Filtrování publikací

    2024

    1. THALEROVÁ, Sandra, Andrea VÍTEČKOVÁ WÜNSCHOVÁ, Patrícia KITTOVÁ, Lucie VAŠÁTKOVÁ, Michaela PEŠKOVÁ, Ondřej VOLNÝ, Anna MAC GILLAVRY DANYLEVSKA, Jan VÍTEČEK, Lukáš KUBALA a Robert MIKULÍK. A collateral circulation in ischemic stroke accelerates recanalization due to lower clot compaction. PLOS ONE. SAN FRANCISCO: PUBLIC LIBRARY SCIENCE, 2024. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0314079.
      Collateral circulation accelerates recanalization

      Klíčová slova anglicky: clot; collateral; in vitro; Recanalization; Stroke
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: Mgr. Jan Víteček, Ph.D., učo 13473. Změněno: 29. 11. 2024 15:09.
    2. KITOKA, Kristine, Alons LENDS, Gytis KUČINSKAS, Anna Lina BULA, Lukas KRASAUSKAS, Vytautas SMIRNOVAS, Monika ZILKOVA, Branislav KOVACECH, Rostislav SKRABANA, Jozef HRITZ a Kristaps JAUDZEMS. dGAE(297-391) Tau Fragment Promotes Formation of Chronic Traumatic Encephalopathy-Like Tau Filaments. Angewandte Chemie International Edition. WEINHEIM (GERMANY): Verlag Chemie, 2024, 8 s. ISSN 1433-7851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/anie.202407821.
      URL
      angličtina. Německo.
      Klíčová slova anglicky: tauopathies; tau protein; dGAE fragment; filamentous aggregates; NMR spectroscopy
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 15. 11. 2024 12:44.
    3. CRHA, Radek, Aneta KOZELEKOVÁ, Alena HOFROVÁ, Lucia IĽKOVIČOVÁ, Norbert GAŠPARIK, Pavel KADEŘÁVEK a Jozef HRITZ. Hiding in plain sight: Complex interaction patterns between Tau and 14-3-3zeta protein variants. INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES. NETHERLANDS: ELSEVIER, 2024, roč. 266, Pt 2, s. 1-14. ISSN 0141-8130. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2024.130802.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Crha, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Kozeleková, Aneta (203 Česká republika, domácí) -- Hofrová, Alena (203 Česká republika, domácí) -- Iľkovičová, Lucia (703 Slovensko, domácí) -- Gašparik, Norbert (703 Slovensko, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Tau protein;14-3-3 zeta protein;Phosphorylation;Interaction;NMR;Cross-linking
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 27. 5. 2024 11:36.
    4. KOZELEKOVÁ, Aneta, Lucia IĽKOVIČOVÁ, Radek CRHA, Alena HOFROVÁ a Jozef HRITZ. How does phosphorylation affect interaction between 14-3-3ζ and Tau proteins? In XX Discussions in Structural Molecular Biology and 7th User Meeting of CIISB. 2024. ISSN 1211-5894.
      URL
      Název česky: Jak ovlivňuje fosforylace interakci mezi proteiny 14-3-3ζ a Tau?
      angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Aneta Kozeleková, učo 461172. Změněno: 12. 7. 2024 09:36.
    5. HAVRÁNKOVÁ, Eva, Karolína ŠELIGOVÁ, Karin RAVASZOVÁ a Alena HOFROVÁ. NOVEL INHIBITORS OF HUMAN CARBONIC ANHYDRASE. In 52nd Conference Synthesis and Analysis of Drugs 2024. 2024.
      RIV: Prezentace na konferencích. angličtina. Česká republika.
      Havránková, Eva (203 Česká republika, garant, domácí) -- Šeligová, Karolína (203 Česká republika, domácí) -- Ravaszová, Karin (703 Slovensko, domácí) -- Hofrová, Alena (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Triazine; carbonic anhydrase; selective inhibition
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: RNDr. Eva Havránková, Ph.D., učo 326894. Změněno: 4. 11. 2024 14:48.
    6. KOZELEKOVÁ, Aneta, Marie CHOVANČÍKOVÁ, Petr KAŠPÁREK, Helena REUTOVÁ, Martina HLOŽÁNKOVÁ a Jozef HRITZ. Preparation of Alzheimer's-disease-relevant Tau protein in HEK293 mammalian cells. In CEITEC PhD School Conference 2024, Brno. 2024.
      Název česky: Příprava proteinu Tau relevantního pro Alzheimerovu chorobu v savčích HEK293 buňkách
      angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Aneta Kozeleková, učo 461172. Změněno: 12. 7. 2024 09:48.
    7. BASHEER, Neha, Luc BUEE, Jean-Pierre BRION, Tomas SMOLEK, Muhammad Khalid MUHAMMADI, Jozef HRITZ, Tomas HROMADKA, Ilse DEWACHTER, Susanne WEGMANN, Isabelle LANDRIEU, Petr NOVAK, Amritpal MUDHER a Norbert ZILKA. Shaping the future of preclinical development of successful disease-modifying drugs against Alzheimer's disease: a systematic review of tau propagation models. Acta Neuropathologica Communications. London: BioMed Central, 2024, roč. 12, č. 1, s. 52-82. ISSN 2051-5960. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s40478-024-01748-5.
      URL
      RIV: Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Tau protein; Propagation; Spreading; Aggregation; Neurofibrillary tangles; Animal models
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 3. 5. 2024 13:34.
    8. ČERNÝ, Martin, Viktor BARTOŠÍK, Markéta PETRŮJOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Libor KRÁSNÝ a Lukáš ŽÍDEK. Tale of tails; structural comparison of the RNA polymerase δ-subunits. In XX Discussions in Structural Molecular Biology and 7th User Meeting of CIISB. 2024. ISSN 1211-5894.
      Odkaz na Abstrakt
      angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Martin Černý, učo 451182. Změněno: 29. 4. 2024 14:00.
    9. IĽKOVIČOVÁ, Lucia, Thomas Peter FELLMETH a Jozef HRITZ. The effect of phosphoserine 324 on the paired helical filaments of tau protein. In Instruct Biennial Structural Biology Conference. 2024.
      URL
      Název česky: Vliv fosfoserinu 324 na párové helikální filamenty tau proteinu
      angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: tau protein, paired helical filaments, phosphorylation, molecular dynamics, free energies
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Bc. Lucia Iľkovičová, učo 505319. Změněno: 10. 6. 2024 12:58.
    10. ČERNÝ, Martin, Anna KOZÁKOVÁ, Klára MIKESKOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Karel ŠKUBNÍK, Libor KRÁSNÝ a Lukáš ŽÍDEK. The interplay of δ-subunit and RNA polymerase in the pre-initiation state. In 7th cryoNET Symposium. 2024.
      Název anglicky: The interplay of δ-subunit and RNA polymerase in the pre-initiation state
      angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: RNA polymerase, transcription, initiation, cryo-EM, RpoE, SigA, SigB
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Martin Černý, učo 451182. Změněno: 23. 10. 2024 14:18.

    2023

    1. LASORSA, Alessia, Krishnendu BERA, Idir MALKI, Elian DUPRE, Francois-Xavier CANTRELLE, Hamida MERZOUGUI, Davy SINNAEVE, Xavier HANOULLE, Jozef HRITZ a Isabelle LANDRIEU. Conformation and Affinity Modulations by Multiple Phosphorylation Occurring in the BIN1 SH3 Domain Binding Site of the Tau Protein Proline-Rich Region. Biochemistry. Washington: American Chemical Society, 2023, roč. 62, č. 11, s. 1631-1642. ISSN 0006-2960. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.biochem.2c00717.
      URL
      RIV/00216224:14310/23:00131225 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Bera, Krishnendu (356 Indie, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Genes; Molecular dynamics; Nuclear magnetic resonance; Nuclear magnetic resonance spectroscopy; Peptides
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 3. 3. 2024 23:59.
    2. BERA, Krishnendu, Isabelle LANDRIEU a Jozef HRITZ. Conformational changes upon phosphorylation of proline rich region of tau(210-240) peptide using molecular dynamic simulation. In XIX Discussions in Structural Molecular Biology and 6th User Meeting of CIISB (Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology), Nove Hrady, South Bohemia, 23-25 March 2023. 2023.
      URL
      angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 21. 3. 2024 08:46.
    3. ., Indu, Jozef HRITZ, Václav BRÁZDA, Rajesh KUMAR a Krishnendu BERA. Designing of Insecticides Against Bemisia tabaci targeting ecdysone receptor. In BERA, Krishnendu. 6th Advanced in Silico Drug Design workshop/challenge, 30st January – 3rd February 2023, Faculty of Science, Palacky University, Olomouc, Czech Republic. 2023.
      Abstract Book

      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Krishnendu Bera, Ph.D., učo 490519. Změněno: 4. 2. 2023 11:04.
    4. KADEŘÁVEK, Pavel, Vojtěch ZAPLETAL, Nicola SALVI, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Milan ZACHRDLA, Petr PADRTA, Subhash NARASIMHAN, Thorsten MARQUARDSEN, Jean-Max TYBURN, Lukáš ŽÍDEK, Martin BLACKLEDGE a Fabien FERRAGE. Detailed insight into dynamics of C-terminal domain of δ subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis using high-resolution relaxometry. In IDP Community F2F/hybrid meeting. 2023.
      URL
      angličtina. Slovensko.
      Klíčová slova anglicky: NMR; protein dynamics
      Druh účasti: vyžádaná přednáška
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 23. 3. 2024 16:28.
    5. ZAPLETAL, Vojtěch, Nicola SALVI, Andrea FLAMM, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Dennis KURZBACH, Mateos BORJA, Milan ZACHRDLA, Petr PADRTA, Subhash NARASIMHAN, Thorsten MARQUARDSEN, Jean-Max TYBURN, Jozef HRITZ, Robert KONRAT, Lukáš ŽÍDEK, Martin BLACKLEDGE, Fabien FERRAGE a Pavel KADEŘÁVEK. Detailed insight into dynamics of intrinsically disordered proteins using high-resolution relaxometry. 2023.
      URL
      angličtina. Slovensko.
      Klíčová slova anglicky: NMR; protein dynamics
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 23. 3. 2024 16:33.
    6. TUŽINČIN, Dávid, Petr PADRTA, Hana ŠANDEROVÁ, Alžběta RABATINOVÁ, Kateřina BENDOVÁ, Libor KRÁSNÝ, Lukáš ŽÍDEK a Pavel KADEŘÁVEK. Domain 1.1 of σA factor of RNA polymerase from Bacillus subtilis beyond its major state conformation. In Inaugural Biochemistry Symposium Puzzles of (Bio)molecular Structure and Dynamics: NMR spectroscopy and complementary approaches. 2023.
      URL
      RIV/00216224:14310/23:00130951 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Tužinčin, Dávid (703 Slovensko, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Rabatinová, Alžběta (203 Česká republika) -- Bendová, Kateřina (203 Česká republika) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: σA factor; RNA polymerase; Bacillus subtilis; NMR; conformational exchange
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: Mgr. Dávid Tužinčin, učo 460988. Změněno: 13. 6. 2023 13:42.
    7. HOFROVÁ, Alena, Karin RAVASZOVÁ, Radek CRHA, Adela FEJFAROVÁ, Pavel SRB, Jiri BRYNDA, Pavlína MALOY ŘEZÁČOVÁ a Jozef HRITZ. Employment of 5D non-uniform sampling NMR assignment strategy to assign disordered protein regions with repetitive motifs. In EUROMAR conference. 2023.
      URL
      angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Klíčová slova anglicky: carbonic anhydrase IX, NMR, NUS, 5D
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Alena Hofrová, učo 119239. Změněno: 11. 8. 2023 18:02.
    8. TUŽINČIN, Dávid, Petr PADRTA, Hana ŠANDEROVÁ, Alžběta RABATINOVÁ, Libor KRÁSNÝ, Lukáš ŽÍDEK a Pavel KADEŘÁVEK. Characterisation of invisible conformation of domain 1.1 of σA factor of RNA polymerase from Bacillus subtilis. In 19th European Magnetic Resonance Congress, EUROMAR 2023. 2023.
      URL
      RIV/00216224:14310/23:00131478 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Tužinčin, Dávid (703 Slovensko, garant, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Rabatinová, Alžběta (203 Česká republika) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: σA factor; RNA polymerase; Bacillus subtilis; NMR; conformational exchange
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Dávid Tužinčin, učo 460988. Změněno: 22. 8. 2023 20:45.
    9. TUŽINČIN, Dávid, Petr PADRTA, Hana ŠANDEROVÁ, Alžbeta RABATINOVÁ, Kateřina BENDOVÁ, Libor KRÁSNÝ, Lukáš ŽÍDEK a Pavel KADEŘÁVEK. Characterization of a transitionally occupied state and thermal unfolding of domain 1.1 of σ A factor of RNA polymerase from Bacillus subtilis. Proteins: Structure, Function and Bioinformatics. Wiley, 2023, roč. 91, č. 9, s. 1276-1287. ISSN 0887-3585. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/prot.26531.
      URL
      RIV/00216224:14740/23:00131160 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Tužinčin, Dávid (703 Slovensko, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Bendová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: σA factor; Bacillus subtilis; NMR; RNA polymerase; conformational exchange.
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 27. 10. 2024 15:25.
    10. BERA, Krishnendu a Jozef HRITZ. Interaction of selected drugs at dimer interface of human 14-3-3ζ protein. In 6th Advanced in Silico Drug Design workshop/challenge, 30st January – 3rd February 2023, Faculty of Science, Palacky University, Olomouc, Czech Republic. 2023.
      Abstract Book

      Klíčová slova anglicky: 14-3-3, Molecular docking, MD simulation, MM/GBSA
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Krishnendu Bera, Ph.D., učo 490519. Změněno: 28. 2. 2023 14:55.
    11. BERA, Krishnendu, Isabelle LANDRIEU, Lasorsa ALESSIA a Jozef HRITZ. Molecular dynamic simulation study of multiple phosphorylations at the proline rich region of tau(210-240) peptide. In ALESSIA, Lasorsa a Jozef HRITZ. Prague Protein Spring 2023, Prague, 4-7 May 2023. 2023. ISBN 978-80-86241-70-8.
      URL
      angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 10. 5. 2024 13:03.
    12. PROCHÁZKOVÁ, Markéta, Eliška KUCHOVSKÁ, Michael KILLINGER a Karel KLEPÁRNÍK. Novel Förster Resonance Energy Transfer probe with quantum dot for a long-time imaging of active caspases inside individual cells. Analytica Chimica Acta. Elsevier B.V., 2023, roč. 1267, August, s. 1-9. ISSN 0003-2670. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.aca.2023.341334.
      URL
      RIV/00216224:14310/23:00130766 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Procházková, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Kuchovská, Eliška (203 Česká republika) -- Killinger, Michael (203 Česká republika, domácí) -- Klepárník, Karel (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: Caspase molecular probe; Time-laps fluorescence microscopy; Quantum dot photostability; FRET probe
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 30. 1. 2024 20:27.
    13. KUČINSKAS, Gytis, Hana NEDOZRÁLOVÁ a Tomi GREŇA. Pathological tau protein fibrils – structure and cellular context. In The XIX Discussions in Structural Molecular Biology and the 6th User meeting of CIISB. 2023.
      URL
      Název anglicky: Pathological tau protein fibrils – structure and cellular context
      angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Bc. Tomi Greňa, učo 505463. Změněno: 11. 11. 2024 14:26.
    14. KULÍŠKOVÁ, Petra, Lucie VAŠÁTKOVÁ a Iva SLANINOVÁ. Quaternary Benzophenanthridine Alkaloids Act as Smac Mimetics and Overcome Resistance to Apoptosis. International Journal of Molecular Sciences. BASEL: MDPI, 2023, roč. 24, č. 20, s. 1-16. ISSN 1661-6596. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/ijms242015405.
      URL
      RIV/00216224:14110/23:00132433 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Kulíšková, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Vašátková, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Slaninová, Iva (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: apoptosis; benzophenanthridine alkaloids; cancer; cell death; cIAP; Smac mimetic drug resistance; chelerythrine; sanguinarine
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 13. 2. 2024 13:38.
    15. PAPAGEORGIOU, Anna, Michaela POSPÍŠILOVÁ, Jakub CIBULKA, Raghib ASHRAF, Christopher WAUDBY, Pavel KADEŘÁVEK, Volha MAROZ, Karel KUBÍČEK, Zbyněk PROKOP, Lumír KREJČÍ a Konstantinos TRIPSIANES. Recognition and coacervation of G-quadruplexes by a multifunctional disordered region in RECQ4 helicase. Nature Communications. Berlin: Nature, 2023, roč. 14, č. 1, s. 1-19. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-42503-z.
      URL
      RIV/00216224:14740/23:00134740 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Papageorgiou, Anna (300 Řecko, domácí) -- Pospíšilová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Cibulka, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Ashraf, Raghib (356 Indie, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Maroz, Volha (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Prokop, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Lumír (203 Česká republika, domácí) -- Tripsianes, Konstantinos (300 Řecko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Biomolecular polyelectrolyte complexes; DNA helicase Q4; G-quadruplexes; intrinsically disordered regions; RPA protein
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 27. 10. 2024 15:27.
    16. BERA, Krishnendu a Thomas Peter FELLMETH. Study of conformational changes of Tau(210-240) upon multiple phosphorylations using molecular dynamics simulations. In ITAT Conference. 2023. ISBN 978-80-8147-132-2.
      Název anglicky: Study of conformational changes of Tau(210-240) upon multiple phosphorylations using molecular dynamics simulations
      angličtina. Slovensko.
      Klíčová slova anglicky: Molecular Dynamics, Tau, Intrinsically Disordered Protein
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Thomas Peter Fellmeth, učo 551150. Změněno: 18. 6. 2024 12:03.
    17. TUŽINČIN, Dávid, Nicola SALVI, Vojtěch ZAPLETAL, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Milan ZACHRDLA, Petr PADRTA, Subhash NARASIMHAN, Thorsten MARQUARDSEN, Jean-Max TYBURN, Hana ŠANDEROVÁ, Alžběta RABATINOVÁ, Kateřina BENDOVÁ, Libor KRÁSNÝ, Lukáš ŽÍDEK, Martin BLACKLEDGE, Fabien FERRAGE a Pavel KADEŘÁVEK. Study of the Dynamics of Flexible Subunits of RNA Polymerase from Bacillus subtilis. 2023.
      URL
      angličtina. Slovensko.
      Klíčová slova anglicky: NMR; protein dynamics
      Druh účasti: vyžádaná přednáška
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 25. 3. 2024 08:55.
    18. KOZELEKOVÁ, Aneta, Lucia IĽKOVIČOVÁ, Radek CRHA, Alena HOFROVÁ a Jozef HRITZ. 14-3-3 dimer vs monomer – (dis)similarities in Tau protein binding. In EBSA Congress 2023 in Stockholm. 2023. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00249-023-01668-7.
      URL
      Název česky: 14-3-3 dimer vs monomer – (ne)podobnost ve vazbě proteinu Tau
      angličtina.
      Klíčová slova anglicky: Neurofibrillary tangles; Tau protein; brain; NMR; affinity
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 6. 3. 2024 07:39.

    2022

    1. JAKLIN, M., Jozef HRITZ a B. HRIBAR-LEE. A new fibrillization mechanism of β-lactoglobulin in glycine solutions. INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES. NETHERLANDS: ELSEVIER, 2022, roč. 216, SEP, s. 414-425. ISSN 0141-8130. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2022.06.182.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00126925 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: beta-lactoglobulinfl-lactoglobulin; FibrillizationBuffer; specific effects;Spheroid oligomers
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Monika Szurmanová, Ph.D., učo 466567. Změněno: 15. 10. 2024 11:07.
    2. BERA, Krishnendu. Binding and inhibitory effect of ravidasvir on 3CLpro of SARS-CoV-2: a molecular docking, molecular dynamics and MM/PBSA approach. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. Taylor & Francis, 2022, roč. 40, č. 16, s. 7303-7310. ISSN 0739-1102. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/07391102.2021.1896388.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00124912 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Bera, Krishnendu (356 Indie, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: 3CLpro; MM/PBSA; SARS-CoV-2; molecular docking; molecular dynamics simulation; principal component analysis
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 6. 2. 2023 19:28.
    3. SIMONČIČ, Matjaž, Jozef HRITZ a Miha LUKŠIČ. Biomolecular Complexation on the "Wrong Side": A Case Study of the Influence of Salts and Sugars on the Interactions between Bovine Serum Albumin and Sodium Polystyrene Sulfonate. Biomacromolecules. American Chemical Society, 2022, roč. 23, č. 10, s. 4412-4426. ISSN 1525-7797. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.biomac.2c00933.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00126924 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: SPHERICAL POLYELECTROLYTE BRUSHESBETA-LACTOGLOBULINCAPILLARY-ELECTROPHORESISELECTROSTATIC INTERACTIONPERSISTENCE LENGTHCHARGE-REGULATIONPROTEINBINDINGCOACERVATIONADSORPTION
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Marie Švancarová, učo 251223. Změněno: 15. 10. 2024 15:46.
    4. HOFROVÁ, Alena, Karin RAVASZOVÁ a Jozef HRITZ. Biophysical characterization of extracellular carbonic anhydrase IX. In Instruct Biennial Structural Biology Conference. 2022.
      Název česky: Biofyzikální charakterizace extracelulární karbonické anhydrázy IX
      Název anglicky: Biophysical characterization of extracellular carbonic anhydrase IX
      angličtina.
      Klíčová slova anglicky: carbonic anhydrase IX
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Alena Hofrová, učo 119239. Změněno: 14. 10. 2022 14:05.
    5. DAS, NR., Krishnendu BERA, T. SHARMA, AP. TOROPOVA, AA. TOROPOV a PGR. ACHARY. Computational approach for building QSAR models for inhibition of HIF-1A. JOURNAL OF THE INDIAN CHEMICAL SOCIETY. INDIA: ELSEVIER, 2022, roč. 99, č. 10, s. 100687-100695. ISSN 0019-4522. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jics.2022.100687.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00126869 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Bera, Krishnendu (356 Indie, domácí)
      Klíčová slova anglicky: ADMET; CORAL software; HIF-1A; Molecular docking; Molecular dynamics; QSAR
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 12. 2022 14:39.
    6. SALVI, Nicola, Vojtěch ZAPLETAL, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Milan ZACHRDLA, Petr PADRTA, Subhash NARASIMHAN, Thorsten MARQUARDSEN, Jean-Max TYBURN, Lukáš ŽÍDEK, Martin BLACKLEDGE, Fabien FERRAGE a Pavel KADEŘÁVEK. Convergent views on disordered protein dynamics from NMR and computational approaches. BIOPHYSICAL JOURNAL. UNITED STATES: CELL PRESS, 2022, roč. 121, č. 20, s. 3785-3794. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2022.09.016.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00126947 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Jaseňáková, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Narasimhan, Subhash (356 Indie, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR; protein dynamics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 30. 10. 2024 14:19.
    7. NÁPLAVOVÁ, Alexandra, Aneta KOZELEKOVÁ a Jozef HRITZ. Describing 14-3-3 dimerization: tools to obtain KD. In XXII. Workshop of Biophysical Chemists and Electrochemists. 2022. ISBN 978-80-280-0087-5.
      URL
      angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: 14-3-3 protein, monomerization; dissociation constant; 19F NMR
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Aneta Kozeleková, učo 461172. Změněno: 13. 10. 2022 13:36.
    8. NÁPLAVOVÁ, Alexandra, Aneta KOZELEKOVÁ a Jozef HRITZ. From nano- to milimolar: dimerization dissociation constant determination. In Chemistry towards Biology (CTB10). 2022. ISBN 978-80-971665-3-3.
      URL
      Název anglicky: From nano- to milimolar: dimerization dissociation constant determination

      Klíčová slova anglicky: 14-3-3 protein; dimerization; protein oligomerization; 19F NMR
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Alexandra Náplavová, učo 484296. Změněno: 13. 10. 2022 15:27.
    9. SIMONOVA, Anna, Veronika ROMANSKA, Barbora BENONI, Karel ŠKUBNÍK, Lenka ŠMERDOVÁ, Michaela PROCHÁZKOVÁ, Kristina SPUSTOVA, Ondrej MORAVCIK, Lenka GAHUROVA, Jan PACES, Pavel PLEVKA a Hana CAHOVA. Honeybee Iflaviruses Pack Specific tRNA Fragments from Host Cells in Their Virions. Chembiochem. WEINHEIM: WILEY-VCH, 2022, roč. 23, č. 17, s. 202200281-202200289. ISSN 1439-4227. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cbic.202200281.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00128475 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Škubník, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Šmerdová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Procházková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: human rhinovirus type 2; human Echovirus 18; LC-MS; Picornavirales; RNA methylation; tRNA fragments
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Monika Szurmanová, Ph.D., učo 466567. Změněno: 31. 10. 2024 10:12.
    10. RUSKAMO, Salla, Arne RAASAKKA, Jan Skov PEDERSEN, Anne MARTEL, Karel ŠKUBNÍK, Tamim DARWISH, Lionel PORCAR a Petri KURSULA. Human myelin proteolipid protein structure and lipid bilayer stacking. Cellular and molecular life sciences. BASEL: SPRINGER BASEL AG, 2022, roč. 79, č. 8, s. 419-437. ISSN 1420-682X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00018-022-04428-6.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00128474 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Škubník, Karel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Myelin; Proteolipid protein; DM20; Integral membrane protein; Small-angle scattering; Atomic force microscopy
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 27. 10. 2024 14:26.
    11. SUBADINI, Suchismita, Ram Sankar PANIGRAHY, Nishesh Kumar GUPTA, Krishnendu BERA a Harekrushna SAHOO. Impact of Chromate and Dichromate on Lysozyme Stability: A Spectroscopic and Molecular Docking Investigation. Luminescence. Wiley, 2022, roč. 37, č. 6, s. 876-882. ISSN 1522-7235. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/bio.4231.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00125554 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Bera, Krishnendu (356 Indie, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Lyz; fluorescence quenching; anisotropy; chromate; dichromate
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 1. 2023 16:32.
    12. BERA, Krishnendu a Jozef HRITZ. Impact of Phosphorylation for Tau210-240 Peptide and Interaction of Small Molecules and 14-3-3ζ Protein Studies Using Computational Methods. In CEITEC PhD Conference. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00126277 Prezentace na konferencích. angličtina. Česká republika.
      Bera, Krishnendu (356 Indie, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Phosphorylation; Tau210-240 Peptide
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 20. 2. 2023 18:49.
    13. PLUCAROVÁ, Jitka, Séverine JANSEN, Alice LANÍKOVÁ a Lukáš ŽÍDEK. Interactions of adaptor protein Grb2 with microtubule associated protein 2c. In XVIII Discussions in Structural Molecular Biology. 2022.
      URL
      Název česky: Interakce adaptorového proteinu Grb2 s mikrotubuly asociavaným proteinem 2c
      Název anglicky: Interactions of adaptor protein Grb2 with microtubule associated protein 2c

      Změnila: Mgr. Jitka Plucarová, Ph.D., učo 436456. Změněno: 19. 10. 2022 17:29.
    14. KITTOVÁ, Patrícia, Sandra THALEROVÁ, Andrea VÍTEČKOVÁ WÜNSCHOVÁ, Lucie VAŠÁTKOVÁ, Michaela PEŠKOVÁ, Ondřej VOLNÝ, Anna MAC GILLAVRY DANYLEVSKA, Jan VÍTEČEK, Lukáš KUBALA a Robert MIKULÍK. Kolaterálna cirkulácia zlepšuje rekanalizáciu pôsobením alteplázy: in vitro štúdia. In 66. Studentská vědecká konference LF MU. 2022. ISBN 978-80-280-0163-6.
      URL
      Název česky: Kolaterální cirkulace zlepšuje rekanalizaci působením alteplázy: in vitro studie
      Název anglicky: Collateral circulation accelerates recanalization using alteplase: an in vitro study

      Změnila: Mgr. Tereza Miškechová, učo 341652. Změněno: 20. 2. 2023 08:57.
    15. CHOCHOLOVÁ, Eva, Eva DROZDOVÁ, Dana FIALOVÁ, Martin ČERNÝ, Barbora ZWINSOVÁ, Petra VÍDEŇSKÁ, Kristýna BRZOBOHATÁ a Kateřina NOVOTNÁ. Metagenomic research of the ancient human dental calculus as a potential source for the study of rare infectious diseases. In The Biomania Student Scientific Meeting 2022. 2022. ISBN 978-80-280-0040-0.
      RIV/00216224:14310/22:00125840 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Chocholová, Eva (203 Česká republika, garant, domácí) -- Drozdová, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Fialová, Dana (203 Česká republika, domácí) -- Černý, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Zwinsová, Barbora (203 Česká republika, domácí) -- Vídeňská, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Brzobohatá, Kristýna (203 Česká republika, domácí) -- Novotná, Kateřina (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: ancient DNA; aDNA; rare disease; rare infectious disease; pathogen; dental calculus; metagenomics
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Chocholová, učo 423026. Změněno: 27. 4. 2023 16:40.
    16. BURIÁNKOVÁ, Iva, Anna MOLÍKOVÁ, Monika VÍTĚZOVÁ, Vladimír ONDERKA, Tomáš VÍTĚZ, Iva URBANOVÁ, Nikola HANIŠÁKOVÁ, Martin ČERNÝ, David NOVÁK, Jan LOCHMAN, Josef ZEMAN, Jakub JAVŮREK, Markéta MACHÁLKOVÁ, Linda DENGLER a Harald HUBER. Microbial Communities in Underground Gas Reservoirs Offer Promising Biotechnological Potential. Fermentation. MDPI, 2022, roč. 8, č. 6, s. 1-16. ISSN 2311-5637. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/fermentation8060251.
      URL
      RIV/00216224:14310/22:00125902 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Buriánková, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Molíková, Anna (203 Česká republika, domácí) -- Vítězová, Monika (203 Česká republika, garant, domácí) -- Vítěz, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Hanišáková, Nikola (203 Česká republika, domácí) -- Černý, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Novák, David (203 Česká republika, domácí) -- Lochman, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Zeman, Josef (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: methanogenic archaea; methanogenesis; underground gas storage; power to methane; green energy; CO2 utilization
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. Ing. Tomáš Vítěz, Ph.D., učo 238240. Změněno: 26. 2. 2024 14:56.
    17. NÁPLAVOVÁ, Alexandra, Aneta KOZELEKOVÁ a Jozef HRITZ. Multiple approaches for protein phosphorylation: a story of 14-3-3. In XVIII Discussions in Structural Molecular Biology and 5th User Meeting of CIISB. 2022.
      URL
      angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: 14-3-3 protein; protein phosphorylation; phosphomimicking mutants
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Aneta Kozeleková, učo 461172. Změněno: 27. 10. 2022 12:09.
    18. GAFFOUR, Amina, Vojtěch ZAPLETAL, Krishnendu BERA a Jana PAVLÍKOVÁ PŘECECHTĚLOVÁ. Multiscale NMR calculations of spin-spin couplings and the phophprylation induced chemical shifts changes in disordered proteins. In International Society of Quantum Biology and Pharmacology (ISQBP). 2022.

      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: Krishnendu Bera, Ph.D., učo 490519. Změněno: 18. 9. 2022 20:47.
    19. CAMACHO-ZARCO, Aldo R., Vincent SCHNAPKA, Serafima GUSEVA, Anton ABYZOV, Wiktor ADAMSKI, Sigrid MILLES, Malene Ringkjøbing JENSEN, Lukáš ŽÍDEK, Nicola SALVI a Martin BLACKLEDGE. NMR Provides Unique Insight into the Functional Dynamics and Interactions of Intrinsically Disordered Proteins. CHEMICAL REVIEWS. UNITED STATES: AMER CHEMICAL SOC, 2022, roč. 122, č. 10, s. 9331-9356. ISSN 0009-2665. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.chemrev.1c01023.
      URL
      RIV/00216224:14310/22:00129086 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Dynamics; Physical chemistry; Proteins; Reaction kinetics; Thermodynamics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 19. 8. 2022 12:36.
    20. KOZELEKOVÁ, Aneta, Alexandra NÁPLAVOVÁ, Tomáš BROM, Zuzana TROŠANOVÁ, Petr LOUŠA a Jozef HRITZ. Phosphomimicking mutations ≠ phosphorylation - a case study of 14-3-3 protein. In XVIII Discussions in Structural Molecular Biology and 5th User Meeting of the Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology. 2022.
      angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Aneta Kozeleková, učo 461172. Změněno: 13. 10. 2022 13:21.
    21. KOZELEKOVÁ, Aneta, Alexandra NÁPLAVOVÁ, Tomáš BROM, Norbert GAŠPARIK, Jan ŠIMEK, Josef HOUSER a Jozef HRITZ. Phosphorylated and Phosphomimicking Variants May Differ—A Case Study of 14-3-3 Protein. Frontiers in Chemistry. Frontiers Media SA, 2022, roč. 10, March, s. 1-17. ISSN 2296-2646. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3389/fchem.2022.835733.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00119696 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Kozeleková, Aneta (203 Česká republika, domácí) -- Náplavová, Alexandra (203 Česká republika, domácí) -- Brom, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Gašparik, Norbert (703 Slovensko, domácí) -- Šimek, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Houser, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: 14-3-3; phosphorylation; phosphomimicking mutation; oligomeric state; dissociation constant
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 27. 10. 2024 15:22.
    22. RAVASZOVÁ, Karin, Alena HOFROVÁ a Jozef HRITZ. Preparation of catalytic domain of carbonic anhydrase IX with different protein tags. In XXII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2022.
      Název česky: Prípřava katalytické domény karbonické anhydrázy IX s použitím různých proteinových kotev
      angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: carbonic anhydrase IX, catalytic domain, protein tag

      Změnila: Mgr. Karin Ravaszová, učo 499287. Změněno: 10. 5. 2023 15:15.
    23. TROŠANOVÁ, Zuzana, Petr LOUŠA, Aneta KOZELEKOVÁ, Tomáš BROM, Norbert GAŠPARIK, Ján TUNGLI, Veronika WEISOVÁ, Erik ŽUPA, Gabriel ŽOLDÁK a Jozef HRITZ. Quantitation of Human 14-3-3ζ Dimerization and the Effect of Phosphorylation on Dimer-monomer Equilibria. Journal of Molecular Biology. Elsevier, 2022, roč. 434, č. 7, s. 1-13. ISSN 0022-2836. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jmb.2022.167479.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00125485 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Trošanová, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Louša, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Kozeleková, Aneta (203 Česká republika, domácí) -- Brom, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Gašparik, Norbert (703 Slovensko, domácí) -- Tungli, Ján (703 Slovensko, domácí) -- Weisová, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Župa, Erik (703 Slovensko, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: 14-3-3; phosphorylation; dimerization; dissociation constant; FRET; NMR
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 9. 10. 2024 13:16.
    24. TUŽINČIN, Dávid, Pavel KADEŘÁVEK, Petr PADRTA a Lukáš ŽÍDEK. Seeing the invisible – Study of transiently formed protein conformation found in domain 1.1 of bacterial transcription factor. In XVIII Discussions in Structural Molecular Biology and 5th User Meeting of CIISB (Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology). 2022.
      URL
      Název anglicky: Seeing the invisible – Study of transiently formed protein conformation found in domain 1.1 of bacterial transcription factor
      RIV/00216224:14310/22:00126954 Prezentace na konferencích. angličtina.
      Tužinčin, Dávid (703 Slovensko, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, garant) -- Padrta, Petr (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: NMR; sigmaA; Bacillus subtilis; region 1.1; protein dynamics
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Dávid Tužinčin, učo 460988. Změněno: 13. 6. 2023 13:44.
    25. PLUCAROVÁ, Jitka, Séverine JANSEN, Subhash NARASIMHAN, Alice LANÍKOVÁ, Marc LEWITZKY, M. Stephan FELLER a Lukáš ŽÍDEK. Specific phosphorylation of microtubule-associated protein 2c by extracellular signal–regulated kinase reduces interactions at its Pro-rich regions. JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. UNITED STATES: ELSEVIER, 2022, roč. 298, č. 10, s. 102384-102399. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jbc.2022.102384.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00126868 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Plucarová, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Narasimhan, Subhash (356 Indie, domácí) -- Laníková, Alice (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR; PKA; Src homology 3 domain; cyclin-dependent kinase; extracellular signal–regulated kinase; growth factor receptor-bound protein 2 (GRB2); microtubule-associated protein
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 9. 10. 2024 13:18.
    26. KUČINSKAS, Gytis a Jozef HRITZ. Structure of recombinant Tau40 protein fibrils prepared without enhancers of fibrilization. 2022.
      Full link to the abstract at the organizers webpage
      angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Gytis Kučinskas, učo 511828. Změněno: 26. 10. 2022 15:36.
    27. ŠIMEK, Jan, Kateřina KRÁLOVÁ a Jozef HRITZ. To homodimerize or to heterodimerize: story of 14-3-3 protein dimer formation. 2022.
      URL

      Klíčová slova anglicky: 14-3-3 protein; homodimerization, heterodimerization, fluorescence, FRET, kinetics, dissociation constant
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Jan Šimek, učo 484776. Změněno: 17. 4. 2023 13:12.
    28. EPASTO, Ludovica M., Kateryna CHE, Fanny KOZAK, Albina SELIMOVIC, Pavel KADEŘÁVEK a Dennis KURZBACH. Toward protein NMR at physiological concentrations by hyperpolarized water-Finding and mapping uncharted conformational spaces. Science advances. New York: American Association for the Advancement of Science, 2022, roč. 8, č. 31, s. 1-7. ISSN 2375-2548. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1126/sciadv.abq5179.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00126458 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DYNAMIC NUCLEAR-POLARIZATIONINTRINSICALLY DISORDERED PROTEINSTRANSCRIPTION FACTORSDNAMAXMYCPREDICTIONMECHANISMINSIGHTSCOGNATE
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 30. 10. 2024 14:18.
    29. ŠIMEK, Jan, Kateřina KRÁLOVÁ a Jozef HRITZ. 14-3-3 protein isoforms: mutual dimerization propensities screening kit. 2022.
      URL

      Klíčová slova anglicky: 14-3-3 protein; homodimerization, heterodimerization, fluorescence, FRET, kinetics, dissociation constant
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Jan Šimek, učo 484776. Změněno: 17. 4. 2023 13:33.
    30. GAŠPARIK, Norbert, Aneta KOZELEKOVÁ, Radek CRHA a Jozef HRITZ. 19F labelling of disordered and hybrid proteins for 19F NMR spectroscopy. In XVIII Discussions in Structural Molecular Biology and 5th User Meeting of CIISB. 2022.
      URL
      RIV/00216224:14740/22:00125691 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Gašparik, Norbert (703 Slovensko, domácí) -- Kozeleková, Aneta (203 Česká republika, domácí) -- Crha, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant)
      Klíčová slova anglicky: 14-3-3 protein; Fluorine NMR; 19F NMR; Tau protein
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Norbert Gašparik, učo 451748. Změněno: 25. 4. 2022 11:56.
    31. NÁPLAVOVÁ, Alexandra, Aneta KOZELEKOVÁ, Norbert GAŠPARIK a Jozef HRITZ. 19F Trp labelling as a selective probe into the dimeric interface. In Instruct Biennial Structural Biology Conference 2022. 2022.
      URL
      angličtina.
      Klíčová slova anglicky: 14-3-3 protein; 19F NMR; 19F Trp labelling
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Alexandra Náplavová, učo 484296. Změněno: 24. 5. 2022 14:37.

    2021

    1. BERA, Krishnendu, V. S. Jeba REEDA, P. R. BABILA, Dhurvas Chandrasekaran DINESH, Jozef HRITZ a Thangavel KARTHICK. An in silico molecular dynamics simulation study on the inhibitors of SARS-CoV-2 proteases (3CLpro and PLpro) to combat COVID-19. Molecular Simulation. Taylor & Francis Ltd, 2021, roč. 47, č. 14, s. 1168-1184. ISSN 0892-7022. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/08927022.2021.1957884.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00122008 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Bera, Krishnendu (356 Indie, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí) -- Karthick, Thangavel (garant)
      Klíčová slova anglicky: SARS-CoV-2 PLpro; SARS-CoV-2 3CLpro inhibitors; molecular docking; molecular dynamics simulation; MM/PBSA
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 30. 1. 2024 09:41.
    2. KUSHKEVYCH, Ivan, Daryna ABDULINA, Dani DORDEVIC, Monika ROZEHNALOVÁ, Monika VÍTĚZOVÁ, Martin ČERNÝ, Pavel SVOBODA a Simon K.-M. R. RITTMANN. Basic Bioelement Contents in Anaerobic Intestinal Sulfate-Reducing Bacteria. Applied Sciences. Basel: MDPI, 2021, roč. 11, č. 3, s. 1-15. ISSN 2076-3417. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/app11031152.
      URL
      RIV/00216224:14310/21:00121033 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Kushkevych, Ivan (804 Ukrajina, garant, domácí) -- Vítězová, Monika (203 Česká republika, domácí) -- Černý, Martin (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: trace metals; hydrogen sulfide; toxicity; cell-free extracts; ulcerative colitis
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 19. 5. 2021 11:50.
    3. KOZELEKOVÁ, Aneta, Alexandra NÁPLAVOVÁ, Tomáš BROM, Norbert GAŠPARIK, Radek CRHA a Jozef HRITZ. Biophysical characterisation of phosphorylated 14-3-3ζ protein. In XXI. Workshop of biophysical chemists and electrochemists. 2021. ISBN 978-80-210-9943-2.
      URL
      angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Aneta Kozeleková, učo 461172. Změněno: 31. 3. 2022 15:16.
    4. GAFFOUR, Amina, Jana PAVLIKOVA PRECECHTELOVA, Michael BAKKER a Krishnendu BERA. Calculation of NMR spin-spin couplings for intrinsically disordered proteins: a prospective tool to facilitate experimental NMR studies. In PAVLIKOVA PRECECHTELOVA, Jana a Michael BAKKER. 5th Users’ Conference of IT4Innovations. 2021.

      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Krishnendu Bera, Ph.D., učo 490519. Změněno: 14. 9. 2022 15:04.
    5. ŠKUBNÍK, Karel, Lukáš SUKENÍK, David BUCHTA, Tibor FÜZIK, Michaela PROCHÁZKOVÁ, Jana MORAVCOVÁ, Lenka ŠMERDOVÁ, Antonín PŘIDAL, Robert VÁCHA a Pavel PLEVKA. Capsid opening enables genome release of iflaviruses. Science advances. New York: American Association for the Advancement of Science, 2021, roč. 7, č. 1, s. 1-9. ISSN 2375-2548. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1126/sciadv.abd7130.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00118990 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Škubník, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Buchta, David (203 Česká republika, domácí) -- Füzik, Tibor (703 Slovensko, domácí) -- Procházková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Moravcová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Šmerdová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Přidal, Antonín (203 Česká republika) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DEFORMED WING VIRUSBEE PARALYSIS VIRUSCRYO-EMMOLECULAR-DYNAMICSFORCE-FIELDX-RAYPOLIOVIRUSRNAMODELTRANSITIONS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 27. 10. 2024 14:18.
    6. SUKENÍK, Lukáš, Liya MUKHAMEDOVA, Michaela PROCHÁZKOVÁ, Karel ŠKUBNÍK, Pavel PLEVKA a Robert VÁCHA. Cargo Release from Nonenveloped Viruses and Virus-like Nanoparticles: Capsid Rupture or Pore Formation. ACS Nano. Washington, D.C.: American Chemical Society, 2021, roč. 15, č. 12, s. 19233-19243. ISSN 1936-0851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acsnano.1c04814.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00119475 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Sukeník, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Mukhamedova, Liya (643 Rusko, domácí) -- Procházková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Škubník, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Vácha, Robert (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: virus-like nanoparticlesRNA virusgenome releasecapsidcomputer simulationscoarse-grained modelcryo-EM
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 27. 10. 2024 14:16.
    7. WALØEN, Kai, Kunwar JUNG-KC, Elisa D. VECCHIA, Sunil PANDEY, Norbert GAŠPARIK, Anne DØSKELAND, Sudarshan PATIL, Rune KLEPPE, Jozef HRITZ, William H J NORTON, Aurora MARTINEZ a Jan HAAVIK. Cysteine Modification by Ebselen Reduces the Stability and Cellular Levels of 14-3-3 Proteins. Molecular Pharmacology. American Society for Pharmacology and Experimental Therapeutics, 2021, roč. 100, č. 2, s. 155-169. ISSN 0026-895X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1124/molpharm.120.000184.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00119210 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Gašparik, Norbert (703 Slovensko, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí) -- Haavik, Jan (garant)
      Klíčová slova anglicky: TYROSINE-HYDROXYLASE; STRUCTURAL BASIS; PHOSPHORYLATION; 14-3-3-PROTEINS; IDENTIFICATION; PROLIFERATION; THIMEROSAL; INHIBITOR; OXIDATION; TARGETS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 2. 11. 2024 20:50.
    8. WANG, Z.Q., S. PISANO, V. GHINI, Pavel KADEŘÁVEK, M. ZACHRDLA, P. PELUPESSY, M. KAZMIERCZAK, T. MARQUARDSEN, J.M. TYBURN, G. BOUVIGNIES, G. PARIGI, C. LUCHINAT a F. FERRAGE. Detection of Metabolite-Protein Interactions in Complex Biological Samples by High-Resolution Relaxometry: Toward Interactomics by NMR. Journal of the American Chemical Society. Washington: American Chemical Society, 2021, roč. 143, č. 25, s. 9393-9404. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jacs.1c01388.
      URL
      angličtina. Spojené státy.
      Klíčová slova anglicky: NUCLEAR-MAGNETIC-RESONANCETRANSFER DIFFERENCE NMRHUMAN SERUM-ALBUMINLIGAND-BINDINGH-1-NMR SPECTROSCOPYLOW-FIELDP-31 NMRRELAXATIONMETABOLOMICSMETABONOMICS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 23. 9. 2021 12:25.
    9. TAYLOR, C., N. SCHONBERGER, Alice LANÍKOVÁ, M. PATZSCHKE, B. DROBOT, Lukáš ŽÍDEK a F. LEDERER. Investigation of the structure and dynamics of gallium binding to high-affinity peptides elucidated by multi-scale simulation, quantum chemistry, NMR and ITC dagger. Physical Chemistry Chemical Physics. CAMBRIDGE: Royal Society of Chemistry, 2021, roč. 23, č. 14, s. 8618-8632. ISSN 1463-9076. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/d1cp00356a.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00121617 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Laníková, Alice (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: high-affinity peptides; multi-scale simulation; quantum chemistry; NMR; ITC
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Jana Kuchtová, učo 241368. Změněno: 15. 10. 2024 14:26.
    10. BERA, Krishnendu. Molecular dynamics simulation of protein and protein-ligand complex. In International E-workshop "Machine Learning applications in Drug Discovery: Basic to Advanced”. 2021.

