FB820 Structural electron microscopy

Faculty of Science
Autumn 2020
Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (plus extra credits for completion). Type of Completion: zk (examination).
Teacher(s)
Mgr. Jiří Nováček, Ph.D. (lecturer)
Dr. Tanvir Shaikh (lecturer)
Guaranteed by
prof. RNDr. Robert Vácha, PhD.
Department of Condensed Matter Physics – Physics Section – Faculty of Science
Contact Person: prof. RNDr. Robert Vácha, PhD.
Supplier department: Department of Condensed Matter Physics – Physics Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Znalosti matematiky a fyziky na středoškolské úrovni
Course Enrolment Limitations
The course is offered to students of any study field.
Course objectives (in Czech)
Kurz nabízí úvod do elektronové mikroskopie pro strukturní biologii a vědy o živé přírodě.
Zahrnuje anatomii elektronového mikroskopu, princip tvorby obrazu a úvod do metod přípravy vzorků pro elektronovou mikroskopii. Studenti získají poznatky o analýze obrazů z kryoelektronové mikroskopie, o jednočásticové analýze a elektronové tomografii.
Syllabus (in Czech)
  • 1. Historie elektronové mikroskopie, aplikace a současné trendy
  • 2. Uspořádání elektronového mikroskopu a princip vytváření obrazu
  • 3. Transmisní a skenovací mikroskopie
  • 4. Metody přípravy vzorku
  • 5. Negativní barvení a a kryoelektronová mikroskopie makromolekulárních systémů
  • 6. Fourierova transformace
  • 7. Vzorkování a multivariantní analýza
  • 8. Jednočásticová analýza
  • 9. 3D reknostrukční metody
  • 10. Rozlišení a statistika
  • 11. Elektronová tomografie
  • 12. Interpretace EM dat ve strukturní biologii
  • 13. Korelativní přístupy
Literature
  • Annie Cavalier, Daniele Spehner, Bruno M. Humbel: Handbook of Cryo-Preparation Methods for Electron Microscopy (Methods in Visualization), CRC Press; 1st Ed., 2008
  • R. A Crowther: The Resolution Revolution: Recent Advances In cryoEM, Volume 579 (Methods in Enzymology) 1st Edition, Academic Press, 2016
  • John Kuo: Electron Microscopy: Methods and Protocols (Methods in Molecular Biology), Humana Press; 3rd ed. 2014
Assessment methods (in Czech)
Písemná zkouška
Language of instruction
Czech
Further Comments
Study Materials
The course is taught annually.
The course is taught every week.
The course is also listed under the following terms Autumn 2019, autumn 2021, Autumn 2022, Autumn 2023, Autumn 2024.
  • Enrolment Statistics (Autumn 2020, recent)
  • Permalink: https://is.muni.cz/course/sci/autumn2020/FB820