Filtrování publikací

    2024

    1. LUO, Yu, Martina LENARČIČ ŽIVKOVIC, Jiawei WANG, Jan RYNEŠ, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, Daniela VERGA a Jean-Louis MERGNY. A sodium/potassium switch for G4-prone G/C-rich sequences. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2024, roč. 52, č. 1, s. 448-461. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkad1073.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Lenarčič Živkovic, Martina (705 Slovinsko, domácí) -- Ryneš, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Mergny, Jean-Louis (garant)
      Klíčová slova anglicky: G-QUADRUPLEX; BASE-PAIR; DNA; STABILITY; metal ions; G/C rich motifs; NMR; PROMOTER
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Jana Kuchtová, učo 241368. Změněno: 15. 10. 2024 15:09.
    2. VÍŠKOVÁ, Pavlína, Eva IŠTVÁNKOVÁ, Jan RYNEŠ, Šimon DŽATKO, Tomáš LOJA, Martina LENARČIČ ŽIVKOVIC, Riccardo RIGO, Roberto EL-KHOURY, Israel SERRANO-CHACON, Masad J DAMHA, Carlos GONZALEZ, Jean-Louis MERGNY, Silvie TRANTÍRKOVÁ a Lukáš TRANTÍREK. In-cell NMR suggests that DNA i-motif levels are strongly depleted in living human cells. Nature Communications. Berlin: Nature, 2024, roč. 15, č. 1, 12 s. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-024-46221-y.
      URL
      angličtina. Německo.
      Klíčová slova anglicky: CYTOSINE-RICH STRAND; G-QUADRUPLEX; HNRNP LL; MOLECULAR SWITCH; GENE-EXPRESSION; LOOP LENGTH; STABILITY; SEQUENCES; DOMAINS; PROTEIN
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 19. 9. 2024 12:43.
    3. PIPIER, Angélique, Titouan CHETOT, Apollonia KALAMATIANOU, Nicolas MARTIN, Maëlle CAROFF, Sébastien BRITTON, Nicolas CHÉRON, Lukáš TRANTÍREK, Anton GRANZHAN a David MONCHAUD. Structural Optimization of Azacryptands for Targeting Three-Way DNA Junctions. ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION. WEINHEIM: WILEY-V C H VERLAG GMBH, 2024. ISSN 1433-7851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/anie.202409780.
      URL

      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 11. 9. 2024 11:56.

    2023

    1. DZUROV, Matej, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Michaela KRAFČÍKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, Lucy VOJTOVÁ a Jan RYNEŠ. A thermosensitive gel matrix for bioreactor-assisted in-cell NMR of nucleic acids and proteins. Journal of biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2023, roč. 77, 5-6, s. 203-215. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-023-00422-7.
      URL
      RIV/00216224:14740/23:00132257 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Dzurov, Matej (703 Slovensko) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Krafčíková, Michaela (703 Slovensko, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Vojtová, Lucy (203 Česká republika) -- Ryneš, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: PLA-PEG-PLA; Thermosensitive hydrogel; Cell immobilization; Bioreactor; In-cell NMR
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Adéla Pešková, učo 143895. Změněno: 2. 11. 2024 16:14.
    2. BUŠA, Daniel, Martin ČULEN, Tomáš LOJA, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, Alois FOLTA a Jiří MAYER. Acute myeloid leukemia suppression by palbociclib and ponatinib in patient-derived xenograft. In 23. Pražské hematologické dny, Praha. 2023.
      Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 1. 2. 2023 10:12.
    3. ČULEN, Martin, Tomáš LOJA, Daniel BUŠA, Zdeňka HERUDKOVÁ, Jan HÝL, Jakub VLAŽNÝ, K. LIŠKOVÁ, Martin REPKO, Lucy VOJTOVÁ a Jiří MAYER. Biomaterial selection does not affect AML engraftment in humanized ossicles. In 12th International Conference Analytical Cytometry, Praha. 2023.
      Název anglicky: Biomaterial selection does not affect AML engraftment in humanized ossicles - conference abstract.
      RIV/00216224:14110/23:00131652 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Čulen, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Buša, Daniel (703 Slovensko, domácí) -- Herudková, Zdeňka (203 Česká republika, domácí) -- Hýl, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Vlažný, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Lišková, K. (203 Česká republika) -- Repko, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Vojtová, Lucy (203 Česká republika) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: AML; humanized ossicles

      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 13. 3. 2024 09:42.
    4. ČESKÁ, Katarína, Jan PAPEŽ, Hana OŠLEJŠKOVÁ, Ondřej SLABÝ, Lenka RADOVÁ, Tomáš LOJA, Zuzana LIBÁ, Anna SVĚRÁKOVÁ, Milan BRÁZDIL a Štefánia AULICKÁ. CCL2/MCP-1, interleukin-8, and fractalkine/CXC3CL1: Potential biomarkers of epileptogenesis and pharmacoresistance in childhood epilepsy. EUROPEAN JOURNAL OF PAEDIATRIC NEUROLOGY. OXON: ELSEVIER, 2023, roč. 46, September 2023, s. 48-54. ISSN 1090-3798. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.ejpn.2023.06.001.
      URL
      Název anglicky: CCL2/MCP-1, interleukin-8, and fractalkine/CXC3CL1: Potential biomarkers of epileptogenesis and pharmacoresistance in childhood epilepsy
      RIV/00216224:14110/23:00131281 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Česká, Katarína (703 Slovensko, domácí) -- Papež, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Ošlejšková, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Slabý, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Radová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Libá, Zuzana (203 Česká republika) -- Svěráková, Anna (203 Česká republika) -- Brázdil, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Aulická, Štefánia (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Chemokine; Cytokine; Epileptogenesis; Interleukin; Pharmacodependent; Pharmacoresistant.
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 8. 2. 2024 07:24.
    5. HOFERKOVÁ, Eva, Soňa KADÁKOVÁ, Václav ŠEDA, Jan VERNER, Miroslav BOUDNÝ, Gabriela MLADONICKÁ PAVLASOVÁ, Tomáš LOJA, Daniel FILIP, Josef VEČEŘA, Květoslava MATULOVÁ, Hana SKUHROVÁ FRANCOVÁ, Sonali SHARMA, Laura ONDRIŠOVÁ, Veronika PALUŠOVÁ, Lucy VOJTOVÁ, Leoš KŘEN, Michael DOUBEK a Marek MRÁZ. Coculture model with CD40L, IL4 and IL21 for study chronic lymphocytic leukemia proliferation. In CEITEC PhD Conference 2023, Brno. 2023.
      URL
      RIV/00216224:14740/23:00132976 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Hoferková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Kadáková, Soňa (703 Slovensko, domácí) -- Šeda, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Verner, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Boudný, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Mladonická Pavlasová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Filip, Daniel (703 Slovensko, domácí) -- Večeřa, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Matulová, Květoslava (203 Česká republika) -- Skuhrová Francová, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Sharma, Sonali (356 Indie, domácí) -- Ondrišová, Laura (703 Slovensko, domácí) -- Palušová, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Vojtová, Lucy (203 Česká republika) -- Křen, Leoš (203 Česká republika) -- Doubek, Michael (203 Česká republika, domácí) -- Mráz, Marek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Chronic lymphocytic leukemia; CD40L; IL4; IL21; inhibitors; proliferation
      Druh účasti: aktivní účast
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 30. 3. 2024 13:05.
    6. KADEŘÁVEK, Pavel, Vojtěch ZAPLETAL, Nicola SALVI, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Milan ZACHRDLA, Petr PADRTA, Subhash NARASIMHAN, Thorsten MARQUARDSEN, Jean-Max TYBURN, Lukáš ŽÍDEK, Martin BLACKLEDGE a Fabien FERRAGE. Detailed insight into dynamics of C-terminal domain of δ subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis using high-resolution relaxometry. In IDP Community F2F/hybrid meeting. 2023.
      URL
      angličtina. Slovensko.
      Klíčová slova anglicky: NMR; protein dynamics
      Druh účasti: vyžádaná přednáška
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 23. 3. 2024 16:28.
    7. ZAPLETAL, Vojtěch, Nicola SALVI, Andrea FLAMM, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Dennis KURZBACH, Mateos BORJA, Milan ZACHRDLA, Petr PADRTA, Subhash NARASIMHAN, Thorsten MARQUARDSEN, Jean-Max TYBURN, Jozef HRITZ, Robert KONRAT, Lukáš ŽÍDEK, Martin BLACKLEDGE, Fabien FERRAGE a Pavel KADEŘÁVEK. Detailed insight into dynamics of intrinsically disordered proteins using high-resolution relaxometry. 2023.
      URL
      angličtina. Slovensko.
      Klíčová slova anglicky: NMR; protein dynamics
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 23. 3. 2024 16:33.
    8. ŠKOLÁKOVÁ, Petra, Martin GAJARSKÝ, Jan PALACKÝ, Denis ŠUBERT, Daniel RENČIUK, Lukáš TRANTÍREK, Jean-Louis MERGNY a Michaela VORLICKOVA. DNA i-motif formation at neutral pH is driven by kinetic partitioning. Nucleic Acids Research. Oxford University Press, 2023, roč. 51, č. 6, s. 2950-2962. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkad119.
      URL
      RIV/00216224:14740/23:00131413 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Školáková, Petra (203 Česká republika) -- Gajarský, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Šubert, Denis (703 Slovensko, domácí) -- Renčiuk, Daniel (203 Česká republika) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Vorlickova, Michaela (garant)
      Klíčová slova anglicky: in-cell NMR; i-motif; DNA; kinetic partitioning
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 6. 8. 2024 11:53.
    9. TUŽINČIN, Dávid, Petr PADRTA, Hana ŠANDEROVÁ, Alžběta RABATINOVÁ, Kateřina BENDOVÁ, Libor KRÁSNÝ, Lukáš ŽÍDEK a Pavel KADEŘÁVEK. Domain 1.1 of σA factor of RNA polymerase from Bacillus subtilis beyond its major state conformation. In Inaugural Biochemistry Symposium Puzzles of (Bio)molecular Structure and Dynamics: NMR spectroscopy and complementary approaches. 2023.
      URL
      RIV/00216224:14310/23:00130951 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Tužinčin, Dávid (703 Slovensko, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Rabatinová, Alžběta (203 Česká republika) -- Bendová, Kateřina (203 Česká republika) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: σA factor; RNA polymerase; Bacillus subtilis; NMR; conformational exchange
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: Mgr. Dávid Tužinčin, učo 460988. Změněno: 13. 6. 2023 13:42.
    10. KONEČNÁ, Kateřina, Lukáš TICHÝ, Tomáš LOJA, Tereza PŘEROVSKÁ a Lenka FAJKUSOVÁ. Functional analysis of LDLR variants using flow cytometry. In ASHG Annual Meeting 2023. 2023.
      Změnila: Mgr. Kateřina Konečná, učo 436857. Změněno: 27. 2. 2024 16:37.
    11. KONEČNÁ, Kateřina, Lukáš TICHÝ, Tomáš LOJA, Tereza PŘEROVSKÁ a Lenka FAJKUSOVÁ. Functional analysis of LDLR variants using flow cytometry and western blot. In XXII. setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2023.
      Změnila: Mgr. Kateřina Konečná, učo 436857. Změněno: 27. 2. 2024 16:38.
    12. DOSTÁLOVÁ, Lenka, Aneta LEDEREROVÁ, Helena PESCHELOVÁ, Tomáš LOJA a Michal ŠMÍDA. Genome-wide CRISPR/Cas9 knockout screening revealed genes involved in CD20 regulation. In CRISPR as a research tool in cancer and regenerative medicine, Stockholm, Švédsko. 2023.
      URL
      RIV/00216224:14740/23:00132784 Konferenční abstrakt. angličtina. Švédsko.
      Dostálová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Ledererová, Aneta (203 Česká republika, domácí) -- Peschelová, Helena (203 Česká republika, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Šmída, Michal (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CD20 antigen; mAb therapy; rituximab
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 2. 4. 2024 10:11.
    13. DOSTÁLOVÁ, Lenka, Aneta LEDEREROVÁ, Helena PESCHELOVÁ, Tomáš LOJA a Michal ŠMÍDA. Genome-wide CRISPR/Cas9 knockout screening revealed genes involved in CD20 regulation in rituximab-resistant cells. In PhD and PostDoc RETREAT, Sněžné, Milovy. 2023.
      URL
      RIV/00216224:14740/23:00132850 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Dostálová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Ledererová, Aneta (203 Česká republika, domácí) -- Peschelová, Helena (203 Česká republika, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Šmída, Michal (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CD20 antigen; therapy of B-cell malignancies; antiCD20 mAb; CRISPR/Cas9 knockout screening;
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 2. 4. 2024 10:14.
    14. TUŽINČIN, Dávid, Petr PADRTA, Hana ŠANDEROVÁ, Alžběta RABATINOVÁ, Libor KRÁSNÝ, Lukáš ŽÍDEK a Pavel KADEŘÁVEK. Characterisation of invisible conformation of domain 1.1 of σA factor of RNA polymerase from Bacillus subtilis. In 19th European Magnetic Resonance Congress, EUROMAR 2023. 2023.
      URL
      RIV/00216224:14310/23:00131478 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Tužinčin, Dávid (703 Slovensko, garant, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Rabatinová, Alžběta (203 Česká republika) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: σA factor; RNA polymerase; Bacillus subtilis; NMR; conformational exchange
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Dávid Tužinčin, učo 460988. Změněno: 22. 8. 2023 20:45.
    15. NAVRÁTILOVÁ, Polina, Jan EMMER, Tomáš LOJA a Monika PÁVKOVÁ GOLDBERGOVÁ. Characterisation of Macrophage Response to Nickel Nanoparticles and Ions Released from Biomaterials. In MATEDAS 2023, 17th INTERNATIONAL CONFERENCE ON MATERIALS AND TECHNOLOGIES FOR DEFENSE AND SECURITY. 2023.
      RIV/00216224:14110/23:00134636 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Navrátilová, Polina (643 Rusko, domácí) -- Emmer, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Pávková Goldbergová, Monika (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nickel Nanoparticles; Ions; Biomaterials; Macrophage Response

      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 23. 4. 2024 10:32.
    16. TUŽINČIN, Dávid, Petr PADRTA, Hana ŠANDEROVÁ, Alžbeta RABATINOVÁ, Kateřina BENDOVÁ, Libor KRÁSNÝ, Lukáš ŽÍDEK a Pavel KADEŘÁVEK. Characterization of a transitionally occupied state and thermal unfolding of domain 1.1 of σ A factor of RNA polymerase from Bacillus subtilis. Proteins: Structure, Function and Bioinformatics. Wiley, 2023, roč. 91, č. 9, s. 1276-1287. ISSN 0887-3585. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/prot.26531.
      URL
      RIV/00216224:14740/23:00131160 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Tužinčin, Dávid (703 Slovensko, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Bendová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: σA factor; Bacillus subtilis; NMR; RNA polymerase; conformational exchange.
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 27. 10. 2024 15:25.
    17. DOSTÁLOVÁ, Lenka, Aneta LEDEREROVÁ, Helena PESCHELOVÁ, Tomáš LOJA a Michal ŠMÍDA. Identification of novel targets that upregulate CD20 expression in rituximab-resistant cells with the use of genomewide CRISPR screening. In XX. International Workshop on CLL (iwCLL 2023), Boston, USA. 2023.
      URL
      RIV/00216224:14740/23:00132772 Konferenční abstrakt. angličtina. Spojené státy.
      Dostálová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Ledererová, Aneta (203 Česká republika, domácí) -- Peschelová, Helena (203 Česká republika, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Šmída, Michal (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CD20 antigen; rituximab; therapy of B-cell malignancies; CRISPR/Cas9 knockout screening
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 26. 3. 2024 14:08.
    18. BUŠA, Daniel, Martin ČULEN, Tomáš LOJA, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, Adam FOLTA a Jiří MAYER. Inhibition of acute myeloid leukemia using palbociclib and ponatinib in a patient-derived xenograft model. In Actual Problems of Medical Prevention, Baku, Azerbajdžán. 2023.
      Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 12. 1. 2024 14:52.
    19. CÍGLER, Petr, Lukáš BÁLEK, Jan HAVLÍK, Pavel KREJČÍ, Lukáš TRANTÍREK a Silvie TRANTÍRKOVÁ. Nanodiamonds as artificial proteins for regulation of a cell signalling system. 2023. Patent. Číslo: US11744855B2. Vydavatel: United States Patent and Trademark Office. Místo vydání: Alexandria, Virginia, USA. Název vlastníka: Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v.v.i.; Masarykova univerzita; Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně;. Datum registrace: 26. 3. 2019. Datum přijetí: 5. 9. 2023.
      Link na PDF dokument na stránkách Google Patents
      Název anglicky: Nanodiamonds as artificial proteins for regulation of a cell signalling system
      RIV/00216224:14740/23:00133169 Patent. angličtina. Spojené státy.
      Bálek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: nanosized diamond crystals;nanodiamonds;fibroblast grow factors;extracellular signalling molecules;serum proteins

