C2175 Využití programu R pro výpočty a zpracování dat v chemii

Faculty of Science
Autumn 2023
Extent and Intensity
0/2/0. 2 credit(s) (plus extra credits for completion). Type of Completion: k (colloquium).
Teacher(s)
Mgr. Ing. Lubomír Prokeš, Ph.D. (seminar tutor)
Mgr. Lukáš Pečinka, Ph.D. (seminar tutor)
Guaranteed by
Mgr. Ing. Lubomír Prokeš, Ph.D.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Supplier department: Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Znalost matematiky a analytické chemie na úrovni základních kurzů, výhodou je absolvování např. PřF:C5120 Počítače v chemii - chemometrie nebo jiný kurs statistických metod. V kurzu je preferována práce na vlastním počítači.
Course Enrolment Limitations
The course is offered to students of any study field.
The capacity limit for the course is 12 student(s).
Current registration and enrolment status: enrolled: 1/12, only registered: 0/12, only registered with preference (fields directly associated with the programme): 0/12
Course objectives (in Czech)
Cílem kurzu je seznámit studenty se statistickým programem R, s knihovnami a funkcemi vhodnými pro numerické výpočty, matematické modelování a zpracování a analýzu dat, využití těchto postupů při zpracování protokolů a publikačních dat v chemii.
Learning outcomes (in Czech)
Cílem kurzu je seznámit studenty se statistickým programem R, s knihovnami a funkcemi vhodnými pro numerické výpočty, matematické modelování a zpracování a analýzu dat, využití těchto postupů při zpracování protokolů a publikačních dat v chemii.
Syllabus (in Czech)
  • 1. Úvod do R (použití, výhody a nevýhody, stažení, instalace, praktická ukázka, základní práce s proměnnými), datové formáty (vektor, matice, dataframe, seznam). 2. Elementární matematika, matice, numerické metody řešení rovnic, numerická derivace a integrace. 3. Symbolická matematika (limity funkcí, derivace, integrály, matice), práce s řetězci a textem. 4. Import, export dat a práce s datovými soubory (načítání formátů txt, xlsx, csv, úprava dat v tabulkách), filtrování dat a databázové funkce, získávání hodnot konstant a fyz.-chemických dat z knihoven R a z webu. 5. Základy programování v R (cyklus typu for, podmínka if-else, funkce typu apply), tvorba vlastních funkcí. 6. Tvorba grafů v R. 7. Zaokrouhlování výsledků, převody jednotek, základní statistické funkce, počítání s nejistotami. 8. Statistické testy, analýza rozptylu (ANOVA), neparametrické testy, korelace. 9. Lineární, nelineární a polynomická regrese, testování parametrů. Vyhlazování a interpolace dat. 10. Zpracování výsledků reálných chemických analýz a tvorba finálních reportů.
Literature
    required literature
  • Drozd, P. 2007. Cvičení z biostatistiky: Základy práce se softwarem R. Ostravská univerzita, Ostrava. Online: https://cran.r-project.org/doc/contrib/CviceniR1.pdf
    recommended literature
  • LEPŠ, Jan and Petr ŠMILAUER. Biostatistika. Vydání 1. České Budějovice: Nakladatelství Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích, 2016, 438 stran. ISBN 9788073945879. info
  • PROCHÁZKA, Bohumír. Biostatistika pro lékaře : principy základních metod a jejich interpretace s využitím statického systému R. Vydání první. V Praze: Univerzita Karlova v Praze, nakladatelství Karolinum, 2015, 345 stran. ISBN 9788024627823. info
    not specified
  • Konečná, K., Koláček, J. 2011. Jak pracovat s jazykem R. Online: https://www.math.muni.cz/~kolacek/vyuka/vypsyst/navod_R.pdf
  • Spiwok, V. 2015. Statistická analysa dat v R. Online:https://web.vscht.cz/~spiwokv/statistika/skripta.pdf
Teaching methods (in Czech)
Systematická výuka základů jazyka R založená na řešených vzorových příkladech, doprovázená samostatnými cvičeními pod dohledem lektora.
Assessment methods (in Czech)
Samostatná práce na PC, vypracování zadaných úkolů resp. zpracování a prezentace vlastních dat.
Language of instruction
Czech
Further Comments
Study Materials
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Autumn 2020, autumn 2021, Autumn 2022, Autumn 2024.
  • Enrolment Statistics (Autumn 2023, recent)
  • Permalink: https://is.muni.cz/course/sci/autumn2023/C2175