      Druh účasti: vyžádaná přednáška
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: Krishnendu Bera, Ph.D., učo 490519. Změněno: 29. 9. 2021 21:53.
    11. KITOKA, K., R. SKRABANA, Norbert GAŠPARIK, Jozef HRITZ a K. JAUDZEMS. NMR Studies of Tau Protein in Tauopathies. Frontiers in Molecular Biosciences. Lausanne: Frontiers Media SA, 2021, roč. 8, NOV, s. 761227-761242. ISSN 2296-889X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3389/fmolb.2021.761227.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00123604 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Gašparik, Norbert (703 Slovensko, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: tau; nuclear magnetic resonance; protein structure; Alzheimer's disease; filaments
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 30. 1. 2024 09:44.
    12. BERA, Krishnendu, Suchismita SUBADINI, Jozef HRITZ a Harekrushna SAHOO. Perturbing the unfolding of CRABP I using polyethylene glycol: An experimental and theoretical study. Online. In 13th EBSA congress, July 24–28, 2021, Vienna, Austria. European Biophysics Journal, Springer Nature, 2021, s. 1–226. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00249-021-01558-w.
      URL
      angličtina.
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: Krishnendu Bera, Ph.D., učo 490519. Změněno: 30. 9. 2021 00:34.
    13. SUBADINI, Suchismita, Krishnendu BERA, Jozef HRITZ a Harekrushna SAHOO. Polyethylene glycol perturbs the unfolding of CRABP I: A correlation between experimental and theoretical approach. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces. Elsevier, 2021, roč. 202, June, s. 111696-111705. ISSN 0927-7765. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.colsurfb.2021.111696.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00121266 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Bera, Krishnendu (356 Indie, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: PEG; protein stabilizer; Crowding agent; excluded volume; protein unfolding
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 30. 1. 2024 09:45.
    14. GVARJALADZE, David, Tamari GULUA, Shota GOGICHAISHVILI, Jozef HRITZ a Nunu METREVEL. Quadruplex Priming Amplification at a Range of Human Body Temperature. Biointerface Research in Applied Chemistry. Bucuresti: AMG Transcend Association, 2021, roč. 11, č. 1, s. 7932-7942. ISSN 2069-5837. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.33263/BRIAC111.79327942.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00120870 Článek v odborném periodiku. angličtina. Rumunsko.
      Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: quadruplex; DNA amplification; the point of care; lead cations; fluorescence
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 30. 1. 2024 09:46.
    15. BERA, Krishnendu, A. LASORSA, I. MALKI, E. DUPRE, F.X. CANTRELLE, H. MERZOUGUI, D. SINNAEVE, X. HANOULLE, Jozef HRITZ a I. LANDRIEU. Study of Conformational and Dynamic Changes upon Phosphorylation of Proline Rich Region of Tau210-240 Peptide Using Molecular Dynamic Simulation. 2021.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00121211 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Bera, Krishnendu (356 Indie, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Molecular Dynamic Simulation; Tau210-240
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 10. 3. 2021 15:12.
    16. HOFROVÁ, Alena, Petr LOUŠA, Monika KUBÍČKOVÁ, Jozef HRITZ, Tomáš OTAŠEVIČ, Martin REPKO, Andrea KNIGHT a Martin PISKÁČEK. Universal two-point interaction of mediator KIX with 9aaTAD activation domains. Journal of cellular biochemistry. Hoboken (USA): WILEY-BLACKWELL, 2021, roč. 122, č. 10, s. 1544-1555. ISSN 0730-2312. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/jcb.30075.
      URL
      RIV/00216224:14110/21:00120140 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Hofrová, Alena (203 Česká republika, domácí) -- Louša, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Kubíčková, Monika (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí) -- Otaševič, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Repko, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Knight, Andrea (203 Česká republika, domácí) -- Piskáček, Martin (40 Rakousko, domácí)
      Klíčová slova anglicky: 9aaTAD; activation domain; E2A; KIX; MLL; p53
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 27. 10. 2024 15:14.
    17. NÁPLAVOVÁ, Alexandra, Aneta KOZELEKOVÁ a Jozef HRITZ. 14-3-3ζ phosphomimicking mutants: an alternative to phosphorylation?. Online. In Študentská vedecká konferencia PriF UK 2021: zborník recenzovaných príspevkov. Bratislava: Univerzita Komenského v Bratislave, 2021, s. 703-708. ISBN 978-80-223-5132-4.
      URL
      RIV: Stať ve sborníku. angličtina. Slovensko.
      Náplavová, Alexandra (203 Česká republika, domácí) -- Kozeleková, Aneta (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: 14-3-3; 14-3-3zeta; phosphomimicking mutant; monomerization; thermal stability
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Dubská, učo 77638. Změněno: 16. 5. 2024 09:24.
    18. GAŠPARIK, Norbert, Aneta KOZELEKOVÁ, Petr LOUŠA a Jozef HRITZ. 19F labelling of 14-3-3ζ recombinant protein for 19F NMR spectroscopy. In XXVI. Annual Congress of Czech and Slovak Societies for Biochemistry and Molecular Biology with cooperation of Austrian and German Biochemical Section. 2021. ISBN 978-80-907779-1-0.
      URL
      RIV/00216224:14740/21:00122345 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Gašparik, Norbert (703 Slovensko, domácí) -- Kozeleková, Aneta (203 Česká republika, domácí) -- Louša, Petr (703 Slovensko, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: 14-3-3 protein; Fluorine NMR; 19F NMR
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Norbert Gašparik, učo 451748. Změněno: 22. 4. 2022 10:20.

    2020

    1. JASEŇÁKOVÁ, Zuzana, Vojtěch ZAPLETAL, Petr PADRTA, Milan ZACHRDLA, N. BOLIK-COULON, T. MARQUARDSEN, J.M. TYBURN, Lukáš ŽÍDEK, F. FERRAGE a Pavel KADEŘÁVEK. Boosting the resolution of low-field 15N relaxation experiments on intrinsically disordered proteins with triple-resonance NMR. Journal of biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2020, roč. 74, 2-3, s. 139-145. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-019-00298-6.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00114136 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Jaseňáková, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Zachrdla, Milan (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nuclear magnetic resonance; Relaxation; Dynamics; Intrinsically disordered proteins; High-resolution relaxometry; Non-uniform sampling
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 30. 10. 2024 14:13.
    2. KUSHKEVYCH, Ivan, Jorge CASTRO SANGRADOR, Dordević DANI, Monika ROZEHNALOVÁ, Martin ČERNÝ, Roman FAFULA, Monika VÍTĚZOVÁ a Simon K.-M. R. RITTMANN. Evaluation of Physiological Parameters of Intestinal Sulfate-Reducing Bacteria Isolated from Patients Suffering from IBD and Healthy People. Journal of Clinical Medicine. BASEL: MDPI, 2020, roč. 9, č. 6, s. 1-19. ISSN 2077-0383. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/jcm9061920.
      URL
      RIV/00216224:14310/20:00115827 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Kushkevych, Ivan (804 Ukrajina, garant, domácí) -- Castro Sangrador, Jorge (724 Španělsko, domácí) -- Dani, Dordević (203 Česká republika) -- Rozehnalová, Monika (203 Česká republika) -- Černý, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Vítězová, Monika (203 Česká republika, domácí) -- Rittmann, Simon K.-M. R. (40 Rakousko)
      Klíčová slova anglicky: ulcerative colitis; intestinal microbiota; bowel disease; sulfate reduction; hydrogen sulfide; toxicity
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 11. 7. 2023 08:46.
    3. LOUŠA, Petr, Zuzana TROŠANOVÁ, Aneta KOZELEKOVÁ, Tomáš BROM, Norbert GAŠPARIK, Veronika WEISOVÁ, G. ŽOLDÁK a Jozef HRITZ. HOW PHOSPHORYLATION IMPACTS 14-3-3ζ DIMERIZATION. In XX. Workshop of Biophysical Chemists and Electrochemists. 2020. ISBN 978-80-210-9655-4.
      URL
      angličtina. Česká republika.
      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 15. 12. 2020 15:38.
    4. HRITZ, Jozef. CHALLENGES IN STRUCTURAL AND INTERACTION PROPERTIES OF INTRINSICALLY DISORDERED PROTEINS. In XX. Workshop of Biophysical Chemists and Electrochemists. 2020. ISBN 978-80-210-9655-4.
      URL
      angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: Intrinsically disordered proteins

      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 15. 12. 2020 15:30.
    5. ZAPLETAL, Vojtěch, Arnošt MLÁDEK, Kateřina BENDOVÁ, Petr LOUŠA, Erik NOMILNER, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Vojtěch KUBÁŇ, Markéta MAKOVICKÁ, Alice LANÍKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Jozef HRITZ. Choice of Force Field for Proteins Containing Structured and Intrinsically Disordered Regions. Biophysical Journal. Bethesda, USA: Biophysical Society, 2020, roč. 118, č. 7, s. 1621-1633. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2020.02.019.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00115635 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Mládek, Arnošt (203 Česká republika, domácí) -- Bendová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Louša, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Nomilner, Erik (703 Slovensko, domácí) -- Jaseňáková, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Kubáň, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Makovická, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Laníková, Alice (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: MOLECULAR-DYNAMICS; TYROSINE-HYDROXYLASE; NMR RELAXATION; RNA-POLYMERASE; DELTA-SUBUNIT; PREDICTION; PHOSPHORYLATION; RECOGNITION; ALIGNMENT; BIOLOGY
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Jana Kuchtová, učo 241368. Změněno: 14. 10. 2024 13:27.
    6. BOUCHAL, Tomáš, Ivo DURNÍK, Viktor ILLÍK, Kamila RÉBLOVÁ a Petr KULHÁNEK. Importance of base-pair opening for mismatch recognition. Nucleic Acids Research. Oxford University Press, 2020, roč. 48, č. 20, s. 11322-11334. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkaa896.
      URL
      Název anglicky: Importance of base-pair opening for mismatch recognition
      RIV/00216224:14310/20:00114694 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Bouchal, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Durník, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- Illík, Viktor (703 Slovensko, domácí) -- Réblová, Kamila (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: mismatch repair; MutS/DNA; adaptive biasing force; free energy; simple base-pair parameters
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703. Změněno: 17. 2. 2023 23:20.
    7. PLEŠINGROVÁ, Klára, Norbert GAŠPARIK a Jozef HRITZ. OPTIMIZATION OF EXPRESSSION AND PURIFICATION OF FRAGMENT FROM TAU PROTEIN. In XX. Workshop of Biophysical Chemists and Electrochemists. 2020. ISBN 978-80-210-9655-4.
      URL
      angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: Tau protein

      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 15. 12. 2020 15:20.
    8. TŘÍSKOVÁ, Iveta, Tadeja JANC a Libuše TRNKOVÁ. OXIDATION SIGNALS OF INSULIN ON SCREEN-PRINTED ELECTRODES. Online. In Libuše Trnková. XX. Workshop of Biophysical Chemists and Electrochemists. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2020, s. 66-67. ISBN 978-80-210-9655-4.
      URL
      angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: insulin; modified screen-printed electrodes; voltammetry
      Druh sborníku: předkonferenční sborník

      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 12. 5. 2021 17:33.
    9. NÁPLAVOVÁ, Alexandra, Aneta KOZELEKOVÁ a Jozef HRITZ. Phosphomimicking mutants: why to be careful. In XX. Workshop of Biophysical Chemists and Electrochemists. 2020. ISBN 978-80-210-9655-4.
      URL
      angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: phosphomimicking mutant; 14-3-3; protein stability

      Změnila: Mgr. Alexandra Náplavová, učo 484296. Změněno: 5. 1. 2023 16:29.
    10. OLSEN, G.L., O. SZEKELY, B. MATEOS, Pavel KADEŘÁVEK, F. FERRAGE, R. KONRAT, R. PIERATTELLI, I.C. FELLI, G. BODENHAUSEN, D. KURZBACH a L. FRYDMAN. Sensitivity-enhanced three-dimensional and carbon-detected two-dimensional NMR of proteins using hyperpolarized water. Journal of biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2020, roč. 74, 2-3, s. 161-171. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-020-00301-5.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00115687 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Hyperpolarization; Dissolution-dynamic nuclear polarization (D-DNP); Direct C-13 detection; 3D NMR; Non-uniform sampling; BEST-HNCO
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 30. 10. 2024 14:14.
    11. KUBÁŇ, Vojtěch, P. MACEK, Jozef HRITZ, K. NECHVATALOVA, K. NEDBALCOVA, M. FALDYNA, Peter ŠEBO, Lukáš ŽÍDEK a L. BUMBA. Structural Basis of Ca2+-Dependent Self-Processing Activity of Repeat-in-Toxin Proteins. MBIO. Washington, D.C.: American Society for Microbiology, 2020, roč. 11, č. 2, s. 1-18. ISSN 2150-7511. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1128/mBio.00226-20.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00115752 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Kubáň, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí) -- Šebo, Peter (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RTX toxins; cell adhesion; clip-and-link; host-pathogen interactions; nuclear magnetic resonance
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Jana Kuchtová, učo 241368. Změněno: 14. 10. 2024 17:35.
    12. LOUŠA, Petr a Jozef HRITZ. Studying Tight Dimers Using Ordinary Fluorimeter. In CEITEC PhD Conference. 2020.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00118403 Konferenční abstrakt. angličtina. Česká republika.
      Louša, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Ordinary Fluorimeter
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 17. 3. 2021 14:29.
    13. BOLIK-COULON, N., Pavel KADEŘÁVEK, P. PELUPESSY, J.N. DUMEZ, F. FERRAGE a S.F. COUSIN. Theoretical and computational framework for the analysis of the relaxation properties of arbitrary spin systems. Application to high-resolution relaxometry. Journal of Magnetic Resonance. San Diego: Academic Press Inc. Elsevier Science, 2020, roč. 313, APR, s. 106718-106734. ISSN 1090-7807. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jmr.2020.106718.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00118364 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nuclear spin relaxation; Analytical relaxation computation; High-resolution relaxometry
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 30. 10. 2024 14:14.
    14. PROCHÁZKOVÁ, Michaela, Karel ŠKUBNÍK, Tibor FÜZIK, Liya MUKHAMEDOVA, A. PRIDAL a Pavel PLEVKA. Virion structures and genome delivery of honeybee viruses. CURRENT OPINION IN VIROLOGY. OXFORD: ELSEVIER SCI LTD, 2020, roč. 45, DEC, s. 17-24. ISSN 1879-6257. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.coviro.2020.06.007.
      URL
      RIV/00216224:14740/20:00114765 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Procházková, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Škubník, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Füzik, Tibor (703 Slovensko, domácí) -- Mukhamedova, Liya (643 Rusko, domácí) -- Plevka, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DEFORMED WING VIRUS; BEE PARALYSIS VIRUS; PICORNA-LIKE VIRUS; APIS-MELLIFERA L.; IN-VITRO; IDENTIFICATION; DECLINES; TRANSMISSION; PARTICLES; SACBROOD
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 10. 3. 2021 21:39.

    2019

    1. BROM, Tomáš, Zuzana TROŠANOVÁ, Petr LOUŠA, Norbert GAŠPARIK, Krishnendu BERA, Gabriel ŽOLDÁK a Jozef HRITZ. Monomer-dimer equilibria of 14-3-3ζ protein. In XVI. Discussions in Structural Molecular Biology. 2019.
      URL
      Název česky: Monomer-dimerní rovnováhy proteinu 14-3-3ζ.

      Změnil: Mgr. Tomáš Brom, učo 436685. Změněno: 5. 1. 2021 15:20.
    2. KADEŘÁVEK, Pavel, N. BOLIK-COULON, S.F. COUSIN, T. MARQUARDSEN, J.M. TYBURN, J.N. DUMEZ a F. FERRAGE. Protein Dynamics from Accurate Low-Field Site-Specific Longitudinal and Transverse Nuclear Spin Relaxation. Journal of Physical Chemistry Letters. Washington: American Chemical Society, 2019, roč. 10, č. 19, s. 5917-5922. ISSN 1948-7185. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jpclett.9b02233.
      URL
      RIV/00216224:14740/19:00113242 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: C-13 NMR-SPECTROSCOPY; SIDE-CHAIN DYNAMICS; BACKBONE DYNAMICS; MAGNETIC-RELAXATION; CYCLING DEVICE; LIQUIDS; PROTON; ENHANCEMENT; RELAXOMETRY; COMPLEXES
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 30. 10. 2024 14:09.
    3. KUBÁŇ, Vojtěch, Pavel SRB, Hana ŠTÉGNEROVÁ, Petr PADRTA, Milan ZACHRDLA, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, H. SANDEROVA, D. VITOVSKA, L. KRASNY, T. KOVAL, J. DOHNALEK, J. ZIEMSKA-LEGIECKA, M. GRYNBERG, P. JARNOT, A. GRUCA, M.R. JENSEN, M. BLACKLEDGE a Lukáš ŽÍDEK. Quantitative Conformational Analysis of Functionally Important Electrostatic Interactions in the Intrinsically Disordered Region of Delta Subunit of Bacterial RNA Polymerase. Journal of the American Chemical Society. Washington: American Chemical Society, 2019, roč. 141, č. 42, s. 16817-16828. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jacs.9b07837.
      URL
      RIV/00216224:14740/19:00108078 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Kubáň, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Srb, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Štégnerová, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Zachrdla, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Jaseňáková, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Sanderova, H. (203 Česká republika) -- Vitovska, D. (203 Česká republika) -- Krasny, L. (203 Česká republika) -- Koval, T. (203 Česká republika) -- Dohnalek, J. (203 Česká republika) -- Ziemska-Legiecka, J. (616 Polsko) -- Grynberg, M. (616 Polsko) -- Jarnot, P. (616 Polsko) -- Gruca, A. (616 Polsko) -- Jensen, M.R. (250 Francie) -- Blackledge, M. (250 Francie) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RESIDUAL DIPOLAR COUPLINGS; BACILLUS-SUBTILIS; GENE-EXPRESSION; RAPID CHANGES; PROTEINS; NMR; TRANSCRIPTION; DETERMINANTS; PREDICTION; SCATTERING
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 30. 10. 2024 14:10.
    4. PAVLÍKOVÁ PŘECECHTĚLOVÁ, Jana, Arnošt MLÁDEK, Vojtěch ZAPLETAL a Jozef HRITZ. Quantum Chemical Calculations of NMR Chemical Shifts in Phosphorylated Intrinsically Disordered Proteins. Journal of Chemical Theory and Computation. Washington DC: American Chemical Society, 2019, roč. 15, č. 10, s. 5642-5658. ISSN 1549-9618. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jctc.8b00257.
      URL
      RIV/00216224:14740/19:00107747 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Pavlíková Přecechtělová, Jana (203 Česká republika, garant, domácí) -- Mládek, Arnošt (203 Česká republika, domácí) -- Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DENSITY-FUNCTIONAL CALCULATIONS; MOLECULAR-ORBITAL METHODS; CORRELATION-ENERGY; BASIS-SET; MECHANICAL CALCULATION; PERTURBATION-THEORY; SHIELDING SCALE; AB-INITIO; P-31; N-15
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 31. 3. 2020 21:50.
    5. BROM, Tomáš, Aneta KOZELEKOVÁ, Petr LOUŠA, Norbert GAŠPARIK, Krishnendu BERA, Gabriel ŽOLDÁK a Jozef HRITZ. Structural study of 14-3-3ζ monomeric mutant. In XIXth Workshop of Physical Chemist and Electrochemists. 2019. ISBN 978-80-210-9309-6.
      URL
      Název česky: Strukturní studie monomerního mutantu proteinu 14-3-3ζ.

      Změnil: Mgr. Tomáš Brom, učo 436685. Změněno: 30. 5. 2022 11:40.
    6. MELKOVÁ, Kateřina, Vojtěch ZAPLETAL, Subhash NARASIMHAN, Séverine JANSEN, Jozef HRITZ, R. SKRABANA, M. ZWECKSTETTER, M. RINGKJOBING JENSEN, M. BLACKLEDGE a Lukáš ŽÍDEK. Structure and Functions of Microtubule Associated Proteins Tau and MAP2c: Similarities and Differences. Biomolecules. Basel, Switzerland: MDPI AG, 2019, roč. 9, č. 3, s. 105-136. ISSN 2218-273X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/biom9030105.
      URL
      RIV/00216224:14740/19:00109608 Článek v odborném periodiku. angličtina. Švýcarsko.
      Melková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Narasimhan, Subhash (356 Indie, domácí) -- Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí) -- Skrabana, R. (703 Slovensko) -- Zweckstetter, M. (276 Německo) -- Ringkjobing Jensen, M. (250 Francie) -- Blackledge, M. (250 Francie) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: microtubule associated protein; tau; intrinsically disordered protein; phosphorylation; nuclear magnetic resonance
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 5. 3. 2020 09:45.
    7. BOLIK-COULON, N., A.F. COUSIN, Pavel KADEŘÁVEK, J.N. DUMEZ a F. FERRAGE. Understanding the methyl-TROSY effect over a wide range of magnetic fields. Journal of Chemical Physics. MELVILLE: American Institute of Physics, 2019, roč. 150, č. 22, s. 224202-224213. ISSN 0021-9606. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1063/1.5095757.
      URL
      RIV/00216224:14740/19:00110669 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Bolik-Coulon, N. (250 Francie) -- Cousin, A.F. (250 Francie) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Dumez, J.N. (250 Francie) -- Ferrage, F. (250 Francie)
      Klíčová slova anglicky: MOLECULAR-WEIGHT PROTEINS; SIDE-CHAIN DYNAMICS; MODEL-FREE APPROACH; NMR-SPECTROSCOPY; RELAXATION; C-13; MACROMOLECULES; STRATEGIES; MOTIONS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Martina Blahová, učo 371476. Změněno: 30. 10. 2024 14:11.

    2018

    1. HRITZ, Jozef a Arnošt MLÁDEK. Computational Molecular Modeling Techniques of Biomacromolecular Systems. Online. In Jan Hejátko, Toshio Hakoshima. Plant Structural Biology: Hormonal Regulations. 1. vyd. CHAM: SPRINGER INT PUBLISHING AG, 2018, s. 295-322. n/a. ISBN 978-3-319-91352-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-91352-0_15.
      URL
      RIV/00216224:14740/18:00103861 Kapitola resp. kapitoly v odborné knize. angličtina. Švýcarsko.
      Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí) -- Mládek, Arnošt (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Molecular biology Plant development Signal transduction Arabidopsis X-ray crystallography NMR SAXS Molecular dynamics simulations
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 3. 2019 10:38.
    2. ZAPLETAL, Vojtěch, Kateřina MELKOVÁ, Séverine JANSEN, Erik NOMILNER, M.R. JENSEN, M. BLACKLEDGE a Lukáš ŽÍDEK. Conformation and dynamics of intrinsically disordered microtubule associated protein 2c. 2018. ISSN 2211-5463. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/2211-5463.12453.
      URL
      RIV/00216224:14740/18:00103544 Konferenční abstrakt. angličtina. Spojené státy.
      Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Melková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Nomilner, Erik (703 Slovensko, domácí) -- Jensen, M.R. (250 Francie) -- Blackledge, M. (250 Francie) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: protein 2c; MAP2c
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 3. 2019 15:24.
    3. JANDOVA, Z., Zuzana TROŠANOVÁ, Veronika WEISOVÁ, C. OOSTENBRINK a Jozef HRITZ. Free energy calculations on the stability of the 14-3-3 zeta protein. Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics. Amsterdam, The Netherlands: Elsevier, 2018, roč. 1866, č. 3, s. 442-450. ISSN 1570-9639. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bbapap.2017.11.012.
      URL
      RIV/00216224:14740/18:00100854 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Jandova, Z. (203 Česká republika) -- Trošanová, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Weisová, Veronika (703 Slovensko, domácí) -- Oostenbrink, C. (40 Rakousko) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: 14-3-3 protein; Protein stability; Molecular dynamics simulation; Differential scanning calorimetry; Free energy calculation; Thermodynamic integration
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 13:20.
    4. MELKOVÁ, Kateřina, Vojtěch ZAPLETAL, Séverine JANSEN, Erik NOMILNER, Milan ZACHRDLA, Jozef HRITZ, Jiří NOVÁČEK, M. ZWECKSTETTER, M.R. JENSEN, M. BLACKLEDGE a Lukáš ŽÍDEK. Functionally specific binding regions of microtubule-associated protein 2c exhibit distinct conformations and dynamics. Journal of Biological Chemistry. Bethesda, USA: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2018, roč. 293, č. 34, s. 13297-13309. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.RA118.001769.
      URL
      RIV/00216224:14740/18:00101098 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Melková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Nomilner, Erik (703 Slovensko, domácí) -- Zachrdla, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Zweckstetter, M. (276 Německo) -- Jensen, M.R. (250 Francie) -- Blackledge, M. (250 Francie) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR relaxation; Tau protein (Tau); microtubule-associated protein (MAP); nuclear magnetic resonance (NMR); paramagnetic relaxation enhancement (PRE); protein conformation; small-angle X-ray scattering (SAXS)
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 13:21.
    5. KADEŘÁVEK, Pavel, F. FERRAGE, G. BODENHAUSEN a D. KURZBACH. High-Resolution NMR of Folded Proteins in Hyperpolarized Physiological Solvents. Chemistry - A European Journal. WEINHEIM: Wiley, 2018, roč. 24, č. 51, s. 13418-13423. ISSN 0947-6539. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/chem.201802885.
      URL
      RIV/00216224:14740/18:00104510 Článek v odborném periodiku. angličtina. Německo.
      Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Ferrage, F. (250 Francie) -- Bodenhausen, G. (250 Francie) -- Kurzbach, D. (250 Francie)
      Klíčová slova anglicky: dissolution DNP; hyperpolarized water; cross-relaxation effect; protein NMR spectroscopy; proton exchange
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 11:20.
    6. HRITZ, Jozef a Zuzana TROŠANOVÁ. Kit pro screening potenciálních léčiv indukujících monomerizaci 14-3-3. 2018.
      Název česky: Kit pro screening potenciálních léčiv indukujících monomerizaci 14-3-3
      Název anglicky: Kit for screening of potential drugs inducing 14-3-3 monomerization
      RIV/00216224:14740/18:00101908 Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek). čeština. Česká republika.
      Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí) -- Trošanová, Zuzana (703 Slovensko, domácí)
      Klíčová slova anglicky: kit; screening; monomerization; 14-3-3 protein; fluorescent detection

      Změnila: Mgr. Zuzana Trošanová, Ph.D., učo 356857. Změněno: 11. 4. 2019 15:28.
    7. ZACHRDLA, Milan, Zuzana JASEŇÁKOVÁ a Lukáš ŽÍDEK. Nuclear Magnetic Resonance. Online. In Jan Hejátko, Toshio Hakoshima. Plant Structural Biology: Hormonal Regulations. 1. vyd. CHAM: SPRINGER INT PUBLISHING AG, 2018, s. 223-221, 25 s. n/a. ISBN 978-3-319-91352-0. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-91352-0_12.
      URL
      RIV/00216224:14740/18:00103860 Kapitola resp. kapitoly v odborné knize. angličtina. Švýcarsko.
      Zachrdla, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Jaseňáková, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Molecular biology Plant development Signal transduction Arabidopsis X-ray crystallography NMR SAXS Molecular dynamics simulations
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 11. 3. 2019 13:46.
    8. ŠPAČKOVÁ, Naděžda, Zuzana TROŠANOVÁ, F. SEBESTA, Séverine JANSEN, J.V. BURDA, Pavel SRB, Milan ZACHRDLA, Lukáš ŽÍDEK a Jiří KOZELKA. Protein environment affects the water-tryptophan binding mode. MD, QM/MM, and NMR studies of engrailed homeodomain mutants. Physical Chemistry Chemical Physics. CAMBRIDGE: Royal Society of Chemistry, 2018, roč. 20, č. 18, s. 12664-12677. ISSN 1463-9076. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c7cp08623g.
      URL
      RIV/00216224:14310/18:00101218 Článek v odborném periodiku. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Špačková, Naděžda (203 Česká republika, domácí) -- Trošanová, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Sebesta, F. (203 Česká republika) -- Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Burda, J.V. (203 Česká republika) -- Srb, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Zachrdla, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Kozelka, Jiří (250 Francie, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NUCLEAR-MAGNETIC-RESONANCE; MOLECULAR-DYNAMICS; CRYSTAL-STRUCTURES; PROTON-EXCHANGE; DNA COMPLEX; CLEANEX-PM; SIMULATIONS; CONSTRAINTS; RESTRAINTS; PARAMETERS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 23. 4. 2024 12:32.
    9. BENEŠÍK, Martin, Jiří NOVÁČEK, Lubomír JANDA, Radka DOPITOVÁ, Markéta PERNISOVÁ, Kateřina MELKOVÁ, Lenka TISAKOVA, Jiří DOŠKAŘ, Lukáš ŽÍDEK, Jan HEJÁTKO a Roman PANTŮČEK. Role of SH3b binding domain in a natural deletion mutant of Kayvirus endolysin LysF1 with a broad range of lytic activity. Virus Genes. DORDRECHT: Springer US, 2018, roč. 54, č. 1, s. 130-139. ISSN 0920-8569. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s11262-017-1507-2.
      URL
      RIV/00216224:14310/18:00102396 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Benešík, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, domácí) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Pernisová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Melková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Tisakova, Lenka (703 Slovensko) -- Doškař, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Staphylococcus bacteriophage; Endolysin; Endopeptidases; Enzybiotics; Src homology domains; Staphylococcal infections
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 8. 3. 2019 13:05.
    10. COUSIN, S.F., Pavel KADEŘÁVEK, N. BOLIK-COULON, Y. GU, C. CHARLIER, L. GARBER, L. BRUSCHWEILER-LI, T. MARQUARDSEN, J.M. TYBURN, R. BRUSCHWEILER a F. FERRAGE. Time-Resolved Protein Side-Chain Motions Unraveled by High-Resolution Relaxometry and Molecular Dynamics Simulations. Journal of the American Chemical Society. Washington: American Chemical Society, 2018, roč. 140, č. 41, s. 13456-13465. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jacs.8b09107.
      URL
      RIV/00216224:14740/18:00104556 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Cousin, S.F. (250 Francie) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bolik-Coulon, N. (250 Francie) -- Gu, Y. (840 Spojené státy) -- Charlier, C. (250 Francie) -- Garber, L. (250 Francie) -- Bruschweiler-Li, L. (840 Spojené státy) -- Marquardsen, T. (276 Německo) -- Tyburn, J.M. (250 Francie) -- Bruschweiler, R. (840 Spojené státy) -- Ferrage, F. (250 Francie)
      Klíčová slova anglicky: NUCLEAR MAGNETIC-RELAXATION; ORDER-PARAMETER ANALYSIS; C-13 NMR-SPECTROSCOPY; DEUTERIUM SPIN PROBES; METHYL-GROUP DYNAMICS; MODEL-FREE APPROACH; AMBER FORCE-FIELDS; SOLID-STATE NMR; CONFORMATIONAL ENTROPY; BACKBONE PARAMETERS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 13. 3. 2019 11:35.

    2017

    1. ZAPLETAL, Vojtěch, Arnošt MLÁDEK, Jozef HRITZ a Lukáš ŽÍDEK. Computational characterization of hybrid proteins containing ordered and intrinsically disordered regions. In 42nd Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies (FEBS) on From Molecules to Cells and Back. 2017. ISSN 1742-464X.
      URL
      Název anglicky: Computational characterization of hybrid proteins containing ordered and intrinsically disordered regions
      RIV/00216224:14740/17:00095560 Konferenční abstrakt. angličtina. Spojené státy.
      Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Mládek, Arnošt (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR; hybrid proteins
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 9. 3. 2018 15:10.
    2. OTRUSINOVÁ, Olga, Gabriel DEMO, Petr PADRTA, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Blanka PEKÁROVÁ, Zuzana GELOVÁ, Agnieszka SZMITKOWSKA, Pavel KADEŘÁVEK, Séverine JANSEN, Milan ZACHRDLA, Tomáš KLUMPLER, Jaromír MAREK, Jozef HRITZ, Lubomír JANDA, Hideo IWAI, Michaela WIMMEROVÁ, Jan HEJÁTKO a Lukáš ŽÍDEK. Conformational dynamics are a key factor in signaling mediated by the receiver domain of a sensor histidine kinase from Arabidopsis thaliana. Journal of Biological Chemistry. Bethesda, USA: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2017, roč. 292, č. 42, s. 17525-17540. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.M117.790212.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00095060 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Otrusinová, Olga (203 Česká republika, domácí) -- Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Jaseňáková, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Pekárová, Blanka (203 Česká republika, domácí) -- Gelová, Zuzana (203 Česká republika, domácí) -- Szmitkowska, Agnieszka (616 Polsko, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Zachrdla, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Klumpler, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Jaromír (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, domácí) -- Iwai, Hideo (246 Finsko) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: histidine kinase; nuclear magnetic resonance (NMR); protein dynamic; protein phosphorylation; X-ray crystallography; receiver domain; relaxation dispersion
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 12. 4. 2018 11:22.
    3. ŽÍDEK, Lukáš a Eva MEIROVITCH. Conformational Entropy from Slowly Relaxing Local Structure Analysis of N-15-H Relaxation in Proteins: Application to Pheromone Binding to MUP-I in the 283-308 K Temperature Range. Journal of Physical Chemistry B. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2017, roč. 121, č. 37, s. 8684-8692. ISSN 1520-6106. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.7b06049.
      URL
      RIV/00216224:14310/17:00098087 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Meirovitch, Eva (376 Izrael)
      Klíčová slova anglicky: MODEL-FREE APPROACH; MAGNETIC-RESONANCE RELAXATION; NMR RELAXATION; BACKBONE DYNAMICS; LIGAND-BINDING; ORDER PARAMETERS; DEPENDENCE; COMPLEX; DOMAIN; MOTIONS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 1. 3. 2018 13:44.
    4. BROM, Tomáš, Zuzana TROŠANOVÁ, Petr LOUŠA, Veronika WEISOVÁ, Gabriel ŽOLDÁK a Jozef HRITZ. Determination of the dimer-monomer equilibrium of 14-3-3ζ protein. In XVIIth Workshop of Physical Chemist and Electrochemists. 2017. ISBN 978-80-210-8580-0.
      Název česky: Určení dimer-monomerní ekvilibria proteinu 14-3-3ζ.

      Změnil: Mgr. Tomáš Brom, učo 436685. Změněno: 30. 5. 2022 11:44.
    5. NOREK, Adam a Lubomír JANDA. Epitope mapping of Borrelia burgdorferi OspC protein in homodimeric fold. Protein Science. HOBOKEN: WILEY, 2017, roč. 26, č. 4, s. 796-806. ISSN 0961-8368. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/pro.3125.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00096691 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Norek, Adam (203 Česká republika, garant, domácí) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: epitope mapping; monoclonal antibody; outer surface protein C; OspC; Borrelia burgdorferi; protein alignment; immunoprecipitation
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 26. 2. 2018 10:39.
    6. NAGY, Gabor, C. OOSTENBRINK a Jozef HRITZ. Exploring the binding pathways of the 14-3-3 zeta : protein Structural and free-energy profiles revealed by Hamiltonian replica exchange molecular dynamics with distancefield distance restraints. Plos one. San Francisco: Public Library of Science, 2017, roč. 12, č. 7, s. nestránkováno, 30 s. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0180633.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00095498 Článek v odborném periodiku. angličtina. Spojené státy.
      Nagy, Gabor (348 Maďarsko, domácí) -- Oostenbrink, C. (40 Rakousko) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: SIMULATIONS; SITES; PHOSPHOSERINE; RECOGNITION; FORCE; NMR
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 9. 3. 2018 12:21.
    7. MELKOVÁ, Kateřina, Séverine JANSEN, Jozef HRITZ a Lukáš ŽÍDEK. NMR characterization of intrinsically disordered microtubule associated protein 2c. In 42nd Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies (FEBS) on From Molecules to Cells and Back. 2017. ISSN 1742-464X.
      URL
      Název anglicky: NMR characterization of intrinsically disordered microtubule associated protein 2c
      RIV/00216224:14740/17:00095559 Konferenční abstrakt. angličtina. Spojené státy.
      Melková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR; MAP2c
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 9. 3. 2018 14:58.
    8. LOUŠA, Petr, Hana NEDOZRÁLOVÁ, Erik ŽUPA, Jiří NOVÁČEK a Jozef HRITZ. Phosphorylation of the regulatory domain of human tyrosine hydroxylase 1 monitored using non-uniformly sampled NMR. Biophysical Chemistry. AMSTERDAM: Elsevier, 2017, roč. 223, April, s. 25-29. ISSN 0301-4622. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpc.2017.01.003.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00094769 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Louša, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Nedozrálová, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Župa, Erik (703 Slovensko, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Human tyrosine hydroxylase; IDP; NMR; Phosphorylation; Kinetics; Time-resolved NMR; Non-uniform sampling; SSP
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: Mgr. Petr Louša, Ph.D., učo 393339. Změněno: 1. 6. 2017 11:35.
    9. JANSEN, Séverine, Kateřina MELKOVÁ, Zuzana TROŠANOVÁ, Kateřina HANÁKOVÁ, Milan ZACHRDLA, Jiří NOVÁČEK, Erik ŽUPA, Zbyněk ZDRÁHAL, Jozef HRITZ a Lukáš ŽÍDEK. Quantitative mapping of microtubule-associated protein 2c (MAP2c) phosphorylation and regulatory protein 14-3-3 zeta-binding sites reveals key differences between MAP2c and its homolog Tau. Journal of Biological Chemistry. Bethesda, USA: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2017, roč. 292, č. 16, s. 6715-6727. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.M116.771097.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00094770 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Melková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Trošanová, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Hanáková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Zachrdla, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Župa, Erik (703 Slovensko, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: INTRINSICALLY UNSTRUCTURED PROTEINS; PAIRED HELICAL FILAMENTS; TUBULIN POLYMERIZATION; MULTIDIMENSIONAL NMR; NEURONAL DEVELOPMENT; DISORDERED PROTEINS; SYNAPTIC PLASTICITY; BETA-STRUCTURE; KINASE-A; BINDING
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 12. 4. 2018 10:49.
    10. ROUDNICKÝ, Pavel, Jiří VOREL, Jana ILGOVÁ, Libor MIKEŠ, Lucie JEDLIČKOVÁ, John DALTON, Jan DVOŘÁK, Lubomír JANDA, Adam NOREK, Milan GELNAR a Martin KAŠNÝ. SERPIN, A KEY MOLECULE IN THE LIFE OF EUDIPLOZOON NIPPONICUM?! In 23rd Helminthological Days. 2017. ISBN 978-80-968473-8-9.
      Programme & Abstracts
      RIV/00216224:14310/17:00094753 Prezentace na konferencích. Zoologie. angličtina. Slovensko.
      Roudnický, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Vorel, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Ilgová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Mikeš, Libor (203 Česká republika) -- Jedličková, Lucie (203 Česká republika) -- Dalton, John (372 Irsko) -- Dvořák, Jan (203 Česká republika) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika) -- Norek, Adam (203 Česká republika) -- Gelnar, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Kašný, Martin (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: serpin; parasite; eudiplozoon; interaction host-parasite; inhibition
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Pavel Roudnický, Ph.D., učo 375907. Změněno: 25. 8. 2017 09:47.
    11. ZACHRDLA, Milan, Petr PADRTA, Alzbeta RABATINOVA, Hana SANDEROVA, Ivan BARVIK, Libor KRASNY a Lukáš ŽÍDEK. Solution structure of domain 1.1 of the sigma(A) factor from Bacillus subtilis is preformed for binding to the RNA polymerase core. Journal of Biological Chemistry. Bethesda: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2017, roč. 292, č. 28, s. 11610-11617. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.M117.784074.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00094887 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Zachrdla, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Rabatinova, Alzbeta (203 Česká republika) -- Sanderova, Hana (203 Česká republika) -- Barvik, Ivan (203 Česká republika) -- Krasny, Libor (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Bacillus; molecular modeling; nuclear magnetic resonance (NMR); protein structure; RNA polymerase; transcription initiation factor
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 28. 2. 2018 16:36.
    12. KOVAŘÍKOVÁ, Petra, Ondřej BERNATÍK, Kateřina HANÁKOVÁ, Zbyněk ZDRÁHAL, Vítězslav BRYJA a Lukáš ČAJÁNEK. Tau tubulin kinase 2 phosphorylations in cilia initiation. In Centrosomes and Spindle Pole Bodies EMBO CONFERENCE 2017. 2017.

      Klíčová slova anglicky: TTBK2, phosphorylations, cilia
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Petra Pejšková, Ph.D., učo 375659. Změněno: 30. 11. 2017 17:29.
    13. TROŠANOVÁ, Zuzana, Petr LOUŠA, Tomáš BROM, Veronika WEISOVÁ, Gabriel ŽOLDÁK a Jozef HRITZ. Thermodynamic and kinetic study of 14-3-3ζ dimerization. In XVIIth Workshop of Physical Chemist and Electrochemists. 2017. ISBN 978-80-210-8580-0.
      Název česky: Termodynamická a kinetická studie dimerizace proteinu 14-3-3ζ

      Změnil: Mgr. Tomáš Brom, učo 436685. Změněno: 6. 1. 2020 15:02.
    14. SRB, Pavel, Jiří NOVÁČEK, Pavel KADEŘÁVEK, A. RABATINOVA, L. KRÁSNÝ, J. ŽÍDKOVÁ, J. BOBÁĽOVÁ, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš ŽÍDEK. Triple resonance NMR relaxation experiments for studies of intrinsically disordered proteins. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2017, roč. 69, č. 3, s. 133-146. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-017-0138-1.
      URL
      RIV/00216224:14740/17:00095497 Článek v odborném periodiku. angličtina. Nizozemské království.
      Srb, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Rabatinova, A. (203 Česká republika) -- Krásný, L. (203 Česká republika) -- Žídková, J. (203 Česká republika) -- Bobáľová, J. (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nuclear magnetic resonance; Relaxation; Non-uniform sampling; Intrinsically disordered proteins
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 14. 3. 2018 14:35.

