÁ, Lenka, Aneta LEDEREROVÁ, Helena PESCHELOVÁ, Václav HEJRET a Michal ŠMÍDA. CRISPR/Cas9 knockout screening revealed genes involved in CD20 regulation. In Annual PhD conference Biomedical sciences, Brno. 2022.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 20. 1. 2023 15:14.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2248128/cs -
PEŠOVÁ, Michaela, Veronika MANČÍKOVÁ, Robert HELMA, Šárka PAVLOVÁ, Václav HEJRET, Petr TAUŠ, Jakub HYNŠT, Karla PLEVOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Distinct p53 phosphorylation patterns in chronic lymphocytic leukemia patients are reflected in circumjacent pathways activation upon DNA damage. In Mendel genetics Conference 2022. 2022.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 18. 8. 2022 14:01.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2211939/cs -
PEŠOVÁ, Michaela, Veronika MANČÍKOVÁ, Robert HELMA, Šárka PAVLOVÁ, Václav HEJRET, Petr TAUŠ, Jakub HYNŠT, Karla PLEVOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Distinct p53 phosphorylation patterns in chronic lymphocytic leukemia patients are reflected in circumjacent pathways activation upon DNA damage. In EHA 2022 in HemaSphere 2022; 6(S3): 976. 2022.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 17. 8. 2022 10:21.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2211826/cs -
PEŠOVÁ, Michaela, Veronika MANČÍKOVÁ, Robert HELMA, Šárka PAVLOVÁ, Václav HEJRET, Petr TAUŠ, Jakub HYNŠT, Karla PLEVOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Distinct p53 phospohrylation patterns in chronic lymphocytic leukemia patients are reflected in circumjacent pathways activation upon DNA damage. In PhD retreat 2022, Telč. 2022.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 20. 1. 2023 14:46.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2248112/cs -
CHALUPOVÁ, Eliška, Ondřej VACULÍK, Jakub POLÁČEK, Filip JOZEFOV, Tomáš MAJTNER a Panagiotis ALEXIOU. ENNGene: an Easy Neural Network model building tool for Genomics. BMC Genomics. BioMed Central, 2022, roč. 23, č. 1, s. 248-258. ISSN 1471-2164. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12864-022-08414-x.URL
RIV/00216224:14740/22:00125837 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Chalupová, Eliška (203 Česká republika, domácí) -- Vaculík, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Poláček, Jakub (703 Slovensko, domácí) -- Jozefov, Filip (703 Slovensko, domácí) -- Majtner, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Alexiou, Panagiotis (300 Řecko, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Deep Learning; Convolutional Neural Network; Recurrent Neural Network; Evolutionary Conservation Score; RNA Secondary Structure; GUI
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 17. 2. 2023 10:38.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1854144/cs -
FROHLICH, Jan, Kristina KOVACOVICOVA, Marco RAFFAELE, Tereza VIRGLOVA, Eliska CIZKOVA, Jan KUČERA, Julie DOBROVOLNÁ, Martin WABITSCH, Marion PEYROU, Francesca BONOMINI, Rita REZZANI, George N. CHALDAKOV, Anton B. TONCHEV, Michelino DI ROSA, Nicolas BLAVET, Václav HEJRET a Manlio VINCIGUERRA. GDF11 inhibits adipogenesis and improves mature adipocytes metabolic function via WNT/beta-catenin and ALK5/SMAD2/3 pathways. Cell Proliferation. 2022, roč. 55, č. 10, s. 1-15. ISSN 0960-7722. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/cpr.13310.URL
RIV/00216224:14310/22:00127398 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Kučera, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Dobrovolná, Julie (203 Česká republika, garant, domácí) -- Blavet, Nicolas (250 Francie, domácí) -- Hejret, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Vinciguerra, Manlio (380 Itálie)
Klíčová slova anglicky: DIFFERENTIATION FACTOR 11; ADIPOSE-TISSUE; SKELETAL-MUSCLE; TGF-BETA; CROSS-TALK; CELL; PROTEIN; WNT; AGE; ADIPONECTIN
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 25. 10. 2024 12:44.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2238150/cs -
VALISKOVA, Barbora, Sona GREGOROVA, Diana LUSTYK, Petr ŠIMEČEK, Petr JANSA a Jiri FOREJT. Genic and chromosomal components of Prdm9-driven hybrid male sterility in mice (Mus musculus). Genetics. BETHESDA (USA): GENETICS SOCIETY AMERICA, 2022, roč. 222, č. 1, s. 1-14. ISSN 0016-6731. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/genetics/iyac116.URL
RIV/00216224:14740/22:00128478 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Šimeček, Petr (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: spermatogenesis; meiosis; homologous synapsis; SYCP3; HORMAD2; synaptonemal complex
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 25. 10. 2024 12:40.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2251936/cs -
GREŠOVÁ, Katarína, Petr ŠIMEČEK, Vlastimil MARTINEK, David ČECHÁK a Panagiotis ALEXIOU. Genomic Benchmarks: A Collection of Datasets for Genomic Sequence Classification. 2022. ISBN 978-80-7592-127-7.
Název anglicky: Genomic Benchmarks: A Collection of Datasets for Genomic Sequence Classification
RIV/00216224:14310/22:00126381 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Grešová, Katarína (703 Slovensko, domácí) -- Šimeček, Petr (203 Česká republika, garant) -- Martinek, Vlastimil (203 Česká republika) -- Čechák, David (203 Česká republika) -- Alexiou, Panagiotis (300 Řecko)
Klíčová slova anglicky: genomics; dataset; benchmark; deep learning; convolutional neural network
Změnila: Ing. Katarína Grešová, učo 514001. Změněno: 6. 10. 2022 14:28.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1883659/cs -
CAVALLIN, Ivana, Marek BARTOŠOVIČ, Tomáš SKALICKÝ, Praveenkumar RENGARAJ, Martin DEMKO, Martina Christina SCHMIDT-DENGLER, Aleksej DRINO, Mark HELM a Štěpánka VAŇÁČOVÁ. HITS-CLIP analysis of human ALKBH8 reveals interactions with fully processed substrate tRNAs and with specific noncoding RNAs. RNA. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2022, roč. 28, č. 12, s. 1568-1581. ISSN 1355-8382. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1261/rna.079421.122.URL
RIV/00216224:14740/22:00128510 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Cavallin, Ivana (203 Česká republika, domácí) -- Bartošovič, Marek (703 Slovensko, domácí) -- Skalický, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Rengaraj, Praveenkumar (356 Indie, domácí) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: ALKBH8; Trm9; wobble uridine modification; mcm(5)U; mcm(5)s(2)U; HITS-CLIP
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 25. 10. 2024 12:23.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2252337/cs -
NEMERGUT, Michal, Tereza BÁŤKOVÁ, Dana VIGAŠOVÁ, Milan BARTOŠ, Martina HLOZANKOVA, Andrea SMITH, Barbora LIŠKOVÁ, Kateřina SHEARDOVÁ, Martin VYHNALEK, Jakub HORT, Jan LACZO, Ingrid KOVÁČOVÁ, Michal ŠITINA, Radoslav MATEJ, Radim JANČÁLEK, Martin MAREK a Jiří DAMBORSKÝ. Increased occurrence of Treponema spp. and double-species infections in patients with Alzheimer's disease. Science of the Total Environment. Amsterdam: Elsevier Science, 2022, roč. 844, October 2022, s. 1-7. ISSN 0048-9697. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.scitotenv.2022.157114.URL
RIV/00216224:14310/22:00127629 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Nemergut, Michal (703 Slovensko, domácí) -- Báťková, Tereza (203 Česká republika, domácí) -- Vigašová, Dana (703 Slovensko, domácí) -- Bartoš, Milan (203 Česká republika) -- Smith, Andrea (703 Slovensko, domácí) -- Lišková, Barbora (203 Česká republika, domácí) -- Sheardová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Kováčová, Ingrid (703 Slovensko) -- Šitina, Michal (203 Česká republika) -- Jančálek, Radim (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Alzheimer'sdisease; Treponemaspp; Microbialinfection; Pathogen; Serum; PCR
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 16. 3. 2023 21:13.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2243093/cs -
LIMBERGER, Tanja, Michaela SCHLEDERER, Karolína TRACHTOVÁ, Ines Garces de los Fayos ALONSO, Jiaye YANG, Sandra HOEGLER, Christina STERNBERG, Vojtěch BYSTRÝ, Jan OPPELT, Boris TICHÝ, Margit SCHMEIDL, Petra KODAJOVA, Anton JAEGER, Heidi A NEUBAUER, Monika OBERHUBER, Belinda S SCHMALZBAUER, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Helmut DOLZNIG, Wolfgang WADSAK, Zoran CULIG, Suzanne Dawn TURNER, Gerda EGGER, Sabine LAGGER a Lukas KENNER. KMT2C methyltransferase domain regulated INK4A expression suppresses prostate cancer metastasis. Molecular Cancer. LONDON: BioMed Central, 2022, roč. 21, č. 1, s. 89-107. ISSN 1476-4598. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12943-022-01542-8.URL
RIV/00216224:14740/22:00126463 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Trachtová, Karolína (203 Česká republika, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Tichý, Boris (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Turner, Suzanne Dawn (826 Velká Británie a Severní Irsko, domácí)
Klíčová slova anglicky: Prostate cancer; Senescence; Metastasis; KMT2C; MYC; p16(INK4A)
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 15. 10. 2024 14:43.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2212060/cs -
POPPOVÁ, Lucie, Šárka PAVLOVÁ, Beatriz GONZALEZ, Jana KOTAŠKOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Gabrijela DUMBOVIC, Pavlína JANOVSKÁ, Vojtěch BYSTRÝ, Anna PANOVSKÁ, Lucie BEZDĚKOVÁ, Stanislava MAŠLEJOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Marcela KRZYŽÁNKOVÁ, Marek BORSKÝ, Jiří MAYER, Vítězslav BRYJA, Sergio ALONSO a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Memory B-cell like chronic lymphocytic leukaemia is associated with specific methylation profile of WNT5A promoter and undetectable expression of WNT5A gene. Epigenetics. Philadelphia: TAYLOR & FRANCIS INC, 2022, roč. 17, č. 12, s. 1628-1635. ISSN 1559-2294. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/15592294.2022.2050004.URL
RIV/00216224:14110/22:00127827 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Poppová, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Pavlová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Kotašková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Plevová, Karla (203 Česká republika, domácí) -- Janovská, Pavlína (203 Česká republika, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Panovská, Anna (203 Česká republika, domácí) -- Bezděková, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Mašlejová, Stanislava (703 Slovensko, domácí) -- Brychtová, Yvona (203 Česká republika, domácí) -- Doubek, Michael (203 Česká republika, domácí) -- Krzyžánková, Marcela (203 Česká republika, domácí) -- Borský, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: WNT5A; chronic lymphocytic leukaemia; methylation; i-CLL; m-CLL
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Adéla Pešková, učo 143895. Změněno: 2. 11. 2024 16:06.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2245078/cs -
KLIMENTOVÁ, Eva, Václav HEJRET, Katarína GREŠOVÁ, Ilektra-Chara GIASSA a Panagiotis ALEXIOU. miRBind: a Deep Learning method for miRNA binding classification. 2022. ISBN 978-80-7592-127-7.
Česká republika.
Změnila: Ilektra-Chara Giassa, Ph.D., učo 238751. Změněno: 15. 6. 2022 17:32.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1860459/cs -
KLIMENTOVÁ, Eva, Václav HEJRET, Ján KRČMÁŘ, Katarína GREŠOVÁ, Ilektra-Chara GIASSA a Panagiotis ALEXIOU. miRBind: A Deep Learning Method for miRNA Binding Classification. GENES. MDPI, 2022, roč. 13, č. 12, s. 2323-2335. ISSN 2073-4425. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/genes13122323.URL
RIV/00216224:14740/22:00128672 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Klimentová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Hejret, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Krčmář, Ján (703 Slovensko, domácí) -- Grešová, Katarína (703 Slovensko, domácí) -- Giassa, Ilektra-Chara (300 Řecko, domácí) -- Alexiou, Panagiotis (300 Řecko, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: miRNA; target prediction; miRNA binding; CLASH; convolutional neural network
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 3. 4. 2023 13:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2257178/cs -
HEJRET, Václav, Nandan Mysore VARADARAJAN, Eva KLIMENTOVÁ, Ilektra-Chara GIASSA, Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Panagiotis ALEXIOU. Noncanonical small RNA chimeras identified by AGO2-CLASH. In 16th Microsymposium on RNA Biology. 2022.
Název anglicky: Noncanonical small RNA chimeras identified by AGO2-CLASH
angličtina. Česká republika.
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: Mgr. Václav Hejret, učo 408320. Změněno: 21. 9. 2022 16:02.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1855257/cs -
BHAGAT, Kriti, Ilektra-Chara GIASSA a Panagiotis ALEXIOU. PENGUINN-RNA: prediction of RNA G-quadruplexes using interpretable Neural Networks. 2022. ISBN 978-80-7592-127-7.
Česká republika.
Změnila: Ilektra-Chara Giassa, Ph.D., učo 238751. Změněno: 15. 6. 2022 17:40.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1860460/cs -
HAKL, Roman, Pavel KUKLÍNEK, Marta SOBOTKOVA, Irena KRCMOVA, Pavlina KRALICKOVA, Martina VACHOVA, Jana HANZLIKOVA, Martina NOVACKOVA, Michal SVOBODA, Ingrid KOVÁČOVÁ a Jiří LITZMAN. Registry-based analysis of Icatibant and C1-inhibitor use in treatment of laryngeal attacks of hereditary angioedema. CLINICAL AND EXPERIMENTAL ALLERGY. HOBOKEN: WILEY, 2022, roč. 52, č. 8, s. 994-997. ISSN 0954-7894. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/cea.14182.URL
RIV/00216224:14110/22:00126581 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Hakl, Roman (203 Česká republika, domácí) -- Kuklínek, Pavel (203 Česká republika) -- Sobotkova, Marta (203 Česká republika) -- Krcmova, Irena (203 Česká republika) -- Kralickova, Pavlina (203 Česká republika) -- Vachova, Martina (203 Česká republika) -- Hanzlikova, Jana (203 Česká republika) -- Novackova, Martina (203 Česká republika) -- Svoboda, Michal (203 Česká republika) -- Kováčová, Ingrid (703 Slovensko) -- Litzman, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Icatibant; C1-inhibitor; hereditary angioedema; laryngeal attacks
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 5. 9. 2022 12:37.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2215440/cs -
SeqUIa: Softwarová platforma pro zpracování sekvenování nové generace skrze grafické rozhraní (software)BYSTRÝ, Vojtěch, Viktor MAŠÍČEK, Nicolas MOKRIŠ a Martin DEMKO. SeqUIa: Softwarová platforma pro zpracování sekvenování nové generace skrze grafické rozhraní. 2022.domovská stránka
Název anglicky: SeqUIa: Software platform for GUI based next generation sequencing data analysis
RIV/00216224:14740/22:00129636 Software. čeština. Česká republika.
Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, garant, domácí) -- Mašíček, Viktor (203 Česká republika) -- Mokriš, Nicolas (203 Česká republika, domácí) -- Demko, Martin (703 Slovensko)
Klíčová slova anglicky: bioinformatics;next generation sequencing;patient stratification;data integration;pediatric solid tumors
Změnila: Ing. Daniela Tršová, Ph.D., učo 242921. Změněno: 17. 4. 2023 10:20.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2275803/cs -
GREŠOVÁ, Katarína, Panagiotis ALEXIOU a Ilektra-Chara GIASSA. Small RNA Targets: Advances in Prediction Tools and High-Throughput Profiling. BIOLOGY-BASEL. BASEL: MDPI, 2022, roč. 11, č. 12, s. 1798-1821. ISSN 2079-7737. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/biology11121798.URL
RIV/00216224:14740/22:00128671 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Grešová, Katarína (703 Slovensko, domácí) -- Alexiou, Panagiotis (300 Řecko, domácí) -- Giassa, Ilektra-Chara (300 Řecko, domácí)
Klíčová slova anglicky: miRNA target prediction; small RNA target prediction; computational biology; machine learning; high-throughput sequencing
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 17. 2. 2023 10:36.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2257177/cs -
MARTINO, Fabiana, Nandan Mysore VARADARAJAN, Ana Rubina PERESTRELO, Václav HEJRET, Helena DURIKOVA, Dragana VUKIĆ, Vladimir HORVATH, Francesca CAVALIERI, Frank CARUSO, Waleed S ALBIHLAL, Andre P GERBER, Mary Anne O'CONNELL, Štěpánka VAŇÁČOVÁ, Stefania PAGLIARI a Giancarlo FORTE. The mechanical regulation of RNA binding protein hnRNPC in the failing heart. Science Translational Medicine. Washington: American Association for the Advancement of Science, 2022, roč. 14, č. 672, s. 1-17. ISSN 1946-6234. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1126/scitranslmed.abo5715.URL
RIV/00216224:14740/22:00128822 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Martino, Fabiana (380 Itálie, domácí) -- Varadarajan, Nandan Mysore (356 Indie, domácí) -- Hejret, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Vukić, Dragana (688 Srbsko, domácí) -- O'Connell, Mary Anne (372 Irsko, domácí) -- Vaňáčová, Štěpánka (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Extracellular Matrix; Heart Failure; Heterogeneous-Nuclear Ribonucleoprotein Group C; Humans
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 31. 10. 2024 11:59.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2265424/cs -
MURESAN, Ximena M., Eva SLABÁKOVÁ, Jiřina PROCHÁZKOVÁ, Stanislav DRÁPELA, Radek FEDR, Markéta PÍCKOVÁ, Ondřej VACEK, Ráchel VÍCHOVÁ, Tereza SUCHÁNKOVÁ, Jan BOUCHAL, Daniela KÜRFÜRSTOVÁ, Milan KRÁL, Tereza HULÍNOVÁ, Radek P. SÝKORA, Vladimír ŠTUDENT, Václav HEJRET, Wytske M. VAN WEERDEN, Martin PUHR, Václav PUSTKA, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Zoran CULIG a Karel SOUČEK. Toll-Like Receptor 3 Overexpression Induces Invasion of Prostate Cancer Cells, whereas Its Activation Triggers Apoptosis. American Journal of Pathology. Elsevier, 2022, roč. 192, č. 9, s. 1321-1335. ISSN 0002-9440. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.ajpath.2022.05.009.URL
RIV/00216224:14310/22:00128751 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Drápela, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Pícková, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Vacek, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Hejret, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Pustka, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Souček, Karel (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: prostate cancer; PCa; toll-like receptor; TLR3; resistance; chemotherapy; endocrine therapy
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 2. 11. 2024 21:09.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2262380/cs -
MURESAN, Ximena M., Eva SLABÁKOVÁ, Jiřina PROCHÁZKOVÁ, Stanislav DRÁPELA, Radek FEDR, Markéta PÍCKOVÁ, Ondřej VACEK, Ráchel VÍCHOVÁ, Tereza SUCHÁNKOVÁ, Jan BOUCHAL, Daniela KÜRFÜRSTOVÁ, Milan KRÁL, Tereza HULÍNOVÁ, Radek P. SÝKORA, Vladimír ŠTUDENT, Václav HEJRET, Wytske M. VAN WEERDEN, Martin PUHR, Václav PUSTKA, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Zoran CULIG a Karel SOUČEK. Toll-Like Receptor 3 Overexpression Induces Invasion of Prostate Cancer Cells, whereas Its Activation Triggers Apoptosis. American Journal of Pathology. Elsevier, 2022, roč. 192, č. 9, s. 1321-1335. ISSN 0002-9440. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.ajpath.2022.05.009.URL
angličtina. Spojené státy.
