FE010 Experimental Methods in Biophysics  -  life science laboratory approaches and excursions

Přírodovědecká fakulta
podzim 2020
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučující
doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D. (přednášející)
Garance
doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D.
Ústav fyziky kondenzovaných látek – Fyzikální sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav fyziky kondenzovaných látek – Fyzikální sekce – Přírodovědecká fakulta
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Cíle předmětu
The objective of lectures, practical demonstrations and excursions is to acquaint with range of methods that enable us to quantitatively and qualitatively describe interactions and structures of proteins, DNA and small molecules such as drugs on one hand and methods that describe ehavior of cells and whole organisms on the other hand.
Výstupy z učení
The students will learn
- principles of methods describing interactions, structure and function of biomolecules
- apply the methods and approaches to practical case studies
- use and broaden our knowledge during planned excursions to local research and development laboratories of companies e.g. TESCAN, BIOVENDOR and FEI-ThermoFisher Scientific
Osnova
  • 1. Overview of biophysical methods and their applications
  • 2. Calorimetry of biopolymers
  • 3. UV/Vis, Infrared and Raman spectroscopy
  • 4. Fluorescence  spectroscopy -  FLIM , FRET, FCCS
  • 5. Fluorescence microscopy -TIRF, PLA, FRAP
  • 6. Scientific Excursion I TESCAN
  • 7. Circular dichroism of DNA a proteins
  • 8. Liquid chromatography of biomolecules
  • 9. Scientific Excursion II BIOVENDOR
  • 10. Electron microscopy
  • 11. Scientific Excursion 3 FEI-THERMOFISHER
  • 12. NMR spectroscopy of  biomolecules
  • 13. Flowcytometry
  • 14. RTG crystallography
Literatura
  • J.L. Nadeau: Introduction to Experimental Biophysics: Biological Methods for Physical Scientists, CRS Press 2017
Výukové metody
lecture
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2018, podzim 2019, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023, podzim 2024.