    2016

    1. SKLENÁŘ, Vladimír. AFM a nanobiotechnologie. 2016.
      URL
      Název anglicky: AFM a nanobiotechnologie
      RIV/00216224:14740/16:00100600 Uspořádání workshopu. angličtina. Česká republika.
      Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: imaging techniques; force spectroscopy; biomechanical mapping

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 24. 4. 2018 13:06.
    2. SKLENÁŘ, Vladimír. CIISB Kick-off Meeting. 2016.
      URL
      Název česky: CIISB Kick-off Meeting
      Název anglicky: CIISB Kick-off Meeting
      RIV/00216224:14740/16:00100569 Uspořádání konference. angličtina. Česká republika.
      Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: kick-off; CIISB; project; research infrastructure

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 24. 4. 2018 08:35.
    3. ILGOVÁ, Jana, Lucie JEDLIČKOVÁ, Hana DVOŘÁKOVÁ, Libor MIKEŠ, Lubomír JANDA, Milan GELNAR a Martin KAŠNÝ. Cystatins of helminths: characterization of molecules with immunomodulatory potential. In Europian Multicolloquium On Parasitology. 2016.
      RIV/00216224:14310/16:00088207 Konferenční abstrakt. Zoologie. angličtina. Finsko.
      Ilgová, Jana (703 Slovensko, garant, domácí) -- Jedličková, Lucie (203 Česká republika) -- Dvořáková, Hana (203 Česká republika) -- Mikeš, Libor (203 Česká republika) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika) -- Gelnar, Milan (203 Česká republika) -- Kašný, Martin (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Helminths; Cystatin; immunomodulation; Bloodfeeding
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: RNDr. Martin Kašný, Ph.D., učo 11259. Změněno: 24. 3. 2017 15:25.
    4. SKLENÁŘ, Vladimír. Den otevřených dvěří pro veřejnost. 2016.
      URL
      Název anglicky: OpenDay for public
      RIV/00216224:14740/16:00100570 Popularizační texty a aktivity. čeština. Česká republika.
      Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Open day; Core facilities; equipment

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 24. 4. 2018 08:42.
    5. SHAIKH, Tanvir. Deveopment of a microfluidic specimenpreparation device for time-resolved cryo-electron microscopy. Brno: Instruct Academic Services Ltd., 2016, 3 s.
      RIV/00216224:14740/16:00094149 Výzkumná zpráva. Biochemie. angličtina. Česká republika. obsah podléhá obchodnímu tajemství.
      Shaikh, Tanvir (840 Spojené státy, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: cryo-electron microscopy; time-resolved; microfluidics

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 13. 4. 2017 17:08.
    6. ČERVENKA, Igor, Jana VALNOHOVÁ, Ondřej BERNATÍK, Jakub HARNOŠ, Matěj RÁDSETOULAL, Kateřina ŠEDOVÁ, Kateřina HANÁKOVÁ, David POTĚŠIL, Miroslava SEDLÁČKOVÁ, Alena SALAŠOVÁ, Zachary STEINHART, Stephane ANGERS, Gunnar SCHULTE, Aleš HAMPL, Zbyněk ZDRÁHAL a Vítězslav BRYJA. Dishevelled is a NEK2 kinase substrate controlling dynamics of centrosomal linker proteins. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Washington: National Academy of Sciences, 2016, roč. 113, č. 33, s. 9304-9309. ISSN 0027-8424. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1073/pnas.1608783113.
      RIV/00216224:14310/16:00088644 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Červenka, Igor (703 Slovensko, domácí) -- Valnohová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Bernatík, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Harnoš, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Rádsetoulal, Matěj (203 Česká republika, domácí) -- Šedová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Hanáková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Sedláčková, Miroslava (203 Česká republika, domácí) -- Salašová, Alena (203 Česká republika, domácí) -- Steinhart, Zachary (124 Kanada) -- Angers, Stephane (124 Kanada) -- Schulte, Gunnar (276 Německo, domácí) -- Hampl, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Wnt signaling; centrosome; Dishevelled; NEK2; linker proteins
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Lucie Jarošová, DiS., učo 205746. Změněno: 13. 3. 2018 15:33.
    7. NOREK, Adam, Lubomír JANDA a Alena ŽÁKOVSKÁ. DNA-based identification and OspC serotyping in cultures of Borrelia burgdorferi s.l. isolated from ticks collected in the Moravia (Czech Republic). Journal of Vector Ecology. Wiley, 2016, roč. 41, č. 1, s. 172-178. ISSN 1081-1710. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/jvec.12209.
      Název anglicky: DNA-based identification and OspC serotyping in cultures of Borrelia burgdorferi s.l. isolated from ticks collected in the Moravia (Czech Republic)
      RIV/00216224:14310/16:00089869 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Norek, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, domácí) -- Žákovská, Alena (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Borrelia burgdorferi sensu lato OspC FlaB
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 4. 4. 2017 12:03.
    8. SHASMAL, Manidip, Sandip DEY, Tanvir SHAIKH, Sayan BHAKTA a Jayati SENGUPTA. E. coli metabolic protein aldehyde-alcohol dehydrogenase-E binds to the ribosome: a unique moonlighting action revealed. Scientific Reports. LONDON: NATURE PUBLISHING GROUP, 2016, roč. 6, January, s. nestránkováno, 12 s. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/srep19936.
      URL
      RIV/00216224:14740/16:00093888 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Shasmal, Manidip (356 Indie) -- Dey, Sandip (356 Indie) -- Shaikh, Tanvir (840 Spojené státy, garant, domácí) -- Bhakta, Sayan (356 Indie) -- Sengupta, Jayati (356 Indie)
      Klíčová slova anglicky: ESCHERICHIA-COLI; TRIGGER FACTOR; MESSENGER-RNA; ELECTRON-MICROSCOPY; BACTERIAL RIBOSOME; CRYSTAL-STRUCTURE; ACETYL-COA; IN-VIVO; PARTICLE; SUBUNIT

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 13. 3. 2017 15:15.
    9. ROUDNICKÝ, Pavel, Jiří VOREL, Jana ILGOVÁ, Libor MIKEŠ, Lucie JEDLIČKOVÁ, John DALTON, Jan DVOŘÁK, Zbyněk ZDRÁHAL, David POTĚŠIL, Lubomír JANDA, Adam NOREK, Milan GELNAR a Martin KAŠNÝ. Eudiplozoon nipponicum (Heteronchoinea: Diplozoidae): insight into composition of E/S products and basic characterization of serpin. 2016. ISBN 978-80-210-8373-8.
      RIV/00216224:14310/16:00088448 Prezentace na konferencích. Zoologie. angličtina. Česká republika.
      Roudnický, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Vorel, Jiří (203 Česká republika) -- Ilgová, Jana (703 Slovensko) -- Mikeš, Libor (203 Česká republika) -- Jedličková, Lucie (203 Česká republika) -- Dalton, John (372 Irsko) -- Dvořák, Jan (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika) -- Potěšil, David (203 Česká republika) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika) -- Norek, Adam (203 Česká republika) -- Gelnar, Milan (203 Česká republika) -- Kašný, Martin (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Monogenea; Eudiplozoon; nipponicum; serpin; excretory; secretory;

      Změnil: RNDr. Martin Kašný, Ph.D., učo 11259. Změněno: 24. 3. 2017 22:28.
    10. SKLENÁŘ, Vladimír. Exkurze talentovaných SŠ studentů. 2016.
      Název anglicky: Excursion for talented high school students
      RIV/00216224:14740/16:00100571 Popularizační texty a aktivity. čeština. Česká republika.
      Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: high school students; Core facilities; excursion

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 24. 4. 2018 08:45.
    11. NOREK, Adam, Silvie LIŠKOVÁ a Lubomír JANDA. High-yield expression of OspC protein from B. burgdorferi, isolation of monoclonal antibodies and epitope mapping. In Ľubica Urbániková, Barbora Vidová, Zuzana Šrámková. 4th Conference on Protein : Naše proteíny 2016 - Štruktúra a funkcia. Bratislava (Slovakia): Institute of Molecular Biology, SAS, Bratislava, 2016, s. 24-25. ISBN 978-80-971617-1-2.
      Název anglicky: High-yield expression of OspC protein from B. burgdorferi, isolation of monoclonal antibodies and epitope mapping
      RIV/00216224:14740/16:00089916 Stať ve sborníku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Slovensko.
      Norek, Adam (203 Česká republika, garant, domácí) -- Lišková, Silvie (203 Česká republika, domácí) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: OspC; expression; monoclonal antibodies; epitope

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 27. 4. 2017 13:22.
    12. VAVRINSKÁ, Andrea, Jiří ZELINKA, Jakub ŠEBERA, Vladimír SYCHROVSKÝ, Radovan FIALA, Rolf BOELENS, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš TRANTÍREK. Impact of nucleic acid self-alignment in a strong magnetic field on the interpretation of indirect spin–spin interactions. Journal of biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2016, roč. 64, č. 1, s. 53-62. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-015-0005-x.
      URL
      Název anglicky: Impact of nucleic acid self-alignment in a strong magnetic field on the interpretation of indirect spin–spin interactions
      RIV/00216224:14740/16:00087769 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Nizozemské království.
      Vavrinská, Andrea (703 Slovensko) -- Zelinka, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Šebera, Jakub (203 Česká republika) -- Sychrovský, Vladimír (203 Česká republika) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Boelens, Rolf (528 Nizozemské království) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nucleic acid; Self-alignment; Magnetic susceptibility; Scalar coupling; Dipolar coupling; Karplus equation

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 16. 3. 2017 12:17.
    13. ILGOVÁ, Jana, Lucie JEDLIČKOVÁ, Jana DVOŘÁKOVÁ, Libor MIKEŠ, Lubomír JANDA, Adam NOREK, Michal BENOVICS, Lukáš VETEŠNÍK, Pavel JURAJDA, Milan GELNAR a Martin KAŠNÝ. Molecular and biochemical characterization of cysteine peptidase inhibitor from Eudiplozoon nipponicum (Monogenea). In 5th Workshop of European Centre of Ichthyoparasitology, Hotel Beatrice, Prušánky. 2016. ISBN 978-80-210-8374-5.
      Název anglicky: Molecular and biochemical characterization of cysteine peptidase inhibitor from Eudiplozoon nipponicum (Monogenea)
      RIV/00216224:14310/16:00093421 Konferenční abstrakt. Zoologie. angličtina. Česká republika.
      Ilgová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Jedličková, Lucie (203 Česká republika) -- Dvořáková, Jana (203 Česká republika) -- Mikeš, Libor (203 Česká republika) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika) -- Norek, Adam (203 Česká republika) -- Benovics, Michal (703 Slovensko) -- Vetešník, Lukáš (203 Česká republika) -- Jurajda, Pavel (203 Česká republika) -- Gelnar, Milan (203 Česká republika) -- Kašný, Martin (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Eudiplozoon nipponicum; inhibitors; cysteine peptidases; cystatins

      Změnil: Mgr. Michal Benovics, Ph.D., učo 437095. Změněno: 8. 1. 2018 13:52.
    14. SKLENÁŘ, Vladimír. Open day for MU students. 2016.
      Název anglicky: Open day for MU students
      RIV/00216224:14740/16:00100572 Popularizační texty a aktivity. čeština. Česká republika.
      Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: MU students; Core facilities; excursion

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 24. 4. 2018 08:48.
    15. SZMITKOWSKA, Agnieszka, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Blanka PEKÁROVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Jan HEJÁTKO. ROLE OF IN VITRO PHOSPHORYLATION ASSAY IN UNDERSTADING MSP SIGNALING IN A. THALIANA. In CECE 2016 13 th International Interdisciplinary Meeting on Bioanalysis. 2016. ISBN 978-80-904959-4-4.
      URL
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Pavla Foltynová, Ph.D., učo 106624. Změněno: 1. 3. 2018 16:27.
    16. KADEŘÁVEK, Pavel, Vojtěch ZAPLETAL, Radovan FIALA, Pavel SRB, Petr PADRTA, Jana PAVLÍKOVÁ PŘECECHTĚLOVÁ, Mária ŠOLTÉSOVÁ, Jozef KOWALEWSKI, Göran WIDMALM, Josef CHMELÍK, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš ŽÍDEK. Spectral density mapping at multiple magnetic fields suitable for C-13 NMR relaxation studies. Journal of Magnetic Resonance. San Diego: Academic Press Inc. Elsevier Science, 2016, roč. 266, May, s. 23-40. ISSN 1090-7807. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jmr.2016.02.016.
      URL
      RIV/00216224:14740/16:00090497 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Srb, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Pavlíková Přecechtělová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Šoltésová, Mária (703 Slovensko) -- Kowalewski, Jozef (752 Švédsko) -- Widmalm, Göran (752 Švédsko) -- Chmelík, Josef (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nuclear magnetic resonance; Relaxation; Spectral density function; Magnetic field; Nucleic acids; Carbohydrates
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 27. 4. 2017 13:36.
    17. PEKÁROVÁ, Blanka, Agnieszka SZMITKOWSKA, Radka DOPITOVÁ, Oksana DEGTJARIK, Lukáš ŽÍDEK a Jan HEJÁTKO. Structural Aspects of Multistep Phosphorelay-Mediated Signaling in Plants. Molecular Plant. Cambridge (USA): Cell Press, 2016, roč. 9, č. 1, s. 71-85. ISSN 1674-2052. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.molp.2015.11.008.
      URL
      Název anglicky: Structural Aspects of Multistep Phosphorelay-Mediated Signaling in Plants
      RIV/00216224:14740/16:00088179 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Pekárová, Blanka (203 Česká republika, domácí) -- Szmitkowska, Agnieszka (616 Polsko, domácí) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Degtjarik, Oksana (112 Bělorusko) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: multistep phosphorelay; structure; histidine kinase; phosphotransfer protein; response regulator
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 27. 4. 2017 16:01.
    18. RUBIO-MARRERO, Eva N., Gabriele VINCELLI, Cy M. JEFFRIES, Tanvir SHAIKH, Irene S. PAKOS, Fanomezana M. RANAIVOSON, Sventja VON DAAKE, Borries DEMELER, Antonella DE JACO, Guy PERKINS, Mark H. ELLISMAN, Jill TREWHELLA a Davide COMOLETTI. Structural Characterization of the Extracellular Domain of CASPR2 and Insights into Its Association with the Novel Ligand Contactin1. Journal of Biological Chemistry. Bethesda: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2016, roč. 291, č. 11, s. 5788-5802. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.M115.705681.
      URL
      RIV/00216224:14740/16:00093873 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Rubio-Marrero, Eva N. (840 Spojené státy) -- Vincelli, Gabriele (840 Spojené státy) -- Jeffries, Cy M. (36 Austrálie) -- Shaikh, Tanvir (840 Spojené státy, garant, domácí) -- Pakos, Irene S. (840 Spojené státy) -- Ranaivoson, Fanomezana M. (840 Spojené státy) -- von Daake, Sventja (840 Spojené státy) -- Demeler, Borries (840 Spojené státy) -- De Jaco, Antonella (380 Itálie) -- Perkins, Guy (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Ellisman, Mark H. (840 Spojené státy) -- Trewhella, Jill (36 Austrálie) -- Comoletti, Davide (840 Spojené státy)
      Klíčová slova anglicky: analytical ultracentrifugation; ligand-binding protein; molecular cell biology; protein structure; small-angle x-ray scattering (SAXS)

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 10. 3. 2017 13:39.
    19. SZMITKOWSKA, Agnieszka, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Blanka PEKÁROVÁ, Jan KOMÁREK, Lukáš ŽÍDEK, Michaela WIMMEROVÁ a Jan HEJÁTKO. STUDIUM INTRACELULÁRNÍCH DOMÉN ETYLÉNOVÉHO RECEPTORU ETR1. In XVI Mezioborové setkání mladých biologů, biochemiků a chemiků. 2016.
      URL
      Biochemie. čeština. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Agnieszka Szmitkowska, Ph.D., M.Sc., učo 417377. Změněno: 23. 9. 2016 18:04.
    20. PERCZEL, András, Atanas G. ATANASOV, Vladimír SKLENÁŘ, Jiří NOVÁČEK, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Pavel KADEŘÁVEK, Lukáš ŽÍDEK, Henryk KOZLOWSKI, Joanna WATLY, Aleksandra HECEL, Paulina KOLKOWSKA, Jaroslav KOČA, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Lukáš PRAVDA, David SEHNAL, Vladimír HORSKÝ, Stanislav GEIDL, Ricardo D. ENRIZ, Pavel MATĚJKA, Adéla JENIŠTOVÁ, Marcela DENDISOVÁ, Alžběta KOKAISLOVÁ, Volkmar WEISSIG, Mark OLSEN, Aidan COFFEY, Jude AJUEBOR, Ruth KEARY, Marta SANZ-GAITERO, Mark J. VAN RAAIJ, Olivia MCAULIFFE, Birgit WALTENBERGER, Andrei MOCAN, Karel ŠMEJKAL, Elke H. HEISS, Marc DIEDERICH, Robert MUSIOL, Janez KOŠMRLJ, Jaroslaw POLANSKI a Josef JAMPÍLEK. The Eighth Central European Conference “Chemistry towards Biology”: Snapshot. MOLECULES. Basel: MDPI AG, 2016, roč. 21, č. 10, s. nestránkováno, 27 s. ISSN 1420-3049. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/molecules21101381.
      URL
      Název anglicky: The Eighth Central European Conference “Chemistry towards Biology”: Snapshot
      RIV/00216224:14310/16:00091715 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Švýcarsko.
      Perczel, András (348 Maďarsko) -- Atanasov, Atanas G. (40 Rakousko) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Kozlowski, Henryk (616 Polsko) -- Watly, Joanna (616 Polsko) -- Hecel, Aleksandra (616 Polsko) -- Kolkowska, Paulina (616 Polsko) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Svobodová Vařeková, Radka (203 Česká republika, garant, domácí) -- Pravda, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Sehnal, David (203 Česká republika, domácí) -- Horský, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Geidl, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Enriz, Ricardo D. (32 Argentina) -- Matějka, Pavel (203 Česká republika) -- Jeništová, Adéla (203 Česká republika) -- Dendisová, Marcela (203 Česká republika) -- Kokaislová, Alžběta (203 Česká republika) -- Weissig, Volkmar (840 Spojené státy) -- Olsen, Mark (840 Spojené státy) -- Coffey, Aidan (372 Irsko) -- Ajuebor, Jude (372 Irsko) -- Keary, Ruth (372 Irsko) -- Sanz-Gaitero, Marta (724 Španělsko) -- van Raaij, Mark J. (724 Španělsko) -- McAuliffe, Olivia (372 Irsko) -- Waltenberger, Birgit (40 Rakousko) -- Mocan, Andrei (642 Rumunsko) -- Šmejkal, Karel (203 Česká republika) -- Heiss, Elke H. (40 Rakousko) -- Diederich, Marc (410 Korejská republika) -- Musiol, Robert (616 Polsko) -- Košmrlj, Janez (705 Slovinsko) -- Polanski, Jaroslaw (616 Polsko) -- Jampílek, Josef (703 Slovensko)
      Klíčová slova anglicky: drug design; targeting; chemical biology; biological chemistry; proteins and nucleic acids; natural compounds; synthesis; biomaterials; nanoparticles; ADME; drug delivery systems
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc., učo 610. Změněno: 9. 4. 2017 11:32.
    21. VÍCHA, Jan, Martin BABINSKÝ, Gabriel DEMO, Olga OTRUSINOVÁ, Séverine JANSEN, Blanka PEKÁROVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Markéta MUNZAROVÁ. The influence of Mg2+ coordination on 13C and 15N chemical shifts in CKI1RD protein domain from experiment and molecular dynamics/density functional theory calculations. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 2016, roč. 84, č. 5, s. 686-699. ISSN 0887-3585. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/prot.25019.
      Název anglicky: The influence of Mg2+ coordination on 13C and 15N chemical shifts in CKI1RD protein domain from experiment and molecular dynamics/density functional theory calculations
      RIV/00216224:14310/16:00087872 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Vícha, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Babinský, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Otrusinová, Olga (203 Česká republika, domácí) -- Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Pekárová, Blanka (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Munzarová, Markéta (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Arabidopsis thaliana; CKI1 histidine kinase; Mg2+ coordination; NMR chemical shift; 13C; 15N; molecular dynamics; density functional theory

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 14. 4. 2017 14:39.
    22. JANDA, Lubomír. Výzkumný plán pro rekombinantní expresi proteas v produkční bakterii Escherichia coli s využitím technologie syntetických genů. Brno: Bio Agens Research and Development - BARD, s.r.o., 2016, 2 s.
      Název anglicky: The research plan for recombinant expression of protease production in Escherichia coli using the technology of synthetic genes
      RIV/00216224:14740/16:00094089 Výzkumná zpráva. Genetika a molekulární biologie. čeština. Česká republika. obsah podléhá obchodnímu tajemství.
      Janda, Lubomír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Bioinformatic analysis; serine protease; cysteine protease; gene synthesis; optimalization of expression

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 12. 4. 2017 10:54.

    2015

    1. KANT, Sarina G., Iveta ČERVENKOVÁ, Lukáš BÁLEK, Lukáš TRANTÍREK, Gijs W. E. SANTEN, Martine C. de VRIES, Hermine A. van DUYVENVOORDE, Michiel J. R. van der WIELEN, Annemieke J. M. H. VERKERK, André G. UITTERLINDEN, Sabine E. HANNEMA, Jan M. WIT, Wilma OOSTDIJK, Pavel KREJČÍ a Monique LOSEKOOT. A novel variant of FGFR3 causes proportionate short stature. European Journal od Endocrinology. Bristol: Bioscientifica LTD, 2015, roč. 172, č. 6, s. 763-770. ISSN 0804-4643. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1530/EJE-14-0945.
      URL
      RIV/00216224:14110/15:00083441 Článek v odborném periodiku. Endokrinologie, diabetologie, metabolismus, výživa. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Kant, Sarina G. (528 Nizozemské království) -- Červenková, Iveta (703 Slovensko, domácí) -- Bálek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Santen, Gijs W. E. (528 Nizozemské království) -- Vries, Martine C. de (528 Nizozemské království) -- Duyvenvoorde, Hermine A. van (528 Nizozemské království) -- Wielen, Michiel J. R. van der (528 Nizozemské království) -- Verkerk, Annemieke J. M. H. (528 Nizozemské království) -- Uitterlinden, André G. (528 Nizozemské království) -- Hannema, Sabine E. (528 Nizozemské království) -- Wit, Jan M. (528 Nizozemské království) -- Oostdijk, Wilma (528 Nizozemské království) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Losekoot, Monique (528 Nizozemské království)
      Klíčová slova anglicky: FACTOR RECEPTOR-3 GENE; ASN540SER MUTATION; DUTCH CHILDREN; HYPOCHONDROPLASIA; ACTIVATION; PHENOTYPE; HEIGHT; FAMILY; LENGTH
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 5. 1. 2016 11:07.
    2. STEJSKAL, Stanislav, Karel ŠTĚPKA, Lenka TESAŘOVÁ, Karel STEJSKAL, Martina MATĚJKOVÁ, Pavel ŠIMARA, Zbyněk ZDRÁHAL a Irena KRONTORÁD KOUTNÁ. Cell cycle-dependent changes in H3K56ac in human cells. Cell Cycle. Philadelphia: Taylor&Francis Inc, 2015, roč. 14, č. 24, s. 3851-3863. ISSN 1538-4101. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/15384101.2015.1106760.
      Full Text
      RIV/00216224:14330/15:00081398 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Štěpka, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Tesařová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Stejskal, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Matějková, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Cell cycle; Chromatin; DNA replication; H3K56ac; Mammalian cells; Nucleosome
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 16. 12. 2019 16:41.
    3. CAMARGO, Diana C. Rodrigues, Konstantinos TRIPSIANES, Tobias G. KAPP, Joaquim MENDES, Jasmin SCHUBERT, Burghard CORDES a Bernd REIF. Cloning, expression and purification of the human Islet Amyloid Polypeptide (hIAPP) from Escherichia coli. Protein Expression and Purification. SAN DIEGO: Elsevier, 2015, roč. 106, Feb, s. 49-56. ISSN 1046-5928. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.pep.2014.10.012.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00087051 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Camargo, Diana C. Rodrigues (276 Německo) -- Tripsianes, Konstantinos (300 Řecko, garant, domácí) -- Kapp, Tobias G. (276 Německo) -- Mendes, Joaquim (276 Německo) -- Schubert, Jasmin (276 Německo) -- Cordes, Burghard (276 Německo) -- Reif, Bernd (276 Německo)
      Klíčová slova anglicky: Amyloid; Diabetes; Recombinant protein; human Islet Amyloid Polypeptide (hIAPP); Escherichia coli; Nuclear magnetic resonance (NMR)
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 6. 4. 2016 08:59.
    4. MACRAILD, Christopher A., Milan ZACHRDLA, Dean ANDREW, Bankala KRISHNARJUNA, Jiří NOVÁČEK, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ, Jack S. RICHARDS, James G. BEESON, Robin F. ANDERS a Raymond S. NORTON. Conformational dynamics and antigenicity in the disordered malaria antigen merozoite surface protein 2. PLOS ONE. San Francisco: Public Library Science, 2015, roč. 10, č. 3, s. "nestránkováno", 18 s. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0119899.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00082589 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      MacRaild, Christopher A. (36 Austrálie) -- Zachrdla, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Andrew, Dean (36 Austrálie) -- Krishnarjuna, Bankala (36 Austrálie) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Richards, Jack S. (36 Austrálie) -- Beeson, James G. (36 Austrálie) -- Anders, Robin F. (36 Austrálie) -- Norton, Raymond S. (36 Austrálie)
      Klíčová slova anglicky: amino terminal sequence; animal experiment; animal model; antibody response; antibody specificity; antigenicity
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 22. 3. 2016 15:24.
    5. KADEŘÁVEK, Pavel, Sarina GRUTSCH, Nicola SALVI, Martin TOLLINGER, Lukáš ŽÍDEK, Geoffrey BODENHAUSEN a Fabien FERRAGE. Cross-correlated relaxation measurements under adiabatic sweeps: determination of local order in proteins. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2015, roč. 63, č. 4, s. 353-365. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-015-9994-8.
      Full Text
      RIV/00216224:14740/15:00086418 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Grutsch, Sarina (40 Rakousko) -- Salvi, Nicola (756 Švýcarsko) -- Tollinger, Martin (40 Rakousko) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Bodenhausen, Geoffrey (250 Francie) -- Ferrage, Fabien (250 Francie)
      Klíčová slova anglicky: NMR; Protein dynamics; Adiabatic sweep; Cross-correlated cross relaxation
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 16. 12. 2019 14:22.
    6. BAZZI, Sophia, Jan NOVOTNÝ, Yevgen YURENKO a Radek MAREK. Designing a New Class of Bases for Nucleic Acid Quadruplexes and Quadruplex-Active Ligands. Chemistry - A European Journal. Weinheim: Wiley-VCH, 2015, roč. 21, č. 26, s. 9414-9425. ISSN 0947-6539. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/chem.201500743.
      DOI: 10.1002/chem.201500743
      RIV/00216224:14740/15:00082881 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Německo.
      Bazzi, Sophia (364 Írán, domácí) -- Novotný, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Yurenko, Yevgen (804 Ukrajina, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Density functional calculations; DNA; G-quadruplexes; ligand design; nucleobases
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 29. 3. 2016 14:49.
    7. LIPOVÝ, Břetislav, Lubomír JANDA, Martin FALDYNA, Adam NOREK, Šárka KOBZOVÁ a Markéta HANSLIANOVÁ. Endolysin a jeho in vitro aktivita vůči kmenům Staphylococcus aureus izolovaných u popálených pacientů a pacientů s chronickou ranou. In XX.výroční konference České společnosti popáleninové medicíny. 2015. ISBN 978-80-210-7875-8.
      Chirurgie vč. transplantologie. čeština. Česká republika.
      Druh účasti: vyžádaná přednáška

      Změnil: prof. MUDr. Břetislav Lipový, Ph.D., MBA, LL.M., učo 60248. Změněno: 11. 12. 2015 19:08.
    8. SKLENÁŘ, Vladimír. EUROMAR 2015. Programme and Abstract Book. 1. elektronické vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2015, 972 s. ISBN 978-80-210-7890-1.
      URL
      Název anglicky: EUROMAR 2015. Programme and Abstract Book
      angličtina. Česká republika.
      Druh sborníku: předkonferenční sborník

      Změnila: Mgr. Radka Vyskočilová, učo 2368. Změněno: 13. 8. 2015 13:19.
    9. VONDROVÁ, Lucie, Lucie KOZÁKOVÁ, Karel STEJSKAL, Panagoula CHARALABOUS, Peter KOLESÁR, Alan LEHMANN, Stjepan ULDRIJAN, Christopher M. SANDERSON, Zbyněk ZDRÁHAL a Jan PALEČEK. Evolution of the NSE1-NSE3-NSE4 subcomplex of the human SMC5/6 complex. In SMC proteins: Chromosomal organizers from bacteria to human. 2015.
      Biochemie. angličtina.
      Změnila: Mgr. Lucie Vondrová, Ph.D., učo 269401. Změněno: 12. 9. 2016 16:31.
    10. KUMARI, Manju, Stanislav KOZMON, Petr KULHÁNEK, Jakub ŠTĚPÁN, Igor TVAROŠKA a Jaroslav KOČA. Exploring Reaction Pathways for O-GlcNAc Transferase Catalysis. A String Method Study. Journal of Physical Chemistry B. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2015, roč. 119, č. 12, s. 4371-4381. ISSN 1520-6106. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jp511235f.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00085002 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Kumari, Manju (356 Indie, domácí) -- Kozmon, Stanislav (703 Slovensko, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Štěpán, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Tvaroška, Igor (703 Slovensko, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CATALYTIC MECHANISM; PK(A) VALUES; ENERGY PATHS; GLYCOSYLTRANSFERASES; SIMULATIONS; PROTEIN; RATIONALIZATION; METABOLISM; SUBSTRATE; CLEAVAGE
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 30. 11. 2015 09:39.
    11. SZMITKOWSKA, Agnieszka, Zuzana JASEŇÁKOVÁ, Blanka PEKÁROVÁ, Jan KOMÁREK, Lukáš ŽÍDEK, Michaela WIMMEROVÁ a Jan HEJÁTKO. Expression, purification and crystallization of the intracellular domains of the ethylene receptor ETR1 from Arabidopsis thaliana. In XVII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2015. ISBN 978-80-210-8015-7.
      URL
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Agnieszka Szmitkowska, Ph.D., M.Sc., učo 417377. Změněno: 23. 9. 2016 17:49.
    12. RABBANI, Gulam, Ejaz AHMAD, Mohsin Vahid KHAN, Mohd. Tashfeen ASHRAF, Rajiv BHAT a Rizwan Hasan KHAN. Impact of structural stability of cold adapted Candida antarctica lipase B (CaLB): in relation to pH, chemical and thermal denaturation. RSC Advances. Cambridge: Royal Society of Chemistry, 2015, roč. 5, č. 26, s. 20115-20131. ISSN 2046-2069. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c4ra17093h.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00087271 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Rabbani, Gulam (356 Indie) -- Ahmad, Ejaz (356 Indie, garant, domácí) -- Khan, Mohsin Vahid (356 Indie) -- Ashraf, Mohd. Tashfeen (356 Indie) -- Bhat, Rajiv (356 Indie) -- Khan, Rizwan Hasan (356 Indie)
      Klíčová slova anglicky: MOLTEN GLOBULE STATE; CIRCULAR-DICHROISM; YEAST HEXOKINASE; THIOFLAVIN-T; PROTEIN; ENZYMES; INTERMEDIATE; MICROORGANISMS; CHROMATOGRAPHY; TEMPERATURES

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 13. 4. 2016 14:32.
    13. BUCHTOVÁ, marcela, Radka CHALOUPKOVÁ, Malgorzata ZAKRZEWSKA, Iva VESELÁ, Petra CELÁ, Jana BARÁTHOVÁ, Iva GUDERNOVÁ, Renata ZAJICKOVA, Lukáš TRANTÍREK, Jorge MARTIN, Martin KOSTAS, Jacek OTLEWSKI, Jiří DAMBORSKÝ, Alois KOZUBÍK, Antoni WIEDLOCHA a Pavel KREJČÍ. Instability restricts signaling of multiple fibroblast growth factors. Cellular and Molecular Life Sciences. Basel: Springer, 2015, roč. 72, č. 12, s. 2445-2459. ISSN 1420-682X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00018-015-1856-8.
      URL
      Název anglicky: Instability restricts signaling of multiple fibroblast growth factors
      RIV/00216224:14110/15:00080926 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Švýcarsko.
      Buchtová, marcela (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Zakrzewska, Malgorzata (616 Polsko) -- Veselá, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Celá, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Baráthová, Jana (703 Slovensko, domácí) -- Gudernová, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Zajickova, Renata (203 Česká republika) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Martin, Jorge (840 Spojené státy) -- Kostas, Martin (616 Polsko) -- Otlewski, Jacek (616 Polsko) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Kozubík, Alois (203 Česká republika, domácí) -- Wiedlocha, Antoni (616 Polsko) -- Krejčí, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Fibroblast growth factor; FGF; Unstable; Proteoglycan; Regulation
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 24. 11. 2015 17:02.
    14. LACINA, Karel, Jan NOVOTNÝ, Zdeněk MORAVEC a Petr SKLÁDAL. Interaction of ferroceneboronic acid with diols at aqueous and non-aqueous conditions - signalling and binding abilities of an electrochemical probe for saccharides. Electrochimica Acta. Oxford: PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD, 2015, roč. 153, january, s. 280-286. ISSN 0013-4686. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.electacta.2014.12.009.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00082937 Článek v odborném periodiku. Elektrochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Lacina, Karel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Novotný, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Moravec, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Skládal, Petr (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Ferroceneboronic acid; Lewis acid; Non-aqueous environment; Binding properties; Detection of saccharides
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 29. 3. 2016 16:34.
    15. FOROUTANNEJAD, Cina. Is NICS a reliable aromaticity index for transition metal clusters? Theoretical Chemistry Accounts. NEW YORK: SPRINGER, 2015, roč. 134, č. 2, s. nestránkováno, 9 s. ISSN 1432-881X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00214-015-1617-7.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00084551 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Foroutannejad, Cina (364 Írán, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Aromaticity; Magnetizability; Current density; Transition metals; QTAIM; NICS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 1. 4. 2016 15:10.
    16. NOREK, Adam, Lubomír JANDA a Alena ŽÁKOVSKÁ. Izolace myších monoklonálních protilátek proti OspC proteinu a identifikace vazebných epitopů. In Kongres klinické mikrobiologie, infekčních nemocí a epidemiologie - KMINE 2015. 2015. ISBN 978-80-906155-3-3.
      URL
      Název anglicky: Isolation of mouse monoclonal antibodies against OspC protein and identification of binding epitopes
      RIV/00216224:14310/15:00084124 Konferenční abstrakt. Epidemiologie, infek.nemoci a klin. imunologie. čeština. Česká republika.
      Norek, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, domácí) -- Žákovská, Alena (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Spirochetes; Lyme borreliosis; OspC protein; mouse monoclonal antibodies;

      Změnil: Mgr. Jan Závala, učo 392533. Změněno: 5. 10. 2015 14:50.
    17. YAMAMOTO, Hiroshi, Marianne COLLIER, Justus LOERKE, Jochen ISMER, Andrea SCHMIDT, Tarek HILAL, Thiemo SPRINK, Kaori YAMAMOTO, Thorsten MIELKE, Joerg BURGER, Tanvir SHAIKH, Marylena DABROWSKI, Peter W. HILDEBRAND, Patrick SCHEERER a Christian M. T. SPAHN. Molecular architecture of the ribosome-bound Hepatitis C Virus internal ribosomal entry site RNA. EMBO Journal. Hoboken (USA): WILEY-BLACKWELL, 2015, roč. 34, č. 24, s. 3042-3058. ISSN 0261-4189. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.15252/embj.201592469.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00087262 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Yamamoto, Hiroshi (276 Německo) -- Collier, Marianne (276 Německo) -- Loerke, Justus (276 Německo) -- Ismer, Jochen (276 Německo) -- Schmidt, Andrea (276 Německo) -- Hilal, Tarek (276 Německo) -- Sprink, Thiemo (276 Německo) -- Yamamoto, Kaori (276 Německo) -- Mielke, Thorsten (276 Německo) -- Burger, Joerg (276 Německo) -- Shaikh, Tanvir (840 Spojené státy, garant, domácí) -- Dabrowski, Marylena (276 Německo) -- Hildebrand, Peter W. (276 Německo) -- Scheerer, Patrick (276 Německo) -- Spahn, Christian M. T. (276 Německo)
      Klíčová slova anglicky: 80S ribosome; cryo-electron microscopy; internal initiation; IRES RNA; translational control

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 12. 4. 2016 16:35.
    18. KALETA, Jiří, Zbyněk JANOUŠEK, Marek NEČAS a Ctibor MAZAL. Molecular Rods Combining o-Carborane and Bicyclo[1.1.1]pentane Cages: An Insertion of the Triple Bond Located Next to a Highly Strained Cage. Organometallics. Spojené státy americké: American Chemical Society, Washington DC, 2015, roč. 34, č. 5, s. 967-972. ISSN 0276-7333. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.organomet.5b00002.
      http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.organomet.5b00002
      RIV/00216224:14310/15:00083775 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Kaleta, Jiří (203 Česká republika) -- Janoušek, Zbyněk (203 Česká republika) -- Nečas, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Mazal, Ctibor (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: KeyWords Plus:DEHYDROGENATIVE ALKYNE-INSERTION; DICOBALT OCTACARBONYL; POLYBORANE REACTIONS; IONIC LIQUIDS; ROTORS; MECHANISM; ARRAYS; DECABORANE; REDUCTION
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: doc. Mgr. Marek Nečas, Ph.D., učo 18809. Změněno: 13. 3. 2018 10:19.
    19. KUBÁŇ, Vojtěch, Jiří NOVÁČEK, Ladislav BUMBA a Lukáš ŽÍDEK. NMR assignment of intrinsically disordered self-processing module of the FrpC protein of Neisseria meningitidis. Biomolecular NMR Assignments. Dordrecht (Netherlands): Springer Netherlands, 2015, roč. 9, č. 2, s. 435-440. ISSN 1874-2718. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s12104-015-9625-z.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00085528 Článek v odborném periodiku. Mikrobiologie, virologie. angličtina. Nizozemské království.
      Kubáň, Vojtěch (203 Česká republika, garant, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Bumba, Ladislav (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: FrpC; Self-processing module; Neisseria meningitidis; Intrinsically disordered proteins; Sparse sampling; Resolution-enhanced spectroscopy; Resonance assignment
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 16. 8. 2022 13:55.
    20. NOREK, Adam, Lubomír JANDA a Alena ŽÁKOVSKÁ. OspC typy a invazivita Bbsl z lokality Pisárky, Brno. Exprese OspC ve vysoké koncentraci, izolace protilátek proti OspC a epitopové mapování OspC. In Odborná konference lymeská borrelióza. 2015.
      Odborná konference lymeská borrelióza
      Název česky: OspC typy a invazivita Bbsl z lokality Pisárky, Brno. Exprese OspC ve vysoké koncentraci, izolace protilátek proti OspC a epitopové mapování OspC
      Název anglicky: OspC types and invasiveness of Bbsl from Brno-Pisárky locality. High yield expression of OspC, isolation of anti-OspC antibodies and epitope mapping of OspC protein
      RIV/00216224:14310/15:00083145 Prezentace na konferencích. Imunologie. čeština.
      Norek, Adam (203 Česká republika, garant, domácí) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika) -- Žákovská, Alena (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Outer surface protein C; OspC; monoklonal antibodies; epitope; Borrelia burgdorferi sensu lato

      Změnila: doc. RNDr. Alena Žákovská, Ph.D., učo 417. Změněno: 14. 10. 2015 10:41.
    21. EKUMI, Kingsley M., Hana PACULOVÁ, Tina LENASI, Vendula POSPÍCHALOVÁ, Christian A. BOESKEN, Jana RYBAŘÍKOVÁ, Vítězslav BRYJA, Matthias GEYER, Dalibor BLAŽEK a Matjaz BARBORIC. Ovarian carcinoma CDK12 mutations misregulate expression of DNA repair genes via deficient formation and function of the Cdk12/CycK complex. Nucleic Acids Research. Oxford, UK: Oxford University Press, 2015, roč. 43, č. 5, s. 2575-2589. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkv101.
      URL
      Název anglicky: Ovarian carcinoma CDK12 mutations misregulate expression of DNA repair genes via deficient formation and function of the Cdk12/CycK complex.
      RIV/00216224:14740/15:00080745 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Ekumi, Kingsley M. (246 Finsko) -- Paculová, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Lenasi, Tina (246 Finsko) -- Pospíchalová, Vendula (203 Česká republika, domácí) -- Boesken, Christian A. (276 Německo) -- Rybaříková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, domácí) -- Geyer, Matthias (276 Německo) -- Blažek, Dalibor (203 Česká republika, garant, domácí) -- Barboric, Matjaz (246 Finsko)
      Klíčová slova anglicky: RNA-POLYMERASE-II; PRE-MESSENGER-RNA; MAINTAINS GENOMIC STABILITY; CYCLIN K/CDK12 COMPLEX; TRANSCRIPTION IN-VIVO; C-TERMINAL DOMAIN; HOMOLOGOUS RECOMBINATION; P-TEFB; KINASE; ELONGATION
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 28. 3. 2016 00:32.
    22. KRUSE, Holger, Arnošt MLÁDEK, Konstantinos GKIONIS, Andreas HANSEN, Sstefan GRIMME a Jiří ŠPONER. Quantum Chemical Benchmark Study on 46 RNA Backbone Families Using a Dinucleotide Unit. Journal of Chemical Theory and Computation. Washington DC: American Chemical Society, 2015, roč. 11, č. 10, s. 4972-4991. ISSN 1549-9618. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/acs.jctc.5b00515.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00081386 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Kruse, Holger (276 Německo, domácí) -- Mládek, Arnošt (203 Česká republika) -- Gkionis, Konstantinos (300 Řecko, domácí) -- Hansen, Andreas (276 Německo) -- Grimme, Sstefan (276 Německo) -- Šponer, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS; DENSITY-FUNCTIONAL THEORY; SUGAR-PHOSPHATE BACKBONE; ELECTRONIC-STRUCTURE CALCULATIONS; MAIN-GROUP THERMOCHEMISTRY; BASIS-SET CALCULATIONS; LONG NONCODING RNAS; NUCLEIC-ACID BASES; AMBER FORCE-FIELD; B-DNA STRUCTURE
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 5. 4. 2016 12:38.
    23. MITRA, Mithun, Dustin SINGER, Yu MANO, Jozef HRITZ, Gabriel NAM, Robert J. GORELICK, In-Ja L. BYEON, Angela M. GRONENBORN, Yasumasa IWATANI a Judith G. LEVIN. Sequence and structural determinants of human APOBEC3H deaminase and anti-HIV-1 activities. Retrovirology. London: Biomed Central LTD, 2015, roč. 12, January, s. nestránkováno, 15 s. ISSN 1742-4690. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12977-014-0130-8.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00087269 Článek v odborném periodiku. Mikrobiologie, virologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Mitra, Mithun (840 Spojené státy) -- Singer, Dustin (840 Spojené státy) -- Mano, Yu (392 Japonsko) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí) -- Nam, Gabriel (840 Spojené státy) -- Gorelick, Robert J. (840 Spojené státy) -- Byeon, In-Ja L. (840 Spojené státy) -- Gronenborn, Angela M. (840 Spojené státy) -- Iwatani, Yasumasa (392 Japonsko) -- Levin, Judith G. (840 Spojené státy)
      Klíčová slova anglicky: HIV-1; APOBEC3H; Homology model; Deaminase activity; Antiviral activity; Deaminase-independent restriction; Reverse transcription

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 13. 4. 2016 13:58.
    24. SHOBEIRI, Zohreh, Mehrdad POURAYOUBI, Marek NEČAS, Vladimir DIVJAKOVIC a Michal BABIAK. Sonochemical synthesis of lithium fluoride nano cubic as an active and simple catalyst for thia-Michael addition process: synthesis and structural characterization of beta-aryl-beta-mercapto ketones. JOURNAL OF THE IRANIAN CHEMICAL SOCIETY. NEW YORK: SPRINGER, 2015, roč. 12, č. 2, s. 245-255. ISSN 1735-207X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s13738-014-0479-6.
      RIV/00216224:14310/15:00082369 Článek v odborném periodiku. Anorganická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Shobeiri, Zohreh (364 Írán) -- Pourayoubi, Mehrdad (364 Írán) -- Nečas, Marek (203 Česká republika, garant, domácí) -- Divjakovic, Vladimir (688 Srbsko) -- Babiak, Michal (703 Slovensko, domácí)
      Klíčová slova anglicky: LiF nano cubic; Thia-Michael addition; beta-Aryl-beta-mercapto ketones; Crystal structure; Ultrasound irradiation
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: doc. Mgr. Marek Nečas, Ph.D., učo 18809. Změněno: 13. 3. 2018 10:20.
    25. VÍCHA, Jan, Jan NOVOTNÝ, Michal STRAKA, Michal REPISKY, Kenneth RUUD, Stanislav KOMOROVSKY a Radek MAREK. Structure, solvent, and relativistic effects on the NMR chemical shifts in square-planar transition-metal complexes: assessment of DFT approaches. Physical Chemistry Chemical Physics. Cambridge: Royal Society of Chemistry, 2015, roč. 17, č. 38, s. 24944-24955. ISSN 1463-9076. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/C5CP04214C.
      DOI: 10.1039/C5CP04214C
      RIV/00216224:14740/15:00080968 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Vícha, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Novotný, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Straka, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Repisky, Michal (703 Slovensko) -- Ruud, Kenneth (578 Norsko) -- Komorovsky, Stanislav (703 Slovensko) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Transition-metal complex; geometry; NMR chemical shift; relativistic DFT; gold; platinum
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 3. 9. 2016 18:14.
    26. YURENKO, Yevgen, Jan NOVOTNÝ, Vladimír SKLENÁŘ a Radek MAREK. Substituting CF2 for O4' in Components of Nucleic Acids: Towards Systems with Reduced Propensity to Form Abasic Lesions. Chemistry - A European Journal. WEINHEIM: Wiley, 2015, roč. 21, č. 49, s. 17933-17943. ISSN 0947-6539. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/chem.201502977.
      DOI: 10.1002/chem.201502977
      RIV/00216224:14740/15:00084338 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Německo.
      Yurenko, Yevgen (804 Ukrajina, domácí) -- Novotný, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: density functional calculations; DNA; fluorinated compounds; G-quadruplexes; relaxed force constants
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 10. 3. 2016 12:15.
    27. LIPOVÝ, Břetislav, Lubomír JANDA, Martin FALDYNA, Adam NOREK, Šárka KOBZOVÁ a Markéta HANSLIANOVÁ. Testování účinnosti enzymové terapie na kmenech Staphylococcus aureus. In XXIV. Tomáškovy dny mladých mikrobiologů. 2015.
      Chirurgie vč. transplantologie. čeština. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: prof. MUDr. Břetislav Lipový, Ph.D., MBA, LL.M., učo 60248. Změněno: 6. 12. 2015 23:14.
    28. KOZÁKOVÁ, Lucie, Lucie VONDROVÁ, Karel STEJSKAL, Panagoula CHARALABOUS, Peter KOLESÁR, Alan R. LEHMANN, Stjepan ULDRIJAN, Christopher M. SANDERSON, Zbyněk ZDRÁHAL a Jan PALEČEK. The melanoma-associated antigen 1 (MAGEA1) protein stimulates the E3 ubiquitin-ligase activity of TRIM31 within a TRIM31-MAGEA1-NSE4 complex. Cell Cycle. Philadelphia: Taylor&Francis Inc, 2015, roč. 14, č. 6, s. 920-930. ISSN 1538-4101. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/15384101.2014.1000112.
      URL
      Název česky: Protein melanoma-associated antigen 1 (MAGEA1) stimuluje E3 ubikvitin-ligasovou aktivitu TRIM31 v rámci komplexu TRIM31-MAGEA1-NSE4
      Název anglicky: The melanoma-associated antigen 1 (MAGEA1) protein stimulates the E3 ubiquitin-ligase activity of TRIM31 within a TRIM31-MAGEA1-NSE4 complex
      RIV/00216224:14740/15:00080494 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Kozáková, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Vondrová, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Stejskal, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Charalabous, Panagoula (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Kolesár, Peter (703 Slovensko, domácí) -- Lehmann, Alan R. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Uldrijan, Stjepan (203 Česká republika, domácí) -- Sanderson, Christopher M. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Paleček, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: E3 ubiquitin ligase; MAGEA1; melanoma-associated antigen family; MDM4; NSE1-NSE3-NSE4 complex; NSE4; EID family; protein evolution; PCGF6; RING-finger proteins; RNF166; TRIM31; TRIM family; TRAF6; TRIM8; TRIM41; ubiquitination
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Lucie Jarošová, DiS., učo 205746. Změněno: 13. 3. 2018 15:37.
    29. BROVARETS, Olha, Yevgen YURENKO a Dmytro HOVORUN. The significant role of the intermolecular CHMIDLINE HORIZONTAL ELLIPSISO/N hydrogen bonds in governing the biologically important pairs of the DNA and RNA modified bases: a comprehensive theoretical investigation. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. Philadelphia: Taylor & Francis, 2015, roč. 33, č. 8, s. 1624-1652. ISSN 0739-1102. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/07391102.2014.968623.
      URL
      Název anglicky: The significant role of the intermolecular CHMIDLINE HORIZONTAL ELLIPSISO/N hydrogen bonds in governing the biologically important pairs of the DNA and RNA modified bases: a comprehensive theoretical investigation
      RIV/00216224:14740/15:00082182 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Brovarets, Olha (804 Ukrajina) -- Yurenko, Yevgen (804 Ukrajina, garant, domácí) -- Hovorun, Dmytro (804 Ukrajina)
      Klíčová slova anglicky: CH...O/N H-bonds; pairs of nucleobases; QTAIM and NBO analyses; Bader’s criteria; two-molecule Koch and Popelier’s criteria; Grunenberg’s compliance constants; quantum-chemical methods; energy decomposition analysis; QTAIM delocalization indexes
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 22. 3. 2016 11:52.
    30. HORNÍ, Michal, Radim BINAR a Marek NEČAS. Trigonal to tetrahedral transitions in Cu(I) six-membered inorganic true heterocycles. In The 14th International Symposium on Inorganic Ring Systems. 2015.
      URL
      Anorganická chemie. angličtina.
      Klíčová slova anglicky: Cu(I) coordination; PNC ligands; true heterocycles
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: Mgr. Michal Horní, učo 269652. Změněno: 3. 8. 2015 14:17.
    31. VÍCHA, Jan, Cina FOROUTANNEJAD, Tomasz PAWLAK, Markéta MUNZAROVÁ, Michal STRAKA a Radek MAREK. Understanding the electronic factors responsible for ligand spin-orbit NMR shielding in transition-metal complexes. Journal of Chemical Theory and Computation. Washington D.C.: American Chemical Society, 2015, roč. 11, č. 4, s. 1509-1517. ISSN 1549-9618. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ct501089z.
      DOI: 10.1021/ct501089z
      RIV/00216224:14740/15:00080688 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Vícha, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Foroutannejad, Cina (364 Írán, domácí) -- Pawlak, Tomasz (616 Polsko, domácí) -- Munzarová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Straka, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR; spin-orbit; nuclear magnetic shielding; chemical bonding; gold; platinum
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 22. 3. 2016 13:18.
    32. ŠKOLÁKOVÁ, Petra, Silvie TRANTÍRKOVÁ, Klára BEDNÁŘOVÁ, Radovan FIALA, Michaela VORLÍČKOVÁ a Lukáš TRANTÍREK. Unique C. elegans telomeric overhang structures reveal the evolutionarily conserved properties of telomeric DNA. Nucleic Acids Research. Oxford, UK: Oxford Press, 2015, roč. 43, č. 9, s. 4733-4745. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkv296.
      URL
      RIV/00216224:14740/15:00080881 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Školáková, Petra (203 Česká republika) -- Trantírková, Silvie (203 Česká republika, domácí) -- Bednářová, Klára (203 Česká republika, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Vorlíčková, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NUCLEASE HYPERSENSITIVE ELEMENT; G-QUADRUPLEX STRUCTURES; I-MOTIF; CAENORHABDITIS-ELEGANS; HYDROGEN-BONDS; CELL-LINES; BASE-PAIRS; CATIONIC PORPHYRINS; CIRCULAR-DICHROISM; HUMAN-CHROMOSOMES
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 3. 7. 2015 09:08.
    33. JANDA, Lubomír. Výzkum a vývoj fágových lytických enzymů pro terapii stafylokokových infekcí. Brno: Bohemia Pharmaceuticals s.r.o., 2015, 10 s.
      Název anglicky: Research and development of bacteriophage enzymes to control staphylococcal infections
      RIV/00216224:14740/15:00087321 Výzkumná zpráva. Imunologie. čeština. Česká republika. obsah podléhá obchodnímu tajemství.
      Janda, Lubomír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: lytic enzyme; endolysin; bacteriophage; expression plasmid

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 21. 4. 2016 16:26.
    34. NOVOTNÝ, Jan, Aleš CÍRKVA, Milena TUREČKOVÁ a Radek MAREK. 30th NMR Valtice - Central European NMR Meeting. 2015.
      NMR Valtice
      RIV/00216224:14740/15:00082747 Uspořádání konference. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Novotný, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Církva, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Turečková, Milena (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR; MRI; metabolomics; biomolecular NMR; paramagnetic; theoretical calculation; experiment; solid-state NMR

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 22. 11. 2015 19:25.