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 3. 4. 2024 15:16.
    20. CÍGLER, Petr, Lukáš BÁLEK, Jan HAVLÍK, Pavel KREJČÍ, Lukáš TRANTÍREK a Silvie TRANTÍRKOVÁ. Nanodiamonds as artificial proteins for regulation of a cell signalling system. 2023. Patent. Číslo: EP3645018B1. Vydavatel: European Patent Office. Místo vydání: Mnichov. Název vlastníka: Ústav organické chemie a biochemie AV ČR; Masarykova univerzita; Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně;. Datum registrace: 26. 3. 2019. Datum přijetí: 19. 7. 2023.
      Odkaz na databázi Evropského patentového úřadu
      Název anglicky: Nanodiamonds as artificial proteins for regulation of a cell signalling system
      RIV/00216224:14740/23:00131427 Patent. angličtina. Německo.
      Cígler, Petr (203 Česká republika) -- Bálek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Havlík, Jan (203 Česká republika) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: nanosized diamond crystals;nanodiamonds;fibroblast grow factors;extracellular signalling molecules;serum proteins

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 3. 4. 2024 15:15.
    21. PAPAGEORGIOU, Anna, Michaela POSPÍŠILOVÁ, Jakub CIBULKA, Raghib ASHRAF, Christopher WAUDBY, Pavel KADEŘÁVEK, Volha MAROZ, Karel KUBÍČEK, Zbyněk PROKOP, Lumír KREJČÍ a Konstantinos TRIPSIANES. Recognition and coacervation of G-quadruplexes by a multifunctional disordered region in RECQ4 helicase. Nature Communications. Berlin: Nature, 2023, roč. 14, č. 1, s. 1-19. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-42503-z.
      URL
      RIV/00216224:14740/23:00134740 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Papageorgiou, Anna (300 Řecko, domácí) -- Pospíšilová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Cibulka, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Ashraf, Raghib (356 Indie, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Maroz, Volha (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Lumír (203 Česká republika, domácí) -- Tripsianes, Konstantinos (300 Řecko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Biomolecular polyelectrolyte complexes; DNA helicase Q4; G-quadruplexes; intrinsically disordered regions; RPA protein
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 27. 10. 2024 15:27.
    22. ROŠKOVÁ, Ivana, Marek VEČEŘA, Lenka RADOVÁ, Karolína TRACHTOVÁ, František SIEGL, Markéta HERMANOVÁ, Michal HENDRYCH, Leoš KŘEN, Václav VYBÍHAL, Hana VALEKOVÁ, Petra KASPAROVA, Ivana KOLOUŠKOVÁ, Tomáš KAZDA, Ondřej SLABÝ, Radim JANČÁLEK, Jiří ŠÁNA a Martin SMRČKA. Small RNA Sequencing Identifies a Six-MicroRNA Signature Enabling Classification of Brain Metastases According to their Origin. CANCER GENOMICS & PROTEOMICS. ATHENS: INT INST ANTICANCER RESEARCH, 2023, roč. 20, č. 1, s. 18-29. ISSN 1109-6535. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.21873/cgp.20361.
      URL
      RIV/00216224:14740/23:00131080 Článek v odborném periodiku. angličtina. Řecko.
      Rošková, Ivana (703 Slovensko, domácí) -- Večeřa, Marek (703 Slovensko, domácí) -- Radová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Trachtová, Karolína (203 Česká republika, domácí) -- Siegl, František (203 Česká republika, domácí) -- Hermanová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Hendrych, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Křen, Leoš (203 Česká republika) -- Vybíhal, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Valeková, Hana (703 Slovensko, domácí) -- Kasparova, Petra (203 Česká republika) -- Koloušková, Ivana (203 Česká republika, domácí) -- Kazda, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Slabý, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Jančálek, Radim (203 Česká republika, domácí) -- Šána, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Smrčka, Martin (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Brain metastases; microRNA; small RNA sequencing; classifier; diagnosis
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 15. 10. 2024 15:09.
    23. HENDRYCH, Michal, Peter SOLÁR, Markéta HERMANOVÁ, Ondřej SLABÝ, Hana VALEKOVÁ, Marek VEČEŘA, Alena KOPKOVÁ, Zdeněk MACKERLE, Tomáš KAZDA, Petr POSPÍŠIL, Radek LAKOMÝ, Jan CHRASTINA, Jiří ŠÁNA a Radim JANČÁLEK. Spinal Metastasis in a Patient with Supratentorial Glioblastoma with Primitive Neuronal Component: A Case Report with Clinical and Molecular Evaluation. Diagnostics. Basel: MDPI, 2023, roč. 13, č. 2, s. 1-14. ISSN 2075-4418. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/diagnostics13020181.
      URL
      RIV/00216224:14110/23:00130182 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Hendrych, Michal (203 Česká republika, garant, domácí) -- Solár, Peter (703 Slovensko, domácí) -- Hermanová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Slabý, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Valeková, Hana (703 Slovensko, domácí) -- Večeřa, Marek (703 Slovensko, domácí) -- Kopková, Alena (203 Česká republika, domácí) -- Mackerle, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Kazda, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšil, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Lakomý, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Chrastina, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Šána, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Jančálek, Radim (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: glioblastoma; metastasis; NF1; NOTCH3; ARID1A; mutation
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 29. 10. 2024 12:15.
    24. TUŽINČIN, Dávid, Nicola SALVI, Vojtěch ZAPLETAL, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Milan ZACHRDLA, Petr PADRTA, Subhash NARASIMHAN, Thorsten MARQUARDSEN, Jean-Max TYBURN, Hana ŠANDEROVÁ, Alžběta RABATINOVÁ, Kateřina BENDOVÁ, Libor KRÁSNÝ, Lukáš ŽÍDEK, Martin BLACKLEDGE, Fabien FERRAGE a Pavel KADEŘÁVEK. Study of the Dynamics of Flexible Subunits of RNA Polymerase from Bacillus subtilis. 2023.
      URL
      angličtina. Slovensko.
      Klíčová slova anglicky: NMR; protein dynamics
      Druh účasti: vyžádaná přednáška
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 25. 3. 2024 08:55.
    25. MIKULOVÁ, Antónia, Pavlína JANOVSKÁ, Jan VERNER, Hana PLEŠINGEROVÁ, Olga VONDÁLOVÁ BLANÁŘOVÁ, Pavlína KEBKOVÁ, Kateřina SOTOLÁŘOVÁ, Jana BARTOŠÍKOVÁ, M. CHORVÁTOVÁ, Terézia KURUCOVÁ, Tomáš LOJA, Boris TICHÝ, Lukáš KUBALA a Vítězslav BRYJA. The role of casein kinase 1 inhibition in treatment of chronic lymphocytic leukemia. In 12th International Conference Analytical Cytometry, Praha. 2023.
      RIV/00216224:14310/23:00131651 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Mikulová, Antónia (703 Slovensko, domácí) -- Janovská, Pavlína (203 Česká republika, domácí) -- Verner, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Plešingerová, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Vondálová Blanářová, Olga (203 Česká republika, domácí) -- Kebková, Pavlína (203 Česká republika, domácí) -- Sotolářová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Bartošíková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Chorvátová, M. (703 Slovensko) -- Kurucová, Terézia (703 Slovensko, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Tichý, Boris (203 Česká republika, domácí) -- Kubala, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: casein kinase 1 inhibition; chronic lymphocytic leukemia

      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 5. 4. 2024 09:52.
    26. AL TUKMACHI, Dagmar, Michaela RUČKOVÁ, Marek VEČEŘA, Táňa MACHÁČKOVÁ, Petra POKORNÁ, Markéta HERMANOVÁ, Michal HENDRYCH, Leoš KŘEN, Ivana ROŠKOVÁ, Václav VYBÍHAL, Hana VALEKOVÁ, Radim JANČÁLEK, Jiří ŠÁNA, Martin SMRČKA a Ondřej SLABÝ. Tumor tissue and cerebrospinal fluid microRNA profiles enable the classification of brain metastasis accordingly to their origin. In AACR Annual Meeting 2023; April 14-19, 2023; Orlando, FL. 2023. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1158/1538-7445.AM2023-3758.
      URL
      RIV: Konferenční abstrakt. angličtina. Spojené státy.
      Al Tukmachi, Dagmar (203 Česká republika, domácí) -- Ručková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Večeřa, Marek (703 Slovensko, domácí) -- Macháčková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Pokorná, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Hermanová, Markéta (203 Česká republika) -- Hendrych, Michal (203 Česká republika) -- Křen, Leoš (203 Česká republika) -- Rošková, Ivana (703 Slovensko) -- Vybíhal, Václav (203 Česká republika) -- Valeková, Hana (703 Slovensko) -- Jančálek, Radim (203 Česká republika) -- Šána, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Smrčka, Martin (203 Česká republika) -- Slabý, Ondřej (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: tumor tissue; cerebrospinal fluid
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 6. 8. 2024 12:49.

    2022

    1. KELAR TUČEKOVÁ, Zlata, Michal PAZDERKA, Lukáš VACEK, Filip RŮŽIČKA, Mirko ČERNÁK, Jakub KELAR, Jaromír HAŠANA, Dušan KOVÁČIK, Eliška KOSTRŮNKOVÁ a Lenka SMÍLKOVÁ. Bio-dekontaminačná komora na báze plazmou aktivovaného dekontaminačného média. 2022.
      Název česky: Bio-dekontaminační komora na bázi plazmatem aktivovaného dekontaminačního média
      Název anglicky: Bio-decontamination chamber using plasma-activated decontamination media
      RIV/00216224:14310/22:00129528 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). čeština. Česká republika.
      Kelar Tučeková, Zlata (703 Slovensko, garant, domácí) -- Pazderka, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Vacek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Růžička, Filip (203 Česká republika, domácí) -- Černák, Mirko (703 Slovensko, domácí) -- Kelar, Jakub (203 Česká republika) -- Hašana, Jaromír (203 Česká republika) -- Kováčik, Dušan (703 Slovensko) -- Kostrůnková, Eliška (203 Česká republika) -- Smílková, Lenka (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: decontamination; plasma-activated media; atmospheric pressure; dielectric barrier discharges

      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 20. 12. 2022 08:45.
    2. ZLÍNSKÁ, Vladimíra, Vaclav MATOUSEK, Lukáš TRANTÍREK a Riccardo RIGO. Fluorine Labeling as a Versatile Tool for Probing Nucleic Acid Folding and Interactions by NMR Spectroscopy. ALDRICHIMICA ACTA. UNITED STATES: ALDRICH CHEMICAL CO INC, 2022, roč. 55, č. 2, s. 45-52. ISSN 0002-5100.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00128812 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Zlínská, Vladimíra (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Rigo, Riccardo (380 Itálie, domácí)
      Klíčová slova anglicky: F-19 NMR spectroscopy; F-19 probes; DNA; RNA; F-19-labeling approaches; nucleic acid folding; nucleic acid/small molecule interactions; nucleic acid/protein interactions; in vitro; in vivo
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 8. 3. 2023 09:36.
    3. ŠEDA, Václav, Eva VOJÁČKOVÁ, Laura ONDRIŠOVÁ, Lenka KOŠŤÁLOVÁ, Tomáš LOJA, Jan VERNER, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Anna PANOVSKÁ, S. ZHANG, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. GAB1 as novel therapeutic target in B lymphoid and myeloid malignancies. In XXXIV. Olomoucké hematologické dny in Transfuze a hematologie dnes. 2022.
      Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 15. 12. 2022 10:04.
    4. KELAR TUČEKOVÁ, Zlata, Lukáš VACEK, Michal PAZDERKA, Eliška KOSTRŮNKOVÁ, Lenka SMÍLKOVÁ, Jakub KELAR, Jaromír HAŠANA, Filip RŮŽIČKA a Mirko ČERNÁK. Optimization of plasma-activated media generation for decontamination of thermally sensitive materials. In 9th Central European Symposium on Plasma Chemistry (CESPC-9) joint with COST Action CA19110 Plasma Applications for Smart and Sustainable Agriculture (PlAgri). 2022. ISBN 978-80-8147-115-5.
      URL
      angličtina. Slovensko.
      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 5. 10. 2022 10:42.
    5. RIGO, Riccardo, Elisabetta GROAZ a Claudia SISSI. Polymorphic and Higher-Order G-Quadruplexes as Possible Transcription Regulators: Novel Perspectives for Future Anticancer Therapeutic Applications. PHARMACEUTICALS. BASEL, SWITZERLAND: MDPI, 2022, roč. 15, č. 3, s. 373-385. ISSN 1424-8247. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/ph15030373.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00127513 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Rigo, Riccardo (380 Itálie, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: G-quadruplex; folding landscapes; gene promoters
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 3. 4. 2023 10:12.
    6. MĄDRZYK, Marie, Táňa MACHÁČKOVÁ, Karolína TRACHTOVÁ, Tina Catela IVKOVIĆ, Kamila SOUČKOVÁ, Jan KOTOUČEK, Josef MAŠEK, Tomáš LOJA, Milana ŠACHLOVÁ a Ondřej SLABÝ. Sekvenování dlouhých nekódujících RNA v exozomech u pacientů s kolorektálním karcinomem. Klinická onkologie. Praha: Česká lékařská společnost J. E. Purkyně, 2022, roč. 35, Supplementum 1, s. "S138"-"S141", 3 s. ISSN 0862-495X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.48095/ccko20221S107.
      URL
      Název anglicky: Sequencing of long non-coding RNAs in exosomes of colorectal cancer patients
      RIV/00216224:14110/22:00127207 Článek v odborném periodiku. čeština. Česká republika.
      Mądrzyk, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Macháčková, Táňa (203 Česká republika, domácí) -- Trachtová, Karolína (203 Česká republika, domácí) -- Součková, Kamila (203 Česká republika, domácí) -- Kotouček, Jan (203 Česká republika) -- Mašek, Josef (203 Česká republika) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Šachlová, Milana (203 Česká republika) -- Slabý, Ondřej (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RNA long noncoding; colorectal neoplasms; exosomes; bio markers tumor; gene expression profiling
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 3. 4. 2023 12:17.
    7. HOFERKOVÁ, Eva, Soňa KADÁKOVÁ, Václav ŠEDA, Tomáš LOJA, Gabriela MLADONICKÁ PAVLASOVÁ, Jan VERNER, Václav CHOCHOLA, Josef JAROŠ, Květoslava LIŠKOVÁ, Daniel FILIP, Josef VEČEŘA, Pedro FARIA ZENI, Jana DORAZILOVÁ, Eva ONDROUŠKOVÁ, Laura ONDRIŠOVÁ, Miroslav BOUDNÝ, Leoš KŘEN, Lucy VOJTOVÁ, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. Versatile coculture systém to study chronic lymhocytic leukemia proliferation. In CEITEC PhD Conference, Brno. 2022.
      Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 21. 11. 2022 14:28.