Klíčová slova anglicky: prostate cancer; PCa; toll-like receptor; TLR3; resistance; chemotherapy; endocrine therapy
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 2. 11. 2024 21:09.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2396650/cs -
DRÁBOVÁ, Klára, Petra POKORNÁ, Hana PÁLOVÁ, Soňa ADAMCOVÁ, Vojtěch BYSTRÝ, Robin JUGAS, Ondřej SLABÝ a Jaroslav ŠTĚRBA. Výsledky celoexomového sekvenování germinální DNA u dětských pacientů se solidními tumory. In XXV. Biologické dny. 2022.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 30. 1. 2023 14:08.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2251004/cs -
GIASSA, Ilektra-Chara a Panagiotis ALEXIOU. Bioinformatics and Machine Learning Approaches to Understand the Regulation of Mobile Genetic Elements. BIOLOGY-BASEL. BASEL: MDPI, 2021, roč. 10, č. 9, s. 896-917. ISSN 2079-7737. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/biology10090896.URL
RIV/00216224:14740/21:00124306 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Giassa, Ilektra-Chara (300 Řecko, domácí) -- Alexiou, Panagiotis (300 Řecko, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: transposable elements regulation; mobile genetic elements; machine learning; bioinformatics methods; DNA methylation; small RNAs; PIWI-interacting RNAs; circular RNAs
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 2. 2022 14:48.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1837291/cs -
PEŠOVÁ, Michaela, Veronika MANČÍKOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Robert HELMA, Jitka MALČÍKOVÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Václav HEJRET, Petr TAUŠ, Jana KOTAŠKOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Fosforylace proteinu p53: vliv na aktivitu dráhy p53 po poškození DNA u chronické lymfocytární leukémie. In II. Český hematologický a transfuziologický sjezd v Transfuze a Hematologie Dnes (2021). 2021.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 20. 12. 2021 08:23.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1812428/cs -
DYKOVÁ, Iva, Jakub ŽÁK, Martin REICHARD, Kamila SOUČKOVÁ, Ondřej SLABÝ, Vojtěch BYSTRÝ a Radim BLAŽEK. Histopathology of laboratory-reared Nothobranchius fishes: Mycobacterial infections versus neoplastic lesions. Journal of Fish Diseases. Hoboken: Wiley, 2021, roč. 44, č. 8, s. 1179-1190. ISSN 0140-7775. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/jfd.13378.URL
RIV/00216224:14310/21:00119124 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Dyková, Iva (203 Česká republika, garant, domácí) -- Žák, Jakub (203 Česká republika) -- Reichard, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Součková, Kamila (203 Česká republika, domácí) -- Slabý, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Blažek, Radim (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: mononuclear phagocytic system; mycobacterial infections; proliferative lesions; tumour misdiagnosis
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 15. 10. 2024 14:09.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1785678/cs -
PEŠOVÁ, Michaela, Veronika MANČÍKOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Robert HELMA, Jitka MALČÍKOVÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Václav HEJRET, Petr TAUŠ, Jana KOTAŠKOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Phosphorylation patterns of tumor suppressor P53 and their impact on the P53 pathway activity in chronic lymphocytic leukemia. In XIX International Workshop on Chronic Lymphocytic Leukemia (iwCLL). 2021.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 31. 1. 2022 14:34.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1829600/cs -
LOBELLO, Cosimo, Boris TICHÝ, Vojtěch BYSTRÝ, Lenka RADOVÁ, Daniel FILIP, Marek MRÁZ, I.A. MONTES-MOJARRO, N. PROKOPH, H. LAROSE, H.C. LIANG, G.G. SHARMA, L. MOLOGNI, D. BELADA, K. KAMARADOVA, F. FEND, C. GAMBACORTI-PASSERINI, O. MERKEL, Suzanne Dawn TURNER, Andrea JANÍKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. STAT3 and TP53 mutations associate with poor prognosis in anaplastic large cell lymphoma. Leukemia. London: Nature Publishing Group, 2021, roč. 35, č. 5, s. 1500-1505. ISSN 0887-6924. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41375-020-01093-1.URL
RIV/00216224:14740/21:00119058 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Lobello, Cosimo (380 Itálie, domácí) -- Tichý, Boris (203 Česká republika, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Radová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Filip, Daniel (703 Slovensko, domácí) -- Mráz, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Turner, Suzanne Dawn (826 Velká Británie a Severní Irsko, domácí) -- Janíková, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: ALCL
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 15. 10. 2024 14:03.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1781892/cs -
LYČKA, Martin, Vratislav PEŠKA, Martin DEMKO, Ioannis SPYROGLOU, Agata Magdalena KILAR, Jiří FAJKUS a Miloslava FOJTOVÁ. WALTER: an easy way to online evaluate telomere lengths from terminal restriction fragment analysis. BMC Bioinformatics. London: BioMed Central, 2021, roč. 22, č. 1, s. "145", 14 s. ISSN 1471-2105. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12859-021-04064-0.URL
RIV/00216224:14740/21:00119108 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Lyčka, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Peška, Vratislav (203 Česká republika) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Spyroglou, Ioannis (300 Řecko, domácí) -- Kilar, Agata Magdalena (616 Polsko, domácí) -- Fajkus, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Fojtová, Miloslava (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Telomere length; Terminal restriction fragments; Online toolset
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 31. 10. 2024 11:48.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1784126/cs -
LOBELLO, Cosimo, Boris TICHÝ, Vojtěch BYSTRÝ, Lenka RADOVÁ, Daniel FILIP, Marek MRÁZ, IA. MONTES-MOJARO, Andrea JANÍKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Analysis mutational landscape in systemic anaplastic large cell lymphoma identifies novel prognostic markers. In 20. Pražské hematologické dny (Hematologie 2020), Praha. 2020.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 6. 11. 2020 13:07.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1689890/cs -
ŠTĚTKOVÁ, Monika, Kateřina GROWKOVÁ, Petr FOJTÍK, Barbora VALČÍKOVÁ, Veronika PALUŠOVÁ, Amandine VERLANDE, Radek JORDA, Vladimír KRYŠTOF, Václav HEJRET, Panagiotis ALEXIOU, Vladimír ROTREKL a Stjepan ULDRIJAN. CDK9 activity is critical for maintaining MDM4 overexpression in tumor cells. CELL DEATH & DISEASE. LONDON: NATURE PUBLISHING GROUP, 2020, roč. 11, č. 9, s. 1-14. ISSN 2041-4889. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41419-020-02971-3.URL
RIV/00216224:14110/20:00114362 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Štětková, Monika (203 Česká republika, domácí) -- Growková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Fojtík, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Valčíková, Barbora (203 Česká republika, domácí) -- Palušová, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Verlande, Amandine (250 Francie, domácí) -- Jorda, Radek (203 Česká republika) -- Kryštof, Vladimír (203 Česká republika) -- Hejret, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Alexiou, Panagiotis (300 Řecko, domácí) -- Rotrekl, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Uldrijan, Stjepan (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: CDK9; MDM4; tumor cells
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 24. 10. 2024 17:22.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1685077/cs -
ŠKOLÁKOVÁ, Petra, Zahra BADRI, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Jan RYNEŠ, Jiří ŠPONER, Miloslava FOJTOVÁ, Jiří FAJKUS, Radek MAREK, Michaela VORLÍČKOVÁ, Jean-Louis MERGNY a Lukáš TRANTÍREK. Composite 5-methylations of cytosines modulate i-motif stability in a sequence-specific manner: Implications for DNA nanotechnology and epigenetic regulation of plant telomeric DNA. BBA - General Subjects. Elsevier B.V., 2020, roč. 1864, č. 9, s. 129651-129659. ISSN 0304-4165. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bbagen.2020.129651.DOI: 10.1016/j.bbagen.2020.129651
RIV/00216224:14740/20:00115829 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
Školáková, Petra (203 Česká republika) -- Badri, Zahra (364 Írán, domácí) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika) -- Ryneš, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Šponer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Fojtová, Miloslava (203 Česká republika, domácí) -- Fajkus, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Vorlíčková, Michaela (203 Česká republika) -- Mergny, Jean-Louis (250 Francie) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: i-motif;DNA;Epigenetic modification;DNA nanotechnology;Plant telomeric DNA;Cytosine methylation
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 14. 10. 2024 12:59.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1663196/cs -
PESCHELOVÁ, Helena, Veronika KOZLOVÁ, Veronika MANČÍKOVÁ, Adriana LADUNGOVÁ, Václav HEJRET a Michal ŠMÍDA. CRISPR/CAS9 technology: a useful tool in the study of chronic lymphocytic leukemia. In XXth Interdisciplinary meeting of young researchs and students in the field of chemistry, biochemistry, molecular biology and biomaterials in Chemické listy. 2020. ISSN 2336-7202.URL
RIV/00216224:14740/20:00118156 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Peschelová, Helena (203 Česká republika, domácí) -- Kozlová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Mančíková, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Ladungová, Adriana (703 Slovensko, domácí) -- Hejret, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Šmída, Michal (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: CRISPR/CAS9
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 17. 3. 2021 13:54.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1740858/cs -
PESCHELOVÁ, Helena, Lenka DOSTÁLOVÁ, Veronika KOZLOVÁ, Aneta LEDEREROVÁ, Václav HEJRET a Michal ŠMÍDA. Genome-wide CRISPR/Cas9 screening reveals novel target genes, whose inactivation is able to upregulate surface expression of immunotherapy target CD20. In 25th Congress of European Hematology Association, Amsterdam, Nizozemsko, in HemaSphere. 2020.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 6. 11. 2020 10:08.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1689694/cs -
GIASSA, Ilektra-Chara, Andrea VAVRINSKÁ, Jiří ZELINKA, Jakub ŠEBERA, Vladimír SYCHROVSKÝ, Rolf BOELENS, Radovan FIALA a Lukáš TRANTÍREK. HERMES - A Software Tool for the Prediction and Analysis of Magnetic-Field-Induced Residual Dipolar Couplings in Nucleic Acids. ChemPlusChem. Weinheim: Wiley - Verlag Chemie, 2020, roč. 85, č. 9, s. 2177-2185. ISSN 2192-6506. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cplu.202000505.URL
RIV/00216224:14740/20:00117855 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
Giassa, Ilektra-Chara (300 Řecko, domácí) -- Zelinka, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: field-induced residual dipolar couplings; magnetic susceptibility anisotropy; NMR; nucleic acids; prediction software
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 30. 10. 2024 14:15.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1729960/cs -
REIGL, Tomáš, Jakub Paweł PORC, Kamila STRÁNSKÁ, Karol PÁL, Veronika NAVRKALOVÁ, Jakub HYNŠT, Vojtěch BYSTRÝ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Nikos DARZENTAS a Karla PLEVOVÁ. High throughput sequencing data analysis of IG/TR rearranged genes in leukemie clinical research. In CEITEC PhD Conference, Brno, únor 2020. 2020.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 20. 1. 2021 08:24.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1730957/cs -
KEENAN, B.T., R.J. GALANTE, J. LIAN, Petr ŠIMEČEK, D.M. GATTI, L. ZHANG, D.C. LIM, K.L. SVENSON, G.A. CHURCHILL a A.I. PACK. High-throughput sleep phenotyping produces robust and heritable traits in Diversity Outbred mice and their founder strains. SLEEP. CARY: OXFORD UNIV PRESS INC, 2020, roč. 43, č. 5, s. nestrankovano, 17 s. ISSN 0161-8105. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/sleep/zsz278.URL
RIV/00216224:14740/20:00118316 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Šimeček, Petr (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: genetics; high-throughput phenotyping; Diversity Outbred mice; sleep latency in new environment; modified Murine Multiple Sleep Latency Test; circadian period; sleep
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 3. 3. 2021 14:42.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1748757/cs -
LOBELLO, Cosimo, Vojtěch BYSTRÝ, Lenka RADOVÁ, Daniel FILIP, Marek MRÁZ, IA. MONTES-MOJARRO, N. PROKOPH, H. LAROSE, HCh. LIANG, G. SHARMA, L. MOLOGNI, D. BELADA, K. KAMARÁDOVÁ, F. FEND, C. GAMBACORTI-PASSERINI, O. MERKEL, S. TURNER, Andrea JANÍKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Mutational landscape analysis in systematic anaplastic large cell lymphoma identifies novel prognostic markers. In CEITEC PhD Conference, Brno, 2020. 2020.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 20. 1. 2021 08:33.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1730958/cs -
KLIMENTOVÁ, Eva, Jakub POLÁČEK, Petr ŠIMEČEK a Panagiotis ALEXIOU. PENGUINN: Precise Exploration of Nuclear G-Quadruplexes Using Interpretable Neural Networks. Frontiers in Genetics. Lausanne: Frontiers, 2020, roč. 11, OCT, s. 568546-568552. ISSN 1664-8021. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3389/fgene.2020.568546.URL
RIV/00216224:14740/20:00118477 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Klimentová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Poláček, Jakub (703 Slovensko, domácí) -- Šimeček, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Alexiou, Panagiotis (300 Řecko, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: bioinformatics and computational biology; machine learning; deep neural network; G quadruplex; web application; genomic; imbalanced data classification
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 9. 4. 2021 14:00.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1757783/cs -
PESCHELOVÁ, Helena, Veronika KOZLOVÁ, Veronika MANČÍKOVÁ, Adriana LADUNGOVÁ, Václav HEJRET a Michal ŠMÍDA. The use of CRISPR/Cas9 technology in the study of chronic lymphocytic leukemia. In CEITEC PhD Conference. 2020.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 20. 1. 2021 08:19.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1730956/cs -
GRIONI, Andrea, G. FAZIO, S. RIGAMONTI, Vojtěch BYSTRÝ, G. DANIELE, Zuzana DOSTÁLOVÁ, M. QUADRI, C. SAITTA, D. SILVESTRI, S. SONGIA, C.T. STORLAZZI, A. BIONDI, Nikos DARZENTAS a G. CAZZANIGA. A Simple RNA Target Capture NGS Strategy for Fusion Genes Assessment in the Diagnostics of Pediatric B-cell Acute Lymphoblastic Leukemia. HEMASPHERE. PHILADELPHIA: LIPPINCOTT WILLIAMS & WILKINS, 2019, roč. 3, č. 3, s. 1-9. ISSN 2572-9241. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1097/HS9.0000000000000250.URL
RIV/00216224:14740/19:00113287 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Grioni, Andrea (380 Itálie, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Dostálová, Zuzana (203 Česká republika, domácí) -- Darzentas, Nikos (300 Řecko, domácí)
Klíčová slova anglicky: HIGH-RISK; EXPRESSION; IKZF1; CRLF2
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 24. 10. 2024 16:44.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1636878/cs -
ZÁPRAŽNÁ, Kristína, Kamila RÉBLOVÁ, V. SVOBODOVA, Lenka RADOVÁ, Vojtěch BYSTRÝ, Jiří BALOUN, Kristina ĎURECHOVÁ, Nikola TOM, Tomáš LOJA, Martina BUREŠOVÁ, Kamila STRÁNSKÁ, Alexandra OLTOVÁ, Michael DOUBEK, M.L. ATCHISON, Martin TRBUŠEK, Jitka MALČÍKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Activation-induced deaminase and its splice variants associate with trisomy 12 in chronic lymphocytic leukemia. Annals of hematology. New York: Springer Verlag, 2019, roč. 98, č. 2, s. 423-435. ISSN 0939-5555. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00277-018-3520-5.URL
RIV/00216224:14740/19:00109169 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Zápražná, Kristína (203 Česká republika, domácí) -- Réblová, Kamila (203 Česká republika, domácí) -- Svobodova, V. (203 Česká republika) -- Radová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Baloun, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Ďurechová, Kristina (203 Česká republika, domácí) -- Tom, Nikola (203 Česká republika, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Burešová, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Stránská, Kamila (203 Česká republika, domácí) -- Oltová, Alexandra (203 Česká republika, domácí) -- Doubek, Michael (203 Česká republika, domácí) -- Atchison, M.L. (840 Spojené státy) -- Trbušek, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Malčíková, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Activation induced deaminase; Chronic lymphocytic leukemia; Complex karyotype; Alternative splicing; Trisomy 12
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 15. 10. 2024 08:59.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1498916/cs -
VEČEŘA, Marek, Jan OPPELT, Radim LIPINA, Martin SMRČKA, Radim JANČÁLEK, Michal FILIP, Markéta HERMANOVÁ, Leoš KŘEN, Jiří ŠÁNA a Ondřej SLABÝ. Analýza dlouhých nekódujících RNA v tkáni multiformního glioblastomu a jejich asociace s celkovým přežíváním. In Klinická onkologie. 2019. ISSN 0862-495X.
čeština. Česká republika.
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 16. 8. 2021 12:37.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1583033/cs -
RAČEK, Tomáš, Ondřej SCHINDLER, Vladimír HORSKÝ, Jaroslav KOČA, Dominik TOUŠEK a Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ. AtomicChargeCalculator II. In ELIXIR CZ Annual Conference 2019. 2019. ISBN 978-80-86241-61-6.
