Bi8661 Analýza dat na PC III: Pokročilý SW pro analýzu dat

Přírodovědecká fakulta
podzim 2008
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.
Vyučující
RNDr. Eva Gelnarová (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D.
RECETOX – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Jiří Jarkovský, Ph.D.
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz && Bi7490 Základy stochast. modelování
This subject is suitable for more advanced students with good knowledge of statistics. More advanced statistical software will be presented.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět Analýza dat na PC III je určen pro pokročilé studenty s dobrými znalostmi statistiky. Cílem předmětu je naučit studenty práci s pokročilými statistickými software na takové úrovni, aby byli schopni samostatné analýzy dat.
Osnova
  • 1. Úvod do R, základní statistické metody a) Základy software R- historie, instalace, načtení dat, základní datové typy a struktury, tvorba funkcí, knihovny, formátování výstupů, operace s maticemi b) Vizualizace dat – boxplot, histogram, scatter-plot c) Operace s daty, transformace, přehled statistických rozdělení, korelační koeficienty d) Statistické testy – testy normality, jednovýběrové a dvouvýběrové t-testy, neparametrické testy e) Analýza rozptylu 2. Pokročilé statistické metody v R a) Kontingenční tabulky – tvorba tabulek, Chi-kvadrát test nezávislosti b) Lineární regresní modely – odhad parametrů, diagnostika reziduí, diagnostika odlehlých pozorování, výběr vysvětlujících proměnných c) Zobecněné lineární modely – logistická regrese, poissonovská regrese d) Analýza hlavních komponent – vlastní čísla matice 3. Volitelná náplň dle komunikace se studenty, varianty: a) Samostatná analýza reálného datového souboru v R, tvorba reportu b) Krátký úvod do dalšího statistického software (Matlab, SPSS) nebo ArcGis
Literatura
  • Zar, J.H.: Biostatistical analysis. New Jersey 1984, Prentice-Hall
  • StatSoft, Inc. (2007). Electronic Statistics Textbook. Tulsa, OK: StatSoft. WEB: http://www.statsoft.com/textbook/stathome.html
  • www.r-project.org
  • Snedecor, G.W., Cochran, W.G.: Statistical methods, Iowa 1971, Iowa State University Press.
  • Legendre, P., Legendre, L. (1998) Numerical ecology. Elsevier, 2nd ed.
  • ter Braak, C.J.F. (1996). Unimodal models to relace species to environment. DLO-Agricultural Mathematics Group, Wageningen Flury, B., Riedwyl, H. (1988) Multivariate statistics. A practical approach. Chapman and Hall, London.
Metody hodnocení
Zápočet z předmětu je udělován za účast na výuce
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2009.