PřF:C8857 Protein Preparation and Charac - Informace o předmětu

C8857 Protein Preparation and Characterization III - Protein-Mediated Interaction

Rozsah

1/0/0. 1 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

NOW(C8875)

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Biochemie (angl.) (program PřF, N-BCH)
• Biochemie (program PřF, N-BCH)
• Biochemie (program PřF, N-CH)
• Biologie (program PřF, N-BI)
• Biomolekulární chemie (angl.) (program PřF, N-BCH)
• Biomolekulární chemie (program PřF, N-BCH)
• Makromolekulární chemie (program PřF, N-CH)
• Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-BI)
• Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-BI, směr Genomika a proteomika)
• Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-BI, směr Molekularni a geneticka diagnostika)

Cíle předmětu

The main aim of the course is to discuss the role of protein-mediated interactions in the biology of the cell. Examples of protein-ligand, protein-protein and protein-DNA interactions and motifs responsible for such interactions will be presented in the context of their biological significance. The course will also include theory of individual methods used for study of protein-mediated interactions.

Osnova

• 1) General concept DNA RNA PROTEIN; Proteins - their structure, assmebly, and folding; Mad cow and other disease; Domains and motifs; Predictions. 2) Why and how do the proteins interact; Little bit of Math; Data mining; Protein localization (NLS), membrane transport , transport in cytosol etc.); Role of protein interactions (cell cycle, enviroment and hormon responses). 3) Modification of protein interactions, their role and types (phosphorylation, Ubq, Sumo, glycosilation, 4) DNA-protein interactions, types of interaction motivs, their roles (replication, transcription, repair), modification again 5) Methods of study (microscopy, Y2H, FRET, in vitro /pulldow). 6) Methods II (IP,CHIP, far western, EMSA, Biocore etc.). 7) Single protein versus complex of proteins. 8) Examples: DNA repair mechanisms, from single protein to multi-protein complexes. 9) DNA repair II

Literatura

• MEYERS., Robert A. Encyclopedia of Molecular Cell Biology and Molecular Medicine, 2nd Edition. 2004. ISBN 3-527-30545-9. info
• BRANDEN, Carl a John TOOZE. Introduction to Protein Structure. 1991. ISBN 0-8153-0270-3. info

Výukové metody

The course will be taken in block during the semester. The teaching language is english. Each lecture will consist of summary of previous lecture, actual lecture and case examples. Special focus will be given for group discussions.

Metody hodnocení

The course will be ended by test. Each student will have to also deliver home assignment that describes their particular project with the potential implementation of the methods and techniques discussed during the course.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• Bi8858 Příprava a charakterizace proteinů II - Biokatalýza a enzymové technologie
• Bi8858c Příprava a charakterizace proteinů II, cvičení
• Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace
• Bi8980c Příprava a charakterizace proteinů I - cvičení

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

• Statistika zápisu (podzim 2010 - akreditace, nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2010-akreditace/C8857