RIV/00216224:14740/19:00111276 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Raček, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Schindler, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Horský, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Toušek, Dominik (203 Česká republika, domácí) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Partial atomic charge; AtomicChargeCalculator
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2020 16:50.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1579098/cs -
MIDLIK, Adam, Ivana HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ, Jan HUTAŘ, Tarakaramji MOTURU, Veronika NAVRÁTILOVÁ, Jaroslav KOČA, Karel BERKA a Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ. Automated family-wide annotation of secondary structure elements. In Alexander E. Kister. Protein supersecondary structures: Methods and protocols. Second Edition. New York: Humana Press, 2019, s. 47-71. Methods in Molecular Biology. ISBN 978-1-4939-9160-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-4939-9161-7_3.URL
RIV/00216224:14740/19:00109647 Kapitola resp. kapitoly v odborné knize. angličtina. Spojené státy.
Midlik, Adam (703 Slovensko, domácí) -- Hutařová Vařeková, Ivana (203 Česká republika, domácí) -- Hutař, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Moturu, Tarakaramji (356 Indie, domácí) -- Navrátilová, Veronika (203 Česká republika) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Berka, Karel (203 Česká republika) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Annotation; Secondary structure; Secondary structure elements; Protein family; Protein domain; SecStrAnnotator; Structural alignment; Secondary structure assignment
Mezinárodní význam: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 23. 1. 2022 19:59.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1530759/cs -
MUSILOVÁ, Kateřina, Kateřina AMRUZ ČERNÁ, Sonali SHARMA, Václav ŠEDA, Gabriela MLADONICKÁ PAVLASOVÁ, Jan OPPELT, Daniel FILIP, Veronika ŠANDOVÁ, Laura ONDRIŠOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Eva VOJÁČKOVÁ, Pedro FARIA ZENI, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. B Cell Receptor Signalling Regulation by Non-coding RNAs. In EU-LIFE Scientific Meeting 2019, Cambridge, UK. 2019.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 29. 1. 2020 10:10.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1613416/cs -
ŠAFRÁNEK, David, Matej TROJÁK, Vojtěch BRŮŽA, Tomáš VEJPUSTEK, Jan PAPOUŠEK, Martin DEMKO, Samuel PASTVA, Aleš PEJZNOCH a Luboš BRIM. Barbaric Robustness Monitoring Revisited for STL* in Parasim. In Bortolussi L., Sanguinetti G. Computational Methods in Systems Biology (CMSB 2019). LNBI 11773. Neuveden: Springer, 2019, s. 356-359. ISBN 978-3-030-31303-6. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-31304-3_26.
RIV/00216224:14330/19:00107671 Stať ve sborníku. angličtina. Česká republika.
Šafránek, David (203 Česká republika, garant, domácí) -- Troják, Matej (703 Slovensko, domácí) -- Brůža, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Vejpustek, Tomáš (203 Česká republika) -- Papoušek, Jan (203 Česká republika) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Pastva, Samuel (703 Slovensko, domácí) -- Pejznoch, Aleš (203 Česká republika) -- Brim, Luboš (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: systems biology; robustness analysis; STL
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D., učo 3159. Změněno: 15. 4. 2021 12:11.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1561203/cs -
HYNŠT, Jakub, Karla PLEVOVÁ, Lenka RADOVÁ, Vojtěch BYSTRÝ, Karol PÁL a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Bioinformatic pipelines for whole transcriptome sequencing data exploitation in leukemia patients with complex structural variants. PeerJ. London: PEERJ INC, 2019, roč. 7, JUN, s. 7071-7086. ISSN 2167-8359. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.7717/peerj.7071.URL
RIV/00216224:14740/19:00108521 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Hynšt, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Plevová, Karla (203 Česká republika, domácí) -- Radová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Pál, Karol (703 Slovensko, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Chromothripsis; Complex structural variants; Fusion gene; Gene expression; Bioinformatic pipeline; Next-generation sequencing; Leukemia; Transcriptomics; Chronic lymphocytic leukemia; Statistics
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Adéla Pešková, učo 143895. Změněno: 2. 11. 2024 16:28.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1567877/cs -
MLADONICKÁ PAVLASOVÁ, Gabriela, Veronika ŠANDOVÁ, Marek BORSKÝ, Jan OPPELT, Václav ŠEDA, Yvona BRYCHTOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. CD20 in the context of microenvironmental interactions of malignant B cells: Implications for targeted therapy. In XXV. Pařízkovy dny, Ostrava. 2019.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 29. 1. 2020 10:38.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1613457/cs -
DEMKO, Martin, Lukáš CHRÁST, Pavel DVOŘÁK, Jiří DAMBORSKÝ a David ŠAFRÁNEK. Computational Modelling of Metabolic Burden and Substrate Toxicity in Escherichia coli Carrying a Synthetic Metabolic Pathway. Microorganisms. Basel: MDPI, 2019, roč. 7, č. 11, s. 553-581. ISSN 2076-2607. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/microorganisms7110553.Full Text
Název anglicky: Computational Modelling of Metabolic Burden and Substrate Toxicity in Escherichia coli Carrying a Synthetic Metabolic Pathway
RIV/00216224:14310/19:00107775 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Demko, Martin (703 Slovensko, garant, domácí) -- Chrást, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Dvořák, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Šafránek, David (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: biodegradation; computational modelling; population growth; metabolic burden; environmental pollutants
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Michaela Hylsová, Ph.D., učo 211937. Změněno: 15. 2. 2023 22:51.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1577678/cs -
MIDLIK, Adam, Ivana HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ, Jan HUTAŘ, Veronika NAVRÁTILOVÁ, Jaroslav KOČA, Karel BERKA a Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ. Creation and visualization of secondary structure consensus for protein families. In XX. setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2019.URL
angličtina. Česká republika.
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: Mgr. et Mgr. Adam Midlik, Ph.D., učo 379962. Změněno: 22. 1. 2020 13:53.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1608525/cs -
PESCHELOVÁ, Helena, Veronika KOZLOVÁ, Václav HEJRET a Michal ŠMÍDA. CRISPR/Cas9 gene editing and functional screening in chronic lymphocytic leukemia. In Joint retreat 2019, Kouty u Ledče nad Sázavou. 2019. ISBN 978-80-210-9300-3.URL
RIV/00216224:14740/19:00112812 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Peschelová, Helena (203 Česká republika, domácí) -- Kozlová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Hejret, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Šmída, Michal (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: CRISPR/Cas9; chronic lymphocytic leukemia
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2020 13:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1613325/cs -
GRIONI, Andrea, Georgios GEORGAKILAS a Panagiotis ALEXIOU. Dicier: a Fine-tuned Bioinformatics Pipeline to Detect Micro-RNA Chimeric Reads. In ASCB / EMBO 2019 meeting. 2019.URL
RIV/00216224:14740/19:00113385 Konferenční abstrakt. angličtina. Spojené státy.
Grioni, Andrea (380 Itálie, domácí) -- Georgakilas, Georgios (300 Řecko, domácí) -- Alexiou, Panagiotis (300 Řecko, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Dicier; Bioinformatics Pipeline; Micro-RNA Chimeric Reads
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 29. 3. 2020 20:13.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1640223/cs -
REIGL, Tomáš, Kamila STRÁNSKÁ, Vojtěch BYSTRÝ, Adam KREJČÍ, Andrea GRIONI, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Nikos DARZENTAS a Karla PLEVOVÁ. Encyklopedie subsetů CLL – Unikátní bio informatický nástroj a databáze pro analýzu subsetů stereotypních B buněčných receptorů u CLL. In Klinická Onkologie. ČR: ČLS JEP, 2019, s. 167-170. ISSN 0862-495X.
Název anglicky: Encyclopedia of CLL subsets - a unique bioinformatics tool and database for analysis of subsets of stereotypical B-Cell receptors in CLL
RIV/00216224:14740/19:00108585 Stať ve sborníku. čeština. Česká republika.
Reigl, Tomáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Stránská, Kamila (203 Česká republika, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Grioni, Andrea (380 Itálie, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Darzentas, Nikos (300 Řecko, domácí) -- Plevová, Karla (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: CLL; bioinformatics; immunogenetics; immunoglobulins; stereotyped BCR
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 3. 2020 17:29.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1614502/cs -
REIGL, Tomáš, Kamila STRÁNSKÁ, Vojtěch BYSTRÝ, Adam KREJČÍ, Andrea GRIONI, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Nikos DARZENTAS a Karla PLEVOVÁ. Encyklopedie subsetů CLL – unikátní bioinformatický nástroj a databáze pro analýzu subsetů stereotypních B buněčných receptorů u CLL. In XLIII. Brněnské onkologické dny v Klinická Onkologie, Brno. 2019.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 20. 11. 2019 13:45.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1582240/cs -
HORSKÝ, Vladimír, Veronika BENDOVÁ, Dominik TOUŠEK, Jaroslav KOČA a Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ. Exploring trends in quality and features of biomacromolecular complexes with ValTrendsDB. In XX. setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2019. ISBN 978-80-210-9420-8.Conference website
RIV/00216224:14740/19:00111378 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Horský, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bendová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Toušek, Dominik (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: PDB; PDBe; Protein Data Bank; three-dimensional macromolecular structure; validation; wwPDB validation pipeline; ligands; ValTrendsDB; X-ray crystallography; NMR spectroscopy; 3DEM; database; trends in quality; visualization; statistical analysis
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2020 16:48.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1581336/cs -
FAZIO, G., V. MASSA, Andrea GRIONI, Vojtěch BYSTRÝ, S. RIGAMONTI, C. SAITTA, M. GALBIATI, C. RIZZARI, C. CONSARINO, A. BIONDI, A. SELICORNI a G. CAZZANIGA. First evidence of a paediatric patient with Cornelia de Lange syndrome with acute lymphoblastic leukaemia. Journal of clinical pathology. London: BMJ Publishing Group, 2019, roč. 72, č. 8, s. 558-561. ISSN 0021-9746. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1136/jclinpath-2019-205707.URL
RIV/00216224:14740/19:00113418 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Grioni, Andrea (380 Itálie, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: molecular genetics; haemato-oncology; molecular oncology; paediatric haematology; paediatric pathology
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 24. 10. 2024 16:56.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1641178/cs -
SOUČKOVÁ, Kamila, Radim BLAŽEK, Vojtěch BYSTRÝ, Iva DYKOVÁ, J. ŽÁK, Markéta HERMANOVÁ, Matej JASÍK, Matej POLAČIK, Martin REICHARD a Ondřej SLABÝ. Halančíci jako nový model pro studium věkem podmíněné spontánní karcinogeneze. In XLIII. Brněnské onkologické dny v Klinická Onkologie, Brno. 2019.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 1. 11. 2019 13:30.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1575096/cs -
HORSKÝ, Vladimír, Veronika BENDOVÁ, Dominik TOUŠEK, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ a Jaroslav KOČA. Interactive exploration of trends in biomacromolecule structure quality with ValTrendsDB. In CEITEC Joint Retreat 2019. 2019. ISBN 978-80-210-9300-3.Book of abstracts
RIV/00216224:14740/19:00110334 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Horský, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bendová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Toušek, Dominik (203 Česká republika, domácí) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: PDB; PDBe; Protein Data Bank; three-dimensional macromolecular structure; validation; wwPDB validation pipeline; ligands; ValTrendsDB; X-ray crystallography; NMR spectroscopy; 3DEM; database; trends in quality; visualization; statistical analysis
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2020 16:52.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1548689/cs -
ONDRIŠOVÁ, Laura, Václav ŠEDA, Kateřina AMRUZ ČERNÁ, Gabriela MLADONICKÁ PAVLASOVÁ, Eva VOJÁČKOVÁ, Jan OPPELT, Daniel FILIP, Veronika ŠANDOVÁ, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. Mechanism of leukemia cell adaptation to targeted therapy in chronic lymphocytic leukemia. In XIX. Interdisciplinary meeting of young life scientists in Czech Chemical Society Symposium Series. 2019.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 24. 1. 2020 07:27.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1609426/cs -
AMRUZ ČERNÁ, Kateřina, Jan OPPELT, Václav CHOCHOLA, Kateřina MUSILOVÁ, Václav ŠEDA, Gabriela PAVLASOVÁ, Lenka RADOVÁ, M. ARIGONI, R.A. CALOGERO, V. BENES, Martin TRBUŠEK, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Marek MRÁZ. MicroRNA miR-34a downregulates FOXP1 during DNA damage response to limit BCR signalling in chronic lymphocytic leukaemia B cells. Leukemia. London: Nature Publishing Group, 2019, roč. 33, č. 2, s. 403-414. ISSN 0887-6924. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41375-018-0230-x.URL
Název anglicky: MicroRNA miR-34a downregulates FOXP1 during DNA damage response to limit BCR signalling in chronic lymphocytic leukaemia B cells.
RIV/00216224:14740/19:00109077 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Amruz Černá, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Chochola, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Musilová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Šeda, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Pavlasová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Radová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Arigoni, M. (380 Itálie) -- Calogero, R.A. (380 Itálie) -- Benes, V. (276 Německo) -- Trbušek, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Brychtová, Yvona (203 Česká republika, domácí) -- Doubek, Michael (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Mráz, Marek (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: TRANSCRIPTION FACTOR; TP53 MUTATION; EXPRESSION; RECEPTOR; LYMPHOMA; SURVIVAL; TRANSFORMATION; FLUDARABINE; PROGRESSION; REPRESSION
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 24. 10. 2024 16:27.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1492287/cs -
WAYHELOVÁ, Markéta, Jan OPPELT, Jan SMETANA, Eva HLADÍLKOVÁ, Hana FILKOVÁ, Eva MAKATUROVÁ, Petra NIKOLOVÁ, Rastislav BEHARKA, Renata GAILLYOVÁ a Petr KUGLÍK. Novel de novo frameshift variant in the ASXL3 gene in a child with microcephaly and global developmental delay. Molecular Medicine Reports. Athens: SPANDIDOS PUBL LTD, 2019, roč. 20, č. 1, s. 505-512. ISSN 1791-2997. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3892/mmr.2019.10303.Full Text
RIV/00216224:14310/19:00109841 Článek v odborném periodiku. angličtina. Řecko.
Wayhelová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Smetana, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Hladílková, Eva (203 Česká republika) -- Filková, Hana (203 Česká republika) -- Makaturová, Eva (203 Česká republika) -- Nikolová, Petra (203 Česká republika) -- Beharka, Rastislav (703 Slovensko) -- Gaillyová, Renata (203 Česká republika) -- Kuglík, Petr (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: NGS; Bainbridge Ropers syndrome; global developmental delay
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 18. 3. 2020 14:46.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1536880/cs -
SCHINDLER, Ondřej, Tomáš RAČEK, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ a Jaroslav KOČA. Partial atomic charges for proteins. In ELIXIR CZ Annual Conference 2019. 2019. ISBN 978-80-86241-61-6.