    2014

    1. BOUCHAL, Pavel, Monika DVOŘÁKOVÁ, Theodoros ROUMELIOTIS, Zbyněk BORTLÍČEK, Ivana IHNATOVÁ, Iva STRUHÁROVÁ, Eva BUDINSKÁ, Spiros D. GARBIS, Bořivoj VOJTĚŠEK a Rudolf NENUTIL. A novel panel of proteins correlating with lymph node metastasis of low-grade breast cancer as identified by combined proteomics and transcriptomics approach. 2014.
      Biochemie. angličtina. Španělsko.
      Klíčová slova anglicky: breast cancer; proteomics; biomarkers
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757. Změněno: 2. 4. 2015 01:55.
    2. TRIPSIANES, Konstantinos, A. FRIBERG, Ch. BARRANDON, M. BROOKS, H. VAN TILBEURGH, B. SERAPHIN a Michael SATTLER. A Novel Protein-Protein Interaction in the RES (REtention and Splicing) Complex. Journal of Biological Chemistry. Bethesda, USA: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2014, roč. 289, č. 41, s. 28640-28650. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.M114.592311.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00079761 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Tripsianes, Konstantinos (300 Řecko, garant, domácí) -- Friberg, A. (276 Německo) -- Barrandon, Ch. (250 Francie) -- Brooks, M. (250 Francie) -- van Tilbeurgh, H. (250 Francie) -- Seraphin, B. (250 Francie) -- Sattler, Michael (276 Německo)
      Klíčová slova anglicky: MESSENGER-RNA RETENTION; RECOGNITION MOTIF; NMR; YEAST; CRYSTALLOGRAPHY; SPLICEOSOME; SYSTEM; DOMAIN; CORE
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 25. 3. 2015 10:06.
    3. BORKOVCOVÁ, Petra, Blanka PEKÁROVÁ, Martina VÁLKOVÁ, Radka DOPITOVÁ, Břetislav BRZOBOHATÝ, Lubomír JANDA a Jan HEJÁTKO. Antibodies against CKI1RD, a receiver domain of the sensor histidine kinase in Arabidopsis thaliana: from antigen preparation to in planta immunolocalization. Phytochemistry. Elsevier, 2014, roč. 100, April 2014, s. 6-15. ISSN 0031-9422. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.phytochem.2014.01.007.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00073827 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Borkovcová, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Pekárová, Blanka (203 Česká republika, domácí) -- Válková, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Brzobohatý, Břetislav (203 Česká republika) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, domácí) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CKI1; Immunolocalization; Immunoprecipitation; Polyclonal antibodies; Receiver domain
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 28. 4. 2015 11:22.
    4. LACINA, Karel, Martin KONHEFR, Jan NOVOTNÝ, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL a Petr SKLÁDAL. Combining ferrocene, thiophene and a boronic acid: a hybrid ligand for reagentless electrochemical sensing of cis-diols. Tetrahedron Letters. Oxford: Pergamon Press, 2014, roč. 55, č. 21, s. 3235-3238. ISSN 0040-4039. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.tetlet.2014.04.036.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00073706 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Lacina, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Konhefr, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Novotný, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Potěšil, David (203 Česká republika, domácí) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, garant, domácí) -- Skládal, Petr (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: SELF-ASSEMBLED MONOLAYER; PHENYLBORONIC ACID; ELECTRODE SURFACE; GOLD ELECTRODE; SACCHARIDES; RECOGNITION; SENSORS; BINDING; SUGARS; DEHYDROGENASE
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 22. 10. 2014 16:54.
    5. BELMONT, Peter J., Eva BUDINSKÁ, Ping JIANG, Mark J. SINNAMON, Erin COFFEE, Jatin ROPER, Tao XIE, Paul A. REJTO, Sahra DERKITS, Owen J. SANSOM, Mauro DELORENZI, Sabine TEJPAR, Kenneth E. HUNG a Eric S. MARTIN. Cross-species analysis of genetically engineered mouse models of MAPK-driven colorectal cancer identifies hallmarks of the human disease. Disease models & mechanisms. Cambridge: Company of Biologists Ltd., 2014, roč. 7, č. 6, s. 613-623. ISSN 1754-8403. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1242/dmm.013904.
      RIV/00216224:14110/14:00075625 Článek v odborném periodiku. Onkologie a hematologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Belmont, Peter J. (840 Spojené státy) -- Budinská, Eva (703 Slovensko, garant, domácí) -- Jiang, Ping (840 Spojené státy) -- Sinnamon, Mark J. (840 Spojené státy) -- Coffee, Erin (840 Spojené státy) -- Roper, Jatin (840 Spojené státy) -- Xie, Tao (840 Spojené státy) -- Rejto, Paul A. (840 Spojené státy) -- Derkits, Sahra (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Sansom, Owen J. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Delorenzi, Mauro (756 Švýcarsko) -- Tejpar, Sabine (56 Belgie) -- Hung, Kenneth E. (840 Spojené státy) -- Martin, Eric S. (840 Spojené státy)
      Klíčová slova anglicky: KRAS; BRAF; MAPK; Colorectal cancer; GEMM; Genomic signatures
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Soňa Böhmová, učo 232884. Změněno: 8. 1. 2015 16:28.
    6. GARDNER, Christina L, Jozef HRITZ, Chengqun SUN, Dana L. VANLANDINGHAM, Timothy Y. SONG, Elodie GHEDIN, Stephen HIGGS, William B. KLIMSTRA a Kate D. RYMAN. Deliberate Attenuation of Chikungunya Virus by Adaptation to Heparan Sulfate-Dependent Infectivity: A Model for Rational Arboviral Vaccine Design. PLOS Neglected Tropical Diseases. San Francisco: PUBLIC LIBRARY SCIENCE, 2014, roč. 8, č. 2, s. "nestránkováno", 16 s. ISSN 1935-2735. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0002719.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00075086 Článek v odborném periodiku. Ostatní lékařské obory. angličtina. Spojené státy.
      Gardner, Christina L (840 Spojené státy) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí) -- Sun, Chengqun (840 Spojené státy) -- Vanlandingham, Dana L. (840 Spojené státy) -- Song, Timothy Y. (840 Spojené státy) -- Ghedin, Elodie (840 Spojené státy) -- Higgs, Stephen (840 Spojené státy) -- Klimstra, William B. (840 Spojené státy) -- Ryman, Kate D. (840 Spojené státy)
      Klíčová slova anglicky: EQUINE ENCEPHALITIS-VIRUS; INDIAN-OCEAN OUTBREAK; SINDBIS VIRUS; CELL-CULTURE; YELLOW-FEVER; MOUSE MODEL; E2 GLYCOPROTEIN; NEONATAL MICE; BINDING; ATTACHMENT
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 17. 10. 2014 12:44.
    7. FOROUTANNEJAD, Cina, Jan VÍCHA a Radek MAREK. Design of Stereoelectronically Promoted Super Lewis Acids and Unprecedented Chemistry of Their Complexes. Chemistry - A European Journal. Weinheim: Wiley, 2014, roč. 20, č. 36, s. 11584-11590. ISSN 0947-6539. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/chem.201402582.
      DOI: 10.1002/chem.201402582
      RIV/00216224:14310/14:00073759 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Německo.
      Foroutannejad, Cina (364 Írán, domácí) -- Vícha, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: aluminum; bond theory; density functional calculations; Lewis acids; scandium
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 7. 11. 2014 17:27.
    8. PAWLAK, Tomasz, Daria NIEDZIELSKA, Jan VÍCHA, Radek MAREK a Leszek PAZDERSKI. Dimeric Pd(II) and Pt(II) chloride organometallics with 2-phenylpyridine and their solvolysis in dimethylsulfoxide. Journal of Organometallic Chemistry. Lausanne (Switzerland): Elsevier, 2014, roč. 759, Juny, s. 58-66. ISSN 0022-328X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jorganchem.2014.02.016.
      DOI: 10.1016/j.jorganchem.2014.02.016
      RIV/00216224:14740/14:00073519 Článek v odborném periodiku. Anorganická chemie. angličtina. Švýcarsko.
      Pawlak, Tomasz (616 Polsko, domácí) -- Niedzielska, Daria (616 Polsko) -- Vícha, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí) -- Pazderski, Leszek (616 Polsko)
      Klíčová slova anglicky: palladium; platinum; solvolysis; low-temperature NMR spectroscopy; relativistic DFT calculations; cluster model
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 10. 3. 2015 18:26.
    9. HRITZ, Jozef, In-Ja L. BYEON, Troyi KRZYSIAK, Aurora MARTINEZ, Vladimír SKLENÁŘ a Angela M. GRONENBORN. Dissection of Binding between a Phosphorylated Tyrosine Hydroxylase Peptide and 14-3-3zéta: A Complex Story Elucidated by NMR. Biophysical Journal. New York, USA: Cell Press, 2014, roč. 107, č. 9, s. 2185-2194. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2014.08.039.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00077266 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Spojené státy.
      Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí) -- Byeon, In-Ja L. (840 Spojené státy) -- Krzysiak, Troyi (840 Spojené státy) -- Martinez, Aurora (578 Norsko) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Gronenborn, Angela M. (840 Spojené státy)
      Klíčová slova anglicky: STRUCTURAL BASIS; PROTEINS; DOMAIN; SITES; GENE
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 10. 3. 2015 18:08.
    10. MISSIAGLIA, E., B. JACOBS, G. D´ARIO, A.F. DI NARZO, C. SONESON, Eva BUDINSKÁ, Vlad POPOVICI, L. VECCHIONE, S. GERSTER, P. YAN, Arnaud ROTH, D. KLINGBIEL, F.T. BOSMAN, M. DELORENZI a S. TEJPAR. Distal and proximal colon cancers differ in terms of molecular, pathological, and clinical features. Annals of Oncology. Oxford: Oxford University Press, 2014, roč. 25, č. 10, s. 1995-2001, 8 s. ISSN 0923-7534. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/annonc/mdu275.
      Název anglicky: Distal and proximal colon cancers differ in terms of molecular, pathological, and clinical features
      RIV/00216224:14110/14:00076812 Článek v odborném periodiku. Onkologie a hematologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Missiaglia, E. (380 Itálie) -- Jacobs, B. (56 Belgie) -- D´Ario, G. (380 Itálie) -- Di Narzo, A.F. (380 Itálie) -- Soneson, C. (752 Švédsko) -- Budinská, Eva (703 Slovensko, garant, domácí) -- Popovici, Vlad (642 Rumunsko, domácí) -- Vecchione, L. (380 Itálie) -- Gerster, S. (756 Švýcarsko) -- Yan, P. (756 Švýcarsko) -- Roth, Arnaud (756 Švýcarsko) -- Klingbiel, D. (276 Německo) -- Bosman, F.T. (756 Švýcarsko) -- Delorenzi, M. (756 Švýcarsko) -- Tejpar, S. (56 Belgie)
      Klíčová slova anglicky: Colon cancer; Expression profiling; Mutations; Oncogenic pathways; Survival
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Soňa Böhmová, učo 232884. Změněno: 24. 4. 2015 13:44.
    11. YURENKO, Yevgen, Jan NOVOTNÝ, Vladimír SKLENÁŘ a Radek MAREK. Exploring non-covalent interactions in guanine- and xanthine-based model DNA quadruplex structures: A comprehensive quantum chemical approach. Physical Chemistry Chemical Physics. Cambridge: Royal Society of Chemistry, 2014, roč. 16, č. 5, s. 2072-2084. ISSN 1463-9076. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/C3CP53875C.
      DOI: 10.1039/C3CP53875C
      RIV/00216224:14740/14:00074812 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Yurenko, Yevgen (804 Ukrajina, domácí) -- Novotný, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: DNA quadruplex; xanthine; guanine; tetrad; H-bonding; stacking; DFT-D3; Quantum Theory of Atoms in Molecules (QTAIM); Natural Bond Orbital (NBO) analysis; Compliance constant
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 14. 10. 2014 16:33.
    12. BOSÁKOVÁ, Michaela, Pavel KREJČÍ, Lukáš TRANTÍREK a Petr DVOŘÁK. FGF19/BETA-KLOTHO REGULATE PHYSIOLOGY AND DIFFERENTIATION OF HUMAN PLURIPOTENT STEM CELLS. In ISSCR 12th Annual Meeting, Vancouver, Canada, June 18-21 2014. 2014.
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 21. 3. 2016 16:04.
    13. LUI, Vivian Way Y., Noah D. PEYSER, Patrick KS NG, Jozef HRITZ, Yan ZENG, Yiling LU, Hua LI, Lins WANG, Breean R. GILBERT, Ignacio J. GENERAL, Ivet BAHAR, Zhenlin JU, Zhenghe WANG, Kelsey P. PENDLETON, Xiao XIAO, Yu DU, John K. VRIES, Peter S. HAMMERMAN, Levi A. GARRAWAY, Gordon B. MILLS, Dean Kim JOHNSON a Jennifer R. GRANDIS. Frequent mutation of receptor protein tyrosine phosphatases provides a mechanism for STAT3 hyperactivation in head and neck cancer. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. WASHINGTON: NATL ACAD SCIENCES, 2014, roč. 111, č. 3, s. 1114-1119. ISSN 0027-8424. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1073/pnas.1319551111.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00075085 Článek v odborném periodiku. Ostatní lékařské obory. angličtina. Spojené státy.
      Lui, Vivian Way Y. (840 Spojené státy) -- Peyser, Noah D. (840 Spojené státy) -- Ng, Patrick KS (840 Spojené státy) -- Hritz, Jozef (703 Slovensko, garant, domácí) -- Zeng, Yan (840 Spojené státy) -- Lu, Yiling (840 Spojené státy) -- Li, Hua (840 Spojené státy) -- Wang, Lins (840 Spojené státy) -- Gilbert, Breean R. (840 Spojené státy) -- General, Ignacio J. (840 Spojené státy) -- Bahar, Ivet (840 Spojené státy) -- Ju, Zhenlin (840 Spojené státy) -- Wang, Zhenghe (840 Spojené státy) -- Pendleton, Kelsey P. (840 Spojené státy) -- Xiao, Xiao (840 Spojené státy) -- Du, Yu (840 Spojené státy) -- Vries, John K. (840 Spojené státy) -- Hammerman, Peter S. (840 Spojené státy) -- Garraway, Levi A. (840 Spojené státy) -- Mills, Gordon B. (840 Spojené státy) -- Johnson, Dean Kim (840 Spojené státy) -- Grandis, Jennifer R. (840 Spojené státy)
      Klíčová slova anglicky: STAT3 activation; driver mutations; phosphatase mutations
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 17. 10. 2014 12:49.
    14. PLITZKO, Jürgen, Daniel NĚMEČEK a Vladimír SKLENÁŘ. Frontiers in CryoEM. 2014.
      URL
      Název anglicky: Frontiers in CryoEM
      RIV/00216224:14740/14:00087218 Uspořádání workshopu. Mikrobiologie, virologie. angličtina. Česká republika.
      Plitzko, Jürgen (276 Německo, domácí) -- Němeček, Daniel (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: microscopy; cryo-electron microscopy; cryo-electron tomography; TEM; SEM; vitrification
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 6. 4. 2016 23:54.
    15. BERNATÍK, Ondřej, Kateřina ŠEDOVÁ, Carolin SCHILLE, Sri Ranjani GANJI, Igor ČERVENKA, Lukáš TRANTÍREK, Alexandra SCHAMBONY, Zbyněk ZDRÁHAL a Vítězslav BRYJA. Functional Analysis of Dishevelled-3 Phosphorylation Identifies Distinct Mechanisms Driven by Casein Kinase 1 epsilon and Frizzled5. Journal of Biological Chemistry. Bethesda, USA: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2014, roč. 289, č. 34, s. 23520-23533. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.M114.590638.
      URL
      RIV/00216224:14310/14:00074125 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Bernatík, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Šedová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Schille, Carolin (276 Německo) -- Ganji, Sri Ranjani (356 Indie, domácí) -- Červenka, Igor (703 Slovensko, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Schambony, Alexandra (276 Německo) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika, domácí) -- Bryja, Vítězslav (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: PLANAR CELL POLARITY; BETA-CATENIN; WNT/BETA-CATENIN; PDZ DOMAIN; I-EPSILON; WNT PATHWAY; PROTEIN; DROSOPHILA; DVL; FAMILY
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. Mgr. Vítězslav Bryja, Ph.D., učo 11088. Změněno: 17. 12. 2014 12:57.
    16. NOVÁK, Martin, Cina FOROUTANNEJAD a Radek MAREK. Halogen bonding: Model complexes having dihalogen molecules bound to two nonequivalent electron-rich species. In VIIth workshop on modern methods in quantum chemistry. 2014.
      Název česky: Halogenové vazby: Modelové komplexy mající dihalogenové molekuly vázány dvěmi neekvivalentními skupinami bohatými na elektrony.
      Název anglicky: Halogen bonding: Model complexes having dihalogen molecules bound to two nonequivalent electron-rich species.
      Biochemie. angličtina.
      Klíčová slova anglicky: Halogen bonding, DFT
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Martin Novák, Ph.D., učo 323460. Změněno: 5. 3. 2014 11:28.
    17. BENEŠÍK, Martin, Radka DOPITOVÁ, Lubomír JANDA, Jiří DOŠKAŘ, Marek MOŠA, Josef BOŠTÍK a Roman PANTŮČEK. CHAP domain of tail-associated protein from phage 812 and its lytic activity against Staphylococcus aureus. Russian Journal of Infection and Immunity. Sankt Peterburg: InformMed, 2014, roč. 4, S1, s. 33. ISSN 2220-7619.
      URL
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Rusko.
      Změnil: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842. Změněno: 5. 3. 2015 17:04.
    18. SLANINA, Jiří, Gabriela PÁCHNIKOVÁ, Martina ČARNECKÁ, Ludmila KOUBÍKOVÁ, Lenka ADÁMKOVÁ, Otakar HUMPA, Karel ŠMEJKAL a Iva SLANINOVÁ. Identification of Key Structural Characteristics of Schisandra chinensis Lignans Involved in P-Glycoprotein Inhibition. Journal of Natural Products. Washington: American Chemical Society, 2014, roč. 77, č. 10, s. 2255-2263. ISSN 0163-3864. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/np500521v.
      Název anglicky: Identification of Key Structural Characteristics of Schisandra chinensis Lignans Involved in P-Glycoprotein Inhibition
      RIV/00216224:14110/14:00077244 Článek v odborném periodiku. Farmakologie a lékárnická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Slanina, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Páchniková, Gabriela (703 Slovensko, domácí) -- Čarnecká, Martina (703 Slovensko, domácí) -- Koubíková, Ludmila (203 Česká republika, domácí) -- Adámková, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Humpa, Otakar (203 Česká republika, domácí) -- Šmejkal, Karel (203 Česká republika) -- Slaninová, Iva (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RESISTANCE-ASSOCIATED PROTEIN-1; MEDIATED MULTIDRUG-RESISTANCE; CANCER-CELLS; DIBENZOCYCLOOCTADIENE LIGNANS; ABSOLUTE STRUCTURE; DRUG-RESISTANCE; GOMISIN-N; CONSTITUENTS; BAILL; SCHIZANDRIN
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 28. 1. 2015 14:29.
    19. HANSEL, Robert, Laura M. LUH, Ivan CORBERSKI, Lukáš TRANTÍREK a Volker DOTSCH. In-Cell NMR and EPR Spectroscopy of Biomacromolecules. Angewandte Chemie International Edition. Weinheim, Germany: Wiley-VCH Verlag GmbH & Co., 2014, roč. 53, č. 39, s. 10300-10314. ISSN 1433-7851. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/anie.201311320.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00074124 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Německo.
      Hansel, Robert (276 Německo) -- Luh, Laura M. (276 Německo) -- Corberski, Ivan (276 Německo) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Dotsch, Volker (276 Německo)
      Klíčová slova anglicky: MAGNETIC-RESONANCE-SPECTROSCOPY; XENOPUS-LAEVIS OOCYTES; ELECTRON-PARAMAGNETIC-RESONANCE; PROTEIN-PROTEIN INTERACTIONS; HUMAN TELOMERIC DNA; DISTANCE MEASUREMENTS; ESCHERICHIA-COLI; LIVING CELLS; F-19 NMR; PHYSIOLOGICAL CONDITIONS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 21. 11. 2014 06:55.
    20. BROVARETS', Ol'ha, Yevgen YURENKO a Dmytro HOVORUN. Intermolecular CH_O/N H-bonds in the biologically important pairs of natural nucleobases: a thorough quantum-chemical study. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. Philadelphia: Taylor&Francis Inc, 2014, roč. 32, č. 6, s. 993-1022. ISSN 0739-1102. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/07391102.2013.799439.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00074805 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Brovarets', Ol'ha (804 Ukrajina) -- Yurenko, Yevgen (804 Ukrajina, garant, domácí) -- Hovorun, Dmytro (804 Ukrajina)
      Klíčová slova anglicky: CH_O/N H-bonds; nucleobase pairs; QTAIM and NBO analyses; Bader ’ s criteria; two-molecule Koch and Popelier ’ s criteria; Grunenberg ’ s compliance constants; geometrical and vibrational analyses; quantum-chemical methods
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 10. 3. 2015 18:23.
    21. BABINSKÝ, Martin, Radovan FIALA, Iva KEJNOVSKÁ, Klára BEDNÁŘOVÁ, Radek MAREK, Janos SAGI, Vladimír SKLENÁŘ a Michaela VORLÍČKOVÁ. Loss of loop adenines alters human telomere d(AG3(TTAG3)3) quadruplex folding. Nucleic Acids Research. UK: Oxford University Press, 2014, roč. 42, č. 22, s. 14031-14041. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/nar/gku1245.
      DOI: 10.1093/nar/gku1245
      RIV/00216224:14740/14:00073361 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Babinský, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Kejnovská, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Bednářová, Klára (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Sagi, Janos (840 Spojené státy) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Vorlíčková, Michaela (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Quadruplex DNA; abasic lesion; NMR; CD;
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 10. 3. 2015 14:23.
    22. ŠEBERA, Jakub, Lukáš TRANTÍREK, Jiří FUKAL, Yoshiyuki TANAKA a Vladimír SYCHROVSKÝ. MECHANISM OF BASE EXCISION WITH THE hOGG1 DNA REPAIR ENZYME. Chemické listy. Praha: Česká společnost chemická, 2014, roč. 108, č. 4, s. 364-367. ISSN 0009-2770.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00077390 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Šebera, Jakub (203 Česká republika) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Fukal, Jiří (203 Česká republika) -- Tanaka, Yoshiyuki (392 Japonsko) -- Sychrovský, Vladimír (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: NUCLEIC-ACID BASES; GLYCOSIDIC BOND-CLEAVAGE; HUMAN 8-OXOGUANINE GLYCOSYLASE; AB-INITIO; TRANSITION-STATE; PROTEIN HOGG1; HARTREE-FOCK; OGG1 GENE; RECOGNITION; GUANINE
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 21. 11. 2014 10:39.
    23. VÍCHA, Jan, Michal STRAKA, Markéta MUNZAROVÁ a Radek MAREK. Mechanism of Spin-Orbit Effects on the Ligand NMR Chemical Shift in Transition-Metal Complexes: Linking NMR to EPR. Journal of Chemical Theory and Computation. Washington: American Chemical Society, 2014, roč. 10, č. 4, s. 1489-1499. ISSN 1549-9618. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ct400726y.
      DOI: 10.1021/ct400726y
      RIV/00216224:14740/14:00073495 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Vícha, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Straka, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Munzarová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR shielding; spin-orbit coupling; d-orbitals; mechanism; transition-metal complex; iridium; EPR; g-tensor; A-tensor
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 26. 9. 2014 10:46.
    24. NOVÁK, Martin, Cina FOROUTANNEJAD a Radek MAREK. Modulating graphene ion-receptor properties under influence of an external electric field. 2014.
      Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: Graphane, Electric field, DFT
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Martin Novák, Ph.D., učo 323460. Změněno: 14. 10. 2014 23:45.
    25. VERLANDE, Amandine, Michaela KRAFČÍKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, I JELÍNKOVÁ, Alena HYRŠLOVÁ VACULOVÁ a Stjepan ULDRIJAN. Modulation of melanoma metabolism and viability with hexokinase and mitochondrial complex I inhibitors. In EMBO conference: Cellular signaling and cancer therapy, Hotel Croatia, Cavtat, Croatia, May 23-27, 2014, poster presentation. 2014.
      Název anglicky: Modulation of melanoma metabolism and viability with hexokinase and mitochondrial complex I inhibitors
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Změnila: Mgr. Martina Vráblíková, učo 10839. Změněno: 18. 12. 2017 11:19.
    26. YURENKO, Yevgen, Jan NOVOTNÝ, Mariusz P. MITORAJ, Vladimír SKLENÁŘ, Artur MICHALAK a Radek MAREK. Nucleic acid quadruplexes based on 8-halo-9-deazaxanthines: Energetics and non-covalent interactions in quadruplex stems. Journal of Chemical Theory and Computation. Washington D.C.: American Chemical Society, 2014, roč. 10, č. 12, s. 5353-5365. ISSN 1549-9618. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ct5007554.
      DOI: 10.1021/ct5007554
      RIV/00216224:14740/14:00076936 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Yurenko, Yevgen (804 Ukrajina, domácí) -- Novotný, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Mitoraj, Mariusz P. (616 Polsko) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Michalak, Artur (616 Polsko) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: nucleic acid; quadruplex; xanthine; halogen; energy of formation; hydrogen bonding; stacking; ion coordination
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 23. 1. 2015 09:29.
    27. BADRI, Zahra, Kateřina BOUZKOVÁ, Cina FOROUTANNEJAD a Radek MAREK. Origin of the Thermodynamic Stability of the Polymorph IV of Crystalline Barbituric Acid: Evidence from Solid-State NMR and Electron Density Analyses. Crystal Growth & Design. Washington, DC: American Chemical Society, 2014, roč. 14, č. 6, s. 2763-2772. ISSN 1528-7483. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/cg401899q.
      DOI: 10.1021/cg401899q
      RIV/00216224:14740/14:00073614 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Badri, Zahra (364 Írán, domácí) -- Bouzková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Foroutannejad, Cina (364 Írán, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: polymorph; cluster; NMR chemical shift tensor; delocalization index; intermolecular interaction; hydrogen bonding; stacking
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 7. 11. 2014 17:30.
    28. HIDALGO, Manuel, Frederic AMANT, Andrew V. BIANKIN, Eva BUDINSKÁ, Annete T. BYRNE, Carlos CALDAS, Robert B. CLARKE, Steven de JONG, Jos JONKERS, Gundhild Mari MAELANDSMO, Sergio ROMAN-ROMAN, Joan SEOANE, Livio TRUSOLINO a Alberto VILLANUEVA. Patient-Derived Xenograft Models: An Emerging Platform for Translational Cancer Research. Cancer Discovery. Philadelphia: American Association for Cancer Research Inc., 2014, roč. 4, č. 9, s. 998-1013. ISSN 2159-8274. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1158/2159-8290.CD-14-0001.
      Název anglicky: Patient-Derived Xenograft Models: An Emerging Platform for Translational Cancer Research
      RIV/00216224:14110/14:00078130 Článek v odborném periodiku. Onkologie a hematologie. angličtina. Spojené státy.
      Hidalgo, Manuel (724 Španělsko) -- Amant, Frederic (56 Belgie) -- Biankin, Andrew V. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Budinská, Eva (703 Slovensko, garant, domácí) -- Byrne, Annete T. (372 Irsko) -- Caldas, Carlos (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Clarke, Robert B. (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Jong, Steven de (528 Nizozemské království) -- Jonkers, Jos (528 Nizozemské království) -- Maelandsmo, Gundhild Mari (578 Norsko) -- Roman-Roman, Sergio (250 Francie) -- Seoane, Joan (724 Španělsko) -- Trusolino, Livio (380 Itálie) -- Villanueva, Alberto (724 Španělsko)
      Klíčová slova anglicky: HUMAN PANCREATIC-CANCER; TUMOR XENOGRAFTS; NUDE-MICE; COLORECTAL-CANCER; STEM-CELLS; IN-VIVO; PERSONALIZED CHEMOTHERAPY; THERAPEUTIC RESPONSE; IMMUNODEFICIENT MICE; DRUG DEVELOPMENT
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Soňa Böhmová, učo 232884. Změněno: 9. 1. 2015 14:10.
    29. FOROUTANNEJAD, Cina a Radek MAREK. Potential energy surface and binding energy in the presence of an external electric field: modulation of anion–pi interactions for graphene-based receptors. Physical Chemistry Chemical Physics. Cambridge: Royal Society of Chemistry, 2014, roč. 16, č. 6, s. 2508-2514. ISSN 1463-9076. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c3cp52671b.
      DOI: 10.1039/c3cp52671b
      RIV/00216224:14310/14:00074895 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Foroutannejad, Cina (364 Írán, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Electric field; binding enery; potential energy surface; anion_pi; graphene
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 7. 11. 2014 17:31.
    30. MRÁZKOVÁ, Jana, Gita JANČAŘÍKOVÁ, Marie POKORNÁ, Peter KYSEĽ a Michaela WIMMEROVÁ. Production of human proteins using well-established and alternative recombinant expression hosts. In 39th FEBS Congress. 2014. ISSN 1742-464X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/febs.12919.
      Název česky: Produkce lidských proteinů pomocí zavedených a alternativních rekombinantních expresních hostitelů
      Název anglicky: Production of human proteins using well-established and alternative recombinant expression hosts
      RIV/00216224:14310/14:00074242 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Francie.
      Mrázková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Jančaříková, Gita (203 Česká republika, domácí) -- Pokorná, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Kyseľ, Peter (703 Slovensko, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Escherichia coli; human proteins production; Leishmania tarentolae
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Jana Šístková, Ph.D., učo 150819. Změněno: 2. 1. 2015 12:44.
    31. ZÁBRADY, Matej. Recombinant antibodies for in vivo applications. In XII Discussions in Structural Molecular Biology. 2014.
      XII Discussions in Structural Molecular Biology
      RIV/00216224:14310/14:00073670 Prezentace na konferencích. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Zábrady, Matej (703 Slovensko, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: recombinant antibodies in vivo inhibition yeast two=hybrid
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Ing. Matej Zábrady, Ph.D., učo 111648. Změněno: 9. 6. 2014 11:03.
    32. VYMETAL, Jiří, Sreenivas Reddy BATHULA, Jiří ČERNÝ, Radka CHALOUPKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ a Jiří VONDRÁŠEK. Retro operation on the Trp-cage miniprotein sequence produces an unstructured molecule capable of folding similar to the original only upon 2,2,2-trifluoroethanol addition. PROTEIN ENGINEERING DESIGN & SELECTION. OXFORD: OXFORD UNIV PRESS, 2014, roč. 27, č. 12, s. 463-472. ISSN 1741-0126. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/protein/gzu046.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00074482 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Vymetal, Jiří (203 Česká republika) -- Bathula, Sreenivas Reddy (356 Indie, domácí) -- Černý, Jiří (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Vondrášek, Jiří (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: protein folding; protein-structure prediction; molecular dynamics; NMR methods; CD spectroscopy
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 3. 4. 2015 07:03.
    33. ZHANG, Zaiyong, Justin PORTER, Konstantinos TRIPSIANES a Oliver F. LANGE. Robust and highly accurate automatic NOESY assignment and structure determination with Rosetta. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer Netherlands, 2014, roč. 59, č. 3, s. 135-145. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-014-9832-4.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00077434 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Zhang, Zaiyong (276 Německo) -- Porter, Justin (276 Německo) -- Tripsianes, Konstantinos (300 Řecko, garant, domácí) -- Lange, Oliver F. (276 Německo)
      Klíčová slova anglicky: Nuclear magnetic resonance; Automatic data analysis; Structure determination
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 10. 3. 2015 18:41.
    34. HOUSER, Josef, Jiří NOVÁČEK, Jan KOMÁREK, David BUCHTA, Daniel POKORNÝ, Peter BYSTRICKÝ, Lukáš ŽÍDEK a Michaela WIMMEROVÁ. RSL lectin - a complex approach to study carbohydrate-protein interaction. In 12th Discussions in Structural Molecular Biology. 2014. ISSN 1211-5894.
      Název anglicky: RSL lectin - a complex approach to study carbohydrate-protein interaction
      RIV/00216224:14310/14:00073537 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Houser, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Komárek, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Buchta, David (203 Česká republika, domácí) -- Pokorný, Daniel (203 Česká republika, domácí) -- Bystrický, Peter (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: lectin; Ralstonia; AAL family
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Josef Houser, Ph.D., učo 77781. Změněno: 15. 3. 2014 19:50.
    35. KADEŘÁVEK, Pavel, Vojtěch ZAPLETAL, Alžběta RABATINOVÁ, Libor KRÁSNÝ, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš ŽÍDEK. Spectral density mapping protocols for analysis of molecular motions in disordered proteins. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2014, roč. 58, č. 3, s. 193-207. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-014-9816-4.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00073529 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Zapletal, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Rabatinová, Alžběta (203 Česká republika) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nuclear magnecit resonance; Relaxation; Spectral density function; Intrinsically disordered proteins
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 10. 3. 2015 18:44.
    36. OBR, Martin, Romana HADRAVOVÁ, Michal DOLEŽAL, Ivana KŘÍŽOVÁ, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Richard HRABAL, Tomáš RUML a Michaela RUMLOVÁ. Stabilization of the beta-hairpin in Mason-Pfizer monkey virus capsid protein- a critical step for infectivity. Retrovirology. London: Biomed Central LTD, 2014, roč. 11, October 2014, s. "nestránkováno", 14 s. ISSN 1742-4690. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12977-014-0094-8.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00077815 Článek v odborném periodiku. Mikrobiologie, virologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Obr, Martin (203 Česká republika) -- Hadravová, Romana (203 Česká republika) -- Doležal, Michal (203 Česká republika) -- Křížová, Ivana (203 Česká republika) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Hrabal, Richard (203 Česká republika) -- Ruml, Tomáš (203 Česká republika) -- Rumlová, Michaela (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: N-TERMINAL DOMAIN; IN-VITRO; STRUCTURAL-ANALYSIS; ESCHERICHIA-COLI; GAG POLYPROTEIN; CORE FORMATION; RESOLUTION; MATURATION; ASSIGNMENT; MUTATIONS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 7. 1. 2015 20:25.
    37. PONOMAREVA, Alla, Yevgen YURENKO, Roman ZHURAKIVSKY, Tanja VAN MOURIK a Dmytro HOVORUN. Structural and energetic properties of the potential HIV-1 reverse transcriptase inhibitors d4A and d4G: a comprehensive theoretical investigation. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. Philadelphia: Taylor & Francis, 2014, roč. 32, č. 5, s. 730-740. ISSN 0739-1102. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/07391102.2013.789401.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00074813 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Ponomareva, Alla (804 Ukrajina) -- Yurenko, Yevgen (804 Ukrajina, garant, domácí) -- Zhurakivsky, Roman (804 Ukrajina) -- van Mourik, Tanja (528 Nizozemské království) -- Hovorun, Dmytro (804 Ukrajina)
      Klíčová slova anglicky: 2 ' 3 ' -didehydro-2' 3 ' -dideoxyadenosine; 2 ' 3 ' -didehydro-2 ' 3 ' -dideoxyguanosine; d4A; d4G; conformational analysis; hydrogen bonds; H-bonds; biological activity; nucleoside reverse transcriptase inhibitors; density functional theory
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 10. 3. 2015 18:52.
    38. DEGTJARIK, Oksana, Radka DOPITOVÁ, Blanka PEKÁROVÁ, Tomáš KLUMPLER, Jakub HORÁK, Petra BORKOVCOVÁ, Eliška NEJEDLÁ, David ŘEHA, Sandra PUEHRINGER, Olga OTRUSINOVÁ, Séverine JANSEN, Michal KUTÝ, Manfred S. WEISS, Vladimír SKLENÁŘ, Jaromír MAREK, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Ivana KUTÁ-SMATANOVÁ, Lubomír JANDA a Jan HEJÁTKO. Structural Biology in Use : NMR, X-ray and Molecular Dynamics Modeling in Study on Multistep Phosphorelay Signaling in Plants. In 6. Metodické dny. 2/2014. 2014, s. 52-52. ISSN 1213-6670.
      URL
      Botanika. angličtina. Česká republika.
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 18. 3. 2015 12:58.
    39. JANČAŘÍKOVÁ, Gita, Gabriel DEMO, Jan KOMÁREK a Michaela WIMMEROVÁ. Structure-functional study of PHL lectin from Photorhabdus asymbiotica. In FEBS Young Scientists' Forum. 2014.
      Název anglicky: Structure-functional study of PHL lectin from Photorhabdus asymbiotica
      RIV/00216224:14740/14:00074015 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Francie.
      Jančaříková, Gita (203 Česká republika, domácí) -- Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Komárek, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: lectin Photorhabdus asymbiotica
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Gabriel Demo, Ph.D., učo 150765. Změněno: 30. 12. 2014 15:56.
    40. JANČAŘÍKOVÁ, Gita, Jan KOMÁREK, Gabriel DEMO a Michaela WIMMEROVÁ. Strukturně-funkční studium lektinu PHL z Photorabdus asymbiotica a jeho význam v patogenezi. In Chemické listy, vol. 108 (5), 2014. 2014. ISSN 0009-2770.
      Název česky: Strukturně-funkční studium lektinu PHL z Photorabdus asymbiotica a jeho význam v patogenezi
      Název anglicky: Structure-functional study of PHL lectin coming from Photorabdus asymbiotica and its importance in pathogenesis
      RIV/00216224:14740/14:00077095 Konferenční abstrakt. Biochemie. čeština. Česká republika.
      Jančaříková, Gita (203 Česká republika, domácí) -- Komárek, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: lectin Photorhabdus asymbiotica
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Gabriel Demo, Ph.D., učo 150765. Změněno: 30. 12. 2014 15:55.
    41. TRIPSIANES, Konstantinos, Nam K. CHU, Anders FRIBERG, Michael SATTLER a Christian F. W. BECKER. Studying Weak and Dynamic Interactions of Posttranslationally Modified Proteins using Expressed Protein Ligation. ACS CHEMICAL BIOLOGY. Washington D.C.: AMER CHEMICAL SOC, 2014, roč. 9, č. 2, s. 347-352. ISSN 1554-8929. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/cb400723j.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00077435 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Tripsianes, Konstantinos (300 Řecko, garant, domácí) -- Chu, Nam K. (36 Austrálie) -- Friberg, Anders (276 Německo) -- Sattler, Michael (276 Německo) -- Becker, Christian F. W. (36 Austrálie)
      Klíčová slova anglicky: SMN TUDOR DOMAIN; RESOLUTION X-RAY; CHEMICAL-SYNTHESIS; ARGININE RESIDUES; SEMISYNTHESIS; PHOTOCONTROL; BINDING; SITE
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 10. 3. 2015 18:55.
    42. NOVOTNÝ, Jan, Yevgen YURENKO, Petr KULHÁNEK a Radek MAREK. Tailoring the Properties of Quadruplex Nucleobases for Biological and Nanomaterial Applications. Physical Chemistry Chemical Physics. Cambridge: Royal Society of Chemistry, 2014, roč. 16, č. 29, s. 15241-15248. ISSN 1463-9076. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/C4CP00541D.
      DOI: 10.1039/C4CP00541D
      RIV/00216224:14740/14:00075618 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Novotný, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Yurenko, Yevgen (804 Ukrajina, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Quadruplex; DNA; guanine; xanthine; 9-deaza-8-haloxanthine; density-functional theory; hydrogen-bonding; stacking; ion coordination; formation energy
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 10. 12. 2019 09:29.
    43. ZÁBRADY, Matej, Vendula HRDINOVÁ, Bruno MÜLLER, Udo CONRAD, Jan HEJÁTKO a Lubomír JANDA. Targeted In Vivo Inhibition of Specific Protein–Protein Interactions Using Recombinant Antibodies. PLOS ONE : Public Library of Science. San Francisco: Public Library Science, 2014, roč. 9, č. 10, s. "nestránkováno", 9 s. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0109875.
      URL
      Název anglicky: Targeted In Vivo Inhibition of Specific Protein–Protein Interactions Using Recombinant Antibodies
      RIV/00216224:14740/14:00074131 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Zábrady, Matej (703 Slovensko, domácí) -- Hrdinová, Vendula (203 Česká republika, domácí) -- Müller, Bruno (756 Švýcarsko) -- Conrad, Udo (276 Německo) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: recombinant antibodies;immunomodulation;inhibition;protein-protein interactions;cytokinin signaling pathway
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 10. 3. 2015 19:08.
    44. NARZO, Antonio Fabio Di, Sabine TEJPAR, Simona ROSSI, Pu YAN, Vlad POPOVICI, Pratyaksha WIRAPATI, Eva BUDINSKÁ, Tao XIE, Heather ESTRELLA, Adam PAVLICEK, Mao MAO, Martin ERIC, Weinrich SCOTT, Fred T BOSMAN, Arnaud ROTH a Mauro DELORENZI. Test of Four Colon Cancer Risk-Scores in Formalin Fixed Paraffin Embedded Microarray Gene Expression Data. Journal of the National Cancer Institute. Bethesda: National Cancer Institute, 2014, roč. 106, č. 10, s. 1-8. ISSN 0027-8874. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1093/jnci/dju247.
      Onkologie a hematologie. angličtina. Spojené státy.
      Klíčová slova anglicky: colon cancer; microarray; gene expression; prognostic signature

      Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 6. 5. 2016 13:45.
    45. ŠEBERA, Jakub, Lukáš TRANTÍREK, Y. TANAKA, R. NENCKA, J. FUKAL a V. SYCHROVSKÝ. The activation of N-glycosidic bond cleavage performed by base-excision repair enzyme hOGG1; theoretical study of the role of Lys 249 residue in activation of G, OxoG and FapyG. RSC Advances. Cambridge: Royal Society of Chemistry, 2014, roč. 4, č. 83, s. 44043-44051. ISSN 2046-2069. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c4ra08278h.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00079762 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Šebera, Jakub (203 Česká republika) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Tanaka, Y. (392 Japonsko) -- Nencka, R. (203 Česká republika) -- Fukal, J. (203 Česká republika) -- Sychrovský, V. (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: 8-OXOGUANINE DNA GLYCOSYLASE; INDEPENDENT CHEMICAL-SHIFTS; OXIDATIVELY DAMAGED DNA; TRANSITION-STATE; PROTEIN HOGG1; GAS-PHASE; OGG1 GENE; RECOGNITION; DENSITY; MECHANISM
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 25. 3. 2015 10:43.
    46. ASBAH, Layka Abbasi, Iria VAZQUEZ, Loredana VECCHIONE, Eva BUDINSKÁ, Veerle DE VRIENDT, Maria Francesca BAIETTI, Mikhail STEKLOV, Bart JACOBS, Nicholas HOE, Sharat SINGH, Naga-Sailaja IMJETI, Pascale ZIMMERMANN, Anna SABLINA a Sabine TEJPAR. The tyrosine phosphatase PTPRO sensitizes colon cancer cells to anti-EGFR therapy through activation of SRC-mediated EGFR signaling. Oncotarget. New York: Impact Journals, 2014, roč. 5, č. 20, s. 10070-10083. ISSN 1949-2553.
      Název anglicky: The tyrosine phosphatase PTPRO sensitizes colon cancer cells to anti-EGFR therapy through activation of SRC-mediated EGFR signaling
      RIV/00216224:14110/14:00078129 Článek v odborném periodiku. Onkologie a hematologie. angličtina. Spojené státy.
      Asbah, Layka Abbasi (56 Belgie) -- Vazquez, Iria (56 Belgie) -- Vecchione, Loredana (56 Belgie) -- Budinská, Eva (703 Slovensko, garant, domácí) -- De Vriendt, Veerle (56 Belgie) -- Baietti, Maria Francesca (56 Belgie) -- Steklov, Mikhail (56 Belgie) -- Jacobs, Bart (56 Belgie) -- Hoe, Nicholas (840 Spojené státy) -- Singh, Sharat (840 Spojené státy) -- Imjeti, Naga-Sailaja (56 Belgie) -- Zimmermann, Pascale (56 Belgie) -- Sablina, Anna (56 Belgie) -- Tejpar, Sabine (56 Belgie)
      Klíčová slova anglicky: EGFR; PTPRO; phosphatase; SRC kinase; EGFR inhibitor; colon cancer
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 24. 4. 2015 14:15.
    47. FOROUTANNEJAD, Cina, Shant SHAHBAZIAN a Radek MAREK. Toward a consistent interpretation of the QTAIM: Tortuous link between chemical bonds, interactions and bond/line paths. Chemistry - A European Journal. Wiley, 2014, roč. 20, č. 32, s. 10140-10152. ISSN 0947-6539. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/chem.201402177.
      DOI: 10.1002/chem.201402177
      RIV/00216224:14310/14:00073654 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Německo.
      Foroutannejad, Cina (364 Írán, domácí) -- Shahbazian, Shant (364 Írán) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Quantum theory of atoms in molecules; bond paths; chemical bond
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 11. 4. 2015 21:55.
    48. NOVÁČEK, Jiří, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Toward optimal-resolution NMR of intrinsically disordered proteins. Journal of Magnetic Resonance. San Diego: Academic Press Inc Elsevier Science, 2014, roč. 241, April, s. 41-52. ISSN 1090-7807. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jmr.2013.12.008.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00073570 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: IDPs; IDPRs; Multi-dimensional NMR; Non-uniform sampling; NUS; PRE; RDC; RNAP delta-subunit
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 17. 10. 2014 13:45.
    49. STADLBAUER, Petr, Lukáš TRANTÍREK, Thomas E. CHEATHAM III., Jaroslav KOČA a Jiří ŠPONER. Triplex intermediates in folding of human telomeric quadruplexes probed by microsecond-scale molecular dynamics simulations. Biochimie. Paris: ELSEVIER FRANCE-EDITIONS SCIENTIFIQUES MEDICALES ELSEVIER, 2014, roč. 105c, October, s. 22-35. ISSN 0300-9084. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.biochi.2014.07.009.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00074073 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Francie.
      Stadlbauer, Petr (203 Česká republika) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Cheatham III., Thomas E. (840 Spojené státy) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Šponer, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: G-DNA folding; Molecular dynamics; Quadruplex; Telomere; Triplex
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 15. 7. 2015 09:13.
    50. JANDA, Lubomír. Výzkum a vývoj fágových lytických enzymů pro terapii stafylokokových infekcí 2014. Masarykova univerzita, Brno: Bohemia Pharmaceuticals, s.r.o., 2014, 5 s.
      Název anglicky: Research and development of phage lytic enzymes for the treatment of staphylococcal infections 2014
      RIV/00216224:14740/14:00079822 Výzkumná zpráva. Genetika a molekulární biologie. čeština. Česká republika. obsah podléhá obchodnímu tajemství.
      Janda, Lubomír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Lytic enzymes; phage endolysin 812; CHAP; F1

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 31. 3. 2015 08:12.
    51. BAJARD-EŠNER, Lola, L.G. MORELLI, S. ARES, J. PECREAUX, F. JULICHER a A.C. OATES. Wnt-regulated dynamics of positional information in zebrafish somitogenesis. Development. Cambridge: Company of Biologists, 2014, roč. 141, č. 6, s. 1381-1391. ISSN 0950-1991. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1242/dev.093435.
      URL
      RIV/00216224:14740/14:00079901 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Bajard-Ešner, Lola (250 Francie, garant, domácí) -- Morelli, L.G. (276 Německo) -- Ares, S. (276 Německo) -- Pecreaux, J. (276 Německo) -- Julicher, F. (276 Německo) -- Oates, A.C. (276 Německo)
      Klíčová slova anglicky: Fgf signaling; Wnt signaling; Embryonic elongation; Segmentation clock; Signal gradient; Time-lapse microscopy
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 30. 3. 2015 09:35.
    52. JEREMIAS, Lukáš, Gabriel DEMO, Michal BABIAK, Jan VÍCHA, Zdeněk TRÁVNÍČEK a Josef NOVOSAD. X-ray structures of heteroleptic zinc(II) complexes involving combinations of O,O-dialkyldithiophosphato and bidentate N-donor ligands. Zeitschrift für Kristallographie - Crystalline Materials. DE GRUYTER, 2014, roč. 229, č. 7, s. 537-542. ISSN 0044-2968. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1515/zkri-2014-1736.
      Název anglicky: X-ray structures of heteroleptic zinc(II) complexes involving combinations of O,O-dialkyldithiophosphato and bidentate N-donor ligands
      RIV/00216224:14310/14:00075889 Článek v odborném periodiku. Anorganická chemie. angličtina. Německo.
      Jeremias, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Babiak, Michal (703 Slovensko, domácí) -- Vícha, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Trávníček, Zdeněk (203 Česká republika) -- Novosad, Josef (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: 1 1-dithiolate dithiophosphate zinc(II) complexes crystal structure analysis X-ray diffraction
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 11. 4. 2015 18:33.
    53. DEMO, Gabriel, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Jan KOMÁREK, Pavel KADEŘÁVEK, Olga OTRUSINOVÁ, Pavel SRB, Alzbeta RABATINOVA, Libor KRÁSNÝ, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ a Michaela WIMMEROVÁ. X-ray vs. NMR structure of N-terminal domain of delta-subunit of RNA polymerase. Journal of Structural Biology. San Diego: Academic Press, 2014, roč. 187, č. 2, s. 174-186. ISSN 1047-8477. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jsb.2014.06.001.
      URL
      Název anglicky: X-ray vs. NMR structure of N-terminal domain of delta-subunit of RNA polymerase
      RIV/00216224:14740/14:00073722 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Komárek, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Otrusinová, Olga (203 Česká republika, domácí) -- Srb, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Rabatinova, Alzbeta (703 Slovensko) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: N-terminal domain; Nuclear magnetic resonance; Protein crystallography; RNA polymerase; delta-Subunit
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 22. 10. 2014 15:09.
    54. MAREK, Radek, Jan NOVOTNÝ, Cina FOROUTANNEJAD, Aleš CÍRKVA a Milena TUREČKOVÁ. 29th NMR Valtice - Central European NMR Meeting. 2014.
      NMR Valtice
      RIV/00216224:14310/14:00075648 Uspořádání konference. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí) -- Novotný, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Foroutannejad, Cina (364 Írán, domácí) -- Církva, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Turečková, Milena (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR; paramagnetic; theoretical calculation; experiment; solid-state NMR; metabolomics; biomolecular NMR
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 7. 6. 2014 13:38.

    2013

    1. VÍCHA, Jan, Michael PATZSCHKE a Radek MAREK. A relativistic DFT methodology for calculating the structures and NMR chemical shifts of octahedral platinum and iridium complexes. Physical Chemistry Chemical Physics. Cambridge: Royal Society of Chemistry, 2013, roč. 15, č. 20, s. 7740-7754. ISSN 1463-9076. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/C3CP44440F.
      DOI: 10.1039/C3CP44440F
      RIV/00216224:14740/13:00066070 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Vícha, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Patzschke, Michael (246 Finsko) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Cluster calculations; PBE0; dispersion correction; exact-exchange admixture; spin-orbit coupling; magnetic shielding; tautomerism
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 10. 4. 2014 09:10.
    2. BADRI, Zahra, Cina FOROUTANNEJAD a Parviz RASHIDI-RANJBAR. A theoretical survey on the D7d [84]fullerene, a fullerene with two heptagon rings. Computational and Theoretical Chemistry. 2013, roč. 1009, č. 1, s. 103-107. ISSN 2210-271X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.comptc.2013.01.005.
      http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2210271X13000273
      Název anglicky: A theoretical survey on the D7d [84]fullerene, a fullerene with two heptagon rings
      RIV/00216224:14310/13:00074684 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Nizozemské království.
      Badri, Zahra (364 Írán) -- Foroutannejad, Cina (364 Írán, garant, domácí) -- Rashidi-Ranjbar, Parviz (364 Írán)
      Klíčová slova anglicky: Fullerene; D7d point group; DFT; QTAIM; Magnetizability; Metallocenoid

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 27. 4. 2015 10:29.
    3. ŽÁKOVSKÁ, Alena, Helena NEJEZCHLEBOVÁ, Naďa BARTOŇKOVÁ, Tereza RAŠOVSKÁ, Hana KUČEROVÁ, Adam NOREK a Petra OVESNÁ. Activity of the tick Ixodes ricinus monitored in a suburban park in Brno, Czech Republic, in association with evaluation of selected repellents. Journal of Vector Ecology. Wiley, 2013, roč. 38, č. 2, s. 295-300. ISSN 1081-1710. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/j.1948-7134.2013.12043.x.
      Název česky: Activity of the tick Ixodes ricinus monitored in a suburban park in Brno, Czech Republic, in association with evaluation of selected repellents
      Název anglicky: Activity of the tick Ixodes ricinus monitored in a suburban park in Brno, Czech Republic, in association with evaluation of selected repellents
      RIV/00216224:14310/13:00071006 Článek v odborném periodiku. Imunologie. angličtina. Spojené státy.
      Žákovská, Alena (203 Česká republika, garant, domácí) -- Nejezchlebová, Helena (203 Česká republika, domácí) -- Bartoňková, Naďa (203 Česká republika, domácí) -- Rašovská, Tereza (203 Česká republika, domácí) -- Kučerová, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Norek, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Ovesná, Petra (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Lyme borreliosis Ixodes ricinus ticks Borrelia burgdorferi sensu lato DEET repellents.

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 29. 4. 2014 17:08.
    4. ROUCHAL, Michal, Alena MATELOVÁ, Fabiana Pires de CARVALHO, Robert BERNAT, Dragan GRBIĆ, Ivo KUŘITKA, Martin BABINSKÝ, Radek MAREK, Richard ČMELÍK a Robert VÍCHA. Adamantane-bearing benzylamines and benzylamides: novel building blocks for supramolecular systems with finely tuned binding properties towards beta-cyclodextrin. Supramolecular Chemistry. Oxon: Taylor & Francis, 2013, roč. 25, č. 6, s. 349-361. ISSN 1061-0278. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/10610278.2013.783916.
      DOI: 10.1080/10610278.2013.783916
      RIV/00216224:14740/13:00068114 Článek v odborném periodiku. Makromolekulární chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Rouchal, Michal (203 Česká republika) -- Matelová, Alena (203 Česká republika) -- Carvalho, Fabiana Pires de (724 Španělsko) -- Bernat, Robert (203 Česká republika) -- Grbić, Dragan (191 Chorvatsko) -- Kuřitka, Ivo (203 Česká republika) -- Babinský, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí) -- Čmelík, Richard (203 Česká republika) -- Vícha, Robert (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: adamantane; amines; cyclodextrins; binding properties; host–guest systems
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 9. 4. 2014 01:34.
    5. BADRI, Zahra, Shubhrodeep PATHAK, Heike FLIEGL, Parviz RASHIDI-RANJBAR, Radovan BAST, Radek MAREK, Cina FOROUTANNEJAD a Kenneth RUUD. All–Metal Aromaticity: Revisiting the Ring Current Model among Transition Metal Clusters. Journal of Chemical Theory and Computation. Washington: American Chemical Society, 2013, roč. 9, č. 11, s. 4789-4796. ISSN 1549-9618. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ct4007184.
      DOI: 10.1021/ct4007184
      RIV/00216224:14740/13:00066466 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Badri, Zahra (364 Írán, domácí) -- Pathak, Shubhrodeep (356 Indie) -- Fliegl, Heike (578 Norsko) -- Rashidi-Ranjbar, Parviz (364 Írán) -- Bast, Radovan (250 Francie) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí) -- Foroutannejad, Cina (364 Írán, domácí) -- Ruud, Kenneth (578 Norsko)
      Klíčová slova anglicky: Ring Current Model; Magnetizability; All-Metal Aromaticity; DFT; MCSCF
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 1. 10. 2014 11:33.
    6. DEBNATH, Mainak, Arpan DUTTA, Surajit BISWAS, Kalyan Kumar DAS, Hon Man LEE, Jan VÍCHA, Radek MAREK, Jaromír MAREK a Mahammad ALI. Catalytic Oxidation of Aromatic Hydrocarbons by Mono-oxido- alkoxidovanadium(V) Complexes of ONNO Donor Ethylenediamine- bis(phenolate) Ligands. Polyhedron. Oxford: Pergamon-Elsevier Science Ltd., 2013, roč. 63, Oct, s. 189-198. ISSN 0277-5387. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.poly.2013.07.013.
      DOI: 10.1016/j.poly.2013.07.013
      RIV/00216224:14740/13:00066264 Článek v odborném periodiku. Anorganická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Debnath, Mainak (356 Indie) -- Dutta, Arpan (356 Indie) -- Biswas, Surajit (356 Indie) -- Das, Kalyan Kumar (356 Indie) -- Lee, Hon Man (158 Tchaj-wan) -- Vícha, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Jaromír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Ali, Mahammad (356 Indie)
      Klíčová slova anglicky: Ethylenediamine-bis(phenolate); Oxidovanadium(V); Catalytic oxidation; Aromatic hydrocarbons; DFT calculation; Hydroperoxido intermediate
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 6. 4. 2014 05:32.
    7. OLEJNÍČKOVÁ, Kateřina, Eva CHALOUPKOVÁ a David ŠMAJS. Celogenomová sekvence bakterie Pragia fontium 26413. In Čo nového v mikrobiológii, Konferencia Mladých mikrobiológov, Jasná. 2013. ISBN 978-80-971422-0-9.
      Změnila: RNDr. Kateřina Snopková, Ph.D., učo 222811. Změněno: 22. 4. 2014 20:28.
    8. SKLENÁŘ, Vladimír a Radovan FIALA. Ceremonial inauguration of the "Josef Dadok National NMR Centre". 2013.
      URL URL
      Název česky: Slavnostní zahájení provozu Core Facility „Národní NMR centrum Josefa Dadoka“
      RIV/00216224:14740/13:00087231 Uspořádání konference. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR; nuclear magnetic resonance; Josef Dadok; structural biology
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 15. 4. 2016 09:28.
    9. DEGTJARIK, Oksana, Radka DOPITOVÁ, Sandra PUEHRINGER, Eliška NEJEDLÁ, Michal KUTÝ, Manfred WEISS, Jan HEJÁTKO, Lubomír JANDA a Ivana KUTÁ-SMATANOVÁ. Cloning, expression, purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of AHP2, a signal transmitter protein from Arabidopsis thaliana. Acta Crystalographica Section F. Hoboken: WILEY-BLACKWELL, 2013, roč. 69, č. 2, s. 158–161. ISSN 1744-3091. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1107/S174430911205186X.
      URL
      RIV/00216224:14740/13:00066056 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Degtjarik, Oksana (112 Bělorusko) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Puehringer, Sandra (276 Německo) -- Nejedlá, Eliška (203 Česká republika, domácí) -- Kutý, Michal (203 Česká republika) -- Weiss, Manfred (276 Německo) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Kutá-Smatanová, Ivana (703 Slovensko)
      Klíčová slova anglicky: multistep phosphorelay; AHP2; thermal shift assay; crystallization; vapor diffusion method; X-ray diffraction
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 18. 6. 2014 11:34.
    10. BUDINSKÁ, Eva, Jenny WILDING, Vlad POPOVICI, Edoardo MISSIAGLIA, Arnaud ROTH, Fred BOSMAN, Mauro DELORENZI, Walter BODMER a Sabine TEJPAR. Connecting gene expression subtypes of colorectal cancer (CRC) with cell lines and drug resistance. In ASCO Annual Meeting. 2013.
      Onkologie a hematologie. angličtina. Spojené státy.
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: doc. Ing. Vlad Popovici, PhD, učo 118944. Změněno: 10. 10. 2014 11:22.
    11. POPOVICI, Vlad, Eva BUDINSKÁ, Fred T BOSMAN, Sabine TEJPAR, Arnaud D ROTH a Mauro DELORENZI. Context-dependent interpretation of the prognostic value of BRAF and KRAS mutations in colorectal cancer. BMC Cancer. LONDON: BIOMED CENTRAL LTD, 2013, roč. 13, č. 439, s. 1-7. ISSN 1471-2407. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/1471-2407-13-439.
      Název anglicky: Context-dependent interpretation of the prognostic value of BRAF and KRAS mutations in colorectal cancer
      RIV/00216224:14110/13:00069862 Článek v odborném periodiku. Onkologie a hematologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Popovici, Vlad (642 Rumunsko, garant, domácí) -- Budinská, Eva (703 Slovensko, domácí) -- Bosman, Fred T (756 Švýcarsko) -- Tejpar, Sabine (56 Belgie) -- Roth, Arnaud D (756 Švýcarsko) -- Delorenzi, Mauro (756 Švýcarsko)
      Klíčová slova anglicky: BRAF V600E mutation; Colorectal cancer; KRAS mutations; Stratified analysis; Survival analysis
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 15. 4. 2014 16:12.
    12. NOVÁČEK, Jiří, Lubomír JANDA, Radka DOPITOVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Efficient protocol for backbone and side-chain assignments of large, intrinsically disordered proteins: transient secondary structure analysis of 49.2 kDa microtubule associated protein 2c. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2013, roč. 56, č. 4, s. 291-301. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-013-9761-7.
      URL
      RIV/00216224:14740/13:00066377 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Nizozemské království.
      Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, domácí) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nuclear magnetic resonance; Intrinsically disordered proteins; Microtubule-associated protein; Transient secondary structure; C-13 detection
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 24. 10. 2013 09:16.
    13. KREJČÍ, Pavel, Michaela KUNOVÁ, Iva KUBÍKOVÁ, Lukáš TRANTÍREK, Alois KOZUBÍK a Petr DVOŘÁK. Expression of FGF19 in Human Embryonic Stem Cells. STEM CELLS. HOBOKEN: WILEY-BLACKWELL, 2013, roč. 31, č. 11, s. 2582-2584. ISSN 1066-5099. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/stem.1493.
      Název anglicky: Expression of FGF19 in Human Embryonic Stem Cells
      RIV/00216224:14110/13:00066459 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Krejčí, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Kunová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Kubíková, Iva (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Kozubík, Alois (203 Česká republika, domácí) -- Dvořák, Petr (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Cell signaling; Embryonic stem cells; FGF19; Fibroblast growth factor; Expression
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Soňa Böhmová, učo 232884. Změněno: 17. 2. 2014 09:29.
    14. HAENSEL, Robert, Frank LOEHR, Lukáš TRANTÍREK a Volker DOETSCH. High-Resolution Insight into G-Overhang Architecture. Journal of the American Chemical Society. Washington: American Chemical Society, 2013, roč. 135, č. 7, s. 2816-2824. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ja312403b.
      RIV/00216224:14740/13:00072647 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Haensel, Robert (276 Německo) -- Loehr, Frank (276 Německo) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Doetsch, Volker (276 Německo)
      Klíčová slova anglicky: HUMAN TELOMERIC DNA; INTRAMOLECULAR G-QUADRUPLEX; K+ SOLUTION; NMR-SPECTROSCOPY; SMALL-MOLECULE; HUMAN CANCER; PULSED EPR; STABILITY; SEQUENCE; CONFORMATIONS
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 20. 3. 2014 08:25.
    15. BENEŠÍK, Martin, Radka DOPITOVÁ, Lubomír JANDA, Jiří DOŠKAŘ, Marek MOŠA a Roman PANTŮČEK. CHAP domain of tail-associated protein from phage 812 and its lytic activity against Staphylococcus aureus. In Molecular Genetics of Bacteria and Phages. 2013.
      URL
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842. Změněno: 1. 8. 2015 18:43.
    16. OLEJNÍČKOVÁ, Kateřina, Eva CHALOUPKOVÁ, Juraj BOSÁK a David ŠMAJS. Identification of genes encoding phage tail-like bacteriocins in Pragia fontium. In 5th Congress of European Microbiologists (FEMS), book of abstracts. 2013.
      Změnila: RNDr. Kateřina Snopková, Ph.D., učo 222811. Změněno: 22. 4. 2014 20:26.
    17. EMMER, Jiří, Andrea VAVRINSKÁ, Vladimír SYCHROVSKÝ, Ladislav BENDA, Zdeněk KŘÍŽ, Jaroslav KOČA, Rolf BOELENS, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš TRANTÍREK. Influence of the O-phosphorylation of serine, threonine and tyrosine in proteins on the amidic N-15 chemical shielding anisotropy tensors. Journal of biomolecular NMR. Dordrecht: Springer, 2013, roč. 55, č. 1, s. 59-70. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-012-9686-6.
      URL
      RIV/00216224:14740/13:00068469 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Emmer, Jiří (203 Česká republika) -- Vavrinská, Andrea (528 Nizozemské království) -- Sychrovský, Vladimír (203 Česká republika) -- Benda, Ladislav (203 Česká republika) -- Kříž, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Boelens, Rolf (528 Nizozemské království) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: CSA; Phosphorylation; Amidic nitrogen; Serine; Threonine; Tyrosine; Protein; NMR
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 6. 4. 2014 06:04.
    18. VALENCIA, Rocio G, Gernot WALKO, Lubomír JANDA, Jiří NOVÁČEK, Eva MIHAILOVSKA, Siegfried REIPERT, Kerstin ANDRA-MAROBELA a Gerhard WICHE. Intermediate filament-associated cytolinker plectin 1c destabilizes microtubules in keratinocytes. Molecular Biology of the Cell. BETHESDA: AMER SOC CELL BIOLOGY, 2013, roč. 24, č. 6, s. 768-784. ISSN 1059-1524. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1091/mbc.E12-06-0488.
      URL
      RIV/00216224:14740/13:00068909 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Valencia, Rocio G (40 Rakousko) -- Walko, Gernot (40 Rakousko) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Mihailovska, Eva (40 Rakousko) -- Reipert, Siegfried (40 Rakousko) -- Andra-Marobela, Kerstin (40 Rakousko) -- Wiche, Gerhard (40 Rakousko)
      Klíčová slova anglicky: SUBSTRATE ADHESION DYNAMICS; EPIDERMOLYSIS-BULLOSA; MUSCULAR-DYSTROPHY; TYROSINE KINASES; VIMENTIN NETWORK; CULTURED-CELLS; PROTEINS MAP-1; GLUCOSE-UPTAKE; ALPHA-TUBULIN; TAU
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 26. 7. 2013 08:09.
    19. BOUZKOVÁ, Kateřina, Martin BABINSKÝ, Lucie NOVOSADOVÁ a Radek MAREK. Intermolecular Interactions in Crystalline Theobromine as Reflected in Electron Deformation Density and 13C NMR Chemical Shift Tensors. Journal of Chemical Theory and Computation. American Chemical Society, 2013, roč. 9, č. 6, s. 2629-2638. ISSN 1549-9618. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ct400209b.
      DOI: 10.1021/ct400209b
      RIV/00216224:14740/13:00066168 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Bouzková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Babinský, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Novosadová, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: crystal packing; hydrogen bonding; aromatic stacking; solid-state NMR spectroscopy; density functional theory
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 5. 4. 2014 23:30.
    20. BABINSKÝ, Martin, Kateřina BOUZKOVÁ, Matej PIPÍŠKA, Lucie NOVOSADOVÁ a Radek MAREK. Interpretation of Crystal Effects on NMR Chemical Shift Tensors: Electron and Shielding Deformation Densities. The Journal of Physical Chemistry A. WASHINGTON, DC: American Chemical Society, 2013, roč. 117, č. 2, s. 497-503. ISSN 1089-5639. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jp310967b.
      Full Text
      RIV/00216224:14740/13:00065973 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Babinský, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Bouzková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Pipíška, Matej (703 Slovensko, domácí) -- Novosadová, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nuclear magnetic resonance; Chemical shift tensor; Electron deformation density; Shielding deformation density; Hydrogen bonding
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 17. 12. 2019 10:13.
    21. KRYUKOV, Fedor, Pavel NĚMEC, Elena DEMENTYEVA, Lenka KUBICZKOVÁ, Ivana IHNATOVÁ, Eva BUDINSKÁ, Jiří JARKOVSKÝ, Sabina ŠEVČÍKOVÁ, Petr KUGLÍK a Roman HÁJEK. Molecular heterogeneity and centrosome-associated genes in multiple myeloma. Leukemia & Lymphoma. London: Taylor & Francis, 2013, roč. 54, č. 9, s. 1982-1988. ISSN 1042-8194. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3109/10428194.2013.764416.
      Název anglicky: Molecular heterogeneity and centrosome-associated genes in multiple myeloma
      RIV/00216224:14110/13:00065610 Článek v odborném periodiku. Onkologie a hematologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Kryukov, Fedor (643 Rusko, domácí) -- Němec, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Dementyeva, Elena (643 Rusko, domácí) -- Kubiczková, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Ihnatová, Ivana (703 Slovensko, domácí) -- Budinská, Eva (703 Slovensko) -- Jarkovský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Ševčíková, Sabina (203 Česká republika, domácí) -- Kuglík, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Hájek, Roman (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Multiple myeloma; centrosome abnormalities; gene expression profile
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 11. 10. 2013 13:45.
    22. ŽÁKOVSKÁ, Alena, Karel VOSTAL, Adam NOREK, Eva BÁRTOVÁ, František TREML, Radek PÍŠE a Hana KUČEROVÁ. Monitoring prevalence patogenů Leptospira grippotyphosa a Leptospira pomona, Borrelia burgdorferi sensu lato (bbsl), Coxiella burnetii a Francisella tularensis se zaměřením Na volně žijící hlodavce na vybraných lokalitách ČR (Poodří, Moravský kras, Mohelno) v letech 2010-2012. In Český kongres o infekčních nemocech. 2013. ISBN 978-80-260-4768-1.
      Název anglicky: Monitoring prevalence of pathogens Leptospira grippotyphosa and pomona, Borrelia burgdorferi sensu lato (Bbsl), Coxiella burnetii and Francisella tularensis with a focus on wild rodents in selected localities of the Czech Republic (Pood, Moravský kras, M
      RIV/00216224:14310/13:00070007 Prezentace na konferencích. Imunologie. čeština. Česká republika.
      Žákovská, Alena (203 Česká republika, garant, domácí) -- Vostal, Karel (203 Česká republika) -- Norek, Adam (203 Česká republika) -- Bártová, Eva (203 Česká republika) -- Treml, František (203 Česká republika) -- Píše, Radek (203 Česká republika) -- Kučerová, Hana (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Prevalence Leptospira grippotyphosa pomona Borrelia aburgdorferi sensu lato Bbsl Coxiella burnetii Francisella tularensis rodents
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Hana Lya Kučerová, učo 211087. Změněno: 4. 11. 2013 08:18.
    23. ŽÁKOVSKÁ, Alena, Karel VOSTAL, Adam NOREK, Eva BÁRTOVÁ, František TREML, Radek PÍŠE a Hana KUČEROVÁ. Monitoring prevalence patogenů Leptospira grippotyphosa a Leptospira pomona, Borrelia burgdorferi sensu lato (Bbsl), Coxiella burnetii a Francisella tularensis se zaměřením na volně žijící hlodavce na vybraných lokalitách ČR (Poodří, Moravský kras, Mohelno) v letech 2010-2012. In Společnost pro lékařskou mikrobiologii ČLS JEP. Kongres klinické mikrobiologie, infekčních nemocí a epidemiologie. Olomouc: Procházka Bořek, 2013, s. 175-176. ISBN 978-80-87735-08-4.
      Název anglicky: Monitoring prevalence of pathogens Leptospira grippotyphosa and pomona, Borrelia burgdorferi sensu lato (Bbsl), Coxiella burnetii and Francisella tularensis with a focus on wild rodents in selected localities of the Czech Republic (Poodří, Moravský kras,
      RIV/00216224:14310/13:00070006 Stať ve sborníku. Imunologie. čeština. Česká republika.
      Žákovská, Alena (203 Česká republika, garant, domácí) -- Vostal, Karel (203 Česká republika) -- Norek, Adam (203 Česká republika) -- Bártová, Eva (203 Česká republika) -- Treml, František (203 Česká republika) -- Píše, Radek (203 Česká republika) -- Kučerová, Hana (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Prevalence Leptospira grippotyphosa pomona Borrelia burgdorferi sensu lato Bbsl Coxiella burnetii Francisella tularensis rodents

      Změnila: Ing. Zdeňka Rašková, učo 140529. Změněno: 29. 4. 2014 10:19.
    24. NYARKO, Afua, Yujuan SONG, Jiří NOVÁČEK, Lukáš ŽÍDEK a Elisar BARBAR. Multiple Recognition Motifs in Nucleoporin Nup159 Provide a Stable and Rigid Nup159-Dyn2 Assembly. Journal of Biological Chemistry. Bethesda, USA: Amer. Soc. Biochem. Mol. Biol., 2013, roč. 288, č. 4, s. 2614-2622. ISSN 0021-9258. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1074/jbc.M112.432831.
      URL
      RIV/00216224:14740/13:00066050 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Spojené státy.
      Nyarko, Afua (840 Spojené státy) -- Song, Yujuan (840 Spojené státy) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Barbar, Elisar (840 Spojené státy)
      Klíčová slova anglicky: Intrinsic disorder NMR ITC polybivalency enthalpy/entropy balance
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 26. 9. 2013 11:05.
    25. GARDNER, Christina L, Jo CHOI-NURVITADHI, Chengqun SUN, Avraham BAYER, Jozef HRITZ, Kate D RYMAN a William B KLIMSTRA. Natural Variation in the Heparan Sulfate Binding Domain of the Eastern Equine Encephalitis Virus E2 Glycoprotein Alters Interactions with Cell Surfaces and Virulence in Mice. JOURNAL OF VIROLOGY. WASHINGTON: AMER SOC MICROBIOLOGY, 2013, roč. 87, č. 15, s. 8582-8590. ISSN 0022-538X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1128/JVI.00937-13.
      Mikrobiologie, virologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Klíčová slova anglicky: ross-river-virus; sindbis virus; flavobacterium-heparinum
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 25. 2. 2014 13:09.
    26. ŠTĚPÁN, Jakub, Petr KULHÁNEK, Milan LENČO, Zora STŘELCOVÁ, Aleš KŘENEK a Jaroslav KOČA. Nemesis - a molecular modeling package. Online. In Uli Fechner. Journal of Cheminformatics 2013, 5(Suppl 1). Goslar (GER): Chemistry Central, 2013, s. 13-14. ISSN 1758-2946. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/1758-2946-5-S1-P12.
      Přímý odkaz na článek.
      RIV/00216224:14740/13:00087699 Stať ve sborníku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Štěpán, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, garant, domácí) -- Lenčo, Milan (703 Slovensko, domácí) -- Střelcová, Zora (203 Česká republika, domácí) -- Křenek, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nemesis molecular modelling 3D structure
      Druh sborníku: postkonferenční sborník

      Změnila: Mgr. Eva Špillingová, učo 110713. Změněno: 3. 5. 2016 16:24.
    27. HABA, Noam Y, Renana GROSS, Jiří NOVÁČEK, Hadassa SHAKED, Lukáš ŽÍDEK, Mira BARDA-SAAD a Jordan H CHILL. NMR Determines Transient Structure and Dynamics in the Disordered C-Terminal Domain of WASp Interacting Protein. Biophysical Journal. CAMBRIDGE: CELL PRESS, 2013, roč. 105, č. 2, s. 481-493. ISSN 0006-3495. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2013.05.046.
      URL
      RIV/00216224:14740/13:00066376 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Haba, Noam Y (376 Izrael) -- Gross, Renana (376 Izrael) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Shaked, Hadassa (376 Izrael) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Barda-Saad, Mira (376 Izrael) -- Chill, Jordan H (376 Izrael)
      Klíčová slova anglicky: WISKOTT-ALDRICH-SYNDROME; NUCLEAR-MAGNETIC-RESONANCE; SEQUENCE-SPECIFIC ASSIGNMENT; PROLINE-RICH REGIONS; 8 M UREA; CHEMICAL-SHIFTS; ALPHA-SYNUCLEIN; N-WASP; ACTIN POLYMERIZATION; POLYPROLINE-II
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 24. 10. 2013 09:18.
    28. BYEON, In-Ja L, Jinwoo AHN, Mithun MITRA, Chang-Hyeock BYEON, Kamil HERCIK, Jozef HRITZ, Lisa M CHARLTON, Judith G LEVIN a Angela M GRONENBORN. NMR structure of human restriction factor APOBEC3A reveals substrate binding and enzyme specificity. NATURE COMMUNICATIONS. LONDON: NATURE PUBLISHING GROUP, 2013, roč. 4, May, s. "nestránkováno", 11 s. ISSN 2041-1723. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/ncomms2883.
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Klíčová slova anglicky: single-stranded DNA; crystal structure; cytidine deaminase
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 25. 2. 2014 13:03.
    29. JANDA, Lubomír, Jan HEJÁTKO, Radka DOPITOVÁ, Martin FALDYNA, Eva KOTLÁŘOVÁ, Hana KUDLÁČKOVÁ, Matej ZÁBRADY, Zuzana GELOVÁ, Martina VÁLKOVÁ a Pavel REICHMAN. Nová možnost pro detekci AHP2 proteinu z A. thaliana. 2013.
      Název anglicky: New approach for detection of A. thaliana AHP2 protein
      RIV/00216224:14740/13:00066990 Poloprovoz, ověřená technologie, odrůda, plemeno. Biochemie. čeština. Česká republika.
      Janda, Lubomír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Faldyna, Martin (203 Česká republika) -- Kotlářová, Eva (203 Česká republika) -- Kudláčková, Hana (203 Česká republika) -- Zábrady, Matej (703 Slovensko, domácí) -- Gelová, Zuzana (203 Česká republika, domácí) -- Válková, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Reichman, Pavel (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: hybridom; monospecific antibody; mass spectrometry; analytical chemistry
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 20. 6. 2014 11:05.
    30. JANDA, Lubomír, Jan HEJÁTKO, Radka DOPITOVÁ, Martin FALDYNA, Eva KOTLÁŘOVÁ, Hana KUDLÁČKOVÁ, Matej ZÁBRADY, Zuzana GELOVÁ, Martina VÁLKOVÁ a Pavel REICHMAN. Nová možnost pro detekci AHP3 proteinu z A. thaliana. 2013.
      Název anglicky: New approach for detection of A. thaliana AHP3 protein
      RIV/00216224:14740/13:00066991 Poloprovoz, ověřená technologie, odrůda, plemeno. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Janda, Lubomír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Faldyna, Martin (203 Česká republika) -- Kotlářová, Eva (203 Česká republika) -- Kudláčková, Hana (203 Česká republika) -- Zábrady, Matej (703 Slovensko, domácí) -- Gelová, Zuzana (203 Česká republika, domácí) -- Válková, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Reichman, Pavel (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: hybridom; monospecific antibody; mass spectrometry; analytical chemistry
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 20. 6. 2014 10:53.
    31. JANDA, Lubomír, Jan HEJÁTKO, Radka DOPITOVÁ, Martin FALDYNA, Eva KOTLÁŘOVÁ, Hana KUDLÁČKOVÁ, Matej ZÁBRADY, Zuzana GELOVÁ, Martina VÁLKOVÁ a Pavel REICHMAN. Nová možnost pro detekci AHP4 proteinu z A. thaliana. 2013.
      Název anglicky: New approach for detection of A. thaliana AHP4 protein
      RIV/00216224:14740/13:00066992 Poloprovoz, ověřená technologie, odrůda, plemeno. Biochemie. čeština. Česká republika.
      Janda, Lubomír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Faldyna, Martin (203 Česká republika) -- Kotlářová, Eva (203 Česká republika) -- Kudláčková, Hana (203 Česká republika) -- Zábrady, Matej (703 Slovensko, domácí) -- Gelová, Zuzana (203 Česká republika, domácí) -- Válková, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Reichman, Pavel (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: hybridom; monospecific antibody; mass spectrometry; analytical chemistry
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 20. 6. 2014 11:08.
    32. JANDA, Lubomír, Jan HEJÁTKO, Radka DOPITOVÁ, Martin FALDYNA, Eva KOTLÁŘOVÁ, Hana KUDLÁČKOVÁ, Matej ZÁBRADY, Zuzana GELOVÁ, Martina VÁLKOVÁ a Pavel REICHMAN. Nová možnost pro detekci AHP5 proteinu z A. thaliana. 2013.
      Název anglicky: New approach for detection of A. thaliana AHP5 protein
      RIV/00216224:14740/13:00066993 Poloprovoz, ověřená technologie, odrůda, plemeno. Biochemie. čeština. Česká republika.
      Janda, Lubomír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Faldyna, Martin (203 Česká republika) -- Kotlářová, Eva (203 Česká republika) -- Kudláčková, Hana (203 Česká republika) -- Zábrady, Matej (703 Slovensko, domácí) -- Gelová, Zuzana (203 Česká republika, domácí) -- Válková, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Reichman, Pavel (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: hybridom; monospecific antibody; mass spectrometry; analytical chemistry
      Recenzováno: ano

      Změnila: Martina Prášilová, učo 342282. Změněno: 20. 6. 2014 11:13.
    33. TOUŠEK, Jaromír, Michal STRAKA, Vladimír SKLENÁŘ a Radek MAREK. Origin of the Conformational Modulation of the 13C NMR Chemical Shift of Methoxy Groups in Aromatic Natural Compounds. The Journal of Physical Chemistry A. American Chemical Society, 2013, roč. 117, č. 3, s. 661-669. ISSN 1089-5639. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jp310470f.
      DOI: 10.1021/jp310470f
      RIV/00216224:14740/13:00067650 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Toušek, Jaromír (203 Česká republika, domácí) -- Straka, Michal (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nuclear magnetic schielding; DFT calculations; molecular orbitals; excitation analysis; orbital rotation model
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 12. 1. 2015 08:30.
    34. VÍCHA, Jan a Radek MAREK. Prediction of relativistic NMR chemical shifts in various heavy transition-metal complexes. In Winter School in Theoretical chemistry 2013, Helsinki, Finland. 2013.
      RIV/00216224:14310/13:00066744 Prezentace na konferencích. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Vícha, Jan (203 Česká republika, garant, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR; chemical shift; PBE0-40; calibration of the functionals;
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 5. 4. 2014 12:48.
    35. NOREK, Adam, Lubomír JANDA a Alena ŽÁKOVSKÁ. Příprava mAb proti rekombinantí formě OspC Borrelia burgdorferi sensu lato. In Český kongres o infekčních nemocech 2013. 2013. ISBN 978-80-260-4768-1.
      Název česky: Příprava mAb proti rekombinantí formě OspC Borrelia burgdorferi sensu lato
      Název anglicky: Preparation of mAb against recombinant form of OspC of Borrelia burgdorferi sensu lato
      RIV/00216224:14310/13:00072616 Konferenční abstrakt. Imunologie. čeština. Česká republika.
      Norek, Adam (203 Česká republika, garant, domácí) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, domácí) -- Žákovská, Alena (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: OspC Borrelia burgdorferi monoclonal Ab
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: doc. RNDr. Alena Žákovská, Ph.D., učo 417. Změněno: 11. 3. 2014 17:53.
    36. VÍCHA, Jan. Relativistic NMR shielding effects in heavy element complexes. In ThUL School in Actinide Chemistry, Karlsruhe, Germany. 2013.
      Název anglicky: Relativistic NMR shielding effects in heavy element complexes
      RIV/00216224:14310/13:00066069 Prezentace na konferencích. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Vícha, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: complexes relativistic NMR shielding
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Jan Vícha, Ph.D., učo 151272. Změněno: 28. 3. 2013 13:31.
    37. VYBÍHAL, Václav, Tomáš SVOBODA, V PROCHÁZKA, Petr BENDA, George HANOUN, K SVOBODA, Pavel FADRUS, Eva BUDINSKÁ a Šárka BOHATÁ. Srovnání laparotomie a laparoskopie při implantaci peritoneální části shuntu v léčbě hydrocefalu. In Výroční kongres České neurochirurgické společnosti - Kniha abstrakt. 2013.

