FI:PA055 Vizualizace komplexních dat - Informace o předmětu
PA055 Vizualizace komplexních dat
Fakulta informatikypodzim 2010
- Rozsah
- 1/1. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- Po 10:00–11:50 B116
- Předpoklady
- Základní znalosti programování a zájem o R a Processing (skriptovací a programovací jazyky)
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 42 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Studenti se seznámí s komplexními typy dat v bioinformatice i jiných disciplínách, způsoby jejich vizualizace na praktických příkladech v jazyce R a Processing nebo z vědecké literatury.
Na konci kurzu dokáží:
vysvětlit základní principy a cíle vizualizace
připravit data pro vizualizaci
zhodnotit existující vizualizaci z hlediska vhodnosti zvolených prostředků
vytvořit vlastní statickou nebo interaktivní vizualizaci zvolených dat - Osnova
- 1.Úvod do vizualizace dat
- 2.Výpočtové prostředí R a jeho vizualizační nástroje
- 3.Výpočtové prostředí Processing a jeho vizualizační nástroje
- 4.Potřeba vizualizace a druhy dat v bioinformatice a systémové biologii
- 5.Předzpracování dat (odhad a redukce dimenzí, PCA, shlukování, metriky pro výpočet podobnosti, vícerozměrné škálování)
- 6.Přehled vizualizačních technik (souřadnicové grafy, histogramy, stromy a jiné grafy, mapy, hybridní vizualizace)
- 7.Příklady vizualizace v bioinformatice, systémové biologii (genomy a proteomy, měření exprese, ontologie, signální a metabolické dráhy) a jiných disciplínách
- Literatura
- Handbook of data visualization. Edited by Chun-houh Chen - Wolfgang Härdle - Antony Unwin. Berlin: Springer, 2008, xiii, 936. ISBN 9783540330370. info
- SARKAR, Deepayan. Lattice : multivariate data visualization with R. New York: Springer, 2008, xvii, 265. ISBN 9780387759685. info
- FRY, Ben. Visualizing data. Beijing: O'Reilly, 2008, xiii, 366. ISBN 9780596514556. info
- Výukové metody
- přednášky, cvičení, krátké studentské prezentace
- Metody hodnocení
- hodnocené úkoly, skupinový projekt a písemná zkouška
- Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
- Statistika zápisu (podzim 2010, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/fi/podzim2010/PA055