Životopis

Životopis

Identifikace osoby

• narozen: 29.12.1980 v Jihlavě

Pracoviště

• CEITEC (Středoevropský technologický institut) a Přírodovědecká fakulta

Funkce na pracovišti

• Vědoucí skupiny

Vzdělání a akademická kvalifikace

• 09/05 - 06/09 Doktorské studium na Přírodovědecké fakultě Univerzity Karlovy v Praze • Obor: Modelování chemických vlastností nano- a biostruktur • Téma disertační práce pod vedením doc. Pavla Jungwirtha: Molecular simulations of surfaces of aqueous solutions
• 09/07 - 06/09 International Max Planck Research School for "Dynamical Processes in Atoms, Molecules and Solids", Drážďany, Německo
• 09/99 - 05/05 Magisterské studium na Matematicko-fyzikální fakultě Univerzity Karlovy v Praze • Obor: Fyzika – specializace Biofyzika a chemická fyzika • Téma diplomové práce pod vedením doc. Pavla Jungwirtha: Molekulové simulace interakcí molekul a iontů na rozhraní voda/vzduch

Přehled zaměstnání

• 06/23 - Profesor, CEITEC a Přírodovědecká fakulta Masarykovy University, Brno
• 07/17 – Group leader, CEITEC a Přírodovědecká fakulta Masarykovy University, Brno
• 04/16 – 06/17 Vědecký pracovník/Docent ve skupině Jaroslava Kočy, CEITEC a Přírodovědecká fakulta Masarykovy University, Brno
• 10/11 – 04/16 Vědecký pracovník/Odborný asistent ve skupině Jaroslava Kočy, CEITEC a Přírodovědecká fakulta Masarykovy University, Brno
• 08/11 – 10/11 Postdoctoral Research Associate ve skupině Mikaela Lunda, Department of Chemistry, Lund University (Švédsko): Zhrubené simulace amyloidů, Dynamické Monte Carlo (DMC)
• 08/09 – 07/11 Postdoctoral Research Associate ve skupině Daana Frenkela, Department of Chemistry, University of Cambridge (Velká Británie): Zhrubené simulace fosfolipidových membrán and proteinů, Molekulární dynamika (MD) a Monte Carlo (MC)
• 02/04 - 09/09 Research assistant ve skupině Pavla Jungwirtha, Ústav organické chemie a biochemie, Akademie věd České Republiky: Hostující pracoviště mé disertační práce: Molecular simulations of surfaces of aqueous solutions
• 05/03 - 12/03 Research assistant ve skupině Pavla Jungwirtha, Ústav fyzikální chemie Jaroslava Heyrovského, Akademie věd České Republiky: Molekulární dynamika polycyklických aromatických uhlovodíků na rozhraní

Pedagogická činnost

• 2017 - Přednáška předmětu C9926 Problémy molekulových simulací, Masarykova Univerzia, Brno, Česká Republika
• 2016 - Přednáška předmětu F1170 Teoretický seminář molekulového modelování, Masarykova Univerzia, Brno, Česká Republika
• 2015 - Přednáška předmětu F8510 - Fyzika biopolymerů, Masarykova Univerzia, Brno, Česká Republika
• 2015 - Přednáška předmětu C9087 - Computational Chemistry for Structural Biology, Masarykova Univerzia, Brno, Česká Republika
• 2013 - Přednáška předmětu NBCM147 – Interakce proteinů a membrán – úvod do soft matter, Karlova Univerzita v Praze, Česká Republika
• 2011 - Přednáška předmětu C9925 - Introduction to soft matter models of membranes and proteins, Masarykova Univerzia, Brno, Česká Republika
• 2010 - 2011 Supervize pro přednášku Termodynamiky a Kinetiky na Churchill College, Cambridge (3 malé skupiny studentů prvního ročníku)
• 2010 - 2011 Mentorování 5-ti studentů (2 Ph.D. and 3 MSc.)
• 2009 - 2010 Supervize pro přednášku Statistické mechaniky na Chemistry Department, University of Cambridge (skupina 3 studentů třetího ročníku)
• 2007 - 2008 Cvičení pro přednášku Klasické molekulové dynamiky na Matematicko-fyzikální fakultě Univerzity Karlovy (12 studentů čtvrtého ročníku)
• 2006 - 2007 Cvičení pro přednášku Klasické a kvantové molekulové dynamiky na Matematicko-fyzikální fakultě Univerzity Karlovy (10 studentů čtvrtého ročníku)