      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Olga Pazderková, učo 46958. Změněno: 5. 2. 2014 09:49.
    38. PAPOUŠKOVÁ, Veronika, Pavel KADEŘÁVEK, Olga OTRUSINOVÁ, Alžběta RABATINOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Jiří NOVÁČEK, Libor KRÁSNÝ, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš ŽÍDEK. Structural Study of the Partially Disordered Full-Length delta Subunit of RNA Polymerase from Bacillus subtilis. ChemBioChem. WEINHEIM: WILEY-VCH Verlag, 2013, roč. 14, č. 14, s. 1772-1779. ISSN 1439-4227. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cbic.201300226.
      URL
      RIV/00216224:14740/13:00066324 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Německo.
      Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Otrusinová, Olga (203 Česká republika, domácí) -- Rabatinová, Alžběta (203 Česká republika) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR spectroscopy; RNA polymerase; partially disordered proteins; protein structures; delta subunit
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 4. 4. 2014 08:42.
    39. KADAM, Shivaji Sambhaji, Lukáš MAIER, Tomáš ŠOLOMEK, Marek NEČAS, Karel ŠMEJKAL, Jiří DOSTÁL, Vladimír SKLENÁŘ a Radek MAREK. Structure and NMR properties of 6-substituted-5,6-dihydrobenzo[c]phenanthridine alkaloids. Journal of Physical Organic Chemistry. Wiley, 2013, roč. 26, č. 10, s. 814-821. ISSN 0894-3230. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/poc.3175.
      DOI: 10.1002/poc.3175
      RIV/00216224:14310/13:00068644 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Kadam, Shivaji Sambhaji (356 Indie, domácí) -- Maier, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Šolomek, Tomáš (703 Slovensko, domácí) -- Nečas, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Šmejkal, Karel (203 Česká republika) -- Dostál, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: 1H and 13C NMR; Nucleophilic addition; X-ray diffraction; DFT calculations; Barrier to rotation; Magnetic shielding; Conformational dependence
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: doc. Mgr. Marek Nečas, Ph.D., učo 18809. Změněno: 13. 3. 2018 10:11.
    40. HRDINOVÁ, Vendula, Blanka PEKÁROVÁ, Tomáš KLUMPLER, Lubomír JANDA a Jan HEJÁTKO. Study of the Receiver and Receiver-like Domain Relationship in Cytokinin Receptor of Arabidopsis thaliana. In ITAT 2013: Information Technologies—Applications and Theory. 2013. ISBN 978-1-4909-5208-6.
      Název anglicky: Study of the Receiver and Receiver-like Domain Relationship in Cytokinin Receptor of Arabidopsis thaliana
      angličtina. Slovensko.
      Klíčová slova anglicky: cytokinin domain protein bioinformatics
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Ing. Vendula Hrdinová, učo 328869. Změněno: 10. 3. 2014 10:35.
    41. KADAM, Shivaji Sambhaji, Lukáš MAIER, Ioannis KOSTAKIS, Nicole POULI, Jaromír TOUŠEK, Marek NEČAS, Panagiotis MARAKOS a Radek MAREK. Synthesis and Tautomerism of Substituted Pyrazolo[4,3-c]pyrazoles. European Journal of Organic Chemistry. Weinheim: WILEY-VCH, 2013, roč. 2013, č. 30, s. 6811-6822. ISSN 1434-193X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/ejoc.201300606.
      DOI: 10.1002/ejoc.201300606
      RIV/00216224:14740/13:00066252 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. angličtina. Německo.
      Kadam, Shivaji Sambhaji (356 Indie, domácí) -- Maier, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Kostakis, Ioannis (300 Řecko) -- Pouli, Nicole (300 Řecko) -- Toušek, Jaromír (203 Česká republika, domácí) -- Nečas, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Marakos, Panagiotis (300 Řecko) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR chemical shift; synthesis of pyrazolo[4.3-c]pyrazoles; stability of tautomers; regioisomers; low-temperature NMR; X-ray diffraction; DFT calculations
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: doc. Mgr. Marek Nečas, Ph.D., učo 18809. Změněno: 13. 3. 2018 10:11.
    42. RABATINOVÁ, Alžbeta, Hana ŠANDEROVÁ, Jitka JIRÁT MATĚJČKOVÁ, Jana KORELUSOVÁ, Luděk SOJKA, Ivan BARVÍK, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Vladimír SKLENÁŘ, Lukáš ŽÍDEK a Libor KRÁSNÝ. The Delta Subunit of RNA Polymerase Is Required for Rapid Changes in Gene Expression and Competitive Fitness of the Cell. Journal of Bacteriology. Washington: American Society for Microbiology, 2013, roč. 195, č. 11, s. 2603-2611. ISSN 0021-9193. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1128/JB.00188-13.
      URL
      RIV/00216224:14740/13:00066221 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Rabatinová, Alžbeta (203 Česká republika) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Jirát Matějčková, Jitka (203 Česká republika) -- Korelusová, Jana (203 Česká republika) -- Sojka, Luděk (203 Česká republika) -- Barvík, Ivan (203 Česká republika) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Krásný, Libor (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: RNA polymerase; delta subunit; regulation; nucleoside triphosphate; gene expression; cell survival
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 8. 4. 2014 14:11.
    43. VINOLO, Emilie, Elisabetta MARANGONI, Violeta SERRA, Frederic AMANT, Andrea BERTOTTI, Andrew V BIANKIN, Anne-Lise BØRRESEN-DALE, Alejandra BRUNA, Eva BUDINSKÁ, Annette BYRNE, Carlos CALDAS, David CHANG, Robert CLARKE, Els HERMANS, Manuel HIDALGO, Steven de JONG, Jos Jonkers Pedro LÓPEZ, Gunhild Mari MÆLANDSMO, Vlad POPOVICI, Sergio ROMAN-ROMAN, Joan SEOANE, Livio TRUSOLINO a Alberto VILLANUEVA. The EurOPDX consortium: Sharing patient tumor-derived xenografts for collaborative multicentric preclinical trials. In AACR-NCI-EORTC International Conference: Molecular Targets and Cancer Therapeutics. 2013. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1158/1535-7163.TARG-13-A8.
      URL

      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: doc. Ing. Vlad Popovici, PhD, učo 118944. Změněno: 14. 5. 2014 13:11.
    44. NETUŠIL, Jakub, Alena ŽÁKOVSKÁ, Karel VOSTAL, Adam NOREK a Michal STANKO. The occurrence of Borrelia burgdorferi sensu lato in certain ectoparasites (Mesostigmata, Siphonaptera) of Apodemus flavicollis and Myodes glareolus in chosen localities in the Czech Republic. Acta Parasitologica. Witold Stefański Institute of Parasitology, 2013, roč. 58, č. 3, s. 337-341. ISSN 1230-2821. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.2478/s11686-013-0147-5.
      Název anglicky: The occurrence of Borrelia burgdorferi sensu lato in certain ectoparasites (Mesostigmata, Siphonaptera) of Apodemus flavicollis and Myodes glareolus in chosen localities in the Czech Republic
      RIV/00216224:14310/13:00071004 Článek v odborném periodiku. Zoologie. angličtina. Polsko.
      Netušil, Jakub (203 Česká republika, garant, domácí) -- Žákovská, Alena (203 Česká republika, domácí) -- Vostal, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Norek, Adam (203 Česká republika, domácí) -- Stanko, Michal (703 Slovensko)
      Klíčová slova anglicky: Borrelia burgdorferi Acarina Siphonaptera PCR rodents
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Zdeňka Rašková, učo 140529. Změněno: 29. 4. 2014 15:20.
    45. PŘECECHTĚLOVÁ, Jana, Markéta MUNZAROVÁ, Juha VAARA, Jan NOVOTNÝ, Martin DRAČÍNSKÝ a Vladimír SKLENÁŘ. Toward Reproducing Sequence Trends in Phosphorus Chemical Shifts for Nucleic Acids by MD/DFT Calculations. Journal of Chemical Theory and Computation. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2013, roč. 9, č. 3, s. 1641-1656. ISSN 1549-9618. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ct300488y.
      URL
      RIV/00216224:14740/13:00067940 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Přecechtělová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Munzarová, Markéta (203 Česká republika, garant, domácí) -- Vaara, Juha (246 Finsko) -- Novotný, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Dračínský, Martin (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: phosphorus chemical shift nucleic acids MD DFT

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 8. 4. 2014 13:26.
    46. DEMO, Gabriel, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Jan KOMÁREK, Pavel KADEŘÁVEK, Olga OTRUSINOVÁ, Pavel SRB, Alzbeta RABATINOVA, Libor KRASNY, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ a Michaela WIMMEROVÁ. X ray vs. NMR structure of the N terminal domain of delta subunit of RNA polymerase. In Fifth Joint BER II and BESSY II User Meeting 2013. 2013.
      Název anglicky: X ray vs. NMR structure of the N terminal domain of delta subunit of RNA polymerase
      RIV/00216224:14740/13:00070649 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Německo.
      Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Komárek, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Otrusinová, Olga (203 Česká republika, domácí) -- Srb, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Rabatinova, Alzbeta (703 Slovensko) -- Krasny, Libor (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: structure NMR crystallographie delta subunit RNA polymerase
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Gabriel Demo, Ph.D., učo 150765. Změněno: 20. 12. 2013 17:06.
    47. STANDARA, Stanislav, Petr KULHÁNEK, Radek MAREK a Michal STRAKA. 129Xe NMR chemical shift in Xe@C60 calculated at experimental conditions: Essential role of the relativity, dynamics, and explicit solvent. Journal of Computational Chemistry. New York: John Wiley & Sons, 2013, roč. 34, č. 22, s. 1890-1898. ISSN 0192-8651. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/jcc.23334.
      DOI: 10.1002/jcc.23334 Inside Cover
      RIV/00216224:14740/13:00068377 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Standara, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí) -- Straka, Michal (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: 129Xe NMR; Xe@C60; dynamical averaging; explicit solvent ; relativistic effects
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 25. 4. 2014 16:19.

    2012

    1. KADEŘÁVEK, Pavel, Vojtěch ZAPLETAL, Radovan FIALA, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš ŽÍDEK. Accurate Reduced Spectral Density Mapping for Analysis of 13C Relaxation Rates. In 53rd Experimental Nuclear Magnetic Resonance Conference. 2012.
      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 8. 8. 2024 09:46.
    2. NOVOTNÝ, Jan, Petr KULHÁNEK a Radek MAREK. Biocompatible Xanthine-Quadruplex Scaffold for Ion-Transporting DNA Channels. The Journal of Physical Chemistry Letters. Washington: American Chemical Society, 2012, roč. 3, č. 13, s. 1788-1792. ISSN 1948-7185. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jz300559w.
      DOI: 10.1021/jz300559w
      RIV/00216224:14740/12:00060331 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Novotný, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: molecular dynamics; guanine; adaptive biasing force; ion transport; free-energy
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 14. 11. 2017 08:32.
    3. PAVLÍKOVÁ, Nela, Lucie BLÁHOVÁ, Petr KLÁN, R. B. BATHULA, Vladimír SKLENÁŘ, J. GIESY a Luděk BLÁHA. Enantioselective effects of alpha-hexachlorocyclohexane (HCH) isomers on androgen receptor activity in vitro. Chemosphere. OXFORD, ENGLAND: PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD,, 2012, roč. 86, č. 1, s. 65-69. ISSN 0045-6535. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.chemosphere.2011.08.052.
      RIV/00216224:14310/12:00059408 Článek v odborném periodiku. Vliv životního prostředí na zdraví. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Pavlíková, Nela (203 Česká republika, domácí) -- Bláhová, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Klán, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Bathula, R. B. (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Giesy, J. (124 Kanada) -- Bláha, Luděk (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Anti-androgenicity; Optical isomers; Pesticide; Hexachlorocyclohexane

      Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 9. 4. 2013 21:19.
    4. FILIPI, Tomáš, Pavel MAZURA, Lubomír JANDA, Nagavalli Subbanna KIRAN a Břetislav BRZOBOHATÝ. Engineering the cytokinin-glucoside specificity of the maize beta-D-glucosidase Zm-p60.1 using site-directed random mutagenesis. Phytochemistry. Oxford, UK: Elsevier Science, 2012, roč. 74, s. 40-48. ISSN 0031-9422. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.phytochem.2011.10.008.
      Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Klíčová slova anglicky: (alpha/beta)(8) Barrel; beta-Glucosidase; cis-Zeatin-O-beta-D-glucopyranoside; Cytokinin metabolism; Glycosidase; Protein engineering; Site-directed random mutagenesis; Substrate specificity; trans-Zeatin-O-beta-D-glucopyranoside; trans-Zeatin-9-beta-D-glucopyranoside
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 9. 4. 2013 11:42.
    5. LANTTO, Perttu, Stanislav STANDARA, Sebastian RIEDEL, Juha VAARA a Michal STRAKA. Exploring new 129Xe chemical shift ranges in HXeY compounds: hydrogen more relativistic than xenon. Physical Chemistry Chemical Physics. Cambridge: Royal Society of Chemistry, 2012, roč. 14, č. 31, s. 10944-10952. ISSN 1463-9076. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/C2CP41240C.
      URL
      RIV/00216224:14740/12:00074606 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Lantto, Perttu (246 Finsko) -- Standara, Stanislav (203 Česká republika, garant, domácí) -- Riedel, Sebastian (276 Německo) -- Vaara, Juha (246 Finsko) -- Straka, Michal (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: COUPLED-CLUSTER CALCULATIONS; DENSITY-FUNCTIONAL CALCULATIONS; RESONANCE SHIELDING TENSORS; NOBLE-GAS ATOMS; RARE-GAS; AB-INITIO; SPECTROSCOPIC PARAMETERS; NUCLEAR SHIELDINGS; MATRIX-ISOLATION; NMR PROPERTIES
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 9. 6. 2014 09:24.
    6. MISHRA, Sushil Kumar, Gabriel DEMO, Jaroslav KOČA a Michaela WIMMEROVÁ. In Silico Engineering of Proteins that Recognize Small Molecules. In Prof. Pravin Kaumaya. Protein Engineering. Neuveden: InTech - Open Access Publisher, 2012, s. 307-344. ISBN 978-953-51-0037-9.
      URL URL
      Název česky: In Silico inzenyrstvi proteinu rozpoznavajici male molekuly
      Název anglicky: In Silico Engineering of Proteins that Recognize Small Molecules
      RIV/00216224:14740/12:00057223 Kapitola resp. kapitoly v odborné knize. Biochemie. angličtina. Chorvatsko.
      Mishra, Sushil Kumar (356 Indie, domácí) -- Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Koča, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: in silico protein structure mutagenesis docking specificity
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 10. 4. 2013 00:44.
    7. OOSTENBRINK, Chris, Anita DE RUITER, Jozef HRITZ a Nico VERMEULEN. Malleability and Versatility of Cytochrome P450 Active Sites Studied by Molecular Simulations. CURRENT DRUG METABOLISM. SHARJAH: BENTHAM SCIENCE PUBL LTD, 2012, roč. 13, č. 2, s. 190-196. ISSN 1389-2002.
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené arabské emiráty.
      Klíčová slova anglicky: Site of metabolism prediction; protein flexibility; molecular docking; molecular dynamics simulations; replica exchange
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 25. 2. 2014 12:56.
    8. BATHULA, Sreenivas Reddy. MOLECULAR INTERVENTIONS OF PEPTIDES AND SMALL MOLECULES: A STRUCTURAL STUDY. 2012.
      Změnil: Mgr. Sreenivas Reddy Bathula, Ph.D., učo 249633. Změněno: 2. 5. 2012 22:18.
    9. OTRUSINOVÁ, Olga, Séverine JANSEN, Pavel KADEŘÁVEK, Blanka PEKÁROVÁ, Jaromír MAREK, Jan HEJÁTKO, Lubomír JANDA, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. NMR Studies of the Receiver Domain of the CKI1 Sensory Histidine Kinase from Arabidopsis thaliana. In XXVth ICMBRS. 2012.
      URL
      Název anglicky: NMR Studies of the Receiver Domain of the CKI1 Sensory Histidine Kinase from Arabidopsis thaliana
      Biochemie. angličtina. Francie.
      Změnila: Mgr. Olga Otrusinová, učo 175607. Změněno: 18. 2. 2013 16:54.
    10. BYSTRICKÝ, Peter, Marie POKORNÁ, Karel KUBÍČEK, Lukáš ŽÍDEK a Michaela WIMMEROVÁ. NMR STUDY - RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS. In 2nd EAST NMR Young Investigator's meeting. 2012.
      Název anglicky: NMR STUDY - RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      RIV/00216224:14740/12:00061756 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Slovensko.
      Bystrický, Peter (703 Slovensko, garant, domácí) -- Pokorná, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      Druh účasti: vyžádaná přednáška
      Recenzováno: ano

      Změnil: Ing. Peter Bystrický, PhD., učo 112674. Změněno: 5. 11. 2012 16:32.
    11. PAPOUŠKOVÁ, Veronika, Jiří NOVÁČEK, Hana ŠANDEROVÁ, Alžběta RABATINOVÁ, Anna ZAWADZKA-KAZIMIERCZUK, Krzystof KAZIMIERCZUK, Lukáš ŽÍDEK, Wiktor KOZMINSKI, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. NMR study of RNA polymerase delta subunit unique for gram-positive bacteria. 2012. ISBN 978-80-86441-43-6.
      URL
      Název česky: NMR studie delta podjednotky RNA polymerázy specifické pro gram-pozitivní bakterie
      Název anglicky: NMR study of RNA polymerase delta subunit unique for gram-positive bacteria
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: delta subunit, RNA polymerase,NMR, assignment, structure
      Druh sborníku: postkonferenční sborník
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 17. 7. 2012 13:35.
    12. FROMMEL, Jan, Miroslav SOURAL, Martina TYLICHOVÁ, David KOPEČNÝ, Gabriel DEMO, Michaela WIMMEROVÁ a Marek ŠEBELA. Plant aminoaldehyde dehydrogenases oxidize a wide range of nitrogenous heterocyclic aldehydes. Amino Acids. Wien: Springer-Verlag, 2012, roč. 43, č. 3, s. 1189-1202. ISSN 0939-4451. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00726-011-1174-x.
      URL
      Název česky: Rostlinne aminoaldehyd-dehydrogenazy oxiduji sirokou skalu dusikovych heterocyklickych aldehydu
      Název anglicky: Plant aminoaldehyde dehydrogenases oxidize a wide range of nitrogenous heterocyclic aldehydes
      RIV/00216224:14740/12:00057220 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Rakousko.
      Frommel, Jan (203 Česká republika) -- Soural, Miroslav (203 Česká republika) -- Tylichová, Martina (203 Česká republika) -- Kopečný, David (203 Česká republika) -- Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Šebela, Marek (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: aldehyde; aminoaldehyde dehydrogenase; pyridine; pyrimidine; purine
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 7. 4. 2013 15:33.
    13. VÍCHA, Jan, Gabriel DEMO a Radek MAREK. Platinum-Modified Adenines: Unprecedented Protonation Behavior Revealed by NMR Spectroscopy and Relativistic Density-Functional Theory Calculations. Inorganic Chemistry. American Chemical Society, 2012, roč. 51, č. 3, s. 1371-1379. ISSN 0020-1669. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ic201595e.
      DOI: 10.1021/ic201595e
      RIV/00216224:14740/12:00057245 Článek v odborném periodiku. Anorganická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Vícha, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Adenine; 15N NMR spectroscopy; Platinum; Relativistic DFT; Spin-orbit; Protonation
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 4. 1. 2014 13:38.
    14. BYSTRICKÝ, Peter, Marie POKORNÁ, Karel KUBÍČEK, Michaela WIMMEROVÁ a Lukáš ŽÍDEK. RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS, A NMR STUDY. In 26th Intenational Carbohydrate Symposium 2012 abstracts. 2012.
      Název anglicky: RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS, A NMR STUDY
      RIV/00216224:14740/12:00061753 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Španělsko.
      Bystrický, Peter (703 Slovensko, garant, domácí) -- Pokorná, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      Druh účasti: aktivní účast
      Recenzováno: ano

      Změnil: Ing. Peter Bystrický, PhD., učo 112674. Změněno: 5. 11. 2012 15:54.
    15. ŠTEFL, Richard a Vladimír SKLENÁŘ. RNA. In Ivano Pertini, Kathleen S. McGreevy, Giacomo Parigi. NMR of Biomolecules, Towards Mechanistic System Biology. 1. vyd. Weinheim, Německo: Wiley-Blackwell, 2012, s. 119-135. ISBN 978-3-527-32850-5.
      Název česky: RNA
      RIV/00216224:14740/12:00057098 Kapitola resp. kapitoly v odborné knize. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Německo.
      Štefl, Richard (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RNA NMR
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 11. 3. 2013 05:09.
    16. BENEŠÍK, Martin, Jiří NOVÁČEK, Lubomír JANDA, Radka DOPITOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Jiří DOŠKAŘ, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Roman PANTŮČEK. SH3b cell wall binding domain of bacteriophage 812 endolysin. In prof. RNDr. Jiří Doškař. The Student Scientific Conference on Biotechnology. Conference book. Brno: Masarykova univerzita, 2012, s. 92-93. ISBN 978-80-210-5811-8.
      RIV/00216224:14310/12:00064946 Stať ve sborníku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Benešík, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, domácí) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Doškař, Jiří (203 Česká republika, garant, domácí) -- Růžičková, Vladislava (203 Česká republika, domácí) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Staphylococcus aureus; Myoviridae; E.coli

      Změnila: Mgr. et Mgr. Veronika Oškerová, Ph.D., učo 134438. Změněno: 27. 3. 2013 12:19.
    17. BENEŠÍK, Martin, Jiří NOVÁČEK, Lubomír JANDA, Radka DOPITOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Jiří DOŠKAŘ, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Marek MOŠA a Roman PANTŮČEK. SH3b cell wall binding domain of bacteriophage 812 endolysin: Cloning, expression and structure determination. In Viruses of Microbes. From exploration to applications in the -omics era. EMBO Conference Series, Brussels, Belgium. 2012.
      URL
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Belgie.
      Klíčová slova anglicky: Staphylococcus; bacteriophage; Myoviridae; endolysin; SH3b domain; NMR
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842. Změněno: 22. 11. 2012 11:34.
    18. DEMO, Gabriel, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Michaela WIMMEROVÁ. Significant changes between the Xray structure and NMR structure of delta subunit of RNA polymerase. In Struktura 2012, Cesko-slovenska krystalograficka spolecnost. 2012. ISSN 1211-5894.
      Název česky: Podstatni zmeny mezi krystalografickou a NMR strukturou delta podjednotky RNA polymerazy
      Název anglicky: Significant changes between the X-ray structure and NMR structure of delta subunit of RNA polymerase
      RIV/00216224:14740/12:00057460 Konferenční abstrakt. Biochemie. čeština. Česká republika.
      Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: delta subunit comparism NMR Xray structure
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Gabriel Demo, Ph.D., učo 150765. Změněno: 29. 6. 2012 10:22.
    19. KADAM, Shivaji Sambhaji, Ioannis KOSTAKIS, Panagiotis MARAKOS, Nicole POULI a Radek MAREK. Tautomeric equilibria of substituted pyrazolo[4,3-c]pyrazoles: Synthesis of their possible N-methyl isomers. In 1st Congress of Pharmaceutical Sciences and Research Society, 27-30 April 2012, University of Athens, Campus Zografou, Greece. 2012.
      Organická chemie. angličtina. Řecko.
      Klíčová slova anglicky: Pharmaceutical chemistry, Medicinal chemistry
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Shivaji Sambhaji Kadam, Ph.D., učo 346100. Změněno: 5. 1. 2013 22:18.
    20. KADAM, Shivaji Sambhaji, Ioannis KOSTAKIS, Panagiotis MARAKOS, Nicole POULI a Radek MAREK. Tautomeric equilibria of substituted pyrazolo[4,3-c]pyrazoles: Synthesis of their possible N-methyl isomers. In 15th Hellenic symposium on medicinal chemistry Athens, May 25-27 2012. 2012.
      URL Conference web pages
      Organická chemie. angličtina. Řecko.
      Klíčová slova anglicky: medicinal chemistry, synthesis, structure
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Shivaji Sambhaji Kadam, Ph.D., učo 346100. Změněno: 19. 7. 2013 13:59.
    21. KADAM, Shivaji Sambhaji, Jaromír TOUŠEK, Lukáš MAIER, Matej PIPÍŠKA, Vladimír SKLENÁŘ a Radek MAREK. Understanding the NMR properties and conformational behavior of indole vs. azaindole group in protoberberines: NICS and NCS analysis. Journal of Molecular Structure. Amsterdam: Elsevier, 2012, roč. 1028, Nov, s. 31-38. ISSN 0022-2860. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.molstruc.2012.06.034.
      URL
      RIV/00216224:14740/12:00060457 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Nizozemské království.
      Kadam, Shivaji Sambhaji (356 Indie, domácí) -- Toušek, Jaromír (203 Česká republika, domácí) -- Maier, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Pipíška, Matej (703 Slovensko, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Density-functional theory; Nuclear magnetic shielding; Conformational analysis; Nucleus-independent chemical shift; Localized molecular orbitals; Berberine
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 18. 1. 2017 15:12.
    22. NOVÁČEK, Jiří, Noam Y HABA, Jordan H CHILL, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. 4D Non-uniformly sampled HCBCACON and (1) J(NC alpha)-selective HCBCANCO experiments for the sequential assignment and chemical shift analysis of intrinsically disordered proteins. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer Netherlands, 2012, roč. 53, č. 2, s. 139-148. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-012-9631-8.
      URL
      Název anglicky: 4D Non-uniformly sampled HCBCACON and (1) J(NC alpha)-selective HCBCANCO experiments for the sequential assignment and chemical shift analysis of intrinsically disordered proteins
      RIV/00216224:14740/12:00057624 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Nizozemské království.
      Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Haba, Noam Y (376 Izrael) -- Chill, Jordan H (376 Izrael) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Intrinsically disordered proteins; Non-uniform sampling; C-13 detection; Chemical shifts; Residual secondary structure; Prolines assignment

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 7. 5. 2013 06:52.

    2011

    1. VALENTOVÁ, Marie, Radek MAREK, Emil ŠVAJDLENKA, Renata KUBÍNOVÁ a Václav SUCHÝ. A new isoflavanone from Iresine herbstii. Fitoterapia. Elsevier Science BV, 2011, roč. 82, č. 2, s. 272-275. ISSN 0367-326X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.fitote.2010.10.010.
      DOI: 10.1016/j.fitote.2010.10.010
      RIV/00216224:14310/11:00052844 Článek v odborném periodiku. Analytická chemie, separace. angličtina. Nizozemské království.
      Valentová, Marie (203 Česká republika, garant) -- Marek, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Švajdlenka, Emil (203 Česká republika) -- Kubínová, Renata (203 Česká republika) -- Suchý, Václav (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Iresine herbstii; Amaranthaceae; 225-Trimethoxy-67-methylenedioxyisoflavanone; 25-Dimethoxy-67-methylenedioxyisoflavone; Tlatlancuayin; alpha-Glucosidase
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 17. 1. 2017 13:22.
    2. HORNIČÁKOVÁ, Michaela, Jaroslava KOHOUTOVÁ, Judith SCHLAGNITWEIT, Christian WOLFSCHLAGER, Rudiger ETTRICH, Radovan FIALA, Wolfgang SCHOEFBERGER a Norbert MÜLLER. Backbone assignment and secondary structure of the PsbQ protein from Photosystem II. Biomolecular NMR Assignments. DORDRECHT: SPRINGER, 2011, roč. 5, č. 2, s. 169-175. ISSN 1874-2718. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s12104-011-9293-6.
      URL
      Název česky: Přiřazení páteře a sekundární struktura proteinu PsbQ z fotosystému II
      Název anglicky: Backbone assignment and secondary structure of the PsbQ protein from Photosystem II
      RIV/00216224:14310/11:00052822 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Horničáková, Michaela (703 Slovensko) -- Kohoutová, Jaroslava (203 Česká republika) -- Schlagnitweit, Judith (40 Rakousko) -- Wolfschlager, Christian (40 Rakousko) -- Ettrich, Rudiger (40 Rakousko) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, garant, domácí) -- Schoefberger, Wolfgang (40 Rakousko) -- Müller, Norbert (40 Rakousko)
      Klíčová slova anglicky: protein; NMR assignment; PsbQ

      Změnil: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc., učo 564. Změněno: 2. 4. 2012 15:55.
    3. BENEŠÍK, Martin, Jiří NOVÁČEK, Lubomír JANDA, Radka DOPITOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK. Cloning and expression of endolysin and its SH3b-domain from polyvalent staphylococcal bacteriophage. In XX. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2011. 2011.
      URL
      Název česky: Klonování a exprese endolyzinu a jeho SH3b-domény z polyvalentního stafylokokového bakteriofága
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842. Změněno: 14. 7. 2011 18:45.
    4. BENEŠÍK, Martin, Jiří NOVÁČEK, Lubomír JANDA, Radka DOPITOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Jiří DOŠKAŘ, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Marek MOŠA a Roman PANTŮČEK. Cloning, expression and structure determination of SH3b cell wall binding domain of bacteriophage 812 endolysin. In Phages 2011 - Bacteriophage Applications, 19-21 September 2011, St Hilda's College, Oxford, UK. 2011.
      URL
      RIV/00216224:14310/11:00050057 Konferenční abstrakt. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Benešík, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Doškař, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Růžičková, Vladislava (203 Česká republika, domácí) -- Moša, Marek (203 Česká republika) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: bacteriophage therapy; Staphylococcus aureus; bacteriophage endolysin; SH3b domain
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842. Změněno: 14. 10. 2011 12:57.
    5. KADEŘÁVEK, Pavel, Carl DIEHL, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Petr PADRTA, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ, Vladimír SKLENÁŘ a Mikael AKKE. Complementation of 3D structure of delta subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis with description of internal motions in terms of reduced spectral density mapping. MATERIALS STRUCTURE. 2011, roč. 18, č. 1, s. 3-5. ISSN 1211-5894.
      URL
      RIV/00216224:14740/11:00057189 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí) -- Diehl, Carl (752 Švédsko) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Akke, Mikael (752 Švédsko)
      Klíčová slova anglicky: NMR; delta subunit; RNA polymerase; spectral density function
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 16. 4. 2013 11:03.
    6. DEMO, Gabriel, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Michaela WIMMEROVÁ. Crystallization and structure determination of delta-subunit of RNApolymerase. In Higher European Research Course for Users of Large Experimental Systems (HERCULES). 2011.
      Název česky: Krystalizace a určení struktury delta-podjednotky RNA polymerázy
      Název anglicky: Crystallization and structure determination of delta-subunit of RNApolymerase
      RIV/00216224:14740/11:00049774 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: delta-subunit RNA polymerase crystallization structure
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Gabriel Demo, Ph.D., učo 150765. Změněno: 8. 5. 2011 12:10.
    7. JANSEN, Séverine, Olga TŘÍSKOVÁ, Blanka PEKÁROVÁ, Tomáš KLUMPLER, Jakub HORÁK, Radka DOPITOVÁ, Jiří NOVÁČEK, Jaromír MAREK, Jan HEJÁTKO, Lubomír JANDA, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Effect of Mg2+ Binding on the Receiver Domain of the CKI1 Sensory Histidine Kinase from Arabidopsis thaliana. Frankfurt am Main, Germany: EUROMAR, 2011, s. 325-325. ISBN 978-3-86955-845-5.
      URL
      Název česky: Efekt vazby Mg2+ iontů na příjímačovou doménu senzoru CKI1 histidin kinázy z Arabidopsis thaliana

      Druh sborníku: předkonferenční sborník

      Změnila: Séverine Jansen, PhD., učo 128288. Změněno: 10. 2. 2012 08:11.
    8. GUÉRINEAU, Marc, Zdeněk KŘÍŽ, Lucie KOZÁKOVÁ, Kateřina BEDNÁŘOVÁ, Sreenivas Reddy BATHULA, Jessica HUDSON, R. Alan LEHMANN a Jan PALEČEK. CHARACTERIZATION OF THE NSE4/EID BINDING TO NSE3/MAGE PROTEINS. In XV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2011.
      Název česky: Charakterizace vazby Nse4/EID s proteiny Nse3/MAGE
      Název anglicky: CHARACTERIZATION OF THE NSE4/EID BINDING TO NSE3/MAGE PROTEINS
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: SMC5/6 complex; Nse4; EID proteins; Nse3; MAGE proteins; pepscan ELISA
      Druh účasti: vyžádaná přednáška
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: doc. Mgr. Jan Paleček, Dr. rer. nat., učo 38623. Změněno: 5. 1. 2012 11:44.
    9. MALIŇÁKOVÁ, Kateřina, Lucie NOVOSADOVÁ, Matej PIPÍŠKA a Radek MAREK. Chemical Shift Tensors in Isomers of Adenine: Relation to Aromaticity of Purine Rings? ChemPhysChem. Weinheim: Wiley-VCH, 2011, roč. 12, č. 2, s. 379-388. ISSN 1439-4235. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/cphc.201000657.
      DOI: 10.1002/cphc.201000657
      Název česky: Tenzory chemického posunu u izomerů adeninu: Vztah k aromaticitě purinových kruhů?
      RIV/00216224:14740/11:00051482 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Německo.
      Maliňáková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Novosadová, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Pipíška, Matej (703 Slovensko, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: solid-state NMR; density-functional theory; X-ray diffraction; nucleus-independent chemical shift; supramolecular cluster
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 19. 2. 2012 12:00.
    10. HUDSON, J J R, Kateřina BEDNÁŘOVÁ, Lucie KOZÁKOVÁ, Chunyan LIAO, Marc GUÉRINEAU, Rita COLNAGHI, Susanne VIDOT, Jaromír MAREK, Sreenivas Reddy BATHULA, Alan LEHMANN a Jan PALEČEK. Interactions between the Nse3 and Nse4 Components of the SMC5-6 Complex Identify Evolutionarily Conserved Interactions between MAGE and EID Families. PloS ONE. San Francisco: Public Library of Science, 2011, roč. 6, č. 2, s. "nestránkováno", 14 s. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0017270.
      URL
      Název česky: Interakce mezi Nse3 a Nse4 podjednotkami SMC5-6 komplexu ukazují na evoluční konzervaci vazby mezi MAGE a EID proteinovými rodinami
      RIV/00216224:14740/11:00049415 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Hudson, J J R (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Bednářová, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Kozáková, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Liao, Chunyan (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Guérineau, Marc (250 Francie, domácí) -- Colnaghi, Rita (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Vidot, Susanne (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Marek, Jaromír (203 Česká republika, domácí) -- Bathula, Sreenivas Reddy (356 Indie, domácí) -- Lehmann, Alan (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Paleček, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: SMC5-6 complex; Nse3/MAGE; Nse4/EID; genome stability; transcription regulation; evolution; placental mammals
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: doc. Mgr. Jan Paleček, Dr. rer. nat., učo 38623. Změněno: 20. 1. 2017 11:39.
    11. ŠVANDOVÁ, Veronika a Lukáš MÜLLER. Internet a výuka chemie. Media4u magazine. 2011, roč. 8, č. X3, s. 105-111. ISSN 1214-9187.
      Změnila: Mgr. Veronika Švandová, Ph.D., učo 106381. Změněno: 21. 7. 2021 09:47.
    12. STANDARA, Stanislav, Kateřina BOUZKOVÁ, Michal STRAKA, Zuzana ZACHAROVÁ, Michal HOCEK, Jaromír MAREK a Radek MAREK. Interpretation of substituent effects on 13C and 15N NMR chemical shifts in 6-substituted purines. Physical Chemistry Chemical Physics. Royal Society of Chemistry, 2011, roč. 13, č. 35, s. 15854-15864. ISSN 1463-9076. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c1cp20680j.
      DOI: 10.1039/c1cp20680j
      RIV/00216224:14740/11:00052846 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Standara, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Bouzková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Straka, Michal (203 Česká republika) -- Zacharová, Zuzana (703 Slovensko, domácí) -- Hocek, Michal (203 Česká republika) -- Marek, Jaromír (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Purine; Nuclear magnetic shielding; Localized molecular orbitals; Conformational dependence
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 18. 6. 2013 08:23.
    13. BENEŠÍK, Martin, David BEDNÁŘ, Lubomír JANDA, Radka DOPITOVÁ, Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK. Klonování genů fágových lytických enzymů a jejich funkčních domén. In Genetická konference GSGM 2011, 14.-16.9.2011, Lednice. 2011. ISBN 978-80-210-5569-8.
      URL
      Genetika a molekulární biologie. čeština. Česká republika.
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Michal Petr, učo 65024. Změněno: 18. 10. 2011 12:50.
    14. HORÁK, Jakub, Lubomír JANDA, Blanka PEKÁROVÁ a Jan HEJÁTKO. Molecular Mechanisms of Signalling Specificity via Phosphorelay Pathways in Arabidopsis. CURRENT PROTEIN & PEPTIDE SCIENCE. Bentham Science Publishers, 2011, roč. 12, č. 2, s. 126-136. ISSN 1389-2037.
      RIV/00216224:14740/11:00050115 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené arabské emiráty.
      Horák, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, domácí) -- Pekárová, Blanka (203 Česká republika, domácí) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Arabidopsis thaliana; cytokinin; phosphorelay; plant hormone; signal integration; signal specificity; signalling pathway; two-component system
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 25. 3. 2012 05:56.
    15. HOŠEK, Jan, Milan BARTOS, Stanislav CHUDÍK, Stefano DALL’ACQUA, Gabbriella INNOCENTI, Murat KARTAL, Ladislav KOKOŠKA, Peter KOLLÁR, Zsófia KUTIL, Přemysl LANDA, Radek MAREK, Veronika ZÁVALOVÁ, Milan ŽEMLIČKA a Karel ŠMEJKAL. Natural Compound Cudraflavone B Shows Promising Anti-inflammatory Properties in Vitro. Journal of Natural Products. American Chemical Society, 2011, roč. 74, č. 4, s. 614-619. ISSN 0163-3864. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/np100638h.
      DOI: 10.1021/np100638h
      RIV/00216224:14740/11:00052845 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Hošek, Jan (203 Česká republika, garant) -- Bartos, Milan (203 Česká republika) -- Chudík, Stanislav (203 Česká republika) -- Dall’Acqua, Stefano (380 Itálie) -- Innocenti, Gabbriella (380 Itálie) -- Kartal, Murat (792 Turecko) -- Kokoška, Ladislav (203 Česká republika) -- Kollár, Peter (203 Česká republika) -- Kutil, Zsófia (203 Česká republika) -- Landa, Přemysl (203 Česká republika) -- Marek, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Závalová, Veronika (203 Česká republika) -- Žemlička, Milan (203 Česká republika) -- Šmejkal, Karel (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Cudraflavone; Morus alba; anti-inflammatory; zinc-finger protein; nonsteroidal drug lead
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 18. 6. 2013 08:25.
    16. BABINSKÝ, Martin, Petr KULHÁNEK, Viktor KOLMAN, Vladimír ŠINDELÁŘ a Radek MAREK. NMR and Computational Study of Supramolecular Interactions. In 26th Central European NMR Meeting Valtice. 2011.

      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Martin Babinský, Ph.D., učo 151360. Změněno: 20. 7. 2011 17:03.
    17. FIALA, Radovan, Naděžda ŠPAČKOVÁ, Silvie FOLDYNOVÁ-TRANTÍRKOVÁ, Jiří ŠPONER, Vladimír SKLENÁŘ a Lukáš TRANTÍREK. NMR cross-­correlated relaxation rates reveal ion coordination sites in DNA. Journal of the American Chemical Society. Washington, DC., USA: American Chemical Society, 2011, roč. 133, č. 35, s. 13790-13793. ISSN 0002-7863. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ja202397p.
      URL
      Název česky: Kroskorelační relaxační rychlosti v NMR ukazují koordinační místa iontů v DNA
      RIV/00216224:14740/11:00053750 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Fiala, Radovan (203 Česká republika, garant, domácí) -- Špačková, Naděžda (203 Česká republika) -- Foldynová-Trantírková, Silvie (203 Česká republika) -- Šponer, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Trantírek, Lukáš (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: DNA; ions; NMR; relaxation
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 31. 7. 2013 15:06.
    18. PAPOUŠKOVÁ, Veronika, Pavel KADEŘÁVEK, Jiří NOVÁČEK, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. NMR study of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria. In Gordon Research Conference. 2011.
      URL
      Název česky: NMR studie podjednotky RNA polymerazy unikatní v grampozitivních bakteriích
      Název anglicky: NMR study of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteri
      Biochemie. angličtina. Itálie.
      Klíčová slova anglicky: NMR, RNA polymerase, delta subunit, structure, dynamics, interactions
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 22. 8. 2011 15:19.
    19. BYSTRICKÝ, Peter, Karel KUBÍČEK, Marie POKORNÁ, Radovan FIALA a Michaela WIMMEROVÁ. NMR STUDY OF INTERACTIONS OF RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN. In XV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů Sborník příspěvků. 2011. ISBN 978-80-210-5594-0.
      Název anglicky: NMR STUDY OF INTERACTIONS OF RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN
      RIV/00216224:14740/11:00053905 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Bystrický, Peter (703 Slovensko, garant, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Pokorná, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      Druh účasti: aktivní účast
      Recenzováno: ano

      Změnil: Ing. Peter Bystrický, PhD., učo 112674. Změněno: 3. 4. 2012 14:44.
    20. BYSTRICKÝ, Peter, Karel KUBÍČEK, Marie POKORNÁ, Radovan FIALA a Michaela WIMMEROVÁ. NMR STUDY OF RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS. In EuroCarb 2011 abstracts. 2011.
      Název anglicky: NMR STUDY OF RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      RIV/00216224:14740/11:00053389 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Itálie.
      Bystrický, Peter (703 Slovensko, garant, domácí) -- Kubíček, Karel (203 Česká republika, domácí) -- Pokorná, Marie (203 Česká republika, domácí) -- Fiala, Radovan (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: NMR RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      Druh účasti: aktivní účast
      Recenzováno: ano

      Změnil: Ing. Peter Bystrický, PhD., učo 112674. Změněno: 3. 4. 2012 14:45.
    21. BYSTRICKÝ, Peter, Karel KUBÍČEK, Marie POKORNÁ, Radovan FIALA a Michaela WIMMEROVÁ. NMR STUDY OF RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS. 2011. ISBN 978-80-86313-34-4.
      Název česky: NMR studium lektinovych interakcii RALSTONIA SOLANACEARUM
      Název anglicky: NMR STUDY OF RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: NMR RALSTONIA SOLANACEARUM LECTIN INTERACTIONS
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Ing. Peter Bystrický, PhD., učo 112674. Změněno: 13. 2. 2013 13:57.
    22. VÍCHA, Jan, Gabriel DEMO a Radek MAREK. NMR, X-ray and relativistic DFT study of Pt (IV) complexes with aromatic cytokinins. In 14th International Density Functional Theory Conference (DFT). 2011.
      Název anglicky: NMR, X-ray and relativistic DFT study of Pt (IV) complexes with aromatic cytokinins

      Klíčová slova anglicky: cytokinins, purine, relativistic DFT, pt(IV)
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Jan Vícha, Ph.D., učo 151272. Změněno: 2. 2. 2012 13:27.
    23. VÍCHA, Robert, Michal ROUCHAL, Zuzana KOZUBKOVÁ, Ivo KUŘITKA, Radek MAREK, Petra BRANNÁ a Richard ČMELÍK. Novel Adamantane-Bearing Anilines and Properties of Their Supramolecular Complexes with beta-Cyclodextrin. Supramolecular Chemistry. Taylor & Francis, 2011, roč. 23, č. 10, s. 663-677. ISSN 1061-0278. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1080/10610278.2011.593628.
      DOI: 10.1080/10610278.2011.593628
      RIV/00216224:14310/11:00052847 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Vícha, Robert (203 Česká republika, garant) -- Rouchal, Michal (203 Česká republika) -- Kozubková, Zuzana (203 Česká republika) -- Kuřitka, Ivo (203 Česká republika) -- Marek, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Branná, Petra (203 Česká republika) -- Čmelík, Richard (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Adamantane; Amines; Cyclodextrins; Host-guest systems
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 17. 2. 2012 08:31.
    24. BATHULA, Sreenivas Reddy. Pavlíková N, Bláhová L, Klán P, Bathula SR, Sklenár V, Giesy JP, Bláha L. Enantioselective effects of alpha-hexachlorocyclohexane (HCH) isomers on androgen receptor activity in vitro. Chemosphere. Chemosphere. 2011. ISSN 0045-6535. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.chemosphere.2011.08.052.
      Biochemie.
      Změnil: Mgr. Sreenivas Reddy Bathula, Ph.D., učo 249633. Změněno: 14. 11. 2011 22:43.
    25. KOLMAN, Viktor, Martin BABINSKÝ, Petr KULHÁNEK, Radek MAREK a Vladimír ŠINDELÁŘ. Redistribution of electron density in pyridinium and pyrazinium guests induced by complexation with cucurbit[6]uril. New Journal of Chemistry. Oxford: Royal Society of Chemistry, 2011, roč. 35, č. 12, s. 2854-2859. ISSN 1144-0546. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c1nj20631a.
      DOI: 10.1039/C1NJ20631A
      RIV/00216224:14310/11:00050071 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Kolman, Viktor (203 Česká republika, domácí) -- Babinský, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Šindelář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: supramolecular chemistry; nuclear magnetic shielding; density-functional theory; point charges; electrostatic repulsion;
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 2. 2. 2012 10:16.
    26. STANDARA, Stanislav, Petr KULHÁNEK, Radek MAREK, Jan HORNÍČEK, Petr BOUŘ a Michal STRAKA. Simulation of 129Xe NMR chemical shift of Xe@C60 dissolved in liquid benzene. In DFT 2011 Athens : 14th International Density Functional Theory Conference (DFT). 2011.
      URL
      Změnil: Mgr. Stanislav Standara, učo 43015. Změněno: 11. 10. 2011 16:45.
    27. STANDARA, Stanislav, Petr KULHÁNEK, Radek MAREK, Jan HORNÍČEK, Petr BOUŘ a Michal STRAKA. Simulations of 129 Xe NMR chemical shift of atomic xenon dissolved in liquid benzene. Theoretical Chemistry Accounts. SPRINGER, 2011, roč. 129, 3-5, s. 677-684. ISSN 1432-881X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00214-011-0930-z.
      DOI: 10.1007/s00214-011-0930-z
      RIV/00216224:14740/11:00052404 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Standara, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Kulhánek, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Horníček, Jan (203 Česká republika) -- Bouř, Petr (203 Česká republika) -- Straka, Michal (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: Breit–Pauli perturbation theory; Density functional theory; Dynamical averaging; Relativistic effects; Xe NMR chemical shift
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 18. 1. 2017 15:15.
    28. DEMO, Gabriel, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Hana SANDEROVA a Michaela WIMMEROVÁ. Structural analysis of delta-subnit of RNA-polymerase by X-ray. In Struktura 2011, Cesko-slovenska krystalograficka spolecnost. 2011. ISSN 1211-5894.
      Název česky: Strukturni analyza delta-podjednotky RNA-polymerazy za pomoci X-ray
      RIV/00216224:14740/11:00049856 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Sanderova, Hana (203 Česká republika) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RNA delta subunit crystallization structure

      Změnila: Mgr. Nikola Kostlánová, Ph.D., učo 12689. Změněno: 4. 4. 2012 11:17.
    29. PEKÁROVÁ, Blanka, Tomáš KLUMPLER, Olga TŘÍSKOVÁ, Jakub HORÁK, Séverine JANSEN, Radka DOPITOVÁ, Petra BORKOVCOVÁ, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Eliška NEJEDLÁ, Vladimír SKLENÁŘ, Jaromír MAREK, Lukáš ŽÍDEK, Jan HEJÁTKO a Lubomír JANDA. Structure and binding specificity of the receiver domain of sensor histidine kinase CKI1 from Arabidopsis thaliana. The Plant Journal. England: BLACKWELL PUBLISHING, 2011, roč. 67, č. 5, s. 827-839. ISSN 0960-7412. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/j.1365-313X.2011.04637.x.
      URL
      RIV/00216224:14740/11:00050106 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Pekárová, Blanka (203 Česká republika, domácí) -- Klumpler, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Třísková, Olga (203 Česká republika, domácí) -- Horák, Jakub (203 Česká republika, domácí) -- Jansen, Séverine (250 Francie, domácí) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Borkovcová, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Nejedlá, Eliška (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Jaromír (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: multistep phosphorelay; receiver domain; CKI1; crystal structure; NMR spectroscopy; Arabidopsis thaliana
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D., učo 1989. Změněno: 1. 5. 2012 01:49.
    30. PAPOUŠKOVÁ, Veronika, Pavel KADEŘÁVEK, Jiří NOVÁČEK, Petr PADRTA, Šanderová HANA, Rabatinová ALŽBĚTA, Zawadzka-Kazimierczuk ANNA, Kazimierczuk KRZYSZTOF, Lukáš ŽÍDEK, Kozminski WIKTOR, Krásný LIBOR a Vladimír SKLENÁŘ. Study of RNA polymerase delta subunit unique for gram-positive bacteria. In 9th Discussions in Structural Molecular Biology Nove Hrady. 2011. ISSN 1211-5894.
      URL
      Název česky: Studie delta podjednotky RNA polymerazi jedinečné pro gram-poziotivní bakterie
      Název anglicky: Study of RNA polymerase delta subunit unique for gram-positive bacteria

