Curriculum Vitae

Životopis

Identifikace osoby

• Mgr. Tibor Botka, Ph.D.

Pracoviště

• Masarykova univerzita
  Přírodovědecká fakulta
  Ústav experimentální biologie
  Laboratoř molekulární diagnostiky mikroorganismů
  Kamenice 5, 625 00 Brno
  

Funkce na pracovišti

• odborný asistent

Vzdělání

• 2017: Ph.D. (PřF MU, Molekulární a buněčná biologie)
  
• 2013: Mgr. (PřF MU, Molekulární biologie a genetika)
  
• 2011: Bc. (PřF MU, Molekulární biologie a genetika)

Předchozí zaměstnání

• 2013-2018 odborný pracovník (PřF MU, ÚEB)

Pedagogická činnost

• Molekulární biologie virů
• Praktikum z molekulární biologie virů
• Praktikum z molekulární biologie
• Laboratorní cvičení z molekulární biologie pro biochemiky
• Specializační seminář Molekulární biologie a genetika
• Laboratorní seminář Oddělení genetiky a molekulární biologie
• Vedoucí, konzultant a oponent bakalářských a diplomovych prací

Vědeckovýzkumná činnost

• řešitel:
  Grant EMBO (EMBO9572): Interactions between therapeutic staphylococcal phages and their hosts in bacterial communities and consequences for phage-antibiotic synergy (PAS)
  Grant AZV MZ ČR (NU21J-05-00035): Synergy of lytic bacteriophages and antibiotics in the therapy of topical infections of Staphylococcus aureus
  Grant FRMU (MUNI/FR/1181/2018): Inovace metod v Praktiku z molekulární biologie virů
  
• člen řešitelského týmu:
  Projekt Národní institut virologie a bakteriologie (LX22NPO5103)
  Grant Ga ČR (GA18-13064S): Analýza interakcí mezi polyvalentním terapeutickým fágem druhu Twort-like a jeho hostitelem Staphylococcus aureus
  Grant MZe ČR (QJ1510216): Fágová terapie infekcí vyvolaných Staphylococcus aureus v chovech hospodářských zvířat
  
• podíl na řešení:
  Grant MZ ČR (NT12395-5): Molekulární průkaz a analýza invazivních kmenů small colony variants (SCV) a rezistentních kmenů S. aureus od pacientů s cystickou fibrózou
  Grant MŠMT (ED0006/01/01): Centrum pro aplikovanou mikrobiologii a imunologii ve veterinární medicíně
  Grant Ga ČR (GBP206/12/G151): Centrum nových přístupů k bioanalýze a molekulární diagnostice
  Grant MŠMT ČR (ED1.1.00/02.0068): CEITEC - central european institute of technology
  Projekt CEB, MŠMT OPVK (CZ.1.07/2.3.00/20.0183): Centrum experimentální biomedicíny
  

Internship and stays for the purpose of study or work

• 28. 8. 2023 – 28. 9. 2023: University of Helsinki, Helsinki, Ostatní, FIN
  • Výzkumný pobyt na University of Helsinki s cílem navázání dlouhodobé spolupráce.
  • LX22NPO5103
• 18. 7. 2022 – 2. 9. 2022: University of York, York, Ostatní, GBR
  • Vědecko-výzkumný pobyt s cílem navázat spolupráci s eko-evoluční laboratoří dr. Ville Frimana, která se zabývá vztahy fágů a jejich hostitelů, zejména rodu Pseudomonas. Laboratoř využívá celou řadu přístupů (např. využití speciálního média pro syntetický model cystické fibrózy), přičemž cílem bylo přenést tyto postupy a znalosti do domovské laboratoře (projekt EMBO9572) a využít je ve stávajících projektech zabývajících se studiem stafylokoků a jejich fágů, a to se zaměřením na vliv antibiotik na systém fág-hostitel s cílem terapeutického využití synergie (projekt NU21J-05-00035).
  • EMBO9572, NU21J-05-00035