    2021

    1. BUŠA, Daniel, Tomáš LOJA, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, A. FOLTA, Jiří MAYER a Martin ČULEN. Acute myeloid leukemia regression induced by palbociclib and ponatinib in patient –derived xenograft model. In Analytická cytometrie XI. 2021.
      Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 2. 2. 2022 14:24.
    2. PLEVOVÁ, Karla, Šárka PAVLOVÁ, Anastasiya VOLAKHAVA, Marcela KRZYŽÁNKOVÁ, Hana SYNÁČKOVÁ, Hana JELÍNKOVÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Michaela BOHÚNOVÁ, Tomáš LOJA, Michael DOUBEK, Libor ČERVINEK, Jana KOTAŠKOVÁ, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Ilgar MAMEDOV. Detekce transpozibilních elementů u hematologických malignit. In II. Český hematologický a transfuziologický sjezd v Transfuze a Hematologie Dnes (2021). 2021.
      Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 20. 12. 2021 08:16.
    3. KOLÁŘOVÁ, Karolína, Martina NEŠPOR DADEJOVÁ, Tomáš LOJA, Gabriela LOCHMANOVÁ, Eva SÝKOROVÁ a Martina DVOŘÁČKOVÁ. Disruption of NAP1 genes in Arabidopsis thaliana suppresses the fas1 mutant phenotype, enhances genome stability and changes chromatin compaction. The Plant Journal. Blackwell Science, 2021, roč. 106, č. 1, s. 56-73. ISSN 0960-7412. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/tpj.15145.
      fulltext
      Název anglicky: Disruption of NAP1 genes in Arabidopsis thaliana suppresses the fas1 mutant phenotype, enhances genome stability and changes chromatin compaction
      RIV/00216224:14740/21:00119611 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Kolářová, Karolína (203 Česká republika, domácí) -- Nešpor Dadejová, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Lochmanová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Dvořáčková, Martina (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: chromatin; histone chaperones; histone variants; DNA repair
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 15. 10. 2024 14:19.
    4. ŠEDA, Václav, Eva VOJÁČKOVÁ, Laura ONDRIŠOVÁ, Lenka KOŠŤÁLOVÁ, Sonali SHARMA, Tomáš LOJA, Gabriela MLADONICKÁ PAVLASOVÁ, Daniel ZICHA, Marie KUDLIČKOVÁ PEŠKOVÁ, Jan KŘIVÁNEK, Květoslava MATULOVÁ, Leoš KŘEN, V. BENES, Markéta LITZMANOVÁ, Marek BORSKÝ, Jan OPPELT, Jan VERNER, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Z. TAN, S.X. ZHANG, Michael DOUBEK, Kateřina AMRUZ ČERNÁ, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. FoxO1-GAB1 axis regulates homing capacity and tonic AKT activity in chronic lymphocytic leukemia. Blood. Washington DC, USA: American Society of Hematology, 2021, roč. 138, č. 9, s. 758-772. ISSN 0006-4971. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1182/blood.2020008101.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00123376 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Šeda, Václav (203 Česká republika, domácí) -- Vojáčková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Ondrišová, Laura (703 Slovensko, domácí) -- Košťálová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Sharma, Sonali (356 Indie, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Mladonická Pavlasová, Gabriela (203 Česká republika, domácí) -- Zicha, Daniel (203 Česká republika) -- Kudličková Pešková, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Křivánek, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Matulová, Květoslava (203 Česká republika, domácí) -- Křen, Leoš (203 Česká republika, domácí) -- Borský, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Oppelt, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Verner, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Brychtová, Yvona (203 Česká republika, domácí) -- Panovská, Anna (203 Česká republika, domácí) -- Doubek, Michael (203 Česká republika, domácí) -- Amruz Černá, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Mráz, Marek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DOCKING PROTEIN GAB1B-CELLSBONE-MARROWCHEMOKINE RECEPTORL-SELECTINP110-GAMMA ISOFORMEPIDERMAL-GROWTHTYROSINE KINASEPI3 KINASEIBRUTINIB
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 15. 10. 2024 14:24.
    5. ŠEDA, Václav, E. VOJÁČKOVÁ, Laura ONDRIŠOVÁ, Lenka KOŠŤÁLOVÁ, Sonali SHARMA, Tomáš LOJA, Daniel ZICHA, Jan VERNER, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Zhuowen TAN, Shelley ZHANG, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. FoxO1-GAB1 Axis Regulates Homing Capacity and Tonic AKT Activity in Chronic Lymphocytic Leukemia: Novel Therapeutic Target. In 26th Congress of the European Hematology Association, červen 2021 in HemaSphere. 2021.
      Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 2. 2. 2022 06:51.
    6. ŠEDA, Václav, Eva HOFERKOVÁ, Laura ONDRIŠOVÁ, Lenka KOŠŤÁLOVÁ, Sonali SHARMA, Tomáš LOJA, Daniel ZICHA, Jan VERNER, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. GAB1 – novel regulator of migration capacity and tonic AKT activity in CLL: Implications for combinatorial therapy with BCR inhibitors. In XIX International Workshop on Chronic Lymphocytic Leukemia (iwCLL). 2021.
      Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 2. 2. 2022 07:03.
    7. MRÁZ, Marek, Václav ŠEDA, Eva HOFERKOVÁ, Laura ONDRIŠOVÁ, Lenka KOŠŤÁLOVÁ, Sonali SHARMA, Tomáš LOJA, Daniel ZICHA, Jan VERNER, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Michael DOUBEK a Jiří MAYER. GAB1 Regulates homing capacity and tonic AKT activity in chronic lymphocytic leukemia: novel therapeutic target. In XXVI. CSBMB 2021. 2021.
      Název anglicky: GAB1 Regulates homing capacity and tonic AKT activity in chronic lymphocytic leukemia: novel therapeutic target

      Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 18. 12. 2021 09:43.
    8. ŠEDA, Václav, Eva VOJÁČKOVÁ, Laura ONDRIŠOVÁ, Lenka KOŠŤÁLOVÁ, Sonali SHARMA, Tomáš LOJA, D. ZICHA, Jan VERNER, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Yvona BRYCHTOVÁ, Anna PANOVSKÁ, Zhuowen TAN, Shelley ZHANG, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. GAB1 reguluje tonickou AKT signalizaci a migraci buněk chronické lymfatické leukémie: implikace pro kombinační léčbu s BCR inhibitory. In II. Český hematologický a transfuziologický sjezd v Transfuze a Hematologie Dnes (2021). 2021.
      Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 20. 12. 2021 09:28.
    9. KEJNOVSKA, I., P. STADLBAUER, Lukáš TRANTÍREK, D. RENCIUK, Martin GAJARSKÝ, Daniel KRAFČÍK, J. PALACKY, K. BEDNAROVA, J. SPONER, J.L. MERGNY a M. VORLICKOVA. G-Quadruplex Formation by DNA Sequences Deficient in Guanines: Two Tetrad Parallel Quadruplexes Do Not Fold Intramolecularly. Chemistry - A European Journal. WEINHEIM: Wiley, 2021, roč. 27, č. 47, s. 12115-12125. ISSN 0947-6539. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/chem.202100895.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00120225 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Gajarský, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Krafčík, Daniel (703 Slovensko, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CD spectroscopy; DNA quadruplexes; G-quartets; nucleic acid folding; molecular dynamics calculations; NMR spectroscopy
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 2. 2022 10:43.
    10. ROMŽOVÁ, Marianna, Dagmar SMITALOVÁ, Jakub HYNŠT, Nikola TOM, Tomáš LOJA, Zdeňka HERUDKOVÁ, Tomáš JURČEK, Lukas STEJSKAL, Daniela ŽÁČKOVÁ, Jiří MAYER, Zdeněk RÁČIL a Martin ČULEN. Hierarchical distribution of somatic variants in newly diagnosed chronic myeloid leukaemia at diagnosis and early follow-up. British journal of haematology. Hoboken: Wiley-Blackwell, 2021, roč. 194, č. 3, s. 604-612. ISSN 0007-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/bjh.17659.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00120115 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Romžová, Marianna (703 Slovensko, garant, domácí) -- Smitalová, Dagmar (203 Česká republika, domácí) -- Hynšt, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Tom, Nikola (203 Česká republika, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Herudková, Zdeňka (203 Česká republika, domácí) -- Jurček, Tomáš (203 Česká republika) -- Stejskal, Lukas (203 Česká republika) -- Žáčková, Daniela (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Ráčil, Zdeněk (203 Česká republika) -- Čulen, Martin (703 Slovensko, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CML; NGS; progenitors; leukaemic stem cells; somatic mutations; ASXL1
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 15. 10. 2024 14:08.
    11. LEDEREROVÁ, Aneta, Lenka DOSTÁLOVÁ, Veronika KOZLOVÁ, Helena PESCHELOVÁ, Adriana LADUNGOVÁ, Martin ČULEN, Tomáš LOJA, Jan VERNER, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Michal ŠMÍDA a Veronika MANČÍKOVÁ. Hypermethylation of CD19 promoter enables antigen-negative escape to CART-19 in vivo and in vitro. Journal for ImmunoTherapy of Cancer. Switzerland: Springer International Publishing AG, 2021, roč. 9, č. 8, s. 1-8. ISSN 2051-1426. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1136/jitc-2021-002352.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00119907 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Ledererová, Aneta (203 Česká republika, domácí) -- Dostálová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Kozlová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Peschelová, Helena (203 Česká republika, domácí) -- Ladungová, Adriana (703 Slovensko, domácí) -- Čulen, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Verner, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Šmída, Michal (203 Česká republika, garant, domácí) -- Mančíková, Veronika (703 Slovensko, domácí)
      Klíčová slova anglicky: antigens; B-lymphocytes; hematologic neoplasms; receptors; chimeric antigen; translational medical research
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 15. 10. 2024 14:21.
    12. DOSTÁLOVÁ, Lenka, Aneta LEDEREROVÁ, Veronika KOZLOVÁ, Helena PESCHELOVÁ, Adriana LADUNGOVÁ, Tomáš LOJA, Jan VERNER, Šárka POSPÍŠILOVÁ, Veronika MANČÍKOVÁ a Michal ŠMÍDA. In vivo antigen-negative escape to CART-19 caused by CD19 promotor hypermethylation. In II. Český hematologický a transfuziologický sjezd v Transfuze a Hematologie Dnes (2021). 2021.
      Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 18. 12. 2021 10:40.
    13. BROFT, P., Šimon DŽATKO, Michaela KRAFČÍKOVÁ, A. WACKER, Robert HANSEL-HERTSCH, Volker DOTSCH, Lukáš TRANTÍREK a Harald SCHWALBE. In-Cell NMR Spectroscopy of Functional Riboswitch Aptamers in Eukaryotic Cells. Angewandte Chemie International Edition. Weinheim: Wiley-VCH Verlag, 2021, roč. 60, č. 2, s. 865-872. ISSN 1433-7851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/anie.202007184.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00118818 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Džatko, Šimon (703 Slovensko, domácí) -- Krafčíková, Michaela (703 Slovensko, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: aptamers; 2' -deoxyguanosine riboswitch; HeLa cells; RNA structures; structural biology
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 18. 11. 2024 09:43.
    14. LENARČIČ ŽIVKOVIĆ, Martina, Martin GAJARSKÝ, Kateřina BEKOVÁ, P. STADLBAUER, Lukáš VICHEREK, M. PETROVA, Radovan FIALA, I. ROSENBERG, Jiří ŠPONER, J. PLAVEC a Lukáš TRANTÍREK. Insight into formation propensity of pseudocircular DNA G-hairpins. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2021, roč. 49, č. 4, s. 2317-2332. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkab029.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00119635 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Lenarčič Živković, Martina (705 Slovinsko, domácí) -- Gajarský, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Beková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Vicherek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Šponer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONSG-QUADRUPLEX STRUCTUREAMBER FORCE-FIELDG-TRIPLEXFOLDING PATHWAYSNUCLEIC-ACIDSRNAIDENTIFICATIONVISUALIZATIONINVOLVEMENT
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 30. 10. 2024 14:16.
    15. BUŠA, Daniel, Tomáš LOJA, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, Adam FOLTA, Jiří MAYER a Martin ČULEN. Palbociclib and ponatinib induce regression of acute myeloid leukemia in patient-derived xenograft model. In II. Český hematologický a transfuziologický sjezd v Transfuze a Hematologie Dnes (2021). 2021.
      Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 18. 12. 2021 12:19.
    16. VOJÁČKOVÁ, E., Jan VERNER, K. LIŠKOVÁ, Václav ŠEDA, Tomáš LOJA, Gabriela MLADONICKÁ PAVLASOVÁ, Daniel FILIP, Sonali SHARMA, Jana DORAZILOVÁ, Hana SKUHROVÁ FRANCOVÁ, Josef VEČEŘA, Laura ONDRIŠOVÁ, Veronika ŠANDOVÁ, Pedro FARIA ZENI, Lenka KOŠŤÁLOVÁ, Miroslav BOUDNÝ, Michaela MEDKOVÁ, Lucy VOJTOVÁ, Leoš KŘEN, Jiří MAYER a Marek MRÁZ. Patient-derived Xenograft Model of Chronic Lymphocytic Leukaemia Based on Mimicking Its Microenvironment. In Ceitec PhD Conference. 2021.
      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 4. 2022 15:13.
    17. CHENG, Mingpan, Dehui QIU, Liezel TAMON, Eva IŠTVÁNKOVÁ, Pavlína VÍŠKOVÁ, Samir AMRANE, Aurore GUÉDIN, Jielin CHEN, Laurent LACROIX, Huangxian JU, Lukáš TRANTÍREK, Aleksandr B. SAHAKYAN, Jun ZHOU a Jean-Louis MERGNY. Thermal and pH stabilities of i‐DNA: confronting in vitro experiments with models and in‐cell NMR data. ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION. Wiley-VCH Verlag GmbH, 2021, roč. 60, č. 18, s. 10286-10294. ISSN 1433-7851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/anie.202016801.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00118900 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Ištvánková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Víšková, Pavlína (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DNA; i-motif; thermal stability; pH transition; intracellular stability
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Jana Kuchtová, učo 241368. Změněno: 14. 10. 2024 17:45.
    18. KRAFČÍK, Daniel, Eva IŠTVÁNKOVÁ, Šimon DŽATKO, Pavlína VÍŠKOVÁ, S. FOLDYNOVA-TRANTIRKOVA a Lukáš TRANTÍREK. Towards Profiling of the G-Quadruplex Targeting Drugs in the Living Human Cells Using NMR Spectroscopy. International Journal of Molecular Sciences. Basel: Multidisciplinary Digital Publishing Institute, 2021, roč. 22, č. 11, s. 6042-6055. ISSN 1422-0067. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/ijms22116042.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00120234 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Krafčík, Daniel (703 Slovensko, domácí) -- Ištvánková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Džatko, Šimon (703 Slovensko, domácí) -- Víšková, Pavlína (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: in-cell NMR; G-quadruplex; ligand; drug; Bcl2; telomeric DNA; KRAS; BRACO19; PhenDC3; NMM
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Jana Kuchtová, učo 241368. Změněno: 15. 10. 2024 14:36.

