PřF:Bi7420 Metody analýzy genomu - Informace o předmětu

Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu

Rozsah

1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

MVDr. Boris Tichý, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Veronika Mančíková, Ph.D. (přednášející)
prof. MUDr. Mgr. Marek Mráz, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Nikola Tom, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Karol Pál, Ph.D. (přednášející)
doc. Mgr. Martin Trbušek, Dr. (přednášející)
RNDr. Jitka Malčíková, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Mgr. Veronika Mančíková, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Po 18. 9. až Pá 15. 12. Po 11:00–12:50 B11/306

Předpoklady

Bi1700 Buněčná biologie && ( Bi4010 Základy molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie ) && ( Bi4020c Základy metod mol. biologie || Bi6400 Metody molekulární biologie )

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 40 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/40, pouze zareg.: 0/40, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/40

Mateřské obory/plány

• Lékařská genetika a molekulární diagnostika pro odborné pracovníky v laboratorních metodách (program PřF, N-BI)
• Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Experimentální biologie živočichů a imunologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci tohoto kurzu bude student schopen se orientovat v moderních molekulárně-biologických metodách a vysvětlit principy sekvenování nové generace

Výstupy z učení

Student bude po absolvování předmětu schopen: - aplikovat metodu CRISPR ve svém výzkumu - popsat princip sekvenování nové generace - navrhnout experiment s využitím sekvenování nové generace - analyzovat data získaná sekvenováním nové generace

Osnova

• 1. CRISPR technologie - principy a využití 2. Sekvenování nové generace (NGS) – technologické aspekty různých NGS platforem 3. Příprava knihoven pro sekvenování nové generace 4. Metody pro analýzu nekódujících RNA – miRNA, lncRNA, příklady využití v onkologii 5. Analýza dat – bioinformatické přístupy a statistické metody hodnocení 6. Aplikace - Využití čipových a NGS technologií, design experimentů

Literatura

• Koubková L, Vojtěšek B, Vyzula R. Next generation sequencing -  application in clinical practice. Klin Onkol. 2014;27 Suppl 1:S61-8.

Výukové metody

Teoretická příprava.

Metody hodnocení

písemný test

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

• Statistika zápisu (podzim 2017, nejnovější)
  
• Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2017/Bi7420