C7995 Practical NMR Spectroscopy of Biomolecules

Přírodovědecká fakulta
podzim 2020
Rozsah
1/0/1. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
Vyučující
doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D. (přednášející)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)
Garance
doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Students should have basic knowledge of NMR theory, previous passing the course C5320 is an advantage but not absolutely necessary.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Cíle předmětu
The students will get hands-on experience with using NMR spectrometers with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important experimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data acquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.
Výstupy z učení
At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.
Osnova
  • 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. 1D proton spectroscopy and water suppression techniques 5. 1D NMR spectroscopy of nuclei other than H-1 6. Homonuclear 2D experiments 7. Heteronuclear experiments for natural abundance and isotopically labeled samples 8. Data processing, apodization functions, linear prediction, non-uniform sampling 9. Analysis of protein NMR spectra 10. Analysis of NMR spectra of nucleic acids
Literatura
    doporučená literatura
  • CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
  • BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
  • NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info
Výukové metody
Lectures plus laboratory practice
Metody hodnocení
Written test of NMR theory plus test of practical operation of the NMR spectrometer.
Vyučovací jazyk
Angličtina
Navazující předměty
Informace učitele
http://www.ncbr.muni.cz/~fiala/
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007 - akreditace, podzim 2010 - akreditace, podzim 2002, podzim 2003, podzim 2004, podzim 2005, podzim 2006, podzim 2007, podzim 2008, podzim 2009, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012, podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, jaro 2016, podzim 2016, jaro 2017, podzim 2017, jaro 2018, podzim 2018, jaro 2019, podzim 2019, jaro 2020, jaro 2021, podzim 2021, jaro 2022, podzim 2022, jaro 2023, podzim 2023, jaro 2024, podzim 2024, jaro 2025.