C6200 Biochemické metody

Přírodovědecká fakulta
jaro 2024
Rozsah
4/0/0. 4 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.
Vyučující
doc. Mgr. Zdeněk Farka, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Marta Pelcová, Ph.D. (přednášející)
Garance
doc. Mgr. Zdeněk Farka, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 19. 2. až Ne 26. 5. Út 12:00–13:50 B11/205, Út 16:00–17:50 B11/205
Předpoklady
( c3181 Biochemie I && C4182 Biochemie II )|| C3580 Biochemie
Základní znalosti biochemie, analyticke a fyzikální chemie
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
předmět má 11 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Hlavní cíle kurzu jsou: porozumění základům metod dezintegrace tkání, metodám izolace a purifikace enzymů a biopolymerů, chromatografickým a elektromigračním metodám, technikám stanovení čistoty, vlastností enzymů a biopolymerů, spektroskopickým, elektrochemickým a fyzikálním metodám biochemické analýzy.
Výstupy z učení
Po absolvování tohoto předmětu bude student schopen nejen teoreticky porozumět, ale i prakticky aplikovat metody dezintegrace tkání, metody izolace a purifikace bílkovin, nukleových kyselin a dalších biopolymerů, metody stanovení jejich čistoty, chromatografické a elektromigrační metody, spektroskopické, elektrochemické a fyzikální metody biochemické analýzy. Tyto znalosti bude moci aplikovat ve vlastní vědecké práci v rámci bakalářské, diplomové či doktorské práce a následně i v rámci svého zaměstnání.
Osnova
  • Blok ZF (vyčující doc. Zdeněk Farka)
    1. Elektronová spektra molekul, přechody, základní a excitovaný stav, vliv prostředí, UV-Vis spektroskopie, použití ke stanovení látek a studiu struktury bílkovin.
    2. Chiroptické metody a jejich princip. ORD a CD a jejich použití ke studiu konformace bílkovin.
    3. IČ spektroskopie a její užití ke studiu struktury bílkovin, Ramanův rozptyl a jeho použití ke studiu struktury bílkovin.
    4. Atomová absorpční a atomová emisní spektroskopie.
    5. Luminiscenční metody. Kvantový výtěžek, vliv prostředí, užití ke stanovení látek a studiu konformace bílkovin, zhášení fluorescence, transfer energie.
    6. Mikroskopie. Metody optické mikroskopie, elektronová mikroskopie, mikroskopie skenující próbou.
    7. Imunochemické metody. Příprava a využití protilátek v bioanalytické chemii, formáty imunochemických stanovení.
    8. Biosenzory. Biokatalytické a bioafinitní senzory, nejvýznamnější druhy převodníků.
    9. Biochemické aplikace nanočástic. Nejvýznamnější druhy nanočástic, jejich příprava, charakterizace a využití v bioanalytické chemii.
  • Blok MP (vyčující Dr. Marta Pelcová)
    1. Zásady práce s biologickým materiálem. Strategie a plánování.
    2. Dezintegrace tkání a buněk. Centrifugace a sedimentační analýza.
    3. Fázové separace. Srážení a extrakce. Membránové separace. Zahušťování a sušení. Úprava vody.
    4. Chromatografické metody. Obecné principy a charakteristiky. Chromatografie adsorpční a rozdělovací. Iontoměničová chromatografie, chromatofokusace.
    5. Reverzně fázová a iontově párová chromatografie. Hydrofobní chromatografie. Chromatografie gelová. Chromatografie afinitní. Plynová chromatografie.
    6. Elektromigrační metody. Obecné charakteristiky a vlivy. Elektroforéza volná a zónová.
    7. Izoelektrická fokusace. Izotachoforéza. Blotting.
    8. Metody určování velikosti a tvaru makromolekul.
    9. Hmotnostní spektrometrie.
Literatura
  • HOLTZHAUER, Martin. Basic methods for the biochemical lab. 1st english ed. Berlin: Springer, 2006, xviii, 251. ISBN 3540327851. info
  • PINGOUD, Alfred. Biochemical methods : a concise guide for students and researchers. Weinheim: Wiley-VCH, 2002, xiii, 360. ISBN 3527302999. info
Výukové metody
Přednášky doplněné demonstracemi dané problematiky za použití videí a demonstračních programů.
Metody hodnocení
Přednáška, na které se podílí více vyučujících - doc. Zdeněk Farka a Dr. Marta Pelcová. Zkouška je písemnou formou. Zkoušející doc. Zdeněk Farka.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každý semestr.
Vyučují učitelé katedry biochemie.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2000, jaro 2001, jaro 2002, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2025.