Informace o předmětu

IV110 Project in Sequence Analysis

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučováno kontaktně

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Eva Budinská, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Jan Kotrs (cvičící)
Mgr. Pavla Holochová, Ph.D. (cvičící)

Garance

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Po 23. 9. až Po 16. 12. Po 10:00–12:50 B410

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 36 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Výstupy z učení

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Marie Krátká (cvičící)
Mgr. Eva Budinská, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Vojtěch Bystrý, Ph.D. (cvičící)

Garance

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Po 10:00–12:50 B410

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 74 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Výstupy z učení

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Marie Krátká (cvičící)

Garance

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Po 14:00–15:50 B410

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 74 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Výstupy z učení

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

Mgr. Monika Čechová, Ph.D. (přednášející)
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

St 15. 9. až St 8. 12. St 12:00–13:50 B204

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 74 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Výstupy z učení

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Út 8:00–9:50 C511

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 74 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Výstupy z učení

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Čt 18:00–19:50 B204

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 74 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Výstupy z učení

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Po 17. 9. až Po 10. 12. Po 12:00–13:50 A319

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 37 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Út 8:00–9:50 B411

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 37 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Po 8:00–9:50 C525

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 37 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

St 16:00–17:50 B411

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 37 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Čt 8:00–9:50 C416

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 36 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Pá 10:00–11:50 G330

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 36 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Út 12:00–13:50 B411

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 36 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Út 10:00–11:50 B411

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 42 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Út 8:00–9:50 B410

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 40 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

St 8:00–9:50 B411

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 45 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji; dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data; dokáže prezentovat své výsledky kolegům.

Osnova

• Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení
• Příprava návrhu studentských projektů
• Realizace
• Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentské projekty, jejich prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II
• IV116 Applied bioinformatics: The Evolutionary relationships of genes and species

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

St 8:00–9:50 B204

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 38 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Studenti si na začátku semestru v reakci na předložený okruh problémů a po vzájemné diskusi mezi sebou a s vyučujícím zvolí vhodný bioinformatický problém k řešení výpočetními prostředky. Výsledky své práce předvedou v závěru semestru v studentské minikonferenci buď formou posteru nebo přednášky s demonstrací na počítači. IV110 je určen primárně bakalářům, obor Bioinformatika na magisterské úrovni vyžaduje absolvování IV114. V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji a dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data.

Osnova

• - Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení - Příprava návrhu studentských projektů - Realizace - Minikonference

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Čt 8:00–9:50 B411

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 38 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Studenti si na začátku semestru v reakci na předložený okruh problémů a po vzájemné diskusi mezi sebou a s vyučujícím zvolí vhodný bioinformatický problém k řešení výpočetními prostředky. Výsledky své práce předvedou v závěru semestru v studentské minikonferenci buď formou posteru nebo přednášky s demonstrací na počítači. IV110 je určen primárně bakalářům, obor Bioinformatika na magisterské úrovni vyžaduje absolvování IV114.

Osnova

• - Okruhy zajímavých problémů k řešení - Příprava návrhu studentských projektů - Realizace - Minikonference

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV110 Projekt z bioinformatiky I

Předmět se v období podzim 2006 nevypisuje.

Rozsah

1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Předpoklady

Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 18 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Studenti si na začátku semestru v reakci na předložený okruh problémů a po vzájemné diskusi mezi sebou a s vyučujícím zvolí vhodný bioinformatický problém k řešení výpočetními prostředky. Výsledky své práce předvedou v závěru semestru v studentské minikonferenci buď formou posteru nebo přednášky s demonstrací na počítači.

Osnova

• - Okruhy zajímavých problémů k řešení - Příprava návrhu studentských projektů - Realizace - Minikonference

Metody hodnocení

Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV106 Bioinformatics seminar
• IV108 Bioinformatika II

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

• Statistika zápisu (nejnovější)