Granty

• 2025 – 2026 European Research Council, Proof of Concept Grant (ERC) – PI, Fighting Resistant Bacteria with Antimicrobial Peptides, 1-letý (150 000 EUR)
• 2025 – 2027 Grantová agentura České Republiky (GAČR) – PI, How lipid asymmetry influences membrane protein function, 3-letý (210 000 EUR)
• 2025 – 2025 Technologcká agentura České Republiky (TAČR) – PI, In vivo efficacy of peptides against bacterial infection in mice, 1-letý (85 000 EUR)
• 2022 – 2025 National Institute of Virology and Bacteriology (NIVB) – member, 3,5-letý (1 600 000 EUR)
• 2022 – 2026 European Research Council, Consolidator Grant (ERC) – PI, Peptide Killers, 5-letý (2 300 000 EUR)
• 2020 – 2025 Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (ERC CZ) – PI, Peptide Killers, 5-letý (2 500 000 EUR)
• 2020 – 2022 Grantová agentura České Republiky (GAČR) – PI, Protein Affinity and Selectivity to Cellular Membranes, 3-letý (320 000 EUR)
• 2017 - 2019 Grantová agentura České Republiky (GAČR) – PI, Amphiphilic Peptides at Phospholipid Membranes, 3-letý (180 000 EUR)
• 2017 - 2019 Grant agentůra Masarykovy Univerzity (GAMU) – co-PI, Computational chemistry for Wnt signaling pathway, 3-letý (190 000 EUR)
• 2016 - 2019 European Regional Development Fund (ERDF) Program Interreg V-A Austria-Czech Republic – co-applicant, Protein Dynamic Center (PDC), 3 years (898 000 EUR)
• 2014 - 2016 Grantová agentura České Republiky (GAČR) – PI, grant ke studiu Samouspořádaných systémů amfifilních peptide, 3-letý ( 160 000 EUR)
• 2008 Japan Society for the Promotion of Science JSPS - grant na 2 měsíční stáž na Institute for Chemical Research, Kyoto University, Japonsko: Investigation and application of novel free energy calculations
• 2008 Grantová agentura Univerzity Karlovy v Praze GAUK - grant na vytvoření a studium smíšených fosfolipidových membrán pomocí počítačových simulací

Akademické stáže

• 11/08 - 12/08 Stáž ve skupině Nobuyuki Matubayasi, Institute for Chemical Research, Kyoto University v Japonsku: Zkoumání a aplikace nové metody výpočtu volných energií
• 09/07 - 09/07 Krátká stáž ve skupině Maxe Berkowitze, University of North Carolina, USA: Ionty a jejich chování na rozhraní voda/fosfolipidvá membrána
• 07/06 - 08/06 Stáž ve skupině Rainera Böckmanna, University of Saarland, Německo: Vývoj nového klasického a polarizovatelného atomického forcefildu pro lipidy
• 01/02 - 06/02 Studentský projekt v JRM Laboratory at Kansas State University, USA: Fragmentation of diatomic molecules following multiple capture of a slow highly charged ion
• 11/00 - 06/01 Studentský project v oddělení Kvantové a nelineární optiky na Matematicko-fyzikální fakultě Univerzity Karlovy v Praze: Měření teplotní závislosti absorpčních spekter polovodičových nanokrystalů CdS a CdSe

Institucionální působení

• 07/23 – Vědecký koordinátor Národního ústavu virologie a bakteriologie
• 03/23 – Člen vědecké rady Ústavu Výpočetní Ttechniky MU
• 06/22 – Člen koordinační rady Národního ústavu virologie a bakteriologie
• 11/21 – Člen vědecké rady CEITEC MU
• 04/23 – 03/25 Předseda biofyzikálního panelu Grantové Agentury České Republiky
• 04/21 – 03/23 Místopředseda biofyzikálního panelu Grantové Agentury České Republiky
• 01/21 – Člen komise uživatelů e-INFRA
• 07/20 – Člen IT rady Masarykovy univerzity
• 07/19 – Předseda IT komise CEITECu

Zvané přednášky

• 2024 CECAM Flagship workshop - Physics of mesoscale liquid condensates, Lyiiang, China
• 2024 CECAM workshop - Exploring bio-inspired systems: a synergy between multiscale experimental and computational approaches, Vienna, Austria
• 2024 Biophysics Austria Conference 2024, Salzburg, Austria
• 2024 CECAM Flagship workshop - Peptides in Biology and Materials: Bridging Simulation and Experimental Data, Florence, Italy
• 2022 Invited seminars at Imperial college, UK; International Institute of Molecular and Cell Biology in Warsaw, Poland; Heyrovsky Institute AVCR, Charles University, and University of Ostrava, Czech Republic
• 2021 EJTEMM 2021 – Graz, Austria
• 2018 43rd FEBS Congress Prague, Czech Republic
• 2018 CECAM workshop - Nano-structured soft matter: a synergy of approaches to amphiphilic and block copolymer systems, Lincoln, United Kingdom
• 2018 CECAM workshop - Frontiers in Computational Biophysics, Lugano, Switzerland
• 2017 CECAM workshop - The future of biomembrane simulations: hidden pitfalls and future challenges, Lyon, France
• 2017 Joint Meeting of Czech and German Biophysicists, Hünfeld, Germany
• 2016 Organizing Molecular Matter - A soft matter symposium, Lund, Sweden
• 2015 CEITEC/ICRC Annual Conference, Brno, Czech Republic
• 2013 TAPPO workshop, Levi, Finland
• 2012 CECAM workshop - Design of Self-assembling Materials, Vienna, Austria
• 2012 Telluride Science Research Center - Protein and Peptide Interactions in Cellular Environments, Telluride, CO, USA
• 2011 ACS national meeting, Denver, USA
• 2010 Hofmesiter fest – Conference about Hofmeister series and ion specificity, Prague

Ocenění vědeckou komunitou

• 2024 MUNI Scientist, CEITEC MU Award
• 2024 zvolen členem Učené společnosti České Republiky
• 2022 Cena Rektora Masarykovy univerzity, Bronzová medaile Masarykovy univerzity, CEITEC MU award
• 2021 MUNI Scientist
• 2010 - 2013 Junior Research Fellowship na Churchill College, Cambridge Vysoce kompetitivní a prestižní fellowship
• 2010 Bolzanova cena v kategorii přírodních věd, Karlova Univerzita v Praze Ocenění dvou nejlepších disertačních prací v oboru přírodních věd
• 1999 - 2004 Stipendium pro 50 nejlepších studentů v ročníku (přibližně 10% studentů)

1. 2. 2025

Další varianta: angličtina(14)