VLBC0321s Biochemie I - seminář

Lékařská fakulta
podzim 2019
Rozsah
0/2/0. 30. 4 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Jiří Dostál, CSc. (cvičící)
Mgr. Jana Gregorová, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Miroslava Hlaváčová, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Michaela Králíková, Ph.D. (cvičící)
RNDr. Hana Paulová, CSc. (cvičící)
doc. Mgr. Ondřej Peš, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Jiří Slanina, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Eva Táborská, CSc. (cvičící)
doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Marie Tomandlová, Ph.D. (cvičící)
PharmDr. Katarína Kostolanská (pomocník)
Lenka Nerudová (pomocník)
Garance
prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
VLBC0321s/01: Po 10:00–11:40 A16/213, M. Králíková
VLBC0321s/02: Po 10:00–11:40 A16/213, M. Králíková
VLBC0321s/03: Po 8:00–9:40 A16/213, J. Gregorová
VLBC0321s/04: Po 8:00–9:40 A16/213, J. Gregorová
VLBC0321s/05: Út 12:00–13:40 A16/213, M. Hlaváčová
VLBC0321s/06: Út 12:00–13:40 A16/213, M. Hlaváčová
VLBC0321s/07: Po 15:00–16:40 A16/213, J. Dostál
VLBC0321s/08: Po 15:00–16:40 A16/213, J. Dostál
VLBC0321s/09: Út 16:00–17:40 A16/215, M. Tomandlová
VLBC0321s/10: Út 16:00–17:40 A16/215, M. Tomandlová
VLBC0321s/11: Út 14:00–15:40 A16/213, H. Paulová
VLBC0321s/12: Út 14:00–15:40 A16/213, H. Paulová
VLBC0321s/13: Po 13:00–14:40 A16/213, E. Táborská
VLBC0321s/14: Po 13:00–14:40 A16/213, E. Táborská
VLBC0321s/15: Po 8:00–9:40 A16/215, J. Slanina
VLBC0321s/16: Po 8:00–9:40 A16/215, J. Slanina
Předpoklady
VLBI0222c Biologie II-cvičení && VLBF011c Biofyzika - cvičení
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Semináře slouží k aktivnímu procvičování probírané látky v předmětu Biochemie I. Cílem předmětu Biochemie I je získat znalosti o základních metabolických pochodech a drahách probíhajících na buněčné úrovni. Porozumění těmto procesům je základem pro pochopení metabolismu na tkáňové a orgánové úrovni, které je studováno v navazujícím předmětu Biochemie II. V úvodních přednáškách jsou shrnuty základní pojmy z chemie nezbytné pro porozumění struktury lidského těla a fyzikálně chemických procesů v něm (chemické složení lidského těla, přehled biologicky významných prvků,voda, elektrolyty, neelektrolyty, osmotický tlak, acidobazické, redoxní a srážecí děje), další lekce jsou zaměřeny na základní biochemické dráhy v buňkách.
Výstupy z učení
Po absolvování předmětu rozumí významu základních chemických pojmů (pH, osmolalita, elektrolyt, pufr ad.) a dokáže tuto znalost aplikovat při popisu vlastností tělních tekutin.
Popíše roli makro- a mikrobiogenních prvků v organismu
Diskutuje vlastnosti a funkci enzymů
Popisuje základní katabolické i anabolické dráhy buněčného metabolismu sacharidů, lipidů a bílkovin a jejich návaznosti.
Rozumí principům získávání,využívání a ukládání energie pochody na buněčné úrovni.
Je obeznámen s funkcí buněčných membrán a principem kompartmentace na buněčné úrovni a transportními procesy na membráně.
Má znalosti o syntéze proteinů, počínaje procesy replikace a transkripce,translace a posttranslační úpravy. Rozumí vztahu mezi strukturou a funkcí proteinů.
Je obeznámen s funkcí hemoglobinu při transportu kyslíku a udržování acidobazické rovnováhy.Diskutuje principy některých chorob na molekulární úrovni.
Osnova
  • 1A: Úvod do biochemie.
  • 1B: Elektrolyty, osmolalita (osmolarita, tonicita, onkotický tlak, osmolální gap).
  • 2A: Acidobazické děje, pH tělesných tekutin.
  • 2B: Pufry, Henderson-Hasselbalchova rovnice.
  • 3A: TEST 1 (sem. 1A-2B). Biochemicky významné org. sloučeniny I (alkoholy, aldehydy, ketony).
