FB840 Integrative Structural Biology

Faculty of Science
Autumn 2023
Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (plus extra credits for completion). Type of Completion: zk (examination).
Teacher(s)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (lecturer)
Guaranteed by
prof. RNDr. Robert Vácha, PhD.
Department of Condensed Matter Physics – Physics Section – Faculty of Science
Contact Person: doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD.
Supplier department: Department of Condensed Matter Physics – Physics Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Všeobecné povědomí o molekulové biofyzice, strukturní biologii a odpovídající matematický, chemický, biologický a fyzikální aparát
Course Enrolment Limitations
The course is offered to students of any study field.
Course objectives (in Czech)
Poskytnout studentům přehled technik a postupů umožňujících studium dynamiky a struktury biomolekul od malých proteinových domén až po velké molekulární komplexy (tzv. molekulární stroje).
Syllabus (in Czech)
  • 1. Komplementární techniky studia struktury biomolekul: Nukleární magnetická rezonance (NMR), Rentgenová krystalografie (X-Ray), Elektronová paramagnetická rezonance (EPR), Hmotnostní spektrometrie (MS)
  • 2. Studium dynamiky biomolekul: Fluorescenční spektroskopie (FA), Nukleární magnetická rezonance (NMR)
  • 3. Určení interakčních konstant a interakčních rozhraní: Izotermální titrační kalorimetrie (ITC), Termoforéza (MST), Fluorescenční anisotropie (FA)
  • 4. Určení biomolekulárních komplexů: Rentgenový rozptyl pod malými úhly (SAXS), Výpočetní nástroje integrativní strukturní biologie, Zobrazovací nástroje.
Literature
  • Iain D. Campbell: Biophysical Techniques, Oxford University Press, 1st Ed., 2012
  • Michael F Moody: Structural Biology Using Electrons and X-Rays, Academic Press, 1st Ed., 2011
  • Donald Voeth and Judith G. Voeth: Biochemistry 4th Ed., Willey, 2010
Teaching methods (in Czech)
Účast na přednáškách, samostatné studium literatury, řešení strukt. biol. problémů a diskuze
Assessment methods (in Czech)
Závěrečný test
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught every week.
The course is also listed under the following terms Autumn 2019, Autumn 2020, autumn 2021, Autumn 2022.
  • Enrolment Statistics (recent)
  • Permalink: https://is.muni.cz/course/sci/autumn2023/FB840