Bi5043 Biostatistický seminář III

Přírodovědecká fakulta
jaro 2005
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: kz.
Vyučující
prof. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D. (cvičící)
RNDr. Danka Haruštiaková, Ph.D. (cvičící)
RNDr. Jiří Jarkovský, Ph.D. (cvičící)
RNDr. Jan Mužík, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Adam Svobodník, Ph.D. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Doporučeno absolvování předmětu Bi5040 Biostatistika - základní kurz.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Cíle předmětu
Prakticky orientovaný kurz aplikované analýzy dat navazující na Biostatistický seminář I a nabízený studentům, kteří navštíví během 1-3 let studia více tematických okruhů. Seminář je součástí řady praktických kurzů Biostatistický seminář I-III a pro plné absolvování je celkově třeba navštívit 18 intenzivních lekcí (rožně obměňovaná témata). Charakteristika výuky odpovídá biostatistickému semináři I, liší se tematickým zaměřením: Prakticky orientovaný intenzivní kurz realizovaný formou specializovaných tematických okruhů z oblasti aplikované analýzy biologických, ekologických, biomedicínských nebo klinických dat Seminář je zaměřován na posluchače s různou úrovní základních znalostí a nemá žádné požadavky na dříve dosažené vzdělání nebo absolvované kurzy. Pro řádné studenty oboru biologie je však vhodné jej zapisovat v návaznosti na základní kurz Biostatistika (Bi5040). Výuka je prakticky orientovaná a probíhá přímo výcvikem na počítačích. Seminář lze zakončit zápočtem na základě absolvování 6 tematických okruhů dle výběru posluchače, posluchači mohou i navrhovat vlastní témata. Pro školní rok 2002/2003 jsou jako nosná témata vypsána témata (1) Biodiverzita a ekologická diverzita a (2) Statistický minor v prediktivní medicíně. Tato témata jsou nabídnuta v celkem 13 samostatných kurzech. Předmět je vypisován každý rok s jinými nosnými tématy.
Osnova
  • Tématický okruh č. 1 pro školní rok 2002/2003: Biodiverzita a ekologická diverzita
  • 1. Kurz 1. MS Office v analýze ekologických dat- databáze, algoritmování
  • 2. Kurz 2. Algoritmy pro ekologická data I. Charakteristika společenstev, diverzita
  • 3. Kurz 3. Algoritmy pro ekologická data II. Metriky podobností a vzdáleností
  • 4. Kurz 4. Algoritmy pro ekologická data III. Valence, nika
  • 5. Kurz 5. Algoritmy pro ekologická data IV. "Species-abundance" modely, interpretace
  • 6. Kurz 6. Vícerozměrné metody v ekologii - shluková, ordinační analýza
  • 7. Kurz 7. Užití diferenciálních rovnic v deterministických modelech v biologii a ekologii
  • Tématický okruh č. 2 pro školní rok 2002/2003: Statistický minor v prediktivní medicíně
  • 1. Kurz 1. Prediktivní analýzy u klinických dat - přehled
  • 2. Kurz 2. Analýza přežití I. Základy
  • 3. Kurz 3. Analýza přežití II. Prediktivní modely
  • 4. Kurz 4. Specifita a sensitivita diagnostických testů, ROC křivky
  • 5. Kurz 5. Jak definovat "cut-off" hodnoty parametrů?
  • 6. Kurz 6. Vícerozměrné metody - aplikace u klinických dat
Literatura
  • MELOUN, Milan a Jiří MILITKÝ. Statistické zpracování experimentálních dat. [1. vyd.]. Praha: Plus, 1994, 839 s. ISBN 80-85297-56-6. info
  • Snedecor G.W. and Cochran W.G. (1971). Statistical methods. Iowa State University Press.
  • Zar J.H. (1984). Biostatistical analysis. Perntice Hall. New Jersey.
  • LEGENDRE, Pierre a Louis LEGENDRE. Numerical ecology. 2nd engl. ed. Amsterdam: Elsevier, 1998, xv, 853 s. ISBN 0-444-89249-4. info
  • SOKAL, Robert R. a James F. ROHLF. Biometry :the principles and practice of statistics in biological research. 3rd ed. New York: W.H. Freeman and Company, 1995, xix, 887 s. ISBN 0-7167-2411-1. info
  • Magurran A., 1983: Ecological diversity and its measurement. Croom Helm, London
  • Cajo J.F. ter Braak, (1996). Unimodal models to relace species to environment. DLO-Agricultural Mathematics Group, Wageningen
  • Jongman, Ter Braak and Van Tongeren (1995). Data analysis in community and landscape ekology, Cambridge University Press, Cambridge
  • BLAND, Martin. An introduction to medical statistics. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1996, xiv, 396. ISBN 0192624288. info
  • Altman D. G. (1991) Practical statistics for medical research. Chapman and Hall. London.
  • HAVRÁNEK, Tomáš. Statistika pro biologické a lékařské vědy. 1. vyd. Praha: Academia, 1993, 476 s. ISBN 8020000801. info
  • HEBÁK, Petr a Jiří HUSTOPECKÝ. Vícerozměrné statistické metody s aplikacemi. Praha: SNTL - Nakladatelství technické literatury, 1987. info
  • Flury B. and Riedwyl H. (1988) Multivariate statistics. A practical approach. Chapman and Hall, London.
Informace učitele
http://www.cba.muni.cz/vyuka/
Další komentáře
Předmět je vyučován každý semestr.
Výuka probíhá každý týden.
Poznámka k četnosti výuky: možnost blokové výuky.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2002, podzim 2003, jaro 2004, podzim 2004.
  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2005/Bi5043