    2020

    1. HERUDKOVÁ, Zdeňka, Martin ČULEN, Adam FOLTA, Ivana JEŽÍŠKOVÁ, Jana CERNA, Tomáš LOJA, Nikola TOM, Jiri SMEJKAL, Lukáš SEMERÁD, Dana DVOŘÁKOVÁ, Jiří MAYER a Zdeněk RÁČIL. Clonal hierarchy of main molecular lesions in acute myeloid leukaemia. British journal of haematology. Hoboken: Wiley-Blackwell, 2020, roč. 190, č. 4, s. 562-572. ISSN 0007-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/bjh.16341.
      URL
      RIV/00216224:14110/20:00115741 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Herudková, Zdeňka (203 Česká republika, domácí) -- Čulen, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Folta, Adam (203 Česká republika) -- Ježíšková, Ivana (203 Česká republika) -- Cerna, Jana (203 Česká republika) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Tom, Nikola (203 Česká republika, domácí) -- Smejkal, Jiri (203 Česká republika) -- Semerád, Lukáš (203 Česká republika) -- Dvořáková, Dana (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Ráčil, Zdeněk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: acute myeloid leukaemia; mutations; relapse; patient-derived xenograft; clonality
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 22. 9. 2020 07:32.
    2. ŠKOLÁKOVÁ, Petra, Zahra BADRI, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Jan RYNEŠ, Jiří ŠPONER, Miloslava FOJTOVÁ, Jiří FAJKUS, Radek MAREK, Michaela VORLÍČKOVÁ, Jean-Louis MERGNY a Lukáš TRANTÍREK. Composite 5-methylations of cytosines modulate i-motif stability in a sequence-specific manner: Implications for DNA nanotechnology and epigenetic regulation of plant telomeric DNA. BBA - General Subjects. Elsevier B.V., 2020, roč. 1864, č. 9, s. 129651-129659. ISSN 0304-4165. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bbagen.2020.129651.
      DOI: 10.1016/j.bbagen.2020.129651
      RIV/00216224:14740/20:00115829 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Školáková, Petra (203 Česká republika) -- Badri, Zahra (364 Írán, domácí) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika) -- Ryneš, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Šponer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Fojtová, Miloslava (203 Česká republika, domácí) -- Fajkus, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Vorlíčková, Michaela (203 Česká republika) -- Mergny, Jean-Louis (250 Francie) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: i-motif;DNA;Epigenetic modification;DNA nanotechnology;Plant telomeric DNA;Cytosine methylation
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 14. 10. 2024 12:59.
    3. VOJÁČKOVÁ, Eva, Jan VERNER, Květoslava LIŠKOVÁ, Jana DORAZILOVÁ, Hana SKUHROVÁ FRANCOVÁ, Tomáš LOJA, Václav ŠEDA, Veronika ŠANDOVÁ, Gabriela MLADONICKÁ PAVLASOVÁ, Sonali SHARMA, Pedro FARIA ZENI, Daniel FILIP, Laura ONDRIŠOVÁ, Lenka KOŠŤÁLOVÁ, Lucy VOJTOVÁ, Leoš KŘEN a Marek MRÁZ. Development of novel patient-derived xenograft model of chronic lymphocytic leukemia. In CEITEC PhD Conference, Brno, únor 2020. 2020.
      Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 20. 1. 2021 09:04.
    4. PALUŠOVÁ, Veronika, Tereza RENZOVÁ, Amandine VERLANDE, Tereza VACLOVÁ, Michaela MEDKOVÁ, Linda CETLOVÁ, Miroslava SEDLÁČKOVÁ, Hana HŘÍBKOVÁ, Iva SLANINOVÁ, Miriama KRUTÁ, Vladimír ROTREKL, Hana UHLIROVA, Aneta KRIZOVA, Radim CHMELIK, Pavel VESELY, Michaela KRAFČÍKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, Kay Oliver SCHINK a Stjepan ULDRIJAN. Dual Targeting of BRAF and mTOR Signaling in Melanoma Cells with Pyridinyl Imidazole Compounds. Cancers. BASEL: MDPI, 2020, roč. 12, č. 6, s. 1-24. ISSN 2072-6694. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/cancers12061516.
      URL
      RIV/00216224:14110/20:00116135 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Palušová, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Renzová, Tereza (203 Česká republika, domácí) -- Verlande, Amandine (250 Francie, domácí) -- Vaclová, Tereza (203 Česká republika, domácí) -- Medková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Cetlová, Linda (203 Česká republika, domácí) -- Sedláčková, Miroslava (203 Česká republika, domácí) -- Hříbková, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Slaninová, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Krutá, Miriama (703 Slovensko, domácí) -- Rotrekl, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Uhlirova, Hana (203 Česká republika) -- Krizova, Aneta (203 Česká republika) -- Chmelik, Radim (203 Česká republika) -- Vesely, Pavel (203 Česká republika) -- Krafčíková, Michaela (703 Slovensko, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Schink, Kay Oliver (578 Norsko) -- Uldrijan, Stjepan (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: melanoma; BRAF V600E; BRAF inhibitor; small molecule drug; pyridinyl imidazole; endosome; lysosome; mTORC1; ER stress
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Jana Kuchtová, učo 241368. Změněno: 14. 10. 2024 17:36.
    5. GREGOR, Tomáš, Michaela BOSÁKOVÁ, Alexandru NITĂ, Sara POOVAKULATHU ABRAHAM, Bohumil FAFÍLEK, Nicole ČERNOHORSKÁ, Jan RYNEŠ, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Daniela ŽÁČKOVÁ, Jiří MAYER, Lukáš TRANTÍREK a Pavel KREJČÍ. Elucidation of protein interactions necessary for the maintenance of the BCR-ABL signaling complex. Cellular and molecular life sciences. BASEL: SPRINGER BASEL AG, 2020, roč. 77, č. 19, s. 3885-3903. ISSN 1420-682X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00018-019-03397-7.
      URL
      RIV/00216224:14110/20:00116512 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Gregor, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Bosáková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Nită, Alexandru (642 Rumunsko, domácí) -- Poovakulathu Abraham, Sara (356 Indie, domácí) -- Fafílek, Bohumil (203 Česká republika, domácí) -- Černohorská, Nicole (203 Česká republika, domácí) -- Ryneš, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika, domácí) -- Žáčková, Daniela (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: BCR-ABL; Chronic myeloid leukemia; Signaling; Protein complex
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 4. 3. 2021 12:28.
    6. JOHARD, H., A. OMELYANENKO, G. FEI, M. ZILBERTER, Z. DAVE, R. ABU-YOUSSEF, L. SCHMIDT, A. HARISANKAR, C.T. VINCENT, J. WALFRIDSSON, S. NELANDER, T. HARKANY, K. BLOMGREN a Michael ANDÄNG. HCN Channel Activity Balances Quiescence and Proliferation in Neural Stem Cells and Is a Selective Target for Neuroprotection During Cancer Treatment. MOLECULAR CANCER RESEARCH. PHILADELPHIA: AMER ASSOC CANCER RESEARCH, 2020, roč. 18, č. 10, s. 1522-1533. ISSN 1541-7786. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1158/1541-7786.MCR-20-0292.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00114755 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Andäng, Michael (752 Švédsko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: LONG-TERM; ADULT; NEUROGENESIS; CYCLE; IRRADIATION; RECEPTOR; PURIFICATION; HIPPOCAMPUS; DYNAMICS; CULTURE
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 1. 4. 2021 12:35.
    7. GIASSA, Ilektra-Chara, Andrea VAVRINSKÁ, Jiří ZELINKA, Jakub ŠEBERA, Vladimír SYCHROVSKÝ, Rolf BOELENS, Radovan FIALA a Lukáš TRANTÍREK. HERMES - A Software Tool for the Prediction and Analysis of Magnetic-Field-Induced Residual Dipolar Couplings in Nucleic Acids. ChemPlusChem. Weinheim: Wiley - Verlag Chemie, 2020, roč. 85, č. 9, s. 2177-2185. ISSN 2192-6506. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cplu.202000505.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00117855 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Giassa, Ilektra-Chara (300 Řecko, domácí) -- Zelinka, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: field-induced residual dipolar couplings; magnetic susceptibility anisotropy; NMR; nucleic acids; prediction software
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 30. 10. 2024 14:15.
    8. DŽATKO, Šimon, Radovan FIALA, R. HANSEL-HERTSCH, Silvie TRANTÍRKOVÁ a Lukáš TRANTÍREK. In-cell NMR Spectroscopy of Nucleic Acids. IN-CELL NMR SPECTROSCOPY: FROM MOLECULAR SCIENCES TO CELL BIOLOGY. CAMBRIDGE: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2020, roč. 21, č. 2020, s. 272-297. ISSN 2044-253X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/9781788013079.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00118650 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Džatko, Šimon (703 Slovensko, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DNA; guanine quadruplex; nucleic acid; water
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 15. 3. 2021 19:08.
    9. DUŠKOVÁ, Lucie, Lucie NOHELOVÁ, Tomáš LOJA, Jana FIALOVÁ, Petra ZAPLETALOVÁ, Kamila RÉBLOVÁ, Lukáš TICHÝ, Tomáš FREIBERGER a Lenka FAJKUSOVÁ. Low Density Lipoprotein Receptor Variants in the Beta-Propeller Subdomain and Their Functional Impact. Frontiers in Genetics. Laussane: FRONTIERS MEDIA SA, 2020, roč. 11, JUN 2020, s. 1-10. ISSN 1664-8021. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3389/fgene.2020.00691.
      URL
      RIV/00216224:14110/20:00116330 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Dušková, Lucie (203 Česká republika) -- Nohelová, Lucie (203 Česká republika) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Fialová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Zapletalová, Petra (203 Česká republika) -- Réblová, Kamila (203 Česká republika, domácí) -- Tichý, Lukáš (203 Česká republika) -- Freiberger, Tomáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Fajkusová, Lenka (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: low density lipoprotein receptor; live cell imaging microscopy; flow cytometry; functional analysis; ER stress
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Adéla Pešková, učo 143895. Změněno: 9. 10. 2024 12:47.
    10. PEŠKOVÁ, Lucie, Denisa JURČÍKOVÁ, Tereza VÁŇOVÁ, Jan KŘIVÁNEK, Michaela CAPANDOVÁ, Zuzana ŠRÁMKOVÁ, Jana ŠEBESTÍKOVÁ, Magdaléna KOLOUŠKOVÁ, Hana KOTASOVÁ, Libor STREIT a Tomáš BÁRTA. miR-183/96/182 cluster is an important morphogenetic factor targetingPAX6expression in differentiating human retinal organoids. Stem Cells. Hoboken: Wiley-Blackwell, 2020, roč. 38, č. 12, s. 1557-1567. ISSN 1066-5099. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/stem.3272.
      URL
      RIV/00216224:14110/20:00116545 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Pešková, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Jurčíková, Denisa (203 Česká republika, domácí) -- Váňová, Tereza (203 Česká republika, domácí) -- Křivánek, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Capandová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Šrámková, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Šebestíková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Koloušková, Magdaléna (203 Česká republika, domácí) -- Kotasová, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Streit, Libor (203 Česká republika) -- Bárta, Tomáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: microRNAs; organoids; pluripotent stem cells; retina
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 7. 10. 2024 17:14.
    11. AULICKÁ, Štefánia, Zuzana LIBÁ, Katarína ČESKÁ, Jiří ŠÁNA, Tomáš LOJA, Elleni PONECHAL MICHU, Ondřej SLABÝ a Hana OŠLEJŠKOVÁ. Možnosti imunomodulační terapie epilepsií. In Český a slovenský epileptologický sjezd, Ostravice. 2020.

      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: doc. MUDr. Štefánia Aulická, Ph.D., učo 229574. Změněno: 21. 2. 2021 20:47.
    12. ČULEN, Martin, Dagmar SMITALOVÁ, Tomáš LOJA, Jiří MAYER a Marianna ROMŽOVÁ. Multicolor immuno-phenotyping of candidate leukemic stem cell markers in CD34+CD38- chronic myeloid leukemia stem cells. In 20. Pražské hematologické dny (Hematologie 2020), Praha. 2020.
      Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 6. 11. 2020 13:18.
    13. MANČÍKOVÁ, Veronika, Helena PESCHELOVÁ, Veronika KOZLOVÁ, Aneta LEDEREROVÁ, Adriana LADUNGOVÁ, Jan VERNER, Tomáš LOJA, František FOLBER, Jiří MAYER, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Michal ŠMÍDA. Performance of anti-CD19 chimeric antigen receptor T cells in genetically defined classes of chronic lymphocytic leukemia. Journal for ImmunoTherapy of Cancer. Switzerland: Springer International Publishing AG, 2020, roč. 8, č. 1, s. 000471-481. ISSN 2051-1426. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1136/jitc-2019-000471.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00115788 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Mančíková, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Peschelová, Helena (203 Česká republika, domácí) -- Kozlová, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Ledererová, Aneta (203 Česká republika, domácí) -- Ladungová, Adriana (703 Slovensko, domácí) -- Verner, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Folber, František (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Šmída, Michal (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: genetics; haematology; immunology
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 17. 8. 2020 16:02.
    14. JURIKOVA, K., Martin GAJARSKÝ, M. HAJIKAZEMI, J. NOSEK, K. PROCHAZKOVA, K. PAESCHKE, Lukáš TRANTÍREK a L. TOMASKA. Role of folding kinetics of secondary structures in telomeric G-overhangs in the regulation of telomere maintenance inSaccharomyces cerevisiae. Journal of Biological Chemistry. Bethesda, USA: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2020, roč. 295, č. 27, s. 8958-8971. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.RA120.012914.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00114648 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Gajarský, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: telomere; telomerase; Saccharomyces cerevisiae; cell cycle; Cdc13; G-hairpin; G-quadruplex; folding kinetics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 14. 10. 2024 15:51.
    15. AULICKÁ, Štefánia, Katarína ČESKÁ, Jiří ŠÁNA, Tomáš LOJA, Petr JABANDŽIEV, Jan PAPEŽ, Pavlína DANHOFER, Hana VINOHRADSKÁ, Irena DOLEŽALOVÁ, Milan BRÁZDIL, Petr ŠTOURAČ, Hana OŠLEJŠKOVÁ a Ondřej SLABÝ. Role zánětu v etiopatogenezi farmakorezistentní epilepsie a refrakterního status epilepticus. Česká a slovenská neurologie a neurochirurgie. Praha: CZECH MEDICAL SOC, 2020, roč. 83, č. 1, s. 8-13. ISSN 1210-7859. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.14735/amcsnn20208.
      URL
      Název anglicky: The role of inflammation in etiopathogenesis of pharmacoresistant epilepsy and refractory status epilepticus
      RIV/00216224:14110/20:00115369 Článek v odborném periodiku. čeština. Česká republika.
      Aulická, Štefánia (703 Slovensko, garant, domácí) -- Česká, Katarína (703 Slovensko, domácí) -- Šána, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Jabandžiev, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Papež, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Danhofer, Pavlína (203 Česká republika, domácí) -- Vinohradská, Hana (203 Česká republika) -- Doležalová, Irena (203 Česká republika, domácí) -- Brázdil, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Štourač, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Ošlejšková, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Slabý, Ondřej (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: pharmacoresistant epilepsy; refractory status epilepticus; cytokines; chemokines; polymorphisms
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 15. 1. 2021 13:40.
    16. LENARČIČ ŽIVKOVIĆ, Martina, J. ROZMAN a J. PLAVEC. Structure of a DNA G-Quadruplex Related to Osteoporosis with a G-A Bulge Forming a Pseudo-loop. MOLECULES. Orlando, Florida: Academic Press, 2020, roč. 25, č. 20, s. 4867-4882. ISSN 1420-3049. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/molecules25204867.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00118353 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Lenarčič Živković, Martina (705 Slovinsko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: G-quadruplex; NMR spectroscopy; structure; osteoporosis
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 12. 5. 2021 12:55.

    2019

    1. SMITALOVÁ, Dagmar, Tomáš LOJA, Martin ČULEN, Zdeňka HERUDKOVÁ, Eva BUDINSKÁ, Jiří MAYER, Zdeněk RÁČIL a Marianna ROMŽOVÁ. Analysis of gene expression in CD26+ CML leukemic stem cell population. In 10th International Conference Analytical Cytometry, Hotel Jizerka, Seč-Ústupky. 2019.
      Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 29. 1. 2020 08:54.
    2. VANECKOVA, T., J. BEZDEKOVA, Michaela TVRDOŇOVÁ, M. VLCNOVSKA, V. NOVOTNA, J. NEUMAN, Aneta ŠTOSSOVÁ, Viktor KANICKÝ, V. ADAM, M. VACULOVICOVA a Tomáš VACULOVIČ. CdS quantum dots-based immunoassay combined with particle imprinted polymer technology and laser ablation ICP-MS as a versatile tool for protein detection. Scientific reports. LONDON: NATURE PUBLISHING GROUP, 2019, roč. 9, AUG, s. 1-9. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-019-48290-2.
      URL
      RIV/00216224:14310/19:00113292 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Tvrdoňová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Štossová, Aneta (203 Česká republika, domácí) -- Kanický, Viktor (203 Česká republika, domácí) -- Vaculovič, Tomáš (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: MAGNETIC NANOPARTICLES; SENSITIVE DETECTION; SURFACE-CHEMISTRY; RECOGNITION; SENSOR; EXTRACTION; SEPARATION; DNA
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 17. 3. 2020 19:50.
    3. HARNOŠ, Jakub, M.C.A. CANIZAL, Miroslav JURÁSEK, Jitender KUMAR, Cornelia HOLLER, Alexandra SCHAMBONY, Kateřina HANÁKOVÁ, Ondřej BERNATÍK, Zbyněk ZDRÁHAL, Kristína GÖMÖRYOVÁ, Tomáš GYBEĽ, Tomasz Witold RADASZKIEWICZ, Marek KRAVEC, Lukáš TRANTÍREK, Jan RYNEŠ, Zankruti DAVE, Ana Iris FERNANDEZ-LLAMAZARES, Robert VÁCHA, Konstantinos TRIPSIANES, Carsten HOFFMANN a Vítězslav BRYJA. Dishevelled-3 conformation dynamics analyzed by FRET-based biosensors reveals a key role of casein kinase 1. Nature Communications. London: Nature Publishing Group, 2019, roč. 10, APR 18 2019, s. 1-18. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-019-09651-7.
      Full Text
      RIV/00216224:14310/19:00107391 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Harnoš, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Canizal, M.C.A. (276 Německo) -- Jurásek, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Kumar, Jitender (356 Indie, domácí) -- Holler, Cornelia (276 Německo) -- Schambony, Alexandra (276 Německo) -- Hanáková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Bernatík, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Gömöryová, Kristína (703 Slovensko, domácí) -- Gybeľ, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Radaszkiewicz, Tomasz Witold (616 Polsko, domácí) -- Kravec, Marek (703 Slovensko, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Ryneš, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Dave, Zankruti (356 Indie, domácí) -- Fernandez-Llamazares, Ana Iris (528 Nizozemské království) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Tripsianes, Konstantinos (300 Řecko, domácí) -- Hoffmann, Carsten (276 Německo) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: PARTICLE MESH EWALD; BETA-CATENIN; WNT/BETA-CATENIN; DIX DOMAIN; MOLECULAR-DYNAMICS; STRUCTURAL BASIS; PDZ DOMAIN; DEP DOMAIN; G-PROTEIN; WNT
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Jana Kuchtová, učo 241368. Změněno: 14. 10. 2024 13:05.
    4. TŘÍSKOVÁ, Iveta, Libuše TRNKOVÁ, Iva KEJNOVSKÁ a Michaela VORLÍČKOVÁ. Electrochemical and Spectral Analysis of Cytosine-rich Nonamers. In Tomáš Navrátil, Miroslav Fojta a Karolina Schwarzová. XXXIX. Moderní elektrochemické metody-sborník přednášek. 1. vyd. Ústí nad Labem: Srsenová Lenka-Best servis Ústí nad Labem, 2019, s. 209-212. ISBN 978-80-905221-7-6.
      Název česky: Elektrochemická a spektrální analýza nonamerú bohatých na cytosin
      Název anglicky: Electrochemical and Spectral Analysis of Cytosine-rich Nonamers
      RIV/00216224:14310/19:00110318 Stať ve sborníku. angličtina. Česká republika.
      Třísková, Iveta (203 Česká republika, domácí) -- Trnková, Libuše (203 Česká republika, garant) -- Kejnovská, Iva (203 Česká republika) -- Vorlíčková, Michaela (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: C-rich ODN; i-motif; Linear sweep voltammetry; Elimination voltammetry with linear scan; CD spectra; Polyacrylamide electrophoresis
      Druh sborníku: předkonferenční sborník