      Klíčová slova anglicky: nmr, delta subunit, RNA polymerase, structure, dynamics, interactions
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 29. 3. 2011 11:24.
    31. KOLMAN, Viktor, Muhammad Shamsul Azim KHAN, Martin BABINSKÝ, Radek MAREK a Vladimír ŠINDELÁŘ. Supramolecular Shuttle Based on Inclusion Complex between Cucurbit[6]uril and Bispyridinium Ethylene. Organic Letters. Washington D.C., USA: American Chemical Society, 2011, roč. 13, č. 23, s. 6148-6151. ISSN 1523-7060. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ol2023888.
      DOI: 10.1021/ol2023888
      RIV/00216224:14310/11:00050102 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Kolman, Viktor (203 Česká republika, domácí) -- Khan, Muhammad Shamsul Azim (50 Bangladéš, domácí) -- Babinský, Martin (703 Slovensko, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Šindelář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: rotaxane; cucurbituril; inclusion complex; NMR
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 2. 2. 2012 10:21.
    32. DEMO, Gabriel, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Hana SANDEROVA, Lukáš ŽÍDEK a Michaela WIMMEROVÁ. The X-ray structure versus NMR structure of delta-subunit of RNA-polymerase. In XV. Setkani biochemiku a molekularnich biologu. 2011. ISBN 978-80-210-5594-0.
      Název česky: Roetgenova struktura verzus NMR struktura delta-podjednotky RNA-polymerazy
      RIV/00216224:14740/11:00050113 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Demo, Gabriel (703 Slovensko, domácí) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Sanderova, Hana (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: X-ray NMR structure delta-subunit comparison
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Nikola Kostlánová, Ph.D., učo 12689. Změněno: 4. 4. 2012 12:09.
    33. DUTTA, Arpan, Atish Dipankar JANA, Sumana GANGOPADHYAY, Kalyan Kumar DAS, Jaromír MAREK, Radek MAREK, Jiří BRUS a Mahammad ALI. Unprecedented pi...pi interaction between an aromatic ring and a pseudo-aromatic ring formed through intramolecular H-bonding in a bidentate Schiff base ligand: crystal structure and DFT calculations. Physical Chemistry Chemical Physics. Royal Society of Chemistry, 2011, roč. 13, č. 35, s. 15845-15853. ISSN 1463-9076. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c1cp21047e.
      DOI: 10.1039/c1cp21047e
      RIV/00216224:14740/11:00049913 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Dutta, Arpan (356 Indie) -- Jana, Atish Dipankar (356 Indie) -- Gangopadhyay, Sumana (356 Indie) -- Das, Kalyan Kumar (356 Indie) -- Marek, Jaromír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Brus, Jiří (203 Česká republika) -- Ali, Mahammad (356 Indie)
      Klíčová slova anglicky: Pi-pi interaction; X-ray diffraction; Solid-state NMR; Molecular orbitals
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 18. 6. 2013 08:26.
    34. PAWLAK, Tomasz, Markéta MUNZAROVÁ, Leszek PAZDERSKI a Radek MAREK. Validation of relativistic DFT approaches to the calculation of NMR chemical shifts in square-planar Pt2+ and Au3+ complexes. Journal of Chemical Theory and Computation. ACS, 2011, roč. 7, č. 12, s. 3909-3923. ISSN 1549-9618. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/ct200366n.
      DOI: 10.1021/ct200366n
      RIV/00216224:14740/11:00053848 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Pawlak, Tomasz (616 Polsko, domácí) -- Munzarová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Pazderski, Leszek (616 Polsko) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Nuclear magnetic shielding; transition metal; density-functional theory; spin-orbit coupling; solvent effect; relativistic effect; exact-exchange admixture
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 31. 7. 2013 14:54.
    35. SOUČEK, Miroslav, Jindřich ŠPINAR, Jiří VORLÍČEK, Zdeněk ADAM, Dagmar ADÁMKOVÁ KRÁKOROVÁ, Lenka BABIČKOVÁ, Karola BALŠÍKOVÁ, Drahomíra BARTOŠOVÁ, Otakar BEDNAŘÍK, Richard BERGER, Šárka BOHATÁ, Petr BRHEL, Tomáš BRYCHTA, Yvona BRYCHTOVÁ, Alena BULIKOVÁ, Petr BURKOŇ, Ivan ČAPOV, Aleš ČERMÁK, Eva ČEŠKOVÁ, Milan DASTYCH, Regina DEMLOVÁ, Petr DÍTĚ, Jiří DOLINA, Michael DOUBEK, Martina DOUBKOVÁ, Lenka DUBSKÁ, Ladislav DUŠEK, Pavel FABIAN, Vuk FAIT, Zdeněk FOJTÍK, Lenka FORETOVÁ, Tomáš FREIBERGER, Renata GAILLYOVÁ, Roman GÁL, Ladislav GROCH, Marek HAKL, Jana HALÁMKOVÁ, Aleš HEP, Jitka HILLOVÁ MANNOVÁ, Ota HLINOMAZ, Ivo HOFÍREK, Jan HOLČÍK, Alena HOLČÍKOVÁ, Alena HONDLOVÁ, Anna HRAZDIROVÁ, Jan HRUDA, Petr HUSA, Libuše HUSOVÁ, Richard CHALOUPKA, Václav CHALOUPKA, Josef CHOVANEC, Stanislav JANOUŠEK, Jana JURÁNKOVÁ, Ladislav KABELKA, Zdeněk KADAŇKA, Bohdan KADLEC, Zdeněk KALA, Bohuslav KIANIČKA, Dagmar KINDLOVÁ, Igor KISS, Jarmila KISSOVÁ, Martin KLABUSAY, Ivo KOCÁK, Jiří KÖNIG, Jana KOPTÍKOVÁ, Zdeněk KOŘÍSTEK, Zdeněk KRÁL, Milan KRATOCHVÍL, Lenka KRBKOVÁ, Marta KREJČÍ, Petr KRIFTA, Petr KROUPA, Darja KRUSOVÁ, Lucie KŘIKAVOVÁ, Růžena LÁBROVÁ, Radek LAKOMÝ, Jan LATA, Jolana LIPOLDOVÁ, Jiří LITZMAN, Ondřej LUDKA, Jan MALÁSKA, Hana MATĚJOVSKÁ KUBEŠOVÁ, Jiří MATOUŠEK, Pavel MATUŠKA, Miloslava MATÝŠKOVÁ, Jaroslav MELUZÍN, Hana MELUZÍNOVÁ, Zdeněk MERTA, Blanka MIČÁNKOVÁ ADAMOVÁ, Miroslav MORÁŇ, Vojtěch MORNSTEIN, Jan MUŽÍK, Tomáš NEBESKÝ, Anna NEČASOVÁ, Marta NEDBÁLKOVÁ, Miroslava NEKULOVÁ, Petr NĚMEC, Jiří NEUBAUER, Pavel NOHEL, Jana BĚLOBRÁDKOVÁ, Miroslav NOVÁK, Bronislava NOVOTNÁ, Petr ŠTOURAČ a Vojtěch THON. Vnitřní lékařství. 1.vyd. Praha, Brno: Grada, 2011, 1788 s. Vnitřní lékařství. ISBN 978-80-247-2110-1.
      Název anglicky: Internal Medicine
      RIV/00216224:14110/11:00054861 Odborná kniha. Ostatní obory vnitřního lékařství. čeština. Česká republika.
      Souček, Miroslav (203 Česká republika, garant, domácí) -- Špinar, Jindřich (203 Česká republika, domácí) -- Vorlíček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Adam, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Adámková Krákorová, Dagmar (203 Česká republika, domácí) -- Babičková, Lenka (203 Česká republika) -- Balšíková, Karola (203 Česká republika, domácí) -- Bartošová, Drahomíra (203 Česká republika) -- Bednařík, Otakar (203 Česká republika, domácí) -- Berger, Richard (203 Česká republika) -- Bohatá, Šárka (203 Česká republika, domácí) -- Brhel, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Brychta, Tomáš (203 Česká republika) -- Brychtová, Yvona (203 Česká republika) -- Buliková, Alena (203 Česká republika, domácí) -- Burkoň, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Čapov, Ivan (203 Česká republika, domácí) -- Čermák, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Češková, Eva (203 Česká republika, domácí) -- Dastych, Milan (203 Česká republika, domácí) -- Demlová, Regina (203 Česká republika, domácí) -- Dítě, Petr (203 Česká republika) -- Dolina, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Doubek, Michael (203 Česká republika, domácí) -- Doubková, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Dubská, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Dušek, Ladislav (203 Česká republika, domácí) -- Fabian, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Fait, Vuk (203 Česká republika, domácí) -- Fojtík, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Foretová, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Freiberger, Tomáš (203 Česká republika, domácí) -- Gaillyová, Renata (203 Česká republika, domácí) -- Gál, Roman (203 Česká republika, domácí) -- Groch, Ladislav (203 Česká republika) -- Hakl, Marek (203 Česká republika, domácí) -- Halámková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Hep, Aleš (203 Česká republika, domácí) -- Hillová Mannová, Jitka (203 Česká republika) -- Hlinomaz, Ota (203 Česká republika) -- Hofírek, Ivo (203 Česká republika) -- Holčík, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Holčíková, Alena (203 Česká republika, domácí) -- Hondlová, Alena (203 Česká republika) -- Hrazdirová, Anna (203 Česká republika, domácí) -- Hruda, Jan (203 Česká republika) -- Husa, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Husová, Libuše (203 Česká republika) -- Chaloupka, Richard (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupka, Václav (203 Česká republika) -- Chovanec, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Janoušek, Stanislav (203 Česká republika) -- Juránková, Jana (203 Česká republika) -- Kabelka, Ladislav (203 Česká republika, domácí) -- Kadaňka, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Kadlec, Bohdan (203 Česká republika, domácí) -- Kala, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Kianička, Bohuslav (203 Česká republika, domácí) -- Kindlová, Dagmar (203 Česká republika) -- Kiss, Igor (203 Česká republika, domácí) -- Kissová, Jarmila (203 Česká republika, domácí) -- Klabusay, Martin (203 Česká republika, domácí) -- Kocák, Ivo (203 Česká republika, domácí) -- König, Jiří (203 Česká republika) -- Koptíková, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Kořístek, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Král, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Kratochvíl, Milan (203 Česká republika) -- Krbková, Lenka (203 Česká republika, domácí) -- Krejčí, Marta (203 Česká republika, domácí) -- Krifta, Petr (203 Česká republika) -- Kroupa, Petr (203 Česká republika) -- Krusová, Darja (203 Česká republika, domácí) -- Křikavová, Lucie (203 Česká republika) -- Lábrová, Růžena (203 Česká republika, domácí) -- Lakomý, Radek (203 Česká republika, domácí) -- Lata, Jan (203 Česká republika) -- Lipoldová, Jolana (203 Česká republika) -- Litzman, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Ludka, Ondřej (203 Česká republika, domácí) -- Maláska, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Matějovská Kubešová, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Matoušek, Jiří (203 Česká republika) -- Matuška, Pavel (203 Česká republika) -- Matýšková, Miloslava (203 Česká republika) -- Meluzín, Jaroslav (203 Česká republika, domácí) -- Meluzínová, Hana (203 Česká republika, domácí) -- Merta, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Mičánková Adamová, Blanka (203 Česká republika, domácí) -- Moráň, Miroslav (203 Česká republika) -- Mornstein, Vojtěch (203 Česká republika, domácí) -- Mužík, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Nebeský, Tomáš (203 Česká republika) -- Nečasová, Anna (203 Česká republika) -- Nedbálková, Marta (203 Česká republika, domácí) -- Nekulová, Miroslava (203 Česká republika) -- Němec, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Neubauer, Jiří (203 Česká republika) -- Nohel, Pavel (203 Česká republika) -- Bělobrádková, Jana (203 Česká republika) -- Novák, Miroslav (203 Česká republika) -- Novotná, Bronislava (203 Česká republika, domácí) -- Štourač, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Thon, Vojtěch (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: cardiology; pneumology; gastroenterology; nephrology; oncology; hematology; endocrinology and metabolism; diabetology; immune system
      Recenzováno: ano

      Změnila: Ing. Mgr. Věra Pospíšilíková, učo 9005. Změněno: 19. 7. 2013 16:19.
    36. NOVÁČEK, Jiří, Anna ZAWADZKA-KAZIMIERCZUK, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Hana ŠANDEROVÁ, Libor KRÁSNÝ, Wiktor KOZMINSKI a Vladimír SKLENÁŘ. 5D 13C-detected experiments for backbone assignment of unstructured proteins with a very low signal dispersion. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer Netherlands, 2011, roč. 50, č. 1, s. 1-11. ISSN 0925-2738. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s10858-011-9496-2.
      RIV/00216224:14740/11:00049942 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Nizozemské království.
      Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Zawadzka-Kazimierczuk, Anna (616 Polsko) -- Papoušková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Kozminski, Wiktor (616 Polsko) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Intrinsically disordered proteins ; Non-uniform sampling ; 13C detection ; Longitudinal relaxation optimization ; Backbone assignment
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 1. 4. 2012 06:35.

    2010

    1. KADEŘÁVEK, Pavel, Carl DIEHL, Veronika MOTÁČKOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ, Vladimír SKLENÁŘ a Mikael AKKE. ANALYSIS OF BACKBONE MOTIONS OF DELTA SUBUNIT OF RNA POLYMERASE FROM BACILLUS SUBTILIS. In 8th Discussions in Structural Molecular Biology Nove Hrady, 2010. 2010.
      URL
      Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 10. 3. 2011 13:01.
    2. KADEŘÁVEK, Pavel a Veronika MOTÁČKOVÁ. BACKBONE MOTIONS OF DELTA SUBUNIT OF RNA POLYMERASE FROM BACILLUS SUBTILIS ON VARIOUS TIME SCALES. In 25th Central Europen NMR meeting, NMR 2010 Valtice. 2010.
      URL
      Změnil: Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D., učo 106653. Změněno: 3. 7. 2010 19:28.
    3. FIALA, Radovan, Michaela HORNIČÁKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Norbert MÜLLER. Carbon-detected Experiments for Assignment of Proline Rich Proteins. In 25th NMR Valtice - Central European NMR Meeting. 2010. ISBN 978-80-86441-42-9.
      URL
      Název česky: Uhlíkem detekované experimenty pro přiřazení proteinů bohatých na prolin
      Název anglicky: Carbon-detected Experiments for Assignment of Proline Rich Proteins
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: NMR spectroscopy, protein, structure, proline
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc., učo 564. Změněno: 4. 10. 2010 15:39.
    4. BENEŠÍK, Martin, Lubomír JANDA, Radka DOPITOVÁ, Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK. Cloning and expression of endolysin and its SH3 domain from polyvalent staphylococcal bacteriophage. In XIV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků. 1. vydání. Brno: Masarykova univerzita, 2010, s. 45-46. ISBN 978-80-210-5164-5.
      URL
      Název česky: Klonování a exprese endolyzinu a jeho SH3 domény z polyvalentního stafylokokového bakteriofága
      RIV/00216224:14310/10:00044000 Stať ve sborníku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Benešík, Martin (203 Česká republika) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, domácí) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Doškař, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Pantůček, Roman (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: bacteriophage; Staphylococcus aureus; bacteriolysis; lytic enzymes; protein preparetion
      Druh sborníku: postkonferenční sborník
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. et Mgr. Veronika Oškerová, Ph.D., učo 134438. Změněno: 27. 3. 2012 12:38.
    5. KAVAN, Daniel, Monika KUBÍČKOVÁ, Jan BILÝ, Ondřej VANĚK, Kateřina HOFBAUEROVÁ, Mrázek HYNEK, Rozbeský DANIEL, Bojarová PAVLA, Vladimír KŘEN, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ a Karel BEZOUŠKA. Cooperativity between subunits is essential for high affinity binding of N-acetylhexosamines to dimeric soluble and dimeric cellular forms of human CD69. Biochemistry. Washington, USA: American Chemical Society, 2010, roč. 49, č. 19, s. 4060-4067. ISSN 0006-2960.
      RIV/00216224:14310/10:00044022 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Kavan, Daniel (203 Česká republika) -- Kubíčková, Monika (203 Česká republika, domácí) -- Bilý, Jan (203 Česká republika) -- Vaněk, Ondřej (203 Česká republika) -- Hofbauerová, Kateřina (203 Česká republika) -- Hynek, Mrázek (203 Česká republika) -- Daniel, Rozbeský (203 Česká republika) -- Pavla, Bojarová (203 Česká republika) -- Křen, Vladimír (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Bezouška, Karel (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: NMR CD69 lectin-type proteins NK cell glycoproteins

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 2. 4. 2014 12:37.
    6. FILIPI, T., P. MAZURA, Radka DOPITOVÁ, Lubomír JANDA, Jiří DAMBORSKÝ, N. S. KIRAN a B. BRZOBOHATY. DESIGNING RECOMBINANT MAIZE beta-GLUCOSIDASE Zm-p60.1: DEVELOPMENT OF NOVEL ENZYMES MODULATING CYTOKININ METABOLISM. In Skarpa, P. MENDELNET 2010. BRNO: MENDEL UNIV BRNO, FAC AGRONOMY, 2010, s. 821-823. ISBN 978-80-7375-453-2.
      URL
      čeština. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: Zm-p60.1; beta-glucosidase; maize; tZOG; cZOG; cytokinin; protein evolution; protein mutagenesis

      Změnila: Mgr. Marie Novosadová Šípková, DiS., učo 437722. Změněno: 10. 9. 2020 11:08.
    7. PEKÁROVÁ, Blanka, Tomáš KLUMPLER, Olga TŘÍSKOVÁ, Jakub HORÁK, Lukáš ŽÍDEK, Jaromír MAREK, Radka DOPITOVÁ, Jan HEJÁTKO a Lubomír JANDA. Dynamic structure and binding specifity of the receiver domain of sensor histidine kinase CKI1. Tarragona, Spain: IPGSA conference 2010, 2010, s. 85-86.
      URL
      Název česky: Dynamika struktury a vazebná specifita přijímačové domény senzorové histidinkinázy CKI1
      Název anglicky: Dynamic structure and binding specifity of the receiver domain of sensor histidine kinase CKI1
      Biochemie. angličtina. Španělsko.
      Klíčová slova anglicky: multistep phosphorelay, crystal structure, NMR analysis, CKI1
      Druh sborníku: předkonferenční sborník

      Změnil: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D., učo 96793. Změněno: 29. 4. 2011 15:32.
    8. BENEŠÍK, Martin, Lubomír JANDA, Radka DOPITOVÁ, Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK. Expression cloning of lysis genes from polyvalent staphylococcal bacteriophage. In The student scientific conference on genetically modified organisms. Brno: Masarykova univerzita, 2010, s. 78. ISBN 978-80-210-5160-7.
      URL
      Název česky: Klonování a exprese lytických genů z polyvalentního stafylokokového bakteriofága
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: bacteriophages; lytic enzymes; Stphylococcus; protein preparation
      Druh sborníku: předkonferenční sborník
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842. Změněno: 16. 12. 2010 16:45.
    9. MAREK, Radek, Anežka KŘÍSTKOVÁ, Kateřina MALIŇÁKOVÁ, Jaromír TOUŠEK, Jaromír MAREK, Michal HOCEK, Olga L. MALKINA a Vladimir G. MALKIN. Interpretation of Indirect Nuclear Spin_Spin Couplings in Isomers of Adenine: Novel Approach to Analyze Coupling Electron Deformation Density Using Localized Molecular Orbitals. The Journal of Physical Chemistry A. American Chemical Society, 2010, roč. 114, č. 24, s. 6689-6700. ISSN 1089-5639.
      DOI: 10.1021/jp102186r
      RIV/00216224:14310/10:00044350 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí) -- Křístková, Anežka (203 Česká republika) -- Maliňáková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Toušek, Jaromír (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Jaromír (203 Česká republika, domácí) -- Hocek, Michal (203 Česká republika) -- Malkina, Olga L. (703 Slovensko) -- Malkin, Vladimir G. (703 Slovensko)
      Klíčová slova anglicky: coupling constant; coupling electron deformation density; localized molecular orbitals; adenine
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 21. 4. 2011 17:09.
    10. BENEŠÍK, Martin, Lubomír JANDA, Radka DOPITOVÁ, Jiří DOŠKAŘ a Roman PANTŮČEK. Klonování a exprese lytických genů polyvalentního stafylokokového bakteriofága. In 25. kongres Československej spoločnosti mikrobiologickej „MIKROORGANIZMY A KVALITA ŽIVOTA“. Bratislava - Praha: Československá spoločnosť mikrobiologická, 2010, s. 172.
      URL
      Název anglicky: Cloning and expression of lytic genes from polyvalent staphylococcal bacteriophage
      Genetika a molekulární biologie. čeština. Slovensko.
      Klíčová slova anglicky: Staphylococcus aureus; bacteriophage; cloning; SH3 domain; endolysin
      Druh sborníku: předkonferenční sborník
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., učo 842. Změněno: 19. 10. 2010 18:20.
    11. PAPOUŠKOVÁ, Veronika, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ, Libor KRÁSNÝ a Wiktor KOZMINSKI. NMR as a tool for studies of (partially) disordered proteins and their interactions. In Molecular Perspectives on Protein-Protein Interactions. 2010.
      URL
      Název česky: NMR jako nástroj pro studium (částečně) neuspořádaných proteinů a jejich interakcí
      Název anglicky: NMR as a tool for studies of (partially) disordered proteins and their interactions

      Druh účasti: aktivní účast

      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 23. 11. 2010 13:48.
    12. VICHA, Jan, Radek MAREK a Gabriel DEMO. NMR,X-ray and DFT investigations of Pt(IV) complexes with aromatic cytokinins. In Helsinki Winter School of Quantum chemistry. 2010.
      Název česky: NMR RTG a DFT charakterizace Pt(IV) komplexu s aromatickymi cytokininy
      Název anglicky: R,X-ray and DFT investigations of Pt(IV) complexes with aromatic cytokinins
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: cytokinins Pt(IV)
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Jan Vícha, Ph.D., učo 151272. Změněno: 18. 2. 2011 13:57.
    13. PŘECECHTĚLOVÁ, Jana, Petr NOVÁK, Markéta MUNZAROVÁ, Martin KAUPP a Vladimír SKLENÁŘ. Phosphorus Chemical Shifts in a Nucleic Acid Backbone from Combined Molecular Dynamics and Density Functional Calculations. The Journal of the American Chemical Society. Washington, D.C.: American Chemical Society, 2010, roč. 132, č. 48, s. 17139–17148. ISSN 0002-7863.
      URL
      RIV/00216224:14310/10:00040633 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Přecechtělová, Jana (203 Česká republika, domácí) -- Novák, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Munzarová, Markéta (203 Česká republika, domácí) -- Kaupp, Martin (276 Německo) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: MD DFT nucleic acids NMR phosphorus
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 10. 3. 2011 13:02.
    14. STANDARA, Stanislav, Petr KULHÁNEK, Radek MAREK, Jan HORNÍČEK, Petr BOUŘ a Michal STRAKA. Simulations of 129Xe chemical shift of atomic xenon dissolved in liquid benzene. In Winter School in Theoretical Chemistry 2010 - Accurate Molecular Structure by Experiment and Theory. 2010.

      Klíčová slova anglicky: 129Xe NMR chemical shift ; quantum-chemical calculations ; molecular dynamics ; density functional theory ; Breit-Pauli Perturbation Theory ; relativistic effects

      Změnil: Mgr. Stanislav Standara, učo 43015. Změněno: 29. 12. 2010 13:50.
    15. MOTÁČKOVÁ, Veronika, Hana ŠANDEROVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Jiří NOVÁČEK, Petr PADRTA, Alžběta ŠVENKOVÁ, Jana KORELUSOVÁ, Jiří JONÁK, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. Solution structure of the N-terminal domain of Bacillus subtilis delta subunit of RNA polymerase and its classification based on structural homologs. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. USA: John Wiley and Sons, 2010, roč. 78, č. 7, s. 1807-1810. ISSN 0887-3585.
      Název česky: Struktura N-terminální domény delta podjednotky RNA polymerasy z Bacilla subtila a její klasifikace na základě strukturních homologů
      RIV/00216224:14310/10:00043931 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Motáčková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Švenková, Alžběta (203 Česká republika) -- Korelusová, Jana (203 Česká republika) -- Jonák, Jiří (203 Česká republika) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: RNA polymerase; delta subunit; gram positive bacteria; nuclear magnetic resonance; structural homologues
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 2. 2. 2012 17:31.
    16. MOTÁČKOVÁ, Veronika, Jiří NOVÁČEK, Anna ZAWADZKA-KAZIMIERCZUK, Krzysztof KAZIMIERCZUK, Lukáš ŽÍDEK, Hana ŠANDEROVÁ, Libor KRÁSNÝ, Wiktor KOZMINSKI a Vladimír SKLENÁŘ. Strategy for complete NMR assignment of disordered proteins with highly repetitive sequences based on resolution-enhanced 5D experiments. Journal of Biomolecular NMR. Netherlands: Springer Netherlands, 2010, roč. 48, č. 3, s. 169-177. ISSN 0925-2738.
      URL
      Název česky: Strategie pro kompletní NMR přiřazení nestrukturovaných proteinů s vysokým počtem repeticí v sekvenci
      Název anglicky: Strategy for complete NMR assignment of disordered proteins with highly repetitive sequences based on resolution-enhanced 5D experiments
      RIV/00216224:14310/10:00045112 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Motáčková, Veronika (203 Česká republika, garant, domácí) -- Nováček, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Zawadzka-Kazimierczuk, Anna (616 Polsko) -- Kazimierczuk, Krzysztof (616 Polsko) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Šanderová, Hana (203 Česká republika) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Kozminski, Wiktor (616 Polsko) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Unfolded proteins; Repetitive sequence; Multi-dimensional NMR; Non-uniform sampling; Assignment
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 2. 2. 2012 17:33.
    17. MOTÁČKOVÁ, Veronika, Pavel KADEŘÁVEK, Lukáš ŽÍDEK, Hana ŠANDEROVÁ, Petr PADRTA, Jiří NOVÁČEK, Alžběta ŠVENKOVÁ, Jana KORELUSOVÁ, Anna ZAWADZKA-KAZIMIERCZUK, Krzysztof KAZIMIERCZUK, Wiktor KOŹMIŃSKI, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. Structure and dynamics of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria. In Joint EUROMAR 2010 and 17th ISMAR Conference. 2010.
      URL
      Název česky: Struktura a dynamika podjednotky RNA polymerazy specifické pro gram-pozitivní bakterie
      Název anglicky: Structure and dynamics of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria
      Biochemie.
      Klíčová slova anglicky: RNA polymerase; delta subunit; gram-positive bacteria; structure; validation; structural homologues; dynamics
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 19. 10. 2010 10:54.
    18. KADEŘÁVEK, Pavel, Veronika MOTÁČKOVÁ, Petr PADRTA, Carl DIEHL, Hana ŠANDEROVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ, Vladimír SKLENÁŘ a Mikael AKKE. Structure and dynamics of delta subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis. In International school of biological magnetic resonance, 10th Course, Biophysics and Structure to Counter Threats and Challenges, Erice 2010. 2010.
      URL
      Změnil: Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D., učo 106653. Změněno: 3. 7. 2010 19:38.
    19. MOTÁČKOVÁ, Veronika, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Structure determination of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria. In XIV. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. 2010. ISBN 978-80-210-5164-5.
      URL
      Název česky: Popis struktury podjednotky RNA polymerasy specificke pro gram-pozitivni bakterie
      Název anglicky: Structure determination of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria

      Klíčová slova anglicky: nmr, delta subunit, RNA polymerase, gram-positive bacteria, assignment, structure, validation, structural homologs, alignment

      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 3. 1. 2011 13:36.
    20. KOVALOVÁ, Anna, Miroslav LEDVINA, David ŠAMAN, Daniel ZYKA, Monika KUBÍČKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ, Petr POMPACH, Daniel KAVAN, Jan BILÝ, Ondřej VANĚK, Zuzana KUBÍNKOVÁ, Markéta VANČUROVÁ, Mária ANTOLÍKOVÁ, Zuzana LEJSKOVÁ, Hynek MRÁZEK, Daniel ROZBESKÝ, Kateřina HOFBAUEROVÁ, Vladimír KŘEN a Karel BEZOUŠKA. Synthetic N-acetylglucosamine based fully branched tetrasaccharide, a mimetic of the endogenous ligand for CD69, activates CD69+ NK cells and killer lymphocytes upon dimerization via a hydrophilic flexible linker. Journal of Medicinal Chemistry. USA: American Chemical Society, 2010, roč. 53, č. 10, s. 4050-4065. ISSN 0022-2623.
      RIV/00216224:14310/10:00044042 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Kovalová, Anna (203 Česká republika) -- Ledvina, Miroslav (203 Česká republika) -- Šaman, David (203 Česká republika) -- Zyka, Daniel (203 Česká republika) -- Kubíčková, Monika (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí) -- Pompach, Petr (203 Česká republika) -- Kavan, Daniel (203 Česká republika) -- Bilý, Jan (203 Česká republika) -- Vaněk, Ondřej (203 Česká republika) -- Kubínková, Zuzana (203 Česká republika) -- Vančurová, Markéta (203 Česká republika) -- Antolíková, Mária (203 Česká republika) -- Lejsková, Zuzana (203 Česká republika) -- Mrázek, Hynek (203 Česká republika) -- Rozbeský, Daniel (203 Česká republika) -- Hofbauerová, Kateřina (203 Česká republika) -- Křen, Vladimír (203 Česká republika) -- Bezouška, Karel (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Lymphocyte activation; receptors for carbohydrates; crosslinking; natural killer cells; tumor immunotherapies
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 2. 4. 2014 12:40.
    21. NOVÁK, Petr, Lukáš ŽÍDEK, Veronika MOTÁČKOVÁ, Petr PADRTA, Alžbeta ŠVENKOVÁ, Jean Marc NUZILLARD, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. S3EPY: a Sparky extension for determination of small scalar couplings from spin-state-selective excitation NMR experiments. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer Netherlands, 2010, roč. 46, č. 2, s. 191-197. ISSN 0925-2738.
      URL
      RIV/00216224:14310/10:00043623 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Novák, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Motáčková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Švenková, Alžbeta (703 Slovensko) -- Nuzillard, Jean Marc (250 Francie) -- Krásný, Libor (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Software - Sparky - Residual dipolar couplings - NMR

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 2. 5. 2012 16:12.
    22. PEKÁROVÁ, Blanka, Tomáš KLUMPLER, Olga TŘÍSKOVÁ, Jakub HORÁK, Lukáš ŽÍDEK, Jaromír MAREK, Radka DOPITOVÁ, Jan HEJÁTKO a Lubomír JANDA. The receiver domain of sensor histidine kinase of CKI1: its dynamic structure and binding specificity. 1. vyd. Suzhou, China: Cold Spring Harbor Conferences Asia, 2010, s. 47.
      URL
      Název anglicky: The receiver domain of sensor histidine kinase of CKI1: its dynamic structure and binding specificity.
      Biochemie. angličtina. Čína.
      Klíčová slova anglicky: vícekomponentní fosforylace, 3-D struktura, NMR analýza
      Druh sborníku: předkonferenční sborník

      Změnil: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D., učo 96793. Změněno: 29. 4. 2011 15:31.
    23. STANDARA, Stanislav, Kateřina MALIŇÁKOVÁ, Radek MAREK, Jaromír MAREK, Michal HOCEK, Juha VAARA a Michal STRAKA. Understanding the NMR chemical shifts for 6-halopurines : role of structure, solvent and relativistic effects. Physical Chemistry Chemical Physics. Cambridge: Royal Society of Chemistry, 2010, roč. 12, č. 19, s. 5126–5139. ISSN 1463-9076. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/b921383j.
      DOI: 10.1039/b921383j
      RIV/00216224:14310/10:00044318 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Standara, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Maliňáková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí) -- Marek, Jaromír (203 Česká republika, domácí) -- Hocek, Michal (203 Česká republika) -- Vaara, Juha (246 Finsko) -- Straka, Michal (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: NMR;chemical shifts;purines;halopurines;DFT;BPPT;solvent effects;relativistic effects
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 5. 1. 2012 14:20.
    24. VÍCHA, Jan, Michal MALOŇ, Petra VESELÁ, Otakar HUMPA, Miroslav STRNAD a Radek MAREK. 1H, 13C, and 15N NMR chemical shifts for selected glucosides and ribosides of aromatic cytokinins. Magnetic Resonance in Chemistry. West Sussex: John Wiley & Sons, Ltd., 2010, roč. 2010, č. 4, s. 318-322. ISSN 0749-1581.
      DOI: 10.1002/mrc.2575
      RIV/00216224:14310/10:00043297 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Vícha, Jan (203 Česká republika, domácí) -- Maloň, Michal (203 Česká republika) -- Veselá, Petra (203 Česká republika, domácí) -- Humpa, Otakar (203 Česká republika, domácí) -- Strnad, Miroslav (203 Česká republika) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: H-1; C-13; N-15; 1H-15N coupling constants; plant hormone; aromatic cytokinin; purine; glucoside; riboside
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 21. 4. 2011 16:52.
    25. MALIŇÁKOVÁ, Kateřina, Lucie NOVOSADOVÁ, Manu LAHTINEN, Erkki KOLEHMAINEN, Jiří BRUS a Radek MAREK. 13C Chemical Shift Tensors in Hypoxanthine and 6-Mercaptopurine : Effects of Substitution, Tautomerism, and Intermolecular Interactions. The Journal of Physical Chemistry A. Washington: Americal Chemical Society, 2010, roč. 114, č. 4, s. 1985-1995. ISSN 1089-5639. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/jp9100619.
      DOI: 10.1021/jp9100619
      Název česky: 13C tenzory chemického posunu u hypoxanthinu a 6-merkaptopurinu : Vliv substituce, tautomerie a mezimolekulárních interakcí
      RIV/00216224:14310/10:00042954 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Maliňáková, Kateřina (203 Česká republika, domácí) -- Novosadová, Lucie (203 Česká republika, domácí) -- Lahtinen, Manu (246 Finsko) -- Kolehmainen, Erkki (246 Finsko) -- Brus, Jiří (203 Česká republika) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: solid-state NMR; DFTcalculations; X-ray powder diffraction; hydrogen bonding; stacking interactions
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 20. 6. 2013 19:35.

    2009

    1. KADEŘÁVEK, Pavel, Carl DIEHL, Veronika MOTÁČKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ a Mikael AKKE. Backbone dynamics of N-terminal Domain of the Delta Subunit of Bacterial RNA Polymerase. In Structural Biology Network 13th Annual Conference. 2009.
      URL
      Změnil: Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D., učo 106653. Změněno: 3. 7. 2010 19:04.
    2. MOTÁČKOVÁ, Veronika, Monika KUBÍČKOVÁ, Milan KOŽÍŠEK, Klára GRANTZ ŠAŠKOVÁ, Martin ŠVEC, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Backbone 1H, 13C, and 15N NMR assignment for the inactive form of the retroviral protease of the murine intracisternal A-type particle, inMIA-14 PR. Biomolecular NMR Assignments. Netherlands: Springer Netherlands, 2009, roč. 3, č. 2, s. 261-264. ISSN 1874-2718.
      Název česky: Backbone 1H, 13C, and 15N NMR assignment for the inactive form of the retroviral protease of the murine intracisternal A-type particle, inMIA-14 PR
      RIV/00216224:14310/09:00037169 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Motáčková, Veronika (203 Česká republika, domácí) -- Kubíčková, Monika (203 Česká republika, domácí) -- Kožíšek, Milan (203 Česká republika) -- Grantz Šašková, Klára (203 Česká republika) -- Švec, Martin (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Retroviral protease; Murine intracisternal A-type particles; inMIA-14 PR; C-terminal domain; Homodimer; Assignment A-type particles \and inMIA-14 PR \and C-terminal domain; Homodimer; Assignment
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 2. 2. 2012 17:37.
    3. KLUMPLER, Tomáš, Blanka PEKÁROVÁ, Jaromír MAREK, Petra BORKOVCOVÁ, Lubomír JANDA a Jan HEJÁTKO. Cloning, purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of the receiver domain of the histidine kinase CKI1 from Arabidopsis thaliana. Acta Crystallographica Section F. 2009, roč. 2009, F65, s. 478-481. ISSN 1744-3091.
      Název česky: Cloning, purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of the receiver domain of the histidine kinase CKI1 from Arabidopsis thaliana.
      Název anglicky: Cloning, purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of the receiver domain of the histidine kinase CKI1 from Arabidopsis thaliana.
      RIV/00216224:14310/09:00036140 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Klumpler, Tomáš (203 Česká republika, garant) -- Pekárová, Blanka (203 Česká republika) -- Marek, Jaromír (203 Česká republika) -- Borkovcová, Petra (203 Česká republika) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: receiver domains; two-component systems; histidine kinases; cytokinins; phosphorelay; CKI1
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D., učo 2658. Změněno: 23. 8. 2010 10:35.
    4. KLUMPLER, Tomáš, Blanka PEKÁROVÁ, Jaromir MAREK, Lubomír JANDA a Jan HEJÁTKO. Crystal structure of CKI1 receiver domain from Arabidopsis. In 7th International Conference of Ph.D Students on Experimental Plant Biology "News - what the plants told us". Brno. 2009. ISBN 978-80-7375-310-8.
      RIV/00216224:14310/09:00039825 Konferenční abstrakt. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Klumpler, Tomáš (203 Česká republika, garant) -- Pekárová, Blanka (203 Česká republika) -- Marek, Jaromir (203 Česká republika) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Arabidopsis cytokinin signaling CKI1 crystallography crystal structure

      Změnil: Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D., učo 55204. Změněno: 31. 3. 2010 10:36.
    5. KLUMPLER, Tomáš, Blanka PEKÁROVÁ, Jaromír MAREK, Pavla BORKOVCOVÁ, Lubomír JANDA a Jan HEJÁTKO. Crystal structure of the receiver domain of the histidine kinase CKI1 from Arabidopsis thaliana. In Kolokvium - Struktura 2009. 2009. ISSN 1211-5894.
      Název anglicky: Crystal structure of the receiver domain of the histidine kinase CKI1 from Arabidopsis thaliana
      RIV/00216224:14310/09:00039824 Konferenční abstrakt. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Klumpler, Tomáš (203 Česká republika, garant) -- Pekárová, Blanka (203 Česká republika) -- Marek, Jaromír (203 Česká republika) -- Borkovcová, Pavla (203 Česká republika) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: histidinkinase CKI1 Arabidopsis cytokinin signaling crystal structure
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D., učo 55204. Změněno: 31. 3. 2010 10:51.
    6. KLUMPLER, Tomáš, Blanka PEKÁROVÁ, Marek MAREK, Petra BORKOVCOVÁ, Lubomír JANDA a Jan HEJÁTKO. CRYSTALLIZATION AND X-RAY ANALYSIS OF THE RECEIVER DOMAIN OF THE HISTIDINE KINASE CKI1 FROM ARABIDOPSIS THALIANA. In Auxins and Cytokinins in Plant Development International symposium (ACPD 2009). 2009.
      Název anglicky: CRYSTALLIZATION AND X-RAY ANALYSIS OF THE RECEIVER DOMAIN OF THE HISTIDINE KINASE CKI1 FROM ARABIDOPSIS THALIANA
      RIV/00216224:14310/09:00039830 Konferenční abstrakt. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Klumpler, Tomáš (203 Česká republika) -- Pekárová, Blanka (203 Česká republika) -- Marek, Marek (203 Česká republika) -- Borkovcová, Petra (203 Česká republika) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: Crystal sructure; Histidin kinase; cytokinin signaling; CKI1
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D., učo 96793. Změněno: 9. 4. 2010 15:03.
    7. NOVÁK, Petr, Vladimír SKLENÁŘ a Radovan FIALA. C-13 Chemical Shifts – Structure Relationships In Nucleic Acids. In 24th NMR Valtice - Central European NMR Meeting. 2009. ISBN 978-80-86441-40-5.
      URL
      Název česky: Vztah struktury a chemických posunů C-13 v nukleových kyselinách
      Název anglicky: C-13 Chemical Shifts – Structure Relationships In Nucleic Acids
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: NMR spectroscopy, nucleic acids, structure, chemical shift
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc., učo 564. Změněno: 7. 1. 2010 10:47.
    8. TŘÍSKOVÁ, Olga, Blanka PEKÁROVÁ, Veronika MOTÁČKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ, Jaromír MAREK a Lubomír JANDA. Effects of magnesium binding and beryllofluoridation on a component of the cytokinin signaling pathway studied by nuclear magnetic resonance. 2009.
      Název česky: Účinek navázání Mg(2+) a BeF3 na část cytokininové dráhy studované pomocí nukleární magnetické rezonance
      Název anglicky: Effects of magnesium binding and beryllofluoridation on a component of the cytokinin signaling pathway studied by nuclear magnetic resonance

      Změnil: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D., učo 96793. Změněno: 9. 4. 2010 15:19.
    9. PAZDERSKI, Leszek, Jaromír TOUŠEK, Jerzy SITKOWSKI, Kateřina MALIŇÁKOVÁ, Lech KOZERSKI a Edward SZLYK. Experimental and quantum-chemical studies of 1H, 13C and 15N NMR coordination shifts in Au(III), Pd(II) and Pt(II) chloride complexes with picolines. Magnetic Resonance in Chemistry. John Wiley & Sons, 2009, roč. 47, č. 3, 11 s. ISSN 1097-458X.
      Název česky: Studium 1H, 13C a 15N NMR chemických posunů v pikolinových komplexech s chloridy Au(III), Pd(II) and Pt(II) experimentálními a kvantově chemickými metodami
      RIV/00216224:14310/09:00035037 Článek v odborném periodiku. Organická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Pazderski, Leszek (616 Polsko) -- Toušek, Jaromír (203 Česká republika, garant) -- Sitkowski, Jerzy (616 Polsko) -- Maliňáková, Kateřina (203 Česká republika) -- Kozerski, Lech (616 Polsko) -- Szlyk, Edward (616 Polsko)
      Klíčová slova anglicky: 15N NMR; 1H NMR; 13C NMR; 15N CPMAS; methylpyridines; picolines; gold complexes; palladium complexes; platinum complexes; NMR coordination shifts

      Změnila: Mgr. Kateřina Bouzková, Ph.D., učo 41974. Změněno: 28. 2. 2010 14:25.
    10. COBO, Marcio Fernando, Kateřina MALIŇÁKOVÁ, Detlef REICHERT, Kay SAALWÄCHTER a Eduardo Ribeiro DEAZEVEDO. Intermediate motions and dipolar couplings as studied by Lee-Goldburg cross-polarization NMR: Hartmann-Hahn matching profiles. Physical Chemistry Chemical Physics. Great Britain: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2009, roč. 11, č. 32, s. 7036-7047. ISSN 1463-9076.
      RIV/00216224:14310/09:00036437 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Cobo, Marcio Fernando (76 Brazílie) -- Maliňáková, Kateřina (203 Česká republika, garant) -- Reichert, Detlef (276 Německo) -- Saalwächter, Kay (276 Německo) -- deAzevedo, Eduardo Ribeiro (76 Brazílie)
      Klíčová slova anglicky: Lee-Goldburg cross-polarization; molecular motion in the intermediate regime; Hartmann-Hahn matching profiles; heteronuclear dipolar coupling
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Kateřina Bouzková, Ph.D., učo 41974. Změněno: 28. 2. 2010 14:25.
    11. MATEJKOVÁ, Michaela, Jitka ŽÍDKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Michaela WIMMEROVÁ, Josef CHMELÍK a Vladimír SKLENÁŘ. Investigation of Thermal Denaturation of Barley Nonspecific Lipid Transfer Protein 1 (ns-LTP1b) by Nuclear Magnetic Resonance and Differential Scanning Calorimetry. Journal of Agricultural and Food Chemistry. WASHINGTON: AMER CHEMICAL SOC, 2009, roč. 57, č. 18, s. 8444-8452. ISSN 0021-8561.
      Název česky: Zkoumání teplotních denaturací nespecifického lipid transfer proteinu 1 (ns-LTP1b) pomocí nukleární magnetické resonance a diferenciální skenovací kalorimetrie
      Název anglicky: Investigation of Thermal Denaturation of Barley Nonspecific Lipid Transfer Protein 1 (ns-LTP1b) by Nuclear Magnetic Resonance and Differential Scanning Calorimetry
      RIV/00216224:14310/09:00036779 Článek v odborném periodiku. Potravinářství. angličtina. Spojené státy.
      Matejková, Michaela (703 Slovensko, domácí) -- Žídková, Jitka (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant, domácí) -- Wimmerová, Michaela (203 Česká republika, domácí) -- Chmelík, Josef (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Non-specific lipid transfer protein 1; barley grain; thermaldenaturation; nuclear magnetic resonance; differential scanningcalorimetry
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 9. 3. 2015 05:39.
    12. BATHULA, Sreenivas Reddy, Jan PALEČEK, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. MAGE (melanoma-associated antigen) Domain structural studies using NMR. In Central European NMR Meeting, Valtice, CR. 2009.
      Název česky: Studium MAGE domény pomocí NMR spektroskopie
      Název anglicky: MAGE (melanoma-associated antigen) Domain structural studies using NMR
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: melanoma antigen MAGE protein NMR
      Druh účasti: aktivní účast

      Změnil: Mgr. Sreenivas Reddy Bathula, Ph.D., učo 249633. Změněno: 14. 11. 2011 22:15.
    13. PEKÁROVÁ, Blanka, Olga TŘÍSKOVÁ, Lukáš ŽÍDEK, Jaromír MAREK, Jakub HORÁK, Radka DOPITOVÁ, Jan HEJÁTKO a Lubomír JANDA. NMR analyses of the receiver domain of CKI1 histidine kinase and its interaction with AHP proteins. In ACPD 2009 : Auxins and Cytokinins in Plant Development International Symposium. 2009.
      URL
      Název anglicky: NMR analyses of the receiver domain of CKI1 histidine kinase and its interaction with AHP proteins
      RIV/00216224:14310/09:00039607 Konferenční abstrakt. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Pekárová, Blanka (203 Česká republika) -- Třísková, Olga (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Marek, Jaromír (203 Česká republika) -- Horák, Jakub (203 Česká republika) -- Dopitová, Radka (203 Česká republika) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika, garant) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Histidine Kinase; CKI1; receiver domain; AHP proteins
      Druh sborníku: předkonferenční sborník

      Změnila: Mgr. Radka Dopitová, Ph.D., učo 12868. Změněno: 9. 4. 2010 15:01.
    14. MOTÁČKOVÁ, Veronika, Hana ŠANDEROVÁ, Jiří NOVÁČEK, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. NMR structural study of N-terminal domain of RNA polymerase delta subunit from Bacillus subtilis. In VII Discussions in Structural Molecular Biology Nové Hrady. 2009. ISSN 1211-5894.
      Název česky: NMR strukturní studie N-terminální domény delta podjednotky RNA polymerasy z Bacilla subtila

      Klíčová slova anglicky: nmr; RNA polymerase; delta subunit; assignment; structure
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 4. 5. 2009 10:00.
    15. MACEK, Pavel, Josef CHMELÍK, Ivana KŘÍŽOVÁ, Pavel KADEŘÁVEK, Petr PADRTA, Lukáš ŽÍDEK, Marcela WILDOVÁ, Romana HADRAVOVÁ, Radka CHALOUPKOVÁ, Iva PICHOVÁ, Tomáš RUML, Michaela RUMLOVÁ a Vladimír SKLENÁŘ. NMR Structure of the N-Terminal Domain of Capsid Protein from the Mason-Pfizer Monkey Virus. Journal of Molecular Biology. 2009, roč. 392, č. 1, s. 100-114. ISSN 0022-2836.
      Název česky: NMR struktura N-terminální domény kapsidového proteinu Mason-Pfizerova opičího viru
      RIV/00216224:14310/09:00036514 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Macek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Chmelík, Josef (203 Česká republika, domácí) -- Křížová, Ivana (203 Česká republika) -- Kadeřávek, Pavel (203 Česká republika) -- Padrta, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Wildová, Marcela (203 Česká republika) -- Hadravová, Romana (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Pichová, Iva (203 Česká republika) -- Ruml, Tomáš (203 Česká republika) -- Rumlová, Michaela (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: M-PMV; betaretroviruses; capsid protein; NMR structure; internal dynamics
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 10. 3. 2011 13:05.
    16. NOVÁK, Petr, Vladimír SKLENÁŘ a Radovan FIALA. Prediction of C-13 chemical shifts in nucleic acids. In 7th Discussions in Structural Molecular Biology and Bioinformatics. 2009.
      Materials Structure in Chemistry, Biology, Physics and Technology, ISSN 1211 – 5894
      Název česky: Predikce chemických posunů C-13 v nukleových kyselinách
      Název anglicky: Prediction of C-13 chemical shifts in nucleic acids
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: NMR spectroscopy, nucleic acids, structure, chemical shift
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc., učo 564. Změněno: 7. 1. 2010 10:13.
    17. MOTÁČKOVÁ, Veronika, Hana ŠANDEROVÁ, Jiří NOVÁČEK, Lukáš ŽÍDEK, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. Structural study of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria. In Central European NMR Meeting Valtice. 2009. ISBN 978-80-86441-40-5.
      Název česky: Strukturní studie podjednotky RNA polymerasy specifické pro gram-positivní bakterie
      Název anglicky: Structural study of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria

      Klíčová slova anglicky: nmr, rna polymerase, assignment, structure, validation
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 30. 4. 2009 12:46.
    18. STANDARA, Stanislav, Kateřina MALIŇÁKOVÁ, Radek MAREK, Jaromír MAREK, Michal HOCEK, Michal STRAKA a Juha VAARA. Understanding the NMR Chemical Shifts for 6-halopurines: Role of Structure, Solvent, and Relativistic Effects. In Modeling Interactions in Biomolecules IV. Praha: MATFYZPRESS, Publishing House of the Faculty of Mathematics and Physics, Charles University in Prague, 2009, s. 80-80.
      Název česky: NMR chemické posuny 6-halogenpurinů: vliv struktury, solventu a relativistických efektů
      Název anglicky: Understanding the NMR Chemical Shifts for 6-halopurines: Role of Structure, Solvent, and Relativistic Effects
      Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: NMR; chemical shifts; quantum chemical calculations; DFT; BPPT; relativistic effects; solvent effects; Breit-Pauli perturbation theory
      Druh sborníku: předkonferenční sborník

      Změnil: Mgr. Stanislav Standara, učo 43015. Změněno: 23. 9. 2009 10:59.

