IV110 Projekt z bioinformatiky I

Fakulta informatiky
podzim 2008
Rozsah
1/1/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučující
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Rozvrh
St 8:00–9:50 B204
Předpoklady
Absolvování předmětu IV107 Bioinformatika I, elementární znalosti programování v libovolném prostředí a jazyce (ideální je UNIX s C/C++/Java a Perl/Python) nebo domluva s vyučujícím
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
předmět má 38 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Studenti si na začátku semestru v reakci na předložený okruh problémů a po vzájemné diskusi mezi sebou a s vyučujícím zvolí vhodný bioinformatický problém k řešení výpočetními prostředky. Výsledky své práce předvedou v závěru semestru v studentské minikonferenci buď formou posteru nebo přednášky s demonstrací na počítači. IV110 je určen primárně bakalářům, obor Bioinformatika na magisterské úrovni vyžaduje absolvování IV114. V kurzu se student seznámí s příslušnými výpočetními nástroji a dokáže samostatně analyzovat molekulárně-biologická data.
Osnova
  • - Seznámení s okruhy zajímavých problémů k řešení - Příprava návrhu studentských projektů - Realizace - Minikonference
Literatura
  • ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info
Metody hodnocení
Student bude hodnocen na základě písemného návrhu projektu (1-2 strany A4) a závěrečné prezentace dle pravidel, které budou upřesněny na začátku semestru.
Navazující předměty
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007, podzim 2009, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2012, podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023, podzim 2024.