      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 31. 1. 2024 17:29.
    5. BOSÁKOVÁ, Michaela, Alexandru NITĂ, Tomáš GREGOR, Miroslav VAŘECHA, Iva GUDERNOVÁ, Bohumil FAFÍLEK, Tomáš BÁRTA, Neha BASHEER, Sara POOVAKULATHU ABRAHAM, Lukáš BÁLEK, Markéta TOMANOVÁ, Jana FIALOVÁ KUČEROVÁ, Juraj BOSÁK, David POTĚŠIL, Jennifer ZIEBA, Jieun SONG, Peter KONIK, Sohyun PARK, Ivan DURAN, Zbyněk ZDRÁHAL, David ŠMAJS, Gert JANSEN, Zheng FU, Hyuk Wan KO, Aleš HAMPL, Lukáš TRANTÍREK, Deborah KRAKOW a Pavel KREJČÍ. Fibroblast growth factor receptor influences primary cilium length through an interaction with intestinal cell kinase. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. WASHINGTON: NATL ACAD SCIENCES, 2019, roč. 116, č. 10, s. 4316-4325. ISSN 0027-8424. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1073/pnas.1800338116.
      URL
      RIV/00216224:14110/19:00107404 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Bosáková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Nită, Alexandru (642 Rumunsko, domácí) -- Gregor, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Vařecha, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Gudernová, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Fafílek, Bohumil (203 Česká republika, domácí) -- Bárta, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Basheer, Neha (356 Indie, domácí) -- Poovakulathu Abraham, Sara (356 Indie, domácí) -- Bálek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Tomanová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Fialová Kučerová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Bosák, Juraj (703 Slovensko, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zieba, Jennifer (840 Spojené státy) -- Song, Jieun (410 Korejská republika) -- Konik, Peter (203 Česká republika) -- Park, Sohyun (840 Spojené státy) -- Duran, Ivan (840 Spojené státy) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Šmajs, David (203 Česká republika, domácí) -- Jansen, Gert (528 Nizozemské království) -- Fu, Zheng (840 Spojené státy) -- Ko, Hyuk Wan (410 Korejská republika) -- Hampl, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Krakow, Deborah (840 Spojené státy) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: fibroblast growth factor; FGFR; intestinal cell kinase; ICK; cilia length
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 2. 11. 2024 20:18.
    6. TVRDOŇOVÁ, Michaela, Marcela VLČNOVSKÁ, Lucie VANICKOVA, Viktor KANICKÝ, Vojtěch ADAM, Lena ASCHER, Norbert JAKUBOWSKI, Markéta VACULOVIČOVÁ a Tomáš VACULOVIČ. Gold nanoparticles as labels for immunochemical analysis using laser ablation inductively coupled plasma mass spectrometry. Analytical and Bioanalytical chemistry. HEIDELBERG: SPRINGER HEIDELBERG, 2019, roč. 411, č. 3, s. 559-564. ISSN 1618-2642. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00216-018-1300-7.
      URL
      RIV/00216224:14310/19:00107331 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Tvrdoňová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Vlčnovská, Marcela (203 Česká republika) -- Vanickova, Lucie (203 Česká republika) -- Kanický, Viktor (203 Česká republika, domácí) -- Adam, Vojtěch (203 Česká republika) -- Ascher, Lena (276 Německo) -- Jakubowski, Norbert (276 Německo) -- Vaculovičová, Markéta (203 Česká republika) -- Vaculovič, Tomáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Dot blot; Antibody labelling; Gold nanoparticles; LA-ICP-MS; Immunochemistry
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 29. 4. 2020 10:33.
    7. ŠEBESTÍKOVÁ, Jana, Tereza VÁŇOVÁ, Lucie PEŠKOVÁ, Kateřina KONEČNÁ, Martin VÁCHA, Michael ANDÄNG a Tomáš BÁRTA. Human retinal organoids as a tool for investigation of circadian rhythms. In 8. ročník Stem Cells and Cell Therapy: From Research to Modern Clinical Applications. 2019.
      Název česky: Human retinal organoids as a tool for investigation of circadian rhythms.
      Název anglicky: Human retinal organoids as a tool for investigation of circadian rhythms.

      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Jana Šebestíková, učo 473806. Změněno: 23. 1. 2020 10:58.
    8. KRAFČÍKOVÁ, Michaela, R. HANSEL-HERTSCH, Lukáš TRANTÍREK a Silvie TRANTÍRKOVÁ. In Cell NMR Spectroscopy: Investigation of G-Quadruplex Structures Inside Living Xenopus laevis Oocytes. G-QUADRUPLEX NUCLEIC ACIDS: METHODS AND PROTOCOLS. TOTOWA: HUMANA PRESS INC, 2019, roč. 2035, č. 2019, s. 397-405. ISSN 1064-3745. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-1-4939-9666-7_25.
      URL
      RIV/00216224:14740/19:00108250 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Krafčíková, Michaela (703 Slovensko, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: In-cell NMR; Xenopus laevis oocyte; DNA; RNA; G-quadruplex
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 6. 4. 2020 18:49.
    9. VÍŠKOVÁ, Pavlína, Daniel KRAFČÍK, Lukáš TRANTÍREK a Silvie TRANTÍRKOVÁ. In-Cell NMR Spectroscopy of Nucleic Acids in Human Cells. Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry. United States: Wiley-Liss Inc, 2019, roč. 76, č. 1, s. 1-14. ISSN 1934-9270. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cpnc.71.
      URL
      RIV/00216224:14740/19:00108251 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Víšková, Pavlína (203 Česká republika, domácí) -- Krafčík, Daniel (703 Slovensko, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DNA; eukaryotic cellin-cell NMR spectroscopy; mammalian cell
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 29. 4. 2020 11:46.
    10. VLČNOVSKÁ, Marcela, Michaela KUCHYNKA, Aneta ŠTOSSOVÁ, Hana HOLCOVÁ POLANSKÁ, Marketa VACULOVICOVA, Tomáš VACULOVIČ a Michal MASAŘÍK. LA-ICP-MS as a sensitive method for detection of nanoparticle-antibody conjugates in immunochemistry analysis. Online. In Cerkal, R Belcredi, NB Prokesova, L Pilatova, A. MENDELNET 2019: PROCEEDINGS OF 26TH INTERNATIONAL PHD STUDENTS CONFERENCE. Brno: MENDEL UNIV BRNO, 2019, s. 682-686. ISBN 978-80-7509-688-3.
      URL
      RIV/00216224:14310/19:00114693 Stať ve sborníku. angličtina. Česká republika.
      Vlčnovská, Marcela (203 Česká republika, domácí) -- Kuchynka, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Štossová, Aneta (203 Česká republika, domácí) -- Holcová Polanská, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Vaculovič, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Masařík, Michal (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: gold nanoparticles; LA-ICP-MS; immunochemistry; dot-blot; protein detection; p53
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 18. 1. 2021 13:23.
    11. VANECKOVA, T., L. VANICKOVA, Michaela TVRDOŇOVÁ, A. POMORSKI, A. KREZEL, Tomáš VACULOVIČ, Viktor KANICKÝ, M. VACULOVICOVA a V. ADAM. Molecularly imprinted polymers coupled to mass spectrometric detection for metallothionein sensing. Talanta. AMSTERDAM: Elsevier, 2019, roč. 198, JUN, s. 224-229. ISSN 0039-9140. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.talanta.2019.01.089.
      URL
      RIV/00216224:14310/19:00108189 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Tvrdoňová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Vaculovič, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Kanický, Viktor (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Metallothionein; Molecularly imprinted polymers; Polydopamine; MALDI-TOP-MS; LA-ICP-MS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 17. 3. 2020 20:25.
    12. KRAFČÍKOVÁ, Michaela, Šimon DŽATKO, C. CARON, A. GRANZHAN, Radovan FIALA, Tomáš LOJA, M.P. TEULADE-FICHOU, T. FESSL, R. HANSEL-HERTSCH, J.L. MERGNY, S. FOLDYNOVA-TRANTIRKOVA a Lukáš TRANTÍREK. Monitoring DNA-Ligand Interactions in Living Human Cells Using NMR Spectroscopy. Journal of the American Chemical Society. Washington: American Chemical Society, 2019, roč. 141, č. 34, s. 13281-13285. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jacs.9b03031.
      URL
      RIV/00216224:14740/19:00107756 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Krafčíková, Michaela (703 Slovensko, domácí) -- Džatko, Šimon (703 Slovensko, domácí) -- Caron, C. (250 Francie) -- Granzhan, A. (250 Francie) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Teulade-Fichou, M.P. (250 Francie) -- Fessl, T. (203 Česká republika) -- Hansel-Hertsch, R. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Mergny, J.L. (250 Francie) -- Foldynova-Trantirkova, S. (203 Česká republika) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: MINOR-GROOVE; NUCLEIC-ACID; DRUG DESIGN; DISCOVERY; BINDERS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 30. 10. 2024 14:10.
    13. ČULEN, Martin, Marianna ROMŽOVÁ, Dagmar SMITALOVÁ, Tomáš LOJA a Jiří MAYER. Multicolor Immunophenotyping of Candidate Leukemic Stem Cell Markers in CD34+CD38- Chronic Myeloid Leukemia Stem Cells. In 61st ASH Annual Meeting and Exposition, Orlando, Florida, USA. 2019.
      Změnila: Bc. Kateřina Kolesová, učo 112275. Změněno: 24. 1. 2020 10:40.
    14. KUCHYNKA, Michaela, Michal MASAŘÍK, Marcela VLČNOVSKÁ, Viktor KANICKÝ a Tomáš VACULOVIČ. Nanoparticles as tags for protein tissue analysis using laser ablation inductively coupled plasma and mass spectrometry. 2019.
      URL URL
      Název anglicky: Nanoparticles as tags for protein tissue analysis using laser ablation inductively coupled plasma and mass spectrometry

      Klíčová slova anglicky: Nanoparticles; Bioimaging; LA, ICP, MS; Immunochemistry
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Michaela Kuchynka, Ph.D., učo 358018. Změněno: 21. 10. 2022 13:20.
    15. STADLBAUER, P., P. KUHROVA, Lukáš VICHEREK, P. BANAS, M. OTYEPKA, Lukáš TRANTÍREK a Jiří ŠPONER. Parallel G-triplexes and G-hairpins as potential transitory ensembles in the folding of parallel-stranded DNA G-Quadruplexes. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2019, roč. 47, č. 14, s. 7276-7293. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkz610.
      URL
      RIV/00216224:14740/19:00108142 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Stadlbauer, P. (203 Česká republika) -- Kuhrova, P. (203 Česká republika) -- Vicherek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Banas, P. (203 Česká republika) -- Otyepka, M. (203 Česká republika) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Šponer, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: TELOMERIC G-QUADRUPLEX; AMBER FORCE-FIELD; MONOVALENT ION PARAMETERS; SINGLE-MOLECULE FRET; PARTICLE MESH EWALD; NUCLEIC-ACIDS; REPLICA-EXCHANGE; K+ SOLUTION; CRYSTAL-STRUCTURE; ENERGY LANDSCAPE
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 8. 3. 2020 20:10.
    16. MUNSTER, Lukas, Michaela FOJTŮ, Zdenka CAPAKOVA, Tomáš VACULOVIČ, Michaela TVRDOŇOVÁ, Ivo KURITKA, Michal MASAŘÍK a Jan VICHA. Selectively Oxidized Cellulose with Adjustable Molecular Weight for Controlled Release of Platinum Anticancer Drugs. Biomacromolecules. Washington: American Chemical Society, 2019, roč. 20, č. 4, s. 1623-1634. ISSN 1525-7797. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.biomac.8b01807.
      URL
      RIV/00216224:14110/19:00107804 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Munster, Lukas (203 Česká republika) -- Fojtů, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Capakova, Zdenka (203 Česká republika) -- Vaculovič, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Tvrdoňová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Kuritka, Ivo (203 Česká republika) -- Masařík, Michal (203 Česká republika, garant, domácí) -- Vicha, Jan (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: NMR CHEMICAL-SHIFTS; DENSITY-FUNCTIONAL THEORY; RELATIVISTIC DOUBLE-ZETA; HYALURONIC-ACID; DIALDEHYDE CELLULOSE; TRIPLE-ZETA; BASIS-SETS; PT-195 NMR; CISPLATIN; PERIODATE
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 31. 3. 2020 22:07.
    17. SKOLAKOVA, P., D. RENCIUK, J. PALACKY, Daniel KRAFČÍK, Z. DVORAKOVA, I. KEJNOVSKA, K. BEDNAROVA a M. VORLICKOVA. Systematic investigation of sequence requirements for DNA i-motif formation. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2019, roč. 47, č. 5, s. 2177-2189. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkz046.
      URL
      RIV/00216224:14740/19:00108184 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Skolakova, P. (203 Česká republika) -- Renciuk, D. (203 Česká republika) -- Palacky, J. (203 Česká republika) -- Krafčík, Daniel (703 Slovensko, garant, domácí) -- Dvorakova, Z. (203 Česká republika) -- Kejnovska, I. (203 Česká republika) -- Bednarova, K. (203 Česká republika) -- Vorlickova, M. (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: GENE-EXPRESSION; RATIONAL DESIGN; G-QUADRUPLEX; LOOP LENGTH; STABILITY; THERMODYNAMICS; KINETICS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 12. 3. 2020 09:23.