Mimouniverzitní aktivity

• člen American Society for Microbiology
  
• člen Československé společnosti mikrobiologické
  
• člen Genetické společnosti Gregora Mendela
  
• člen The International Society for Viruses of Microorganisms

Vybrané publikace

• DVOŘÁK, Pavel, Barbora BURÝŠKOVÁ, Barbora POPELÁŘOVÁ, Birgitta E. EBERT, Tibor BOTKA, Dalimil BUJDOŠ, Alberto SÁNCHEZ-PASCUALA, Hannah SCHÖTTLER, Heiko HAYEN, Víctor DE LORENZO, Lars M. BLANK and Martin BENEŠÍK. Synthetically-primed adaptation of Pseudomonas putida to a non-native substrate D-xylose. Nature Communications. Nature Portfolio, 2024, vol. 15, March 2024, p. 1-18. ISSN 2041-1723. Available from: https://dx.doi.org/10.1038/s41467-024-46812-9. URL info
• KUNTOVÁ, Lucie, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Radka OBOŘILOVÁ, Hana ŠIMEČKOVÁ, Adéla FINSTRLOVÁ, Pavol BÁRDY, Marta ŠIBOROVÁ, Liudmyla TROIANOVSKA, Tibor BOTKA, Petr GINTAR, Ondrej ŠEDO, Zdeněk FARKA, Jiří DOŠKAŘ and Roman PANTŮČEK. Staphylococcus aureus Prophage-Encoded Protein Causes Abortive Infection and Provides Population Immunity against Kayviruses. mBio. Washington, DC, USA: American Society for Microbiology, 2023, vol. 14, No 2, p. 1-15. ISSN 2150-7511. Available from: https://dx.doi.org/10.1128/mbio.02490-22. Publisher info
• KOVAŘOVIC, Vojtěch, Adéla FINSTRLOVÁ, Ivo SEDLÁČEK, Petr PETRÁŠ, Pavel ŠVEC, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Meina NEUMANN-SCHAAL, Ondrej ŠEDO, Tibor BOTKA, Eva STAŇKOVÁ, Jiří DOŠKAŘ and Roman PANTŮČEK. Staphylococcus brunensis sp. nov. isolated from human clinical specimens with a staphylococcal cassette chromosome-related genomic island outside of the rlmH gene bearing the ccrDE recombinase gene complex. Microbiology Spectrum. Washington, DC: American Society for Microbiology, 2023, vol. 11, No 5, p. 1-22. ISSN 2165-0497. Available from: https://dx.doi.org/10.1128/spectrum.01342-23. URL info
• FIŠAROVÁ, Lenka, Tibor BOTKA, Xin DU, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Pavol BÁRDY, Roman PANTŮČEK, Martin BENEŠÍK, Pavel ROUDNICKÝ, Volker WINSTEL, Jesper LARSEN, Ralf ROSENSTEIN, Andreas PESCHEL and Jiří DOŠKAŘ. Staphylococcus epidermidis Phages Transduce Antimicrobial Resistance Plasmids and Mobilize Chromosomal Islands. mSphere. Washington, DC, USA: American Society for Microbiology, 2021, vol. 6, No 3, p. 1-19. ISSN 2379-5042. Available from: https://dx.doi.org/10.1128/mSphere.00223-21. URL info
• FIŠAROVÁ, Lenka, Roman PANTŮČEK, Tibor BOTKA and Jiří DOŠKAŘ. Variability of resistance plasmids in coagulase-negative staphylococci and their importance as a reservoir of antimicrobial resistance. Research in Microbiology. Amsterdam: Elsevier Science, 2019, vol. 170, No 2, p. 105-111. ISSN 0923-2508. Available from: https://dx.doi.org/10.1016/j.resmic.2018.11.004. Full Text info
• BOTKA, Tibor, Roman PANTŮČEK, Ivana MAŠLAŇOVÁ, Martin BENEŠÍK, Petr PETRÁŠ, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Pavla HAVLÍČKOVÁ, Marian VARGA, Helena ŽEMLIČKOVÁ, Ivana KOLÁČKOVÁ, Martina FLORIANOVÁ, Vladislav JAKUBŮ, Renata KARPÍŠKOVÁ and Jiří DOŠKAŘ. Lytic and genomic properties of spontaneous host-range Kayvirus mutants prove their suitability for upgrading phage therapeutics against staphylococci. Scientific Reports. London: Nature Publishing Group, 2019, vol. 9, No 1, p. 5475-5486. ISSN 2045-2322. Available from: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-019-41868-w. URL info
• DOŠKAŘ, Jiří, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Martin BENEŠÍK, Tibor BOTKA, Marcela KLIMEŠOVÁ, Renáta KARPÍŠKOVÁ and Ivana KOLÁČKOVÁ. Příprava purifikovaného fága S. aureus pro použití ve veterinární praxi (Preparation of a purified S. aureus phage for use in veterinary practice). 2018. Příprava purifikovaného fága Staphylococcus aureus pro použití ve veterinární praxi (STAF1) info
• BOTKA, Tibor, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Karla SVOBODOVÁ, Roman PANTŮČEK, Petr PETRÁŠ, Darina ČEJKOVÁ and Jiří DOŠKAŘ. Two highly divergent lineages of exfoliative toxin B-encoding plasmids revealed in impetigo strains of Staphylococcus aureus. International Journal of Medical Microbiology. Jena: ELSEVIER GMBH, URBAN & FISCHER VERLAG, 2017, vol. 307, No 6, p. 291-296. ISSN 1438-4221. Available from: https://dx.doi.org/10.1016/j.ijmm.2017.05.005. URL info
• TKADLEC, Jan, Eva VAŘEKOVÁ, Roman PANTŮČEK, Jiří DOŠKAŘ, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Tibor BOTKA, Libor FILA and Oto MELTER. Characterization of Staphylococcus aureus strains isolated from Czech cystic fibrosis patients: high rate of ribosomal mutation conferring resistance to MLSB antibiotics as a result of long-term and low-dose azithromycin treatment. Microbial Drug Resistance. New Rochelle, NY, USA: Mary Ann Liebert Inc., 2015, vol. 21, No 4, p. 416-423. ISSN 1076-6294. Available from: https://dx.doi.org/10.1089/mdr.2014.0276. URL info
• BOTKA, Tibor, Vladislava RŮŽIČKOVÁ, Hana KONEČNÁ, Roman PANTŮČEK, Ivan RYCHLÍK, Zbyněk ZDRÁHAL, Petr PETRÁŠ and Jiří DOŠKAŘ. Complete genome analysis of two new bacteriophages isolated from impetigo strains of Staphylococcus aureus. Virus Genes. Springer US, 2015, vol. 51, No 1, p. 122-131. ISSN 0920-8569. Available from: https://dx.doi.org/10.1007/s11262-015-1223-8. URL info

2023/06/12