FI:PV270 Biocomputing - Informace o předmětu

PV270 Biocomputing

Rozsah

2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Čt 14:00–15:50 B411

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Analýza a zpracování obrazu (program FI, N-VIZ)
• Bioinformatika a systémová biologie (program FI, N-UIZD)
• Computer Games Development (program FI, N-VIZ_A)
• Computer Graphics and Visualisation (program FI, N-VIZ_A)
• Computer Networks and Communications (program FI, N-PSKB_A)
• Cybersecurity Management (program FI, N-RSSS_A)
• Formální analýza počítačových systémů (program FI, N-TEI)
• Grafický design (program FI, N-VIZ)
• Graphic Design (program FI, N-VIZ_A)
• Hardware Systems (program FI, N-PSKB_A)
• Hardwarové systémy (program FI, N-PSKB)
• Image Processing and Analysis (program FI, N-VIZ_A)
• Informační bezpečnost (program FI, N-PSKB)
• Informatika (program FI, B-INF) (2)
• Informatika ve vzdělávání (program FI, B-IVV) (2)
• Information Security (program FI, N-PSKB_A)
• Kvantové a jiné neklasické výpočetní modely (program FI, N-TEI)
• Počítačová grafika a vizualizace (program FI, N-VIZ)
• Počítačové sítě a komunikace (program FI, N-PSKB)
• Principy programovacích jazyků (program FI, N-TEI)
• Programování a vývoj aplikací (program FI, B-PVA)
• Řízení kyberbezpečnosti (program FI, N-RSSS)
• Řízení vývoje služeb (program FI, N-RSSS)
• Řízení vývoje softwarových systémů (program FI, N-RSSS)
• Services Development Management (program FI, N-RSSS_A)
• Software Systems Development Management (program FI, N-RSSS_A)
• Software Systems (program FI, N-PSKB_A)
• Softwarové systémy (program FI, N-PSKB)
• Strojové učení a umělá inteligence (program FI, N-UIZD)
• Učitel informatiky a správce sítě (program FI, N-UCI)
• Učitelství informatiky pro střední školy (program FI, N-UCI) (2)
• Vývoj počítačových her (program FI, N-VIZ)
• Zpracování a analýza rozsáhlých dat (program FI, N-UIZD)
• Zpracování přirozeného jazyka (program FI, N-UIZD)

Cíle předmětu

Kurz poskytuje přehled v oblasti naturálních výpočtů s důrazem na biomolekulární (DNA) výpočty, buněčné výpočty a molekulární programování.

Výstupy z učení

Student bude po absolvování předmětu schopen:
- porozumět základním pojmům z oblasti biovýpočtů;
- identifikovat základní výpočetní operace nad biologickou hmotou;
- asociovat vhodné formalismy s konkrétní výpočetní platformou.

Osnova

• Úvod do biovýpočtů
• Základní pojmy molekulární biologie a biotechnoloigie
• Umělé systémy inspirované živými organismy
• Fyzické mapování problému
• Bio-operace
• Molekulární výpočty, výpočty pomocí DNA
• Buněčné výpočty
• Membránové výpočty
• Molekulární programování

Literatura

• AMOS, Martyn. Theoretical and experimental DNA computation. 1st ed. New York, NY: Springer, 2005, xiii, 172. ISBN 3-540-65773-8. info
• Cellular computing. Edited by Martyn Amos. New York: Oxford University Press, 2004, xii, 226 p. ISBN 0195155408. info
• CALUDE, Cristian. Computing with cells and atoms : an introduction to quantum, DNA and membrane computing. Edited by Gheorghe Paun. London: Taylor & Francis, 2001, x, 309. ISBN 0748408991. info
• ROZENBERG, Grzegorz, Gheorghe PAUN a Arto SALOMAA. DNA computing : new computing paradigms. Berlin: Springer, 1998, ix, 400. ISBN 3540641963. info

Výukové metody

přednáška, samostatné studium

Metody hodnocení

Zkouška je písemná. V případě zadání průběžných testů během semestru, mají tyto podíl nejvýše 30% na závěrečném hodnocení. Pomocné materiály nejsou povoleny.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován jednou za dva roky.

• Statistika zápisu (nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/fi/jaro2024/PV270