  • 3B: Biochemicky významné org. sloučeniny II (kyseliny a deriváty).
  • 4A: Úvod do bioenergetiky, Gibbsova energie, makroergní sloučeniny. Redoxní reakce.
  • 4B: Enzymy, kinetika, saturační křivka, Km, inhibice enzymů.
  • 5A: Kofaktory enzymů. Funkce a vztah k vitaminům.
  • 5B: Citrátový cyklus, respirační řetězec, oxid. fosforylace.
  • 6A: Struktura a vlastnosti sacharidů. Sacharidy ve výživě. Trávení sacharidů. Transport glukosy do buněk. Glykolýza.
  • 6B: Glukoneogeze. Syntéza a odbourání glykogenu. Metabolismus fruktosy a galaktosy.
  • 7A: TEST 2 (sem. 3A-6B). Tenzidy (struktura, typy, použití, biologicky významné tenzidy). Lipidy (struktura).
  • 7B: Buněčné membrány, membránový transport.
  • 8A: Trávení lipidů. Lipidy ve výživě. Odbourávání mastných kyselin, tvorba a utilizace ketolátek.
  • 8B: Syntéza, desaturace mastných kyselin. Metabolismus cholesterolu.
  • 9A: Metabolismus žlučových kyselin, ikosanoidů, fosfolipidů.
  • 9B: Lipofilní vitaminy. Reaktivní formy kyslíku. Lipoperoxidace.
  • 10A: TEST 3 (sem. 7A-9B). Aminokyseliny, proteiny, struktura a vlastnosti.
  • 10B: Struktura hemoglobinu, vztah k funkci. Typy Hb v krvi zdravých osob, HbCO a MetHb, abnormální typy Hb.
  • 11A: Trávení proteinů. Přehled metabolismu proteinů. Obecné rysy přeměny aminokyselin. Syntéza močoviny.
  • 11B: Metabolismus aminokyselin I (katabolismus, syntéza neesenciálních AK, vratné přeměny, vrozené poruchy).
  • 12A: Metabolismus aminokyselin II (přeměny na specializované produkty). Syntéza hemu.
  • 12B: TEST 4 (sem. 10A-12A). Struktura bází, nukleosidů a nukleotidů, význam nukleotidů v metabolismu (kofaktory, makroergní sloučeniny, druzí poslové). Metabolismus purinových a pyrimidinových nukleotidů I.
  • 13A: Metabolismus purinových a pyrimidinových nukleotidů II.
  • 13B: Struktura DNA, RNA, replikace, transkripce.
  • 14A: Syntéza proteinů, posttranslační modifikace, syntéza kolagenu. ZÁPOČTOVÝ TEST.
  • 14B: Náhradní témata, konsultace.
Literatura
    povinná literatura
  • Podklady k přednáškám dostupné v IS
  • Seminární texty dostupné v IS.
  • KOOLMAN, Jan a Klaus-Heinrich RÖHM. Barevný atlas biochemie. Translated by Vladimír Benda - Martin Vejražka - Jiří Jonák. 1. české vydání. Praha: Grada, 2012, xiv, 498. ISBN 9788024729770. info
  • MURRAY, Robert K., David A. BENDER, Kathleen M. BOTHAM, Peter J. KENNELLY, Victor W. RODWELL a P. Anthony WEIL. Harperova ilustrovaná biochemie. Translated by Bohuslav Matouš. Páté české vydání, prv. Praha: Galén, 2012, xii, 730. ISBN 9788072629077. info
Výukové metody
Kurs probíhá formou diskuze k zadaným tématům. Osnova diskuzí je zahrnuta v doporučeném skriptu. Doplňkové materiály jsou zveřejňovány v sekci Studijní materiály
Metody hodnocení
Základní podmínkou je absolvování všech seminářů. V průběhu semestru se v semináři píšou 4 průběžné testy. Pokud z průběžných testů získá student nejméně 42 bodů, je mu udělen zápočet bez povinnosti psát zápočtový test. Ostatní studenti píší zápočtový test, který má 30 otázek. Podmínkou pro udělení zápočtu je 14 bodů. Zápočtový test je možno psát po nahrazení veškeré zameškané výuky. Studenti, kteří v zápočtovém týdnu nesplní podmínky zápočtového testu, mají možnost jej jedenkrát opakovat.
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023, podzim 2024.