RIV/00216224:14740/19:00111277 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Schindler, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Raček, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Partial atomic charges; proteins
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2020 16:49.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1579102/cs -
POPPOVÁ, Lucie, Pavlína JANOVSKÁ, B. GONZALEZ, Karla PLEVOVÁ, Vojtěch BYSTRÝ, Karol PÁL, Hana PLEŠINGEROVÁ, Marek BORSKÝ, Helena OLBERTOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, PAVLOVÁ, S ALONSO, Vítězslav BRYJA a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Promoter Methylation of ROR1 Ligand WNT5A associates with Its Expression in Chronic Lymphocytic Leukemia. In XIX. Interdisciplinary meeting of young life scientists in Czech Chemical Society Symposium Series. 2019.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 30. 1. 2020 14:04.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1614700/cs -
BURLEY, S.K., H.M. BERMAN, C. BHIKADIYA, C.X. BI, L. CHEN, L. DI COSTANZO, C. CHRISTIE, J.M. DUARTE, S. DUTTA, Z.K. FENG, S. GHOSH, D.S. GOODSELL, R.K. GREEN, V. GURANOVIC, D. GUZENKO, B.P. HUDSON, Y.H. LIANG, R. LOWE, E. PEISACH, I. PERISKOVA, C. RANDLE, A. ROSE, M. SEKHARAN, CH. SHAO, Y.P. TAO, Y. VALASATAVA, M. VOIGT, J. WESTBROOK, J. YOUNG, C. ZARDECKI, M. ZHURAVLEVA, G. KURISU, H. NAKAMURA, Y. KENGAKU, H. CHO, J. SATO, J.Y. KIM, Y. IKEGAWA, A. NAKAGAWA, R. YAMASHITA, T. KUDOU, G.J. BEKKER, H. SUZUKI, T. IWATA, M. YOKOCHI, N. KOBAYASHI, T. FUJIWARA, S. VELANKAR, G.J. KLEYWEGT, S. ANYANGO, D.R. ARMSTRONG, J.M. BERRISFORD, M.J. CONROY, J.M. DANA, M. DESHPANDE, P. GANE, Romana GÁBOROVÁ, D. GUPTA, A. GUTMANAS, Jaroslav KOČA, L. MAK, S. MIR, A. MUKHOPADHYAY, N. NADZIRIN, S. NAIR, A. PATWARDHAN, T. PAYSAN-LAFOSSE, Lukáš PRAVDA, O. SALIH, David SEHNAL, M. VARADI, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, J.L. MARKLEY, J.C. HOCH, P.R. ROMERO, K. BASKARAN, D. MAZIUK, E.L. ULRICH, J.R. WEDELL, H.Y. YAO, M. LIVNY a Y.E. IOANNIDIS. Protein Data Bank: the single global archive for 3D macromolecular structure data. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2019, roč. 47, D1, s. "D520"-"D528", 9 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gky949.URL
RIV/00216224:14740/19:00109524 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Burley, S.K. (840 Spojené státy) -- Berman, H.M. (840 Spojené státy) -- Bhikadiya, C. (840 Spojené státy) -- Bi, C.X. (840 Spojené státy) -- Chen, L. (840 Spojené státy) -- Di Costanzo, L. (840 Spojené státy) -- Christie, C. (840 Spojené státy) -- Duarte, J.M. (840 Spojené státy) -- Dutta, S. (840 Spojené státy) -- Feng, Z.K. (840 Spojené státy) -- Ghosh, S. (840 Spojené státy) -- Goodsell, D.S. (840 Spojené státy) -- Green, R.K. (840 Spojené státy) -- Guranovic, V. (840 Spojené státy) -- Guzenko, D. (840 Spojené státy) -- Hudson, B.P. (840 Spojené státy) -- Liang, Y.H. (840 Spojené státy) -- Lowe, R. (840 Spojené státy) -- Peisach, E. (840 Spojené státy) -- Periskova, I. (840 Spojené státy) -- Randle, C. (840 Spojené státy) -- Rose, A. (840 Spojené státy) -- Sekharan, M. (840 Spojené státy) -- Shao, CH. (840 Spojené státy) -- Tao, Y.P. (840 Spojené státy) -- Valasatava, Y. (840 Spojené státy) -- Voigt, M. (840 Spojené státy) -- Westbrook, J. (840 Spojené státy) -- Young, J. (840 Spojené státy) -- Zardecki, C. (840 Spojené státy) -- Zhuravleva, M. (840 Spojené státy) -- Kurisu, G. (392 Japonsko) -- Nakamura, H. (392 Japonsko) -- Kengaku, Y. (392 Japonsko) -- Cho, H. (392 Japonsko) -- Sato, J. (392 Japonsko) -- Kim, J.Y. (392 Japonsko) -- Ikegawa, Y. (392 Japonsko) -- Nakagawa, A. (392 Japonsko) -- Yamashita, R. (392 Japonsko) -- Kudou, T. (392 Japonsko) -- Bekker, G.J. (392 Japonsko) -- Suzuki, H. (392 Japonsko) -- Iwata, T. (392 Japonsko) -- Yokochi, M. (392 Japonsko) -- Kobayashi, N. (392 Japonsko) -- Fujiwara, T. (392 Japonsko) -- Velankar, S. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Kleywegt, G.J. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Anyango, S. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Armstrong, D.R. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Berrisford, J.M. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Conroy, M.J. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Dana, J.M. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Deshpande, M. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Gane, P. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Gáborová, Romana (703 Slovensko, domácí) -- Gupta, D. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Gutmanas, A. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, garant, domácí) -- Mak, L. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Mir, S. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Mukhopadhyay, A. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Nadzirin, N. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Nair, S. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Patwardhan, A. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Paysan-Lafosse, T. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Pravda, Lukáš (203 Česká republika) -- Salih, O. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Sehnal, David (203 Česká republika, domácí) -- Varadi, M. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Markley, J.L. (840 Spojené státy) -- Hoch, J.C. (840 Spojené státy) -- Romero, P.R. (840 Spojené státy) -- Baskaran, K. (840 Spojené státy) -- Maziuk, D. (840 Spojené státy) -- Ulrich, E.L. (840 Spojené státy) -- Wedell, J.R. (840 Spojené státy) -- Yao, H.Y. (840 Spojené státy) -- Livny, M. (840 Spojené státy) -- Ioannidis, Y.E. (300 Řecko)
Klíčová slova anglicky: RESOURCE DESCRIPTION FRAMEWORK; VALIDATION; REPRESENTATION; PREDICTION; DEPOSITION; CHALLENGE; SYSTEM; TOOLS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 24. 10. 2024 16:41.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1525776/cs -
KNECHT, H., Tomáš REIGL, M. KOTROVA, F. APPELT, P. STEWART, Vojtěch BYSTRÝ, Adam KREJČÍ, A. GRIONI, Karol PÁL, Kamila STRÁNSKÁ, Karla PLEVOVÁ, J. RIJNTJES, S. SONGIA, M. SVATON, E. FRONKOVA, J. BARTRAM, B. SCHEIJEN, D. HERRMANN, R. GARCIA-SANZ, J. HANCOCK, J. MOPPETT, J.J.M. VAN DONGEN, G. CAZZANIGA, F. DAVI, P.J.T.A. GROENEN, M. HUMMEL, E.A. MACINTYRE, K. STAMATOPOULOS, J. TRKA, A.W. LANGERAK, D. GONZALEZ, C. POTT, M. BRUGGEMANN a Nikos DARZENTAS. Quality control and quantification in IG/TR next-generation sequencing marker identification: protocols and bioinformatic functionalities by EuroClonality-NGS. Leukemia. London: Nature Publishing Group, 2019, roč. 33, č. 9, s. 2254-2265. ISSN 0887-6924. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41375-019-0499-4.URL
RIV/00216224:14740/19:00108523 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Knecht, H. (276 Německo) -- Reigl, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Kotrova, M. (276 Německo) -- Appelt, F. (276 Německo) -- Stewart, P. (372 Irsko) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Grioni, A. (380 Itálie) -- Pál, Karol (703 Slovensko, domácí) -- Stránská, Kamila (203 Česká republika, domácí) -- Plevová, Karla (203 Česká republika, domácí) -- Rijntjes, J. (528 Nizozemské království) -- Songia, S. (380 Itálie) -- Svaton, M. (203 Česká republika) -- Fronkova, E. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Bartram, J. (528 Nizozemské království) -- Scheijen, B. (276 Německo) -- Herrmann, D. (276 Německo) -- Garcia-Sanz, R. (724 Španělsko) -- Hancock, J. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Moppett, J. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- van Dongen, J.J.M. (528 Nizozemské království) -- Cazzaniga, G. (380 Itálie) -- Davi, F. (250 Francie) -- Groenen, P.J.T.A. (528 Nizozemské království) -- Hummel, M. (276 Německo) -- Macintyre, E.A. (250 Francie) -- Stamatopoulos, K. (300 Řecko) -- Trka, J. (203 Česká republika) -- Langerak, A.W. (528 Nizozemské království) -- Gonzalez, D. (372 Irsko) -- Pott, C. (276 Německo) -- Bruggemann, M. (276 Německo) -- Darzentas, Nikos (300 Řecko, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: MINIMAL RESIDUAL DISEASE; ACUTE LYMPHOBLASTIC-LEUKEMIA; CELL LYMPHOMA; IMMUNOGLOBULIN; PCR; STANDARDIZATION; PRIMERS; RELAPSE; RISK
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 24. 10. 2024 16:33.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1569017/cs -
BRUGGEMANN, M., M. KOTROVA, H. KNECHT, J. BARTRAM, M. BOUDJOGRHA, Vojtěch BYSTRÝ, G. FAZIO, E. FRONKOVA, M. GIRAUD, A. GRIONI, J. HANCOCK, D. HERRMANN, C. JIMENEZ, Adam KREJČÍ, J. MOPPETT, Tomáš REIGL, M. SALSON, B. SCHEIJEN, M. SCHWARZ, S. SONGIA, M. SVATON, J.J.M. VAN DONGEN, P. VILLARESE, S. WAKEMAN, G. WRIGHT, G. CAZZANIGA, F. DAVI, R. GARCIA-SANZ, D. GONZALEZ, P.J.T.A. GROENEN, M. HUMMEL, E.A. MACINTYRE, K. STAMATOPOULOS, C. POTT, J. TRKA, Nikos DARZENTAS a A.W. LANGERAK. Standardized next-generation sequencing of immunoglobulin and T-cell receptor gene recombinations for MRD marker identification in acute lymphoblastic leukaemia; a EuroClonality-NGS validation study. Leukemia. London: Nature Publishing Group, 2019, roč. 33, č. 9, s. 2241-2253. ISSN 0887-6924. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41375-019-0496-7.URL
RIV/00216224:14740/19:00108540 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Bruggemann, M. (276 Německo) -- Kotrova, M. (203 Česká republika) -- Knecht, H. (276 Německo) -- Bartram, J. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Boudjogrha, M. (250 Francie) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Fazio, G. (380 Itálie) -- Fronkova, E. (203 Česká republika) -- Giraud, M. (250 Francie) -- Grioni, A. (250 Francie) -- Hancock, J. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Herrmann, D. (276 Německo) -- Jimenez, C. (724 Španělsko) -- Krejčí, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Moppett, J. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Reigl, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Salson, M. (250 Francie) -- Scheijen, B. (528 Nizozemské království) -- Schwarz, M. (276 Německo) -- Songia, S. (380 Itálie) -- Svaton, M. (203 Česká republika) -- van Dongen, J.J.M. (528 Nizozemské království) -- Villarese, P. (250 Francie) -- Wakeman, S. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Wright, G. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Cazzaniga, G. (380 Itálie) -- Davi, F. (250 Francie) -- Garcia-Sanz, R. (724 Španělsko) -- Gonzalez, D. (372 Irsko) -- Groenen, P.J.T.A. (528 Nizozemské království) -- Hummel, M. (372 Irsko) -- Macintyre, E.A. (250 Francie) -- Stamatopoulos, K. (300 Řecko) -- Pott, C. (276 Německo) -- Trka, J. (203 Česká republika) -- Darzentas, Nikos (300 Řecko, garant, domácí) -- Langerak, A.W. (528 Nizozemské království)
Klíčová slova anglicky: MINIMAL RESIDUAL DISEASE; TIME QUANTITATIVE PCR; CONCERTED ACTION; BONE-MARROW; REARRANGEMENTS; RELAPSE; HEAVY; QUANTIFICATION; CHILDREN; PRIMERS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 24. 10. 2024 16:30.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1581687/cs -
VEČEŘA, Marek, Jiří ŠÁNA, Jan OPPELT, Boris TICHÝ, Alena KOPKOVÁ, R. LIPINA, Martin SMRČKA, Radim JANČÁLEK, Markéta HERMANOVÁ, Leoš KŘEN a Ondřej SLABÝ. Testing of library preparation methods for transcriptome sequencing of real life glioblastoma and brain tissue specimens: A comparative study with special focus on long non-coding RNAs. Plos one. San Francisco: Public Library of Science, 2019, roč. 14, č. 2, s. 1-18. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0211978.URL
RIV/00216224:14740/19:00108512 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Večeřa, Marek (703 Slovensko, domácí) -- Šána, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Tichý, Boris (203 Česká republika, domácí) -- Kopková, Alena (203 Česká republika, domácí) -- Lipina, R. (203 Česká republika) -- Smrčka, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Jančálek, Radim (203 Česká republika, domácí) -- Hermanová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Křen, Leoš (203 Česká republika, domácí) -- Slabý, Ondřej (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: SEQ; PROLIFERATION; CANCER
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 15. 10. 2024 09:15.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1555282/cs -
ISON, Jon, Hans IENASESCU, Piotr CHMURA, Emil RYDZA, Hervé MÉNAGER, Matúš KALAŠ, Veit SCHWÄMMLE, Björn GRÜNING, Niall BEARD, Rodrigo LOPEZ, Severine DUVAUD, Heinz STOCKINGER, Bengt PERSSON, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Tomáš RAČEK, Jiří VONDRÁŠEK, Hedi PETERSON, Ahto SALUMETS, Inge JONASSEN, Rob HOOFT, Tommi NYRÖNEN, Alfonso VALENCIA, Salvador CAPELLA, Josep GELPÍ, Federico ZAMBELLI, Babis SAVAKIS, Brane LESKOŠEK, Kristoffer RAPACKI, Christophe BLANCHET, Rafael JIMENEZ, Arlindo OLIVEIRA, Gert VRIEND, Olivier COLLIN, Jacques van HELDEN, Peter LØNGREEN a Søren BRUNAK. The bio.tools registry of software tools and data resources for the life sciences. GENOME BIOLOGY. LONDON: BIOMED CENTRAL LTD, 2019, roč. 20, č. 164, s. 1-4. ISSN 1474-760X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13059-019-1772-6.URL
RIV/00216224:14740/19:00110410 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Ison, Jon (garant) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Raček, Tomáš (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: bio.tools registry; life sciences
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 12. 5. 2020 13:07.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1549416/cs -
PLASIL, M., S. WIJKMARK, J.P. ELBERS, Jan OPPELT, P.A. BURGER a P. HORIN. The major histocompatibility complex of Old World camelids: Class I and class I-related genes. HLA. HOBOKEN: WILEY, 2019, roč. 93, č. 4, s. 203-215. ISSN 2059-2302. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/tan.13510.URL
RIV/00216224:14740/19:00113331 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Oppelt, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: camel; MHC class I; MICA; MR1; polymorphism; SNP
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 24. 10. 2024 16:54.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1637978/cs -
AMRUZ ČERNÁ, Kateřina, Kateřina MUSILOVÁ, Gabriela MLADONICKÁ PAVLASOVÁ, Václav ŠEDA, Jan OPPELT, Daniel FILIP, Veronika ŠANDOVÁ, Eva VOJÁČKOVÁ, Sonali SHARMA, Pedro FARIA ZENI, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. The surprising role of microRNAs in the DNA damage and B cell receptor signalling in malignant B cells. In XXXIII. Olomoucké hematologické dny, Olomouc. 2019.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 24. 1. 2020 13:45.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1609636/cs -
PESCHELOVÁ, Helena, Veronika KOZLOVÁ, Václav HEJRET a Michal ŠMÍDA. The use of CRISPR/Cas9 technology in the study of chronic lymphocytic leukemia. In Biomania, Brno. 2019.
RIV/00216224:14740/19:00112810 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Peschelová, Helena (203 Česká republika, domácí) -- Kozlová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Hejret, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Šmída, Michal (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: CRISPR/Cas9; chronic lymphocytic leukemia
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2020 13:37.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1613320/cs -
HORSKÝ, Vladimír, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Veronika BENDOVÁ, Dominik TOUŠEK a Jaroslav KOČA. ValTrendsDB: bringing Protein Data Bank validation information closer to the user. In ELIXIR - EXCELERATE All Hands meeting 2019. 2019.Conference announcement
RIV/00216224:14740/19:00110335 Konferenční abstrakt. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Horský, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Bendová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Toušek, Dominik (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: PDB; PDBe; Protein Data Bank; three-dimensional macromolecular structure; validation; wwPDB validation pipeline; ligands; ValTrendsDB; X-ray crystallography; NMR spectroscopy; 3DEM; database; trends in quality; visualization; statistical analysis
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2020 16:51.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1548691/cs -
HORSKÝ, Vladimír, Veronika BENDOVÁ, Dominik TOUŠEK, Jaroslav KOČA a Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ. ValTrendsDB: bringing Protein Data Bank validation information closer to the user. Bioinformatics. Oxford (UK): Oxford University Press, 2019, roč. 35, č. 24, s. 5389-5390. ISSN 1367-4803. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btz532.URL
RIV/00216224:14740/19:00110332 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Horský, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Bendová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Toušek, Dominik (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: PDB; PDBe; Protein Data Bank; three-dimensional macromolecular structure; validation; wwPDB validation pipeline; ligands; ValTrendsDB; X-ray crystallography; NMR spectroscopy; 3DEM; database; trends in quality; visualization; statistical analysis
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 3. 2020 18:18.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1548686/cs -
HORSKÝ, Vladimír, Veronika BENDOVÁ, Dominik TOUŠEK, Jaroslav KOČA a Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ. ValTrendsDB: Database of biomacromolecular structure validation trends. 2019.URL
RIV/00216224:14740/19:00110338 Software. angličtina. Česká republika.
Horský, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bendová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Toušek, Dominik (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: PDB; PDBe; Protein Data Bank; three-dimensional macromolecular structure; validation; wwPDB validation pipeline; ligands; ValTrendsDB; database; trends in quality; visualization; statistical analysis; C++; Qt SDK; JavaScript; d3.js; Metro UI
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 3. 2020 18:19.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1548695/cs -
HORSKÝ, Vladimír, Veronika BENDOVÁ, Dominik TOUŠEK, Jaroslav KOČA a Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ. ValTrendsDB: Enabling comparison of quality and features of biomacromolecular complexes to the global trend. In ELIXIR CZ Annual Conference 2019. 2019. ISBN 978-80-86241-61-6.Conference website
RIV/00216224:14740/19:00111379 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Horský, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bendová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Toušek, Dominik (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: PDB; PDBe; Protein Data Bank; three-dimensional macromolecular structure; validation; wwPDB validation pipeline; ligands; ValTrendsDB; X-ray crystallography; NMR spectroscopy; 3DEM; database; trends in quality; visualization; statistical analysis
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2020 16:47.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1581337/cs -
GIASSA, Ilektra-Chara, Jan RYNEŠ, T. FESSL, Silvie TRANTÍRKOVÁ a Lukáš TRANTÍREK. Advances in the cellular structural biology of nucleic acids. FEBS LETTERS. HOBOKEN: WILEY, 2018, roč. 592, č. 12, s. 1997-2011. ISSN 1873-3468. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/1873-3468.13054.URL
RIV/00216224:14740/18:00101748 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Giassa, Ilektra-Chara (300 Řecko, domácí) -- Ryneš, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Fessl, T. (203 Česká republika) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: DNA; in-cell chemical probing; in-cell EPR; in-cell NMR; in-cell single-molecule FRET; RNA
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 15. 3. 2019 13:58.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1503022/cs -
PLEVOVÁ, Karla, Tobias RAUSCH, Marie JAROŠOVÁ, Jakub HYNŠT, Kristýna ZÁVACKÁ, Šárka PAVLOVÁ, Vojtěch BYSTRÝ, Eva ONDROUŠKOVÁ, Kamila STRÁNSKÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Lenka RADOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Richard ROSENQUIST, Michael DOUBEK, Vladimír BENEŠ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Analýza rozsáhlých přestaveb genomu u chronické lymfocytární leukémie. In 22. celostátní konference DNA diagnostiky, České Budějovice. 2018.
Název česky: Analýza rozsáhlých přestaveb genomu u chronické lymfocytární leukémie
Název anglicky: Analysis of extensive reconstruction of the genome in chronic lymphocytic leukemia
čeština.
Klíčová slova anglicky: CLL; genome; TP53
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2019 15:40.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1480246/cs -
MIDLIK, Adam, Ivana HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ, Jan HUTAŘ, Veronika NAVRÁTILOVÁ, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Jaroslav KOČA a Karel BERKA. Annotation of protein secondary structure elements for whole protein families. In ECCB 2018, Athens, Greece. 2018.
angličtina. Česká republika.
Mezinárodní význam: ano
Změnila: doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D., učo 4056. Změněno: 25. 10. 2018 13:44.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1455916/cs -
MIDLIK, Adam, Ivana HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ, Jan HUTAŘ, Tarakaramji MOTURU, Veronika NAVRÁTILOVÁ, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Jaroslav KOČA a Karel BERKA. Automated Annotation of Secondary Structure Elements for Entire Protein Families. In National Bioinformatic Conference ENBIK. 2018.URL
angličtina. Česká republika.