    2018

    1. GIASSA, Ilektra-Chara, Jan RYNEŠ, T. FESSL, Silvie TRANTÍRKOVÁ a Lukáš TRANTÍREK. Advances in the cellular structural biology of nucleic acids. FEBS LETTERS. HOBOKEN: WILEY, 2018, roč. 592, č. 12, s. 1997-2011. ISSN 1873-3468. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/1873-3468.13054.
      URL
      RIV/00216224:14740/18:00101748 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Giassa, Ilektra-Chara (300 Řecko, domácí) -- Ryneš, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Fessl, T. (203 Česká republika) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DNA; in-cell chemical probing; in-cell EPR; in-cell NMR; in-cell single-molecule FRET; RNA
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 15. 3. 2019 13:58.
    2. HARNOŠ, Jakub, Jan RYNEŠ, Pavlína VÍŠKOVÁ, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Lola Murielle BAJARD ÉP.ESNER, Lukáš TRANTÍREK a Vítězslav BRYJA. Analysis of binding interfaces of the human scaffold protein AXIN1 by peptide microarrays. Journal of Biological Chemistry. Bethesda, USA: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2018, roč. 293, č. 42, s. 16337-16347. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.RA118.005127.
      URL
      RIV/00216224:14310/18:00101698 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Harnoš, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Ryneš, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Víšková, Pavlína (203 Česká republika, domácí) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika, domácí) -- Bajard ép.Esner, Lola Murielle (250 Francie, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: peptide array; scaffold protein; axin; serine; threonine protein kinase; p53; Myc (c-Myc); casein kinase 1E; dishevelled; intrinsically disordered region; Wnt pathway
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2019 13:07.
    3. DŽATKO, Šimon, Michaela KRAFČÍKOVÁ, R. HANSEL-HERTSCH, T. FESSL, Radovan FIALA, Tomáš LOJA, Daniel KRAFČÍK, J.L. MERGNY, Silvie TRANTÍRKOVÁ a Lukáš TRANTÍREK. Evaluation of the Stability of DNA i-Motifs in the Nuclei of Living Mammalian Cells. Angewandte Chemie International Edition. WEINHEIM (GERMANY): Verlag Chemie, 2018, roč. 57, č. 8, s. 2165-2169. ISSN 1433-7851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/anie.201712284.
      RIV/00216224:14740/18:00100847 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Džatko, Šimon (703 Slovensko, domácí) -- Krafčíková, Michaela (703 Slovensko, domácí) -- Hansel-Hertsch, R. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Fessl, T. (203 Česká republika) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Krafčík, Daniel (703 Slovensko, domácí) -- Mergny, J.L. (250 Francie) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DNA; i-motifs; in-cell NMR spectroscopy; structural biology
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 13:16.
    4. DVOŘÁKOVÁ, Zuzana, Daniel RENČIUK, Iva KEJNOVSKÁ, Petra ŠKOLÁKOVÁ, Klára BEDNÁŘOVÁ, J SAGI a Michaela VORLÍČKOVÁ. i-Motif of cytosine-rich human telomere DNA fragments containing natural base lesions. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2018, roč. 46, č. 4, s. 1624-1634. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gky035.
      URL
      angličtina.
      Změnila: Mgr. Zuzana Dvořáková, Ph.D., učo 211080. Změněno: 9. 4. 2018 15:13.
    5. VERLANDE, Amandine, Michaela KRAFČÍKOVÁ, David POTĚŠIL, Lukáš TRANTÍREK, Zbyněk ZDRÁHAL, M. ELKALAF, J. TRNKA, Karel SOUČEK, N. RAUCH, J. RAUCH, W. KOLCH a Stjepan ULDRIJAN. Metabolic stress regulates ERK activity by controlling KSR-RAF heterodimerization. EMBO reports. Hoboken: Wiley-Blackwell, 2018, roč. 19, č. 2, s. 320-336. ISSN 1469-221X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.15252/embr.201744524.
      RIV/00216224:14110/18:00100832 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Verlande, Amandine (250 Francie, domácí) -- Krafčíková, Michaela (703 Slovensko, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Elkalaf, M. (203 Česká republika) -- Trnka, J. (203 Česká republika) -- Souček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Rauch, N. (372 Irsko) -- Rauch, J. (372 Irsko) -- Kolch, W. (372 Irsko) -- Uldrijan, Stjepan (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: cell cycle arrest; cell survival; melanoma; metabolic stress; RAF-ERK signaling
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 6. 3. 2019 13:35.
    6. CLARK, S., J.B. MYERS, A. KING, Radovan FIALA, Jiří NOVÁČEK, G. PEARCE, J. HEIERHORST, S.L. REICHOW a E.J. BARBAR. Multivalency regulates activity in an intrinsically disordered transcription factor. elife. CAMBRIDGE: ELIFE SCIENCES PUBLICATIONS LTD, 2018, roč. 7, MAY, s. 1-28. ISSN 2050-084X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.7554/eLife.36258.
      RIV/00216224:14740/18:00106665 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Clark, S. (840 Spojené státy) -- Myers, J.B. (840 Spojené státy) -- King, A. (36 Austrálie) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Pearce, G. (554 Nový Zéland) -- Heierhorst, J. (36 Austrálie) -- Reichow, S.L. (840 Spojené státy) -- Barbar, E.J. (840 Spojené státy)
      Klíčová slova anglicky: DYNEIN LIGHT-CHAIN; BINDING PROTEIN CBP; C-TERMINAL DOMAIN; MULTISITE PHOSPHORYLATION; UNSTRUCTURED REGION; DNA-BINDING; LC8; COMPLEX; DYNLL1; ASCIZ
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 19. 3. 2019 16:32.
    7. BÁLEK, Lukáš, Marcela BUCHTOVÁ, Michaela BOSÁKOVÁ, Miroslav VAŘECHA, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Iva GUDERNOVÁ, Iva VESELÁ, Jan HAVLIK, Jitka NEBURKOVA, Stuart TURNER, Mateusz Adam KRZYSCIK, Malgorzata ZAKRZEWSKA, Lars KLIMASCHEWSKI, Peter CLAUS, Lukáš TRANTÍREK, Petr CIGLER a Pavel KREJČÍ. Nanodiamonds as "artificial proteins": Regulation of a cell signalling system using low nanomolar solutions of inorganic nanocrystals. Biomaterials. OXFORD: ELSEVIER SCI LTD, 2018, roč. 176, SEP 2018, s. 106-121. ISSN 0142-9612. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.biomaterials.2018.05.030.
      URL
      RIV/00216224:14110/18:00101655 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Bálek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Buchtová, Marcela (203 Česká republika, domácí) -- Bosáková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Vařecha, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika, domácí) -- Gudernová, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Veselá, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Havlik, Jan (203 Česká republika) -- Neburkova, Jitka (203 Česká republika) -- Turner, Stuart (56 Belgie) -- Krzyscik, Mateusz Adam (616 Polsko) -- Zakrzewska, Malgorzata (56 Belgie) -- Klimaschewski, Lars (40 Rakousko) -- Claus, Peter (276 Německo) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Cigler, Petr (203 Česká republika) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nanodiamonds; Cell signalling; FGF; Fibroblast growth factor; Nanotherapeutics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 20. 4. 2022 12:40.
    8. TRANTÍREK, Lukáš. NMR spectroscopy of nucleic acids in human cells. In 43rd FEBS Congress Prague. 2018. ISSN 2211-5463.
      RIV/00216224:14740/18:00101760 Konferenční abstrakt. angličtina. Spojené státy.
      Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR spectroscopy; nucleic acids; human cells
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 6. 3. 2019 15:55.
    9. GONZÁLEZ-OLVERA, Julio C., Matúš DUREC, Radek MAREK, Radovan FIALA, María del Rosario J. MORALES-GARCÍA, Eva GONZÁLEZ-JASSO a Reynaldo Carlos PLESS. Protonation of nucleobases in single- and double-stranded DNA. ChemBioChem. Weinheim: WILEY-VCH, 2018, roč. 19, č. 19, s. 2088-2098. ISSN 1439-4227. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cbic.201800310.
      DOI: 10.1002/cbic.201800310
      RIV/00216224:14740/18:00103378 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      González-Olvera, Julio C. (484 Mexiko) -- Durec, Matúš (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Morales-García, María del Rosario J. (484 Mexiko) -- González-Jasso, Eva (484 Mexiko) -- Pless, Reynaldo Carlos (484 Mexiko)
      Klíčová slova anglicky: oligonucleotide; DNA; strand; NMR; UV; protonation; cytosine; 5-methyl cytosine
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 16:42.
    10. FAFÍLEK, Bohumil, Lukáš BÁLEK, Michaela BOSÁKOVÁ, Miroslav VAŘECHA, Alexandru NITĂ, Tomáš GREGOR, Iva GUDERNOVÁ, Jitka KŘENOVÁ, S. GHOSH, Martin PISKÁČEK, Lucie JONATOVA, Nicole ČERNOHORSKÁ, J.T. ZIEBA, M. KOSTAS, E.M. HAUGSTEN, J. WESCHE, C. ERNEUX, Lukáš TRANTÍREK, D. KRAKOW a Pavel KREJČÍ. The inositol phosphatase SHIP2 enables sustained ERK activation downstream of FGF receptors by recruiting Src kinases. SCIENCE SIGNALING. WASHINGTON: AMER ASSOC ADVANCEMENT SCIENCE, 2018, roč. 11, č. 548, s. 1-14. ISSN 1945-0877. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1126/scisignal.aap8608.
      RIV/00216224:14110/18:00101653 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Fafílek, Bohumil (203 Česká republika, domácí) -- Bálek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Bosáková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Vařecha, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Nită, Alexandru (642 Rumunsko, domácí) -- Gregor, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Gudernová, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Křenová, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Ghosh, S. (56 Belgie) -- Piskáček, Martin (40 Rakousko, domácí) -- Jonatova, Lucie (203 Česká republika) -- Černohorská, Nicole (203 Česká republika, domácí) -- Zieba, J.T. (840 Spojené státy) -- Kostas, M. (578 Norsko) -- Haugsten, E.M. (578 Norsko) -- Wesche, J. (578 Norsko) -- Erneux, C. (56 Belgie) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Krakow, D. (840 Spojené státy) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: The inositol phosphatase SHIP2
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 8. 3. 2019 16:00.
    11. CSUKASI, F., I. DURAN, M. BARAD, Tomáš BÁRTA, Iva GUDERNOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, J.H. MARTIN, C.Y. KUO, J. WOODS, H. LEE, D.H. COHN, Pavel KREJČÍ a D. KRAKOW. The PTH/PTHrP-SIK3 pathway affects skeletogenesis through altered mTOR signaling. Science Translational Medicine. Washington: American Association for the Advancement of Science, 2018, roč. 10, č. 459, s. 1-11. ISSN 1946-6234. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1126/scitranslmed.aat9356.
      RIV/00216224:14110/18:00101652 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Csukasi, F. (840 Spojené státy) -- Duran, I. (840 Spojené státy) -- Barad, M. (840 Spojené státy) -- Bárta, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Gudernová, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Martin, J.H. (840 Spojené státy) -- Kuo, C.Y. (840 Spojené státy) -- Woods, J. (840 Spojené státy) -- Lee, H. (840 Spojené státy) -- Cohn, D.H. (840 Spojené státy) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Krakow, D. (840 Spojené státy, garant)
      Klíčová slova anglicky: mTOR
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 12. 3. 2019 16:30.

    2017

    1. DŽATKO, Šimon, Michaela KRAFČÍKOVÁ, Radovan FIALA, Tomáš FESSL, Tomáš LOJA, C. CARON, A. GRANZHAN, M.P. TEULADE FICHOU, J.L. MERGNY, Silvie TRANTÍRKOVÁ a Lukáš TRANTÍREK. Cellular structural biology of nucleic acids. In 42nd FEBS Congress, Jerusalem, Izrael, září 2017 in The FEBS Journal (2017). 2017. ISSN 1742-464X.
      RIV/00216224:14740/17:00095290 Konferenční abstrakt. angličtina. Spojené státy.
      Džatko, Šimon (703 Slovensko, domácí) -- Krafčíková, Michaela (703 Slovensko, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Fessl, Tomáš (203 Česká republika) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Caron, C. (250 Francie) -- Granzhan, A. (250 Francie) -- Teulade Fichou, M.P. (250 Francie) -- Mergny, J.L. (250 Francie) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: nucleic acids; DNA
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 18. 3. 2018 20:29.
    2. KEJNOVSKÁ, Iva, Klára BEDNÁŘOVÁ, Daniel RENČIUK, Zuzana DVOŘÁKOVÁ, Petra ŠKOLÁKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, Radovan FIALA, Michaela VORLÍČKOVÁ a J. SAGI. Clustered abasic lesions profoundly change the structure and stability of human telomeric G-quadruplexes. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2017, roč. 45, č. 8, s. 4294-4305. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkx191.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00095078 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Kejnovská, Iva (203 Česká republika) -- Bednářová, Klára (203 Česká republika) -- Renčiuk, Daniel (203 Česká republika) -- Dvořáková, Zuzana (203 Česká republika) -- Školáková, Petra (203 Česká republika) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Vorlíčková, Michaela (203 Česká republika) -- Sagi, J. (840 Spojené státy)
      Klíčová slova anglicky: DNA-DAMAGE CLUSTERS; K+ SOLUTION; GUANINE QUADRUPLEXES; IONIZING-RADIATION; BASE LESIONS; CELLS; 8-OXOGUANINE; SEQUENCE; TETRAD; SITES
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 3. 2018 14:52.
    3. BOSTROM, Johan, Zuzana ŠRÁMKOVÁ, Alena SALAŠOVÁ, Helena Anna Dagmar JOHARD, Diana MAHDESSIAN, Radek FEDR, Carolyn MARKS, Jiřina MEDALOVÁ, Karel SOUČEK, Emma LUNDBERG, Sten LINNARSON, Vítězslav BRYJA, Petra SEKYROVÁ, Mikael ALTUN a Michael ANDÄNG. Comparative cell cycle transcriptomics reveals synchronization of developmental transcription factor networks in cancer cells. PLOS ONE. Public Library of Science, 2017, roč. 12, č. 12, s. 0188772-188795. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0188772.
      URL
      Název anglicky: Comparative cell cycle transcriptomics reveals synchronization of developmental transcription factor networks in cancer cells
      RIV/00216224:14740/17:00095459 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Bostrom, Johan (752 Švédsko) -- Šrámková, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Salašová, Alena (203 Česká republika) -- Johard, Helena Anna Dagmar (752 Švédsko, domácí) -- Mahdessian, Diana (752 Švédsko) -- Fedr, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Marks, Carolyn (752 Švédsko) -- Medalová, Jiřina (203 Česká republika) -- Souček, Karel (203 Česká republika) -- Lundberg, Emma (752 Švédsko) -- Linnarson, Sten (752 Švédsko) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika) -- Sekyrová, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Altun, Mikael (752 Švédsko) -- Andäng, Michael (752 Švédsko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: cell cycle; synchronization; fucci reporter
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 3. 2018 15:55.
    4. RENCIUK, D., Jan RYNEŠ, I. KEJNOVSKA, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Michael ANDÄNG, Lukáš TRANTÍREK a M. VORLICKOVA. G-quadruplex formation in the Oct4 promoter positively regulates Oct4 expression. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENE REGULATORY MECHANISMS. AMSTERDAM: ELSEVIER SCIENCE BV, 2017, roč. 1860, č. 2, s. 175-183. ISSN 1874-9399. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bbagrm.2016.11.002.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00095539 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Renciuk, D. (203 Česká republika) -- Ryneš, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Kejnovska, I. (203 Česká republika) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika, domácí) -- Andäng, Michael (752 Švédsko, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Vorlickova, M. (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Guanine quadruplex; Oct4; Transcription regulation; Circular dichroism; Luciferase reporter; Human embryonic stem cells
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 3. 2018 15:15.
    5. DŽATKO, Šimon, Michaela KRAFČÍKOVÁ, Radovan FIALA, Tomáš FESSL, Tomáš LOJA, JL. MERGNY, Silvie TRANTÍRKOVÁ a TRANTÍREK. Characterization of Non-B DNA structures in complex environment of mammalian cells by in cell NMR spectroscopy. In G4thering - 6th International Meeting on Quadruplex Nucleic Acids, Praha. 2017.
      Změnila: Ing. Kateřina Ornerová, Ph.D., učo 116800. Změněno: 8. 1. 2018 15:44.
    6. GUDERNOVÁ, Iva, Lukáš BÁLEK, Miroslav VAŘECHA, Jana FIALOVÁ KUČEROVÁ, Michaela BOSÁKOVÁ, Bohumil FAFÍLEK, Veronika PALUŠOVÁ, Stjepan ULDRIJAN, Lukáš TRANTÍREK a Pavel KREJČÍ. Inhibitor repurposing reveals ALK, LTK, FGFR, RET and TRK kinases as the targets of AZD1480. Oncotarget. New York: Impact Journals LLC, 2017, roč. 8, č. 65, s. 109319-109331. ISSN 1949-2553. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.18632/oncotarget.22674.
      http://www.oncotarget.com/index.php?journal=oncotarget&page=article&op=view&path[]=22674&pubmed-linkout=1
      Název anglicky: Inhibitor repurposing reveals ALK, LTK, FGFR, RET and TRK kinases as the targets of AZD1480
      RIV/00216224:14110/17:00095429 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Gudernová, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Bálek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Vařecha, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Fialová Kučerová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Bosáková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Fafílek, Bohumil (203 Česká republika, domácí) -- Palušová, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Uldrijan, Stjepan (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: AZD1480; drug repurposing; in-cell profiling; inhibitor; receptor tyrosine kinase
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Soňa Böhmová, učo 232884. Změněno: 13. 3. 2018 16:37.
    7. NIKLASSON, M., G. MADDALO, Zuzana ŠRÁMKOVÁ, E. MUTLU, S. WEE, Petra SEKYROVÁ, L. SCHMIDT, N. FRITZ, I. DEHNISCH, G. KYRIATZIS, Michaela KRAFČÍKOVÁ, B.B. CARSON, J.M. FEENSTRA, V.D. MARINESCU, A. SEGERMAN, M. HARALDSSON, A.L. GUSTAVSSON, L.G.J. HAMMARSTROM, A.J. JENSEN, L. UHRBOM, A.F.M. ALTELAAR, S. LINNARSSON, P. UHLEN, Lukáš TRANTÍREK, C.T. VINCENT, S. NELANDER, P.O. ENGER a Michael ANDÄNG. Membrane-Depolarizing Channel Blockers Induce Selective Glioma Cell Death by Impairing Nutrient Transport and Unfolded Protein/Amino Acid Responses. Cancer Research. PHILADELPHIA: AMER ASSOC CANCER RESEARCH, 2017, roč. 77, č. 7, s. 1741-1752. ISSN 0008-5472. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-16-2274.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00095470 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Niklasson, M. (752 Švédsko) -- Maddalo, G. (528 Nizozemské království) -- Šrámková, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Mutlu, E. (578 Norsko) -- Wee, S. (752 Švédsko) -- Sekyrová, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Schmidt, L. (752 Švédsko) -- Fritz, N. (752 Švédsko) -- Dehnisch, I. (752 Švédsko) -- Kyriatzis, G. (752 Švédsko) -- Krafčíková, Michaela (703 Slovensko, domácí) -- Carson, B.B. (840 Spojené státy) -- Feenstra, J.M. (752 Švédsko) -- Marinescu, V.D. (752 Švédsko) -- Segerman, A. (752 Švédsko) -- Haraldsson, M. (752 Švédsko) -- Gustavsson, A.L. (752 Švédsko) -- Hammarstrom, L.G.J. (752 Švédsko) -- Jensen, A.J. (752 Švédsko) -- Uhrbom, L. (752 Švédsko) -- Altelaar, A.F.M. (528 Nizozemské království) -- Linnarsson, S. (752 Švédsko) -- Uhlen, P. (752 Švédsko) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Vincent, C.T. (752 Švédsko) -- Nelander, S. (752 Švédsko) -- Enger, P.O. (752 Švédsko) -- Andäng, Michael (752 Švédsko, domácí)
      Klíčová slova anglicky: TUMOR-INITIATING CELLS; CANCER STEM-CELLS; T-TYPE; HUMAN GLIOBLASTOMA; MULTIDRUG-RESISTANCE; GENE-EXPRESSION; HIGH-THROUGHPUT; INHIBITION; CULTURE; IDENTIFICATION
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 4. 2018 12:46.
    8. LINKE, F., M. HARENBERG, M.M. NIETERT, S. ZAUNIG, von Bonin F., A. ARLT, M. SZCZEPANOWSKI, HA WEICH, S. LUTZ, C. DULLIN, Pavlína JANOVSKÁ, Michaela KRAFČÍKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, Petra OVESNÁ, W. KLAPPER, T. BEISSBARTH, F. ALVES, Vítězslav BRYJA, L. TRÜMPER, J. WILTING a Dieter KUBE. Microenvironmental interactions between endothelial and lymphoma cells: a role for the canonical WNT pathway in Hodgkin lymphoma. Leukemia. London: Nature Publishing Group, 2017, roč. 31, č. 2, s. 361-372. ISSN 0887-6924. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/leu.2016.232.
      URL
      Název anglicky: Microenvironmental interactions between endothelial and lymphoma cells: a role for the canonical WNT pathway in Hodgkin lymphoma
      RIV/00216224:14310/17:00095626 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Linke, F. (276 Německo) -- Harenberg, M. (276 Německo) -- Nietert, M.M. (276 Německo) -- Zaunig, S. (276 Německo) -- F., von Bonin (276 Německo) -- Arlt, A. (276 Německo) -- Szczepanowski, M. (276 Německo) -- Weich, HA (276 Německo) -- Lutz, S. (276 Německo) -- Dullin, C. (276 Německo) -- Janovská, Pavlína (203 Česká republika, domácí) -- Krafčíková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Ovesná, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Klapper, W. (276 Německo) -- Beissbarth, T. (276 Německo) -- Alves, F. (276 Německo) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, domácí) -- Trümper, L. (276 Německo) -- Wilting, J. (276 Německo) -- Kube, Dieter (276 Německo, garant)
      Klíčová slova anglicky: CHRONIC LYMPHOCYTIC-LEUKEMIA; CHEMOKINE RECEPTOR CCR7; FUNCTIONAL CD30 LIGAND; GROWTH-FACTOR; CONSTITUTIVE ACTIVATION; TUMOR; EXPRESSION; DISEASE; DISSEMINATION; VEGF
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Nicole Zrilić, učo 240776. Změněno: 9. 4. 2018 10:47.
    9. KRAFČÍKOVÁ, Michaela, Šimon DŽATKO, Tomáš LOJA, Radovan FIALA, A GRANZHAN, MP. TEULADE-FICHOU, C. CARON, Silvie TRANTÍRKOVÁ a TRANTÍREK. Monitoring DNA-ligand interactions using in cell NMR spectroscopy. In G4thering - 6th International Meeting on Quadruplex Nucleic Acids, Praha. 2017.
      Změnila: Ing. Kateřina Ornerová, Ph.D., učo 116800. Změněno: 8. 1. 2018 15:45.
    10. NOVOTNÝ, Aleš, Jan NOVOTNÝ, Radovan FIALA a Radek MAREK. NMR STUDY OF d(CCCGAGA) i-MOTIF STRUCTURE. In 32nd NMR VALTICE. 2017. ISBN 978-80-86441-49-8.
      RIV/00216224:14740/17:00113582 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Novotný, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Novotný, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR; i-MOTIF