    2008

    1. PŘECECHTĚLOVÁ, Jana, Petr NOVAK a Vladimír SKLENÁŘ. Calculation of 13C chemical shifts in Pseudoknot. 2008.
      Název česky: Calculation of 13C chemical shifts in Pseudoknot
      Název anglicky: Calculation of 13C chemical shifts in Pseudoknot
      Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Nizozemské království.
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Jana Pavlíková Přecechtělová, Ph.D., učo 14825. Změněno: 19. 12. 2008 13:53.
    2. DOPITOVÁ, Radka, Pavel MAZURA, Lubomír JANDA, Radka CHALOUPKOVÁ, Petr JEŘÁBEK, Jiří DAMBORSKÝ, Tomáš FILIPI, Nagavalli S. KIRAN a Břetislav BRZOBOHATÝ. Functional analysis of the aglycone - binding site of the maize beta-glucosidase Zm-p60.1. FEBS Journal. 2008, roč. 275, č. 24, s. 6123-6135. ISSN 1742-464X.
      Název česky: Funkční analýza aglykon vazebného místa kukuřičné beta glukosidasy Zm-p60.1
      Název anglicky: Functional analysis of the aglycone - binding site of the maize beta-glucosidase Zm-p60.1
      RIV/00216224:14310/08:00027235 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Dopitová, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Mazura, Pavel (203 Česká republika) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, domácí) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika, domácí) -- Jeřábek, Petr (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika, domácí) -- Filipi, Tomáš (203 Česká republika) -- Kiran, Nagavalli S. (356 Indie) -- Brzobohatý, Břetislav (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: aglycone-binding site; Brassica napus; substrate specificity; Zea mays; b-glucosidase

      Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 18. 1. 2012 08:22.
    3. ŠMAJS, David, Magda DOLEŽALOVÁ, Pavel MACEK a Lukáš ŽÍDEK. Inactivation of colicin Y by intramembrane helix helix interaction with its immunity protein. FEBS Journal. 2008, roč. 275, č. 21, s. 5325 - 5331. ISSN 1742-464X.
      Název česky: Inaktivace kolicinu Y jeho imunitním proteinem
      Název anglicky: Inactivation of colicin Y by intramembrane helixhelix interaction with its immunity protein
      RIV/00216224:14310/08:00027657 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Šmajs, David (203 Česká republika, garant) -- Doležalová, Magda (203 Česká republika) -- Macek, Pavel (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: colicin immunity; colicin Y; helix helix interaction; pore orming colicin; site drected mutagenesis
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 8. 6. 2010 10:40.
    4. MOTÁČKOVÁ, Veronika, Monika KUBÍČKOVÁ, Martin ŠVEC, Milan KOŽÍŠEK, Lukáš ŽÍDEK, Jan KONVALINKA a Vladimír SKLENÁŘ. NMR study of a single-stranded DNA binding to the C-terminal domain of the protease from murine intracisternal A-type particle. In XXIII International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems San Diego. 2008.
      Název česky: NMR studie retrovirové proteasy se zaměřením na vazbu jednovláknových nukleových kyselin k C-terminální doméně
      Název anglicky: NMR study of a single-stranded DNA binding to the C-terminal domain of the protease from murine intracisternal A-type particle

      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D., učo 106467. Změněno: 30. 4. 2009 13:02.
    5. PRECECHTELOVA, Jana, Petr PADRTA, Marketa MUNZAROVA a Vladimír SKLENÁŘ. P-31 Chemical Shift Tensors in Nucleic Acids from the Quantum Chemistry Point of View. In 23rd NMR Valtice. 2008. vyd. Brno: Masaryk University, 2008, s. 7. ISBN 978-80-86441-39-9.
      Název česky: Tenzory 31P chemickeho posunu v nukleovych kyselinach z pohledu kvantove chemie
      Název anglicky: P-31 Chemical Shift Tensors in Nucleic Acids from the Quantum Chemistry Point of View
      Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: NMR, DFT, nucleic acids, chemical shift

      Změnila: Mgr. Jana Pavlíková Přecechtělová, Ph.D., učo 14825. Změněno: 27. 6. 2008 14:12.
    6. MAREK, Jaromír, Tomáš KLUMPLER, Blanka PEKÁROVÁ, Petra BORKOVCOVÁ, Jan HEJÁTKO a Lubomír JANDA. Structure of CKI1RD, the receiver domain of the histidine kinase CKI1 from Arabidopsis thaliana. In XXI Congress and Assembly of the International Union of Crystallography (IUCr2008) - Book of Abstracts. 2008. ISSN 0108-7673.
      Název česky: Struktura CKI1RD, přijímačové domény histidinové kinázy CKI1 z Arabidopsis thaliana
      Název anglicky: Structure of CKI1RD, the receiver domain of the histidine kinase CKI1 from Arabidopsis thaliana
      RIV/00216224:14310/08:00027326 Konferenční abstrakt. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Japonsko.
      Marek, Jaromír (203 Česká republika, garant) -- Klumpler, Tomáš (203 Česká republika) -- Pekárová, Blanka (203 Česká republika) -- Borkovcová, Petra (203 Česká republika) -- Hejátko, Jan (203 Česká republika) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: RESPONSE REGULATOR; TWO-COMPONENT SYSTEM; HISTIDINE KINASE; CYTOKININ; PHOSPHORELAY; CKI1; CHEY; ETR; PLANT; PROTEIN
      Druh sborníku: předkonferenční sborník
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: doc. RNDr. Jaromír Marek, Ph.D., učo 1989. Změněno: 9. 4. 2010 14:49.
    7. MALIŇÁKOVÁ, Kateřina, Stanislav STANDARA a Radek MAREK. 13C CHEMICAL SHIFT TENSORS IN REGIOISOMERS OF N-SUBSTITUTED ADENINES. In 23rd NMR Valtice. 2008. ISBN 978-80-86441-39-9.
      Název česky: Tenzory chemického posunu uhlíku 13C v regioizomerech substituovaných adeninů
      RIV/00216224:14310/08:00025914 Konferenční abstrakt. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Maliňáková, Kateřina (203 Česká republika) -- Standara, Stanislav (203 Česká republika) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: adenine; regioisomers; 13C chemical shift tensors

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 9. 4. 2010 17:29.
    8. MACEK, Pavel, Lukáš ŽÍDEK, Michaela RUMLOVÁ, Ivana PÍCHOVÁ a Vladimír SKLENÁŘ. 1H, 13C, and 15N Resonance Assignment of the N-terminal Domain of Mason-Pfizer Monkey Virus Capsid Protein, CA1-140. Biomolecular NMr Assignments. Netherlands: Springer Netherlands, 2008, roč. 2, č. 1, s. 43-45. ISSN 1874-2718.
      Název česky: Přiřazení signálů 1H, 13C, and 15N N-terminální domény kapsidového proteinu Mason-Pfizer opičího viru, CA1-140.
      RIV/00216224:14310/08:00026072 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Macek, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Rumlová, Michaela (203 Česká republika) -- Píchová, Ivana (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí)
      Klíčová slova anglicky: Mason-Pfizer Virus NMr assigments capsid protein N-terminal domain
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 10. 3. 2011 13:06.
    9. PŘECECHTĚLOVÁ, Jana, Petr PADRTA, Markéta MUNZAROVÁ a Vladimír SKLENÁŘ. 31P Chemical Shift Tensors for Canonical and Non-Canonical Nucleic Acid Conformations: DFT Calculations and NMR Implications. Journal of Physical Chemistry B. American Chemical Society, 2008, roč. 112, č. 11, s. 3470-3478. ISSN 1520-6106.
      Název česky: Tenzory 31P chemickeho posunu pro kanonické a nekanonické konformace nukleových kyselin. DFT výpočty a NMR implikace.
      Název anglicky: 31P Chemical Shift Tensors for Canonical and Non-Canonical Nucleic Acid Conformations: DFT Calculations and NMR Implications.
      RIV/00216224:14310/08:00026071 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Přecechtělová, Jana (203 Česká republika) -- Padrta, Petr (203 Česká republika) -- Munzarová, Markéta (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: NMR chemical shift tensor 31P nucleic acids RDC
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 1. 7. 2009 16:47.

    2007

    1. MACEK, Pavel, Petr NOVÁK, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Backbone Motions of Free and Pheromone-Bound Major Urinary Protein I Studied by Molecular Dynamics Simulation. Journal of Physical Chemistry B. USA: The American Chemical Society, 2007, roč. 111, č. 20, s. 5731-5739. ISSN 1089-5639.
      Název česky: Backbone Motions of Free and Pheromone-Bound Major Urinary Protein I Studied by Molecular Dynamics Simulation
      RIV/00216224:14310/07:00022171 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Spojené státy.
      Macek, Pavel (203 Česká republika) -- Novák, Petr (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: Molecular dynamics; order parameter; NMR relaxation; motional analysis

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 11. 6. 2007 15:46.
    2. PRECECHTELOVA, Jana, Markéta MUNZAROVÁ a Vladimír SKLENÁŘ. Conformational Dependence of 31P Chemical Shift Tensors in Nucleic Acids. In Viral RNA: Structure, Function and Targeting. Heidelberg: EMBL Heidelberg, 2007, s. 8-8.
      Název česky: Konformacni zavislost tenzoru 31P chemickeho posunu v nukleovych kyselinach
      Název anglicky: Conformational Dependence of 31P Chemical Shift Tensors in Nucleic Acids
      Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: RNA; Structure; Function
      Druh sborníku: postkonferenční sborník
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Jana Pavlíková Přecechtělová, Ph.D., učo 14825. Změněno: 27. 6. 2008 13:33.
    3. MACEK, Pavel, Petr NOVÁK, Hana KŘÍŽOVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Dynamics of major urinary protein-pheromone interactions: Insight by NMR and MD simulations. In ISMAR 2007, Program and Abstracts. Taiwan: Taiwan Magnetic Resonance Society, 2007, s. 63-63.
      URL
      Název česky: Dynamika interakce močovinového proteinu s feromonem: Studie pomocí NMR spektroskopie a MD simulací.
      RIV/00216224:14310/07:00022902 Stať ve sborníku. Biofyzika. angličtina. Tchaj-wan.
      Macek, Pavel (203 Česká republika) -- Novák, Petr (203 Česká republika) -- Křížová, Hana (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: NMR; relaxation; protein-ligand interactions; internal dynamics; N-15; MD simulations;
      Druh sborníku: předkonferenční sborník
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 20. 6. 2008 12:55.
    4. FOHLEROVÁ, Radka, Pavel MAZURA, Lubomír JANDA, Radka CHALOUPKOVÁ, Petr JEŘÁBEK, Jiří DAMBORSKÝ a Břetislav BRZOBOHATÝ. Functional analysis of aglycone-binding site of the maize beta-glucosidase Zm-p60.1. In IPGSA 19th Annual Meeting-Abstracts. 2007.
      Název česky: Funkční analýza aglykon-vazebného místa kukuřičné beta-glukozidázy Zm-p60.1
      Název anglicky: Functional analysis of aglycone-binding site of the maize beta-glucosidase Zm-p60.1
      RIV/00216224:14310/07:00019506 Konferenční abstrakt. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Fohlerová, Radka (203 Česká republika) -- Mazura, Pavel (203 Česká republika) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Jeřábek, Petr (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika) -- Brzobohatý, Břetislav (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: functional analysis; Beta-Glucosidase Zm.p60.1; active site

      Změnila: Mgr. Radka Dopitová, Ph.D., učo 12868. Změněno: 9. 4. 2010 15:01.
    5. FOHLEROVÁ, Radka, Pavel MAZURA, Lubomír JANDA, Radka CHALOUPKOVÁ, Petr JEŘÁBEK, Jiří DAMBORSKÝ a Břetislav BRZOBOHATÝ. Funkční analýza aglykon-vazebného místa kukuřičné beta-glukozidázy Zm-p60.1. In Bulletin České společnosti experimentální biologie rostlin a Fyziologické sekce Slovenské botanické společnosti. Olomouc: Česká společnost experimentální biologie rostlin, 2007, s. 106-106, 143 s. ISSN 1213-6670.
      Název česky: Funkční analýza aglykon-vazebného místa kukuřičné beta-glukozidázy Zm-p60.1
      Název anglicky: Functional analysis of aglycone-binding site of the maize beta glucosidase Zm-p60.1
      RIV/00216224:14310/07:00019507 Stať ve sborníku. Biochemie. čeština. Česká republika.
      Fohlerová, Radka (203 Česká republika) -- Mazura, Pavel (203 Česká republika) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika) -- Chaloupková, Radka (203 Česká republika) -- Jeřábek, Petr (203 Česká republika) -- Damborský, Jiří (203 Česká republika) -- Brzobohatý, Břetislav (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: functional analysis; Beta-glucosidase Zm-p60.1; active site

      Změnila: Mgr. Radka Dopitová, Ph.D., učo 12868. Změněno: 26. 3. 2010 17:44.
    6. SPURNÝ, Radovan, Kamaran ABDOULRAHMAN, Lubomír JANDA, Dominik RUNZLER, Gottfried KOHLER, Maria CASTANON a Gerhard WICHE. Oxidation and Nitrosylation of Cysteines Proximal to the Intermediate Filament (IF)-binding Site of Plectin. The Journal of biological chemistry. USA: American Society for Biochemistry and M., 2007, roč. 282, č. 11, s. 8175-8187. ISSN 0021-9258.
      Název česky: Oxidace a nitrosilace cysteinů blízkých k IF vazebnému místu plektinu
      RIV/00216224:14310/07:00033664 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Spurný, Radovan (703 Slovensko) -- Abdoulrahman, Kamaran (368 Irák) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, garant) -- Runzler, Dominik (40 Rakousko) -- Kohler, Gottfried (40 Rakousko) -- Castanon, Maria (724 Španělsko) -- Wiche, Gerhard (40 Rakousko)
      Klíčová slova anglicky: Plectin; Nitrosylation; Intermediate Filament
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D., učo 96793. Změněno: 9. 4. 2010 15:20.
    7. NOVÁK, Petr, Lukáš ŽÍDEK, Pavel MACEK, Petr PADRTA a Vladimír SKLENÁŘ. Program for Analysis of Internal Motion in Molecular Dynamics Simulation. In Konference mladých vědeckých pracovníků "Strukturní biofyzika makromolekul". Brno: Biofyzikální ústav AV CR a Masarykova univerzita-Přírodovědecká fakulta, 2007, 1 s.
      Název česky: Program pro analýzu vnitřních pohybů v molekulové dynamice
      Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: MD; PAIN; protein; dynamics;
      Druh sborníku: předkonferenční sborník
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 9. 4. 2010 13:44.
    8. PEKÁROVÁ, Blanka, Petra BORKOVCOVÁ, Břetislav BRZOBOHATÝ, Ľubica URBANÍKOVÁ, Jan HEJÁTKO a Lubomír JANDA. Purifikace a krystalizace přijímačové domény receptorové histidinkinázy CKI1. In Bulletin České společnosti experimentální biologie rostlin a Fyziologické sekce Slovenské botanické společnosti. 1. vyd. Olomouc (ČR): Česká společnost experimentální biologie rostlin, 2007, s. 64. ISBN 1213-6670.
      URL
      Název anglicky: Purification and crystallization of the receiver domain of the receptor histidine kinaseCKI1
      Genetika a molekulární biologie. čeština. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: cytokinins; histidine kinase; CKI1; receiver domain; purification
      Druh sborníku: předkonferenční sborník

      Změnil: Mgr. Petr Bureš, učo 40751. Změněno: 16. 7. 2008 13:55.
    9. MALIŇÁKOVÁ, Kateřina, Zuzana ZACHAROVÁ, Stanislav STANDARA, Jaromír TOUŠEK, Michal HOCEK, Vladimír SKLENÁŘ a Radek MAREK. Purine derivatives: Substituent effects as monitored by NMR. In Strukturní biofyzika makromolekul II. 2007.
      Název česky: Deriváty purinu: Efekty substituce ve vztahu k NMR
      RIV/00216224:14310/07:00020230 Konferenční abstrakt. Organická chemie. angličtina. Česká republika.
      Maliňáková, Kateřina (203 Česká republika) -- Zacharová, Zuzana (703 Slovensko) -- Standara, Stanislav (203 Česká republika) -- Toušek, Jaromír (203 Česká republika) -- Hocek, Michal (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika) -- Marek, Radek (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: purine; NMR

      Změnil: prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D., učo 381. Změněno: 9. 4. 2010 17:31.
    10. PŘECECHTĚLOVÁ, Jana, Petr PADRTA, Markéta MUNZAROVÁ a Vladimír SKLENÁŘ. P-31 Chemical Shift Tensors in RNA and DNA Backbone. A DFT Study of Conformational Dependence and Its Implications for NMR Studies. In 43rd Symposium on Theoretical Chemistry: Large, Non-Biological Systems. 2007.
      Název česky: P-31 Chemicke posuny v pateri RNA a DNA. DFT studium konformacni zavislosti a jeji dusledky pro NMR aplikace.
      Název anglicky: P-31 Chemical Shift Tensors in RNA and DNA Backbone. A DFT Study of Conformational Dependence and Its Implications for NMR Studies.
      Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: DFT calculations; P-31 chemical shifts; NMR ; DNA; RNA
      Druh sborníku: předkonferenční sborník
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Jana Pavlíková Přecechtělová, Ph.D., učo 14825. Změněno: 27. 6. 2008 13:36.
    11. PRECECHTELOVA, Jana, Markéta MUNZAROVÁ, Petr NOVÁK a Vladimír SKLENÁŘ. Relationships between 31P Chemical Shift Tensors and Conformation of Nucleic Acid Backbobe: A DFT Study. Journal of Physical Chemistry B. American Chemical Society, 2007, roč. 111, č. 12, s. 2658-2667. ISSN 1520-6106.
      Název česky: Vztahy mezi tenzory 31P chemickeho posunu a konformaci patere nukleovych kyselin: DFT studie
      Název anglicky: Relationships between 31P Chemical Shift Tensors and Conformation of Nucleic Acid Backbobe: A DFT Study
      RIV/00216224:14310/07:00021992 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Precechtelova, Jana (203 Česká republika) -- Munzarová, Markéta (203 Česká republika) -- Novák, Petr (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: NMR chemical shift tensor 31P nucleic acids
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 20. 6. 2008 12:55.
    12. JANSEN, Séverine, Josef CHMELÍK, Lukáš ŽÍDEK, Petr PADRTA, Petr NOVÁK, Zbyněk ZDRÁHAL, Jean-François PICIMBON, Christer LÖFSTEDT a Vladimír SKLENÁŘ. Structure of Bombyx mori chemosensory protein 1 in solution. Archives of Insect Biochemistry and Physiology. Wiley, 2007, roč. 66, č. 3, s. 135-145. ISSN 0739-4462.
      Název česky: Structure of Bombyx mori chemosensory protein 1 in solution
      RIV/00216224:14310/07:00020544 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Jansen, Séverine (250 Francie) -- Chmelík, Josef (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant) -- Padrta, Petr (203 Česká republika) -- Novák, Petr (203 Česká republika) -- Zdráhal, Zbyněk (203 Česká republika) -- Picimbon, Jean-François (250 Francie) -- Löfstedt, Christer (752 Švédsko) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Bombyx mori; Chemosensory proteins; NMR
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr., učo 34759. Změněno: 26. 6. 2009 10:22.

    2006

    1. MAZURA, Pavel, Radka FOHLEROVÁ, Břetislav BRZOBOHATÝ, Nagavalli Subbanna KIRAN a Lubomír JANDA. A new, sensitive method for enzyme kinetic studies of scarce glucosides. JOURNAL OF BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL METHODS. Elsevier, 2006, roč. 68, č. 2006, s. 55-63. ISSN 0165-022X.
      Název česky: Nová citlivá metoda pro stanovení kinetických parametrů přirozených substrátů.
      RIV/00216224:14310/06:00018065 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Nizozemské království.
      Mazura, Pavel (203 Česká republika) -- Fohlerová, Radka (203 Česká republika) -- Brzobohatý, Břetislav (203 Česká republika, garant) -- Kiran, Nagavalli Subbanna (356 Indie) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Amplex UltraRed reagent; beta-glucosidase; glucose assay; glucose-oxidase / peroxidase coupled reaction; phytohormone conjugation; zeatin-O-glucoside

      Změnila: Mgr. Gabriela Jalová, učo 208673. Změněno: 23. 8. 2010 10:10.
    2. PŘECECHTĚLOVÁ, Jana, Markéta MUNZAROVÁ a Vladimír SKLENÁŘ. Conformational Dependence of 31P Chemical Shift Tensors. In 42nd Symposium on Theoretical Chemistry CONFERENCE BOOK. Nemecko: Humboldt Universtaet Berlin, 2006, s. 137.
      Název česky: Konformacni zavislost tenzoru 31P chenickeho posunu.
      Název anglicky: Conformational Dependence of 31P Chemical Shift Tensors
      Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Německo.
      Klíčová slova anglicky: NMR DFT B-DNA 31P
      Druh sborníku: předkonferenční sborník
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Jana Pavlíková Přecechtělová, Ph.D., učo 14825. Změněno: 27. 6. 2008 13:37.
    3. PRECECHTELOVA, Jana, Petr NOVÁK, Martin KAUPP, Markéta MUNZAROVÁ a Vladimír SKLENÁŘ. MD/DFT STUDY OF ENVIRONMENTAL EFFECTS ON 31P CHEMICAL SHIFT TENSORS IN B-DNA. Materials Structure in Chemistry, Biology, Physics and Technology. Praha, 2006, roč. 13, č. 1, s. 34-34. ISSN 1211-5894.
      Název česky: MD/DFT studie vlivu prostredi na tensory 31P chemickeho stineni
      RIV/00216224:14310/06:00017640 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Precechtelova, Jana (203 Česká republika) -- Novák, Petr (203 Česká republika) -- Kaupp, Martin (276 Německo) -- Munzarová, Markéta (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: NMR 31P DFT B-DNA
      Mezinárodní význam: ano

      Změnila: Mgr. Jana Pavlíková Přecechtělová, Ph.D., učo 14825. Změněno: 10. 1. 2007 16:26.
    4. MACEK, Pavel, Petr NOVÁK, Hana KŘÍŽOVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Molecular dynamics study of major urinary protein-pheromone interactions: A structural model for ligand-induced flexibility increase. FEBS Letters. Amsterdam: Elsevier Science B.V., 2006, roč. 580, č. 1, s. 682-684. ISSN 0014-5793.
      URL
      RIV/00216224:14310/06:00017608 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Macek, Pavel (203 Česká republika, garant) -- Novák, Petr (203 Česká republika) -- Křížová, Hana (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: Major urinary protein; Molecular dynamics simulation; Pheromone–protein interaction; Molecular motion; TZL; Order parameter
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: Mgr. Petr Novák, Ph.D., učo 23060. Změněno: 30. 3. 2010 08:41.
    5. MATEJKOVÁ, Michaela, Petr NOVÁK, Radovan FIALA, Petr PADRTA a Vladimír SKLENÁŘ. NMR Distance Restraints At Low Temperatures: Application To DNA Hairpin. In International school on High field NMR spectroscopy for solids and liquids. Les Houches, France: Physics Centre, Les Houches, 2006, s. 45-45.
      Název česky: Měření a extrakce experimentálních dat z NMR spekter za nízkých teplot : Aplikace metody pro DNA hairpin
      Biochemie. angličtina. Francie.
      Klíčová slova anglicky: NMR;nucleic acid structure;DNA
      Druh sborníku: předkonferenční sborník

      Změnil: RNDr. JUDr. Vladimír Šmíd, CSc., učo 1084. Změněno: 6. 7. 2007 09:44.
    6. JANSEN, Séverine, Lukáš ŽÍDEK, Christer LÖFSTEDT, Jean-Francois PICIMBON a Vladimír SKLENÁŘ. 1H, 13C, and 15N resonance assignment of Bombyx mori chemosensory protein 1 (BmorCSP1). Journal of Biomolecular NMR. ESCOM Science Publishers B.V., 2006, roč. 36, č. 5, s. 47-47. ISSN 0925-2738.
      Název česky: 1H, 13C, and 15N resonance assignment of Bombyx mori chemosensory protein 1 (BmorCSP1)
      Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Klíčová slova anglicky: NMR
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 16. 3. 2007 07:52.

    2005

    1. MAZURA, Pavel, Radka FOHLEROVÁ, Břetislav BRZOBOHATÝ, Nagavalli Subbanna KIRAN a Lubomír JANDA. A new sensitive method for enzyme studies of rare glucosides. In Biologia Plantarum Supplement to vol. 49, 2nd International Symposium Auxins and Cytokinins in Plant Development. Praha: Institute of experimental botany AS CR, 2005, s. 35-35. ISSN 0006-3134.
      Název česky: Nová citlivá metoda pro stanovení enzymové kinetiky vzácných glukozidů
      Název anglicky: A new sensitive method for enzyme studies of rare glucosides
      RIV/00216224:14310/05:00013306 Stať ve sborníku. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Mazura, Pavel (203 Česká republika) -- Fohlerová, Radka (203 Česká republika) -- Brzobohatý, Břetislav (203 Česká republika) -- Kiran, Nagavalli Subbanna (356 Indie) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: beta-glucosidase; enzyme kinetics; rare glucosides; zeatin-O-glucoside

      Změnil: Mgr. Pavel Mazura, Ph.D., učo 12213. Změněno: 16. 7. 2008 11:09.
    2. ŠEVČÍK, Jozef, Lubica URBÁNIKOVÁ, Július KOŠŤAN, Lubomír JANDA a Gerhard WICHE. Actin-binding domain of mouse plectin. Crystal structure and binding to vimentin. 1873-84. Oxford: Blackwell Science, 2005, roč. 271, č. 10, s. 1873-1884, 2004 s. ISSN 0014-2956.
      Název česky: Aktin vazebná doména myšího plektinu. Krystalová struktura a vazba k vimentinu
      Název anglicky: Actin-binding domain of mouse plectin. Crystal structure and binding to vimentin
      RIV/00216224:14310/05:00039944 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Rakousko.
      Ševčík, Jozef (703 Slovensko) -- Urbániková, Lubica (703 Slovensko) -- Košťan, Július (703 Slovensko) -- Janda, Lubomír (203 Česká republika, garant) -- Wiche, Gerhard (40 Rakousko)
      Klíčová slova anglicky: Actin binding domain; vimentin; plectin

      Změnil: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D., učo 96793. Změněno: 9. 4. 2010 15:49.
    3. MATEJKOVÁ, Michaela, Petr NOVÁK, Radovan FIALA, Petr PADRTA a Vladimír SKLENÁŘ. Analysis of NMR Distance Restraints - An Application To DNA and RNA Hairpins. In Konference mladých vědeckých pracovníků "Strukturní biofyzika makromolekul". Brno: Biofyzikální ústav AV CR a Masarykova univerzita-Přírodovědecká fakulta, 2005, s. 11-11.
      Název česky: Analýza experimentálních dat z NMR spekter - Aplikace metody pro DNA a RNA hairpiny
      Název anglicky: Analysis of NMR Distance Restraints - An Application To DNA and RNA Hairpins
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: NMR; NOESY; restraints
      Druh sborníku: předkonferenční sborník

      Změnila: Ing. Michaela Matejková, učo 75859. Změněno: 21. 11. 2006 13:00.
    4. FIALA, Radovan a Lukáš ŽÍDEK. New NMR Methods for Conformational Studies of Biomolecules. Materials Structure. Praha: The Czech and Slovak Cryst. Assoc., 2005, roč. 12, č. 1, s. 23-24. ISSN 1211-5894.
      URL
      Název česky: Nové metody NMR spektroskopie pro studium konformace biomolekul
      Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: NMR spectroscopy; protein; nucleic acid; structure; conformation; residual dipolar coupling; chemical shift anisotropy

      Změnil: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc., učo 564. Změněno: 4. 11. 2005 17:32.
    5. NOVÁK, Petr, Lukáš ŽÍDEK, Pavel MACEK, Petr PADRTA a Vladimír SKLENÁŘ. NEW TOOLS FOR AN ANALYSIS OF EXPERIMENTAL (NMR) AND THEORETICAL (MD) DATA. In Konference mladých vědeckých pracovníků "Strukturní biofyzika makromolekul". Brno: Biofyzikální ústav AV CR a Masarykova univerzita-Přírodovědecká fakulta, 2005, 1 s.
      Název česky: Nové nástroje pro analýzu experimentálních (NMR) a teoretických (MD) dat
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: S3EPY; MD; RDC; PAIN;
      Druh sborníku: předkonferenční sborník
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 9. 4. 2010 14:03.
    6. MATEJKOVÁ, Michaela, Petr NOVÁK, Radovan FIALA, Petr PADRTA a Vladimír SKLENÁŘ. NMR Distance Restraints At Low temperatures : An Application To DNA Hairpin. Materials Structure. Praha: The Czech and Slovak Cryst. Assoc., 2005, roč. 12, č. 1, s. 33-33. ISSN 1211-5894.
      Název česky: Měření a extrakce experimentálních dat z NMR spekter za nízkých teplot : Aplikace metody pro DNA hairpin.
      Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: NMR;structure;DNA

      Změnila: Ing. Michaela Matejková, učo 75859. Změněno: 31. 5. 2005 15:02.
    7. NÁLEZKOVÁ, Monika, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. NMR Study of Protein CD69. In Strukturni biofyzika makromolekul. Czech Republic: MU, 2005, s. 13.
      Název česky: Stidium proteinu CD69 pomoci NMR
      Název anglicky: NMR Study of Protein CD69
      Biofyzika. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: NMR CD69 lectin-type proteins NK cell glycoproteins
      Druh sborníku: předkonferenční sborník

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 9. 4. 2010 14:03.

    2004

    1. NOVÁK, Petr, Lukáš ŽÍDEK, Petr PADRTA a Vladimír SKLENÁŘ. Refinement of Trypanosoma U6 RNA Stem-Loop Structure Using 1- and 2-Bond Residual Dipolar Couplings. In 19th NMR Valtice. Brno: Masarykova universita v Brně, 2004, s. 30-30. ISBN 80-210-3352-5.
      Název česky: Rafinace struktury Trypanosoma U6 RNA s využitím jedno- a dvouvazebných zbytkových dipolárních interakcí
      RIV/00216224:14310/04:00011133 Stať ve sborníku. Biochemie. angličtina. Česká republika.
      Novák, Petr (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Padrta, Petr (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: NMR; Residual dipolar couplings; RNA; structure;

      Změnil: Mgr. Petr Novák, Ph.D., učo 23060. Změněno: 31. 5. 2005 13:42.
    2. KŘÍŽOVÁ, Hana, Lukáš ŽÍDEK, Martin J. STONE, Milos V. NOVOTNY a Vladimír SKLENÁŘ. Temperature Dependent Spectral Density Analysis Applied to Monitoring Backbone Dynamics of Major Urinary Protein-I Complexed with the Pheromone 2-sec-Butyl-4,5-dihydrothiazole. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Kluwer/Escom, 2004, roč. 28, č. 4, s. 369-384. ISSN 0925-2738.
      Název česky: Temperature Dependent Spectral Density Analysis Applied to Monitoring Backbone Dynamics of Major Urinary Protein-I Complexed with the Pheromone 2-sec-Butyl-4,5-dihydrothiazole
      RIV/00216224:14310/04:00019739 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Křížová, Hana (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant) -- Stone, Martin J. (840 Spojené státy) -- Novotny, Milos V. (840 Spojené státy) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: backbone dynamics; NMR relaxation; spectral density function;temperature dependence

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 12. 7. 2005 13:02.

    2003

    1. ŽÍDEK, Lukáš, Petr PADRTA, Josef CHMELÍK a Vladimír SKLENÁŘ. Internal Consistency of NMR Data Obtained in Partially Aligned Biomacromolecules. Journal of Magnetic Resonance. San Diego: Academic Press, 2003, roč. 162, č. 1, s. 385-395. ISSN 1090-7807.
      Název anglicky: Internal Consistency of NMR Data Obtained in Partially Aligned Biomacromolecules
      RIV/00216224:14310/03:00008778 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Padrta, Petr (203 Česká republika) -- Chmelík, Josef (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: residual dipolar couplings; chemical shift anisotropy; peptide plane; nucleic acids base

      Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 20. 6. 2008 12:55.
    2. SYCHROVSKÝ, Vladimír, Bohdan SCHNEIDER, Pavel HOBZA, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. The effect of water on NMR spin-spin couplings in DNA: Improvement of calculated values by application of two solvent models. Physical Chemistry Chemical Physics. Great Britain: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2003, roč. 5, č. 4, s. 734-739. ISSN 1463-9076.
      Název anglicky: The effect of water on NMR spin-spin couplings in DNA: Improvement of calculated values by application of two solvent models
      RIV/00216224:14310/03:00007956 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Sychrovský, Vladimír (203 Česká republika) -- Schneider, Bohdan (203 Česká republika) -- Hobza, Pavel (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: NMR; coupling constants; DNA hairpin DFT

      Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 20. 6. 2008 12:55.

    2002

    1. SYCHROVSKÝ, Vladimír, Jaroslav VACEK, Pavel HOBZA, Lukáš ŽÍDEK, Vladimír SKLENÁŘ a Dieter CREMER. Exploring the Structure of a DNA Hairpin with the Help of NMR Spin-spin Coupling Constants: An Experimental and Quantum Chemical Investigation. Journal of Physical Chemistry B. USA: The American Chemical Society, 2002, roč. 106, č. 29, s. 10242-10250. ISSN 1089-5639.
      Název anglicky: Exploring the Structure of a DNA Hairpin with the Help of NMR Spin-spin Coupling Constants: An Experimental and Quantum Chemical Investigation
      RIV/00216224:14310/02:00006454 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Spojené státy.
      Sychrovský, Vladimír (203 Česká republika) -- Vacek, Jaroslav (203 Česká republika) -- Hobza, Pavel (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, domácí) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant, domácí) -- Cremer, Dieter (752 Švédsko)
      Klíčová slova anglicky: NMR; coupling constants; DNA hairpin DFT

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 9. 3. 2015 05:41.
    2. SHARROW, Scott D., Jeffrey L. VAUGHN, Lukáš ŽÍDEK, Milos V. NOVOTNY a Martin J STONE. Pheromone binding by polymorphic mouse major urinary proteins. Protein Science. Plainview: Cold Spring Harbor Lab. Press, 2002, roč. 11, č. 11, s. 2247-2256. ISSN 0961-8368.
      Název anglicky: Pheromone binding by polymorphic mouse major urinary proteins
      RIV/00216224:14310/02:00007921 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Spojené státy.
      Sharrow, Scott D. (840 Spojené státy) -- Vaughn, Jeffrey L. (840 Spojené státy) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika, garant) -- Novotny, Milos V. (840 Spojené státy) -- Stone, Martin J (840 Spojené státy)
      Klíčová slova anglicky: Binding affinity; isothermal titration calorimetry; major urinary proteins eins; pheromones; selectivity

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 26. 2. 2004 09:58.
    3. PADRTA, Petr, Richard ŠTEFL, Lukáš KRÁLÍK, Lukáš ŽÍDEK a Vladimír SKLENÁŘ. Refinement of d(GCGAAGC) hairpin structure using one- and two-bond residual dipolar couplings. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Kluwer/Escom, 2002, roč. 24, č. 1, s. 1-14. ISSN 0925-2738.
      Název anglicky: Refinement of d(GCGAAGC) hairpin structure using one- and two-bond residual dipolar couplings
      RIV/00216224:14310/02:00006455 Článek v odborném periodiku. Biochemie. angličtina. Nizozemské království.
      Padrta, Petr (203 Česká republika) -- Štefl, Richard (203 Česká republika) -- Králík, Lukáš (203 Česká republika) -- Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: DNA hairpin; NMR; refinement; residual dipolar couplings

      Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 20. 6. 2008 12:55.

    2001

    1. ŽÍDEK, Lukáš, Haihong WU, Juli FEIGON a Vladimír SKLENÁŘ. Measurement of small scalar and resiudal dipolar couplings in purine and pyrimidine bases. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Kluwer/Escom, 2001, roč. 21, č. 2, s. 153-159. ISSN 0925-2738.
      Název anglicky: Measurement of small scalar and resiudal dipolar couplings in purine and pyrimidine bases
      RIV/00216224:14310/01:00004651 Článek v odborném periodiku. Fyzikální chemie a teoretická chemie. angličtina. Nizozemské království.
      Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: NMR methods; nucleic acid bases; residual dipolar couplings; spin-state-selective filter

      Změnil: prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc., učo 2611. Změněno: 20. 6. 2008 12:40.
    2. ŽÍDEK, Lukáš, Richard ŠTEFL a Vladimír SKLENÁŘ. NMR methodology for the study of nucleic acids. Current Opinion in Structural Biology. London: Elsevier Science Ltd., 2001, roč. 11, č. 3, s. 275-281. ISSN 0959-440X.
      Název anglicky: NMR methodology for the study of nucleic acids
      RIV/00216224:14310/01:00004237 Článek v odborném periodiku. Biofyzika. angličtina. Česká republika.
      Žídek, Lukáš (203 Česká republika) -- Štefl, Richard (203 Česká republika) -- Sklenář, Vladimír (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: NMR; nucleic acids; NMR methods; review

      Změnil: prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D., učo 19362. Změněno: 26. 1. 2007 17:20.
    3. TIMM, David E., L. J. BAKER, H MUELLER, Lukáš ŽÍDEK a Milos NOVOTNY. Structural basis of pheromone binding to mouse major urinary protein (MUP-I). Protein Science. Plainview: Cold Spring Harbor Lab. Press, 2001, roč. 10, č. 5, s. 997-1005. ISSN 0961-8368.

      Klíčová slova anglicky: FEMALE MICE; HOUSE MOUSE; PUBERTY; RESOLUTION; CRYSTALLOGRAPHY; REFINEMENT; LIPOCALIN; MUSCULUS; LIGAND; GENES

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 21. 5. 2001 10:01.

    2000

    1. MECHREF, Yehiya, Lukáš ŽÍDEK, Weidong MA a Milos NOVOTNY. Glycosylated major urinary protein of the house mouse: characterization of its N-linked oligosaccharides. Glycobiology. Oxford: Oxford University Press, 2000, roč. 10, č. 3, s. 231-235. ISSN 0959-6658.

      Klíčová slova anglicky: MASS-SPECTROMETRY; VOMERONASAL ORGAN; MUS-MUSCULUS; GENES; MATRIX; FAMILY; MICE

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 21. 5. 2001 09:55.

    1999

    1. STONE, Martin J, Lukáš ŽÍDEK, Susan M LATO, Andrew D ELLINGTON a Milos NOVOTNY. An increase in protein backbone flexibility upon binding a hydrophobic ligand. FASEB Journal. Bethesda: Federation Amer. Soc. Exp. Biol., 1999, roč. 13, 7, S, s. A1570, 1 s. ISSN 0892-6638.
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 21. 5. 2001 09:51.
    2. ŽÍDEK, Lukáš, Milos NOVOTNY a Martin J STONE. Increased protein backbone conformational entropy upon hydrophobic ligand binding. Nature Structural Biology. New York: Nature America Inc., 1999, roč. 6, č. 12, s. 1118-1121. ISSN 1072-8368.

      Klíčová slova anglicky: N-15 NMR RELAXATION; NUCLEAR-MAGNETIC-RESONANCE; MODEL-FREE APPROACH; ORDER PARAMETERS; DYNAMICS; SPECTROSCOPY; RECOGNITION; ENERGY; DOMAIN; ENZYME

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 21. 5. 2001 09:46.
    3. ŽÍDEK, Lukáš, Martin J STONE, Susan M LATO, Mark D PAGEL, Zhongshan MIAO, Andrew D ELLINGTON a Milos V NOVOTNY. NMR mapping of the recombinant mouse major urinary protein I binding site occupied by the pheromone 2-sec-butyl-4,5-dihydrothiazole. Biochemistry. Washington: Amer. Chemical Soc., 1999, roč. 38, č. 31, s. 9850-9861. ISSN 0006-2960.

      Klíčová slova anglicky: CHEMICAL-SHIFT INDEX; GENE FAMILY; MUS-MUSCULUS; MOLECULAR HETEROGENEITY;IMPROVED SENSITIVITY; BACKBONE ASSIGNMENT; SECONDARY STRUCTURE; FEMALE MICE;SPECTROSCOPY; LIVER

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 26. 2. 2003 07:33.
    4. NOVOTNY, Milos, Weidong MA, Don WIESLER a Lukáš ŽÍDEK. Positive identification of the puberty-accelerating pheromone of the house mouse: the volatile ligands associating with the major urinary protein. Proceedings of the Royal Society of London, Series B - Biological Sciences. London: Royal Soc. London, 1999, roč. 266, č. 1432, s. 2017-2022. ISSN 0962-8452.

      Klíčová slova anglicky: FEMALE MICE; MUS-MUSCULUS; SYNTHETIC ANALOGS; CONSTITUENTS; RESPONSES; FAMILY

      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 14. 7. 2005 07:33.
    5. NOVOTNY, Milos V., Weidong MA, Lukáš ŽÍDEK a Evgenij DAEV. Recent biochemical insights into puberty acceleration, estrus induction and puberty delay in the house mouse. editors. In JOHNSTON, Robert E., Dietland MULLER-SCHWARTZE a Peter W. SORENSEN. Chemical Signals in Vertebrates 8. New York: Kluwer Academic / Plenum Publishers, 1999, s. 99-116. ISBN 0306461145.
      Změnil: prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990. Změněno: 21. 10. 2002 09:47.
Zobrazeno: 17. 12. 2024 06:02