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: Mgr. et Mgr. Adam Midlik, Ph.D., učo 379962. Změněno: 22. 1. 2020 13:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1608524/cs -
TRACHTOVÁ, Karolína, Jan OPPELT, Kateřina AMRUZ ČERNÁ a Marek MRÁZ. Bioinformatic analysis of microRNAs and long non-coding RNAs in malignant B cells. In RNA and Disease, Uppsala, Sweden. 2018.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 28. 2. 2019 12:55.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1501800/cs -
REIGL, Tomáš, Kamila STRÁNSKÁ, Karol PÁL, Vojtěch BYSTRÝ, Adam KREJČÍ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Nikos DARZENTAS a Karla PLEVOVÁ. Bioinformatická platforma pro rutinní využití v diagnostice pacientů s chronickou lymfocytární leukémií. In XLII. Brněnské onkologické dny, Brno in Klinická Onkologie. 2018.
Název anglicky: Bioinformatic Platform for Routine Use in Diagnostics of Patients with Chronic Lymphocytic Leukemia
RIV/00216224:14740/18:00104469 Konferenční abstrakt. čeština. Česká republika.
Reigl, Tomáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Stránská, Kamila (203 Česká republika, domácí) -- Pál, Karol (703 Slovensko, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Darzentas, Nikos (300 Řecko, domácí) -- Plevová, Karla (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: bioinformatic; platform; CLL; diagnostic
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2019 15:37.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1468077/cs -
REIGL, Tomáš, Kamila STRÁNSKÁ, Karol PÁL, Vojtěch BYSTRÝ, Adam KREJČÍ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Nikos DARZENTAS a Karla PLEVOVÁ. Bioinformatics platform for routine diagnostics of chronic lymphocytic leukemia patients. In CEITEC PHD and POSTDOC RETREAT 2018, Telč. 2018.
RIV/00216224:14740/18:00106179 Konferenční abstrakt. angličtina.
Reigl, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Stránská, Kamila (203 Česká republika, domácí) -- Pál, Karol (703 Slovensko, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Adam (203 Česká republika) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Darzentas, Nikos (300 Řecko, domácí) -- Plevová, Karla (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: CLL; bioinformatics; routine
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2019 12:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1496442/cs -
REIGL, Tomáš, Kamila STRÁNSKÁ, Karol PÁL, Vojtěch BYSTRÝ, Adam KREJČÍ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Nikos DARZENTAS a Karla PLEVOVÁ. Bioinformatics platform for routine diagnsotics of chronic lymphocytic leukemia patients. In ENBIK2018 conference proceedings, Skalský dvůr. 2018.
Název anglicky: Bioinformatics platform for routine diagnsotics of chronic lymphocytic leukemia patients
RIV/00216224:14740/18:00105058 Konferenční abstrakt. angličtina.
Reigl, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Stránská, Kamila (203 Česká republika, domácí) -- Pál, Karol (703 Slovensko, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Darzentas, Nikos (300 Řecko, domácí) -- Plevová, Karla (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: CLL; bioinformatics
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2019 15:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1481538/cs -
RAČEK, Tomáš, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Dan POLANSKÝ, Karel BERKA a Jaroslav KOČA. bio.tools Sum – tool for exploration of summary information about bioinformatics services in bio.tools. In F1000Research. 2018. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.7490/f1000research.1115564.1.
angličtina. Česká republika.
Mezinárodní význam: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2019 15:23.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1430916/cs -
SMART, Oliver S., Vladimír HORSKÝ, Swanand GORE, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Veronika BENDOVÁ, Gerard J. KLEYWEGT a Sameer VELANKAR. Bringing validation information closer to the user. In CEITEC PhD and Postdoc Retreat 2018. 2018. ISBN 978-80-210-8941-9.
RIV/00216224:14740/18:00102640 Prezentace na konferencích. angličtina. Česká republika.
Smart, Oliver S. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Horský, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Gore, Swanand (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Bendová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Kleywegt, Gerard J. (528 Nizozemské království) -- Velankar, Sameer (826 Velká Británie a Severní Irsko)
Klíčová slova anglicky: PDB; Protein Data Bank; three-dimensional macromolecular structure; validation; ligands; ValTrendsDB
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnil: Mgr. Vladimír Horský, Ph.D., učo 358970. Změněno: 29. 4. 2018 17:17.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1415496/cs -
RAČEK, Tomáš, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ a Jaroslav KOČA. CCL - Charge Calculation Language. In ELIXIR CZ Annual Conference 2018. 2018. ISBN 978-80-86241-60-9.
RIV/00216224:14740/18:00108934 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Raček, Tomáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: partial atomic charges; empirical methods; domain specific language
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2020 16:54.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1471685/cs -
CHIRACKAL MANAVALAN, Anil Paul, Květa PILAŘOVÁ, M. KLUGE, Koen BARTHOLOMEEUSEN, Jan OPPELT, PrashantKumar KHIRSARIYA, Kamil PARUCH, Lumír KREJČÍ, C. FRIEDEL a Dalibor BLAŽEK. CDK12 kinase activity controls G1/S progression by regulating optimal transcription of core DNA replication genes. In 2018 ASCB | EMBO Annual Meeting. 2018.
RIV/00216224:14740/18:00106752 Konferenční abstrakt. angličtina. Spojené státy.
Chirackal Manavalan, Anil Paul (356 Indie, domácí) -- Pilařová, Květa (203 Česká republika, domácí) -- Kluge, M. (276 Německo) -- Bartholomeeusen, Koen (56 Belgie, domácí) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Khirsariya, PrashantKumar (356 Indie, domácí) -- Paruch, Kamil (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Lumír (203 Česká republika, domácí) -- Friedel, C. (276 Německo) -- Blažek, Dalibor (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: CDK12kinase; DNA replication genes
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 3. 4. 2019 10:55.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1514997/cs -
PAVLASOVÁ, Gabriela, Veronika SVOBODOVÁ, Marek BORSKÝ, Jan OPPELT, J. NOVOTNÁ, Kateřina AMRUZ ČERNÁ, Kateřina MUSILOVÁ, Václav ŠEDA, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. CD20 is a direct regulator of B-cell receptor signaling in the microenvironment of chronic lymphocytic leukemia. 2018.
Název anglicky: CD20 is a direct regulator of B-cell receptor signaling in the microenvironment of chronic lymphocytic leukemia
RIV/00216224:14740/18:00104060 Konferenční abstrakt. angličtina.
Pavlasová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Svobodová, Veronika (203 Česká republika) -- Borský, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Novotná, J. (203 Česká republika) -- Amruz Černá, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Musilová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Šeda, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Brychtová, Yvona (203 Česká republika, domácí) -- Doubek, Michael (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Mráz, Marek (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: CD20; receptor; microenvironment; CLL
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2019 15:26.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1450236/cs -
MRÁZ, Marek, Gabriela PAVLASOVÁ, Veronika SVOBODOVÁ, Marek BORSKÝ, Jan OPPELT, Kateřina AMRUZ ČERNÁ, Kateřina MUSILOVÁ, Václav ŠEDA, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Jiří MAYER. CD20 reguluje signalizaci přes B-buněčný receptor v mikroprostředí chronické lymfocytární leukémie. In I. Český hematologický a transfuziologický sjezd, Praha. 2018.
Název anglicky: CD20 regulates signaling via the B-cell receptor in the microenvironment of chronic lymphocytic leukemia
RIV/00216224:14740/18:00104059 Konferenční abstrakt. čeština.
Mráz, Marek (203 Česká republika, garant, domácí) -- Pavlasová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Borský, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Amruz Černá, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Musilová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Šeda, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Brychtová, Yvona (203 Česká republika, domácí) -- Doubek, Michael (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: CD20; CLL; receptor
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2019 15:26.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1450217/cs -
PAVLASOVÁ, Gabriela, Marek BORSKÝ, Veronika SVOBODOVÁ, Jan OPPELT, Kateřina AMRUZ ČERNÁ, Jitka NOVOTNÁ, Kateřina MUSILOVÁ, Václav ŠEDA, Eva VOJÁČKOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. CD20 supports BCR signaling in an intra clonal aggressive chronic lymphocytic leukemia subpopulation of cells and rituximab primarily targets these BCR proficient B cells in vivo. In AACR Annual Meeting Chicago Illinois USA. 2018.
RIV/00216224:14740/18:00104003 Konferenční abstrakt. angličtina.
Pavlasová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Borský, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Amruz Černá, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Novotná, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Musilová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Šeda, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Vojáčková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Brychtová, Yvona (203 Česká republika, domácí) -- Doubek, Michael (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Mráz, Marek (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: CD20; BCR; CLL
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2019 15:25.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1448118/cs -
STROUHAL, Michal, Lenka PAŠTĚKOVÁ, Jan HAVIERNIK, Sascha KNAUF, Sylvia BRUISTEN, Gerda T. NOORDHOEK, Jan OPPELT, Darina ČEJKOVÁ a David ŠMAJS. Complete genome sequences of two strains of Treponema pallidum subsp pertenue from Indonesia: Modular structure of several treponemal genes. PLoS neglected tropical diseases. San Francisco: Public Library of Science, 2018, roč. 12, č. 10, s. 0006867-6886. ISSN 1935-2735. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0006867.URL
RIV/00216224:14110/18:00101497 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Strouhal, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Paštěková, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Haviernik, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Knauf, Sascha (276 Německo) -- Bruisten, Sylvia (528 Nizozemské království) -- Noordhoek, Gerda T. (528 Nizozemské království) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Čejková, Darina (203 Česká republika) -- Šmajs, David (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Treponema pallidum subsp. pertenue
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Soňa Böhmová, učo 232884. Změněno: 30. 4. 2019 09:22.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1482997/cs -
SUCHÁNKOVÁ, Pavla a Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ. Connection of glycoinformatics databases with Pubchem. In ENBIK. 2018. ISBN 978-80-7592-017-1.
Název česky: Propojení glycoinformatických databází s Pubchem
RIV/00216224:14740/18:00108837 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Suchánková, Pavla (203 Česká republika, domácí) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Glycoinformatics; format conversion; PubChem
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2020 16:44.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1421017/cs -
RAČEK, Tomáš, Ondřej SCHINDLER, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ a Jaroslav KOČA. Empirical methods for calculation of partial atomic charges – applicability for proteins? In ENBIK2018. 2018. ISBN 978-80-7592-017-1.URL
angličtina. Česká republika.
Klíčová slova anglicky: EEM, QEq, parameterization, atomic charges, proteins
Změnil: RNDr. Tomáš Raček, Ph.D., učo 324965. Změněno: 2. 10. 2018 11:13.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1421343/cs -
REIGL, Tomáš, Kamila STRÁNSKÁ, Vojtěch BYSTRÝ, Adam KREJČÍ, Andrea GRIONI, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Karla PLEVOVÁ a Nikos DARZENTAS. Encyclopedia of CLL Subsets: An Online Knowledgebase forSubsets of CLL Cases with Stereotyped B Cell Receptors. In 23rd Congress of the European Hematology Association, Stockholm, Sweden in HemaSphere. 2018.
RIV/00216224:14740/18:00106178 Konferenční abstrakt. angličtina.
Reigl, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Stránská, Kamila (203 Česká republika, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Adam (203 Česká republika) -- Grioni, Andrea (380 Itálie, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Plevová, Karla (203 Česká republika, domácí) -- Darzentas, Nikos (300 Řecko, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: CLL; encyclopedia;B cell receptors
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2019 12:45.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1496440/cs -
SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Radka, Ivana HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ, Adam MIDLIK, Jan HUTAŘ, Tarakaramji MOTURU, Veronika NAVRÁTILOVÁ, Jaroslav KOČA a Karel BERKA. Family-wide annotation and schematic 2D visualization of secondary structure elements. In National Bioinformatic Conference ENBIK. 2018.URL
angličtina. Česká republika.
Změnil: Mgr. et Mgr. Adam Midlik, Ph.D., učo 379962. Změněno: 22. 1. 2020 13:12.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1608457/cs -
FADRUS, Pavel, Alena KOPKOVÁ, Marek VEČEŘA, Jiří ŠÁNA, Jan OPPELT, Táňa MACHÁČKOVÁ, Václav VYBÍHAL, Martin SMRČKA a Ondřej SLABÝ. Global microRNA analysis in cerebrospinal fluid in glioblastoma patients. In The 15th Meeting of the Asian Society for Neuro-Oncology (ASNO 2018), Bejing, China,. 2018.
Druh účasti: aktivní účast
Změnila: Olga Pazderková, učo 46958. Změněno: 8. 1. 2019 14:29.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1484247/cs -
NOVÁK, Jan, Táňa MACHÁČKOVÁ, Tereza NOVÁKOVÁ, Dalibor MLEJNEK, Július GODAVA, Petr HUDE, Víta ŽAMPACHOVÁ, Jan OPPELT, Petr NĚMEC, Helena BEDÁŇOVÁ, Ondřej SLABÝ, Julie DOBROVOLNÁ, Jan KREJČÍ a Lenka ŠPINAROVÁ. Hladiny vybraných plazmatických mikroRNA u pacientů po srdeční transplantaci odrážejí probíhající celulární rejekci štěpu - primární výsledky sekvenací. In 46. pracovní konference Komise experimentální kardiologie. 2018. ISSN 1801-6103.URL
Název anglicky: Levels of selected plasmatic microRNAs in patients after heart transplantation reflect acute cellular rejection - primary results of NGS
čeština. Česká republika.
Klíčová slova anglicky: microRNA; heart transplantation; rejection; plasmatic
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: MUDr. Jan Novák, Ph.D., učo 324158. Změněno: 27. 1. 2019 19:53.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1491043/cs -
SMETANA, Jan, Jan OPPELT, Martin ŠTORK, Luděk POUR a Petr KUGLÍK. Chromothripsis 18 in multiple myeloma patient with rapid extramedullary relapse. MOLECULAR CYTOGENETICS. BioMed Central, 2018, roč. 11, JAN, s. nestrankovano, 6 s. ISSN 1755-8166. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13039-018-0357-5.URL
Název anglicky: Chromothripsis 18 in multiple myeloma patient with rapid extramedullary relapse
RIV/00216224:14310/18:00102223 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Smetana, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Štork, Martin (203 Česká republika) -- Pour, Luděk (203 Česká republika) -- Kuglík, Petr (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Multiple myeloma; Chromothripsis; Array-CGH; NGS; Mutation screening
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 19. 3. 2019 13:50.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1405096/cs -
ZWINSOVÁ, Barbora, Jan OPPELT, Petra VÍDEŇSKÁ a Eva BUDINSKÁ. Identifikace mikrobiomu kolorektálního karcinomu z RNAseq dat nádorové tkáně a jeho korelace s klinickými proměnnými a molekulárními podtypy. In Brněnské onkologické dny. 2018. ISSN 0862-495X.
Druh účasti: vyžádaná přednáška
Změnila: Mgr. Barbora Zwinsová, učo 356955. Změněno: 18. 5. 2018 15:30.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1417456/cs -
SEHNAL, David, M DESHPANDE, A ROSE, Lukáš PRAVDA, Adam MIDLIK, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, S MIR, K BERKA, S VELANKAR a Jaroslav KOČA. Interactive 3D Macromolecular Structure Data Mining with MolQL and Litemol Suite. In 62nd Annual Meeting of the Biophysical-Society. 2018. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2017.11.308.URL
angličtina. Spojené státy.
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 1. 7. 2020 13:39.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1668648/cs -
KUZAK, M., J. HARROW, R.C. JIMENEZ, P.A. MARTINEZ, F.E. PSOMOPOULOS, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ a A. VIA. Lesson development for Open Source Software best practices adoption. Online. In 2018 IEEE 14TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON E-SCIENCE (E-SCIENCE 2018). NEW YORK: IEEE, 2018, s. 19-20. ISBN 978-1-5386-9156-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1109/eScience.2018.00011.URL
RIV/00216224:14310/18:00113651 Stať ve sborníku. angličtina. Itálie.
Kuzak, M. (garant) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: training; Open Source; software guidelines; best practices; recommendations; Open Science; Reproducible Research; sustainability; FAIR
Druh sborníku: postkonferenční sborník
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 17. 4. 2020 22:46.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1646559/cs -
BARTAS, Martin, Jiri ČERVEŇ, Jan OPPELT, Matus PETEJA, Petr VÁVRA, Pavel ZONČA, Vaclav PROCHÁZKA, Václav BRÁZDA a Petr PEČINKA. Liver regeneration during the associating liver partition and portal vein ligation for staged hepatectomy procedure in Sus scrofa is positively modulated by stem cells. Oncology Letters. Spandidos Publ., 2018, roč. 15, č. 5, s. 6309-6321. ISSN 1792-1074. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3892/ol.2018.8108.URL
Název anglicky: Liver regeneration during the associating liver partition and portal vein ligation for staged hepatectomy procedure in Sus scrofa is positively modulated by stem cells
RIV/00216224:14740/18:00102616 Článek v odborném periodiku. angličtina. Řecko.
Bartas, Martin (203 Česká republika) -- Červeň, Jiri (203 Česká republika) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, garant, domácí) -- Peteja, Matus (203 Česká republika) -- Vávra, Petr (203 Česká republika) -- Zonča, Pavel (203 Česká republika) -- Procházka, Vaclav (203 Česká republika) -- Brázda, Václav (203 Česká republika) -- Pečinka, Petr (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: liver regeneration; Sus scrofa; associating liver partition and portal vein ligation for staged hepatectomy; stem cells; transcriptome sequencing
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 11:26.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1415103/cs -
KUBEŠOVÁ, Blanka, Šárka PAVLOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ, Jitka KABÁTHOVÁ, Lenka RADOVÁ, Nikola TOM, Boris TICHÝ, Karla PLEVOVÁ, Barbara KANTOROVÁ, Kristýna FIEDOROVÁ, M. SLAVIKOVA, Vojtěch BYSTRÝ, Jarmila KISSOVÁ, B. GISSLINGER, H. GISSLINGER, Miroslav PENKA, Jiří MAYER, R. KRALOVICS, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Michael DOUBEK. Low-burden TP53 mutations in chronic phase of myeloproliferative neoplasms: association with age, hydroxyurea administration, disease type and JAK2 mutational status. Leukemia. London: Nature Publishing Group, 2018, roč. 32, č. 2, s. 450-461. ISSN 0887-6924. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/leu.2017.230.