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 7. 4. 2020 10:51.
    11. GUDERNOVÁ, Iva, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Barbora EL GHANNAMOVÁ, Bohumil FAFÍLEK, Miroslav VAŘECHA, Lukáš BÁLEK, Eva HRUBÁ, Lucie JONÁTOVÁ, Iva JELÍNKOVÁ, Michaela BOSÁKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, Jiří MAYER a Pavel KREJČÍ. One reporter for in-cell activity profiling of majority of protein kinase oncogenes. eLife. Cambridge: eLife Sciences Publications Ltd., 2017, roč. 6, "e21536", s. 1-14. ISSN 2050-084X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.7554/eLife.21536.
      RIV/00216224:14110/17:00094746 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Gudernová, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika, domácí) -- El Ghannamová, Barbora (203 Česká republika, domácí) -- Fafílek, Bohumil (203 Česká republika, domácí) -- Vařecha, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Bálek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Hrubá, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Jonátová, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Jelínková, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Bosáková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: FIBROBLAST-GROWTH-FACTOR; RECEPTOR TYROSINE KINASES; EMBRYONIC STEM-CELLS; INHIBITOR AZD9291; MULTIPLE-MYELOMA; PATHWAY; RESISTANCE; MUTATIONS; CANCER; ACHONDROPLASIA
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Soňa Böhmová, učo 232884. Změněno: 18. 3. 2018 15:15.
    12. GAJARSKÝ, Martin, Martina Lenarcic ZIVKOVIC, Petr STADLBAUER, Bruno PAGANO, Radovan FIALA, Jussara AMATO, L´ubomir TOMASKA, Jiří ŠPONER, Janez PLAVEC a Lukáš TRANTÍREK. Structure of a Stable G-Hairpin. Journal of the American Chemical Society. WASHINGTON: American Chemical Society, 2017, roč. 139, č. 10, s. 3591-3594. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jacs.6b10786.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00094788 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Gajarský, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Zivkovic, Martina Lenarcic (705 Slovinsko) -- Stadlbauer, Petr (203 Česká republika) -- Pagano, Bruno (380 Itálie) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Amato, Jussara (380 Itálie) -- Tomaska, L´ubomir (703 Slovensko) -- Šponer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Plavec, Janez (705 Slovinsko) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: G-QUADRUPLEX STRUCTURES; HUMAN TELOMERIC DNA; SINGLE-STRANDED-DNA; G-TRIPLEX; FOLDING PATHWAYS; KINETICS; RECOGNITION; VISUALIZATION; DETERMINANTS; REPEATS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 16. 6. 2017 14:06.
    13. RYNEŠ, Jan, T. FESSL, Michaela KRAFČÍKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK a Silvie TRANTÍRKOVÁ. Structure-activity relationships in polymorphic G-quadruplex forming segment of c-MYC promoter. In 42nd Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies (FEBS) on From Molecules to Cells and Back. 2017. ISSN 1742-464X.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00095589 Konferenční abstrakt. angličtina.
      Ryneš, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Fessl, T. (203 Česká republika) -- Krafčíková, Michaela (703 Slovensko, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: polymorphic G-quadruplex; c-MYC promoter
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 19. 3. 2018 16:51.
    14. GREGOR, Tomáš, Jan RYNEŠ, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Jiří MAYER, Pavel KREJČÍ a Lukáš TRANTÍREK. Systematic analysis of BCR-ABL interactome in chronic myeloid leukemia. In 42nd Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies (FEBS) on From Molecules to Cells and Back. 2017. ISSN 1742-464X.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00095713 Konferenční abstrakt. angličtina.
      Gregor, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Ryneš, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika, domácí) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: BCR-ABL; chronic myeloid leukemia
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 19. 3. 2018 17:00.

    2016

    1. TAYLOR, S. Paige, Michaela BOSÁKOVÁ, Miroslav VAŘECHA, Lukáš BÁLEK, Tomáš BÁRTA, Lukáš TRANTÍREK, Iva JELÍNKOVÁ, Ivan DURAN, Iva VESELÁ, Kimberly N. FORLENZA, Jorge H. MARTIN, Aleš HAMPL, Michael BAMSHAD, Deborah NICKERSON, Margie L. JAWORSKI, Jieun SONG, Hyuk WAN KO, Daniel H. COHN, Deborah KRAKOW a Pavel KREJČÍ. An inactivating mutation in intestinal cell kinase, ICK, impairs hedgehog signalling and causes short rib-polydactyly syndrome. Human Molecular Genetics. Oxford: Oxford University Press, 2016, roč. 25, č. 18, s. 3998-4011. ISSN 0964-6906. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/hmg/ddw240.
      RIV/00216224:14110/16:00092007 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Taylor, S. Paige (840 Spojené státy) -- Bosáková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Vařecha, Miroslav (203 Česká republika, domácí) -- Bálek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Bárta, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Jelínková, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Duran, Ivan (840 Spojené státy) -- Veselá, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Forlenza, Kimberly N. (840 Spojené státy) -- Martin, Jorge H. (840 Spojené státy) -- Hampl, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Bamshad, Michael (840 Spojené státy) -- Nickerson, Deborah (840 Spojené státy) -- Jaworski, Margie L. (840 Spojené státy) -- Song, Jieun (410 Korejská republika) -- Wan Ko, Hyuk (410 Korejská republika) -- Cohn, Daniel H. (840 Spojené státy) -- Krakow, Deborah (840 Spojené státy) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: signal transduction; mutation; fibroblast; cartilage; genes; epiphysial cartilage; erinaceidae; homozygote; intestines; phosphotransferases; polydactyly; ribs; short rib-polydactyly syndrome; cilia; long bone; whole exome sequencing
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 10. 4. 2017 17:34.
    2. VAVRINSKÁ, Andrea, Jiří ZELINKA, Jakub ŠEBERA, Vladimír SYCHROVSKÝ, Radovan FIALA, Rolf BOELENS, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš TRANTÍREK. Impact of nucleic acid self-alignment in a strong magnetic field on the interpretation of indirect spin–spin interactions. Journal of biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2016, roč. 64, č. 1, s. 53-62. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-015-0005-x.
      URL
      Název anglicky: Impact of nucleic acid self-alignment in a strong magnetic field on the interpretation of indirect spin–spin interactions
      RIV/00216224:14740/16:00087769 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Nizozemské království.
      Vavrinská, Andrea (703 Slovensko) -- Zelinka, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Šebera, Jakub (203 Česká republika) -- Sychrovský, Vladimír (203 Česká republika) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Boelens, Rolf (528 Nizozemské království) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nucleic acid; Self-alignment; Magnetic susceptibility; Scalar coupling; Dipolar coupling; Karplus equation

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 16. 3. 2017 12:17.
    3. SHYAMSUNDER, Pavithra, Milan EŠNER, Maunish BARVALIA, Yu Jun WU, Tomáš LOJA, Huat Bay BOON, Matilde E. LLEONART, Rama S VERMA, Lumír KREJČÍ a Alex LYAKHOVICH. Impaired mitophagy in Fanconi anemia is dependent on mitochondrial fission. Oncotarget. New York: Impact Journals, 2016, roč. 7, č. 36, s. 58065-58074. ISSN 1949-2553. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.18632/oncotarget.11161.
      RIV/00216224:14110/16:00091248 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Shyamsunder, Pavithra (702 Singapur) -- Ešner, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Barvalia, Maunish (356 Indie) -- Wu, Yu Jun (702 Singapur) -- Loja, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Boon, Huat Bay (702 Singapur) -- Lleonart, Matilde E. (724 Španělsko) -- Verma, Rama S (356 Indie) -- Krejčí, Lumír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Lyakhovich, Alex (643 Rusko, domácí)
      Klíčová slova anglicky: mitophagy; impaired autophagy; Fanconi anemia; ROS; oxidative stress
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 9. 1. 2017 14:30.
    4. VERLANDE, Amandine, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Michaela KRAFČÍKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, Karel SOUČEK, Jan TRNKA, W KOLCH a M ELKALAF. KSR proteins link metabolic changes to the MAPK/ERK pathway. In EACR 24: from basic research to precision medicine, Central Convention Complex, Manchester, UK, July 9-12, 2016, poster presentation. 2016.
      Název anglicky: KSR proteins link metabolic changes to the MAPK/ERK pathway
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Změnila: Mgr. Martina Vráblíková, učo 10839. Změněno: 18. 12. 2017 11:10.
    5. SLANINOVA, Vera, Michaela KRAFČÍKOVÁ, Raquel PEREZ-GOMEZ, Pavel STEFFAL, Lukáš TRANTÍREK, Sarah J. BRAY a Alena KREJCI. Notch stimulates growth by direct regulation of genes involved in the control of glycolysis and the tricarboxylic acid cycle. OPEN BIOLOGY. LONDON: ROYAL SOC, 2016, roč. 6, č. 2, s. nestránkováno, 14 s. ISSN 2046-2441. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1098/rsob.150155.
      URL
      RIV/00216224:14740/16:00093886 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Slaninova, Vera (203 Česká republika) -- Krafčíková, Michaela (703 Slovensko, domácí) -- Perez-Gomez, Raquel (203 Česká republika) -- Steffal, Pavel (203 Česká republika) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bray, Sarah J. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Krejci, Alena (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: metabolism; Notch targets; Warburg effect; glycolytic shift; tissue growth
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Michaela Krafčíková, Ph.D., učo 393655. Změněno: 5. 2. 2021 12:38.
    6. TŘÍSKOVÁ, Iveta, Radovan FIALA a Libuše TRNKOVÁ. Redox Processes of Guanine Moieties in DNA Heptamers Related to Hydrogen Evolution. Electroanalysis. 2016, roč. 28, č. 11, s. 2841-2848. ISSN 1040-0397. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/elan.201600321.
      URL
      RIV/00216224:14310/16:00093647 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Německo.
      Třísková, Iveta (203 Česká republika, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Trnková, Libuše (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Hairpins; NMR of DNA heptamers; cyclic voltammetry; hydrogen evolution reaction; vertex potential; neurodegenerative diseases

      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 23. 4. 2020 17:37.
    7. KADEŘÁVEK, Pavel, Vojtěch ZAPLETAL, Radovan FIALA, Pavel SRB, Petr PADRTA, Jana PAVLÍKOVÁ PŘECECHTĚLOVÁ, Mária ŠOLTÉSOVÁ, Jozef KOWALEWSKI, Göran WIDMALM, Josef CHMELÍK, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš ŽÍDEK. Spectral density mapping at multiple magnetic fields suitable for C-13 NMR relaxation studies. Journal of Magnetic Resonance. San Diego: Academic Press Inc. Elsevier Science, 2016, roč. 266, May, s. 23-40. ISSN 1090-7807. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jmr.2016.02.016.
      URL
      RIV/00216224:14740/16:00090497 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Srb, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Pavlíková Přecechtělová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Šoltésová, Mária (703 Slovensko) -- Kowalewski, Jozef (752 Švédsko) -- Widmalm, Göran (752 Švédsko) -- Chmelík, Josef (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nuclear magnetic resonance; Relaxation; Spectral density function; Magnetic field; Nucleic acids; Carbohydrates
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 27. 4. 2017 13:36.
    8. OMELYANENKO, Anna, Petra SEKYROVÁ a Michael ANDÄNG. ZD7288, a blocker of the HCN channel family, increases doubling time of mouse embryonic stem cells and modulates differentiation outcomes in a context-dependent manner. SpringerPlus. Cham: Springer International Publishing, 2016, roč. 5, January, s. nestránkováno, 10 s. ISSN 2193-1801. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s40064-016-1678-7.
      URL
      RIV/00216224:14740/16:00088770 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Švýcarsko.
      Omelyanenko, Anna (752 Švédsko) -- Sekyrová, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Andäng, Michael (752 Švédsko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Embryonic stem cells; Ion channel modulator; ZD7288; Differentiation; Proliferation; Pluripotency; Cell cycle; Serum

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 3. 2018 15:56.

