Bi6420 Ekotoxikologie mikroorganismů

Přírodovědecká fakulta
podzim 2008
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. RNDr. Jakub Hofman, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Ivan Holoubek, CSc.
RECETOX – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jakub Hofman, Ph.D.
Rozvrh
St 13:00–14:50 Kontaktujte učitele
Předpoklady
NOW( Bi6420c Ekotox. mikroorganismů - cv. )
Základy obecné ekotoxikologie a obecné mikrobiologie
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět je orientován jako základní kurz ekotoxikologie mikroorganismů zahrnující především výklad o ekotoxikologických biostestech s využitím mikroorganismů a výklad o bioindikaci stresu na přirozená mikrobiální společenstva v půdě, sedimentech a vodě. Latka je vysvětlovana s ohledem na aplikace v procesu hodnoceni ekologickych rizik.
Na koncitohoto kurzu bude student schopen:
- vyjmenovat a charakterizovat hlavní skupiny mikroorganismů, jejich fyziologii, morfologii a ekologii
- objasnit základní funkce mikroorganismů v různých typech ekosystémů
- řešit základní otázky environmentální mikrobiologie
- obhájit důležitost ekotoxikologie mikroorganismů
- srovnat specifika ekotoxikologie mikroorganismů oproti jiným ekotoxikologickým disciplínám
- klasifikovat metody pozorování mikroorganismů
- ilustrovat na příkladech jak jednotlivé metody mohou být využity v ekotoxikologii mikroorganismů
- hodnotit biologickou kvalitu půd z mikrobiálních parametrů
- srovnávat výhody a nevýhody metod z různých úhlů pohledu
- popsat základní principy bioremediací
- diskutovat využitelnost mikrobiální ekotoxikologie ve vztahu k hodnocení ekologických rizik
Osnova
  • Mikrobiální ekotoxikologie jako obor. Existující metodické přístupy. Toxicita látek a mikroorganismy.
  • Možnosti sledování a testování toxických účinků u prokaryot.
  • Hodnocení testů toxicity.
  • Růst mikroorganismů jako ukazatel vlivu stresových faktorů.
  • Inkubační techniky ,celková analýza společenstev, inkubace fyziologických skupin. Mikroskopické techniky v ekotoxikologii.
  • Základní matematický model růstu mikroorganismů. Monodova kinetika růstu.
  • Logistický růstový model ,interpretace parametrů. Koncept udržovací energie a specifické rychlosti metabolismu. Růstové modely - simulace.
  • Biodegradace organických látek a růst mikroorganismů. Kinetické modely.
  • Obecné mechanismy biodegradace persistentních organických látek.
  • Testy biodegradace organických látek - OECD, ISO.
  • Mikrobiální společenstva reálného prostředí, obecná ekologie.
  • Významné fyziologické skupiny mikroorganismů, fyziologie, ekologické funkce.
  • Význam mikrobiálních společenstev reálného prostředí pro hodnocení ekologických rizik.
  • Mikrobiální ekotoxikologie půdy. Obsah mikrobiální biomasy v půdě, její potenciální a bazální respirační aktivita. Kinetika substrátem indukované respirace. Testy mineralizace dusíku.
  • Biodiversita mikrobiálních společenstev reálného prostředí.
Literatura
  • MAIER, Raina M., Ian L. PEPPER a Charles P. GERBA. Environmental microbiology. San Diego: Academic Press, 2000, xix, 585. ISBN 0124975704. info
  • TATE, Robert L. Soil microbiology. 2nd ed. New York: John Wiley & Sons, 2000, xxiii, 508. ISBN 0471317918. info
  • Techniques in microbial ecology. Edited by Robert S. Burlage. New York: Oxford University Press, 1998, xii, 468. ISBN 0195092236. info
  • ATLAS, Ronald M. a Richard BARTHA. Microbial ecology :fundamentals and applications. 4th ed. Menlo Park, California: Addison Wesley Longman, 1997, x, 694 s. ISBN 0-8053-0655-2. info
  • Manual of environmental microbiology. Edited by Christon J. Hurst. Washington: ASM Press, 1996, 894 s. ISBN 155581087X. info
  • ATLAS, Ronald M. Handbook of media for environmental microbiology. Boca Raton: CRC Press, 1995, iv, 540 s. ISBN 0-8493-0603-5. info
  • Methods in applied soil microbiology and biochemistry. Edited by Kassem Alef - Paolo Nannipieri. London: Academic Press, 1995, 576 s. ISBN 0125138407. info
Metody hodnocení
Písemná zkouška
Informace učitele
http://www.recetox.muni.cz
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, podzim 2007, podzim 2009, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2014, jaro 2015.