Název anglicky: Low- burden TP53 mutations in chronic phase of myeloproliferative neoplasms: association with age, hydroxyurea administration, disease type and JAK2 mutational status.
RIV/00216224:14110/18:00101843 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Kubešová, Blanka (203 Česká republika, domácí) -- Pavlová, Šárka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Malčíková, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Kabáthová, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Radová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Tom, Nikola (203 Česká republika, domácí) -- Tichý, Boris (203 Česká republika, domácí) -- Plevová, Karla (203 Česká republika, domácí) -- Kantorová, Barbara (203 Česká republika, domácí) -- Fiedorová, Kristýna (203 Česká republika, domácí) -- Slavikova, M. (203 Česká republika) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Kissová, Jarmila (203 Česká republika, domácí) -- Gisslinger, B. (40 Rakousko) -- Gisslinger, H. (40 Rakousko) -- Penka, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Kralovics, R. (40 Rakousko) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Doubek, Michael (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: TP53 mutations; myeloproliferative neoplasms
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 17:48.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1404544/cs -
OPPELT, Jan, Karolína TRACHTOVÁ a Marek MRÁZ. microRNA – are you real? In ENBIK2018 conference proceedings, Skalský dvůr. 2018.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 29. 12. 2018 16:51.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1481573/cs -
OPPELT, Jan a Marek MRÁZ. microRNA – are you real? In RNA and Disease, Uppsala, Sweden. 2018.
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 29. 12. 2018 16:43.
Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1481572/cs -
OPPELT, Jan, Karolína TRACHTOVÁ a Marek MRÁZ. microRNA – are you real?! In ENBIK2018 - National Bioinformatics Conference. 2018. ISBN 978-80-7592-017-1.Home page of the meeting Conference proceedings
Název česky: microRNA – are you real?!
Název anglicky: microRNA – are you real?!
angličtina. Česká republika.
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: Mgr. Jan Oppelt, Ph.D., učo 323639. Změněno: 16. 8. 2021 06:13.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1786435/cs -
MUSILOVÁ, Kateřina, Ján DEVÁN, Kateřina AMRUZ ČERNÁ, Václav ŠEDA, Gabriela PAVLASOVÁ, Sonali SHARMA, Jan OPPELT, R. PYTLIK, V. PROCHAZKA, Z. PROUZOVA, Martin TRBUŠEK, L. ZLAMALIKOVA, K. LISKOVA, L. KRUZOVA, M. JAROSOVA, Andrea MAREČKOVÁ, C. KORNAUTH, I. SIMONITSCH-KLUPP, A.I. SCHIEFER, O. MERKEL, H. MOCIKOVA, P. BURDA, K.M. POLAKOVA, L. KREN, Jiří MAYER, C.S. ZENT, M. TRNENY, A.G. EVANS, Andrea JANÍKOVÁ a Marek MRÁZ. miR-150 downregulation contributes to the high-grade transformation of follicular lymphoma by upregulating FOXP1 levels. Blood. Washington DC, USA: American Society of Hematology, 2018, roč. 132, č. 22, s. 2389-2400. ISSN 0006-4971. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1182/blood-2018-06-855502.URL
RIV/00216224:14740/18:00105661 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Musilová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Deván, Ján (703 Slovensko, domácí) -- Amruz Černá, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Šeda, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Pavlasová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Sharma, Sonali (356 Indie, domácí) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Pytlik, R. (203 Česká republika) -- Prochazka, V. (203 Česká republika) -- Prouzova, Z. (203 Česká republika) -- Trbušek, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Zlamalikova, L. (203 Česká republika) -- Liskova, K. (203 Česká republika) -- Kruzova, L. (203 Česká republika) -- Jarosova, M. (203 Česká republika) -- Marečková, Andrea (203 Česká republika) -- Kornauth, C. (40 Rakousko) -- Simonitsch-Klupp, I. (40 Rakousko) -- Schiefer, A.I. (40 Rakousko) -- Merkel, O. (40 Rakousko) -- Mocikova, H. (203 Česká republika) -- Burda, P. (203 Česká republika) -- Polakova, K.M. (203 Česká republika) -- Kren, L. (203 Česká republika) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Zent, C.S. (840 Spojené státy) -- Trneny, M. (203 Česká republika) -- Evans, A.G. (840 Spojené státy) -- Janíková, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Mráz, Marek (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: B-CELL LYMPHOMA; TRANSCRIPTION FACTOR; T-CELLS; C-MYC; HISTOLOGIC TRANSFORMATION; COPY-NUMBER; KAPPA-B; EXPRESSION; SURVIVAL; MICRORNAS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 16:23.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1488089/cs -
MOTURU, Tarakaramji, Sravankumar THULA, R.K. SINGH, Tomasz NODZYNSKI, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, J. FRIML a Sibu SIMON. Molecular evolution and diversification of the SMXL gene family. Journal of Experimental Botany. Oxford: OXFORD UNIV PRESS, 2018, roč. 69, č. 9, s. 2367-2378. ISSN 0022-0957. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/jxb/ery097.URL
RIV/00216224:14740/18:00101161 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Moturu, Tarakaramji (356 Indie, domácí) -- Thula, Sravankumar (356 Indie, domácí) -- Singh, R.K. (356 Indie) -- Nodzynski, Tomasz (616 Polsko, domácí) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Friml, J. (40 Rakousko) -- Simon, Sibu (356 Indie, domácí)
Klíčová slova anglicky: D14; DLK2; evolution; KAI2; karrikin; MAX2; SMAX1-like; strigolactone
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 23. 4. 2024 14:52.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1435099/cs -
PRAVDA, Lukáš, David SEHNAL, Dominik TOUŠEK, Veronika NAVRÁTILOVÁ, Václav BAZGIER, Karel BERKA, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Jaroslav KOČA a Michal OTYEPKA. MOLEonline: a web-based tool for analyzing channels, tunnels and pores (2018 update). Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2018, roč. 46, W1, s. "W368"-"W373", 6 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gky309.
RIV/00216224:14740/18:00103406 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Pravda, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Sehnal, David (203 Česká republika, domácí) -- Toušek, Dominik (203 Česká republika, domácí) -- Navrátilová, Veronika (203 Česká republika) -- Bazgier, Václav (203 Česká republika) -- Berka, Karel (203 Česká republika) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, garant, domácí) -- Otyepka, Michal (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: tunnel; pore; aquaporine; protein; MOLE; software
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc., učo 610. Změněno: 24. 4. 2019 16:40.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1427156/cs -
VOREL, Jiří, Marie JANKŮJOVÁ, Jan OPPELT, Filip PARDY, David POTĚŠIL, Pavel ROUDNICKÝ, Jana ILGOVÁ, Lucie JEDLIČKOVÁ, Hana DVOŘÁKOVÁ, Libor MIKEŠ, Milan GELNAR a Martin KAŠNÝ. Monogenea, fish parasites and their unknown molecules. In International Symposium on Flatworm Biology. 2018.
Název anglicky: Monogenea, fish parasites and their unknown molecules
RIV/00216224:14310/18:00101136 Prezentace na konferencích. angličtina. Itálie.
Vorel, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Jankůjová, Marie (203 Česká republika) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika) -- Pardy, Filip (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika) -- Roudnický, Pavel (203 Česká republika) -- Ilgová, Jana (703 Slovensko) -- Mikeš, Libor (203 Česká republika) -- Gelnar, Milan (203 Česká republika) -- Kašný, Martin (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Monogenea; Eudiplozoon; nipponicum; excretory; secretory; genome; transcriptome
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: Mgr. Jiří Vorel, Ph.D., učo 376321. Změněno: 5. 9. 2018 15:43.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1432676/cs -
VOREL, Jiří, Marie JANKŮJOVÁ, Jan OPPELT, Filip PARDY, Pavel ROUDNICKÝ, Jana ILGOVÁ, Libor MIKEŠ, Milan GELNAR a Martin KAŠNÝ. Monogeneans in the pores. In 24th Helminthological Days. 2018. ISBN 978-80-7444-057-1.
RIV/00216224:14310/18:00100930 Prezentace na konferencích. angličtina. Česká republika.
Vorel, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Jankůjová, Marie (203 Česká republika) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika) -- Pardy, Filip (203 Česká republika) -- Roudnický, Pavel (203 Česká republika) -- Ilgová, Jana (703 Slovensko) -- Mikeš, Libor (203 Česká republika) -- Gelnar, Milan (203 Česká republika) -- Kašný, Martin (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Parasites; Monogenea; Sequencing; Genome; Nanopores
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: Mgr. Jiří Vorel, Ph.D., učo 376321. Změněno: 13. 5. 2018 12:09.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1416798/cs -
VOREL, Jiří, Marie JANKŮJOVÁ, Jan OPPELT, David POTĚŠIL, Lucie JEDLIČKOVÁ, Pavel ROUDNICKÝ, Jana ILGOVÁ, Libor MIKEŠ, Zbyněk ZDRÁHAL, Milan GELNAR a Martin KAŠNÝ. Parazitičtí jednorodí (Monogenea) - stále neznámé organismy. In Zoologické dny 2018. 2018. ISBN 978-80-87189-24-5.
Název anglicky: Parasitic monogeneans - still unknown organisms
RIV/00216224:14310/18:00100816 Prezentace na konferencích. čeština. Česká republika.
Vorel, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Jankůjová, Marie (203 Česká republika) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika) -- Jedličková, Lucie (203 Česká republika) -- Roudnický, Pavel (203 Česká republika) -- Ilgová, Jana (703 Slovensko) -- Mikeš, Libor (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika) -- Gelnar, Milan (203 Česká republika) -- Kašný, Martin (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Monogenea; parasites; transcriptomics
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: Mgr. Jiří Vorel, Ph.D., učo 376321. Změněno: 17. 9. 2018 15:06.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1407538/cs -
PITHYA (software)online verzia zdrojovy kod
Název česky: PITHYA
Název anglicky: PITHYA
RIV/00216224:14330/18:00101130 Software. angličtina. Česká republika.
Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Pastva, Samuel (703 Slovensko, domácí) -- Šafránek, David (203 Česká republika, domácí) -- Beneš, Nikola (203 Česká republika, domácí) -- Brim, Luboš (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: Parameter synthesis; Dynamical systems; Model checking; Temporal logic; ODE; Systems biology
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Luboš Brim, CSc., učo 197. Změněno: 16. 1. 2019 18:07.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1432079/cs -
ŠUSTR, Filip, Táňa MACHÁČKOVÁ, Jan OPPELT, Ondřej SLABÝ, Zdeněk STÁREK a Jan NOVÁK. Použití sekvenování nové generace při hledání kandidátních mikroRNA jako biomarkerů rekurence fibrilace síní po katetrové ablaci - pilotní data. In 46. pracovní konference Komise experimentální kardiologie. 2018. ISSN 1801-6103.URL
Název anglicky: Using next generation sequencing in search of candidate microRNAs as markers of reccurence of atrial fibrilation after catheter ablation - pilot results
čeština. Česká republika.
Klíčová slova anglicky: microRNA; atrial fibrilation; catheter ablation; prediction
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: MUDr. Jan Novák, Ph.D., učo 324158. Změněno: 27. 1. 2019 19:53.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1491046/cs -
POPPOVÁ, Lucie, Pavlína JANOVSKÁ, B. GONZALEZ, Karla PLEVOVÁ, Vojtěch BYSTRÝ, Karol PÁL, Hana PLEŠINGEROVÁ, Marek BORSKÝ, Jana KOTAŠKOVÁ, G. DUMBOVIC, J. BIAYNA, JM. MORENO, CM MORALEDA, S. JANSEN, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Šárka PAVLOVÁ, S. ALONSO, Vítězslav BRYJA a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Promoter methylation of ROR1 ligand WNT5A associates with its expression in CLL. In CEITEC PHD and POSTDOC RETREAT 2018, Telč. 2018.
RIV/00216224:14740/18:00106180 Konferenční abstrakt. angličtina.
Poppová, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Janovská, Pavlína (203 Česká republika, domácí) -- Gonzalez, B. (724 Španělsko) -- Plevová, Karla (203 Česká republika, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Pál, Karol (703 Slovensko, domácí) -- Plešingerová, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Borský, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Kotašková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Brychtová, Yvona (203 Česká republika, domácí) -- Doubek, Michael (203 Česká republika, domácí) -- Pavlová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: ROR1; CLL; WNT5A
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2019 12:46.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1496445/cs -
HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ, Ivana, Jan HUTAŘ, Adam MIDLIK, Veronika NAVRÁTILOVÁ, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ a Karel BERKA. Protein family based 2D Diagrams of Secondary Structure Elements. In National Bioinformatic Conference ENBIK. 2018.URL
angličtina. Česká republika.
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: Mgr. et Mgr. Adam Midlik, Ph.D., učo 379962. Změněno: 22. 1. 2020 13:18.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1608476/cs -
STROUHAL, Michal, Jan OPPELT, Lenka MIKALOVÁ, Natasha ARORA, Kay NIESELT, Fernando GONZÁLEZ-CANDELAS a David ŠMAJS. Reanalysis of Chinese Treponema pallidum samples: all Chinese samples cluster with SS14-like group of syphilis-causing treponemes. BMC Research Notes. London: BioMed Central Ltd., 2018, roč. 11, č. 1, s. 1-5. ISSN 1756-0500. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13104-017-3106-7.URL
Název anglicky: Reanalysis of Chinese Treponema pallidum samples: all Chinese samples cluster with SS14-like group of syphilis-causing treponemes
RIV/00216224:14110/18:00100799 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Strouhal, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Mikalová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Arora, Natasha (756 Švýcarsko) -- Nieselt, Kay (276 Německo) -- González-Candelas, Fernando (724 Španělsko) -- Šmajs, David (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Genome sequencing; Phylogenetic analysis; Single nucleotide variant; SyphilisTreponema pallidum
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Soňa Böhmová, učo 232884. Změněno: 25. 5. 2018 16:28.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1405097/cs -
PAVLASOVÁ, Gabriela, Marek BORSKÝ, Veronika ŠANDOVÁ, Jan OPPELT, Kateřina AMRUZ ČERNÁ, Jitka NOVOTNÁ, Václav ŠEDA, Miloslava FOJTOVÁ, Jiří FAJKUS, Yvona BRYCHTOVÁ, Michael DOUBEK, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. Rituximab primarily targets an intra-clonal BCR signaling proficient CLL subpopulation characterized by high CD20 levels. Leukemia. London: Nature Publishing Group, 2018, roč. 32, č. 9, s. 2028-2031. ISSN 0887-6924. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41375-018-0211-0.URL
RIV/00216224:14740/18:00106954 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Pavlasová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Borský, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Šandová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Amruz Černá, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Novotná, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Šeda, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Fojtová, Miloslava (203 Česká republika, domácí) -- Fajkus, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Brychtová, Yvona (203 Česká republika, domácí) -- Doubek, Michael (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Mráz, Marek (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: CHRONIC LYMPHOCYTIC-LEUKEMIA; B-CELLS; EXPRESSION; COMPLEMENT
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 9. 6. 2022 11:31.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1477620/cs -
SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Radka, Adam MIDLIK, Ivana HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ, Jan HUTAŘ, Veronika NAVRÁTILOVÁ, Jaroslav KOČA a Karel BERKA. Secondary Structure Elements-Annotations and Schematic 2D Visualizations Stable for Individual Protein Families. In Biophysical Society 62nd Annual Meeting, San Francisco, California. 2018. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2017.11.307.URL
angličtina. Česká republika.
Mezinárodní význam: ano
Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 1. 7. 2020 12:21.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1455876/cs -
GRILLOVÁ, Linda, Lorenzo GIACANI, Lenka PAŠTĚKOVÁ, Michal STROUHAL, Radim STRNADEL, Christina MARRA, Arturo CENTURION-LARA, Lucy POVEDA, Giancarlo RUSSO, Darina ČEJKOVÁ, Vladimír VAŠKŮ, Jan OPPELT a David ŠMAJS. Sequencing of Treponema pallidum subsp pallidum from isolate UZ1974 using Anti-Treponemal Antibodies Enrichment: First complete whole genome sequence obtained directly from human clinical material. Plos one. San Francisco: Public Library Science, 2018, roč. 13, č. 8, s. 1-14. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0202619.
RIV/00216224:14110/18:00101320 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Grillová, Linda (203 Česká republika, domácí) -- Giacani, Lorenzo (840 Spojené státy) -- Paštěková, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Strouhal, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Strnadel, Radim (203 Česká republika) -- Marra, Christina (840 Spojené státy) -- Centurion-Lara, Arturo (840 Spojené státy) -- Poveda, Lucy (756 Švýcarsko) -- Russo, Giancarlo (756 Švýcarsko) -- Čejková, Darina (203 Česká republika) -- Vašků, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Šmajs, David (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Treponema pallidum
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Soňa Böhmová, učo 232884. Změněno: 21. 3. 2019 12:24.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1461497/cs -
ALOCCI, Davide, Pavla SUCHÁNKOVÁ, Renaud COSTA, Nicolas HORY, Julien MARIETHOZ, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Philip TOUKACH a Frederique LISACEK. SugarSketcher: Quick and Intuitive Online Glycan Drawing. Molecules. Mayer und Muller, 2018, roč. 23, č. 12, s. 3206-3216. ISSN 1420-3049. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/molecules23123206.
RIV/00216224:14740/18:00105326 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
Alocci, Davide (380 Itálie) -- Suchánková, Pavla (203 Česká republika, domácí) -- Costa, Renaud (203 Česká republika) -- Hory, Nicolas (250 Francie) -- Mariethoz, Julien (276 Německo) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Toukach, Philip (756 Švýcarsko) -- Lisacek, Frederique (756 Švýcarsko)
Klíčová slova anglicky: carbohydrate; 2D structure; software; SNFG notation
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: Mgr. Martin Prokop, Ph.D., učo 1474. Změněno: 25. 4. 2019 11:58.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1484322/cs -
ČULEN, Martin, Zdeňka KOSAŘOVÁ, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, A. FOLTA, Jana CHOVANCOVÁ, Tomáš LOJA, Nikola TOM, Vojtěch BYSTRÝ, V. JANECKOVA, Dana DVOŘÁKOVÁ, Jiří MAYER a Zdeněk RÁČIL. The influence of mutational status and biological characteristics of acute myeloid leukemia on xenotransplantation outcomes in NOD SCID gamma mice. Journal of cancer research and clinical oncology. New York: Springer-Verlag, 2018, roč. 144, č. 7, s. 1239-1251. ISSN 0171-5216. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00432-018-2652-2.