    2015

    1. KANT, Sarina G., Iveta ČERVENKOVÁ, Lukáš BÁLEK, Lukáš TRANTÍREK, Gijs W. E. SANTEN, Martine C. de VRIES, Hermine A. van DUYVENVOORDE, Michiel J. R. van der WIELEN, Annemieke J. M. H. VERKERK, André G. UITTERLINDEN, Sabine E. HANNEMA, Jan M. WIT, Wilma OOSTDIJK, Pavel KREJČÍ a Monique LOSEKOOT. A novel variant of FGFR3 causes proportionate short stature. European Journal od Endocrinology. Bristol: Bioscientifica LTD, 2015, roč. 172, č. 6, s. 763-770. ISSN 0804-4643. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1530/EJE-14-0945.
      URL
      RIV/00216224:14110/15:00083441 Článek v odborném periodiku. Endokrinologie, diabetologie, metabolismus, výživa. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Kant, Sarina G. (528 Nizozemské království) -- Červenková, Iveta (703 Slovensko, domácí) -- Bálek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Santen, Gijs W. E. (528 Nizozemské království) -- Vries, Martine C. de (528 Nizozemské království) -- Duyvenvoorde, Hermine A. van (528 Nizozemské království) -- Wielen, Michiel J. R. van der (528 Nizozemské království) -- Verkerk, Annemieke J. M. H. (528 Nizozemské království) -- Uitterlinden, André G. (528 Nizozemské království) -- Hannema, Sabine E. (528 Nizozemské království) -- Wit, Jan M. (528 Nizozemské království) -- Oostdijk, Wilma (528 Nizozemské království) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Losekoot, Monique (528 Nizozemské království)
      Klíčová slova anglicky: FACTOR RECEPTOR-3 GENE; ASN540SER MUTATION; DUTCH CHILDREN; HYPOCHONDROPLASIA; ACTIVATION; PHENOTYPE; HEIGHT; FAMILY; LENGTH
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 5. 1. 2016 11:07.
    2. KAŠPAROVÁ, Helena, Zuzana DVOŘÁKOVÁ, Daniel RENČIUK, Klára BEDNÁŘOVÁ, Iva KEJNOVSKÁ, Lukáš TRANTÍREK, Michaela VORLÍČKOVÁ a Janos SAGI. Diverse effects of naturally occurring base lesions on the structure and stability of the human telomere DNA quadruplex. Biochimie. Paris: Elsevier France- editions Scientifiques Medicales Elsevier, 2015, roč. 118, Nov, s. 15-25. ISSN 0300-9084. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.biochi.2015.07.013.
      Full Text
      RIV/00216224:14740/15:00081336 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Francie.
      Kašparová, Helena (203 Česká republika, domácí) -- Dvořáková, Zuzana (203 Česká republika, domácí) -- Renčiuk, Daniel (203 Česká republika, domácí) -- Bednářová, Klára (203 Česká republika, domácí) -- Kejnovská, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Vorlíčková, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí) -- Sagi, Janos (840 Spojené státy)
      Klíčová slova anglicky: DNA secondary structure; Circular dichroism spectroscopy; Guanine quadruplex; Base modification; Oxidative damage
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 17. 12. 2019 14:42.
    3. SKAAR, Karin, Henryj J. KORZA, Michael TARRY, Petra SEKYROVÁ a Martin HOGBOM. Expression and Subcellular Distribution of GFP-Tagged Human Tetraspanin Proteins in Saccharomyces cerevisiae. Plos one. San Francisco: Public Library of Science, 2015, roč. 10, č. 7, s. nestránkováno, 19 s. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0134041.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00087273 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Skaar, Karin (752 Švédsko) -- Korza, Henryj J. (752 Švédsko) -- Tarry, Michael (752 Švédsko) -- Sekyrová, Petra (203 Česká republika, garant, domácí) -- Hogbom, Martin (752 Švédsko)
      Klíčová slova anglicky: FAMILIAL EXUDATIVE VITREORETINOPATHY; EUKARYOTIC MEMBRANE-PROTEINS; ACUTE LYMPHOBLASTIC-LEUKEMIA; MALEIC ACID COPOLYMER; ENDOPLASMIC-RETICULUM; EXTRACELLULAR DOMAIN; FREE PURIFICATION; ESCHERICHIA-COLI; PICHIA-PASTORIS; QUALITY-CONTROL

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 14. 4. 2016 09:19.
    4. STADLBAUER, Petr, Petra KUHROVÁ, Pavel BANÁŠ, Jaroslav KOČA, Giovanni BUSSI, Lukáš TRANTÍREK, Michal OTYEPKA a Jiří ŠPONER. Hairpins participating in folding of human telomeric sequence quadruplexes studied by standard and T-REMD simulations. Nucleic Acids Research. Oxford: Oxford University Press, 2015, roč. 43, č. 20, s. 9626-9644. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkv994.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00086621 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Stadlbauer, Petr (203 Česká republika) -- Kuhrová, Petra (203 Česká republika) -- Banáš, Pavel (203 Česká republika) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Bussi, Giovanni (380 Itálie) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Otyepka, Michal (203 Česká republika) -- Šponer, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS; INTRAMOLECULAR DNA QUADRUPLEXES; PARTICLE MESH EWALD; AMBER FORCE-FIELD; G-TRACT LENGTH; NUCLEIC-ACIDS; REPLICA-EXCHANGE; K+ SOLUTION; ENERGY LANDSCAPE; STRUCTURAL DYNAMICS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 5. 4. 2016 15:54.
    5. BUCHTOVÁ, marcela, Radka CHALOUPKOVÁ, Malgorzata ZAKRZEWSKA, Iva VESELÁ, Petra CELÁ, Jana BARÁTHOVÁ, Iva GUDERNOVÁ, Renata ZAJICKOVA, Lukáš TRANTÍREK, Jorge MARTIN, Martin KOSTAS, Jacek OTLEWSKI, Jiří DAMBORSKÝ, Alois KOZUBÍK, Antoni WIEDLOCHA a Pavel KREJČÍ. Instability restricts signaling of multiple fibroblast growth factors. Cellular and Molecular Life Sciences. Basel: Springer, 2015, roč. 72, č. 12, s. 2445-2459. ISSN 1420-682X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00018-015-1856-8.
      URL
      Název anglicky: Instability restricts signaling of multiple fibroblast growth factors
      RIV/00216224:14110/15:00080926 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Švýcarsko.
      Buchtová, marcela (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Zakrzewska, Malgorzata (616 Polsko) -- Veselá, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Celá, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Baráthová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Gudernová, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Zajickova, Renata (203 Česká republika) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Martin, Jorge (840 Spojené státy) -- Kostas, Martin (616 Polsko) -- Otlewski, Jacek (616 Polsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Kozubík, Alois (203 Česká republika, domácí) -- Wiedlocha, Antoni (616 Polsko) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Fibroblast growth factor; FGF; Unstable; Proteoglycan; Regulation
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 24. 11. 2015 17:02.
    6. ZANNI, Giulia, Elena DI MARTINO, Anna OMELYANENKO, Michael ANDÄNG, Ulla DELLE, Kecke ELMROTH a Klas BLOMGREN. Lithium increases proliferation of hippocampal neural stem/progenitor cells and rescues irradiation-induced cell cycle arrest in vitro. Oncotarget. Albany: Impact Journals, 2015, roč. 6, č. 35, s. 37083-37097. ISSN 1949-2553.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00087265 Článek v odborném periodiku. Onkologie a hematologie. angličtina. Spojené státy.
      Zanni, Giulia (752 Švédsko) -- Di Martino, Elena (752 Švédsko) -- Omelyanenko, Anna (752 Švédsko) -- Andäng, Michael (752 Švédsko, garant, domácí) -- Delle, Ulla (752 Švédsko) -- Elmroth, Kecke (752 Švédsko) -- Blomgren, Klas (752 Švédsko)
      Klíčová slova anglicky: lithium; hippocampus; radiotherapy; apoptosis; paediatric oncology

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 13. 4. 2016 10:14.
    7. ŠKOLÁKOVÁ, Petra, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Klára BEDNÁŘOVÁ, Radovan FIALA, Michaela VORLÍČKOVÁ a Lukáš TRANTÍREK. Unique C. elegans telomeric overhang structures reveal the evolutionarily conserved properties of telomeric DNA. Nucleic Acids Research. Oxford, UK: Oxford Press, 2015, roč. 43, č. 9, s. 4733-4745. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkv296.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00080881 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Školáková, Petra (203 Česká republika) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika, domácí) -- Bednářová, Klára (203 Česká republika, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Vorlíčková, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NUCLEASE HYPERSENSITIVE ELEMENT; G-QUADRUPLEX STRUCTURES; I-MOTIF; CAENORHABDITIS-ELEGANS; HYDROGEN-BONDS; CELL-LINES; BASE-PAIRS; CATIONIC PORPHYRINS; CIRCULAR-DICHROISM; HUMAN-CHROMOSOMES
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 3. 7. 2015 09:08.

    2014

    1. BOSÁKOVÁ, Michaela, Pavel KREJČÍ, Lukáš TRANTÍREK a Petr DVOŘÁK. FGF19/BETA-KLOTHO REGULATE PHYSIOLOGY AND DIFFERENTIATION OF HUMAN PLURIPOTENT STEM CELLS. In ISSCR 12th Annual Meeting, Vancouver, Canada, June 18-21 2014. 2014.
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 21. 3. 2016 16:04.
    2. BERNATÍK, Ondřej, Kateřina ŠEDOVÁ, Carolin SCHILLE, Sri Ranjani GANJI, Igor ČERVENKA, Lukáš TRANTÍREK, Alexandra SCHAMBONY, Zbyněk ZDRÁHAL a Vítězslav BRYJA. Functional Analysis of Dishevelled-3 Phosphorylation Identifies Distinct Mechanisms Driven by Casein Kinase 1 epsilon and Frizzled5. Journal of Biological Chemistry. Bethesda, USA: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2014, roč. 289, č. 34, s. 23520-23533. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.M114.590638.
      URL
      RIV/00216224:14310/14:00074125 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Bernatík, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Šedová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Schille, Carolin (276 Německo) -- Ganji, Sri Ranjani (356 Indie, domácí) -- Červenka, Igor (703 Slovensko, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Schambony, Alexandra (276 Německo) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: PLANAR CELL POLARITY; BETA-CATENIN; WNT/BETA-CATENIN; PDZ DOMAIN; I-EPSILON; WNT PATHWAY; PROTEIN; DROSOPHILA; DVL; FAMILY
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. Mgr. Vítězslav Bryja, Ph.D., učo 11088. Změněno: 17. 12. 2014 12:57.
    3. HANSEL, Robert, Laura M. LUH, Ivan CORBERSKI, Lukáš TRANTÍREK a Volker DOTSCH. In-Cell NMR and EPR Spectroscopy of Biomacromolecules. Angewandte Chemie International Edition. Weinheim, Germany: Wiley-VCH Verlag GmbH & Co., 2014, roč. 53, č. 39, s. 10300-10314. ISSN 1433-7851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/anie.201311320.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00074124 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Německo.
      Hansel, Robert (276 Německo) -- Luh, Laura M. (276 Německo) -- Corberski, Ivan (276 Německo) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Dotsch, Volker (276 Německo)
      Klíčová slova anglicky: MAGNETIC-RESONANCE-SPECTROSCOPY; XENOPUS-LAEVIS OOCYTES; ELECTRON-PARAMAGNETIC-RESONANCE; PROTEIN-PROTEIN INTERACTIONS; HUMAN TELOMERIC DNA; DISTANCE MEASUREMENTS; ESCHERICHIA-COLI; LIVING CELLS; F-19 NMR; PHYSIOLOGICAL CONDITIONS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 21. 11. 2014 06:55.
    4. BABINSKÝ, Martin, Radovan FIALA, Iva KEJNOVSKÁ, Klára BEDNÁŘOVÁ, Radek MAREK, Janos SAGI, Vladimír SKLENÁŘ a Michaela VORLÍČKOVÁ. Loss of loop adenines alters human telomere d(AG3(TTAG3)3) quadruplex folding. Nucleic Acids Research. UK: Oxford University Press, 2014, roč. 42, č. 22, s. 14031-14041. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gku1245.
      DOI: 10.1093/nar/gku1245
      RIV/00216224:14740/14:00073361 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Babinský, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Kejnovská, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Bednářová, Klára (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Sagi, Janos (840 Spojené státy) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Vorlíčková, Michaela (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Quadruplex DNA; abasic lesion; NMR; CD;
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 10. 3. 2015 14:23.
    5. ŠEBERA, Jakub, Lukáš TRANTÍREK, Jiří FUKAL, Yoshiyuki TANAKA a Vladimír SYCHROVSKÝ. MECHANISM OF BASE EXCISION WITH THE hOGG1 DNA REPAIR ENZYME. Chemické listy. Praha: Česká společnost chemická, 2014, roč. 108, č. 4, s. 364-367. ISSN 0009-2770.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00077390 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Šebera, Jakub (203 Česká republika) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Fukal, Jiří (203 Česká republika) -- Tanaka, Yoshiyuki (392 Japonsko) -- Sychrovský, Vladimír (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: NUCLEIC-ACID BASES; GLYCOSIDIC BOND-CLEAVAGE; HUMAN 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE; AB-INITIO; TRANSITION-STATE; PROTEIN HOGG1; HARTREE-FOCK; OGG1 GENE; RECOGNITION; GUANINE
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 21. 11. 2014 10:39.
    6. VERLANDE, Amandine, Michaela KRAFČÍKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, I JELÍNKOVÁ, Alena HYRŠLOVÁ VACULOVÁ a Stjepan ULDRIJAN. Modulation of melanoma metabolism and viability with hexokinase and mitochondrial complex I inhibitors. In EMBO conference: Cellular signaling and cancer therapy, Hotel Croatia, Cavtat, Croatia, May 23-27, 2014, poster presentation. 2014.
      Název anglicky: Modulation of melanoma metabolism and viability with hexokinase and mitochondrial complex I inhibitors
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Změnila: Mgr. Martina Vráblíková, učo 10839. Změněno: 18. 12. 2017 11:19.
    7. ŠEBERA, Jakub, Lukáš TRANTÍREK, Y. TANAKA, R. NENCKA, J. FUKAL a V. SYCHROVSKÝ. The activation of N-glycosidic bond cleavage performed by base-excision repair enzyme hOGG1; theoretical study of the role of Lys 249 residue in activation of G, OxoG and FapyG. RSC Advances. Cambridge: Royal Society of Chemistry, 2014, roč. 4, č. 83, s. 44043-44051. ISSN 2046-2069. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c4ra08278h.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00079762 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Šebera, Jakub (203 Česká republika) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Tanaka, Y. (392 Japonsko) -- Nencka, R. (203 Česká republika) -- Fukal, J. (203 Česká republika) -- Sychrovský, V. (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: 8-OXOGUANINE DNA GLYCOSYLASE; INDEPENDENT CHEMICAL-SHIFTS; OXIDATIVELY DAMAGED DNA; TRANSITION-STATE; PROTEIN HOGG1; GAS-PHASE; OGG1 GENE; RECOGNITION; DENSITY; MECHANISM
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 25. 3. 2015 10:43.
    8. STADLBAUER, Petr, Lukáš TRANTÍREK, Thomas E. CHEATHAM III., Jaroslav KOČA a Jiří ŠPONER. Triplex intermediates in folding of human telomeric quadruplexes probed by microsecond-scale molecular dynamics simulations. Biochimie. Paris: ELSEVIER FRANCE-EDITIONS SCIENTIFIQUES MEDICALES ELSEVIER, 2014, roč. 105c, October, s. 22-35. ISSN 0300-9084. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.biochi.2014.07.009.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00074073 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Francie.
      Stadlbauer, Petr (203 Česká republika) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Cheatham III., Thomas E. (840 Spojené státy) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Šponer, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: G-DNA folding; Molecular dynamics; Quadruplex; Telomere; Triplex
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 15. 7. 2015 09:13.

    2013

    1. SKLENÁŘ, Vladimír a Radovan FIALA. Ceremonial inauguration of the "Josef Dadok National NMR Centre". 2013.
      URL URL
      Název česky: Slavnostní zahájení provozu Core Facility „Národní NMR centrum Josefa Dadoka“
      RIV/00216224:14740/13:00087231 Uspořádání konference. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR; nuclear magnetic resonance; Josef Dadok; structural biology
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 15. 4. 2016 09:28.
    2. KREJČÍ, Pavel, Michaela KUNOVÁ, Iva KUBÍKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, Alois KOZUBÍK a Petr DVOŘÁK. Expression of FGF19 in Human Embryonic Stem Cells. STEM CELLS. HOBOKEN: WILEY-BLACKWELL, 2013, roč. 31, č. 11, s. 2582-2584. ISSN 1066-5099. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/stem.1493.
      Název anglicky: Expression of FGF19 in Human Embryonic Stem Cells
      RIV/00216224:14110/13:00066459 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Krejčí, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Kunová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Kubíková, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Kozubík, Alois (203 Česká republika, domácí) -- Dvořák, Petr (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Cell signaling; Embryonic stem cells; FGF19; Fibroblast growth factor; Expression
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Soňa Böhmová, učo 232884. Změněno: 17. 2. 2014 09:29.
    3. HAENSEL, Robert, Frank LOEHR, Lukáš TRANTÍREK a Volker DOETSCH. High-Resolution Insight into G-Overhang Architecture. Journal of the American Chemical Society. Washington: American Chemical Society, 2013, roč. 135, č. 7, s. 2816-2824. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ja312403b.
      RIV/00216224:14740/13:00072647 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Haensel, Robert (276 Německo) -- Loehr, Frank (276 Německo) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Doetsch, Volker (276 Německo)
      Klíčová slova anglicky: HUMAN TELOMERIC DNA; INTRAMOLECULAR G-QUADRUPLEX; K+ SOLUTION; NMR-SPECTROSCOPY; SMALL-MOLECULE; HUMAN CANCER; PULSED EPR; STABILITY; SEQUENCE; CONFORMATIONS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 20. 3. 2014 08:25.
    4. EMMER, Jiří, Andrea VAVRINSKÁ, Vladimír SYCHROVSKÝ, Ladislav BENDA, Zdeněk KŘÍŽ, Jaroslav KOČA, Rolf BOELENS, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš TRANTÍREK. Influence of the O-phosphorylation of serine, threonine and tyrosine in proteins on the amidic N-15 chemical shielding anisotropy tensors. Journal of biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2013, roč. 55, č. 1, s. 59-70. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-012-9686-6.
      URL
      RIV/00216224:14740/13:00068469 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Emmer, Jiří (203 Česká republika) -- Vavrinská, Andrea (528 Nizozemské království) -- Sychrovský, Vladimír (203 Česká republika) -- Benda, Ladislav (203 Česká republika) -- Kříž, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Boelens, Rolf (528 Nizozemské království) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CSA; Phosphorylation; Amidic nitrogen; Serine; Threonine; Tyrosine; Protein; NMR
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 6. 4. 2014 06:04.

    2012

    1. KADEŘÁVEK, Pavel, Vojtěch ZAPLETAL, Radovan FIALA, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš ŽÍDEK. Accurate Reduced Spectral Density Mapping for Analysis of 13C Relaxation Rates. In 53rd Experimental Nuclear Magnetic Resonance Conference. 2012.
      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 8. 8. 2024 09:46.
Zobrazeno: 21. 12. 2024 03:11