Průchod studijním plánem

Student je připraven k vykonání státní doktorské zkoušky po splnění všech studijních povinností, tj. absolvování předmětů teoretické přípravy, splnění povinnosti jazykové kompetence, povinnosti spojené s pedagogickým rozvojem, tj. v polovině standardní doby studia. Státní doktorskou zkoušku student vykonává v průběhu 5. nebo nejpozději 6. semestru studia. Státní doktorská zkouška probíhá formou pohovoru, ve kterém uchazeč prokazuje celkovou orientaci v oboru a schopnost komunikovat a diskutovat s examinátory. Okruhy státní doktorské zkoušky:
- struktura a molekulární principy fungování mikrobiálních, rostlinných a živočišných buněk a jejich virů
- mechanismy mutageneze, rekombinace, transpozice a oprav DNA
- molekulární podstata kancerogeneze
- principy buněčných signalizací
- charakteristika a možnosti využití kmenových buněk
- principy řízení proliferace, diferenciace a odumírání buněk
- možnosti genového inženýrství a genových terapií
- genomika a proteomika
- molekulární podstata dědičných chorob
- obecná, molekulární a vývojová genetika
- lékařská genetika a cytogenetika
- genetika kvantitativních znaků
- genetika rostlin
- genetika živočichů

Základní literatura:
SNUSTAD, D. Peter, Michael J. SIMMONS, Jiřina RELICHOVÁ, Jiří DOŠKAŘ, Jiří FAJKUS, Petr HOŘÍN, Aleš KNOLL, Petr KUGLÍK, Jan ŠMARDA, Jana ŠMARDOVÁ, Renata VESELSKÁ a Boris VYSKOT. Genetika. 2. akt. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2017. 864 s. Učebnice. ISBN 978-80-210-8613-5.

Nejpozději do konce 8. semestru studia student prokáže splnění povinnosti prezentace na zahraniční konferenci, zpracuje dizertační práci a předloží žádost o obhajobu dizertační práce.

Studijní povinnosti (cca 20% studijní zátěže)
absolvování předmětů souvisejících s tématem disertační práce a rozšiřujících znalosti v oboru, případně předměty vedoucí k prohloubení manažerských kompetencí - tzv. soft skills, jako např. S4001 Prezentování na mezinárodním fóru, S4003 Vedení vědecké kariéry, S4004 Financování výzkumu - trénink v grantových přihláškách, D01 Publish or Perish: The art of research and scientific writing, apod. (18 kreditů/první 4 semestry)
doktorský seminář UEB (16 kreditů/8 semestrů)
MU Life Sciences Seminar (8 kreditů/první 4 semestry)
pomoc při zajišťování praktické výuky v pregraduálním studiu (150 hodin za celé studium) a podíl na vedení a oponování bakalářských prací (cca 5% zátěže)
vykonání státní doktorské zkoušky v průběhu pátého, maximálně šestého semestru

Výzkumné povinnosti
příprava disertační práce po celou dobu studia (min. 70 % pracovní zátěže - zahrnuje i publikační činnost)
absolvování předmětu XD020 (Kontrolní den) v pátém semestru: vypracování stručné písemné zprávy a krátká ústní prezentace o stavu řešení projektu v polovině standardní doby studia členům oborové rady
průběžná prezentace výsledků na seminářích a vědeckých konferencích
minimálně jedna aktivní účast na mezinárodní konferenci
kdykoliv v průběhu studia je povinná min. měsíční zahraniční stáž (cca 5% studijní zátěže)
publikační činnost: nejméně jeden článek v časopisu s impaktovým faktorem, který je nad mediánem oboru, u kterého je student prvním autorem; alternativní variantou jsou dva články (alespoň jeden z nich prvoautorský) v mezinárodních časopisech s impaktovým faktorem vyšším než jedna bez ohledu na medián časopisu. Student je na těchto publikacích povinen uvádět řádnou afiliaci: Ústav experimentální biologie, Přírodovědecká fakulta MU.

Aktuální témata disertačních prací:

https://www.sci.muni.cz/pro-uchazece/doktorske-studium/24071-molekularni-a-bunecna-biologie-a-genetika (záložka Výzkumná zaměření disertačních prací)

Vybraná témata obhájených prací:

Protein engineering for analysis of structure-functin relationships of enzymes (Veronika Lišková), obhájeno 11.5. 2018
Mechanismus protinádorového působení wedelolaktonu (Tereza Kučírková), obhájeno 20.4. 2018
Mechanismy oprav DNA studované metodami pokročilé konfokální mikroskopie (Jana Suchánková), obhájeno 16.3. 2018
Komplexní analýza genomů jedinečných bakteriofágů a plazmidů nesoucích geny pro exfoliativní toxiny A a B u Staphylococcus aureus (Tibor Botka), obhájeno 20.10. 2017
Studium reorganizace jadérek u embryonálních kmenových buněk (Michal Franek), obhájeno 13.10. 2017