RIV/00216224:14110/18:00103216 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Čulen, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Kosařová, Zdeňka (203 Česká republika, domácí) -- Ježíšková, Ivana (203 Česká republika) -- Folta, A. (203 Česká republika) -- Chovancová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Tom, Nikola (203 Česká republika, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Janeckova, V. (203 Česká republika) -- Dvořáková, Dana (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Ráčil, Zdeněk (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: AML; Engraftment; NOD SCID gamma; Mutations; Sequencing
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Soňa Böhmová, učo 232884. Změněno: 2. 5. 2019 13:30.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1423213/cs -
TOM, Nikola, O. TOM, Jitka MALČÍKOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Blanka KUBEŠOVÁ, T. RAUSCH, M. KOLARIK, V. BENES, Vojtěch BYSTRÝ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. ToTem: a tool for variant calling pipeline optimization. BMC Bioinformatics. London: BioMed Central, 2018, roč. 19, JUN, s. 243-251. ISSN 1471-2105. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12859-018-2227-x.URL
RIV/00216224:14740/18:00101855 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Tom, Nikola (203 Česká republika, domácí) -- Tom, O. (203 Česká republika) -- Malčíková, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Pavlová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Kubešová, Blanka (203 Česká republika, domácí) -- Rausch, T. (276 Německo) -- Kolarik, M. (203 Česká republika) -- Benes, V. (276 Německo) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Variant calling; Benchmarking; Next generation sequencing; Parameter optimization
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 17:22.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1443180/cs -
SMART, Oliver S., Vladimír HORSKÝ, Swanand GORE, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Veronika BENDOVÁ, Gerard J. KLEYWEGT a Sameer VELANKAR. Validation information in the Protein Data Bank: What is it and why should you care? In ENBIK 2018. 2018. ISBN 978-80-7592-017-1.
RIV/00216224:14310/18:00103001 Prezentace na konferencích. angličtina. Česká republika.
Smart, Oliver S. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Horský, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Gore, Swanand (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Bendová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Kleywegt, Gerard J. (528 Nizozemské království) -- Velankar, Sameer (826 Velká Británie a Severní Irsko)
Klíčová slova anglicky: PDB; Protein Data Bank; three-dimensional macromolecular structure; validation; validation metrics; density fit; visualization; ligands; ValTrendsDB
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: Mgr. Vladimír Horský, Ph.D., učo 358970. Změněno: 12. 6. 2018 18:56.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1420656/cs -
SMART, Oliver S., Vladimír HORSKÝ, Swanand GORE, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Veronika BENDOVÁ, Gerard J. KLEYWEGT a Sameer VELANKAR. Validation of ligands in macromolecular structures determined by X-ray crystallography. Acta Crystallographica Section D. 2018, roč. 74, č. 3, s. 228-236. ISSN 2059-7983. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1107/S2059798318002541.URL
RIV/00216224:14740/18:00102379 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Smart, Oliver S. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Horský, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Gore, Swanand (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bendová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Kleywegt, Gerard J. (528 Nizozemské království) -- Velankar, Sameer (826 Velká Británie a Severní Irsko)
Klíčová slova anglicky: PDB; Protein Data Bank; three-dimensional macromolecular structure; validation; ligands; ValTrendsDB
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: Mgr. Martin Prokop, Ph.D., učo 1474. Změněno: 25. 4. 2019 11:50.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1410438/cs -
HORSKÝ, Vladimír, Veronika BENDOVÁ, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ a Jaroslav KOČA. ValTrendsDB: Viewing structure quality from macro and micro perspective. In ELIXIR CZ Annual Conference 2018. 2018.
RIV/00216224:14310/18:00104935 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Horský, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bendová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: PDB; Protein Data Bank; Chemical Component Dictionary; three-dimensional macromolecular structure; validation; validation metrics; density fit; visualization; ligands; ValTrendsDB; analysis of trends
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: Mgr. Vladimír Horský, Ph.D., učo 358970. Změněno: 16. 12. 2018 15:56.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1478656/cs -
SMART, Oliver S., Vladimír HORSKÝ, Swanand GORE, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Veronika BENDOVÁ, Gerard J. KLEYWEGT a Sameer VELANKAR. Worldwide Protein Data Bank validation information: usage and trends. Acta Crystallographica Section D. 2018, roč. 74, MAR, s. 237-244. ISSN 2059-7983. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1107/S2059798318003303.URL
RIV/00216224:14740/18:00102378 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Smart, Oliver S. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Horský, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Gore, Swanand (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bendová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Kleywegt, Gerard J. (528 Nizozemské království) -- Velankar, Sameer (826 Velká Británie a Severní Irsko)
Klíčová slova anglicky: PDB; Protein Data Bank; three-dimensional macromolecular structure; validation; quality control; X-ray crystallography; ValTrendsDB
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: Mgr. Martin Prokop, Ph.D., učo 1474. Změněno: 25. 4. 2019 11:52.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1410436/cs -
Analysis of gene expression and protein synthesis related to hypobiosis of Teladorsagia circumcinctaJANKŮJOVÁ, Marie, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Martin DEMKO, Jan OPPELT, Martin KAŠNÝ a Jaroslav VADLEJCH. Analysis of gene expression and protein synthesis related to hypobiosis of Teladorsagia circumcincta. In The 26th International Conference of the World Association for the Advancement of Veterinary Parasitology. 2017.URL
Název anglicky: Analysis of gene expression and protein synthesis related to hypobiosis of Teladorsagia circumcincta
Klíčová slova anglicky: Hypobiosis; Teladorsagia; dauer larva; Caenorhabditis elegans; LC-MS/MS; RNA microarray
Mezinárodní význam: ano
Změnil: Mgr. Jan Oppelt, Ph.D., učo 323639. Změněno: 18. 9. 2017 16:11.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1389962/cs -
BYSTRÝ, Vojtěch, Tomáš REIGL, Adam KREJČÍ, Martin DEMKO, Barbora HANÁKOVÁ, Andrea GRIONI, Henrik KNECHT, Max SCHLITT, Peter DREGER, Leopold SELLNER, Dietrich HERRMANN, Marine PINGEON, Myriam BOUDJOGHRA, Jos RIJNTJES, Christiane POTT, Anton W. LANGERAK, Patricia J. T. A. GROENEN, Frederic DAVI, Monika BRUGGEMANN a Nikos DARZENTAS. ARResT/Interrogate: an interactive immunoprofiler for IG/TR NGS data. Bioinformatics. Oxford: Oxford University Press, 2017, roč. 33, č. 3, s. 435-437. ISSN 1367-4803. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btw634.URL
RIV/00216224:14740/17:00095641 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Reigl, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Hanáková, Barbora (203 Česká republika, domácí) -- Grioni, Andrea (380 Itálie, domácí) -- Knecht, Henrik (276 Německo) -- Schlitt, Max (276 Německo) -- Dreger, Peter (276 Německo) -- Sellner, Leopold (276 Německo) -- Herrmann, Dietrich (276 Německo) -- Pingeon, Marine (250 Francie) -- Boudjoghra, Myriam (250 Francie) -- Rijntjes, Jos (528 Nizozemské království) -- Pott, Christiane (276 Německo) -- Langerak, Anton W. (528 Nizozemské království) -- Groenen, Patricia J. T. A. (528 Nizozemské království) -- Davi, Frederic (250 Francie) -- Bruggemann, Monika (276 Německo) -- Darzentas, Nikos (300 Řecko)
Klíčová slova anglicky: REPERTOIRE
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 28. 2. 2018 10:10.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1381958/cs -
STEJSKALOVA, Karla, Zuzana BAYEROVÁ, Ján FUTAS, Kristýna HRAZDILOVÁ, Marie KLUMPLEROVÁ, Jan OPPELT, Petra SPLICHALOVA, Giovanni Di GUARDO, Sandro MAZZARIOL, Cristina Esmeralda Di FRANCESCO, Gabriella Di FRANCESCO, Giuliana TERRACCIANO, Romulus-Marian PAIU, Teodor Dan URSACHE, David MODRY a Petr HOŘÍN. Candidate gene molecular markers as tools for analyzing genetic susceptibility to Morbillivirus infection in stranded Cetaceans. HLA. 2017, roč. 90, č. 6, s. 343-353. ISSN 2059-2302. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/tan.13146.URL
RIV/00216224:14740/17:00097652 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
Stejskalova, Karla (203 Česká republika) -- Bayerová, Zuzana (203 Česká republika) -- Futas, Ján (703 Slovensko) -- Hrazdilová, Kristýna (203 Česká republika) -- Klumplerová, Marie (203 Česká republika) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, garant, domácí) -- Splichalova, Petra (203 Česká republika) -- Guardo, Giovanni Di (380 Itálie) -- Mazzariol, Sandro (380 Itálie) -- Francesco, Cristina Esmeralda Di (380 Itálie) -- Francesco, Gabriella Di (380 Itálie) -- Terracciano, Giuliana (380 Itálie) -- Paiu, Romulus-Marian (380 Itálie) -- Ursache, Teodor Dan (380 Itálie) -- Modry, David (203 Česká republika) -- Hořín, Petr (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Cetacea; Immunity; innate; Haplotype; MHC-DQB; Phocoena phocoena; Polymorphism; single nucleotide; Stenella coeruleoalba
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 17. 5. 2018 14:05.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1390270/cs -
VOREL, Jiří, Marie JANKŮJOVÁ, Jan OPPELT, Filip PARDY, Pavel ROUDNICKÝ, Jana ILGOVÁ, Hana DVOŘÁKOVÁ, Lucie JEDLIČKOVÁ, Libor MIKEŠ, Dagmar JIRSOVÁ, Božena KOUBKOVÁ, Milan GELNAR a Martin KAŠNÝ. Could nanopore sequencing help us improve genome assembly of Eudiplozoon nipponicum (Polyopisthocotylea, Diplozoidae)? In 6th ECIP meeting - European Centre of Ichtyoparasitology. 2017. ISBN 978-80-210-8799-6.URL
RIV/00216224:14310/17:00095265 Prezentace na konferencích. Zoologie. angličtina. Česká republika.
Vorel, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Jankůjová, Marie (203 Česká republika) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika) -- Pardy, Filip (203 Česká republika) -- Roudnický, Pavel (203 Česká republika) -- Ilgová, Jana (703 Slovensko) -- Dvořáková, Hana (203 Česká republika) -- Jedličková, Lucie (203 Česká republika) -- Mikeš, Libor (203 Česká republika) -- Jirsová, Dagmar (203 Česká republika) -- Koubková, Božena (203 Česká republika) -- Gelnar, Milan (203 Česká republika) -- Kašný, Martin (203 Česká republika, garant)
Klíčová slova anglicky: NGS; nanopore; Monogenea; Eudiplozoon; nipponicum; genome
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: Mgr. Jiří Vorel, Ph.D., učo 376321. Změněno: 13. 12. 2017 14:53.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1399070/cs -
BRIM, Luboš, Jiří BARNAT, David ŠAFRÁNEK, Nikola BENEŠ, Martin DEMKO, Samuel PASTVA a Matej HAJNAL. Detecting Attractors in Biological Models with Uncertain Parameters. In Jérôme Feret and Heinz Koeppl. Computational Methods in Systems Biology. CMSB 2017. LNCS 10545. Cham: Springer International Publishing, 2017, s. 40-56. ISBN 978-3-319-67470-4. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-67471-1_3.
Název anglicky: Detecting Attractors in Biological Models with Uncertain Parameters
RIV/00216224:14330/17:00094899 Stať ve sborníku. Informatika. angličtina. Česká republika.
Brim, Luboš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Barnat, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Šafránek, David (203 Česká republika, domácí) -- Beneš, Nikola (203 Česká republika, domácí) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Pastva, Samuel (703 Slovensko, domácí) -- Hajnal, Matej (703 Slovensko, domácí)
Klíčová slova anglicky: model checking; systems biology; Computational Tree Logic; dynamical systems; distributed algorithms;
Druh sborníku: předkonferenční sborník
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D., učo 3159. Změněno: 13. 5. 2021 13:12.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1387860/cs -
BENEŠ, Nikola, Luboš BRIM, Martin DEMKO, Matej HAJNAL, Samuel PASTVA a David ŠAFRÁNEK. Discrete Bifurcation Analysis with Pithya. In Feret J. et al. 15th International Conference on Computational Methods in Systems Biology (CMSB). LNCS 10545. Cham: Springer, 2017, s. 319-320. ISBN 978-3-319-67470-4.
Název anglicky: Discrete Bifurcation Analysis with Pithya
RIV/00216224:14330/17:00114985 Stať ve sborníku. Informatika. angličtina.
Beneš, Nikola (203 Česká republika, domácí) -- Brim, Luboš (203 Česká republika, domácí) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Hajnal, Matej (703 Slovensko, domácí) -- Pastva, Samuel (703 Slovensko, domácí) -- Šafránek, David (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: bifurcation analysis; model checking; systems biology; terminal strongly connected components; parameter synthesis; parallel algorithms
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 13. 5. 2021 17:30.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1394275/cs -
KIRMZIS, Antonis, Diego MOLINA-SERRANO, Vassia SCHIZA, Christis DEMOSTHENOUS, Jan OPPELT, Wei LIU, Gertrude ZISSE, Helmut BERGLER a Weiwei DANG. Epigenetic Control Of Aging In Response To Caloric Restriction. In 28th International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology (ICYGMB). 2017.URL
Název česky: Epigenetická kontrola strárnutí v reakci na omezení kalorií
Název anglicky: Epigenetic Control Of Aging In Response To Caloric Restriction
Genetika a molekulární biologie. angličtina.
Mezinárodní význam: ano
Změnil: Mgr. Jan Oppelt, Ph.D., učo 323639. Změněno: 7. 9. 2017 08:48.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1388699/cs -
VOREL, Jiří, Pavel ROUDNICKÝ, Jana ILGOVÁ, Hana DVOŘÁKOVÁ, Lucie JEDLIČKOVÁ, Libor MIKEŠ, Petr BROŽ, Dagmar JIRSOVÁ, Roman LEONTOVYČ, Lukáš VETEŠNÍK, Pavel JURAJDA, Marie JANKŮJOVÁ, Jan OPPELT, Božena KOUBKOVÁ, Milan GELNAR a Martin KAŠNÝ. Eudiplozoon nipponicum (Monogenea: Diplozoidae): Comparative study of transcriptome and secretome of fish parasite. In 23rd Helminthological Days. 2017. ISBN 978-80-968473-8-9.Programme & Abstracts
RIV/00216224:14310/17:00094742 Konferenční abstrakt. Zoologie. angličtina. Slovensko.
Vorel, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Roudnický, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Ilgová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Dvořáková, Hana (203 Česká republika) -- Jedličková, Lucie (203 Česká republika) -- Mikeš, Libor (203 Česká republika) -- Brož, Petr (203 Česká republika) -- Jirsová, Dagmar (203 Česká republika) -- Leontovyč, Roman (203 Česká republika) -- Vetešník, Lukáš (203 Česká republika) -- Jurajda, Pavel (203 Česká republika) -- Jankůjová, Marie (203 Česká republika) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika) -- Koubková, Božena (203 Česká republika) -- Gelnar, Milan (203 Česká republika) -- Kašný, Martin (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Sequencing; transcriptomics; helminths; Eudiplozoon nipponicum; Monogenea
Druh účasti: aktivní účast
Změnil: Mgr. Jiří Vorel, Ph.D., učo 376321. Změněno: 26. 5. 2017 18:38.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1380405/cs -
VOREL, Jiří, Pavel ROUDNICKÝ, Jana ILGOVÁ, Hana DVOŘÁKOVÁ, Lucie JEDLIČKOVÁ, Libor MIKEŠ, Petr BROŽ, Dagmar JIRSOVÁ, Roman LEONTOVYČ, Lukáš VETEŠNÍK, Pavel JURAJDA, Marie JANKŮJOVÁ, Jan OPPELT, Božena KOUBKOVÁ, Milan GELNAR a Martin KAŠNÝ. Eudiplozoon nipponicum (Polyopisthocotylea: Diplozoidae): transcriptome and secretome analyses of hematophagous fish parasite. In 8th International Symposium on Monogenea. 2017. ISBN 978-80-210-8666-1.ECIP - European Centre of IchthyoParasitology
RIV/00216224:14310/17:00094901 Konferenční abstrakt. Zoologie. angličtina. Česká republika.
Vorel, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Roudnický, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Ilgová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Dvořáková, Hana (203 Česká republika) -- Jedličková, Lucie (203 Česká republika) -- Mikeš, Libor (203 Česká republika) -- Brož, Petr (203 Česká republika) -- Jirsová, Dagmar (203 Česká republika) -- Leontovyč, Roman (203 Česká republika) -- Vetešník, Lukáš (203 Česká republika) -- Jurajda, Pavel (203 Česká republika) -- Jankůjová, Marie (203 Česká republika) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika) -- Koubková, Božena (203 Česká republika) -- Gelnar, Milan (203 Česká republika) -- Kašný, Martin (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Sequencing; transcriptomics; helminths; Eudiplozoon nipponicum; Monogenea
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnil: Mgr. Jiří Vorel, Ph.D., učo 376321. Změněno: 28. 8. 2017 09:55.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1388127/cs -
SLANÝ, Michal, Jan OPPELT a Lenka ČINČÁROVÁ. Formation of Staphylococcus aureus biofilm in the presence of sub-lethal concentrations of disinfectants: a transcriptomic analysis using RNA-seq. APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY. American Society for Microbiology, 2017, roč. 83, č. 24, s. nestránkováno, 13 s. ISSN 0099-2240. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1128/AEM.01643-17.URL
Název anglicky: Formation of Staphylococcus aureus biofilm in the presence of sub-lethal concentrations of disinfectants: a transcriptomic analysis using RNA-seq
RIV/00216224:14740/17:00098003 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
Slaný, Michal (203 Česká republika) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, garant, domácí) -- Činčárová, Lenka (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: STRESS RESISTANCE; QUALITY-CONTROL; EXPRESSION; BIOCONDUCTOR; PREVALENCE; REGULATORS; STRATEGIES; VIRULENCE; CATALASE; SAMPLES
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 17. 5. 2018 14:09.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1393159/cs -
GLASS (software)PÁL, Karol, Vojtěch BYSTRÝ, Tomáš REIGL, Martin DEMKO, Adam KREJČÍ, T. TOULOUMENIDOU, E. STALIKA, Boris TICHÝ, P. GHIA, K. STAMATOPOULOS, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ a Nikos DARZENTAS. GLASS. 2017.zdrojovy kod
Název česky: GLASS
Název anglicky: GLASS
RIV/00216224:14740/17:00094448 Software. angličtina. Česká republika.
Pál, Karol (703 Slovensko, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Reigl, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Krejčí, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Touloumenidou, T. (300 Řecko) -- Stalika, E. (300 Řecko) -- Tichý, Boris (203 Česká republika) -- Ghia, P. (380 Itálie) -- Stamatopoulos, K. (300 Řecko) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika) -- Malčíková, Jitka (203 Česká republika) -- Darzentas, Nikos (300 Řecko)
Klíčová slova anglicky: Sanger sequencing data; GLASS
Změnil: Mgr. Karol Pál, Ph.D., učo 173390. Změněno: 19. 3. 2018 12:07.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1411787/cs -
PÁL, Karol, Vojtěch BYSTRÝ, Tomáš REIGL, Martin DEMKO, Adam KREJČÍ, T. TOULOUMENIDOU, E. STALIKA, Boris TICHÝ, P. GHIA, K. STAMATOPOULOS, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ a Nikos DARZENTAS. GLASS: assisted and standardized assessment of gene variations from Sanger sequence trace data. Bioinformatics. Oxford: Oxford University Press, 2017, roč. 33, č. 23, s. 3802-3804. ISSN 1367-4803. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btx423.URL
RIV/00216224:14740/17:00094417 Článek v odborném periodiku. Biotechnologie a bionika. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
Pál, Karol (703 Slovensko, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Reigl, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Krejčí, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Touloumenidou, T. (300 Řecko) -- Stalika, E. (300 Řecko) -- Tichý, Boris (203 Česká republika, domácí) -- Ghia, P. (380 Itálie) -- Stamatopoulos, K. (300 Řecko) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Malčíková, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Darzentas, Nikos (300 Řecko, domácí)
Klíčová slova anglicky: Sanger sequencing data; GLASS
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: Mgr. Karol Pál, Ph.D., učo 173390. Změněno: 19. 3. 2018 12:24.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1403133/cs -
PÁL, Karol, Vojtěch BYSTRÝ, Tomáš REIGL, Martin DEMKO, Adam KREJČÍ, Boris TICHÝ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ a Nikos DARZENTAS. GLASS: assisted and standardized assessment of gene variations from Sanger sequence trace data. In CEITEC PHD RETREAT II, Telč. 2017.
Název anglicky: GLASS: assisted and standardized assessment of gene variations from Sanger sequence trace data.
RIV/00216224:14740/17:00097042 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Pál, Karol (703 Slovensko, domácí) -- Bystrý, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Reigl, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Krejčí, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Tichý, Boris (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Malčíková, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Darzentas, Nikos (300 Řecko, domácí)
Klíčová slova anglicky: gene variations; data; GLASS
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 17. 5. 2018 13:59.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1383730/cs -
PÁL, Karol, Vojtěch BYSTRÝ, Tomáš REIGL, Martin DEMKO, Adam KREJČÍ, Boris TICHÝ, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ a Nikos DARZENTAS. GLASS:assisted and standardized assessment of gene variations from Sanger sequence trace data. In Curie-Pasteur-CEITEC joint young scientist retreat. 2017.
Název anglicky: GLASS: assisted and standardized assessment of gene variations from Sanger sequence trace data.
angličtina.
Klíčová slova anglicky: assessment; Sanger sequence
Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 14. 2. 2018 14:24.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1404082/cs -
MIKALOVÁ, Lenka, Michal STROUHAL, Jan OPPELT, Philippe Alain GRANGE, Michel JANIER, Nadjet BENHADDOU, Nicolas DUPIN a David ŠMAJS. Human Treponema pallidum 11q/j isolate belongs to subsp. endemicum but contains two loci with a sequence in TP0548 and TP0488 similar to subsp. pertenue and subsp. pallidum, respectively. PLoS neglected tropical diseases. San Francisco: Public Library of Science, 2017, roč. 11, č. 3, s. 1-14. ISSN 1935-2735. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0005434.URL
Název anglicky: Human Treponema pallidum 11q/j isolate belongs to subsp. endemicum but contains two loci with a sequence in TP0548 and TP0488 similar to subsp. pertenue and subsp. pallidum, respectively
RIV/00216224:14110/17:00094671 Článek v odborném periodiku. Epidemiologie, infek.nemoci a klin. imunologie. angličtina. Spojené státy.
Mikalová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Strouhal, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Grange, Philippe Alain (250 Francie) -- Janier, Michel (250 Francie) -- Benhaddou, Nadjet (250 Francie) -- Dupin, Nicolas (250 Francie) -- Šmajs, David (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: Treponema pallidum
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: Mgr. Vincent Belej, učo 7792. Změněno: 7. 3. 2018 11:48.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1375593/cs -
MicroRNA induced by DNA damage response regulate the expression of FOXP1 and therapy response in CLLČERNÁ, Kateřina, Jan OPPELT, Václav ŠEDA, Kateřina MUSILOVÁ, Gabriela PAVLASOVÁ, Veronika SVOBODOVÁ, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Marek MRÁZ. MicroRNA induced by DNA damage response regulate the expression of FOXP1 and therapy response in CLL. In 2nd International Conference on the Long and the Short of Non-Coding RNAs, Heraklion, Greece. 2017.
Název anglicky: MicroRNA induced by DNA damage response regulate the expression of FOXP1 and therapy response in CLL
RIV/00216224:14740/17:00098567 Konferenční abstrakt. Onkologie a hematologie. angličtina.
Černá, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Šeda, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Musilová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Pavlasová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Svobodová, Veronika (203 Česká republika) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Mráz, Marek (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: FOXP1; DNA; expression
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 17. 5. 2018 14:11.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1397359/cs -
ČERNÁ, Kateřina, Jan OPPELT, Václav ŠEDA, Kateřina MUSILOVÁ, Gabriela PAVLASOVÁ, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Marek MRÁZ. MicroRNA induced by DNA damage response regulates the expression of FOXP1 and therapy response in CLL. In XVII International Workshop on Chronic Lymphocytic Leukemia, USA, New York. 2017.
Název anglicky: MicroRNA induced by DNA damage response regulates the expression of FOXP1 and therapy response in CLL
RIV/00216224:14740/17:00099046 Konferenční abstrakt. Onkologie a hematologie. angličtina.
Černá, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Šeda, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Musilová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Pavlasová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Mráz, Marek (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: CLL; FOXP1; DNA damage
Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 27. 3. 2018 14:04.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1401007/cs -
BENEŠ, Nikola, Luboš BRIM, Martin DEMKO, David ŠAFRÁNEK, Samuel PASTVA a Matej HAJNAL. Model Checking Approach to Discrete Bifurcation Analysis. In Doctoral Workshop on Mathematical and Engineering Methods in Computer Science. 2017.URL
Název anglicky: Model Checking Approach to Discrete Bifurcation Analysis
Informatika. angličtina. Česká republika.
Klíčová slova anglicky: model checking, bifurcation analysis, parameters, phase portrait, temporal logic
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: RNDr. Martin Demko, Ph.D., učo 325073. Změněno: 4. 9. 2018 12:05.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1392805/cs -
BRIM, Luboš, David ŠAFRÁNEK, Nikola BENEŠ, Martin DEMKO, Samuel PASTVA a Matej HAJNAL. Parameter Synthesis of Biological Models by Model Checking: A Case Study. In 4th International Synthetic & Systems Biology Summer School. SSBSS 2017. 2017.URL
Název anglicky: Parameter Synthesis of Biological Models by Model Checking: A Case Study
Informatika. angličtina. Česká republika.
Klíčová slova anglicky: parameter synthesis; model checking; systems biology; dynamical systems; synthetic biology
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Luboš Brim, CSc., učo 197. Změněno: 26. 2. 2018 10:28.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1387861/cs -
BENEŠ, Nikola, Luboš BRIM, Martin DEMKO, Samuel PASTVA a David ŠAFRÁNEK. Pithya: A Parallel Tool for Parameter Synthesis of Piecewise Multi-Affine Dynamical Systems. In Rupak Majumdar and Viktor Kunčak. Computer Aided Verification. CAV 2017. LNCS 10426. Cham: Springer International Publishing, 2017, s. 591-598. ISBN 978-3-319-63386-2. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-63387-9_29.URL
Název anglicky: Pithya: A Parallel Tool for Parameter Synthesis of Piecewise Multi-Affine Dynamical Systems
RIV/00216224:14330/17:00094898 Stať ve sborníku. Informatika. angličtina. Česká republika.
Beneš, Nikola (203 Česká republika, domácí) -- Brim, Luboš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Pastva, Samuel (703 Slovensko, domácí) -- Šafránek, David (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: model checking; satisfiability modulo theories; Computational Tree Logic; dynamical systems; distributed algorithms
Druh sborníku: předkonferenční sborník
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 13. 5. 2020 19:18.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1387857/cs -
BRIM, Luboš, Nikola BENEŠ, David ŠAFRÁNEK, Martin DEMKO, Samuel PASTVA a Matej HAJNAL. PITHYA: High-Performance Parameter Synthesis for Biological Models. In Intelligent Systems for Molecular Biology and European Conference on Computational Biology. ISMB/ECCB 2017. 2017.URL
Název anglicky: PITHYA: High-Performance Parameter Synthesis for Biological Models
Informatika. angličtina. Česká republika.
Klíčová slova anglicky: parameter synthesis; model checking; systems biology; dynamical systems; synthetic biology
Druh účasti: aktivní účast
Mezinárodní význam: ano
Změnil: prof. RNDr. Luboš Brim, CSc., učo 197. Změněno: 26. 2. 2018 10:31.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1387862/cs -
WAYHELOVÁ, Markéta, Jan OPPELT, Jan SMETANA, Filip PARDY, Hana FILKOVÁ, Renata GAILLYOVÁ a Petr KUGLÍK. The clinical impact of targeted „next-generation“ sequencing in molecular diagnostics of intellectual disabilities and multiple congenital abnormalities. In The Biomania Student Scientific Meeting 2017. 2017. ISBN 978-80-210-8737-8.
Název česky: Klinický význam cíleného sekvenování "nové generace" v molekulární diagnostice mentálních retardací a mnohočetných vývojových vad
Název anglicky: The clinical impact of targeted „next-generation“ sequencing in molecular diagnostics of intellectual disabilities and multiple congenital abnormalities
angličtina. Česká republika.
Druh účasti: aktivní účast
Změnila: Mgr. Markéta Wayhelová, Ph.D., učo 357389. Změněno: 28. 1. 2018 15:48.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1404610/cs -
WAYHELOVÁ, Markéta, Jan OPPELT, Denisa VESELÁ, Jan SMETANA, Filip PARDY, Hana FILKOVÁ, Dita MATUCHOVÁ, Jana ŠOUKALOVÁ, Renata GAILLYOVÁ a Petr KUGLÍK. The clinical utility of array-CGH and targeted NGS in idiopathic intellectual disabilities and developmental delays: a case report of SCN2A p.Ala263Val variant. In The European Human Genetics Conference ESHG 2017. 2017. ISSN 1018-4813.
RIV/00216224:14310/17:00114994 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
Wayhelová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Veselá, Denisa (203 Česká republika, domácí) -- Smetana, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Pardy, Filip (203 Česká republika, domácí) -- Filková, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Matuchová, Dita (203 Česká republika, domácí) -- Šoukalová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Gaillyová, Renata (203 Česká republika, domácí) -- Kuglík, Petr (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: neurodevelopmental disorders; NGS; SCN2A
Druh účasti: aktivní účast
Změnila: Mgr. Markéta Wayhelová, Ph.D., učo 357389. Změněno: 13. 5. 2021 18:14.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1407163/cs -
OPPELT, Jan a Marek MRÁZ. The impact of choice of reference gene annotation. In CEITEC PhD Retreat II. 2017. ISBN 978-80-210-8550-3.URL
Název česky: Dopad výběru referenční genové anotace
Název anglicky: The impact of choice of reference gene annotation
Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
Klíčová slova anglicky: RNA-Seq, gene annotation, expression, impact
Změnil: Mgr. Jan Oppelt, Ph.D., učo 323639. Změněno: 24. 7. 2017 18:28.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1385964/cs -
BENEŠ, Nikola, Luboš BRIM, Martin DEMKO, Samuel PASTVA a David ŠAFRÁNEK. A Model Checking Approach to Discrete Bifurcation Analysis. In John S. Fitzgerald et al. Formal Methods. FM 2016. LNCS 9995. Neuveden: Springer International Publishing, 2016, s. 85-101. ISBN 978-3-319-48988-9. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-48989-6_6.
Název anglicky: A Model Checking Approach to Discrete Bifurcation Analysis
RIV/00216224:14330/16:00088309 Stať ve sborníku. Informatika. angličtina. Česká republika.
Beneš, Nikola (203 Česká republika, domácí) -- Brim, Luboš (203 Česká republika, domácí) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Pastva, Samuel (703 Slovensko, domácí) -- Šafránek, David (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: model checking; satisfiability modulo theories; Computational Tree Logic; dynamical systems; distributed algorithms; bifurcation analysis
Druh sborníku: předkonferenční sborník
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 13. 5. 2020 19:12.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1359653/cs -
ŠKORPÍKOVÁ, Lucie, Jana ILGOVÁ, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Martin DEMKO, Jan OPPELT, Milan GELNAR a Martin KAŠNÝ. Deep insight into secretome and transcriptome of Trichinella spiralis and Trichinela pseudospiralis. In EMOP XII – the 12th European Multicolloquium of Parasitology. 2016.URL
Název česky: Detailní pohled na sekretom a transkriptom Trichinella spiralis a Trichinela pseudospiralis
Název anglicky: Deep insight into secretome and transcriptome of Trichinella spiralis and Trichinela pseudospiralis
RIV/00216224:14310/16:00090454 Vyžádané přednášky. Zoologie. angličtina. Česká republika.
Škorpíková, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Ilgová, Jana (703 Slovensko) -- Potěšil, David (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika) -- Demko, Martin (703 Slovensko) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika) -- Gelnar, Milan (203 Česká republika) -- Kašný, Martin (203 Česká republika)
Klíčová slova anglicky: Eudiplozoon; serpin
Mezinárodní význam: ano
Změnil: RNDr. Martin Kašný, Ph.D., učo 11259. Změněno: 24. 3. 2017 22:32.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1350531/cs -
DEMKO, Martin, Nikola BENEŠ, Luboš BRIM, Samuel PASTVA a David ŠAFRÁNEK. High-Performance Symbolic Parameter Synthesis of Biological Models: A Case Study. In Ezio Bartocci et al. Computational Methods in Systems Biology. CMSB 2016. LNBI 9859. Neuveden: Springer International Publishing, 2016, s. 82-97. ISBN 978-3-319-45176-3. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-45177-0_6.
Název anglicky: High-Performance Symbolic Parameter Synthesis of Biological Models: A Case Study
RIV/00216224:14330/16:00088099 Stať ve sborníku. Informatika. angličtina. Česká republika.
Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Beneš, Nikola (203 Česká republika, domácí) -- Brim, Luboš (703 Slovensko, domácí) -- Pastva, Samuel (703 Slovensko, domácí) -- Šafránek, David (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: model checking; systems biology; Computational Tree Logic; dynamical systems; distributed algorithms
Druh sborníku: předkonferenční sborník
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 13. 5. 2020 19:15.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1352261/cs -
BENEŠ, Nikola, Luboš BRIM, Martin DEMKO, Samuel PASTVA a David ŠAFRÁNEK. Parallel SMT-Based Parameter Synthesis with Application to Piecewise Multi-Affine Systems. In Cyrille Artho et al. Automated Technology for Verification and Analysis. ATVA 2016. LNCS 9938. Neuveden: Springer International Publishing, 2016, s. 192-208. ISBN 978-3-319-46519-7. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-46520-3_13.
Název anglicky: Parallel SMT-Based Parameter Synthesis with Application to Piecewise Multi-Affine Systems
RIV/00216224:14330/16:00088098 Stať ve sborníku. Informatika. angličtina. Česká republika.
Beneš, Nikola (203 Česká republika, domácí) -- Brim, Luboš (203 Česká republika, domácí) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Pastva, Samuel (703 Slovensko, domácí) -- Šafránek, David (203 Česká republika, garant, domácí)
Klíčová slova anglicky: model checking; satisfiability modulo theories; Computational Tree Logic; dynamical systems; distributed algorithms
Druh sborníku: předkonferenční sborník
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 13. 5. 2020 19:15.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1352259/cs -
HAJNAL, Matej, David ŠAFRÁNEK, Martin DEMKO, Samuel PASTVA, Pavel KREJČÍ a Luboš BRIM. Toward Modelling and Analysis of Transient and Sustained Behaviour of Signalling Pathways. In Eugenio Cinquemani. Hybrid Systems Biology. HSB 2016. LNBI 9957. Neuveden: Springer International Publishing, 2016, s. 57-66. ISBN 978-3-319-47150-1. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-47151-8_4.
Název anglicky: Toward Modelling and Analysis of Transient and Sustained Behaviour of Signalling Pathways
RIV/00216224:14330/16:00088117 Stať ve sborníku. Informatika. angličtina. Česká republika.
Hajnal, Matej (703 Slovensko, domácí) -- Šafránek, David (203 Česká republika, garant, domácí) -- Demko, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Pastva, Samuel (703 Slovensko, domácí) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Brim, Luboš (203 Česká republika, domácí)
Klíčová slova anglicky: signalling pathways; systems biology; parameter synthesis; dynamical systems; parameter estimation
Druh sborníku: předkonferenční sborník
Mezinárodní význam: ano
Recenzováno: ano
Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 13. 5. 2020 19:15.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/1353254/cs
2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
2016
Zobrazeno: 1. 1. 2025 07:13